Le Forum de l'Alliance Francophone

Boinc et les projets distribués => Biologie => Discussion démarrée par: Sébastien le 29 avril 2010 à 20:35

Titre: [Citizen Science Grid] DNA@home
Posté par: Sébastien le 29 avril 2010 à 20:35
(http://volunteer.cs.und.edu/dna/ch7f19.jpg)
L'objectif de DNA@Home est de découvrir ce qui régule les gènes de l'ADN. Avez-vous remarqué que les cellules de la peau sont différentes d'une des cellules musculaires, qui sont différentes d'une des cellules osseuses, même si toutes les cellules de votre corps a chaque gène dans votre génome? C'est parce que tous les gènes sont "sur" tout le temps. Selon le type de cellules et de ce que la cellule essaie de faire à un moment donné, seul un sous-ensemble de ces gènes est utilisé, et le reste est fermé. ADN @ home utilise des algorithmes statistiques pour déverrouiller la clé de cette régulation différentielle, en utilisant votre bénévolat ordinateurs.

Le principal moyen par lequel les gènes sont régulés est au stade de la "transcription", où une molécule appelée polymérase lit long de l'ADN à partir du début du gène à la fin de la création d'un gène de l'ARN messager. D'autres molécules, appelées facteurs de transcription, se lient à l'ADN vers le début du gène et peuvent aider à recruter de la polymérase ou ils peuvent obtenir de la manière de, ou inhibent la polymérase. C'est la présence ou l'absence de la liaison de ces facteurs de transcription qui déterminent si un gène est "on" ou "off", mais, pour la plupart, les scientifiques ne savent pas quels sont les facteurs de transcription est responsable de la régulation des gènes.

Les facteurs de transcription ont «doigts» qui préfèrent une certaine somme, peu soigné dans le modèle de nucléotides "lettres" d'une séquence d'ADN, mais dans de nombreux cas nous ne savons pas ce que ces modèles sont. Notre logiciel de recherche de courtes séquences de nucléotides qui apparaissent plus ou moins les mêmes débuts près de gènes multiples et qui semblent aussi plus ou moins la même dans les emplacements correspondants dans les génomes d'espèces apparentées. Comme les séquences d'ADN sont énormes, allant de millions de milliards de nucléotides, et ces séquences sont courtes et seulement environ conservée d'un site à l'autre, c'est un vrai problème aiguille dans une botte de foin-et exige beaucoup de puissance de calcul. Nous espérons que votre ordinateur peut vous aider.

Nos plans actuels portent sur la lutte contre le génome de Mycobacterium tuberculosis à bien comprendre comment la tuberculose accomplit ce qu'il fait - afin que d'autres peuvent utiliser cette information pour arrêter cette maladie qui tue des millions chaque année. Nous prévoyons également de lutter contre Yersinia pestis, la cause de la peste bubonique.

DNA@Home est basé au Rensselaer Polytechnic Institute (http://www.rpi.edu/).

DNA@Home est actuellement géré par:

    Travis Desell (http://www.cs.rpi.edu/%7Edeselt/), Associé de recherche postdoctoral en sciences informatiques
    Chen Lei, assistante de recherche d'études supérieures en informatique
    Magdon Malik-Ismail (http://www.cs.rpi.edu/%7Emagdon/), Professeur agrégé d'informatique
    Lee Newberg (http://www.rpi.edu/%7Enewbel/), professeur agrégé d'informatique,  État de New York, Centre de recherche scientifique Wadsworth
    Boleslaw Szymanski (http://www.cs.rpi.edu/%7Eszymansk/index.php), Professeur Claire et Roland Schmitt distingué de l'informatique


Url pour s'attacher : http://volunteer.cs.und.edu/csg/

L'Alliance Francophone : http://volunteer.cs.und.edu/csg/team_display.php?teamid=9






31/07/2014

Le projet est revenu d'entre les morts !

Mail reçu:
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19993 UT sont disponibles sur le projet DNA@Home

Un coup d'oeil sur le site:
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generating new work units
Hi Everyone,

It's been awhile but I've generated some new work units today, to test how things are going and if we need to make any updates to the application. We have some new data that we're looking forward to analyzing to try and find areas of DNA that might cause cancer in humans (although the data set we'll be working with is from mice).

I'll keep you all posted as we start generating more work, and let me know if there are any problems with the work units that I just sent out.

cheers,
--Travis 31 Jul 2014, 18:49:40 UTC

Traduction:
Génération de nouvelles UT
Salut tout le monde,

Ça fait longtemps, mais j'ai généré quelques nouvelles UT aujourd'hui pour voir comment les choses fonctionnent et si nous avons besoin de faire quelques mises à jour à l'application. Nous avons de nouvelles données que nous espérons analyser pour tenter de trouver des zones d'ADN qui pourraient provoquer le cancer chez les humains (bien que nous allons travailler sur un jeu de données de souris).
Je vous tiendrai tous au courant quand nous commencerons à générer davantage de travail, et veuillez me faire savoir s'il y a des problèmes avec les UT que je viens d'envoyer.

A bientôt
Travis

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Infos du 18/04/2012 :


Salut tout le monde,

Les dernières semaines ont été mouvementées ! J'étais à New York pour une présentation au Centre de recherche T.J. Watson d'IBM. Maintenant que je suis de retour, j'ai quelques informations supplémentaires pour tous.

Tout d'abord, j'ai fait un portail sur la page d'accueil de ce serveur de calcul volontaire avec des liens vers les autres projets que nous ferons tourner ici : http://volunteer.cs.und.edu/index.html (http://volunteer.cs.und.edu/index.html)

Notamment, SubsetSum@Home et Wildlife@home. Nous commençons à avoir des vidéos pour Wildlife@home qui devraient s'avérer vraiment intéressantes, cela vaudrait le coup de jeter un coup d’œil à ce projet. Je commencerai aussi à envoyer des UT pour SubsetSum@Hom d'ici la fin de la semaine (car nous avons une date limite pour une conférence et aimerions avoir le projet prêt et en fonctionnement d'ici là). Une fois que SubsetSum@Home sera prêt et enverrai des UT, je mettrai à jour l'application client ici (pour remédier au problème des points de sauvegarde) et enverrai quelques UT supplémentaires.

D'ici là, j'espère que les vidéos que nous mettrons sur Wildlife@home vous maintiendront intéressés et que les UT sur SubsetSum@Home garderont vos ordinateurs occupés.

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Post de Modesti Mai 2011 concernant une éventuelle application GPU :

Citer
Pas sûr. D'abord, il faut que l'appli CPU fasse correctement ce qu'on lui demande. Ensuite, Travis a dit que l'appli n'était pas très "parallélisable" et que par conséquent il n'y aurait pas beaucoup de gain de temps. De plus, il semblerait que les GPU n'aiment pas les "longs doubles" et il ne sait pas encore comment traiter le problème des différences de précision.

AMHA, c'est pas demain la veille qu'on verra du GPU ic

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Post de Modesti Juillet 2010 :

Citer
Après avoir relu les objectifs de DNA@home et ceux de RNA World, je crois qu'il y a une légère différence.
DNA@home cherche à comprendre le fonctionnement du Mycobacterium tuberculosis (déclencheur de la tuberculose) et par la suite du Yersinia pestis (déclencheur de la peste bubonique) à fond, avec tout ce que le génome peut leur révéler. (Enfin, c'est ce que j'ai cru comprendre à partir du dernier § de leur présentation.)
Titre: Re : DNA@home
Posté par: modesti le 29 avril 2010 à 21:06
Intéressant :)

Par contre, en lisant ça :
Citer
The goal of DNA@Home is to discover what regulates the genes in DNA. Ever notice that skin cells are different from a muscle cells, which are different from a bone cells, even though every cell in your body has every gene in your genome? That's because not all genes are "on" all the time. Depending on the cell type and what the cell is trying to do at any given moment, only a subset of the genes are used, and the remainder are shut off.
je me demande si ça ne fait pas doublon avec RNA World :??:

Extrait description de projet RNA World: http://www.rechenkraft.net/wiki/index.php?title=RNA_World/Project_description/en
Citer
Fascinatingly, the initial analysis of the human genome sequence revealed that, apparently, only a very small fraction of the DNA of our genome is encoding proteins. Scientists at first thought "what is all this junk DNA about?" or "can't we just delete it?". Today, it has become clear that probably a major fraction of regulatory events taking place in a human cell might be governed by small RNAs, the so-called miRNAs. Among other functions, these appear responsible for making sure that a skin cell becomes a skin cell while a muscle, liver or hair cell differentiates to a muscle, liver or hair cell during development and all this although the genetic material (DNA) of all of these very different cell types is essentially identical.
Titre: Re : Re : DNA@home
Posté par: supersnoopy le 29 avril 2010 à 21:58

ça semble proche, en effet...

