Le Forum de l'Alliance Francophone

Boinc et les projets distribués => Biologie => Discussion démarrée par: fr@ntz le 22 décembre 2009 à 11:37

Titre: RNA World (béta)
Posté par: fr@ntz le 22 décembre 2009 à 11:37
(http://www.rnaworld.de/rnaworld//img/rna4.png)
projet bio hébergé par Rechenkraft et administré par Yoyo


Objet : recherches sur l'A.R.N. (http://fr.wikipedia.org/wiki/ARN)

Description : http://www.rechenkraft.net/wiki/index.php?title=RNA_World/Projectdescription/en (http://www.rechenkraft.net/wiki/index.php?title=RNA_World/Projectdescription/en)

Lien projet : http://www.rnaworld.de/rnaworld/ (http://www.rnaworld.de/rnaworld/)


L'AF a déjà été créée : http://www.rnaworld.de/rnaworld/team_display.php?teamid=8 (http://www.rnaworld.de/rnaworld/team_display.php?teamid=8)

29/05/2010 : 76 membres dont 63 actifs (http://www.rnaworld.de/rnaworld/team_members.php?teamid=8&offset=0&sort_by=expavg_credit) (merci Shann qui a été le premier  :jap: )

---

21/12/2013



"Salut, comme vous pouvez le remarquer, nous avons une nouvelle version (1.10) de notre logiciel, avec des corrections de bugs et de nouvelles unités de travail d'essai. THX est là pour vous aider. Pour tout ceux qui ne veulent pas de grosses unités XXL ou des problèmes avec la version VM, nous avons généré de nouvelles unités de travail de petites tailles. Nous prévoyons de publier ce unités de travail à partir du 01/01/2014, plus de 2 millions d'unités sont prévues. Vous serez informé sur le site web de RNA World de la date exacte. j'espère que la puissance de la FA est prête. Je vous souhaite à tous un joyeux Noël et une bonne année 2014. Merci beaucoup à l'AF. Norman:"
Titre: Re : RNA World
Posté par: supersnoopy le 22 décembre 2009 à 14:32

où peut on récupérer un code d'invitation ?

je suis très intéressé
Titre: Re : RNA World
Posté par: fr@ntz le 22 décembre 2009 à 15:35
J'ai demandé à Yoyo par MP via le forum SG
Je viens d'avoir sa réponse : ils ont assez de testeurs et n'en prennent plus pour l'instant  :spamafote:
Citer
Hello,
we have currently enough hosts and are still in the phase of testing and enhancing the app and the server. Therfore currently no invitation code.
yoyo
Titre: Re : RNA World
Posté par: supersnoopy le 22 décembre 2009 à 15:57

OK, merci pour ces niouzes frantz.  :jap:

Plus qu'à attendre la fin de la phase de test alors...


Titre: Re : RNA World
Posté par: al@ON le 22 décembre 2009 à 22:54

Merci fr@ntz et tiens-nous au courant. :jap:
Titre: Re : RNA World
Posté par: yoyo le 24 janvier 2010 à 19:00
Hello,
it is now possible to translate the RNA World project pages. If you want to help there you need an account in the Boinc Translation System (http://boinc.berkeley.edu/translate/projects/rnaworld/). Afterward I can give the translation rights.
Would be nice if you could help to translate the project.

kind regards,
yoyo
Titre: Re : RNA World
Posté par: jm@rc le 24 janvier 2010 à 21:11
:hello:

i've tried to translate as much as I can :jap:
now you have many suggestions...
Titre: Re : RNA World
Posté par: Origin le 24 janvier 2010 à 21:14
Je viens d'ajouter le projet aux stats BZH, en attendant que ça ouvre ;)
Titre: Re : RNA World
Posté par: JeromeC le 24 janvier 2010 à 23:33
Raz la casquette des traductions :D
Titre: Re : RNA World
Posté par: luger11 le 03 février 2010 à 10:22
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We are currently looking for a few people willing to help in our testing efforts who exclusively use Windows 2000 as operating system.

Y a des gens qui utilisent encore window 2000??  :D :D
Titre: Re : RNA World
Posté par: JeromeC le 03 février 2010 à 16:09
Pas qu'un peu ! (http://fr.boincstats.com/stats/host_os_stats.php?pr=bo&teamid=&st=0&or=2)

On y trouve même du 98, du millennium (plus de 8000 !), encore 154 Windows 95 (!!).

Le seul qu'on voit plus c'est Windows 3.11, ils ont pas réussi à installer boinc dessus :D
Titre: Re : RNA World
Posté par: luger11 le 03 février 2010 à 16:37
ca fait du monde je n'ai jamais utilise millenium je suis passer de 98 à XP alors voir des gens avec cet OS ca m'a toujours fait bizarre
Titre: Re : RNA World
Posté par: JeromeC le 03 février 2010 à 16:44
Je suis persuadé qu'il existe encore du win 3.11 installé et utilisé dans des ordis de part le monde, je suis sérieux quand je dis que c'est parce que boinc marche pas dessus qu'on en voit pas dans les stats... avec un vieux word et une vieille imprimante, ça doit permettre de faire de vieilles lettres :D
Titre: Re : RNA World
Posté par: chev6791 le 03 février 2010 à 19:29
 :D ca doit encore être utilisé pour des applications très particulières (par exemple pour piloter certaines machines outils) dont les couts de re-développement sont prohibitifs par rapport à l'usage, donc tant que le PC sur lequel ca tourne tient le coup on change pas, par contre le jour ou ca lache, à mon avis c'est changement de l'ensemble  :lol:
Titre: Re : RNA World
Posté par: jm@rc le 04 février 2010 à 07:41
jusqu'à il y a peu de temps, nous avions des PCs sous Windows 98 à cause d'une application impossible à migrer.
de plus, nous avons encore des PCs genre 286 avec cartes ISA pour un système de retour son propre à la "maison" :)
Titre: Re : RNA World
Posté par: RLDF le 04 février 2010 à 16:47
j'ai du windows 3.11 sans boinc dans mon établissement
essentiellement des PC connectés à des machines de labo dont la connectique et les logiciels ne fonctionnement pas avec autre chose :)
Titre: Re : RNA World
Posté par: JeromeC le 06 février 2010 à 16:02
Ça doit être bonheuuuuur à regarder :D
Titre: Re : RNA World
Posté par: modesti le 06 février 2010 à 16:20
Hier j'ai vu dans la shoutbox de BoincStats que la création de compte était ouverte (retrouvé le message (http://boincstats.com/forum/forum_thread.php?id=1431&nowrap=true#80270)). Ça se passe à la même adresse que dans le premier post ?

edit : confirmé
Citer
Account registration open
Although we are still in testing mode and currently have few if any work units since we have to perform thorough in-depth data analysis of our previous test runs, we have now transiently opened RNA World registration without further invitation code requirements. ;-) Michael. 6 Feb 2010 14:15:11 UTC
Titre: Re : RNA World
Posté par: fr@ntz le 06 février 2010 à 16:46
danke schön Modesti  :jap:
inscrit  :smak:
Titre: Re : RNA World
Posté par: modesti le 06 février 2010 à 17:00
je vous t'en prie, fr@ntz :jap:

ce qui est marrant, c'est qu'on télécharge des tas de fichiers alors qu'il n'y a pas de boulot :lol:
Citer
06.02.10 16:25:41|RNA World|Sending scheduler request: Project initialization.  Requesting 1 seconds of work, reporting 0 completed tasks
06.02.10 16:25:45|RNA World|Scheduler request completed: got 0 new tasks
06.02.10 16:25:45|RNA World|Message from server: (Project has no jobs available)
06.02.10 16:25:48|RNA World|Started download of stat_icon_01.png
06.02.10 16:25:48|RNA World|Started download of rkn.png
06.02.10 16:25:49|RNA World|Finished download of stat_icon_01.png
06.02.10 16:25:49|RNA World|Finished download of rkn.png
06.02.10 16:25:49|RNA World|Started download of MW-6SRNAFragment_mini_txt.png
06.02.10 16:25:49|RNA World|Started download of PDB-1EGK_PMID-10864501_FourWayJunction_mini_txt.png
06.02.10 16:25:50|RNA World|Finished download of MW-6SRNAFragment_mini_txt.png
06.02.10 16:25:50|RNA World|Finished download of PDB-1EGK_PMID-10864501_FourWayJunction_mini_txt.png
06.02.10 16:25:50|RNA World|Started download of PDB-1Q8N_PMID-10617571_MalachiteGreenAptamer_mini_txt.png
06.02.10 16:25:50|RNA World|Started download of PDB-1SJ3_PMID-15141216_HDVRibozyme_mini_txt.png
06.02.10 16:25:51|RNA World|Finished download of PDB-1Q8N_PMID-10617571_MalachiteGreenAptamer_mini_txt.png
06.02.10 16:25:51|RNA World|Finished download of PDB-1SJ3_PMID-15141216_HDVRibozyme_mini_txt.png
06.02.10 16:25:51|RNA World|Started download of PDB-1U9S_PMID-15459389_S-DomainA-TypeRNaseP_mini_txt.png
06.02.10 16:25:51|RNA World|Started download of PDB-2A2E_PMID-16113684_A-typeRNaseP_mini_txt.png
06.02.10 16:25:53|RNA World|Finished download of PDB-1U9S_PMID-15459389_S-DomainA-TypeRNaseP_mini_txt.png
06.02.10 16:25:53|RNA World|Finished download of PDB-2A2E_PMID-16113684_A-typeRNaseP_mini_txt.png
06.02.10 16:25:53|RNA World|Started download of PDB-2NZ4_PMID-17196404_GlmS-GlcN6P_mini_txt.png
06.02.10 16:25:54|RNA World|Finished download of PDB-2NZ4_PMID-17196404_GlmS-GlcN6P_mini_txt.png
06.02.10 16:27:38|RNA World|Sending scheduler request: Requested by user.  Requesting 0 seconds of work, reporting 0 completed tasks
06.02.10 16:27:43|RNA World|Scheduler request completed: got 0 new tasks
Titre: Re : RNA World
Posté par: supersnoopy le 06 février 2010 à 22:35

inscrit !  :love: :love:

pas de taff pour le moment, mais pas grave car SIMAP en ce moment.
Titre: Re : RNA World
Posté par: xipehuz le 06 février 2010 à 22:40
En fait, on pouvait déjà s'inscrire depuis la veille, ce dont je me suis rendu compte par hasard en passant par Boincstats BAM!

N'oubliez pas de cocher dans vos préférences que vous acceptez les UT en test.
Titre: Re : RNA World
Posté par: peluche le 07 février 2010 à 00:41
inscrite aussi
Titre: Re : RNA World
Posté par: Hildor le 07 février 2010 à 10:42

inscrit également  :jap:
Titre: Re : Re : RNA World
Posté par: al@ON le 07 février 2010 à 15:49
En fait, on pouvait déjà s'inscrire depuis la veille, ce dont je me suis rendu compte par hasard en passant par Boincstats BAM!
Pareil. :coffeetime:

N'oubliez pas de cocher dans vos préférences que vous acceptez les UT en test.
:jap: xipe.
Titre: Re : RNA World
Posté par: Netrider le 07 février 2010 à 21:06
je comprends mieux pourquoi je recevait rien  :lol:  :smak:
Titre: Re : RNA World
Posté par: sbmtl le 08 février 2010 à 19:46
Il y a du travail :love:

Projet intéressant, ça me rappèle mes années en technique de microbiologie.

Utilisation de la mémoire vive, pics à 120 Mo.

A noter que la version Windows ne comporte pas de points de sauvegarde.
Titre: Re : RNA World
Posté par: alipse le 08 février 2010 à 22:52
Merci pour ces détails :jap:
Titre: Re : RNA World
Posté par: al@ON le 08 février 2010 à 23:27

P*tain... Shann nous a mis un gros vent. :blbl:
Titre: Re : RNA World
Posté par: samuel debergh le 09 février 2010 à 01:27
les graphismes sont évolutifs durant le calcul :love:
Titre: Re : RNA World
Posté par: Hildor le 09 février 2010 à 06:08

ah oui c'est jolie  :love:
Titre: Re : RNA World
Posté par: gaulois952 le 09 février 2010 à 09:37
Ca crédite bien ca les copains ?
Titre: Re : RNA World
Posté par: samuel debergh le 09 février 2010 à 11:29
(bug=))bzh Rna (20k dans tout l'af tout membre compris)devrait pas être mis au mtfb actuellement dans ce cas on met goldbach et mopac!  sans oublier quake network catcher...
Titre: Re : Re : RNA World
Posté par: supersnoopy le 09 février 2010 à 13:58
Ca crédite bien ca les copains ?

ça m'a l'air d'être dans la moyenne des projets bio, genre POEM ou SIMAP

ce soir je ne reçois plus d'UT
Titre: Re : Re : Re : RNA World
Posté par: al@ON le 09 février 2010 à 22:32
...
ce soir je ne reçois plus d'UT

Le "sample_work_generator" est au rouge.  :spamafote:
Titre: Re : RNA World
Posté par: Hildor le 10 février 2010 à 19:30

N'oubliez pas, que ce sont des unités de test !  :o
Titre: Re : RNA World
Posté par: luger11 le 10 février 2010 à 22:09
j'en est beaucoup qui sont annulé "par le projet" :/
Titre: Re : Re : RNA World
Posté par: al@ON le 10 février 2010 à 23:04
N'oubliez pas, que ce sont des unités de test !  :o

Pas besoin de gueuler pour dire ça! :D  :coffeetime:
Titre: Re : Re : RNA World
Posté par: supersnoopy le 10 février 2010 à 23:38
N'oubliez pas, que ce sont des unités de test !  :o

...mais qui ont une valeur scientifique quand même
Titre: Re : RNA World
Posté par: al@ON le 13 février 2010 à 22:32
Citer
13 Feb 2010 16:19:28 UTC
CMC work units available for Linux x64 systems
The new CMCALIBRATE (CMC) WUs for Linux x64 have been generated and uploaded to the server. Following their completion, a second set of CMC WUs will be released for Windows x64. Afterwards, results will be compared and then there should be no more WU shortage since on the basis of the CMC results we will most likely commence with CMSEARCH mass production. In parallel to this weekends CMC WUs, additional CMSEARCH WUs will be fed into the system to ensure that those of you who do not run Linux x64 systems will have something to munch on. For the CMC guys, please note as stated in the FAQ: You may experience huge hardware demands for some of these WUs with RAM requirements above 1.5 GB per WU and run times of maybe even a week. If you have a multicore machine, be aware that the RAM requirement in the worst case might have to be multiplied by your core number. Now you will understand, why we run CMC exclusively on x64 machines at present. Of course, I exaggerate a bit here, but it is better to be prepared than to experience unwelcomed surprises. I do not think that there is another DC project out there at present that beats us in what we have to demand from our participants. Consequently, your efforts are most welcome.
 Michael.

Nouvelle série d'UTs "cmcalibrate 0.20" pour les machines sous GNU/Linux 64 bits, 1 UT nécessite 1,5 Gio de RAM et la date limite de renvoi est de 14 jours. :hyperbon:
Titre: Re : RNA World
Posté par: sbmtl le 14 février 2010 à 01:42
... des unités du même genre pour WIndows_64 suivront lorsque les unités pour Linux seront complétées.
Titre: Re : RNA World
Posté par: Pascal94 le 14 février 2010 à 18:03
inscrit aujourd'hui, je viens d'avoir 2 UT cmcalibrate 0.20, et 1 UT cmsearch 0.10, sur linux 64  :hyperbon:
Titre: Re : RNA World
Posté par: rvp_lan le 17 février 2010 à 12:56
Les allemands (mais aussi les américains, les italiens, les japonais...) ont pris un peu d'avance : http://www.rnaworld.de/rnaworld/top_teams.php
Je confirme...
Eh ben alors les p'tits gars de l'Alliance là!?! Allez hop hop hop!
On se fait un peu carrément piler là...
Par Rechenkraft.net mais bon c'est normal, en interne, ils ont mis le paquet.
Par Free.DC, SETI.germany...
Titre: Re : Re : RNA World
Posté par: al@ON le 17 février 2010 à 15:41
Je confirme...
Eh ben alors les p'tits gars de l'Alliance là!?! Allez hop hop hop!
On se fait un peu carrément piler là...
Par Rechenkraft.net mais bon c'est normal, en interne, ils ont mis le paquet.
Par Free.DC, SETI.germany...

Bin y'a du taf que pour les Manchots :spamafote:

Citer
cmsearch     0 pour tous les OS... mais y en a plus
cmcalibrate    3,251 ne fonctionne que sous GNU/Linux 64 bits

Pour les ceux qui veulent cruncher sur ce projet... vous reste plus qu'à installer une distribution Libre sur vos bécanes. :p
Titre: Re : Re : Re : RNA World
Posté par: [AF>Libristes>Jip] Elgrande71 le 17 février 2010 à 16:34
Bin y'a du taf que pour les Manchots :spamafote:

Pour les ceux qui veulent cruncher sur ce projet... vous reste plus qu'à installer une distribution Libre sur vos bécanes. :p
Merci al@ON  :jap: :jap: :jap: :jap: :jap: :jap: :jap: :jap: :jap: :adonf: :adonf: :winner2: :winner2: :D :D :dialout:
Titre: Re : RNA World
Posté par: Netrider le 17 février 2010 à 17:58
j'ai 9 manettes d'ouvertes à fond sur 7 jours de cache et rien à se mettre sous la dent mais ca va viendre j'ai téléphoné à Billou  :sun: En plus il va y avoir le crasch du premier mars...  :/
Titre: Re : RNA World
Posté par: modesti le 17 février 2010 à 18:10
En plus il va y avoir le crasch du premier mars...  :/

:??:
Titre: Re : RNA World
Posté par: al@ON le 20 février 2010 à 00:19

P*tain :rhaa: + de 27 h de calcul sur 1 UT POUR RIEN :o... arrivée à 100% elle est repartie à 0% pour un recalcul :pt1cable:... je l'ai virée!!! :blbl:
Titre: Re : Re : RNA World
Posté par: Netrider le 20 février 2010 à 08:22
:??:

Windows 7 realease RC  :/
Titre: Re : RNA World
Posté par: Pascal94 le 20 février 2010 à 16:21
Citer
HD checkup complete, new CMS WUs ahead

Last night we have run a thorough HD hardware check over several hours to identify the reason for why our RAID system on the server occasionally slows down. However, the HD is error-free. Anyway, new CMS work units for all operating systems will be released some time this weekend in addition to the remainder of the CMC work for Linux x64 machines. It would help us to speed up things (and generate even more CMS work) if the Linux x64 users could transiently disable the cmsearch application and focus on completion of the CMC packets. Michael.

Bilan complet des disques durs, de nouvelles UT CMS à venir

La nuit dernière, nous avons exécuté un contrôle approfondi des disques durs sur plusieurs heures pour déterminer la raison pour laquelle notre système RAID sur le serveur ralentissait parfois. Toutefois, les disques durs ne contiennent pas d'erreurs. Quoi qu'il en soit, de nouvelles unités de travail CMS pour tous les systèmes d'exploitation seront parfois libérées ce week-end en complément des CMC pour les machines sur Linux x64. Ca nous aiderait à accélérer les choses (et même générer plus de travail CMS) si les utilisateurs de Linux x64 pouvaient temporairement désactiver l'application cmsearch et se concentrer sur l'achèvement des paquets de CMC. Michael.
Titre: Re : RNA World
Posté par: al@ON le 20 février 2010 à 20:26
Bon bin je vais arrêter les CMC... puisque c'est demandé si gentiment. :D
Titre: Re : RNA World
Posté par: Pascal94 le 20 février 2010 à 20:30
temporairement, il a dit le monsieur...  :D
Titre: Re : RNA World
Posté par: al@ON le 20 février 2010 à 20:36

J'en ai encore 8 en cache. :p

 (http://moe.mabul.org/up/moe/2009/05/14/img-1105374fn89.gif) yoyo.
Titre: Re : Re : RNA World
Posté par: yoyo le 20 février 2010 à 20:45
J'en ai encore 8 en cache. :p

 (http://moe.mabul.org/up/moe/2009/05/14/img-1105374fn89.gif) yoyo.
Here!
Titre: Re : RNA World
Posté par: al@ON le 21 février 2010 à 00:43

Ayé j'ai reçu des CMS. :hyperbon:
Titre: Re : RNA World
Posté par: [AF>Libristes>Jip] Elgrande71 le 21 février 2010 à 06:55
Moi aussi, chouette.  ;) :adonf:
Titre: Re : RNA World
Posté par: Netrider le 21 février 2010 à 09:20
Flute  :eek:  j'ai 7 jours de cache sur un autre projet  :cry:
Titre: Re : RNA World
Posté par: Hildor le 21 février 2010 à 12:01

Du travail pour Windows maintenant  :hello:
Titre: Re : RNA World
Posté par: JeromeC le 22 février 2010 à 23:45
ah oui, Seven RC :

"En effet, à compter du 1er mars 2010, votre ordinateur commencera à s'éteindre toutes les deux heures. Votre travail ne sera pas enregistré pendant la mise hors tension.

La version RC de Windows 7 expirera complètement le 1er juin 2010. Votre ordinateur continuera à s'éteindre toutes les deux heures et vos fichiers ne seront pas enregistrés pendant la mise hors tension. De plus, votre fond d'écran sera remplacé par un message sur fond noir affiché en permanence sur le Bureau. Des notifications rappelleront régulièrement que votre version Windows n'est pas authentique. Ceci signifie que votre ordinateur n'est plus en mesure de recevoir de mises à jour facultatives ou de téléchargements nécessitant la validation de l'authenticité de votre copie de Windows."

Amusant :D
Titre: Re : RNA World
Posté par: al@ON le 23 février 2010 à 23:25

Une occasion rêvée de passer au Libre! :biglol:
Titre: Re : Re : Re : RNA World
Posté par: rvp_lan le 24 février 2010 à 13:19
Bin y'a du taf que pour les Manchots :spamafote:
Déjà signalé, mais au cas où pour ceusses qui restaient en attente: c'est bon! Les windows peuvent bosser! Mes box XP64 calculent plein de petites unités. Et pour le moment, ça rapporte gentiment.

