Rosetta@home

[JeromeC]

C'est peut être Rosetta Beta qui intègre ça ?

Rosetta beta est la seule appli qui a été mise à jour (en août) les autres ne le sont plus depuis longtemps. Mais il n'y a aucune info à ce sujet pour le moment.

[JeromeC]

Bobovitz a (évidemment) répondu, il convient que le projet ne communique pas mais il a montré ceci (un an d'âge "seulement") qui précise que "Computing resources were provided by the volunteers who have donated the spare CPU cycles of their cellular telephones and computers to the Rosetta@Home project; the Hyak supercomputer at the University of Washington; and the Rhino cluster at the Fred Hutchinson Cancer Center"

Donc ça, c'est cool.

[JeromeC]

D'autres infos intéressantes :

(bobovitz)

(moi) J'espère que c'est toujours le cas avec la ou les applications actuelles et pour l'avenir.
Avez-vous des informations sur la version bêta ?
Et à propos de TrRosetta ?

Les protocoles Rosetta (qui sont les mêmes que ceux de Rosetta@Home et Foldit) sont utilisés quotidiennement sur le serveur Robetta.

Le problème des résultats/publications est que beaucoup d'entre eux sont derrière des paywall (Nature, Science, etc).
Pour cet article (avril 2024), par exemple, il faut payer. Mais Bakerlab, heureusement, l'a rendu disponible gratuitement :

Nous remercions l'équipe de supercalculateurs Hyak de l'Université de Washington et les volontaires du projet Rosetta@home pour la mise à disposition de ressources de calcul.

(faconet) En ce qui concerne TrRosetta, il semble qu'il ait été remplacé par RoseTTAFold, comme on peut le voir sur la page Robetta où il est indiqué « 27 mai 2022 - TrRosetta n'est plus disponible en tant qu'option de modélisation. Veuillez utiliser la méthode plus précise, RoseTTAFold'.

Je ne crois pas qu'il y ait d'informations sur la version Beta 6.06. Chez Ralph, par contre, on testait une nouvelle application appelée RoseTTAFold All-Atom. Le dernier travail pour cette application a eu lieu début septembre, d'après ce que j'ai pu lire sur les forums. La version 4.29 de Rosetta a également été testée le 4 août 2024.

Dans l'ensemble, le développement semble actif, mais la communication est pratiquement inexistante.

Donc heureusement qu'il y a des crunchers dans les projets boinc !!

[[AF>Amis des Lapins] Jean-Luc]

Faudra que j'en lance à nouveau un de ces jours !