RNA
Citer
The goal of this RNA World sub-project is to systematically identify all known RNA family members in all organisms known to date and make the results available to the public in a timely fashion

DNA
Citer
Our software looks for short sequences of nucleotides that appear more-or-less the same near multiple gene beginnings and which also appear more-or-less the same in the corresponding locations in the genomes of related species.

L'AF n'est pas encore crée sur ce projet.

Si j'ai bien compris, il y a des comptes "fondateurs" qui servent à cela ?
Titre: Re : DNA@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 29 avril 2010 à 22:15
merci pour l'infos.  je suis inscrit, merci aux admins de crée l'équipe pour ce projet.

Mais pas d'uts pour l'instant, dommage

Encore en test, alors patience...
Titre: Re : DNA@home
Posté par: al@ON le 29 avril 2010 à 22:45

Merci seb pour l'info. :jap:
Titre: Re : DNA@home
Posté par: tristesire le 30 avril 2010 à 00:12
compte af crée.
Titre: Re : Re : DNA@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 30 avril 2010 à 15:40
compte af crée.

ok ainsi que l'équipe
Titre: Re : DNA@home
Posté par: modesti le 30 avril 2010 à 19:11
attachée :ange:
Titre: Re : Re : DNA@home
Posté par: fr@ntz le 30 avril 2010 à 22:40
attachée :ange:
et UOTD dans la foulée :gloiraseti:
Titre: Re : DNA@home
Posté par: modesti le 01 mai 2010 à 00:05
pas fait exprès :D
par contre, j'ai pas pu mettre d'avatar, ça m'a collé direct une page "fatal error" quand j'ai essayé :/
Titre: Re : DNA@home
Posté par: xipehuz le 02 mai 2010 à 22:42
Merci pour l'info.

Attaché, mais il n'y a pas encore de client Linux, ni d'UT, d'ailleurs  :D
Titre: Re : DNA@home
Posté par: modesti le 23 juillet 2010 à 19:24
Des nouvelles ! :bounce:

Citer
Finally an update -- checkpointing working in the application
So I didn't want to send out any workunits until I got checkpointing working, and good news after a couple long weeks and not to mention slamming my head against my computer a few times, the DNA@Home client application has working checkpointing.
This means we should have workunits being sent out within a week or so. We've also gotten the data we need for the Mycobacterium tuberculosis genome, so the first workunits will be doing work on a real genome as opposed to test data.
Expect updates more frequently now that I finally have something working.
--Travis 23 Jul 2010 13:53:49 UTC

Traduction :
Enfin une mise à jour - les points de sauvegarde fonctionnent dans l'application
Je ne voulais pas envoyer d'UT tant que les points de sauvegarde ne fonctionnaient pas et, bonne nouvelle, après de longues semaines - sans parler du nombre de fois où je me suis tapé la tête contre l'ordinateur - l'application du client DNA@home exécute des points de sauvegarde.
Cela signifie que nous devrions avoir des UT à envoyer d'ici une semaine à peu près. Nous avons également eu les données dont nous avons besoin pour le génome du Mycobacterium tuberculosis, les premières UT travailleront donc sur un vrai génome contrairement aux données de test.
Maintenant que j'ai enfin quelque-chose qui fonctionne, attendez-vous à avoir des mises à jour plus souvent.
-- Travis


---
a) Vous pensez que ça vaut une news sur le portail ?

b) Y avait pas déjà RNA World qui travaillait sur le Mycobacterium tuberculosis ?
Titre: Re : DNA@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 23 juillet 2010 à 19:32
merci pour les infos...
Titre: Re : Re : DNA@home
Posté par: al@ON le 24 juillet 2010 à 01:14
...
a) Vous pensez que ça vaut une news sur le portail ?

b) Y avait pas déjà RNA World qui travaillait sur le Mycobacterium tuberculosis ?

Je pense que oui. :D
Titre: Re : DNA@home
Posté par: modesti le 24 juillet 2010 à 16:21
C'est fait (http://www.boinc-af.org/actualites-biologie/1203-un-nouveau-projet-bio-dnahome.html) :D
Titre: Re : Re : DNA@home
Posté par: Pascal94 le 24 juillet 2010 à 17:58
Intéressant :)

Par contre, en lisant ça :je me demande si ça ne fait pas doublon avec RNA World :??:

Des nouvelles ! :bounce:

[...]

a) Vous pensez que ça vaut une news sur le portail ?

b) Y avait pas déjà RNA World qui travaillait sur le Mycobacterium tuberculosis ?

Je pense que oui. :D

et moi aussi je pense que oui, d'ailleurs je confirme avoir déjà vu "Mycobacterium tuberculosis" sur RNA  :heink:

je veus pas dire du mal, mais je trouve qu'avec le nombre de projets qui tournent sur Boinc, y'a sûrement des doublons et pas de coordination  :cpopossib:
Titre: Re : DNA@home
Posté par: modesti le 24 juillet 2010 à 18:44
En fait, je ne suis plus très sûre. :heink:

Après avoir relu les objectifs de DNA@home et ceux de RNA World (http://www.rechenkraft.net/wiki/index.php?title=RNA_World/Project_description/fr), je crois qu'il y a une légère différence.
DNA@home cherche à comprendre le fonctionnement du Mycobacterium tuberculosis (déclencheur de la tuberculose) et par la suite du Yersinia pestis (déclencheur de la peste bubonique) à fond, avec tout ce que le génome peut leur révéler. (Enfin, c'est ce que j'ai cru comprendre à partir du dernier § de leur présentation.)
Citer
Our current plans involve tackling the Mycobacterium tuberculosis genome to thoroughly understand how tuberculosis accomplishes what it does -- so that others can use that information to stop this disease that kills millions every year. We also plan to tackle Yersinia pestis, the cause of bubonic plague.

Alors que RNA World cherche - a priori - à comprendre le pourquoi du comment une cellule devient ce qu'elle est, puisqu'à la base une cellule est capable de tout faire/devenir. Il étudie le "junk DNA" (traduit dans la version française par "foutoir d'ADN" :D) de plein de choses puisqu'on a déjà eu toutes sortes de bactéries, des mammifères...

ché pas :spamafote:
Titre: Re : Re : DNA@home
Posté par: al@ON le 24 juillet 2010 à 19:53
C'est fait (http://www.boinc-af.org/actualites-biologie/1203-un-nouveau-projet-bio-dnahome.html) :D

 :smak:
Titre: Re : DNA@home
Posté par: Netrider le 25 juillet 2010 à 07:33
En tout cas il ni a pas d'ut  :cavapobienmwa:
Titre: Re : DNA@home
Posté par: modesti le 25 juillet 2010 à 07:45
:cpopossib: Faut être un peu patient, Netrider :p

Citer
[...]Cela signifie que nous devrions avoir des UT à envoyer d'ici une semaine à peu près.[...]
Titre: Re : DNA@home
Posté par: popolito le 25 juillet 2010 à 09:26
De toute façon, rien que dans le nom, c'est différent, l'un parle de l'ADN l'autre de l'ARN nah.
Voilà.
Pis y'a un projet boche et un projet ricain (du même institut que celui de milkyway).  :D
Titre: Re : DNA@home
Posté par: miskic le 22 août 2010 à 13:38
une question un peu bête mais comment rejoindre ce projet car l'interface de bam! ne propose pas ce projet par défaut?  :??:
 