Citer
Pour les ceux qui veulent cruncher sur ce projet... vous reste plus qu'à installer une distribution Libre sur vos bécanes.
L'un n'empêche pas l'autre! Si vous êtes vraiment addict à Boinc et un projet, mais que celui-ci ne propose pas de WU pour votre système winj'en-ai-ma-dose, vous pouvez installer une machine virtuelle tout gratos avec VirtualBox et un Linux qui va bien. Ca bouffera (presque) pas plus le CPU mais un peu beaucoup la mémoire, quoique.

C'est même utilisé par certains boinceurs pour bien segmenter le travail des CPU et les projets, voire pour être sûrs de ne pas se faire hacker son système par un vilain projet douteux. Machine virtuelle = étanchéité. Entre autres!

@+
Titre: Re : RNA World
Posté par: JeromeC le 25 février 2010 à 20:27
Il faut cependant faire attention a comment on la configure car il y a de plus en plus de ponts entre host et VM (selon le soft de virtualisation et sa version), qui peuvent simplifier la vie mais qui peuvent aussi être activités par défaut
Titre: Re : RNA World
Posté par: Pascal94 le 05 mars 2010 à 19:51
Citer
News

last 2 cmsearch archives
With the last 2 cmsearch runs we send and received round about 900.000 results and transfered 1 TByte of data. yoyo 4 Mar 2010 21:32:03 UTC · Comment (http://www.rnaworld.de/rnaworld/forum_thread.php?id=42)

Current status
The entire set of CMC work units for Linux x64 machines is almost complete now and so is the current CMS bundle. We have already prepared the first eukaryotic organisms which will cause significantly more traffic during download and correspondingly require more HD storage as well. As soon as the results have been assembled (a matter of just a few days), we will normalize the client server communication intervalls such that all the problems that occurred with the last CMS work units will not reappear. We will then release a set of CMC work units for Windows x64 only plus a first test set of the eukaryotic CMS WUs for all systems to check whether it runs smoothly. If that is the case, we will fill up the server with more work. Exact dates will be announced here. Thank you all for your patience and help with the trouble shooting. Michael. 4 Mar 2010 15:09:40 UTC · Comment (http://www.rnaworld.de/rnaworld/forum_thread.php?id=41)

Dernière archives 2 cmsearch
Avec les 2 dernières séries cmsearch nous avons envoyé et reçu autour de 900.000 résultats et transféré 1 To de données. yoyo

Situation actuelle
L'ensemble des unités de travail CMC pour les machines Linux x64 est maintenant presque terminé, de même que la série CMS. Nous avons déjà préparé les premiers organismes eucaryotes qui provoqueront un trafic beaucoup plus élevé pendant le téléchargement et exigeront corrélativement plus de stockage sur disque dur. Dès que les résultats auront été assemblés (une question de juste quelques jours), nous normaliserons les Intervals de communication client-serveur, de sorte que tous les problèmes survenus avec les unités de travail CMS dernier ne réapparaissent pas. Nous mettrons alors en circulation une série d'unités de travail CMC pour Windows x64 uniquement, plus un premier set de test d'unités de travail eucaryotes CMS pour tous les systèmes, afin de vérifier si elles fonctionnent correctement. Si tel est le cas, nous remplirons le serveur avec plus de travail. Les dates exactes seront annoncées ici. Merci à tous pour votre patience et votre aide pour le dépannage. Michael.
Titre: Re : RNA World
Posté par: al@ON le 05 mars 2010 à 23:09

Merci Pascal pour ces infos. :jap:
Titre: Re : RNA World
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 06 mars 2010 à 02:34
(http://www.rnaworld.de/rnaworld//img/rna4.png)
Nouveau projet bio hébergé par Rechenkraft et administré par Yoyo

Objet : recherches sur l'A.R.N. (http://fr.wikipedia.org/wiki/ARN)
Description : http://www.rechenkraft.net/wiki/index.php?title=RNA_World/Projectdescription/en

Sur invitation seulement actuellement en Beta test
edit : inscriptions ouvertes depuis le 5 février (http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,3273.msg218275.html#msg218275)
http://www.rnaworld.de/rnaworld/

Je viens de m'inscrire, j'espère avoir des unités pour windows 64...


L'AF a déjà été créée : http://www.rnaworld.de/rnaworld/team_display.php?teamid=8
Importée par Yoyo : http://www.rnaworld.de/rnaworld/forum_thread.php?id=10
mais personne dedans hormis le fondateur générique.
edit du 08/02 : 19 membres dont 1 seul actif (http://www.rnaworld.de/rnaworld/team_members.php?teamid=8&offset=0&sort_by=expavg_credit) (merci Shann  :jap: )

Yoyo attend 600 testeurs.
Pensez à cocher que vous acceptez les UT de test.

Les allemands (mais aussi les américains, les italiens, les japonais...) ont pris un peu d'avance : http://www.rnaworld.de/rnaworld/top_teams.php
Titre: Re : RNA World
Posté par: Hildor le 06 mars 2010 à 09:10
 :??:
Titre: Re : RNA World
Posté par: Pascal94 le 06 mars 2010 à 09:38
 :??: :??:
Titre: Re : RNA World
Posté par: fr@ntz le 06 mars 2010 à 10:16
boris61 a rajouté dans la citation
Citer
Je viens de m'inscrire, j'espère avoir des unités pour windows 64...
Titre: Re : RNA World
Posté par: Pascal94 le 06 mars 2010 à 11:55
ah ok, je me demandais ce qu'il voulait dire en citant ton post  :D

moi aussi je suis en 64bits( Linux) et je mange à ma faim  :hyperbon:

par contre, certaines Ut sont très difficiles à digérer  :eek:


Edit:

Citer
News

Problem solved

I have good news for those of you whose machines failed on the CMC "monster WUs" delivered to Linux x64 systems. Tonight we most likely solved the problem which indeed has to do with memory allocation. A new parameter setting has been applied and these WUs are now out again in the wild for those who dare munching on them once again. Solving this problem was only possible with the valuable help of some of you who ran the diagnostics which we had posted to diverse forums. Thanks again for your help. Michael. 5 Mar 2010 22:49:05 UTC · Comment (http://www.rnaworld.de/rnaworld/forum_thread.php?id=43)

Problème résolu

J'ai de bonnes nouvelles pour ceux d'entre vous dont les machines ont échoué sur les "unités monstrueuses" CMC délivrés aux systèmes Linux x64. Ce soir, nous avons résolu en grande partie le problème qui a certainement à voir avec l'allocation de mémoire. Un nouveau paramètre de réglage a été appliqué et ces unités sont maintenant à nouveau disponibles pour ceux qui oseront s'y attaquer à nouveau. La résolution de ce problème a été possible uniquement grâce à l'aide précieuse de certains d'entre vous qui ont effectué le diagnostic que nous avions publié sur divers forums. Merci encore pour votre aide. Michael.



Edit 2 : ceci explique celà  :D
Titre: Re : RNA World
Posté par: al@ON le 06 mars 2010 à 23:55
Ça explique peut-être le problème que j'avais rencontré http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,3273.msg219842.html#msg219842 (http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,3273.msg219842.html#msg219842) sur les UTs CMC. :p

...
moi aussi je suis en 64bits( Linux) et je mange à ma faim  :hyperbon:
...
Bin pour moi c'est
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sam 06 mar 2010 23:56:06 CET|RNA World|Message from server: No work sent
sam 06 mar 2010 23:56:06 CET|RNA World|Message from server: cmcalibrate is not available for your type of computer.

 :cry:
Titre: Re : RNA World
Posté par: Pascal94 le 07 mars 2010 à 10:44
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Sun 07 Mar 2010 10:32:19 CET   RNA World   Starting task cmc_Lin64[Rfam-9.1-seed]_RF00028_Intron_gpI_Rfam-9.1_1266128987_27_8 using cmcalibrate version 20
Sun 07 Mar 2010 10:32:19 CET   RNA World   Starting task cmc_Lin64a[Rfam-9.1-full]_RF00177_SSU_rRNA_5_Rfam-9.1_1267812414_1_3 using cmcalibrate version 21
Sun 07 Mar 2010 10:32:19 CET   RNA World   Starting task cmc_Lin64a[Rfam-9.1-full]_RF01272_snR86_Rfam-9.1_1267812414_2_4 using cmcalibrate version 21
Sun 07 Mar 2010 10:33:35 CET   RNA World   Sending scheduler request: To fetch work.
Sun 07 Mar 2010 10:33:35 CET   RNA World   Requesting new tasks
Sun 07 Mar 2010 10:33:45 CET   RNA World   Scheduler request completed: got 0 new tasks
Sun 07 Mar 2010 10:33:45 CET   RNA World   Message from server: No work sent
Sun 07 Mar 2010 10:33:45 CET   RNA World   Message from server: cmcalibrate is not available for your type of computer.

ah... y'a plus apparemment  :D
Titre: Re : RNA World
Posté par: al@ON le 07 mars 2010 à 11:05

P*tain sur le portable de ma sœur les 2 UTs CMC calculées c'est 0 crédit :rhaa:
506346 (http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=506346)
506242 (http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=506242)

 :blbl:
Titre: Re : RNA World
Posté par: Pascal94 le 07 mars 2010 à 16:42
les runtime à 0 c'est bizarre  :heink:
Titre: Re : RNA World
Posté par: Pascal94 le 07 mars 2010 à 16:47
Citer
New work

This weekend we will release new work. As announced earlier, first we will send out two sets of CMC WUs exclusively for Windows x64 machines. These will be submitted this evening. In parallel to that we will upload our first CMS test set of WUs to analyze eukaryotic organisms including the human genome to all systems. Please note that these WUs will require a broadband internet connection since the sizes of the genomes of these organisms are one to two orders of magnitude larger than all what we have analyzed so far. Importanly, run times can be significantly longer as well with up to 100 hrs for a single WU. Michael. 6 Mar 2010 18:56:29 UTC · Comment (http://www.rnaworld.de/rnaworld/forum_thread.php?id=44)

Nouveau travail

Ce week-end nous allons publier du nouveau travail. Comme annoncé précédemment, nous allons d'abord envoyer deux séries d'unités CMC exclusivement pour les machines Windows x64. Cela sera envoyé ce soir. En parallèle à cela nous mettrons en ligne notre première série d'unités de test CMS qui vise à analyser les organismes eucaryotes, y compris le génome humain, pour tous les systèmes. Veuillez noter que ces unités nécessiteront une connexion Internet à haut débit puisque la taille des génomes de ces organismes seront de un à deux ordres de grandeur plus importante que tout ce que nous avons analysé jusqu'à présent. Important également, les temps de fonctionnement peuvent être considérablement plus longs avec jusqu'à 100 heures pour une unité de travail unique. Michael.


ça promet :D
Titre: Re : RNA World
Posté par: al@ON le 07 mars 2010 à 23:31

J'ai des cms6S[e] (je ne sais pas si ce sont celles-là), mais la + longue ne m'a pris que 23 min.
Titre: Re : RNA World
Posté par: modesti le 09 mars 2010 à 10:24
c'est plutôt rassurant, al@ON :D parce que j'en ai chopé une (http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=512638) dans la nuit qui est donnée pour... 70h49 !
Titre: Re : RNA World
Posté par: F5LCU le 09 mars 2010 à 18:10
Si c'est des cmcalibrate, j'en ai eu une qui a durée 24h et s'est arrêtée à 99.5 et des brouettes. :blbl:
Ils testent, c'est le cas de le dire c'est du gros calibre.
Titre: Re : RNA World
Posté par: modesti le 09 mars 2010 à 18:29
Nan, pas de cmcalibrate pour moi :spamafote: c'est une cmsearch. mais visiblement faut plus de temps pour un taureau (voir le lien dans mon message précédent) que pour les bactéries qu'on a eues jusqu'à maintenant :lol:
Titre: Re : RNA World
Posté par: luger11 le 09 mars 2010 à 19:23
oui moi j'ai un taureau, homo sapien ,souris et un marsupiale et le temps est beaucoup plus long 60 heures pour le marsupiale
Titre: Re : RNA World
Posté par: F5LCU le 09 mars 2010 à 22:51
J'ai aussi eu une partie du zoo avec les temps en jours!!
A voir ou à revoir selon!
Titre: Re : RNA World
Posté par: al@ON le 09 mars 2010 à 23:56

Perso je fais une pause sur ce projet car calculer des UTs qui partent en
Citer
"Error while computing" ou "Completed, can't validate"
ça me gonfle :rhaa:... surtout que je peux utiliser ma (petite) puissance de cacul sur d'autres projets qui ne me rendent pas pareils messages. :blbl:

Y reviendrais + tard. :coffeetime:
Titre: Re : RNA World
Posté par: Netrider le 10 mars 2010 à 07:04
S'upporte pas l'OC non plus   :/

Edit  La vache j'ai chopé une wu donnée pour 220 heures  :eek:

Tombera tombera pas  :gno:

(http://images2.hiboox.com/images/1010/3834e5defd72f8aaddb8d16b2c12812a.jpg) (http://www.hiboox.fr/go/images/divers/rna1,3834e5defd72f8aaddb8d16b2c12812a.jpg.html)
Titre: Re : RNA World
Posté par: Netrider le 10 mars 2010 à 10:05
Yoyo au secours  :pt1cable:  :hello:
Titre: Re : Re : RNA World
Posté par: Pascal94 le 10 mars 2010 à 21:49
Nouveau travail

Ce week-end nous allons publier du nouveau travail. Comme annoncé précédemment, nous allons d'abord envoyer deux séries d'unités CMC exclusivement pour les machines Windows x64. Cela sera envoyé ce soir. En parallèle à cela nous mettrons en ligne notre première série d'unités de test CMS qui vise à analyser les organismes eucaryotes, y compris le génome humain, pour tous les systèmes. Veuillez noter que ces unités nécessiteront une connexion Internet à haut débit puisque la taille des génomes de ces organismes seront de un à deux ordres de grandeur plus importante que tout ce que nous avons analysé jusqu'à présent. Important également, les temps de fonctionnement peuvent être considérablement plus longs avec jusqu'à 100 heures pour une unité de travail unique. Michael.

petit rajout:

Citer
Also, please watch the RAM requirements since a few WUs might end up taking up to 2.3 GB of memory. Michael.

qui se traduit par:

De plus, attention au besoins en RAM puisque une UT pourrait finir par prendre jusqu'à 2,3 Go de mémoire.

 :eek: :eek: :eek:
Titre: Re : RNA World
Posté par: fr@ntz le 10 mars 2010 à 23:11
20h annoncées pour un canasson (sans compter le temps perdu par remise à 0 suite à mise à jour client boinc > v.6.10.36)
Je crois qu'il va rester au box, y'a du Leiden plus urgent qui attend... :blbl:
Titre: Re : RNA World
Posté par: modesti le 11 mars 2010 à 10:38
Bon ben, mon taureau a fini en erreur de calcul au bout d'1h08 :( Finalement, suis pas mieux lotie que les autres qui s'y sont essayés
Titre: Re : RNA World
Posté par: tristesire le 11 mars 2010 à 12:16
Et +2go/unités j'ai pas les moyens.
Titre: Re : RNA World
Posté par: modesti le 11 mars 2010 à 12:54
pareil, viens de trouver ça dans mes messages :
Citer
11.03.10 12:33:55|RNA World|Message from server: No work sent
11.03.10 12:33:55|RNA World|Message from server: cmsearch needs 1907.35 MB RAM but only 1842.74 MB is available for use.
11.03.10 12:33:55|RNA World|Message from server: cmcalibrate is not available for your type of computer.

:/

peut-être cette nuit, quand mes logiciels de travail seront fermés :spamafote:
Titre: Re : RNA World
Posté par: modesti le 14 mars 2010 à 18:28
Arf ! :eek: :eek: De mal en pis :
Citer
14.03.10 18:05:33|RNA World|Message from server: cmsearch needs 3814.70 MB RAM but only 1842.74 MB is available for use.

Je sens que je vais le suspendre, celui-là, jusqu'au prochain changement de bécane :/
Titre: Re : RNA World
Posté par: Pascal94 le 27 mars 2010 à 00:01
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no multiple screensaver starts anymore

With cmcalibrate 0.22 for win32/64 and cmsearch 0.11 for win32/64 the screensaver shouldn't start multiple times anymore. yoyo 18 Mar 2010 20:59:27 UTC · Comment  (http://www.rnaworld.de/rnaworld/forum_thread.php?id=45)

fini les écrans de veille multiples  :D
Titre: Re : RNA World
Posté par: Pascal94 le 08 avril 2010 à 20:41
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Nouvelles

Projet sur la Tuberculose

La première série de WUS de notre projet sur la tuberculose (veuillez voir le thread précédent et les objectifs du projet scientifique sur notre site Web) est maintenant prête pour la transformation. Ces WUs pourraient avoir une durée de calcul très hétérogène, jusqu'à un maximum de 10 heures (sur un processeur Intel i7 920 2,66 GHz CPU Quad-Core) et devraient être dépourvues de problèmes de mémoire vive ou de circulation. J'espère que même ceux qui avaient eu des problèmes avec notre dernière série de WUs énormes CMS envisageront de participer à nouveau, car je crois que c'est un projet de recherche très intéressant. Michael. 7 avril 2010 12:50:59 UTC commentaire (http://www.rnaworld.de/rnaworld/forum_thread.php?id=47).


Problème de RAM CMS, WUs actuelles et projet novateur

Vous avez peut être remarqué que j'ai été un peu moins disponible au cours des deux dernières semaines concernant le support utilisateurs. Ceci pour une bonne raison puisque je voyage actuellement à travers l'Inde pour répondre à nos partenaires de coopération et de discuter sur une série de projets très intéressants, que j'ai sous le coude depuis un certain temps maintenant. Le résultat est le suivant: Alors que nous travaillons actuellement à résoudre le problème de RAM avec les grandes unités de travail eucaryotes, à compter d'aujourd'hui, j'ai remplacé les WUs restantes de ce lot par un nouveau projet très intéressant traitant de la tuberculose, qui repose en fait sur nos résultats très prometteurs obtenus pour la série Lin64 de Wus CMC que nous avons complété avec succès il y a quelques semaines. J'ai testé en attendant les résultats de Lin64 CMC et ils semblent parfaits car tous les tests ont pu être achevés, à ma plus grande satisfaction. Si tout fonctionne comme prévu, vous pouvez vous attendre à voir les premières WUs du type tuberculose affluer sur vos machines d'ici demain ou peut-être même ce soir. Nous avons juste besoin de finir le dernier lot de grandes WUs grande qui a été traité et à nourrir le serveur. Pour un peu plus de détails sur ce projet, il suffit de jeter un oeil à notre page des objectifs scientifiques (http://www.rechenkraft.net/wiki/index.php?title=RNA_World/Scientific_objectives/en), en constante amélioration. Michael. 5 avril 2010 17:46:08 UTC commentaire (http://www.rnaworld.de/rnaworld/forum_thread.php?id=46)
Titre: Re : RNA World
Posté par: tristesire le 08 avril 2010 à 20:45
voilà un admin à l'écoute de ses volontaires. Je ferais un petit effort prochainement pour le remercier.
Titre: Re : RNA World
Posté par: Netrider le 08 avril 2010 à 20:57
Je comprends mieux pourquoi j'ai arrété de cruncher sur ce projet  :miam:

Edit > normal il faut que la roue tourne  :jap:
Titre: Re : RNA World
Posté par: Pascal94 le 08 avril 2010 à 21:05
je l'aimais déjà, je l'aime encore plus... pour le coup je viens de rouvrir le robinet  :D


Edit:

ah ba oui, ça y est  :yahoo:

Citer
jeu. 08 avril 2010 21:05:20 CEST   RNA World   Scheduler request completed: got 2 new tasks
jeu. 08 avril 2010 21:05:22 CEST   RNA World   Started download of cms_Mtb-p[Lin64s]_Mycobacterium-tuberculosis-H37Ra_CP000611.cir.EMBL_RF00828_mir-75_1270744623_1592-in.zip
jeu. 08 avril 2010 21:05:23 CEST   RNA World   Started download of cms_Mtb-p[Lin64s]_Mycobacterium-tuberculosis-H37Ra_CP000611.cir.EMBL_RF00187_SNORD102_1270744623_364-in.zip
Titre: Re : RNA World
Posté par: al@ON le 08 avril 2010 à 23:13

Merci Pascal pour ces bonnes nouvelles. ;)
Titre: Re : RNA World
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 27 avril 2010 à 19:28
je trouves nul le faite que les uts que je reçois partent toutes en erreur et que rna m'envoit encore qui partent en erreur...
Titre: Re : RNA World
Posté par: modesti le 27 avril 2010 à 19:33
si elles partent toutes en erreur chez toi et que tu n'en veux pas d'autres, il te suffit de mettre le projet en "pas de nouveau travail" - ou de le suspendre ;)
Titre: Re : Re : RNA World
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 27 avril 2010 à 19:35
si elles partent toutes en erreur chez toi et que tu n'en veux pas d'autres, il te suffit de mettre le projet en "pas de nouveau travail" - ou de le suspendre ;)

 :/ :cavapobienmwa:

 :lol:
Titre: Re : RNA World
Posté par: Sébastien le 27 avril 2010 à 19:52
Regardes le message d'erreur.
<core_client_version>6.10.43</core_client_version>
<![CDATA[
<message>
CreateProcess() failed - Accès refusé. (0x5)
</message>
]]>
Tu as surement un antivirus ou un pare-feu qui bloque l'exécution du programme.
http://boincfaq.mundayweb.com/index.php?language=1&view=448
Titre: Re : RNA World
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 27 avril 2010 à 19:56
je n'ai pas de message pour me dire l'erreur dans l'onglet messages...
Titre: Re : RNA World
Posté par: Sébastien le 27 avril 2010 à 20:10
Il faut aller voir sur le site du projet.
Tu regardes tes résultats et tu verras le message d'erreur.
Titre: Re : Re : RNA World
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 27 avril 2010 à 20:17
Il faut aller voir sur le site du projet.
Tu regardes tes résultats et tu verras le message d'erreur.

merci de l'infos, c'est vrai qu'il y a marqué accès refusé...
Titre: Re : RNA World
Posté par: bill1170 le 28 avril 2010 à 22:55
Je suis passé des unités de 15 secondes à une unité de 110 heures.

