Sujet: Éléments d'un développement réussi de logiciels scientifiques dans une communauté de collaboration

[fzs600]

Trouver l'article sur Twitter,l’info vient du forum de Rosetta, apparemment ça parle de code, de Rosetta, et de GPU.
L'article est long pour être traduit complètement,mais en tirer l'essentiel.
L'arriver du GPU sur Rosetta ?
 A voir. 
https://journals.plos.org/ploscompbiol/article?id=10.1371/journal.pcbi.1007507

[franky82]

L'article est difficile à résumer car les explications détaillées sont assez intéressantes (on peut juste éliminer les références...)
Je tente quand-même : cela parle de comunauté collaborative scientifique, avec comme exemple Rosetta :
- historique,
- languages de programmation,
- interface avec la base de données principale,
- communauté de développeurs RosettaCommons,
- formations des scientifiques et des développeurs,
- passage à BOINC (début 2000) : Rosetta@Home,
- projet combiné avec WCG (2004) pour repliement de protéines du génome humain dont le succésseur est Microbiome Immunity Project (microbiome intestinal humain)...
Les défis pour l'avenir comportent, entre autres, le développement d'applications GPU pour Rosetta.
En conclusion,  les logiciels scientifiques ne peuvent pas être maintenus sans une communauté autour d'eux (formation, communication, expertise, développeurs... collaboration plutôt que compétition).

[fzs600]

L'article est difficile à résumer car les explications détaillées sont assez intéressantes (on peut juste éliminer les références...)
Je tente quand-même : cela parle de comunauté collaborative scientifique, avec comme exemple Rosetta :
- historique,
- languages de programmation,
- interface avec la base de données principale,
- communauté de développeurs RosettaCommons,
- formations des scientifiques et des développeurs,
- passage à BOINC (début 2000) : Rosetta@Home,
- projet combiné avec WCG (2004) pour repliement de protéines du génome humain dont le succésseur est Microbiome Immunity Project (microbiome intestinal humain)...
Les défis pour l'avenir comportent, entre autres, le développement d'applications GPU pour Rosetta.
En conclusion,  les logiciels scientifiques ne peuvent pas être maintenus sans une communauté autour d'eux (formation, communication, expertise, développeurs... collaboration plutôt que compétition).

Si c'est interessant peut-etre en tirer une synthèse ?
Pour publication sur le portail ?

[franky82]

Si c'est interessant peut-etre en tirer une synthèse ?
Pour publication sur le portail ?

Je vais essayer de raccourcir l'article, tout en gardant les parties intéressantes et détaillées !

[fzs600]

Si c'est interessant peut-etre en tirer une synthèse ?
Pour publication sur le portail ?

Je vais essayer de raccourcir l'article, tout en gardant les parties intéressantes et détaillées !

[JeromeC]

Ca a l'air fort intéressant et hyper d'actualité ! bon courage, et merci !

[franky82]

J'ai commencé à traduire et éditer l'article sur le portail (dépublié) :
malgré le retrait de paragraphes et bouts de paragraphes, ça va rester un peu long...

[JeromeC]

Plus c'est long...

[franky82]

Plus c'est long...

Je ne sais pas si "plus c'est long, plus c'est bon" 
mais j'ai publié le long article (légèrement réduit) traduit, sur le portail (rubrique Actualités - Calcul partagé)
http://www.boinc-af.org/mieux-ensemble-%C3%A9l%C3%A9ments-d-un-d%C3%A9veloppement-logiciel-scientifique-r%C3%A9ussi-dans-une-communaut%C3%A9-collaborative-distribu%C3%A9e.html

C'est intéressant, bien que pas mal orienté programmation C++, Python et son vocabulaire de partage de code...
(J'ai coloré la partie du texte parlant de BOINC en bleu foncé, au lieu de noir)

[fzs600]

Plus c'est long...

Je ne sais pas si "plus c'est long, plus c'est bon" 
mais j'ai publié le long article (légèrement réduit) traduit, sur le portail (rubrique Actualités - Calcul partagé)
http://www.boinc-af.org/mieux-ensemble-%C3%A9l%C3%A9ments-d-un-d%C3%A9veloppement-logiciel-scientifique-r%C3%A9ussi-dans-une-communaut%C3%A9-collaborative-distribu%C3%A9e.html

C'est intéressant, bien que pas mal orienté programmation C++, Python et son vocabulaire de partage de code...
(J'ai coloré la partie du texte parlant de BOINC en bleu foncé, au lieu de noir)

Chapeau pour le boulot. 

[JeromeC]

Wow ! quel article !! capello ! (mais ça dit qu'il est publié depuis le 04/05 ? )

Et je suppose que tu as fait exprès de pas le mettre sur la page d'accueil ? (car "trop technique" ?), mais je me rends compte que c'est bien dommage qu'on ait pas un espèce d'encart dans un coin qui liste juste les titres des articles par date de publication décroissante, toute catégories confondues, parce là si le visiteur de passage n'a pas la curiosité d'ouvrir chaque catégorie, ben il verra pas... fzs tu sais si ça serait possible ?

A le réflexion franky je pense que tu devrais quand même le mettre en page d'accueil... ça rend le portail vivant !

[naz]

Gros et très beau boulot!!! Merci infiniment 

[franky82]

Wow ! quel article !! capello ! (mais ça dit qu'il est publié depuis le 04/05 ? )

Et je suppose que tu as fait exprès de pas le mettre sur la page d'accueil ? (car "trop technique" ?), mais je me rends compte que c'est bien dommage qu'on ait pas un espèce d'encart dans un coin qui liste juste les titres des articles par date de publication décroissante, toute catégories confondues, parce là si le visiteur de passage n'a pas la curiosité d'ouvrir chaque catégorie, ben il verra pas... fzs tu sais si ça serait possible ?

A le réflexion franky je pense que tu devrais quand même le mettre en page d'accueil... ça rend le portail vivant !

J'y ai passé plusieurs jours, petit à petit !
Publié le 04/05  comme l'article d'origine, effectivement je ne l'ai pas mis en page d'accueil car assez pointu mais si on me dit qu'on peut l'y mettre, je ferais la modif. 
(et puis, je ne voulais pas que mon article sur le calcul pour CoVID-19 descende trop vite...)

C'est vrai qu'un encart avec les derniers articles publiés serait sympa, qu'on voit rapidement ce qui n'est pas sur la page d'accueil ! 

[ousermaatre]

  franky,

tu peux le publier en page d'accueil dans 2-3 semaines comme cela ça laisse ton article sur le Covid en première ligne quelques temps.

[franky82]

OK, je ferai comme ça !