Titre: Re : DNA@home
Posté par: supersnoopy le 22 août 2010 à 14:22

tu passes par le client boinc et mets cette adresse :    http://dnahome.cs.rpi.edu/dna/

par contre, pour info, j'y suis abonné depuis 2 mois et n'ai jamais reçu de travail.
Titre: Re : DNA@home
Posté par: miskic le 23 août 2010 à 10:55
j'ai fait comme tu m'as dit. j'ai un compte  :jap:
par contre je ne sais pas comment faire pour le gerer depuis bam...  :??:
ça va se mettre a jour tout seul ? (j'ai utilisé le même identifiant et meme pass que pour mes autre compte sous bam!)
Titre: Re : DNA@home
Posté par: gregoryd01 le 23 août 2010 à 11:05
Apparemment il n'est sous BAM, donc on ne peut pas le gérer par BAM ... Il doit surement y avoir une raison, faut chercher sur le forum de BAM.
Titre: Re : DNA@home
Posté par: supersnoopy le 23 août 2010 à 11:42

est-ce que ce serait parce que le projet n'a jamais encore "démarré" ?

c'est un peu comme sur les sites de stats, il n'apparait pas car personne n'a jamais reçu ou renvoyé de résultats...
Titre: Re : DNA@home
Posté par: miskic le 23 août 2010 à 11:44
le projet semble inconnu sur le forum de boinc. je vais créer un post dans la section nouveaux projets

et apparemment il n'a pas encore envoyé d'unités de calculs effectivement.

je suis malgré tout  l'utilisateur du jour,
et premier dans les top participants avec 0 crédits  :pt1cable:

Titre: Re : DNA@home
Posté par: JeromeC le 25 août 2010 à 06:25
c'est un projet spécial pour ceusses qu'ont pas de CPU ni de GPU :D
Titre: Re : DNA@home
Posté par: supersnoopy le 25 août 2010 à 08:05
 :lol:
Titre: Re : DNA@home
Posté par: Sébastien le 18 octobre 2010 à 19:05
Un premier lot de WU a été crée aujourd'hui.
Pour l'instant, il n'y a qu'une seule application pour Mac et toutes les WU sont parties.
Titre: Re : DNA@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 18 octobre 2010 à 19:27
merci de l'info, pour une fois je crois qu'il commence par l'appli MAC ...
Titre: Re : DNA@home
Posté par: tibidao le 19 octobre 2010 à 12:59
A priori il y a une application linux aussi, je ne sais pas s'il y a des unités.  :jap:

Par contre, j'ai regardé sur wuprop, il y a un temps donné pour les unités (seulement pour un type de proc pour l'instant), mais pas de données checkpoint. ça signifie qu'il n'y a pas assez de données ou qu'il n'y a pas de checkpoints ? ;)
Titre: Re : Re : DNA@home
Posté par: al@ON le 19 octobre 2010 à 14:36
A priori il y a une application linux aussi, je ne sais pas s'il y a des unités.  :jap:
...
Citer
Gibbs sampler
Linux running on an Intel x86-compatible CPU              0.04     18 Oct 2010 21:00:38 UTC
Linux running on an AMD x86_64 or Intel EM64T CPU     0.04     18 Oct 2010 21:00:38 UTC
Mac OS 10.4 or later running on Intel                         0.03     18 Oct 2010 19:54:20 UTC
Intel 64-bit Mac OS 10.5 or later                               0.03     18 Oct 2010 19:54:20 UTC
Par contre, impossible pour moi de témoigner sur les "points de sauvegarde" :desole:... ch'uis même pas inscrit sur ce projet. :D
Titre: Re : DNA@home
Posté par: Sébastien le 20 octobre 2010 à 22:35
A priori il y a une application linux aussi, je ne sais pas s'il y a des unités.  :jap:

Par contre, j'ai regardé sur wuprop, il y a un temps donné pour les unités (seulement pour un type de proc pour l'instant), mais pas de données checkpoint. ça signifie qu'il n'y a pas assez de données ou qu'il n'y a pas de checkpoints ? ;)
ça signifie qu'il n'y a pas de checkpoints.
Titre: Re : DNA@home
Posté par: fzs600 le 27 octobre 2010 à 06:44
Enfin du taf recu 2 UT

Citer
   3 Nov 2010 23:49:57 UTC    En cours    ---    ---    ---    ---    Gibbs sampler v0.04
27 Oct 2010 4:35:05 UTC    Terminé, en attente de validation    0.00    5,190.94    16.06    en attente    Gibbs sampler v0.04
:jap:
Titre: Re : DNA@home
Posté par: samuel debergh le 27 octobre 2010 à 07:33
toujours rien :D
Titre: Re : DNA@home
Posté par: samuel debergh le 04 novembre 2010 à 08:42
tes wu n'ont toujours pas été crédité le projet serais  sur stat seb sinon?
Titre: Re : DNA@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 25 novembre 2010 à 23:42
Il parle d'une appli Windows, mais apparemment il a des problèmes avec, il accordera des bonus pour nous remercier de l'attente...

http://dnahome.cs.rpi.edu/dna/forum_thread.php?id=27
Titre: Re : DNA@home
Posté par: modesti le 26 novembre 2010 à 00:17
D'après ce qu'il dit, il a des problèmes à ce que l'appli Windaube retourne les mêmes résultats que Linux. Je sais pas vous, mais moi j'ai pas vu la queue d'une UT - et pourtant les vannes sont ouvertes :/
Titre: Re : DNA@home
Posté par: fzs600 le 26 novembre 2010 à 07:37
J'en ai deux en pending depuis un moment
Citer
   26 Oct 2010 23:49:57 UTC    27 Oct 2010 7:21:14 UTC    Terminé, en attente de validation    0.00    5,232.14    16.19    en attente    Gibbs sampler v0.04
26 Oct 2010 21:15:58 UTC    27 Oct 2010 4:35:05 UTC    Terminé, en attente de validation    0.00    5,190.94    16.06    en attente    Gibbs sampler v0.04
:jap:
Titre: Re : DNA@home
Posté par: fzs600 le 04 février 2011 à 20:44
 :hello:

En faisant un tour sur le fofo du projet,j'ai vu ceci (en anglais ) http://dnahome.cs.rpi.edu/dna/forum_thread.php?id=29 (http://dnahome.cs.rpi.edu/dna/forum_thread.php?id=29)

En gros il remercie les gus (donc moi  :D ) de leur patiente en leur donnant quelques menus credits  pour la "mise en place"

Citer
J'ai donc mis à jour l'utilisateur ou de l'équipe d'accueil / crédit pour tous ceux qui avaient présenté une unité de travail anciennes. Étant donné que vous les gars ont dû attendre si longtemps j'ai été généreux et vous a donné 500 crédits par unité de travail pour la mise en place avec nous alors que nous sommes encore en alpha. S'il ya des problèmes avec le crédit-le moi savoir comme je l'avais sous la main le saisir dans la base de données.
<br>


Je me retrouve a la tete de 1000 credits  :ange:
Titre: DNA@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 16 mars 2011 à 00:44
Apparemment le projet ne devrait pas tarder à vraiment commencer....

http://dnahome.cs.rpi.edu/dna/forum_thread.php?id=32 (http://dnahome.cs.rpi.edu/dna/forum_thread.php?id=32)
Titre: Re : DNA@home
Posté par: modesti le 16 mars 2011 à 10:00
merci pour l'info Boris :jap:
Titre: Re : DNA@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 31 mars 2011 à 22:52
il y a du taf.... :hyperbon:
Titre: Re : DNA@home
Posté par: modesti le 01 avril 2011 à 11:51
oui, et pour des UT test ça paie pas trop mal : 50 pts/UT

en vérifiant, je viens de voir qu'il m'avait filé 2x la même UT : http://dnahome.cs.rpi.edu/dna/workunit.php?wuid=8522
:lol:

une 3è est en cours
Titre: Re : DNA@home
Posté par: samuel debergh le 01 avril 2011 à 12:01
je ne reçois pas de travail.
... c'est bon fallait attendre.
Titre: Re : DNA@home
Posté par: fzs600 le 01 avril 2011 à 12:24
Citer
je ne reçois pas de travail.
Moi non plus je ne recois pas de travail ..........mais c'est vrai que je ne suis qu'un Gnu-linuxiens,ont ne comptes pas nous autres  :jeboude:
Titre: Re : DNA@home
Posté par: samuel debergh le 01 avril 2011 à 13:54
vous êtes hors la loi vous ne faites pas marcher l'économie de bilou ( licence gratuite) XD
Titre: Re : DNA@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 03 avril 2011 à 20:28
@Séb : c'est pas possible de reprendre ma présentation du projet dans le premier post ?