Au fait elle font aussi chauffer vos processeurs plus que la moyenne ces UT (du genre 5° de plus) ?
Titre: Re : RNA World
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 28 avril 2010 à 22:56
idem pour moi...

edit : elle avance très doucement...
Titre: Re : RNA World
Posté par: modesti le 28 avril 2010 à 23:12
z'avez de la chance, moi je me suis retrouvée avec plein d'UT annulées par le projet :/
Titre: Re : RNA World
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 28 avril 2010 à 23:14
vus la durée j'espére qu'elle rapporte...
Titre: Re : RNA World
Posté par: supersnoopy le 28 avril 2010 à 23:27

+1 j'espère aussi qu'il y a un prorata temporis, et que les UT de 15 s sont légèrement moins créditées que celles de 20 heures...  :D

Titre: Re : Re : RNA World
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 28 avril 2010 à 23:50
+1 j'espère aussi qu'il y a un prorata temporis, et que les UT de 15 s sont légèrement moins créditées que celles de 20 heures...  :D

 :kookoo:
Titre: Re : Re : RNA World
Posté par: al@ON le 29 avril 2010 à 10:51
+1 j'espère aussi qu'il y a un prorata temporis, et que les UT de 15 s sont légèrement moins créditées que celles de 20 heures...  :D

Tout le contraire :/, pour mon 3400+ que j' :love: (GNU/Linux 64 bits)


ÉDIT: J'ai oublié de vous dire qu'actuellement je suis sur une UT qui me demandera 18 h de crunch (estimation calculée par mézigue (http://www.ah-le-con.org/) :D).
Titre: Re : RNA World
Posté par: Sébastien le 29 avril 2010 à 18:08
Il y a deux jours, j'ai renvoyé une unité calibrate de 150 heures et j'en ai une autre en cours qui devrait durer 300 heures :eek:
Et il n'y a pas de checkpoints sur ces unités.
Titre: Re : Re : RNA World
Posté par: al@ON le 29 avril 2010 à 20:17
Il y a deux jours, j'ai renvoyé une unité calibrate de 150 heures et j'en ai une autre en cours qui devrait durer 300 heures :eek:
Et il n'y a pas de checkpoints sur ces unités.
:bouh: Ils les ont salement rallongées, mais perso je n'en ai pas reçues et je n'en recevrai pas car j'ai décoché les CMC.

Pour ma CMS longue elle s'est en fait terminée au bout de 09:12:29 et a été créditée de 228,48 --> 24,8/h.
Titre: Re : RNA World
Posté par: Pascal94 le 03 mai 2010 à 20:46
Citer
News

Problems solved
The WU generator is working again, the small WUs will now be processed on the server, except for very, very few which we will deliver to some remote machines. Please also note that the server response delay has been drastically reduced such that connection issues should be resolved by now as well. We have plenty of WUs, will not run out of work and hope for your further support which is very much appreciated. ;-) Michael. 30 Apr 2010 12:21:04 UTC · Comment (http://www.rnaworld.de/rnaworld/forum_thread.php?id=50)

WU generator transiently stopped...
...due to improvements we are currently working on to process the tiny WUs on the server in the future. The background is that batches of very short WUs cause severe server stress regarding the number of connections and MySQL requests despite our good server hardware specifications. Since these small WUs will re-occur in future projects as well, we need to do something about this. At present, we have implemented a server response delay which is causing many machines to sit idle exclusively once these small WU batches enter the system - a situation which clearly is unacceptable. These WUs are usually consisting of plasmids or phages with very short DNA sequences and are consequently processed within just a few minutes - sometimes even shorter depending on your hardware - and therefore the server contact frequencies are massively increased. We could solve the issue by just adding a couple of servers as put into practice by some of the bigger DC projects. Unfortunately, our current project budget does not allow for such a solution, so we decided to process these small WUs on one or two of the server cores in the future. Michael. 28 Apr 2010 6:36:30 UTC · Comment (http://www.rnaworld.de/rnaworld/forum_thread.php?id=49)

Genome annotations running
As you may have seen, in parallel to the tuberculosis project, we have also initiated the systematic genome annotation analyses (GA projects) in order to globally map the presence of non-coding RNAs. Michael. 26 Apr 2010 8:20:14 UTC · Comment (http://www.rnaworld.de/rnaworld/forum_thread.php?id=48)

annotations du génome en cours d'exécution
Comme vous avez pu le voir, en parallèle au projet de la tuberculose, nous avons également entrepris des analyses systématiques des annotations des génomes (projets GA) dans le monde afin de cartographier la présence d'ARN non-codants. Michael.
Titre: Re : RNA World
Posté par: fr@ntz le 10 juin 2010 à 11:41
Un mini challenge de 24h démarre demain
http://fr.boincstats.com/bam/challengeChat.php?chid=43

mais nous ne sommes pas inscrits (l'inscription automatique n'a pas fonctionné ?!)
http://fr.boincstats.com/bam/challenges.php?action=details&chid=43


Ca pourrait être l'occasion de manger du sushi (sans tuer de thon rouge (http://www.greenpeace.fr/thon-rouge/))
http://statseb.boinc-af.org/details_FB.py?projet=110

 :hyperbon:
Titre: Re : RNA World
Posté par: Netrider le 10 juin 2010 à 11:57
Dommage...je suis déja à fond dessus, et on est que 10 à cruncher pour l'instant sur ce projet coté AF

Viendez résorber mes 12 000 de pending  :lol:
Titre: Re : RNA World
Posté par: Pascal94 le 10 juin 2010 à 21:00
j'ouvre un peu les vannes  :jap:
Titre: Re : RNA World
Posté par: al@ON le 10 juin 2010 à 23:30

Je m'y suis un peu remis ce matin après avoir fini mes SIMAP. :hyperbon:
Titre: Re : RNA World
Posté par: Netrider le 11 juin 2010 à 17:42
Toujours pas d'inscription...mince ca débute dans 3 heures, je pense que on va s'en passer  :/
Titre: Re : RNA World
Posté par: Netrider le 14 juin 2010 à 15:11
The server is Planted  :cry: surement suite au challenge... :cavachier:
Titre: Re : RNA World
Posté par: Netrider le 15 juin 2010 à 11:53
Punaise à 20 minutes pres de la deadline j'ai envoyé une wu de 420 000 000 secondes pour 3.700 points en pending  :doh: Je suis curieux de voir le granted
Titre: Re : Re : RNA World
Posté par: al@ON le 15 juin 2010 à 22:06
Punaise à 20 minutes pres de la deadline j'ai envoyé une wu de 420 000 000 secondes :bouh: :gne: (ce qui fait quand même + de 13 ans de crunch :pt1cable:)  pour 3.700 points en pending  :doh: Je suis curieux de voir le granted et moi donc!!! :siflotte:
Titre: Re : RNA World
Posté par: Netrider le 16 juin 2010 à 06:08
Arf un O en trop

http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=1059795

450.997.97  :gno:
Titre: Re : RNA World
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 16 juin 2010 à 10:59
ut très longues
Titre: Re : RNA World
Posté par: Netrider le 26 juin 2010 à 11:45
Searching translators
The RNA World project description is currently only available in English and German. We are searching for help to translate the project description into as much languages as possible. Please contact us if you want to help. yoyo 25 Jun 2010 21:19:08 UTC · Comment


En fait yoyo cherche un traducteur car pour l'instant c'est en D et GB seulement  :coffeetime:

http://www.rechenkraft.net/wiki/index.php?title=RNA_World/Projectdescription/en

Et certaimenent en raport avec cela :

http://www.futura-sciences.com/fr/news/t/genetique-1/d/les-pseudogenes-vont-ils-bouleverser-la-biologie_24222/#xtor=RSS-14
Titre: Re : RNA World
Posté par: [AF>Libristes>Jip]Augure le 15 juillet 2010 à 12:10
je viens de découvrir le projet...

dommage, la description ne dis pas vraiment les info que donne les UT comme résultats ! :/
c'est vaguement une description des ARN et mi(si)RNA que l'on peu trouver sur wiki ou n'importe ou ailleurs !  :siflotte:

je continue a regarder plus pour voir si je trouve de plus ample informations sur leur projet ! ;)
Titre: Re : RNA World
Posté par: Netrider le 05 août 2010 à 09:45
Tien il y a Rechenkraft qui vient de se réveiller  :miam: Ca va etre dur de les dépasser avant la fin de l'année  :lol:
Titre: RNA World et virus détecter....
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 17 août 2010 à 23:41
Voici ce que me dit kaspersky quand j'ai voulus télécharger des uts :

(http://img.lbzh.fr/images/capturenpn.png)


??????
Titre: Re : RNA World
Posté par: supersnoopy le 18 août 2010 à 08:09

pareil pour moi, Avira Antivir : un vers

Dans le fichier 'C:\Documents and Settings\All Users\Application Data\BOINC\projects\www.rnaworld.de_rnaworld\graphics_0.06_windows_intelx86.exe'
un virus ou un programme indésirable 'WORM/Autorun.blot' [worm] a été détecté.
Action exécutée : Refuser l'accès

 :??:
Titre: Re : RNA World
Posté par: Netrider le 18 août 2010 à 08:18
J'ai fait un scan et un anti malware et rien d'anormal ici  :cavapobienmwa:
Titre: Re : RNA World
Posté par: MDodier le 18 août 2010 à 11:48
rien d'anormal également en ouin dows
Titre: RNA World et virus détecter....
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 18 août 2010 à 12:39
Voici ce que me dit kaspersky quand j'ai voulus télécharger des uts :

(http://img.lbzh.fr/images/capturenpn.png)


??????

Vrai virus ou pas ?
Titre: Re : RNA World
Posté par: whispers le 18 août 2010 à 12:52
mon petit grain de sel..lol

il est gratuis,et tres efficace......http://www.cloudantivirus.com/fr/


et pour les pc vérolé,juste pour nettoyer(pas de protection en temps réel)....http://www.01net.com/telecharger/windows/Securite/antivirus-antitrojan/fiches/33668.html  :miam:

Titre: Re : RNA World
Posté par: Jeannot Le Tazon le 18 août 2010 à 19:56
Même chose chez moi.
y a un sujet sur le forum RNA (en allemand) :
http://www.rechenkraft.net/phpBB/viewtopic.php?f=76&t=11085
il semble que le pb ait été remonté à Avira par exemple. (faux positif)
Titre: Re : RNA World
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 18 août 2010 à 20:08
Ok, ce serait l'économiseur d'écran ce fichier, en attendant je t'enterrais de temps en temps de recharger des uts pour voir si le problème est régler...
Titre: Re : RNA World
Posté par: modesti le 21 août 2010 à 11:19
Une réponse à vos soucis :

Citer
Virusscanner issues - all false positives
Since a few days, some of the current virus scanners, as e.g. AntiVir, report a virus threat for the RNA World-associated file graphics_0.06_windows_intelx86.exe. This is a false positive detection that relates to the imperfect heuristics of these types of software. We have already informed the the antivirus scanner company AntiVir and they confirmed that this file is NOT a virus (we have that in writing!). As a consequence, the false-positive detection will be fixed in one of the next scanner updates. However, you need to take immediate action to prevent your machines from trashing one RNA World WU after the other if your system is Windows-based. You need to exclude the RNA World work directory from being scanned as long as the company has not fixed that issue. Please note, that RNA World will NEVER distribute malware! Thanks to the people who came to our forum and brought this issue to our attention such that we could inspect it in detail and solve the problem.
Seit einigen Tagen melden einige Virenscanner (u.a. z.B. AntiVir) für die RNA World assoziierte Datei graphics_0.06_windows_intelx86.exe einen Virus (WORM/Autorun.blot). Hierbei handelt es sich um eine Falschmeldung, wie uns die Firma AntiVir schriftlich bestätigte. Das Problem wird zumindest von AntiVir in einer der nächsten Versionen behoben sein. Dennoch ist ein sofortiges Eingreifen unter Windows erforderlich, indem einfach das RNA World Arbeitsverzeichnis in der Virenscannerkonfiguration von der Virensuche ausgenommen wird - zumindest solange, bis das Problem vom Hersteller behoben wurde. Hintergrund ist die ärgerliche Tatsache, dass sonst u.U. eine WU nach der anderen geschrottet werden kann. Generell gilt: RNA World versendet NIEMALS Malware. Vielen Dank an die Leute, die uns dieses Problem in unserem Forum gemeldet und somit dazu beigetragen haben, dass wir es aufklären und eine Lösung finden konnten.
Michael. 21 Aug 2010 1:17:07 UTC

Traduction :
Depuis quelques jours certains logiciels anti-virus (entre autres AntiVir) signalent un virus pour le fichier associé à RNA World graphics_0.06_windows_intelx86.exe (WORM/Autorun.blot). Il s'agit ici d'un faux positif, comme nous l'a confirmé la société AntiVir par écrit. Le problème sera résolu dans une des prochaines versions, au moins chez AntiVir. Toutefois, il convient d'agir immédiatement sous Windows, tout simplement en excluant le dossier de RNA World de la recherche de virus dans la configuration de votre logiciel anti-virus - au moins jusqu'à ce que le problème ait été résolu par le fabricant. Tout cela pour éviter de voir une UT après l'autre partir en erreur. Par principe, RNA World n'envoie JAMAIS de malware. Merci à ceux qui ont signalé le problème sur notre forum et qui ont ainsi contribué à sa résolution.

:jap:
Titre: Re : RNA World
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 21 août 2010 à 11:45
merci pour la traduction

Edit : de toute façon mon kaspersky (PURE) bloque l'adresse internet d'où vient ce fichier ! et que pour ce fichier pas les autres...
Titre: Re : RNA World
Posté par: Pascal94 le 24 août 2010 à 19:36
New WU information panels available

Citer
We have developed a small script that generates a graphical overview of a given CMCALIBRATE WU set regarding expected runtime requirements. See below for links to the figures (SEED, FULL, COMBINED). We plan to implement this in a fully automated manner for CMSEARCH as well. A central display URL will be selected soon (probably on the server status page).

Nouveau panneaux d'information sur les UT disponibles

Nous avons développé un petit script qui génère un aperçu graphique d'un lot donné d'UT CMCALIBRATE, concernant les exigences d'exécution requises. Voir ci-dessous les liens vers les graphiques (SEED, FULL, COMBINED). Nous prévoyons de mettre ceci en œuvre d'une manière entièrement automatisée pour CMSEARCH également. Une URL centrale sera sélectionnée bientôt (probablement sur la page d'état du serveur).

SEED: http://www.rnaworld.de/rnaworld/cmc_rfam10_seed.png
FULL: http://www.rnaworld.de/rnaworld/cmc_rfam10_full.png
COMBINED: http://www.rnaworld.de/rnaworld/cmc_rfam10_both.png


traduction par mon ami Google  :D
Titre: Re : RNA World
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 30 août 2010 à 22:50
cela ne dit plus qu'il y a un virus quand je télécharge des uts, enfin.... kasp à corrigé ce faux positif....
Titre: Re : RNA World
Posté par: modesti le 05 septembre 2010 à 17:05
Des infos ! (http://www.rnaworld.de/rnaworld/forum_thread.php?id=63)

Citer
Due to an excellent, but unfortunately unannounced race with tremendous throughput (increase of compute power from approx. 2.5 TFLOPS to above 4.5 TFLOPS within only two days), our WU buffer has been sucked dry. Although we have more than enough work for even more participants, RNA World WU production is computationally expensive (for each WU that can be delivered, a mini simulation has to be carried out on the server), so our server currently can't keep up with the demand. Whatever is produced is downloaded almost instantly. On top of that the current WUs appear rather short (WU runtimes can not be deduced without the results from the mini simulations). We now try to feed in some longer running tasks over the weekend but still it may take quite some time to refill the buffers although the server works on refilling constantly.

Aufgrund eines hervorragenden, aber leider unangekündigten Rennens, bei dem die Rechenleistung von RNA World von 2,5 TFLOPS innerhalb von nur zwei Tagen auf über 4,5 TFLOPS anstieg, ist unser WU Vorrat sozusagen abgegrast. Obwohl wir mehr als genug Arbeit für noch wesentlich mehr Teilnehmer haben, kommen wir momentan mit der WU-Produktion nicht nach, da diese im Gegensatz zu vielen anderen Projekten äusserst rechenintensiv ist (für jede WU muss auf dem Server eine kleine Minisimulation durchgeführt werden). Was immer an WUs produziert wird, laden die vielen Clients nahezu sofort wieder herunter und leider sind die momentan produzierten WUs etwas kurz (was wir ohne die Minisimulation auch nicht vorhersehen können). Wir probieren jetzt über das Wochenende selektiv längere Tasks einzuspeisen, um dem Server Zeit zu geben, den Arbeitspuffer wieder hochzufahren. Dieser war bislang auf 100k WUs gesetzt, die immer auf Vorrat sein müssen und wurde gestern angesichts der aktuellen Verdopplung der Projektleistung erst mal verdreifacht.
Michael.

Traduction :
Compte tenu d'un excellent challenge - mais malheureusement non annoncé - qui a fait monter la puissance de calcul de RNA World de 2,5 TFLOPS à plus de 4,5 TFLOPS en seulement deux jours, on peut dire que nos stocks d'UT ont été littéralement aspirés. Bien que nous ayons largement assez de travail pour bien plus de participants, nous n'arrivons actuellement plus à fournir d'UT car - contrairement à de nombreux autres projets - la production d'UT exige beaucoup de calculs (le serveur doit effectuer une mini-simulation pour chaque UT). Quelle que soit la quantité d'UT que nous produisions, elle est immédiatement téléchargée par les clients et malheureusement les UT produites en ce moment sont un peu courtes (ce que nous ne pouvons pas prévoir sans la mini-simulation). Pendant le week-end, nous essayons d'alimenter le serveur de manière sélective avec des UT plus longues pour lui donner le temps de ré-alimenter le tampon de travail. Jusqu'à présent, celui-ci était fixé à 100k UT qui doivent toujours être en stock. Compte tenu de l'actuel doublement de la puissance de calcul sur le projet, nous avons commencé par tripler ce tampon hier.



Moi, ce que j'en dis, c'est que si on les prévient suffisamment à l'avance d'un raid/challenge ou d'une course (je pense p. ex. au Charity Race :siflotte: ), ils sont capables de prévoir le coup et de fournir assez de boulot. Et visiblement leurs serveurs tiennent la charge... :D
Titre: Re : RNA World
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 05 septembre 2010 à 19:36
Merci Modesti, tu es la meilleure....
Titre: Re : RNA World
Posté par: Netrider le 21 septembre 2010 à 15:59
Juste pour sinaler que les wu longues genre 70 heures et voir plus partent toutes en erreur sur la fin des calculs  :o  :priz2tet:
Titre: Re : RNA World
Posté par: al@ON le 21 septembre 2010 à 22:17
Tu devrais aller en causer sur leur Forum. :spamafote:
Titre: Re : RNA World
Posté par: fr@ntz le 21 septembre 2010 à 23:12
La pression des SG devrait baisser sur RNA puisque les SPEG continuent seuls depuis que les 2d wave se rabattent sur Yoyo pour contrer la diversion des RR
Titre: Re : RNA World
Posté par: Meteore31 le 23 septembre 2010 à 19:33
SG à surveiller :

(http://statseb.fr/graphe.py?graph_id=4eca58dcb48e5f314f6a646a6ca9b963)
Titre: Re : RNA World
Posté par: modesti le 04 octobre 2010 à 15:11
Dites, est-ce qu'il y en a parmi vous qui ont des UT avec les mêmes caractéristiques ? parce que là, comment dire, c'est un peu  :priz2tet:
L'orang-outan de Sumatra, il commence à me les briser :gno: d'autant plus que j'avais cru voir cette UT à >14% déjà ce matin :electric:

Je ne parle que tu temps hein, pas de la RAM (en pointe elle était montée à 1,86 Go :pt1cable: )
Titre: Re : RNA World
Posté par: Netrider le 04 octobre 2010 à 20:54
Je ne sais plus sur quel pc elle est mais j'en ai effectivement une de 157 heures qui traine depuis plusieurs jours, et d'autres qui mon raporté 1300 pts dans les 140 heures environ aussi, sauf sur un pc oc la elle a foirée... :siflotte:

Si j'ai le temps j'irais la retrouver au milieu de ma meule de foins  :lol:

Par contre si on a l'intention de redémarrer la machine il vaut mieux abandonné l'ut car toujours pas de sauvegarde en cours sur les wus  :/
Titre: Re : RNA World
Posté par: modesti le 04 octobre 2010 à 21:02
Merci Netrider. Comme j'ai pas l'intention de rebooter et que les dernières màj windaube ne l'ont pas demandé, je vais la laisser vivre sa vie. Elle en est à 13.537%...
>1000 pts c'est toujours bon à prendre :D
Titre: Re : Re : RNA World
Posté par: Hildor le 06 octobre 2010 à 19:39
c'est un peu  :priz2tet: L'orang-outan de Sumatra, il commence à me les briser :gno:

Ah oui  :??:

 :marcp:
Titre: Re : Re : Re : RNA World
Posté par: fr@ntz le 07 octobre 2010 à 11:00
Je crois qu'elle préfère les minets

 :marcp:
Titre: Re : RNA World
Posté par: modesti le 07 octobre 2010 à 11:28
Uniquement ceux qui marchent à 4 pattes ;)

Z'avez pas bientôt fini de vous foutre de ma gueule ? non mais ! :D :lol:



edit 15h30 : Ce matin j'avais remarqué que le BoincManager avait mis l'UT de l'orang-outan en attente pour calculer sur d'autres trucs. Je ne m'en suis pas inquiétée. Là, je viens de refaire un tour dans le BM et qu'est-ce que je vois ? L'UT qui était à 87% au bout de >58h ce matin n'est plus qu'à 5% et le temps de calcul est passé à 1h42 (pour un temps écoulé de plus de 88h) :gun: C'est bon, l'orang-outan peut retourner à Sumatra, je le vire de ma bécane ! :rhaa:
Et bonne chance à celui ou celle qui va le récupérer !


edit2 (17h45) : apparemment, yen a déjà plusieurs qui se sont cassé les dents sur cet orang-outan... http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=3015959
Titre: Re : RNA World
Posté par: Hildor le 07 octobre 2010 à 19:05

En effet c'est la Wu de la mort  :o
Il y en a un qui a crunché presque 8,5 jours avant qu'elle tombe en erreur  :electric:
Titre: Re : RNA World
Posté par: JeromeC le 08 octobre 2010 à 14:44
D'où le "béta" dans le titre du projet d'ailleurs...

Pourquoi ne pas mettre ce "béta" dans le titre de ce topic, d'ailleurs ?
Titre: Re : RNA World
Posté par: Netrider le 08 octobre 2010 à 17:44
Nouvelles

Nouveaux binaires pour les machines Windows
À compter d'aujourd'hui, les nouveaux binaires pour CMSEARCH ont été libérés pour les systèmes Windows 32/64 bits. Celles-ci doivent résoudre un bug qui a été identifié avec un sous-ensemble des unités de travail très exigeant. Nos tests ont montré que ce bug ne devrait plus se produire. Nouveaux binaires pour les machines Linux sera bientôt disponible ainsi. Nous sommes en train de tester des améliorations de la vitesse supplémentaire pour Linux en utilisant le compilateur Intel.  Michael. 7 octobre 2010 21:19:37 UTC ·



Outan en emporte le vent  :pt1cable:
Titre: Re : RNA World
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 12 octobre 2010 à 18:56
Auch die Linux x32/64 Binaries für CMSEARCH sind inzwischen durch verbesserte, neue ersetzt worden. In einigen Tagen werden wir ein weiteres Mal die Binaries tauschen, um eine weitere ca. 10%ige Geschwindigkeitsverbesserung nutzbar zu machen, die wir durch Einsatz des Intel C++ Compilers herauskitzeln konnten (auch AMD CPUs werden genau wie Intel CPUs von diesen Verbesserungen profitieren).

Michael.
_______

Les binaires pour Linux x32/64 r CMSEARCH ont depuis été remplacé par l'amélioration, de nouvelles. Dans quelques jours nous serons de nouveau remplacer les fichiers binaires d'apporter une amélioration encore plus la vitesse d'environ 10% disponibles, nous avons pu démêler l'aide de l'Intel compilateur C + + (également processeurs AMD, comme les processeurs Intel bénéficier de ces améliorations).

Michael.
Titre: Re : Re : RNA World (béta)
Posté par: fr@ntz le 12 octobre 2010 à 19:07
D'où le "béta" dans le titre du projet d'ailleurs...

Pourquoi ne pas mettre ce "béta" dans le titre de ce topic, d'ailleurs ?

Voilà, c'est fait d'ailleurs  ;)
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 12 octobre 2010 à 19:12
Citer
Auch die Linux x32/64 Binaries für CMSEARCH sind inzwischen durch verbesserte, neue ersetzt worden. In einigen Tagen werden wir ein weiteres Mal die Binaries tauschen, um eine weitere ca. 10%ige Geschwindigkeitsverbesserung nutzbar zu machen, die wir durch Einsatz des Intel C++ Compilers herauskitzeln konnten (auch AMD CPUs werden genau wie Intel CPUs von diesen Verbesserungen profitieren).

Michael.

Traduction (humaine ;)) :
Entre-temps, les fichiers binaires (*) Linux x32/64 pour CMSEARCH ont également été remplacés par des versions améliorées, nouvelles. Dans quelques jours, nous changerons une nouvelle fois les fichiers binaires pour pouvoir mettre à profit une nouvelle amélioration de la vitesse d'environ 10% que nous avons pu obtenir grâce à la mise en oeuvre du compilateur Intel C++ (les CPU AMD pourront profiter de ces améliorations au même titre que les CPU Intel).


(*) Je ne sais toujours pas ce que sont des "binaires", mais les pros comprendront :D

Edit : ajouts en rouge
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: al@ON le 12 octobre 2010 à 19:19
Merci modesti pour la trad :jap:... Fichier binaire (http://fr.wikipedia.org/wiki/Fichier_binaire), bonne lecture. :D
Titre: Re : Re : RNA World (béta)
Posté par: Pascal94 le 12 octobre 2010 à 19:21
Traduction (humaine ;)) :
[...]
(*) Je ne sais toujours pas ce que sont des "binaires", mais les pros comprendront :D

merci mam'zelle  :smak:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 12 octobre 2010 à 19:31
merci modesti
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 12 octobre 2010 à 19:31
Merci modesti pour la trad :jap:... Fichier binaire (http://fr.wikipedia.org/wiki/Fichier_binaire), bonne lecture. :D

Merci pour l'info, al@ON. Je vais donc éditer la trad et remplacer "binaires" par "fichiers binaires" ça sera plus clair pour tout le monde :jap:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: al@ON le 12 octobre 2010 à 19:47
Non mais pas de problème les geeks disent "les binaires". :D
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 12 octobre 2010 à 22:19
tu oublies qu'il n'y a pas que des geeks qui passent par là ;) :p
Titre: Re : Re : RNA World (béta)
Posté par: fr@ntz le 12 octobre 2010 à 22:21
tu oublies qu'il n'y a pas que des geeks qui passent par là ;) :p
... il y a aussi des primaires. :siflotte:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Netrider le 14 octobre 2010 à 07:36
Tien j'ai une wu en pendong de 1992 points  :love: Mon record  :D
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 14 octobre 2010 à 22:34
Mac OS X version finale est sorti aujourd'hui.

allez les pommiers...

http://www.rnaworld.de/rnaworld/apps.php
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 14 octobre 2010 à 22:37
Hé ho je trempe pas mes CPUs dans la première béta venue hein, moi, Môssieur !

Surtout s'il y a du pendong, ça me rend dongue !
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 14 octobre 2010 à 22:38
Mac OS X version finale est sorti aujourd'hui.

allez les pommiers...

http://www.rnaworld.de/rnaworld/apps.php

Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 14 octobre 2010 à 22:40
Ah oui, tu bégayes :gnu:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: mcroger le 14 octobre 2010 à 22:52
Oui mais si ça se répète de manière systématique, m'en vais faire de l'orthophonie "nettoyage de topic" moi  :cavachier:

;)

Merci pour ton annonce mais c'est contre-productif de poster à répétition Question Man :jap:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 14 octobre 2010 à 22:56
Dommage que l'on ne puisse mettre un bandeau défilant dans les MT pour des messages que l'on veut être sûr d'être vus... avec bien sûr l'accord d'un modo...
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 14 octobre 2010 à 23:28
ARG je m'étrangle, boris veut nous spammer directement dans notre topic !!! :lol:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: viny le 15 octobre 2010 à 20:38
Binetôt c'est votre fofo qu'il va spammer !     :lol:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 15 octobre 2010 à 20:41
 :cavachier: :siflotte: :gno:
Titre: Re : Re : RNA World (béta)
Posté par: mcroger le 15 octobre 2010 à 20:48
Binetôt c'est votre fofo qu'il va spammer !     :lol:

Et "bêche-tard" sont sur un bateau... :ptdr:
 
Ca a l'air de te perturber sérieusement Viny !

;)
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 16 octobre 2010 à 17:13
Binera bien qui binera le dernier :jap:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Netrider le 18 octobre 2010 à 13:57
Nouveau record en ce qui me concerne :

583,726.80 secondes   4,221.84 pending  3,615.66 crédits   :hello:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 31 octobre 2010 à 22:20
Le site RNA world cherche des testeurs de la pomme pour une nouvelle appli : http://www.rnaworld.de/rnaworld/forum_thread.php?id=70 (http://www.rnaworld.de/rnaworld/forum_thread.php?id=70)
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 03 novembre 2010 à 10:22
:hello: Netrider,

à ce que je vois (http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=3488244), on a tous deux hérités d'un nouvel orang-outan :D Espérons que celui-là ira au bout de ses calculs...
Titre: Re : Re : RNA World (béta)
Posté par: al@ON le 03 novembre 2010 à 11:59
:hello: Netrider,

à ce que je vois (http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=3488244), on a tous deux hérités d'un nouvel orang-outan :D Espérons que celui-là ira au bout de ses calculs...

Ce que je trouve zarbi c'est que vous avez tout les 2 un i7 860 @ 2.80GHz
Citer
modesti --> Measured floating point speed   2626.84 million ops/sec
                  Measured integer speed   8092.91 million ops/sec

Netrider --> Measured floating point speed   3033.55 million ops/sec
                  Measured integer speed   10569.8 million ops/sec

... Netrider aurait-il ajouté un pincée d'O/C. :gniak:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 03 novembre 2010 à 12:08
Ou peut-être qu'il ne lui sert que pour cruncher actuellement :siflotte: Le mien me sert *aussi* à bosser :ange:


edit 17h46 : En attendant, j'ai fini moi :siflotte:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Netrider le 14 novembre 2010 à 11:57
 :hello:

j'ai bien deux 860, un dans un coin rangé sur le balcon au frais,  et l'autre qui me sert a passer ici entre autres, celui dans son coin il tourne a 3.3 Ghtz

Pour les wu j'en ai deux qui tournent encore bien que finies et entre 400 et 500 heures  :eek: deadline le 21

J'ai l'angoisse d'une éventuelle coupure éléctrique d'ici la  :gno:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 14 novembre 2010 à 13:54
Ils vont créditer deux fois plus, les très longues unités : http://www.rnaworld.de/rnaworld/forum_thread.php?id=71
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Netrider le 16 novembre 2010 à 17:47
je confirme pour celles tournant a 90 heures environ, mais pour les plus longues genre 520 heures je ne sait pas encore... :??:
Afin d'y voir plus clair j'ai arété les autres projets cpu pour un temps  :hyperbon:

(http://images4.hiboox.com/images/4610/5ef483dde5cc7174e26c0e0c33a9cae8.jpg) (http://www.hiboox.fr/go/images/informatique/rna-rec,5ef483dde5cc7174e26c0e0c33a9cae8.jpg.html)
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Netrider le 12 décembre 2010 à 09:52
la c'est les boules vegra  :priz2tet:

(http://images4.hiboox.com/images/4910/ef887255620c7c219c152419782319f0.jpg) (http://www.hiboox.fr/go/images/informatique/les-boules,ef887255620c7c219c152419782319f0.jpg.html)
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: F5LCU le 12 décembre 2010 à 10:28
Moi j'ai arreté ce projet qui n'a aucun point de sauvegarde.
Le PC il plante, on l'éteint, on veut faire un autre projet sur Boinc, les WUs redémarrent à 0.

ZERO le concept, enfin pour moi.
Les fois ou je suis dessus, tout ce qui dépasse 2 à 4 h je les vire.
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: supersnoopy le 12 décembre 2010 à 18:38

ouch, ah ouais du beau gâchis !  :(

j'ai également arrêté ce projet.
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: al@ON le 12 décembre 2010 à 23:02
On avait pensé à ce projet pour la Charity Race... :/
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Netrider le 13 décembre 2010 à 06:20
J'ai eu la reponse de l'admin du projet > ces wus sonts en fait données pour 1000 heures de travail a 2 gbts de ram par wu, hélas j'ai ressété le projet, je vais y retourner avec ce pc uniquement sur RNA pour voir en desactivant l'HT  :cavapobienmwa:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 13 décembre 2010 à 21:48
Oui c'est ballot, t'avais fait 1/3 sur certaines UT... c'est toujours difficile de savoir si c'est l'estimation de temps qui fouare ou les UTs qui sont kaka...
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 04 mars 2011 à 20:58
Vous arrivez à recevoir des unités de la nouvelle appli ? merci
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: fzs600 le 04 mars 2011 à 22:42
 :hello: poly

Tu parle de cette appli la?
Citer
4 Mar 2011 21:34:58 UTC    24 Mar 2011 21:34:58 UTC    In progress    ---    ---    ---    ---    cmsearch2 v0.31


Recu 1 ut  :jap:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 04 mars 2011 à 23:08
oui
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: fzs600 le 04 mars 2011 à 23:36
UT deja fini  :pt1cable:

Citer
   4 Mar 2011 21:34:58 UTC    4 Mar 2011 22:32:24 UTC    Completed and validated    3,282.99    3,003.20    17.15    19.67    cmsearch2 v0.31
Titre: RNA World (béta)
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 15 mars 2011 à 00:06
Ils travaillent sur 2 variantes de l'appli cmsearch dont une apparemment [size=100%] sera exécuter en package combiné de nombreuses unités de travail très faible....

http://www.rnaworld.de/rnaworld/forum_thread.php?id=76
[/size]
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Netrider le 15 mars 2011 à 19:31
Je ne sait pas chez vous mais ici les wu on maintenant des checkpoints yahooooo :smak:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Norman_RKN le 28 mars 2011 à 21:34
@Netrider: vous obtenez post: http://www.rechenkraft.net/phpBB/viewtopic.php?f=75&p=126201#p126201

Actuellement, nous travaillons à réorganiser application CMSEARCH dans deux nouvelles variantes. L'un d'eux, de nombreuses très petites unités de travail dans un ensemble plus vaste disponibles, tandis que l'autre contient les unités de travail restantes. Nous voulons atteindre trois objectifs. Premièrement, la combinaison de plusieurs unités de travail dans un petit paquet de la communication client-serveur est réduite de façon spectaculaire, et ainsi de soulager notre serveur général et stabiliser ce, en particulier lors des compétitions. Deuxièmement, après avoir travaillé à travers chacune des unités de travail dans un paquet de petites écrit un poste de contrôle. Troisièmement, les participants au projet, les deux variantes dans leurs milieux d'ARN CMSEARCH projet mondial d'activer ou de désactiver individuellement. De cette façon, nous donnons plus de liberté pour choisir le maximum de WU-terme.Il est également prévu que le moment tout CMSEARCH version XXL est plus WUs avec les conditions d'utilisation de 20 heures, alors que toutes les unités de travail plus courtes sont traitées avec la demande CMSEARCH S. Plus de détails nous le lui dire.

À l'heure actuelle exécuter tous (à long et court) en vertu de cmsearch S, depuis le vieux n'ont pas été complètement calculé. (Malheureusement)

Nous sommes toujours à la recherche de testeurs pour Mac OS 10.4 et 10.5 avec Intel 64 et vous remercions de votre collaboration.
La sélection du temps d'exécution d'un package de travail peut avoir lieu que lorsque les «anciens» cmsearch toutes été traitées. bientôt je l'espère;)
nous avons besoin de puissance de calcul supplémentaire.

p.s:
WU paquets de nouveaux travaux comprennent les mini (comme cela a été dit) la fin de chaque lettre dans une sorte de point de contrôle.

Par exemple:
cms_GA-p [DZ-Lin64s] _7_Desulfitobacterium-hafniense-Y51_ ......
il contient 7 petits WU. ;)
le virus WU prochaine peut contenir jusqu'à 1000;)


merci beaucoup
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: ousermaatre le 28 mars 2011 à 22:10
thank a lot for answer reply Norman_RKN.

And nice to translate in french your text, thank for this effort.
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Norman_RKN le 28 mars 2011 à 22:57
thank you very much.
We are always ready to work closely with the users and I think the only project that does this in the manner. ;)
if we get feedback, we are always ready to implement it immediately.
deadline to short (as intron_gpI monster WU)? we extend it
credits lost through our fault? we try to give. for example (http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=4496172).
some new software will soon be integrated (eg by folding @ home gomacs known and others)
the time is still at the completion of our results database and an interface in which scientists can set their own dna sequences.
one works very hard at checkpoints in the cm-apps to integrate.
this is very difficult because they are actually HPC apps and it would have to rewrite the huge source code completely. : /
maybe he can solve any other way. ;)

happy crunching and thank you for your support AF.
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: al@ON le 28 mars 2011 à 23:51
Citer
lun. 28 mars 2011 23:49:49 CEST   RNA World   Message from server: No work sent
lun. 28 mars 2011 23:49:49 CEST   RNA World   Message from server: No work is available for cmalign 1.0.2
lun. 28 mars 2011 23:49:49 CEST   RNA World   Message from server: No work available for the applications you have selected.  Please check your settings on the web site.

 :/
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: ousermaatre le 29 mars 2011 à 00:47
 :ptdr:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Norman_RKN le 29 mars 2011 à 00:53
http://www.rnaworld.de/rnaworld/server_status.php
no work for cmalign only cmsearch S for the moment ;)
(you could try to check all apps or check allow work for other applications if no work available.)
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Netrider le 29 mars 2011 à 06:57
Merci Norman  :hello:
Titre: Re : Re : RNA World (béta)
Posté par: ousermaatre le 29 mars 2011 à 09:54
thank you very much.
We are always ready to work closely with the users and I think the only project that does this in the manner. ;)
if we get feedback, we are always ready to implement it immediately.
deadline to short (as intron_gpI monster WU)? we extend it
credits lost through our fault? we try to give. for example (http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=4496172).
some new software will soon be integrated (eg by folding @ home gomacs known and others)
the time is still at the completion of our results database and an interface in which scientists can set their own dna sequences.
one works very hard at checkpoints in the cm-apps to integrate.
this is very difficult because they are actually HPC apps and it would have to rewrite the huge source code completely. : /
maybe he can solve any other way. ;)

happy crunching and thank you for your support AF.


traduction Ouser+ Bing ( avec quelques approximations )


Merci beaucoup.

Nous sommes toujours prêts à travailler en étroite collaboration avec les utilisateurs, et je crois, que nous sommes un des rares projets à le faire régulièrement.
Si nous obtenons vos commentaires, nous sommes toujours prêts à y répondre promptement.
Date limite de retour trop courte (comme intron_gpI monster WU) ? nous l'étendons.
crédits perdu par notre faute ? Nous essayons de les retrouver, par exemple (http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=4496172).
Certains nouveaux logiciels seront bientôt intégrés (p. ex. par pliage @ gomacs domicile connu et d'autres)
Il existe  une interface où les scientifiques peuvent définir leurs propres séquences d'ADN, sur notre site.
On travaille très fort aux points de contrôle dans les cm-apps à intégrer.
C'est très difficile, parce que ce sont en réalité des applications HPC et il faudrait réécrire le code source immense complètement. : /
Peut-être existe-t-il, une autre solution pour résoudre ce problème ?


Bon crunch et merci pour votre soutien, l'AF.
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 29 mars 2011 à 11:43
"un problème d'argent ? on s'en occupe !"

C'est où qu'il faut appeler ? :D
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Norman_RKN le 29 mars 2011 à 13:35
JeromeC:  :lol:  :ange:

info brève de l'administration du serveur:
J'ai doublé quelques wus vieux, pour obtenir ces archives fini. Mais cela signifie, que ces tâches a obtenu le «HR classe" même que celles existantes.
Dim. certains HR-classes sont maintenant bloquer la file d'envoi et doit être envoyé en premier, avant d'obtenir de nouveaux travaux.
un peu plus linux 32 bits sont utiles.
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Pascal94 le 29 mars 2011 à 18:51
Hi Norman_RKN  :kookoo:

thanks a lot for these news  :jap:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Norman_RKN le 31 mars 2011 à 22:11
pas de problème.   :kookoo:
des questions, des problèmes ou des suggestions?

Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: loulou35 le 05 avril 2011 à 14:34
on s'inscrie ou ,j'ai pas trouver  :cry:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 05 avril 2011 à 14:44
Toutes les infos sont dans le 1er message du sujet (valable pour tous les sujets concernant les projets).

Si le créateur du sujet (ou à défaut les puissants) a bien bossé :ange:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: ousermaatre le 05 avril 2011 à 15:07
je confirme le posteur du sujet a bien bossé, premier post à jour.

Bienvenue loulou35  :kookoo:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: loulou35 le 05 avril 2011 à 15:35
merci , je ne conner pas trop encore le systeme de la map  :pt1cable:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 05 avril 2011 à 17:24
C'est la map qu'on préfère ? :warf:

Heu, tu veux dire le fonctionnement du forum ?

Règle n°1 : dans toutes les sections relatives aux projets par catégorie, chaque sujet commence par un 1er message qui résume les informations utiles de ce projet, normalement mis à jour par le créateur du sujet, ou des modos si le créateur a été dévoré par les autres membres du forum (ce qui est souvent le cas)

Règle n°2 : il faut se remettre sérieusement au français (ou alors ne pas s'arrêter), et on peut mettre le texte dans Word avant de le poster ici (il est pas mal le correcteur ortho-grammatical de Word). Parce que nous sommes les Ayatollah du français, et surtout parce qu'après on a les yeux qui piquent.

Règle n°3 : si tu poses beaucoup de questions, il te faudra apporter beaucoup de réponses à l'avenir. Demande à Boris.

Règle n°4 : si tu veux beaucoup d'étoiles sous ton pseudo, il faut poser vraiment beaucoup de questions et apporter beaucoup de réponses. Ou pas. Demande mo... demande à Boris !

Règle n°5 : a propos on cherche quelqu'un pour faire des mises à jour journalières du portail et traduire toutes les news, c'est pas payé mais qu'est-ce que c'est fun, ça t'intéresse ? :D
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 05 avril 2011 à 17:31
Arrête Jéjé, tu vas le faire fuir ! Même une carotte survitaminée a ses limites :D

Bienvenue, loulou35 :hello:
Titre: Re : Re : RNA World (béta)
Posté par: ousermaatre le 05 avril 2011 à 18:02


Règle n°2 : il faut se remettre sérieusement au français (ou alors ne pas s'arrêter), et on peut mettre le texte dans Word avant de le poster ici (il est pas mal le correcteur ortho-grammatical de Word). Parce que nous sommes les Ayatollah du français, et surtout parce qu'après on a les yeux qui piquent.

Règle n°3 : si tu poses beaucoup de questions, il te faudra apporter beaucoup de réponses à l'avenir. Demande à Boris.

Règle n°4 : si tu veux beaucoup d'étoiles sous ton pseudo, il faut poser vraiment beaucoup de questions et apporter beaucoup de réponses. Ou pas. Demande mo... demande à Boris !


 :ptdr:

Merci Jéjé, je crois qu'on va te prendre comme modo, tu sais tellement bien expliqué les choses  :smak:  :D :D :D :D
Titre: Re : Re : RNA World (béta)
Posté par: Pascal94 le 05 avril 2011 à 18:44
Règle n°3 : si tu poses beaucoup de questions, il te faudra apporter beaucoup de réponses à l'avenir. Demande à Boris.