En corrigeant les fautes de trad... :desole:

http://www.boincedls.org/forum/viewtopic.php?id=484 (http://www.boincedls.org/forum/viewtopic.php?id=484)
Titre: Re : DNA@home
Posté par: Infomat le 04 avril 2011 à 02:30
WU reçues...
Titre: DNA@home - News
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 22 avril 2011 à 13:02
Peut-être du taf la semaine prochaine car pour l'instant ils analysent les unités déjà calculer et l'application doit être mis à jour par Travis Desell qui était pris sur le projet Milkyway@Home...

http://dnahome.cs.rpi.edu/dna/forum_thread.php?id=79&nowrap=true#459
Titre: Re : DNA@home
Posté par: Geantvert le 28 avril 2011 à 18:58
A priori des tâches ont été expédiées hier soir, mais je n'ai rien vu passer  :/  (et dans les stats j'ai l'impression qu'il y a eu une raffle  (http://statsbzh.boinc-af.org/list.php?project_id=dna) :??: )
Titre: Re : DNA@home
Posté par: fzs600 le 28 avril 2011 à 20:02
 :kookoo: Kevin_L

Peut-etre du pending ?
Titre: Re : Re : DNA@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 28 avril 2011 à 20:12
A priori des tâches ont été expédiées hier soir, mais je n'ai rien vu passer  :/  (et dans les stats j'ai l'impression qu'il y a eu une raffle  (http://statsbzh.boinc-af.org/list.php?project_id=dna) :??: )

Moi non plus j'ai rien vus.... :??: :desole:
Titre: Re : Re : DNA@home
Posté par: Geantvert le 28 avril 2011 à 20:46
:kookoo: Kevin_L

Peut-etre du pending ?
Pas bête, du coup j'ai vérifié et...

"Pending credit: 0.00"   :desole:
Titre: Re : DNA@home
Posté par: modesti le 29 avril 2011 à 09:20
Depuis quelque temps, on ne peut plus se fier à ce qui est affiché dans la rubrique "Pending". Chez certains projets (notamment MalariaControl), ça affiche Pending = 0, et quand on va dans "Tâches" (Tasks), on trouve des UT en pending.

:jap:
Titre: Re : DNA@home
Posté par: samuel debergh le 29 avril 2011 à 10:01
ah ptete le retour de dna je pourrais atteindre 100 000 alors :jap:
Titre: Re : DNA@home
Posté par: cedricdd le 02 mai 2011 à 00:20
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Since I've implemented BOINCs new credit policy on milkyway@home for the nbody application, I'm also testing it here. It will probably take awhile for the credit to get fully adjusted, and since we're in alpha i'm going to be multiplying it by 5. If you have any problems with it, let me know.

http://dnahome.cs.rpi.edu/dna/forum_thread.php?id=83 (http://dnahome.cs.rpi.edu/dna/forum_thread.php?id=83)

Étant donné que j'ai mis en œuvre la nouvelle politique de crédit sur milkyway@home pour l'application nbody, je vais également la tester ici. Il faudra probablement un certain temps avant que les crédits soient correctement ajustée, et puisque nous sommes en alpha, je vais les multiplier par 5. Si vous avez des problèmes avec les crédits, tenez moi au courant.

En gros terminé l'opulence du 50 crédits pour toutes les taches.
Titre: Re : DNA@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 02 mai 2011 à 01:10
peut pas tester car il y a plus de taf...
Titre: Re : DNA@home
Posté par: cedricdd le 02 mai 2011 à 01:26
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251471    124426    2119    1 May 2011 | 20:44:58 UTC    1 May 2011 | 21:11:06 UTC    Terminé et validé    687.53    671.23    4.54    Gibbs sampler v0.06
251400    124391    2119    1 May 2011 | 20:40:28 UTC    1 May 2011 | 21:02:42 UTC    Terminé et validé    731.92    671.49    12.89    Gibbs sampler v0.06
251398    124390    2119    1 May 2011 | 20:40:28 UTC    1 May 2011 | 21:05:00 UTC    Terminé et validé    748.04    679.40    12.30    Gibbs sampler v0.06

Sacré différence  :/
Titre: Re : DNA@home
Posté par: modesti le 02 mai 2011 à 07:33
ouais :/

chez moi, c'est pas aussi dramatique (http://dnahome.cs.rpi.edu/dna/results.php?hostid=669&offset=0&show_names=0&state=3&appid=), mais heureusement qu'il a multiplié les crédits normalement accordés par 5
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248634    123014    1 May 2011 | 18:16:03 UTC    2 May 2011 | 4:18:12 UTC    Completed and validated    1,184.86    1,072.80    24.85    Gibbs sampler v0.06
248442    122918    1 May 2011 | 18:08:24 UTC    2 May 2011 | 3:30:04 UTC    Completed and validated    1,189.41    1,066.97    24.33    Gibbs sampler v0.06
248441    122917    1 May 2011 | 18:08:24 UTC    2 May 2011 | 2:30:42 UTC    Completed and validated    1,188.32    1,080.18    19.32    Gibbs sampler v0.06
248304    122849    1 May 2011 | 18:01:46 UTC    2 May 2011 | 1:57:19 UTC    Completed and validated    1,139.39    1,069.48    16.47    Gibbs sampler v0.06
Titre: Re : DNA@home
Posté par: fzs600 le 06 mai 2011 à 05:06
 :kookoo:

Applications pour Gnu-linuxiens enfin disponible

Citer
5 May 2011 | 22:52:58 UTC    6 May 2011 | 1:59:39 UTC    Terminé et validé    821.21    709.58    63.86    Gibbs sampler v0.13
5 May 2011 | 22:52:58 UTC    6 May 2011 | 1:59:39 UTC    Terminé et validé    710.16    641.51    28.12    Gibbs sampler v0.13

 :jap:
Titre: DNA@home - GPU ?
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 06 mai 2011 à 13:41
Bientôt une appli GPU ?

http://dnahome.cs.rpi.edu/dna/forum_thread.php?id=26&nowrap=true#451
Titre: Re : DNA@home
Posté par: modesti le 06 mai 2011 à 14:37
Pas sûr. D'abord, il faut que l'appli CPU fasse correctement ce qu'on lui demande. Ensuite, Travis a dit (http://dnahome.cs.rpi.edu/dna/forum_thread.php?id=26&nowrap=true#355) que l'appli n'était pas très "parallélisable" et que par conséquent il n'y aurait pas beaucoup de gain de temps. De plus, il semblerait que les GPU n'aiment pas les "longs doubles" (http://dnahome.cs.rpi.edu/dna/forum_thread.php?id=26&nowrap=true#352) et il ne sait pas encore comment traiter le problème des différences de précision.

AMHA, c'est pas demain la veille qu'on verra du GPU ici :spamafote:
Titre: Re : Re : DNA@home
Posté par: Prof le 06 mai 2011 à 18:47
:kookoo:

Applications pour Gnu-linuxiens enfin disponible

 :jap:

Et toutes les apllis ont été mises à jour entre hier et aujourd'hui!!! :bounce: :bounce:
Titre: DNA@home - 64 bits
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 06 mai 2011 à 19:25
oui 64 bits pour toutes aussi....
Titre: Re : Re : DNA@home
Posté par: al@ON le 06 mai 2011 à 21:37
...
Citer
5 May 2011 | 22:52:58 UTC    6 May 2011 | 1:59:39 UTC    Terminé et validé    821.21    709.58    63.86    Gibbs sampler v0.13
5 May 2011 | 22:52:58 UTC    6 May 2011 | 1:59:39 UTC    Terminé et validé    710.16    641.51    28.12    Gibbs sampler v0.13

C'est pas un peu n'importe quoi les crédits là... :??:
Titre: Re : DNA@home
Posté par: fzs600 le 06 mai 2011 à 21:49
Citer
C'est pas un peu n'importe quoi les crédits là... :??:
Tu veux dire que ca sur crédite,je trouve aussi  :cpopossib: 
Titre: Re : Re : DNA@home
Posté par: al@ON le 06 mai 2011 à 23:09
Tu veux dire que ca sur crédite,je trouve aussi  :cpopossib:

C'est le moins que l'on puisse dire. :lol:
Titre: Re : DNA@home
Posté par: bordi le 02 juin 2011 à 22:07
Bonjour,

j'ai ajouté le projet DNA@Home en plus du seti, vu que j'ai des processeurs qui cherchent à s'occuper, mais je me suis apercu que
le projet n'est pas encore lancé, vu qu'il n y a pas de données à traiter.

Ma config :
Intel(R) Core(TM) i7 CPU X 980 @ 3.33GHz (12 processors)
2 x CAL ATI Radeon HD 5800 series (Cypress) (1024MB)
12GB ram
1000GB disque+ bientot 2000GB

le dernier message que j'ai lu sur le forum.  On dirait qu'il va travailler sur le code du serveur.

http://dnahome.cs.rpi.edu/dna/forum_thread.php?id=109#813

Citer
status update
Just had a long meeting today -- I think we've come up with a strategy for making workunits available in a more consistent manner. Should be updating the server code this week, and then expect a bunch of workunits.
 
--Travis1 Jun 2011 | 22:50:57 UTC · Comment
Titre: Re : DNA@home
Posté par: fzs600 le 02 juin 2011 à 22:17
 :hello: bordi

Bienvenue parmi nous

Pour DNA, si le projet est bien  lancer,mais actuellement il n'y a pas de travail il faut patienter 

En tout cas bien ta config  :)

Bon crunch

 :jap: 
Titre: Re : DNA@home
Posté par: kasur le 03 juin 2011 à 12:18
 :hello: Bienvenue
Titre: Re : DNA@home
Posté par: modesti le 25 août 2011 à 08:13
Citer
Work flowing again!
Finally, we have some new workunits for you guys to crunch. I'm hoping to make some changes in the next few weeks that will get a much more steady flow of workunits out to everyone.

--Travis 24 Aug 2011 | 19:40:06 UTC

Traduction :
Le travail coule à nouveau !
Finalement, nous avons quelques nouvelles UT à vous donner à cruncher. J'espère faire quelques modifications dans les prochaines semaines qui donneront un flux bien plus stable d'UT pour tout le monde.

---
Trouvé cette info parce que j'avais vu que j'avais eu des crédits ce matin... :hyperbon:
Titre: Re : DNA@home
Posté par: fzs600 le 25 août 2011 à 08:44
Merci modesti   :kookoo:

J'avais pourtant regardé mes stats ce matin et j'avais pas vu  :lol:

Mais dediou qu'est ce que ca surcredite !  :eek:
Titre: Re : DNA@home
Posté par: modesti le 25 août 2011 à 09:48
C'est vrai que c'est bien payé (j'avais même pas fait gaffe avant). Peut-être parce que c'est toujours en phase de test ?
Titre: Re : Re : DNA@home
Posté par: fzs600 le 25 août 2011 à 10:51
C'est vrai que c'est bien payé (j'avais même pas fait gaffe avant). Peut-être parce que c'est toujours en phase de test ?

C'est surtout en phase de : "viendez chez nous ont payent mieux que les autres. "   :gno:
Titre: Re : DNA@home
Posté par: modesti le 25 août 2011 à 11:10
:ptdr:

Chuuuuuuuuuuuut ! Faut pas le dire trop fort, sinon les autres vont nous piquer les UT...
Titre: Re : DNA@home
Posté par: Pascal94 le 25 août 2011 à 11:28
 :shy:
Titre: Re : DNA@home
Posté par: [AF>Libristes] nico8313 le 25 août 2011 à 11:30
De quoi ???? Qu'ouis-je ????
Des p'tits points par ici ???

 :D :D :D
Titre: Re : DNA@home
Posté par: ousermaatre le 13 octobre 2011 à 14:38
News

Bonjour tout le monde,


Si vous désirez jeter un coup d'oeil sur le code que vous exécutez avec le projet DNA@Home, j'ai créé un référentiel public sur github pour notre application :


https://Github.com/travisdesell/dnaathome_client


--Travis20 Sep 2011 | 23:54:37 UTC · Commentaire
Titre: Re : DNA@home
Posté par: Pascal94 le 14 octobre 2011 à 20:13
merci Ouser  :jap:... mais quézako ?
Titre: Re : DNA@home
Posté par: Sébastien le 14 octobre 2011 à 20:27
Le code source de l'application.
Titre: Re : DNA@home
Posté par: ousermaatre le 22 octobre 2011 à 02:34
Unités de travail en plus grand nombre et mises à jour.

Bonjour tout le monde !

Nous démarrons un nouveau lot d'UTs sur le projet.
J'ai également terminé  la nouvelle version de l'application, normalement celle-ci devrait bientôt arriver sur le serveur.
Je pense, j'espère, pouvoir commencer à la tester dès la semaine prochaine.
La nouvelle version de l'application va permettre d'offrir plus de travail  (UTs), en une seule fois, et sera disponible pour tous ceux qui l'attende avec impatience. :)


--Travis          21 Oct 2011 | 19:56:31 UTC
Titre: Re : DNA@home
Posté par: al@ON le 22 octobre 2011 à 12:21
Bonne nouvelle :hyperbon:... merci ouser. ;)
Titre: Re : DNA@home
Posté par: ousermaatre le 31 octobre 2011 à 10:04
les problèmes de validation devraient être réglés.

J'ai mis à jour les fenêtres, les versions OSX et linux (sauf pour les 32 bit linux car j'ai désactivé cette machine au Bureau avant de partir à la maison pour le week-end),
mais néammoins les unités devraient encore se valider correctement à l'instar des unités des nouvelles applications.

Je voudrais savoir si vous rencontrez d'autres problèmes de validation avec la version 0,20 de l'application ? Contactez-moi.


Travis
Titre: Re : DNA@home
Posté par: modesti le 31 octobre 2011 à 10:35
Je suppose que BoincLogX reporterait la version 0.20 comme 2.0 (déjà vu sur d'autres projets) ?

En tout cas, sur mes bécanes je n'en ai pas. :spamafote:
Athlon 64 3000+: versions 1.4 / 1.5 / 1.7 / 1.8 / 2.1 / 6 => 0 erreurs
i7 860: versions 1.8 / 6 => 0 erreurs
Pentium M: versions 1.8 / 1.9 / 2.1 => 0 erreurs
Titre: Re : DNA@home
Posté par: fzs600 le 26 février 2012 à 11:10
De l'admin du projet.  :kookoo:

Citer
Salut tout le monde, Juste pour que nous puissions avoir un serveur plus moderne (et je vais avoir un meilleur support pour maintenir le code du serveur mis à jour), l'ADN @ Home va se déplacer plus à l'université du Dakota du Nord (où je suis maintenant à) . La nouvelle adresse pour le projet seront: http://volunteer.cs.und.edu/dna/~~V Donc, une fois que c'est en place et opérationnel (je suis en attente pour le démon http être redémarré sur le serveur), je serai le déplacement de tout le monde les comptes d'ici à là, et puis en arrêtant le projet ici. - Travi
http://dnahome.cs.rpi.edu/dna/forum_thread.php?id=157#1177 (http://dnahome.cs.rpi.edu/dna/forum_thread.php?id=157#1177)

 :jap:
Titre: Re : DNA@home
Posté par: fzs600 le 27 février 2012 à 04:23
La nouvelle URL du projet est celle-ci : http://volunteer.cs.und.edu/dna/ (http://volunteer.cs.und.edu/dna/)
Une petite MAJ du topic.  :kookoo:

Et en plus il y a du  :hyperbon:

 :jap:
Titre: Re : DNA@home
Posté par: modesti le 27 février 2012 à 09:50
Merci pour l'info, fzs600 :jap:
Titre: Re : DNA@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 27 février 2012 à 14:44
dommage, s'est limité à 2 unités....
Titre: Re : DNA@home
Posté par: modesti le 01 mars 2012 à 15:31
J'ai ma première UT dont le nom ne commence pas par "test" :bounce:
Actuellement 6h54 / 70% sur le i7 860.... à suivre :D
Titre: Re : DNA@home
Posté par: cedricdd le 01 mars 2012 à 16:16
Oui Travis a générer 30k de WUs pour un papier, 10k de small, 10k de medium et 10k de long, la durée est normalement 10x supérieur à chaque fois, pour le moment il semble y avoir que des "long" de disponible, les derinères WU de test de ces derniers jours étaient des mediums.
Titre: Re : DNA@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 01 mars 2012 à 17:21
Bonjour,

Les longues s'est une unité ou plusieurs à l'intérieur ?