Règle n°4 : si tu veux beaucoup d'étoiles sous ton pseudo, il faut poser vraiment beaucoup de questions et apporter beaucoup de réponses. Ou pas. Demande mo... demande à Boris !
:ptdr:


bienvenu loulou35  :kookoo:
Titre: Re : Re : RNA World (béta)
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 05 avril 2011 à 20:20
Règle n°2 : il faut se remettre sérieusement au français (ou alors ne pas s'arrêter), et on peut mettre le texte dans Word avant de le poster ici (il est pas mal le correcteur ortho-grammatical de Word). Parce que nous sommes les Ayatollah du français, et surtout parce qu'après on a les yeux qui piquent.

Règle n°3 : si tu poses beaucoup de questions, il te faudra apporter beaucoup de réponses à l'avenir. Demande à Boris.

Règle n°4 : si tu veux beaucoup d'étoiles sous ton pseudo, il faut poser vraiment beaucoup de questions et apporter beaucoup de réponses. Ou pas. Demande mo... demande à Boris !

Règle n°5 : a propos on cherche quelqu'un pour faire des mises à jour journalières du portail et traduire toutes les news, c'est pas payé mais qu'est-ce que c'est fun, ça t'intéresse ? :D

       
Ah ah ah je me marre.....
 
  Pour la règle 5, tu peux expliquer plus précisément.... merci (je me porterais  bien volontaire si je vois que je ne suis pas trop C.. pour çà...)
 
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Pascal94 le 05 avril 2011 à 20:44
bah en gros, faut des volontaires pour "entretenir" et mettre à jour le portail... on est nombreux à avoir les droits, mais soit on a pas le temps, soit on se dit "c'est pas grave, quelqu'un d'autre va le faire", et du coup personne ne le fait  :/
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 05 avril 2011 à 21:58
Bien résumé :jap:

Moi j'ai pas le temps :suri:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Norman_RKN le 06 avril 2011 à 22:46
Bonjour!
nous ne pourrons probablement annuler le solde de 10 WU intron.
il n'y a essayer autre chose.
L'utilisateur pourra alors obtenir les crédits crédité.
peut alors commencer les modifications (adaptation de la période cmsearch S et XXL).
les introns restants sont attribués uniquement en "XXL".
le moment venu, être donné plus d'infos sur le site du projet est connu.
et ici;)
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Norman_RKN le 07 avril 2011 à 18:52
l'intron restants ont été tués par le projet.
ils sont nourris à nouveau au xxl.
les crédits devraient tous être crédité.
Il suit maintenant la séparation des WU longues et courtes. (comme prévu)
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: popolito le 07 avril 2011 à 20:13
 :eek:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Norman_RKN le 07 avril 2011 à 20:44
Les introns restants ont été annulés et les crédits doivent avoir été accordés ou sont-il encore.
si ce n'est pas le cas est s'il vous plaît d'annoncer.
Ensuite, le XXL cmsearch adapté de sorte qu'il fonctionne comme le S.
un test de quelques-WU va suivre et les introns sont de nouveau redistribuées entre XXL.
WU-générateur est donc adaptée pour le grand moment.
À l'heure actuelle, la XXL d'une application de test (pour qui veut permettre)
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Netrider le 08 avril 2011 à 04:31
Bonjour  :kookoo:

J'ai bien recu les credits pour mes 6 wu xxl 0.20  :D

Il en reste une qui en est a plus de 900 heures je la laisse tourner  :miam:

(http://images4.hiboox.com/images/1411/be0aaa0d8ac9e5582890abe3a8cfd11c.jpg) (http://www.hiboox.fr/go/images/informatique/intron,be0aaa0d8ac9e5582890abe3a8cfd11c.jpg.html)
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 08 avril 2011 à 18:14
SURTOUT ne vexez pas l'intron, il paraît que ça peut se mettre dans une de ces fureurs ces petites bêtes la... :ange:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: loulou35 le 09 avril 2011 à 18:44
desoler ,je ne parle pas anglais ,un italiens ses tous et 2 a 3 mots de japonais ses pas mal deja :priz2tet:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: ousermaatre le 09 avril 2011 à 18:48
 :kookoo: loulou

Sur ce forum, nous essayons, du mieux que nous puissions, d'écrire en bon français.

Essaie de faire l'effort la prochaine fois, merci.

Citer :

desolé ,je ne parle pas anglais ,un peu l'italien, c'est tout   et 2 à 3 mots de japonais c'est pas mal dejà.
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 10 avril 2011 à 01:26
T'inquiètes, on va commencer par le français, il faut faire les choses calmement, les unes après les autres...
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: popolito le 11 avril 2011 à 14:11
Mince, je n'ai pas pu troller avant...  :D
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Netrider le 14 avril 2011 à 07:27
10 000 000  :winner2:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Hildor le 14 avril 2011 à 07:36

  :eek: Grand respect  !

Tu fais les trois quart de la production de l'AF sur ce projet  :jap:

Si on est 3ième au classement général sur ce projet c'est grâce à toi, sinon on ne serait que 8ième
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 14 avril 2011 à 10:01
chapeau bas :jap:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Netrider le 14 avril 2011 à 17:05
Merci  :jap: Entre nous et ce n'est pas fait expres cela ma pris neuf mois quand meme  :lol: Depuis juillet 2010
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: popolito le 14 avril 2011 à 17:42
Merci  :jap: Entre nous et ce n'est pas fait expres cela ma pris neuf mois quand meme  :lol: Depuis juillet 2010
T'es une femme ?
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: fzs600 le 14 avril 2011 à 17:53
Citer
Citation de: Netrider le Aujourd'hui à 17:05:23

    Merci  :jap: Entre nous et ce n'est pas fait expres cela ma pris neuf mois quand meme  :lol: Depuis juillet 2010

T'es une femme ?
Et tu connais qui est son Processeur ?   :biglol: 
Titre: RNA World (béta) - 3 nouveaux sous-projets
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 23 avril 2011 à 21:10
3 nouveaux sous-projets devraient bientôt arriver :

Citer
Tout d'abord, nous souhaitons à tous nos participants une saison de Pâques. ;-)

Alors que nous sommes au milieu de la transition complète vers l'a annoncé plus tôt spécialisés S CMSEARCH et applications XXL, un ensemble de nouveaux projets très intéressants sont en cours de préparation pour laquelle nous avons fait un certain nombre de tests prometteurs à l'avance. Parmi ceux-ci sont des projets qui traitent (1) des capteurs thermiques à base d'ARN (extension d'un projet qui nous avons réalisé autour de Février 2010 / Mars), (2) l'identification des ARN non-codants dans les ensembles de données métagénomique (c.-à-environnement échantillons d'acide nucléique , par exemple l'eau de mer ou de sources hydrothermales) et (3) un projet très important de la pertinence médicale potentiels qui vise à analyser les mécanismes basés sur l'ARN par lequel les virus perturbent les processus de réglementation de leurs cellules cibles. Plus d'informations suivront bientôt.

http://www.rnaworld.de/rnaworld/forum_thread.php?id=78
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 24 avril 2011 à 12:45
Traduction revisitée par un humain ;)

Citer
Tout d'abord, nous souhaitons à tous nos participants de joyeuses Pâques. ;-)

Tandis que nous sommes en pleine transition vers les deux nouvelles applications spécialisées CMSEARCH S et XXL, nous préparons une série de nouveaux projets très intéressants pour laquelle nous avons fait un certain nombre de tests prometteurs pendant la phase préparatoire. Dans le cadre de ces projets nous nous occuperons
(1) de capteurs thermiques à base d'ARN (extension d'un projet que nous avions déjà réalisé en février/mars 2010),
(2) de l'identification d'ARN non-codants dans des ensembles de données de méta-génomes (il s'agit d'échantillons d'acides nucléiques prélevés dans l'environnement, par exemple dans de l'eau de mer ou des sources thermales) et
(3) d'un projet très important, avec une importance médicale potentielle, qui vise à analyser les mécanismes basés sur l'ARN utilisés par les virus pour reprogrammer à leur gré les processus régulateurs de leurs cellules cibles.
Plus d'informations suivront bientôt.

Merci pour l'info Boris :jap:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Pascal94 le 31 mai 2011 à 19:38
Database crash resolved (http://www.rnaworld.de/rnaworld/forum_thread.php?id=79)

Source: RNA World (beta) (http://www.rnaworld.de/rnaworld/)
Mardi, 31 Mai 2011 19:50
Citer
You might have noticed a recent problem with our server. We have fixed it. Now we are in the process of moving on to a whole new bunch of projects as announced earlier.

Michael.

Vous avez sans doute remarqué un problème récent avec notre serveur. Nous l'avons réglé. Maintenant, nous sommes en train de passer à tout un tas de nouveaux projets comme annoncé précédemment.
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Norman_RKN le 07 juin 2011 à 19:31
Notre base de données est tombé en panne à nouveau. :electric:
Nous nous excusons pour la gêne occasionnée et nous travaillons là-dessus.
Happy crunching ;)
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Netrider le 07 juin 2011 à 19:56
Merci de l'info  :hello: Mais je ne suis pas la en juin  :/
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 07 juin 2011 à 20:09
Danke für die Info, Norman :jap:

@ Netrider : t'inquiète, d'autres prendront la relève :gniak:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Norman_RKN le 08 juin 2011 à 17:25
bitte sehr ;)

crash de base de données est terminée.
nouveaux virus WU sont sur ​​le serveur.
elles sont très intéressantes en vue de la médecine et très petite. ( bien sûr, regroupés dans des emballages surdimensionnés. )  :kookoo:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 09 juin 2011 à 17:59
Il y a des virus sur le serveur ? Mais c'est dangereux ça !! :lol:

:suri:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Norman_RKN le 09 juin 2011 à 19:41
Jerome  :lol:  :D
non, pas de danger. seuls des colis importants travaux.
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: [AF>Libristes] nico8313 le 09 juin 2011 à 19:51
Sacré Jérôme  :ptdr: :ptdr: :ptdr:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 10 juin 2011 à 14:18
seuls des colis importants travaux.
Salut Norman. Ecoute, il faut savoir que la traduction de google a des limites. Tu veux dire qu'il y a beaucoup de nouvelles WU générée disponibles sur le serveur ?

Do you mean there are many new WU available on the server ?
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 10 juin 2011 à 15:04
non, je pense qu'il parle des UT "cmsearch XXL" ;)

et puis, faut pas s'en faire : Google Trad va être supprimé (remplacé) d'ici la fin de l'année :p
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Norman_RKN le 10 juin 2011 à 16:18
hello, yes there are new kinds of WU on the server.
""(1) RNA-based thermosensors (extension of a project which we performed around February/March 2010),
  (2) the identification of non-coding RNAs in metagenomic data sets (i.e., environmental nucleic acid samples, e.g. from seawater or hydrothermal vents) and
  (3) a very important project of potential medical relevance that aims at analyzing RNA-based mechanisms by which viruses perturb regulatory processes of their target cells.""

p.e. RSwitch-p[e***], ***Vir-p and GA-p[eXXMB....]
for cmsearch S and xxl.
you can see here: http://www.rnaworld.de/rnaworld/server_status.php

xxl are the longrunners and should be only select with a 24/7 computer and/or a working hibernate (ram-to-disk) because the apps are without checkpoints until now.
(cmsearch S comes with a type of checkpointing because they have included several mini-wu. after finishing a mini a checkpoint is on the disk ;)

Norman
Titre: Re : Re : RNA World (béta)
Posté par: Pascal94 le 10 juin 2011 à 18:47
xxl are the longrunners and should be only select with a 24/7 computer and/or a working hibernate (ram-to-disk) because the apps are without checkpoints until now.
(cmsearch S comes with a type of checkpointing because they have included several mini-wu. after finishing a mini a checkpoint is on the disk ;)
Hi Norman  :kookoo:

thanks for these news, and thanks for the warning about XXL WUs  :jap:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Norman_RKN le 10 juin 2011 à 22:54
Pas de quoi ! :)

BoincTasks is also recommended to see the checkpoints of each WU and to set other very useful things.
It´s a good alternative to the ordinary manager with different rules and features. (multilingual too)

http://www.efmer.eu/boinc/boinc_tasks/
Titre: Re : Re : Re : RNA World (béta)
Posté par: Norman_RKN le 11 juin 2011 à 13:24
thanks for these news, and thanks for the warning about XXL WUs  :jap:

it seems to be a little bit unclear for users about xxl and s and what they do/we mean.
so we have modified the apps-name to:

cmsearch XXL (large) 1.0.2
cmsearch S (small) 1.0.2

and we hope it´s now easy to understand what we mean with xxl and s ;)
is it better ?! any suggestion ?  :desole:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: ousermaatre le 11 juin 2011 à 17:42
Yes, i have a question !

How are you ?  :D
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Norman_RKN le 11 juin 2011 à 18:23
thx good!  :sun:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: ousermaatre le 11 juin 2011 à 18:27
 :hello: have a nice week-end
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 12 juin 2011 à 12:18
it seems to be a little bit unclear for users about xxl and s and what they do/we mean.
so we have modified the apps-name to:

cmsearch XXL (large) 1.0.2
cmsearch S (small) 1.0.2

and we hope it´s now easy to understand what we mean with xxl and s ;)
is it better ?! any suggestion ?  :desole:

Hi Norman,

With what you said before
Citer
xxl are the longrunners and should be only select with a 24/7 computer and/or a working hibernate (ram-to-disk) because the apps are without checkpoints until now.
(cmsearch S comes with a type of checkpointing because they have included several mini-wu. after finishing a mini a checkpoint is on the disk ;)
it's clear now.

At the beginning, I thought that the XXL were those WUs including many many small sub-units. :pt1cable:
Titre: Re : Re : Re : Re : RNA World (béta)
Posté par: al@ON le 12 juin 2011 à 23:26
it seems to be a little bit unclear for users about xxl and s and what they do/we mean.
so we have modified the apps-name to:

cmsearch XXL (large) 1.0.2
cmsearch S (small) 1.0.2

and we hope it´s now easy to understand what we mean with xxl and s ;)
is it better ?! any suggestion ?  :desole:

Les calculs doivent porter sur la taille des tee-shirts. :siflotte:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Pascal94 le 13 juin 2011 à 12:59
 :ptdr:
Titre: RNA World (béta) - Escherichia-coli
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 20 juillet 2011 à 11:32
RNA est sur : Escherichia-coli  :hyperbon: :hyperbon: :hyperbon: :hyperbon: :hyperbon: :hyperbon:

Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Pascal94 le 20 juillet 2011 à 12:42
merci Boris  :jap:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: ousermaatre le 13 octobre 2011 à 15:54
Générateur d'unités interrompu provisoirement

Malheureusement, nous avons seulement un petit espace laissé libre sur les disques durs du serveur pour le projet.
Donc, nous avons  besoin de  stopper le générateur de WU's une fois de plus.
Il est probable que le problème sera résolu rapidement pour demain soir.
À l'heure actuelle, nous ne pouvons accroître nos capacités HD en raison d'un manque de financement. .

Michael.14 Sep 2011 18:44:50 UTC
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: al@ON le 13 octobre 2011 à 20:35
Merci ouser pour cette info :jap:... je comprends mieux le manque d'UTs pour mon élevage.
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: ousermaatre le 04 novembre 2011 à 01:38
Chers partisans de RNA World,
comme vous le savez sûrement, RNA World est un projet qui est pris en charge par Rechenkraft.net e.V.
À l'heure actuelle, cette association à but non lucratif allemande a la possibilité unique de recevoir un don de 1.000 €.
À cette fin, votre aide serait appréciée.Une banque allemande, bien connue, a lancé une campagne, où  1.000 associations
à but non lucratif peuvent gagner un don unique de 1.000 € chacunes.
Le critère pour recevoir ce prix est le suivant :
- Se classer parmi le top 1000 des sassociations à but non lucratif ! Par un vote sur internet.
C'est ainsi que le nombre total de votes recueillis grâce aux utilisateurs d'internet est d'importance.
Avec votre vote, Rechenkraft.net e.V. pourrait être capable de se classer parmi les 1.000 premières
associations et celà  nous permettrait de financer l'hébergement du serveur RNA World.
La seule chose que vous pouvez faire pour nous aider, est de vous inscrire par vous-même avec l'une
de vos adresses mails sur le site Web lié ci-dessous.
En cliquant sur le lien de confirmation par la suite envoyé par mail de cette banque, vous confirmerez votre vote. C'est tout.
 Il y a trois votes possibles  par adresse mail, ceux-ci peuvent être donné à la même association.
https://verein.ing-diba.de/sonstiges/35039/rechenkraftnet-ev
Nous serions vraiment comblés si vous envisagiez de nous soutenir dans cette campagne.

Meilleurs voeux, Michael


note : Le site est malheureusement en allemand uniquement.
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 04 novembre 2011 à 05:50
Super !
On essaye de se mobiliser un petit peu !

Il est evident que les projets ont besoin de fonds et ce genre d'apport financier ne tache nullement notre ethique.
Du coup, autant en profiter.

Je viens de voter et je le ferai de differentes adresses email sur differentes IP.  :siflotte:
3 fois  :D

PS:
Donc, on clic sur leur bouton, on met notre email puis le captcha puis on recoit un mail. On clic sur le premier lien et ca valide notre vote.
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: ousermaatre le 04 novembre 2011 à 07:37
merci dudu pour le complément d'infos  :hello:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 04 novembre 2011 à 08:22
:hello:
J'avais déjà donné mes 3 voix à Rechenkraft qui m'avait envoyé un mail.

Petite correction Ouser : il ne s'agit pas de sociétés mais d'associations à but non lucratif (un peu comme les associations loi 1901 en France)
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: ousermaatre le 04 novembre 2011 à 08:37
 :hello:
Modesti

modifs apportées

a deux heurs du mat, j'arrivais plus à trouver le mot association.... Faudrait que je pense à dormir de temps en temps  :jap: :D :D
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: al@ON le 04 novembre 2011 à 09:18
Je viens de voter sur mon poste au taf avec 2 adresses courriels, ce soir est-ce-que je pourrais me resservir de ces 2 mêmes adresses sur ma bécane @ home. :??:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: ousermaatre le 04 novembre 2011 à 09:54
Tu peux voter 3 fois avec la même adresse mail, c-à-d 3 votes, mais je ne sais pas si avec une autre id d'ordis, tu peux répéter l'opération...
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 04 novembre 2011 à 10:15
Il me semble que c'est le mail qui compte, pas l'IP. De toute façon, dans le mail de confirmation qu'envoie ING, il y a une phrase sous un des liens qui indique le nombre de voix qu'il nous reste.

@ Ouser: oui, faut dormir de temps en temps :D  Et merci pour la trad :smak:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: kasur le 04 novembre 2011 à 10:28
J'ai voté 3 fois et ils ont pas bougé au classement :( pour info 1843eme à l'instant.

Pour les suivant, allez y c'est rapide à faire ;)
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 04 novembre 2011 à 13:11
Bizarre car je viens de voter 5 fois par le biais du lien fournis dans le mail...
Titre: Re : Re : RNA World (béta)
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 04 novembre 2011 à 13:24
J'ai voté 3 fois et ils ont pas bougé au classement :( pour info 1843eme à l'instant.

Pour les suivant, allez y c'est rapide à faire ;)

C'est qu'il y doit avoir pas mal de concurrence derriere alors....
Ils sont 1844 maintenant  :cavachier:

EDIT: Une fois que vous cliquez sur le lien du mail, il faut recliquer sur le bouton de la nouvelle page ouverte pour comptabiliser le vote !!!
Titre: Re : Re : RNA World (béta)
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 04 novembre 2011 à 13:30
Il me semble que c'est le mail qui compte, pas l'IP.

C'est un peu dommage si ils font comme cela...


J'ai mon nom de domaine et je peux faire autant de boite mail que je veux....
Du coup ca peut vite monter les scores alors que ca ne vient que d'une seule IP...

Je ne sais pas trop comment ils vont gerer cela...

EDIT:
Je viens de voter 15 fois (5 boites mails)
Ils sont 1842 maintenant.
(Il y a du chemin a faire !)
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: al@ON le 04 novembre 2011 à 14:25
Merci ouser. :jap:

Citer
Rang 1.837 Stimmen 1.093
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 04 novembre 2011 à 14:38
Moi j'ai voté 8 fois avec le même lien venant d'une seule adresse mail...
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 04 novembre 2011 à 14:39
Il faut + de 2416 votes pour rentrer dans le top 1000 actuel.
 :hyperbon:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: [AF>Libristes] Elorak le 04 novembre 2011 à 22:09
9 Votes de plus  :cavachier:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 14 novembre 2011 à 23:17
Sur le même sujet : Info trouvée chez les SG, en provenance du site de Yoyo (= Rechenkraft) http://www.rechenkraft.net/yoyo/all_news.php#187
Citer
13 Nov 2011 Please further support yoyo@home
Thanks so far for 5.500 votes. We are now at #890. We estimated that we need round about 1.500 more votes to stay in the top 1000 until the campain ends on the 15. and get the donation. Here is the voting link:

https://verein.ing-diba.de/sonstiges/35039/rechenkraftnet-ev

Thank you very much for your vote and support. We appreciate it very much.

Traduction :
Veuillez continuer à supporter yoyo@home [NdT: ou RNA, et en fait l'équipe Rechenkraft e. V.]
Merci pour les 5.500 votes jusqu'à présent. Nous sommes actuellement 890e. Nous avons calculé qu'il nous faudrait environ 1.500 votes supplémentaires pour rester dans le top 1000 jusqu'à la fin de la campagne le 15 et obtenir la subvention. Voici le lien vers le vote :
https://verein.ing-diba.de/sonstiges/35039/rechenkraftnet-ev
Merci beaucoup pour votre vote et votre soutien. Cela nous fait très plaisir.
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: ousermaatre le 14 novembre 2011 à 23:30
 :bounce: :bounce: :love: :love:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: lamoule le 14 novembre 2011 à 23:58
jobs done
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 15 novembre 2011 à 10:05
voix 6201-6206 de ma part

par contre, ils sont redescendus au rang 1215 :(
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 17 décembre 2011 à 19:19
Y'a pas de point de reprise sur RNA ?? Je viens d'essayer de trouver sur leur forum, mais je trouve pas.