Super ce n'est plus limité à seulement 2 unités...  :hyperbon:
Titre: Re : Re : DNA@home
Posté par: cedricdd le 01 mars 2012 à 17:33
Bonjour,

Les longues s'est une unité ou plusieurs à l'intérieur ?

Super ce n'est plus limité à seulement 2 unités...  :hyperbon:

Je crois que c'est une seule unité, oui maintenant c'est 3x le nombre de cores, mais vu le temps de calcul des longues je pense qu'il devrait arrêter d'en réclamer avant la limite au vu de la deadline bien courte.
Titre: Re : DNA@home
Posté par: modesti le 18 avril 2012 à 19:57
Des nouvelles de Travis !
Citer
some updates
Hi Everyone,

The last couple weeks have been hectic! I was off in NY to give a presentation at IBM T.J. Watson Research center. Now that I'm back I have a few more updates for everyone.

First, I've made a portal on the front page of this volunteer computing server with links to the other projects we'll be running here: http://volunteer.cs.und.edu/index.html

Notably, SubsetSum@Home and Wildlife@Home. We're starting to get video for wildlife@home, which should prove really interesting so it might be worth taking a look at that project over there. I'll also be starting to send out workunits for SubsetSum@Home by the end of the week (as we have a deadline for a conference and would like to have the project running by then). After SubsetSum@Home is up and sending out workunits, I'll be updating the client application here (to fix the checkpointing issue) and sending out some more workunits.

Until then, hopefully the videos we'll be putting up on wildlife@home will keep you interested, and the workunits at subsetsum@home will keep your computers busy. :)

--Travis 11 Apr 2012 | 18:31:28 UTC

Traduction :
Quelques infos
Salut tout le monde,

Les dernières semaines ont été mouvementées ! J'étais à New York pour une présentation au Centre de recherche T.J. Watson d'IBM. Maintenant que je suis de retour, j'ai quelques informations supplémentaires pour tous.

Tout d'abord, j'ai fait un portail sur la page d'accueil de ce serveur de calcul volontaire avec des liens vers les autres projets que nous ferons tourner ici : http://volunteer.cs.und.edu/index.html

Notamment, SubsetSum@Home et Wildlife@home. Nous commençons à avoir des vidéos pour Wildlife@home qui devraient s'avérer vraiment intéressantes, cela vaudrait le coup de jeter un coup d'oeil à ce projet. Je commencerai aussi à envoyer des UT pour SubsetSum@Hom d'ici la fin de la semaine (car nous avons une date limite pour une conférence et aimerions avoir le projet prêt et en fonctionnement d'ici là). Une fois que SubsetSum@Home sera prêt et enverrai des UT, je mettrai à jour l'application client ici (pour remédier au problème des points de sauvegarde) et enverrai quelques UT supplémentaires.

D'ici là, j'espère que les vidéos que nous mettrons sur Wildlife@home vous maintiendront intéressés et que les UT sur SubsetSum@Home garderont vos ordinateurs occupés. :)

***
Je mets une copie du message chez SubsetSum@Home.
Titre: Re : Re : DNA@home
Posté par: Pascal94 le 18 avril 2012 à 20:13
D'ici là, j'espère que les vidéos que nous mettrons sur Wildlife@home vous maintiendront intéressés
:dingue: :chuidac: :dingue: :chuidac: :dingue: :chuidac: :dingue:

merci la miss  :smak:
Titre: Re : DNA@home
Posté par: Pascal94 le 18 avril 2012 à 20:59
j'ai ouvert un topic ICI (http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,4778.0.html), vu que l'AF y est déjà créée, et compte 5 membres  :jap:
Titre: Re : DNA@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 18 avril 2012 à 21:31
J'ai mis ta traduction sur le portail : http://goo.gl/iKuUc
Titre: Re : DNA@home
Posté par: Pascal94 le 18 avril 2012 à 21:38
ah cool, en plus t'as mis les liens vers les 2 topics  :oki:
Titre: DNA@home - refonte du premier post
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 19 avril 2012 à 20:36
@Séb : Je me suis permis de refaire le premier post....
Titre: Re : DNA@home
Posté par: ousermaatre le 19 avril 2012 à 21:03
beau travail ,merci Poly  :hello:
Titre: Re : DNA@home
Posté par: fzs600 le 27 septembre 2012 à 22:42
De l'admin du projet.  :kookoo:

Citer
Désolé pour les choses étant tellement lent ici, trop de projets en cours à la fois en plus d'être un membre du corps professoral nouvelle! Cependant, j'ai quelques nouvelles assez intéressant pour le projet. Deux nouveaux professeurs ont rejoint l'Université du Dakota du Nord cette année qui travaillent sur ​​l'épigénomique. Donc, nous allons être en mesure d'utiliser les mêmes algorithmes et les applications clientes actuellement utilisés par l'ADN @ Home pour analyser les segments du génome humain -. Dans le cadre pour aider à comprendre la formation du cancer J'espère être envoyer quelques unités de travail à l'aide de nouveaux de nouvelles données (à partir du génome humain!) dès que nous pouvons le faire nettoyer et traiter. Travis -
http://volunteer.cs.und.edu/dna/forum_thread.php?id=181 (http://volunteer.cs.und.edu/dna/forum_thread.php?id=181)

 :jap:
Titre: Re : DNA@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 28 septembre 2012 à 08:13
enfin !!!!
Titre: Re : DNA@home
Posté par: Pascal94 le 28 septembre 2012 à 12:46
 :lestat:
Titre: Re : DNA@home
Posté par: modesti le 31 juillet 2014 à 22:11
Le projet est revenu d'entre les morts ! :bounce: :bounce: :bounce:

Mail reçu:
Citer
19993 UT sont disponibles sur le projet DNA@Home

Un coup d'oeil sur le site (http://volunteer.cs.und.edu/dna/):
Citer
generating new work units
Hi Everyone,

It's been awhile but I've generated some new work units today, to test how things are going and if we need to make any updates to the application. We have some new data that we're looking forward to analyzing to try and find areas of DNA that might cause cancer in humans (although the data set we'll be working with is from mice).

I'll keep you all posted as we start generating more work, and let me know if there are any problems with the work units that I just sent out.

cheers,
--Travis 31 Jul 2014, 18:49:40 UTC

Traduction:
Génération de nouvelles UT
Salut tout le monde,

Ça fait longtemps, mais j'ai généré quelques nouvelles UT aujourd'hui pour voir comment les choses fonctionnent et si nous avons besoin de faire quelques mises à jour à l'application. Nous avons de nouvelles données que nous espérons analyser pour tenter de trouver des zones d'ADN qui pourraient provoquer le cancer chez les humains (bien que nous allons travailler sur un jeu de données de souris).
Je vous tiendrai tous au courant quand nous commencerons à générer davantage de travail, et veuillez me faire savoir s'il y a des problèmes avec les UT que je viens d'envoyer.

A bientôt
Travis
Titre: Re : DNA@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 31 juillet 2014 à 22:24
Merci, je mis remets :)
Titre: Re : DNA@home
Posté par: [AF]Cortanaa le 31 juillet 2014 à 22:29
bon ben j'essaye aussi le sujet me plait bien. :hyperbon:
Edit: Ou pas je le trouve pas dans Boinc?
Titre: Re : DNA@home
Posté par: modesti le 31 juillet 2014 à 22:41
Il faut rentrer l'adresse à la main, Cortanaa. Tu la trouves dans le premier post de ce topic (ou en suivant le lien de mon précédent message ;))


Edit: limite de 3 UT / coeur
Titre: Re : DNA@home
Posté par: RLDF le 01 août 2014 à 01:33
il n'apparait pas dans les stats wuprop ?
seb, peux-tu l'ajouter dans la liste des applications pour la course aux badges ?
Titre: Re : DNA@home
Posté par: bernardP le 01 août 2014 à 07:00
 :kookoo:
Lorsque je cherche une équipe, je n'ai pas d'endroit où cliquer pour rejoindre l'AF, seulement un bouton "connexion" alors que je suis connecté... :siflotte:
Titre: Re : DNA@home
Posté par: [AF>Libristes] Pascal le 01 août 2014 à 07:12
 :kookoo: As-tu essayé le lien donné dans le premier post du topic ?
http://volunteer.cs.und.edu/dna/team_display.php?teamid=20 (http://volunteer.cs.und.edu/dna/team_display.php?teamid=20)
Titre: Re : DNA@home
Posté par: bernardP le 01 août 2014 à 07:33
Vi, bouton "connexion" en haut à droite et bien sûr, rien pour rejoindre.
Ca fonctionnera bien un jour, en attendant ça calcule.
Titre: Re : DNA@home
Posté par: kikiphil le 01 août 2014 à 08:51
J'avais deja le meme probleme , resolu avec un autre navigateur oueb  :kookoo:
Titre: Re : Re : DNA@home
Posté par: RLDF le 01 août 2014 à 09:09
il n'apparait pas dans les stats wuprop ?
seb, peux-tu l'ajouter dans la liste des applications pour la course aux badges ?
merci seb, c'est bon DNA est comptabilisé  :hyperbon:
Titre: Re : DNA@home
Posté par: bernardP le 01 août 2014 à 10:35
Opération réussie, ça s'est réparé tout seul. :D
Titre: DNA@home : fusion et nouveau projet
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 01 août 2014 à 15:57
Apparemment L'admin va fusionner plusieurs projet sous la bannière d'un nouveau nommé "Citizen Science Grid" qui regroupera : Wildlife@Home, DNA@Home, and SubsetSum@Home.

Il y aura des soucis de fusion de nos crédits apparemment...

http://volunteer.cs.und.edu/dna/forum_thread.php?id=261#1574

Citer
So I want to try and start unifying the projects to simplify server updates, checking the forums, etc. Before I get going I want a little feedback as to what I'm planning so everyone is okay with it.

Basically, I'm going to create a new project (probably called "Citizen Science Grid") or something along those lines. Unfortunately, because people have different accounts on each project I can't do an automatic merge of the users and databases. So this means you'd have to create a new account on the new project (when the new project starts those will be the only forums for the site).

When the new project is up and going, I'll allow everyone to transfer their credit from their other accounts via a webpage (basically if you're logged in, you can enter in the user name and id of your account on citizen science grid, hit okay and it will transfer the credit over). So a couple questions about this approach:

1. will it break the credit trackers too badly? I'll subtract credit on the old project to 0, and then add the same amount of credit to the new account on citizen science grid.
2. I kind of want to keep credit for the different projects separate; if I keep different tables and export the stats of each project as it's own part of XML, will that cause any problems? Or would everyone rather just have one combined credit for each of the projects here (Wildlife@Home, DNA@Home, and SubsetSum@Home -- we'll probably be launching another one in the fall as well, so I want to get this done before we go doing that).

So, once I get some feedback, and if people don't have too many issues with this I'll set up the new project and get things started. Otherwise back to the drawing board. :P

thanks, hope to hear from you soon about this!
Titre: Re : DNA@home
Posté par: bernardP le 02 août 2014 à 09:52
Il y a des unités.
Mais ça serait bien de lui dire d'en fabriquer assez pour que l'on puisse atteindre les 500h :jap: :D
Avant de se lancer sur des modifications.  :cpopossib:
Titre: Re : DNA@home
Posté par: nabz le 02 août 2014 à 12:03
Ca :hyperbon: sec !  :miam:
Titre: Re : DNA@home
Posté par: modesti le 03 août 2014 à 11:29
Ca :hyperbon: à sec !  :miam:

:cry:
Titre: Re : DNA@home
Posté par: nabz le 03 août 2014 à 15:06
 :calin: :spamafote:
Titre: Re : DNA@home
Posté par: [AF]Cortanaa le 03 août 2014 à 21:02
Je confirme a sec de chez sec rien du tout  :gno:
Titre: Re : DNA@home
Posté par: nabz le 03 août 2014 à 21:09
En effet, plus d'UT disponibles : http://volunteer.cs.und.edu/dna/server_status.php (http://volunteer.cs.und.edu/dna/server_status.php)

Pour ce qui me concerne, la validation c'est pas dans la poche.  :D

Citer
État: Tous (39) · En cours (0) · Validation pending (36) · Validation inconclusive (3) · Valide (0) · Invalide (0) · Erreur (0)
Application: All (39) · Gibbs sampler (39) · upperCASE (0)
Titre: Re : DNA@home
Posté par: nabz le 07 août 2014 à 19:36
A taaaaaable !  :hyperbon:
Titre: Re : DNA@home
Posté par: Philippe06121966 le 07 août 2014 à 19:54
Bon App :)

Suis parti à la chasse pour quelques jours encore ...  :gun:

Euh non, je ne tue pas les lapins  :ane:

A la chasse à l'étoile Saphire sur WuProp :D
Titre: Re : Re : DNA@home
Posté par: nafrayou le 07 août 2014 à 22:19
A taaaaaable !  :hyperbon:

miam maim  MIAM  .......... !!!!
Titre: Re : DNA@home
Posté par: [AF]Cortanaa le 07 août 2014 à 23:26
A taaaaaable !  :hyperbon:
Cela remarche chez toi? Moi il me reste un seul calcul et rien dans la liste d'attente?
A moins qu'il faille attendre le nouveau projet "Citizen Science Grid"
Titre: Re : DNA@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 08 août 2014 à 11:55
Nouveau site : http://volunteer.cs.und.edu/csg/
Titre: Re : DNA@home
Posté par: [AF]Cortanaa le 08 août 2014 à 12:17
Projet ajouté.
Par contre le site marche mal. J'arrive pas à naviguer dans les onglets ils s'ouvrent pas.
Du coup, on peux virer le projet DNA de Boinc?
Titre: Re : DNA@home
Posté par: mamouth le 08 août 2014 à 13:00
Le nouveau projet Citizen science groupe ne fonctionne pas encore

DNA se trouve là
http://volunteer.cs.und.edu/dna/

mais pas d'ut pour le moment
Titre: Re : DNA@home
Posté par: [AF]Cortanaa le 08 août 2014 à 13:23
Ma question est plus de savoir si le DNA que l'on avait avant Citizen science est toujours utile ou non?
Titre: Re : DNA@home
Posté par: Hildor le 08 août 2014 à 21:12

Bien sur, que oui !
Il y a maintenant quelques UT qui arrives parfois

https://statseb.boinc-af.org/nb_ut.py?projet=117
Titre: Re : DNA@home
Posté par: [AF]Cortanaa le 12 août 2014 à 17:35
ok merci.
Je pensais que le nouvel ensemble avait absorbé l'ancien et que du coup on pouvait supprimer DNA et le remplacer par Citizen science.
Titre: Re : DNA@home
Posté par: PhilTheNet le 09 décembre 2014 à 06:47
Salut,

qlq connait le nom des applis DNA pour mettre dans app_config ?

j'ai tenté DNA au blair pour avoir en réponse les noms exacts des applications connues (ca marche pour tous les autres projets) et j'ai comme réponse :

Your app_config.xml file refers to an unknown application 'dna'. Known applications: None  :rhaa:

 :??: :??: :??:
Titre: Re : DNA@home
Posté par: Philippe06121966 le 09 décembre 2014 à 06:51
 :hello:

<app_config>
   <app>
      <name>Gibbs</name>

      <max_concurrent>8</max_concurrent>

      </app>
</app_config>

 :kookoo:
Titre: Re : DNA@home
Posté par: PhilTheNet le 09 décembre 2014 à 06:56
Merci mais ca marche pas

gibbs idem
gibbs_snail idem

 :??:
Titre: Re : DNA@home
Posté par: Philippe06121966 le 09 décembre 2014 à 06:59
Gibbs

Çà devrait fonctionner pourtant ...