J'étais sur le point de rebooter le mac pour tester Knoppix et je me rends compte qu'aucune de mes 8 unités RNA ne présente de "temps processeur au dernier point de sauvegarde" supérieur à quelques secondes dans les propriétés des unités, et certaines ont déjà 16h au compteur, et une a 37 heures !
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: ousermaatre le 17 décembre 2011 à 19:42
 :hello: Jérôme,

c'est un des gros inconvénients de ce projet, pas de point de sauvegarde.
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Meteore31 le 17 décembre 2011 à 19:47
pas de point de sauvegarde ??? je suis en train de calculer une grosse unité, j'en ai encore pour 200 heures environ, j'ai l'habitude de rebooter mon pc tous les 3 jours, je suis mal là non ?
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: kasur le 17 décembre 2011 à 20:14
Une XXL? oui elle risque de squatter^^
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: ousermaatre le 17 décembre 2011 à 20:31
pour ceux qui éteignent en cours de journée leur ordi, vaut mieux cocher que les unités S, et surtout pas les XXL.
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 18 décembre 2011 à 00:29
Et quand vous crunchez des XXL, débrouillez-vous pour que rien ne vienne perturber Boinc.
J'en ai eu une qui a tourné sans flancher plus de 140h pour 48% (de mémoire), un bug (probablement une surcharge de RAM) et elle est repartie de zéro. Quelques heures plus tard elle s'est terminée en erreur de calcul :( (Elle était donnée pour plus de 8 jours de calcul)
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Meteore31 le 18 décembre 2011 à 08:54
ils peuvent pas ajouter des points de sauvegarde ? j'aurai bien crunché quelques XXL de plusieurs jours moi...
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 18 décembre 2011 à 10:27
Nan, peuvent pas. C'est bien pour ça qu'ils ont créé les 2 séries distinctes :spamafote:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Meteore31 le 18 décembre 2011 à 10:59
je met 8 coeurs quelques temps sur les unités Small, on peut gagner 1 place au FB
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 18 décembre 2011 à 12:05
Ah bon ? ben je viens de benner les 7 XXL que j'avais (une seule S en cours) après avoir changé le réglage sur le projet, pour ne recharger que des S... au diable les heures de calcul cumulées, je devais être vener.
Titre: RNA World (béta)
Posté par: mcroger le 18 décembre 2011 à 14:46
Les XXL sur le Mac Pro et les S sur le mini :hyperbon:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: [AF>Libristes] cottesloe le 14 janvier 2012 à 08:38
Salut à tous.

Prêt pour le Charity Race 2012?
Ça commence demain le 15, et jusqu'au 28 janvier.
Plus d'info ici => http://forum.charity.boinc-af.org/index.php/board,6.0.html

Viendez nombreux!  :winner: :oki: :winner2: :fccpu:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Norman_RKN le 16 janvier 2012 à 23:11
Merci pour la participation à la «race charité» et prêt pour l'ordinateurs, qui comptent pour "rnaworld".
Bienvenue et merci. merci beaucoup.

Norman
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: [AF>Libristes] nico8313 le 16 janvier 2012 à 23:32
C'est un plaisir de participer à la course sur RNA  :jap: :jap: :jap:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 17 janvier 2012 à 16:28
Merci pour la participation à la «race charité» et prêt pour l'ordinateurs, qui comptent pour "rnaworld".
Bienvenue et merci. merci beaucoup.

Norman
Ce serait plutôt la "course de charité" s'il fallait traduire, mais garde "charity race" (ou "charity event"), on se comprend :)

Mais c'est gentil de passer nous voir  :kookoo:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: al@ON le 17 janvier 2012 à 20:46
(http://img.lbzh.fr/images/hellod.gif) Norman, thank you for being to pass here... good crunch to you. :hyperbon:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: lamoule le 06 mars 2012 à 11:29
Si vous cochez les ut XXL, sachez que certaines sont vraiment longues : mon record est de 1 700 000 secondes soit presque 20 jours (h24 bien entendu) pour un peu moins de 30 000 points
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Spica le 06 mars 2012 à 12:45
Ouais... du meme ordre de grandeur que les WUs sur Climate Prediction (les longues: Hadcm3n) qui ne rapportent que 12441.6 credits ... pour aussi environ 3 semaines de taff (1 500 000-1 700 000 secondes chez moi et je suis plutot bien equipé). RNA est bien meilleur crediteur que Climate donc ...
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 06 mars 2012 à 19:57
il ne faut pas oublier que les UT XXL de RNA n'ont pas de point de sauvegarde, ceci expliquant sûrement cela ;)
Titre: Re : Re : RNA World (béta)
Posté par: Spica le 06 mars 2012 à 22:54
il ne faut pas oublier que les UT XXL de RNA n'ont pas de point de sauvegarde, ceci expliquant sûrement cela ;)
OK,  :eek:  :eek: je vois, en apnée pendant 3 semaines en esperant qu'il n'y ait pas de coupure de courant et surtout ne pas faire d'autres projets en meme temps des fois que BOINC decide tout seul de faire autre chose... Pas pour moi donc....  :priz2tet: et je parle pas des MaJ de win$...
Merci Modesti pour ta precision importante  :jap:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 06 mars 2012 à 23:35
Et sur multi-coeurs, vu que la conso de RAM peut dépasser le Go/UT, limiter BOINC (perso 75%) ; suspendre FreeHal le temps qu'on calcule des UT XXL...

Celle-ci (http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=5688554) a redémarré je ne sais plus combien de fois, puis, après >500h de "temps écoulé", le compteur s'est remis à zéro et finalement - avec toutes les astuces ci-dessus - elle a fini par se calculer en >280h. Maintenant reste plus qu'à attendre un 3e courageux pour nous départager...
:D
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Pascal94 le 07 mars 2012 à 19:50
c'est marrant, j'ai calculé une XXL en à-peu-près 5H45min, c'est pas ce que j'appelle du XXL  :lol:

http://www.rnaworld.de/rnaworld/results.php?hostid=16193

88 points réclamés, c'est peu cher payé  :o
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 07 mars 2012 à 20:55
88 points réclamés, mais probablement 176 accordés ;)
Voire plus. Je ne retrouve plus le lien vers le forum RNA où il était question de la formule appliquée et des paliers de secondes pour le calcul des points.
Mais c'est au minimum : crédits accordés = (plus petit claimed) * 2
et au maximum : crédits accordés = (plus petit claimed) * 4
De mémoire.
Par contre, je ne me souviens absolument pas des paliers de secondes :cpopossib:
Titre: Re : Re : Re : RNA World (béta)
Posté par: lamoule le 08 mars 2012 à 00:13
OK,  :eek:  :eek: je vois, en apnée pendant 3 semaines en esperant qu'il n'y ait pas de coupure de courant et surtout ne pas faire d'autres projets en meme temps des fois que BOINC decide tout seul de faire autre chose... Pas pour moi donc....  :priz2tet: et je parle pas des MaJ de win$...
Merci Modesti pour ta precision importante  :jap:

Pour être honnête je ne fais pas tourner ces ut sur de "simples" pc, sinon c'est pas possible, les serveurs eux par contre ...

Le point positif c'est la consommation réseau qui est ridicule (une ut par jour en moyenne sur les serveurs) : 5mo/jour/serveur  :D
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 16 juin 2012 à 17:46
Tiens je croyais qu'il y avait une description du projet sur le portail  :??: :??:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Pascal94 le 23 juin 2012 à 12:24
Citer
small workunits (http://www.rnaworld.de/rnaworld/forum_thread.php?id=95)
Source:  RNA World (beta) (http://www.rnaworld.de/rnaworld/)
Samedi, 23 Juin 2012 09:49

The wu-generator is running and creates now also cmsearch S (short running) workunits. If you were waiting for them, now it is time to fetch them.

Yoyo
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Pascal94 le 22 décembre 2012 à 14:08
Citer
Moved XXL workunits to S (http://www.rnaworld.de/rnaworld/forum_thread.php?id=100)
Source:  RNA World (beta) (http://www.rnaworld.de/rnaworld/)
jeudi 20 décembre 2012 17:38

Since we are running out of S (short) workunits I moved some shorter XXL workunits to S workunits. This means, that S workunits run now up to 2 days. yoyo
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 22 décembre 2012 à 18:46
Bonjour le S ! :eek:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: TBirdTheYuri le 16 février 2013 à 22:10
J'ai actuellement une unité qui hyper longue (3.5% en 24h) qui va plus que dépasser la date limite, dans 10 jours.
Je continue jusqu'à la fin, ou bien elle sera considérée par le projet comme perdue et je peux alors la supprimer?
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 16 février 2013 à 22:15
Ce projet est toujours en beta ?
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Sébastien le 16 février 2013 à 22:24
J'ai actuellement une unité qui hyper longue (3.5% en 24h) qui va plus que dépasser la date limite, dans 10 jours.
Je continue jusqu'à la fin, ou bien elle sera considérée par le projet comme perdue et je peux alors la supprimer?
Il y a un topic (http://www.rechenkraft.net/phpBB/viewtopic.php?f=75&t=10717) sur le forum du projet pour demander aux admins de rallonger la durée des UT.
Attention, ces UT n'ont pas de points de sauvegarde.
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: TBirdTheYuri le 16 février 2013 à 22:56
Pas de sauvegarde?
Bon je vais la shooter alors, je relancerai ça une fois l'hiver passé, autrement elle recommencera à zéro à chaque reboot.

 :jap:  pour le lien
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Sébastien le 16 février 2013 à 23:20
Si tu souhaites calculer des UT XXL, il vaut mieux le faire dans une VM en faisant des snapshots réguliers.
Certaines UT peuvent durer plusieurs semaines.
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: TBirdTheYuri le 16 février 2013 à 23:52
Je préfère éviter les VM.
Je réactiverai ces unités XXL une fois la période hivernale passée, quand EDF aura épuisé le quota de jours rouges et blancs et que mes machines pourront alors tourner en continu :)
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: sebastien11 le 16 février 2013 à 23:58
Ah le tempo, quel bonheur  :rhaa: , moi mes deux machines principales ont tournées 24/24 en rouge en blanc en bleu, un vrai p'tit drapeau français   :lol:
Titre: Re : Re : RNA World (béta)
Posté par: fr@ntz le 17 février 2013 à 22:40
Ce projet est toujours en beta ?
c'est marqué partout sur le site  :/
http://www.rnaworld.de/rnaworld/ (http://www.rnaworld.de/rnaworld/)
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 18 février 2013 à 14:09
RNA c'est pour les crunchers couillus qui aiment travailler sur le fil du rasoir :D
Titre: Re : Re : RNA World (béta)
Posté par: Pascal94 le 18 février 2013 à 18:42
RNA c'est pour les crunchers couillus qui aiment travailler sur le fil du rasoir :D

I've got Big Balls (http://www.youtube.com/watch?v=nQSk0CYPvwE)  :D
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 18 février 2013 à 20:20
:lol:

Excellentissime ! Je connaissais pas du tout, on a même peine à croire que c'est eux au début ! :D
Titre: Re : Re : Re : RNA World (béta)
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 18 février 2013 à 20:51
Ce projet est toujours en beta ?
c'est marqué partout sur le site  :/
http://www.rnaworld.de/rnaworld/ (http://www.rnaworld.de/rnaworld/)

ok ok mais cela fait un moment quand même que c'est en beta..
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 27 février 2013 à 12:21
J'ai une unité XXL de + de 2600 heures avec même pas 3% en 1h40...
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Spica le 27 février 2013 à 12:26
1h40=3% donc 100% correspond à 100/3*1h40= 56h environ, c'est à dire 2jours et 8h on est loin de 2600h  :gniak: je dirais que c'est du XL a la rigueur, les longues CPDN c'est 500h
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 27 février 2013 à 12:43
en faite 2.943 en 2h :desole:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: ousermaatre le 27 février 2013 à 17:43
Oui, elles sont effectivement terriblement longues, certaines unités dépassent les 1000 heures de crunch.....environ 40 jours non-stop.  :pt1cable: :pt1cable:

Et lorsque tu enlèves l’option des XXL de RNAWorld, afin de cruncher sur de plus courtes unités, tu te retrouves quand même avec des unités XXL...

C'est dommage.  :/
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 27 février 2013 à 18:31
Je l'ai abandonnée car même pas 3% après 5h de crucnh... :eek:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Pascal94 le 27 février 2013 à 18:35
p'tit joueur  :D
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Spica le 27 février 2013 à 18:48
@poly: ne te lances pas a cruncher sur Climate prediction parce que la, c'est 600h les 100% donc 6h les 1% ou 1h pour 0,25%.... Mais ca marche tres bien....
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 27 février 2013 à 19:21
C'est quoi le problème d'avoir des unités très longues en fait ? (à part que RNA n'a pas de points de sauvegarde :siflotte:)
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: ousermaatre le 27 février 2013 à 19:57
oui, de mon côté, c'est celui -ci qui pose souci, lorsque tu as des mises à jour (merci windaube) à faire.....  :rhaa:
Titre: Re : Re : RNA World (béta)
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 27 février 2013 à 20:06
C'est quoi le problème d'avoir des unités très longues en fait ? (à part que RNA n'a pas de points de sauvegarde :siflotte: )

Mon PC ne calculs pas quand je dors...  :D la nuit
Titre: Re : Re : RNA World (béta)
Posté par: Pascal94 le 27 février 2013 à 20:08
oui, de mon côté, c'est celui -ci qui pose souci, lorsque tu as des mises à jour (merci windaube) à faire.....  :rhaa:

 :gniak:

naaan, je ne vais rien dire (http://www.fedora-fr.org/)  :siflotte:

Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: ousermaatre le 27 février 2013 à 20:18
 :smak: pit'être bientôt.....  :siflotte: :siflotte: ou en tout cas sous linux....  :siflotte:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 27 février 2013 à 20:25
C'est quoi le problème d'avoir des unités très longues en fait ? (à part que RNA n'a pas de points de sauvegarde :siflotte: )

Mon PC ne calculs pas quand je dors...  :D la nuit
La solution est simple : veille prolongée et pas arrêt total de la bécane. Ça marche bien.

Enfin, sous windows, faut voir... :siflotte:
Titre: Re : Re : RNA World (béta)
Posté par: Pascal94 le 27 février 2013 à 20:26
:smak: pit'être bientôt.....  :siflotte: :siflotte: ou en tout cas sous linux....  :siflotte:

en voilà une bonne nouvelle  :D
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: fr@ntz le 28 février 2013 à 15:22
 :/
J'ai une UT sous Debian qui tourne depuis 843h40mn !
4,70% effectué, temps restant estimé : 3982h32mn
date limite passée depuis le 4 février

Sur le site de RNA, il semble qu'il n'y ait eu aucun contact avec la machine (qui par ailleurs fonctionne très bien 24/24 avec le sensor QCN)
http://www.rnaworld.de/rnaworld/result.php?resultid=14880984

Personne n'a encore réussi à la calculer : je persiste bêtement ?
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=6093568  :??:

Citer
jeu. 28 févr. 2013 15:30:30 CET   RNA World   Task cms_GA-p[e30-50MB_Lin64f]_1_Oryza-sativa-Japonica-Group_CM000141.lin.EMBL_RF00177_SSU_rRNA_5_1330438623_87981_6 is 23.85 days overdue; you may not get credit for it.  Consider aborting it.


Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 28 février 2013 à 21:15
Essaye d'en causer sur le forum ? Je sais qu'ils ont un topic pour les demandes d'extensions de deadline du fait d'UT super longue, et normalement l'admin les prend en compte... mais celle-ci en particulier a peut-être un problème, c'est aussi dommage d'abandonner une UT après 800 de calcul si elle n'a pas planté... mais elle est peut-être également vérolée... ?
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 15 avril 2013 à 22:32
J'ADORE RNA (http://www.rechenkraft.net/phpBB/viewtopic.php?f=75&t=10717&p=138680#p138680). J'aurai même pas besoin de demander une extension de deadline.
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 15 avril 2013 à 22:47
Sincères condoléances, Jéjé :smak:
Avec un peu de chance, le temps passé sera au moins comptabilisé chez WUprop ;) (J'ai eu le cas avec une UT WCG qui a redémarré au bas mot 5x sur un ordi, ya bien 40h qui ont été comptabilisées chez WUprop, pour 12h chez WCG)
Titre: Re : Re : RNA World (béta)
Posté par: LOCTET SetiOne le 16 avril 2013 à 08:30
J'ADORE RNA (http://www.rechenkraft.net/phpBB/viewtopic.php?f=75&t=10717&p=138680#p138680). J'aurai même pas besoin de demander une extension de deadline.
Il serait intéressant (et cela vaut pour d'autres projets avec WU très longues) que l'envoi de ce type de WU ne se fasse pas vers des PC domestiques (quelque soit l'OS Mac, Linux, Crosoft ou autre) car nos PC sont dans des environnements (électriques) instables, les Crosoft ont des saturations de mémoire et le reboot leur fait du bien au moins une fois par semaine, donc c'est très risqué et frustrant ... n'est ce pas JC
Elle devraient n'être destinées qu'à des serveurs plus stables à tous égards.
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: sebastien11 le 16 avril 2013 à 10:26
Ils devraient surtout "adapter" leur wu au tout venant, ils connaissent le principe de Boinc quand même  :cpopossib: :D
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 16 avril 2013 à 13:34
Sur mon Mac et le PC du bureau je fais des CPDN méga longues sans soucis, le seul vrai problème est l'absence de point de reprise, dû à la nature des calculs faite par l'appli, l'admin a encore récemment confirmé sur le forum qu'il n'y aura pas de point de reprise sur cette appli car ce n'est pas possible...

La seule vraie solution : se faire ses propres points de reprise en mettant RNA dans l'OS d'une machine virtuelle qui se bakcup toute seule (snapshots) à intervalle régulier. Mais perso je ne souhaite pas monipoliser un ou plusieurs cores de façon permanente sur RNA (puisque ça se passe "en dehors" du boinc principal, auquel il faut d'ailleurs soustraire le nombre de core alloués à la VM pour que ça se passe bien), cela va à l'encontre de ma façon de cruncher (pleins de projets qui tournent tout le temps en fonction des priorités), la seule exception que je m'autorise étant freehal car n'existe pas sous OS X et c'est nci, donc j'ai une VM linux qui le fait tourner.
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Xe120 le 24 avril 2013 à 13:39
Pour ceux qui aiment bien le projet, les classements et les défis, ils ont rajouté un classement des plus grosses UTs calculés.  :coffeetime:

http://www.rnaworld.de/rnaworld/y_monster.php (http://www.rnaworld.de/rnaworld/y_monster.php)
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 25 avril 2013 à 00:26
Ouais c'est clair qu'il donne un crédit hallucinant pour remercier ceux qui crunche ces méga longues WU, je le trouve même carrément disproportionné, mais bon quand ça te pète au nez après plusieurs centaines d'heures c'est aussi du foutage de gueule... et t'as 0 crédit en remerciement dans ce cas.

En comparaison CPDN t'as du long mais c'est du sérieux, et y'a même des tricklets pour avoir des crédits au fur et à mesure du calcul de la WU...
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Lic le 25 avril 2013 à 12:09
Oh un Sébastien en 60ème position  :D :+1:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Fred VW le 06 mai 2013 à 17:50
Il me reste une UT qui devait finir aujourd'hui, elle est à 100% depuis ce midi et depuis l'état est toujours : Calcul en cours.
Le temps restant n'est plus affiché..

J'en fais quoi? Je la laisse encore?
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 06 mai 2013 à 18:00
Oui, oui, laisse-la se terminer tranquillement. Ce serait ballot de perdre le temps de calcul
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: RLDF le 06 mai 2013 à 23:20
sur 2 machines, j'ai laissé continuer 6j après le 100% et elles ont fini par se terminer
patience, ça paye
tant que la deadline n'est pas dépasser de quelques jours, ça compte toujours :jap:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Fred VW le 07 mai 2013 à 10:02
ha d'accords, je la laisse alors, la deadline est pour le 22 donc..
Titre: Re : Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 11 mai 2013 à 15:59
sur 2 machines, j'ai laissé continuer 6j après le 100% et elles ont fini par se terminer
patience, ça paye
tant que la deadline n'est pas dépasser de quelques jours, ça compte toujours :jap:
6 jours après 100% c'est quand même 'port nawak...
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Fred VW le 11 mai 2013 à 16:10
J'ai 2 UT depuis lundi a 100% soit plus de 110h après avoir atteint les 100%..

C'est gênant, ca m’empêche de rebooter pour que mon fichier host de yoyo soit pris en compte..
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Hildor le 11 mai 2013 à 19:19

Normalement tu n'as pas besoin de rebooter,
il te suffit de relancer Boinc.
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Fred VW le 11 mai 2013 à 19:58
[HS ON]  :D

Edit :

Effectivement ! Merci de l'info ca évitera la fuite de quelque UT !

11/05/2013 20:03:12 | yoyo@home | Scheduler request failed: Couldn't connect to server
11/05/2013 20:03:15 |  | Project communication failed: attempting access to reference site
11/05/2013 20:03:17 |  | Internet access OK - project servers may be temporarily down.
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Fred VW le 12 mai 2013 à 21:33
Je viens de perdre 4 UT qui représentais presque 950heures de calculs, ils leurs restaient moins de 12h 
:rhaa: :rhaa: :rhaa: :rhaa: :rhaa: :rhaa: :rhaa: :rhaa: :rhaa: :rhaa: :rhaa: :rhaa:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 12 mai 2013 à 21:40
Oui je sais, ça fait mal... tu les as perdu comment ?
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Fred VW le 12 mai 2013 à 21:58
Erreur de BoincManager (Plus aucun projet ni aucune tache), et le CPU était utilisé a 0%
J'ai donc quitté Boinc manager pour le relancer et quand il a redémarré les UT n'était plus qu'a 2%...

J'abandonne se projet, les UT sont trop longue pour moi..

Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 13 mai 2013 à 09:03
J'avoue que tente de nouveau mais s'il me refait le coup de la dernière ut que j'avais aussi perdu...
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: fr@ntz le 15 mai 2013 à 00:25
Je fais confiance à l'admin qui m'a prolongé une UT qui est a + de 2600h de travail ! Il en resterait 4600. Le % de progression varie de 2 à 16% selon les jours (j'espère qu'il ne recommence pas indéfiniment). Si je ne suis pas crédité de ces heures, je laisse aussi tomber ce projet, à mon grand regret  :/
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Maurice Goulois le 15 mai 2013 à 01:47
J'ai laissé tomber, je n'ai aucune machine dont je peux garantir le fonctionnement aussi longtemps, surtout à l'approche du réchauffement estival.
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 16 mai 2013 à 15:27
C'est clair que c'est une appli kamikaze en ce qui concerne l'appli cmsearch XXL (long), je rappelle l'existence des cmsearch S (short) mais il y en a pas des masses (http://www.rnaworld.de/rnaworld/server_status.php) en ce moment :D
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: mamouth le 16 mai 2013 à 15:59
utilisateurs dans les 24 dernières heures  ==> 5
ça en dit long
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 16 mai 2013 à 18:29
2547 ordinateurs actifs dans les 7 derniers jours, y'a quand même quelques courageux :)

Mais 15502 ordinateurs avec crédit, y'a eu du déchet :D
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Fred VW le 16 mai 2013 à 19:23
Au bon vieux temps, s'était que du Short  :love:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 27 mai 2013 à 12:24
Citation de: Michael
Well, the good news is: checkpointing appears to come up soon. After all. :D (http://www.rechenkraft.net/phpBB/viewtopic.php?f=75&t=10717&p=139880#p139838)
Des points de reprise bientôt sur RNA. Ça change tout :)
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 27 mai 2013 à 18:35
c'est clair
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: [AF>Libristes>Jip] Elgrande71 le 28 mai 2013 à 12:16
En voilà, une bonne nouvelle.
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 24 juin 2013 à 18:18
En si j'ai bien compris ce qu'il veulent faire pour avoir des points de reprise, c'est carrément inclure l'application dans une VM, à la T4T. Et donc les points de reprise seraient ceux de la VM complète, leur appli ne serait toujours pas capable d'en avoir à l'intérieur de la VM, mais on s'en foutrait.

C'était en fait ce qu'ils suggéraient depuis longtemps dans leur forum, s'occuper soi même de sa VM et mettre RNA dedans, mais là ça serait toutotomatix.

Donc les détracteurs des VM continueront de passer leur chemin, et les autres se remettront à RNA :)

(quand ça sera fait...)
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: toTOW le 30 juin 2013 à 16:40
Solution usine à gaz :/
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 01 juillet 2013 à 15:36
Oui, l'alternative étant "pas de solution"...
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: sebastien11 le 02 juillet 2013 à 20:41
Ils ont fumés pour les crédits ?  :cavapobienmwa:  2725 points pour une unité de plus de 111 heures  :pt1cable:  :rhaa: ça va pas bien !!!
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 03 juillet 2013 à 09:49
Tu peux nous mettre un lien vers l'UT, STP ?
Il me semble que les crédits sont un calcul savant à partir du "claimed".
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: sebastien11 le 03 juillet 2013 à 10:00
voici l'objet du délire  :siflotte:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 03 juillet 2013 à 10:20
Cherche pas, c'est parce que ton wingman l'a fait presque en moitié moins de temps que toi et donc son "claimed" est nettement inférieur. :spamafote:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: sebastien11 le 03 juillet 2013 à 10:46
Merci pour l'explication  :jap:  :cry:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 03 juillet 2013 à 12:19
Enfoiré de wingman !!

(http://www.wingmantactics.com/wp-content/uploads/2010/07/wingman-feedback-3.jpg)
Titre: Re : Re : RNA World (béta)
Posté par: [AF>Libristes>Jip] Elgrande71 le 03 juillet 2013 à 17:58
Enfoiré de wingman !!

(http://www.wingmantactics.com/wp-content/uploads/2010/07/wingman-feedback-3.jpg)
:JC:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Sloan le 03 juillet 2013 à 22:51
 :hilare:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: laurent02 le 07 juillet 2013 à 21:11
Bonjour,

J'avais profité du PDLS pour essayer quelques unités RNA, malgré les retour négatifs...
J'ai terminé les 8 unités chargés et aucune est parti en erreur. Certaines sont en pending, les autres ont été créditées. J'ai pris la peine d'attendre un ou deux jours pour des wu qui étaient à 100% et qui semblaient tourner en rond, et j'ai bien fait.
La plupart des temps annoncés au départ étaient largement sur-estimés, avec des temps de travail parfois divisés par deux.

Par contre, c'est vrai, il faut laisser le PC tourner ! Je pars en vacances dans trois jours, et il était temps que ça se termine !
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Sloan le 08 juillet 2013 à 04:33
Merci pour l'info laurent02 à la fin du PDS2 je retesterais :hello:
Titre: Re : Re : RNA World (béta)
Posté par: Fred VW le 08 juillet 2013 à 23:42
@ laurent02

Ca allait toujours très bien aussi chez moi jusqu'au jour où...
J’espère que ca ne t'arrivera pas si tu reprend le projet en rentrant de vacance!

Et au passage, passe de très bonne vacance!
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: laurent02 le 09 juillet 2013 à 21:42
En rentrant je suivrai les consignes de l'AF pour le PDLS ! Alors faites un bon choix  :)
Pour les vacances ça va aller...

Bon crunch avant l'augmentation de la facture d'électricité !  :siflotte:  :kookoo:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: chev6791 le 06 août 2013 à 11:29
 :D et une XXL validée de plus

prévue pour 140heures elle aura au final duré 332 heures  :eek:

mais au final 38489 granted credit  :love:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: jascooby le 06 août 2013 à 12:24
 :kookoo:

Sur mon Core I3 j'en ai 2 qui calculent depuis + de... 370 heures !

La première est bientôt terminée (plus que 70 heurs !  :D), par contre la seconde est à... à peine 10%  :eek: avec une deadline au 10 aout !  :pt1cable:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: chev6791 le 06 août 2013 à 12:26
J'ai oublié de dire qu'elle avait atteind les 100% au bout de 160heures, comme quoi faut être patient.
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 06 août 2013 à 12:49
:kookoo:

Sur mon Core I3 j'en ai 2 qui calculent depuis + de... 370 heures !

La première est bientôt terminée (plus que 70 heurs !  :D), par contre la seconde est à... à peine 10%  :eek: avec une deadline au 10 aout !  :pt1cable:

Tu peux demander une prolongation pour ton UT chez Yoyo. Personnellement, je passe par le forum SG (http://www.seti-germany.de/forum/medizin-und-biologie/3946-rna-world.html) pour le faire, mais il doit y avoir un topic dédié sur le forum RNA aussi. Il suffit de mettre le lien vers ton UT (Workunit ou Task) ainsi que l'avancement actuel (heures + pourcentage).

L'UT que j'avais était à 59% quand je suis partie du bureau vendredi midi et elle était renvoyée et validée quand je suis rentrée (vers minuit). Je crois que les pourcentages sont un peu .... aléatoires :D
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: jascooby le 06 août 2013 à 12:53
Merci de l'info !  :jap:

Mais je pense qu'elle sera créditée même si la deadline est dépassée du fait que le calcul a début avant  :??:

Oui c'est très fantaisiste les temps de calcul, avec un P4 ça doit prendre une vie entière !  :D

Tu as essayé avec ton Athlon XP ?
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 06 août 2013 à 14:11
Il vaut mieux demander une prolongation. Ça ne coûte qu'un message et ça évite que l'UT ne soit mise en "Time out" ;)

Pour répondre à ta question: non, je n'ai pas encore mis l'Athlon XP dessus, mais l'Athlon 64 3000+ et - par le passé - même mon portable (modesti-unika), un Pentium M :D Mais à l'époque il devait encore exister des UT S :D
http://www.rnaworld.de/rnaworld/hosts_user.php?sort=rpc_time&rev=0&show_all=1&userid=846
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: jascooby le 25 août 2013 à 22:00
 :hello:

J'en ai une belle en pending :
http://www.rnaworld.de/rnaworld/result.php?resultid=14913333

A noter qu'elle a mouliné encore 8 jours après avoir été terminée à 100%  :D
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: [AF>Libristes] nico8313 le 25 août 2013 à 22:04
Ta pas vu? elle est partie en erreur de calcul !









































































 :D :D :D :D :D :D
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: jascooby le 25 août 2013 à 22:11
Bien joué mais ça ne prend pas chenapan !  :o :lol:

Server state   Over
Outcome   Success  :miam:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: [AF>Libristes] nico8313 le 25 août 2013 à 22:28
Oui mais le "Validate state"   indique   "Initial"
http://www.rnaworld.de/rnaworld/result.php?resultid=14913333
Il devrait y avoir écrit "Valide"  :D

Bon je vais pas te porter la poisse non plus  :lol:

Je croise les doigts et prie le dieu du binaire  :D
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: [AF>Libristes] nico8313 le 25 août 2013 à 22:47
Ta vu le nombre de personnes qui ont fait la même UT que toi et s'y sont cassés les dents  :D

http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=6329132


Faudrait que j'arrive à chopper l'UT pour essayer aussi  :o :o :o :o :o :o  :D :D :D
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: jascooby le 26 août 2013 à 02:22
Oui j'ai vu, ils ne sont pas patients, c'est tout !  :D
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Norman_RKN le 11 septembre 2013 à 12:11
new news ;)

Citer
Checkpointing coming up
Presumably next wednesday we will install the new checkpointing system. So please do not be surprised if there is a system outage. Old WUs should be preocessed as usual - so do not worry about your long-runners. If you like to use the checkpointing system, you will have to install VirtualBox. Of course, we will first send out WUs to the beta testers.

Citer
Hello,

I'm preparing the Beta test for the new cmsearch VM application. I'm looking for volunteers that want to try this out. As far as I know, this is the first real implementation of the BOINC VirtualBox feature in public (Test4Theory uses the same technology but has a very different VirtualMachine).

I'm going to deploy a new Linux and Windows application after the server upgrade on Thursday. What you need for this betatest is:

    a 64-bit processor and operating system (Windows or Linux)
    BOINC Version 7.0.x (or newer)
    VirtualBox (v 4.2.16 is recommended)
    at least 2 GB of free hard disk space (allow BOINC to use it!)
    at least 4 GB of RAM (I may lower this if it is a problem)
    a reliable Internet-connection (the initial Download is roughly 180MB)
    Join the VirtualBox Beta team on RNAWorld


Join the VirtualBox Beta team as all members are getting the test workunit. Please post here if you have questions, problems or want to participate.

I read on Test4Theory that VirtualBox 4.2.18 is buggy, so please use 4.2.16 if possible!

betateam is: http://www.rnaworld.de/rnaworld/team_display.php?teamid=1801

Citer
I upgraded the servercode and now some additional steps are necessary:

    go to Project Preferences and select "allow beta applications"/"Testanwendungen erlauben" and if you changed the "Run only the selected applications" setting please also select the new cmsearch VM (VirtualBox) 1.0.2 application on the same page
    as with every test, please make sure you have a backup of your important files (I don't expect the app crashing your computer, but better be safe than sorry)


The new Design is not final and will be changed later. I will now continue with the upgrade of all the backend services.

if you have some additional questions there is a thread in rna-world board: https://www.rechenkraft.net/phpBB/viewtopic.php?f=75&t=13058

thx for absolute beta-testing  :love:


Norman
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Norman_RKN le 11 septembre 2013 à 13:00
changed: The Testwork is now available and is send out to all that have set "allow beta applications" and "cmsearch VM" application. The Beta team is not necessary anymore you may switch back to your old team.

Norman
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Pascal94 le 11 septembre 2013 à 13:10
Hi Norman  :kookoo:

Well, as I already run T4T usining VB, I'm now trying to test RNA Beta with VB  :yahoo:

I hope that these 2 projects can run side-by-side without crashing  :D



Edit : ouch  :eek:
Citer
Wed 11 Sep 2013 13:11:20 CEST | RNA World | Message from server: cmsearch VM (VirtualBox) 1.0.2 needs 4005.43 MB RAM but only 3550.92 MB is available for use.
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Sph3re le 11 septembre 2013 à 13:11
idem pour les XXL environ 170h estimées ( sur un i7 )

Vu ce que j'ai lu plus haut ....
 .... j'en ai lancé aucune

j'attends patiemment les Shorts  et/ou les upperCASE ...
& on verra ce que ça donne ....

+++ :kookoo:
Titre: Re : Re : RNA World (béta)
Posté par: Norman_RKN le 11 septembre 2013 à 14:39
Hi Norman  :kookoo:

Well, as I already run T4T usining VB, I'm now trying to test RNA Beta with VB  :yahoo:

I hope that these 2 projects can run side-by-side without crashing  :D



Edit : ouch  :eek:
Citer
Wed 11 Sep 2013 13:11:20 CEST | RNA World | Message from server: cmsearch VM (VirtualBox) 1.0.2 needs 4005.43 MB RAM but only 3550.92 MB is available for use.

Hi Pascal,

yes, atm there are tests with big WU with short runtime.
because we dont know how much RAM we need for xxl-wu the settings are very high for the moment.
after good results the config will be changed of course for all types of WU.
64-bit systems with more then 4GB RAM (free) are necessary for current runs. ;)

 :kookoo:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 11 septembre 2013 à 15:11
Avec mes 16 go de ram je vais en essayer une si j'arrive à en avoir :desole:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 11 septembre 2013 à 15:17
I'm preparing the Beta test for the new cmsearch VM application. I'm looking for volunteers that want to try this out. As far as I know, this is the first real implementation of the BOINC VirtualBox feature in public (Test4Theory uses the same technology but has a very different VirtualMachine).
Hi Norman : I think you are referring to the "old" (initial) T4T application where they would use a specific VirtualBox wrapper, but the current T4T application version (after extensive beta testing during several months) is now using the official boinc / berkeley wrapper - Rom Walton did help a lot during the beta test and released several versions of that wrapper thanks to beta testing inputs.

So I don't thing this is the "first real implementation of the BOINC VirtualBox feature" :)

But personally I'm quite happy you did that for RNA, I had stopped using it because I lost to many WUs after crunching during dozens of hours, on my Mac. I hope you will release a Mac version of your new application.
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Norman_RKN le 11 septembre 2013 à 17:18
salut Jerome,
we hope to build a application for everyone.
the f***ing systemcrashes/reboots/other_things are very  :electric: :cavapobienmwa:
now we have a solution that all participiants can shutdown the system every time.
a monster xxl is not a problem ( ok, RAM) in runtime anymore.
if you crunch one hour or 24/7 should now not more the important thing.  :pt1cable:

return to your qestion.
I´ve a answer from Chris (he is building the VM and did changes on server) for you Jerome:

Citer
Yes, it's right that T4T uses the same technique (vboxwrapper) but they still have a Virtual Machine that is running as one really long task on your computer. The actual scientific work is not distributed through BOINC but through some other CERN-own mechanism. So BOINC is just a medium to distribute the CernVM to volunteers where it operates without knowledge of the BOINC Client. That was not the purpose of the BOINC VirtualBox Feature. RNA World is using this feature, as it was intended, by distributing scientific work through BOINC to volunteer computers honoring all the preferences a user sets.

Regards
Christian

if all things are fine i think we release a version for MAC too. why not ? is a VM ;)

if someone have questions ? shout out ;)

Norman
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Norman_RKN le 11 septembre 2013 à 17:43
update:
yes, the MAC app will be coming soon. tests are running. if it´s all good then we could release also for MAC  :kookoo:
also a new windows app - the wrapper is running well but there are a few things that could be a litte bit better.

Norman
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 11 septembre 2013 à 18:00
Ah it's much clearer, I fully agree with what Chris explains :) T4T VM is doing all the work under cover, they designed a special webpage to connect to a small webserver inside the VM in order to have more informations about what's going on (jobs, logs...), but if your VM system is behaving like a regular boinc project "through" a VM, it is actually quite good.

Do you measure the loss of computing power between the VM WU compared to your regular WU? this is an issue that is often debated but I don't have a clear answer on this.

Also I'll be more than happy to test your Mac version of the (same) VM... once we finish our current RAID (http://www.boinc-af.org/actus-af/1414-raid-d-automne-2013.html) on TSN POGS :)
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Norman_RKN le 11 septembre 2013 à 18:24
No I didn't measure the loss through virtualisation. What I read somewhere else it should be around 10% at most. With a runtime of 100h per task this sounds a lot but you also gain checkpointing that could otherwise lead to the loss of all of the 100h (without checkpointing) and not only the last 30 to 60min (with checkpointing).

Maybe we could rerun some older work but that wouldn't be the same.
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 11 septembre 2013 à 18:28
I definitively praise the checkpointing against "limited" (or not) loss of power :D

I also have 10% loss as a vague reference, but if you have the occasion to compare it will interesting to confirm this.
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 11 septembre 2013 à 18:30
Question to Norman: Does this mean that you will definitely give up the "old/classical" WUs without VM and checkpoints?
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Norman_RKN le 11 septembre 2013 à 19:23
unclear...
i think the short/very short WU dont need a VM, its more for the long runnig WU.
it makes more sense then to run tiny WU in a VM.
maybe we can bundle a big amount of tiny WU in one WU if the VM´s make no trouble.
i think we use it for the long running xxl and maybe for the moderate WU.
the time must be discussed before but i think we will find a good timesolution to decide the right value.

for now, we should test what we can do.
all is new ;)

i will inform AF surely about the progress.

Norman

Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 11 septembre 2013 à 21:00
Thank you. So I'll have to try and get one or two "normal" XXL before you generalize the VMs in order to get my 1000 hours at WUprop :D
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Norman_RKN le 11 septembre 2013 à 22:29
WUprob ? your bunker is full right ?  :lol:
OOhhouu, we will never do that and stop running WU !
the workload you have - you have !
if so we grant lost credits of sure.

should it be any trouble just inform us ;)

Norman
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 11 septembre 2013 à 23:07
Mmmm modesti tu peux nous faire une petite trad là parce que j'ai franchement rien compris à ce qu'il raconte ! :pt1cable: :gnu: :gno: :gni:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Norman_RKN le 11 septembre 2013 à 23:36
now we have a few hundert WU for testing.
feel free to test and report bad things ;)

Norman
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 12 septembre 2013 à 08:59
Mmmm modesti tu peux nous faire une petite trad là parce que j'ai franchement rien compris à ce qu'il raconte ! :pt1cable: :gnu: :gno: :gni:
WUprob ? your bunker is full right ?  :lol:
OOhhouu, we will never do that and stop running WU !
the workload you have - you have !
if so we grant lost credits of sure.

should it be any trouble just inform us ;)

Norman
Traduction:
Wuprop? ton cache est plein, c'est ça?
OOOOOOOOh nous n'arrêterons jamais des UT en cours!
La charge de travail que vous avez, vous l'avez!
Si c'était le cas, nous accorderions les crédits perdus bien sûr.

S'il y avait le moindre problème, il suffit de nous en informer
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 12 septembre 2013 à 09:04
WUprob ? your bunker is full right ?  :lol:
OOhhouu, we will never do that and stop running WU !
the workload you have - you have !
if so we grant lost credits of sure.

should it be any trouble just inform us ;)

Norman

Hi Norman,
The trouble is that we are in full raid at the moment on other projects, and before there was the Wow! Event of SG. So I don't have any WUs left on my computers. I'd love to have just one our two WUs to complete the 1000 hours of computing on the old XXL application (338 hours would be enough) :siflotte:

But never mind, go on with your tests. That's simply a wish of one of many many crunchers :D
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 12 septembre 2013 à 13:17
J'ai eu pas mal d'unités ce matin, c'était une par coeur/CPU donc 8 unités calculés dans une VM ?
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 12 septembre 2013 à 17:10
T'as activé les UT béta dans tes préférences RNA ?

Si t'avais 8 VM en même tu t'en serais vite rendu compte question RAM à mon avis, regarde ton gestionnaire de tâche ça doit pas se présenter pareil que des WU boinc normal : tu devrais voir des wrapper côté boinc, ne consommant presque pas de CPU, et des tâches de VirtualBox à un autre endroit qui consomment le CPU. Mais à mon avis chaque tâche doit bouffer pas mal de RAM.

A moins qu'ils ne soient capables de mettre plusieurs WU dans une même VM ?

--> Norman : is it one VM per WU ? can you have several WU/VM at the same time ? or can it be multiple WUs in one VM ?
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 12 septembre 2013 à 22:02
Non pas beaucoup de ram utilisés... en comptant tout les autres trucs en fonction sur mon PC pendant leurs calculs j'étais dans les 5gm de ram utilisés
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: toTOW le 13 septembre 2013 à 00:33
Raaaah, encore une VM :priz2tet:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 13 septembre 2013 à 08:02
Il revient et il est pas content. toTOW, l'homme qui n'aimait pas les VM.

(à lire avec une voix super grave)
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: chev6791 le 13 septembre 2013 à 10:40
Ben moi j'aimais bien les XXL  :lol: , il y avait un challenge supplémentaire à les mener à terme  :hyperbon:
Titre: Re : Re : RNA World (béta)
Posté par: Norman_RKN le 13 septembre 2013 à 12:43

--> Norman : is it one VM per WU ? can you have several WU/VM at the same time ? or can it be multiple WUs in one VM ?

yes and no.
how could i that explain.
it´s a difference between T4T and rnaworld. we are the only project that do that in this way.
the first time you (boinc-client) download the compressed VM from projectpage (rnaworld)..
it´s round about 180MB but you need that download only one time.
the new client can communicate with the VM active and if you want only 1 WU to crunch then it is so.
if you change to 8 cores then you see 8 VboxHeadless.exe in your taskmanager but not 8 fully loaded VMs.
VM is loaded one time so you can change in your boincmanger how many WU you want to crunch simultanly.
the VM is starting for each WU a VboxHeadless.exe as processname of course.
RAM is allocated with dynamic method so the WU/VM dont reserve the complete RAM from beginning. only what are needed for the moment.
It´s like the old apps but with the difference it´s with checkpointing now and you could shutdown or crash your system everytime :D
per default the VM stores a checkpoint every 10 minutes but you can change that in your boincmanager of corse.

NOTE: dont use PAE/service-installation of BOINC. with a PAE/service installation we cant communicate with the VM.
uncheck this option if you make a fresh/reinstall of boinc.