Il faut mettre la majuscule, et éventuellement redémarrer BM ...
Titre: Re : DNA@home
Posté par: PhilTheNet le 09 décembre 2014 à 07:03
j'ai essayé Gibbs et gibbs meme reponse :

Mar  9 déc 06:54:07 2014 | Universe@Home | Your app_config.xml file refers to an unknown application 'Gibbs'.  Known applications: None

C le  Known applications: None qui me plait pas s'il connait pas le nom de son application....
Titre: Re : DNA@home
Posté par: PhilTheNet le 09 décembre 2014 à 07:08
Trouvé,

c'est bien gibbs y'avait une couffe au niveau des repertoires

Thks
Titre: Re : DNA@home
Posté par: Philippe06121966 le 09 décembre 2014 à 07:19
Ah oui, dans Universe@Home, il n'y a pas de Gibbs ;)

 :hello: :kookoo:

EDIT : Je me demande bien ce que ce chef d'équipe du NCIS vient faire dans ce projet ...  :??:

 :marcp:
Titre: Re : DNA@home
Posté par: PhilTheNet le 09 décembre 2014 à 07:21
Je change de marque de KF  :D
Titre: Re : DNA@home
Posté par: JeromeC le 09 décembre 2014 à 09:49
Mmmm je comprends plus rien comment c'est possible que DNA marche toujours puisque le but de CSG est d'absorber les trois anciens projets et qu'il a fusionné les points ? (ou alors j'ai rêvé ??)

Et moi j'avais de bonnes grosses erreurs dans mon BM disant qu'il trouvait plus les sites sur WildLife et DNA donc je les ai "logiquement" viré de mon boinc, d'autant plus que sur mon compte CSG j'ai bien les applis suivante sélectionnées

Wildlife@Home Motion Detection
Wildlife@Home Feature Detection (SURF)
Wildlife@Home Descriptor Collection (SURF)
DNA@Home Gibbs Sampler
SubsetSum@Home Sum Calculator

donc c'est quoi ce souk ??
Titre: Re : DNA@home
Posté par: PhilTheNet le 09 décembre 2014 à 09:56
C'est bien CSG http://volunteer.cs.und.edu/csg/dna/ (http://volunteer.cs.und.edu/csg/dna/) mais comme le projet se nomme DNA@Home j'ai mis mon message sur l'entrée DNA du forum  :desole:
Titre: Re : DNA@home
Posté par: PhilTheNet le 11 décembre 2014 à 19:54
Ce soir toutes les ut DNA partent en erreur  :o

Ps: y'a une rubrique csg d'ouverte sur le forum j'ai pas trouvé  ?  :desole:
R
Titre: Re : DNA@home
Posté par: modesti le 11 décembre 2014 à 20:05
Le topic de Citizen Science Grid (http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,6236.0.html) est là.

D'ailleurs, si un gentil modo voulait bien le déplacer vers les "Multi-catégories", ce serait gentil :jap:
Titre: Re : DNA@home
Posté par: PhilTheNet le 11 décembre 2014 à 20:10
Thks
Titre: Re : DNA@home
Posté par: Philippe06121966 le 11 décembre 2014 à 20:20
Il y a un topic CSG, mais on peut continuer à discuter de DNA ici, non ?  :??:

 :hello: :kookoo:
Titre: Re : DNA@home
Posté par: PhilTheNet le 11 décembre 2014 à 20:29
Vu que c'est le premier forum que je fréquente ou c'est pas le Bronx total....La parole est aux modos  :D

Titre: Re : DNA@home
Posté par: modesti le 11 décembre 2014 à 21:07
Il y a un topic CSG, mais on peut continuer à discuter de DNA ici, non ?  :??:

 :hello: :kookoo:

Perso, je pense aussi. On a bien un topic WCG général et un topic par sous-projet.
Peut-être juste renommer le topic "[CSG] DNA@home"?
:spamafote:
Titre: Re : DNA@home
Posté par: JeromeC le 11 décembre 2014 à 23:00
D'ailleurs faut qu'on fasse aussi les demandes pour la barre de l'AF pour regrouper les 3 anciens dans un même CSG en catégorie multi, avec les bonnes URL... un peu la flemme maintenant... another day.
Titre: [Citizen Science Grid] DNA@home
Posté par: tibidao le 10 juillet 2015 à 12:47
Du nouveau, normalement il devrait y avoir des unités DNA bientôt. L'administrateur sur le forum :

Citer
Soon! I'm hoping in the next day or two to test the new fixed credit for DNA@Home.
(08 juillet 2015)

Traduction : bientôt, j'espère dans les prochains jours, quelques petits tests.  :siflotte:

J'en ai profité pour changer un peu le nom du topic, mettre un nom plus orthodoxe (de la même façon que WCG).  :jap:
Titre: Re : [Citizen Science Grid] DNA@home
Posté par: JeromeC le 10 juillet 2015 à 13:47
Tibi il fait feu de tout bois depuis son retour !

C'est pas mal de partir quelques temps finalement quand tu reviens t'es au top :D

Merci tibi !
Titre: Re : [Citizen Science Grid] DNA@home
Posté par: tibidao le 10 juillet 2015 à 14:25
Ah bah il y a du travail à faire, je participe....  :gno:
Titre: Re : [Citizen Science Grid] DNA@home
Posté par: LOCTET SetiOne le 10 juillet 2015 à 20:50
Mais il est partout notre tibidao, génial  :kookoo: :jap:
Titre: Re : [Citizen Science Grid] DNA@home
Posté par: Antares le 10 juillet 2015 à 21:52
Comme à l'époque...
Titre: Re : [Citizen Science Grid] DNA@home
Posté par: tibidao le 17 juillet 2015 à 12:21
 :hyperbon: :hyperbon: :hyperbon:

Il y a du boulot sur DNA !  :yaya:
Titre: Re : [Citizen Science Grid] DNA@home
Posté par: Scrat65 le 04 décembre 2016 à 17:05
Bonjour,

Le projet DNA@home est-il toujours actif ?
Le statut du serveur indique "not running" et il n'y a aucune tâche à envoyer ou en progrès. Rien non plus dans les News de la page d'accueil de ce sous-projet de CSG.

Bonsoir chez vous
Titre: Re : [Citizen Science Grid] DNA@home
Posté par: DonPanic le 28 avril 2018 à 21:34
4 jours que CSG me crédite que dalle  :rhaa:

j'envisage de changer de crèmerie  :coffeetime:
Titre: Re : [Citizen Science Grid] DNA@home
Posté par: ordralfabetix le 28 avril 2018 à 21:54
Pareil chez moi,il y'a une discussion ouverte ici (https://csgrid.org/csg/forum_thread.php?id=2520).
J'espère que l'admin va se bouger. :/
Titre: Re : [Citizen Science Grid] DNA@home
Posté par: ordralfabetix le 05 juin 2018 à 18:55
on dirait que le site est encore dans les choux:https://csgrid.org/csg/server_status.php (https://csgrid.org/csg/server_status.php)
 :gno:
Titre: Re : [Citizen Science Grid] DNA@home
Posté par: [AF] fansyl le 06 juin 2018 à 18:21
Serveur de retour: tâches validées et créditées.

 :hello:
Titre: Re : [Citizen Science Grid] DNA@home
Posté par: ordralfabetix le 06 juin 2018 à 18:29
énéfé.
 :jap:
Titre: Re : [Citizen Science Grid] DNA@home
Posté par: naz le 28 août 2019 à 05:50
J'ai une UT qui calcule depuis 15 jours. Ça vous le fait aussi alors qu'elle était prévu sur 4 jours?
Titre: Re : [Citizen Science Grid] DNA@home
Posté par: modesti le 28 août 2019 à 08:41
Ya de nouveau du taf sur DNA??? Faudra que je m'y remette après le Wow!