Norman
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Pascal94 le 13 septembre 2013 à 12:51
Hi Norman,

could you try to downsize the RAM requirement from 4005 MB to 3500 MB ?
Titre: Re : Re : RNA World (béta)
Posté par: Norman_RKN le 13 septembre 2013 à 13:04
Hi Norman,

could you try to downsize the RAM requirement from 4005 MB to 3500 MB ?

yes surely, we did that only for the first tests of big WU´s.
this requirement is later only for the xxl WU because they need more RAM.
on can say secureoption. it´s not luky if the WU crashed because no RAM available  :priz2tet:
the ordinary WU we set to a much lower value because the RAM-usage is not a big point.
we will release also 32-bit versions too for the smaller WU.
dont forget, we are still in testing. ;)

the first tests are finished and we analyse the results.
first errors with pathlenghts > 256 chars on windows and serviceinstallation of boinc (did not work and will not work) we have detected and solved.
with a serviceinstallation /pae/  of boinc we cant communicate with the VM. :cpopossib:

the next workload is next week monday until then we analyse and write down reports.
the results we have are really good and we have not todo much as expected. :sun:

Norman
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: chev6791 le 13 septembre 2013 à 13:25
For the service install not communicating with the VM, proably the same issue as with GPU.
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Norman_RKN le 13 septembre 2013 à 13:28
it´s possible.
we cant get rights.. access denied blabla.
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 13 septembre 2013 à 14:30
Ce serait pas mal de partager les infos  pour les non anglophones  :ange: :cpopossib: Merci
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 13 septembre 2013 à 16:34
Thanks for the info Norman, regarding the explanation about the way the VM is working with multiple WU it's good news.

About service installation, my Mac has boinc as a service and T4T vboxheadless is working though - at some point there was a Mac issue and they thought it was because I'm using a service, but then they solved the issue (which was not related to this finally) and it's working fine.

Are you using boinc_dev mailing list ?


Et en français ben heu, ça avance :)
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Norman_RKN le 17 septembre 2013 à 00:09
Citation de: ChristianB
Thanks to the good support by our helpful Betatester, here are some preliminary results from the cmsearch VirtualBox Betatest last week:

  • The good news first: checkpointing is working with the VM, although we may need to find out how to change the frequency of snapshots.
  • Automatic deadline extension is also working, although we didn't need it for the Betatest I could see trickle messages coming in on the server.
  • On Windows systems the maximum path length of 256 characters is reached due to long tasknames. The client uses the taskname to create the VM in a subfolder of the slot directory using the taskname as folder and filename thus double the character usage. We currently circumvent this by shortening the taskname as much as possible.
  • Under some unknown circumstances the vboxwrapper reports the exit status 194 when it can't clean the VM subfolder after the VM shuts down normally. The results are intact and uploaded to the server so I manually mark the result a success. We try to find a better solution.
  • Running more than one VM on a host with limited RAM may lead to sluggish behavior for the user. The Client shouldn't start a VM task if not enough RAM is available, this will be investigated with the BOINC developers.
  • VirtualBox 4.2.18 has a problem when recovering from a snapshot and the task will fail. This is investigated by BOINC developers as T4T and Climate@home have the same issue. I would encourage all Betatesters to install 4.2.16 if possible or deselect the cmsearch VM app in project preferences.
  • Users that have installed BOINC as a Service (Windows only) also have to stop participating in the Betatest or upgrade the BOINC Client to 7.2.11 (unstable developer version) to see if this issue is fixed.
  • Credit is granted based on used CPU time of the vboxwrapper not the used CPU time of the VM (that's why it is so low), this is under investigation.
  • Lack of RAM is also an ongoing issue as I try to modify the VM to detect a high memory usage by cmsearch that is reported back to the server so we can send the task to a computer with a larger amount of RAM. When this is solved we will lower the 4GB RAM requirement and also provide 32bit VM's.
Most of this will be discussed at the BOINC workshop in Grenoble. The cmsearch VM application will stay Beta but I may convert some production tasks from XXL to VM to test our backend processing.

The remaining cmsearch XXL tasks are phased out gradually. All workunits that don't have at least one successful result will not be resend but wait for conversion to cmsearch VM. The workunits that have a successful result will be resend to computers that have a high "always on" probability.

Thanks again to all Betatesters.

That are the facts of the moment and can/will be on some parts changed.
You will surely see a RNAWORLD-reloaded ;)

Norman
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Norman_RKN le 22 septembre 2013 à 13:37
we have now a app for Mac OS 10.5 or later but no WU atm to test in the pipeline.
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 22 septembre 2013 à 19:52
Great thanks for the info, I hope we'll soon get some work :)
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Sph3re le 22 septembre 2013 à 21:50
i'll be pleased to work on the new ones ....
( im on Mac Too as JeromeC )
For now i just get 1 of the last ( maybe the last ) "XXL" avaible on the server ...
and i'll start it Tomorrow ... just to see what happens ....
Thanks for the info and the care on Macs users ...
 :kookoo:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 22 septembre 2013 à 23:07
Bonne chance !!! :D

Les XXL ça a été la cata sur mon mac...
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 22 octobre 2013 à 09:23
J'ai enfin eu 2 nouvelles WU VM/VB, la bonne nouvelle c'est que ça checkpointe et ça mouline, la mauvaise c'est que c'est peut-être cette appli qui me met le souk dans boinc qui s'est déjà arrêté complètement (ou presque) à 2 reprises... Mais j'ai aussi une WU VM/VB de T4T qui tourne, coïncidence ? (... ^_^)
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: [AF>Libristes] cottesloe le 30 octobre 2013 à 15:42
Salut à tous,

Question à deux balles: les UTs cmsearch XXL font des chexkpoints tous les combien de temps?  :??:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 30 octobre 2013 à 15:51
Si c'est une UT sans VM: jamais. Enfin si, un checkpoint au bout de 2 min et qq et après plus rien.
Pourquoi ?

Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: [AF>Libristes] Pascal le 30 octobre 2013 à 15:59
 :kookoo: Sinon, tu peux avoir des infos ici :
http://wuprop.boinc-af.org/results/projet.py?projet=RNA+World&application=cmsearch+XXL+%28long%29+1.0.2 (http://wuprop.boinc-af.org/results/projet.py?projet=RNA+World&application=cmsearch+XXL+%28long%29+1.0.2)
ou là en mettant les données qui t'intéressent :
http://wuprop.boinc-af.org/results/check.py?cpuid=58&tri=projet&sort=asc
Titre: Re : Re : RNA World (béta)
Posté par: [AF>Libristes] cottesloe le 30 octobre 2013 à 21:23
Si c'est une UT sans VM: jamais. Enfin si, un checkpoint au bout de 2 min et qq et après plus rien.
Pourquoi ?

Bah, parce que j'en ai pris une sur mon PC sous Arch Linux, qui tourne H24, mais qui doit être redémarré parfois, genre après une mise à jour du noyau...  :D
Je sens que je vais la traîner un bon moment celle là...
Mais pourquoi ils ne font pas un système "à la ClimatePrédiction@home"?
Ou au pire un ou deux checkpoints par jour...  :cpopossib:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 30 octobre 2013 à 23:31
Y'a jamais eu de checkpoint sur ce projet parce qu'ils ne pouvaient pas en avoir (raisons complexes, lire leur forum).

Ils ont donc une appli en béta, la solution est d'inclure la WU dans une VM (comme T4T) qui elle fait des checkpoint, c'est à dire que les états de la VM sont sauvegardées, l'appli (la même) qui tourne dedans n'est toujours pas capable de faire ses propres checkpoints.

Je me suis lancé dans le test de cette chose, et je viens d'arrêter après 200 heures (https://www.rechenkraft.net/phpBB/viewtopic.php?f=75&t=13058&p=143700&sid=a9d63918e3c58036edc23cfc25090114#p143700) car ils vient d'annoncer un bug qui faisait que le % d'évolution était faux et que les résultats scientifiques ne seraient pas pris en compte (étant faux aussi, apparemment). Donc oui c'était une béta mais oui ils m'ont saoulé, j'arrête le test avec eux, j'attendrai qu'ils sortent un système stable et je participerai.

La VM était très grosse (bien plus que celle de T4T), genre 1,5 Go de RAM sur mon Mac.
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 31 octobre 2013 à 09:59
@ cottesloe: Si ça peut te rassurer, j'en ai une actuellement qui a redémarré à presque zéro le WE dernier après plus de 3 jours de calculs: il y a eu de l'orage et le différentiel a sauté pendant que je n'étais pas chez moi, les onduleurs n'ont pas tenu, forcément. D'un autre côté, l'UT est donnée pour une durée de 10 semaines sur leur système de référence et le seul qui a réussi à la mener à terme actuellement a mis 1460h. Donc que représentent ~70-80h? :D

Par contre, j'ai déjà demandé une prolongation pour mon poulet (http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=6284331) :D Parce que c'est sûr qu'il ne sera pas cuit d'ici le 29 novembre :D
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: [AF>Libristes] cottesloe le 01 novembre 2013 à 21:22
 :kookoo: Modesti

Ouais, je vais essayer de jouer le jeu en allant au bout de cette UT.
Soyons fou !!!  :gno:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 02 novembre 2013 à 10:50
Si tu y arrives, tu ne seras pas déçu côté crédits ;)
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 02 novembre 2013 à 13:59
Mais si on te dit au bout de 200h "ah ben non faut les abandonner" forcément tu seras déçu...
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: [AF>Libristes] cottesloe le 02 novembre 2013 à 19:20
Même pas peur...  :blbl:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: chev6791 le 05 novembre 2013 à 17:23
 :D je me fais un petit poisson http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=6098560 (http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=6098560) y en a que pour 18 semaines, ca c'est du challenge  :lol:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Lic le 06 novembre 2013 à 09:37
A la fin ça donne une appli en vert dans WuProp avec une seule WU lol.
Bonne chance ;)
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 06 novembre 2013 à 23:24
Oui, il en faut.
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Philippe06121966 le 07 novembre 2013 à 08:42
J'admire votre patience !  :ange: :coffeetime:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 07 novembre 2013 à 09:16
Pas besoin de patience ;) Après tout, Boinc est censé tourner en arrière-plan sur nos ordis. Il n'a pas vocation à être babysitté en permanence comme j'ai parfois l'impression que certain(e)s le font :D :siflotte:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Philippe06121966 le 07 novembre 2013 à 11:39
 :45896_45: :poingordi:

Je crois que je me suis fait griller ;)
Chez moi, les pc's tournent sur BOINC en priorité ... :coffeetime:
Mais ça me passera, dès que je rebosserai  :siflotte:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 07 novembre 2013 à 12:00
Mais ça me passera, dès que je rebosserai  :siflotte:

... ou pas ;) (j'en sais qqch)
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 07 novembre 2013 à 13:32
Pas besoin de patience ;) Après tout, Boinc est censé tourner en arrière-plan sur nos ordis. Il n'a pas vocation à être babysitté en permanence comme j'ai parfois l'impression que certain(e)s le font :D :siflotte:
Genre t'as pas lu ce qu'on a dit plus... pareil pour Yoyo avec une ecm partie hier à la poubelle après 90h de calcul (cf topic yoyo)...

Si, de la patience il faut.
Titre: Re : Re : RNA World (béta)
Posté par: [AF>Libristes] cottesloe le 13 novembre 2013 à 10:24
@ cottesloe: Si ça peut te rassurer, j'en ai une actuellement qui a redémarré à presque zéro le WE dernier après plus de 3 jours de calculs: il y a eu de l'orage et le différentiel a sauté pendant que je n'étais pas chez moi, les onduleurs n'ont pas tenu, forcément. D'un autre côté, l'UT est donnée pour une durée de 10 semaines sur leur système de référence et le seul qui a réussi à la mener à terme actuellement a mis 1460h. Donc que représentent ~70-80h? :D

Par contre, j'ai déjà demandé une prolongation pour mon poulet (http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=6284331) :D Parce que c'est sûr qu'il ne sera pas cuit d'ici le 29 novembre :D

Comment on s'y prend pour demander une prolongation?
Non, parce que je me demande comment rendre en un mois une UT qui en nécessite trois...  :siflotte:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: chev6791 le 13 novembre 2013 à 11:55
ici : http://www.rechenkraft.net/phpBB/viewtopic.php?f=75&t=12075 (http://www.rechenkraft.net/phpBB/viewtopic.php?f=75&t=12075)
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 13 novembre 2013 à 14:02
Si tu lis ce topic ça parle d'un système d’extension automatique, mais il y a peut-être les UT "d'avant" et celles "d'après"... ?
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Xe120 le 22 novembre 2013 à 20:55
Hier les UTs en erreur ont été crédités!  :miam:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: fzs600 le 01 décembre 2013 à 12:27
2 ut en erreurs de calcul et des crédits quand même.   :??:
Citer
30 Nov 2013, 13:07:52 UTC    30 Nov 2013, 13:26:02 UTC    Erreur en cours de calculs    320.29    0.29    0.96    cmsearch VM (VirtualBox) 1.0.2 v1.06 (vbox64)
30 Nov 2013, 13:26:02 UTC    30 Nov 2013, 13:33:47 UTC    Erreur en cours de calculs    320.70    0.29    0.96    cmsearch VM (VirtualBox) 1.0.2 v1.06 (vbox64)
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Norman_RKN le 01 décembre 2013 à 13:45
hi  :hello:
we have a few more testworkunits for cmsvm2.
now only 1 core with 1 vm will be used, because the trouble in the past. now you can use any version of VM.
we hope the mosts user a agree with that solution - so you have free cores for other things like the cmsearch small :D
the VM was designed for the big XXL ( Intron_gpI).
atm there is a discussion what is small and what is long.
for the small Workunits we plan NOT to use the VM because the efficience is not good for short running tasks.
only for the very long running tasks we use the VM checkpointing system. we will see maybe the middle is a good point ;)

pioneering work will be granted for sure.
if you have errors and not granted credits please contact ChristianB ( http://www.rechenkraft.net/forum/memberlist.php?mode=viewprofile&u=3256 )
or post in the project forum ( http://www.rechenkraft.net/forum/viewforum.php?f=74 ) and you get your credits for sure ;)

a lot of bugfixes are done with your help and big thanks for reporting and testing.  :smak:
now it should run much more stable.

Norman


Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Norman_RKN le 02 décembre 2013 à 03:23
hi,
with the new cmsearch (VM) the deadline will be extended automatic on serverside.
sadly the boinmanager (client) does not show it but if you login into your account you will see the extentions.
the VM sends all 4 hours trickles to the server and so you dont need to ask for a extension with version 1.06 ;)

Norman
Titre: Re : Re : RNA World (béta)
Posté par: Philippe06121966 le 02 décembre 2013 à 06:44
hi,
with the new cmsearch (VM) the deadline will be extended automatic on serverside.
sadly the boinmanager (client) does not show it but if you login into your account you will see the extentions.
the VM sends all 4 hours trickles to the server and so you dont need to ask for a extension with version 1.06 ;)

Norman

Dear Norman,

Thank you for your messages.

Kind Regards,

Philippe
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: kasur le 02 décembre 2013 à 06:54
Good news and very good trick for boinc world, thanks!
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 02 décembre 2013 à 11:36
C'est bien les news mais en Français ce serait encore mieux pour tout le monde  :desole:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Xe120 le 02 décembre 2013 à 13:03
Alors de ce que j'ai compris, maintenant on ne peut plus faire qu'une UT donc 1 core avec VM, un peu comme Test for theory!
L'application avec VM ne sera utilisé que pour les UTs XXL (Intron_gpI) et pas les petites parce que l'efficacité est moindre avec la VM.
Les UTs avec erreur seront crédités. Si ce n'est pas fait il faut envoyer un message à ChristianB ou laisser un message sur le forum, les liens sont plus haut.
La date limite de retour (deadline) est automatiquement repoussé, plus besoin de faire de demande sur le forum.
La VM envoie des "tricckles" tous les 4 heures et l'extension se fait si besoin par contre la date ne bouge dans le BM, il faut vérifier sur son compte sur le site web.

 :hello:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 02 décembre 2013 à 13:30
J'en ai eu une (http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=6330891) de nouveau, faites attention car on voit "1.0.2 v1.06" dans le nom de l'app et ça veut bien dire v1.06 et pas 1.02. Malheureusement le délai estimé n'est valide que sur le détail sur la WU sur le site et pas dans le boinc manager, donc il ne faut pas se laisser impressionner :)

Thanks Norman for keeping us informed here, don't worry with the translation we take care of this :jap:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 03 décembre 2013 à 00:00
Amusez-vous bien avec vos VM :D
Mon XXL sans VM a atteint le point de non-retour aujourd'hui : le poulet est à moitié cuit :lol:
Me reste plus que 35-36 jours à patienter :gno: :hyperbon: :gno: :hyperbon: :gno:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 03 décembre 2013 à 00:06
Pour le moment ça avance, j'en suis à 46 heures. J'aime les VM :miam:

Sauf qu'il faut pas que j'oublie de PAS lancer de VM win depuis Parallels Desktop à cause d'une petite incompatibilité avec VirtualBox qui empêche de la lancer en même temps la VM RNA, sinon... ça plante le Mac sans autre forme de procès :electric: :desole:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Norman_RKN le 05 décembre 2013 à 15:27
Salut AF,  :kookoo:
We have found with the help of crunchers like you another bug only into the Windows app.
Now the vboxwrapper is fixed and your work should not abort with errors caused by the vboxwrapper anymore.
Also we grant access to the "remotedesktop" of the VM so you can show what happens atm and if you have installed the VM Extension Pack,
then you should get access directly over your Manager by push the Button. (note this make only sense for advanced users).
Forecast now more exactly.
All in Version 1.08.
If you want the new version for Windows then feel free to abort your workunit or crunch at your own risk. (no risk no fun  :D ).

Merci pour le travaux et votre soutien.


Norman

Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Xe120 le 05 décembre 2013 à 16:22
Phil, regarde plus haut les dates de retour sont augmentées au fur et à mesure si tu crunches l'UT et ça se fait tout seul.  :hello:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Philippe06121966 le 05 décembre 2013 à 16:25
Phil, regarde plus haut les dates de retour sont augmentées au fur et à mesure si tu crunches l'UT et ça se fait tout seul.  :hello:

Merci Beaucoup, je n'avais pas vu .... du coup j'ai viré mon post ;)
Merci et Bon Crunch  :jap:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 06 décembre 2013 à 00:01
Hi Norman I have the VB extensions but the button "show graphics" is greyed out. I use this with T4T, I have "Show Graphics" (that opens a web page connected to the T4T VM) and "Show console" that opens a console access on the VM log (but the log is better with the web page).

How is your "button" working ?

(I have Mac OS X with boinc 7.2.33 and VB 4.2.16, not upgraded because of T4T asking not to upgrade)
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: chev6791 le 13 décembre 2013 à 10:15
Arghhhhhhhhhhhh

Malgré ma demande de prolongation, ca n'a pas été fait, ma WU est expired  :rhaa:
1000 heures de calcul (42%), je fais quoi je continue ou je jette (j'ai bien envie de continuer juste pour le fun  :pt1cable:)
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 13 décembre 2013 à 10:37
Continue !!!
La deadline n'est pas mise à jour dans le BM mais sur le site de RNA
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: chev6791 le 13 décembre 2013 à 11:11
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=6098560

 :cry: l'avant dernière c'est la mienne, pas mise à jour sur le site......
Titre: Re : Re : RNA World (béta)
Posté par: Philippe06121966 le 13 décembre 2013 à 11:14
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=6098560

 :cry: l'avant dernière c'est la mienne, pas mise à jour sur le site......

Dingue ces UT's .... celle-ci attend d'être validée depuis ... le 13 mais 2013 !  :priz2tet:

Y'a pas à dire, faut vraiment de la patience ...  :coffeetime:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 13 décembre 2013 à 11:39
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=6098560

 :cry: l'avant dernière c'est la mienne, pas mise à jour sur le site......

T'avais eu une réponse à ta demande de prolongation? Si ça se trouve, ils ne l'ont pas vue :(
Mais je tenterais quand même de la finir. Et de remettre un message sur leur forum.

J'ai redemandé une prolongation pour mon poulet ce matin (mais dans la partie allemande). Il lui faut encore 26.5 jours...
En attendant, les màj Windaube s'accumulent :lol:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 13 décembre 2013 à 20:32
Oui normalement ils sont plutôt réactifs.

Moi je continue mon test de la béta VM (VirtualBox), depuis que j'en ai une qui marche (enfin, mais bon c'est du béta...), ben elle marche (300 heures au compteur), avec checkpoint intégré (= la VM, c'est entre autres pour ça qu'ils l'ont fait) ET prolongation automatique de deadline. So far so good.
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: chev6791 le 14 décembre 2013 à 08:31
Oui m'enfin le système de deadline est un peu foireux quand tu recois une unité avec près de 3000 heures de calcul estimé et qu'on te donne 45 jours pour la renvoyer, c'est d'office ouvrir la porte à des problènes. C'est pas non plus comme ci je  :hyperbon: avec un un rasperry.

Mais bon elle a été prolongée (pas assez), donc les mises à jour windows attendront  :siflotte:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 14 décembre 2013 à 11:29
Ils ne prolongent toujours que de 30 jours. La mienne est passée au 28 janvier en deadline, elle devrait être finie le 7 *croise-les-doigts*
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 14 décembre 2013 à 12:03
Oui tu peux demander un autre prolongement. Mais bon ça reste quand même bien galère, être obligé de monitorer des UT super longues sous peine de perte, on est loin de l'esprit de boinc ! (F&F (http://fr.wikipedia.org/wiki/Tire_et_oublie))

D'où le grand intérêt de leur version béta en machine virtuelle, qui résout tous ces problèmes (risque de perte complète car pas de points de sauvegarde, deadline), avec les inconvénients des VM, pour ceux qui les aiment pas :)

--> pour le moment grosse conso de RAM, mais c'est censé baisser quand ils auront optimisé leur appli VM, et heu... devoir installer VirtualBox ? c'est grave ? et heu... ben je vois pas ;)

Vous l'aurez compris, moi je suis pour.
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Philippe06121966 le 14 décembre 2013 à 12:15
Petite question : Appli VM = environ une trentaine d'heures ?
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 14 décembre 2013 à 12:49
Pour moi pour le moment c'est plutôt plusieurs centaines d'heures ! Ils ont fait la VM pour faire tourner les XXL... Ici (http://wuprop.boinc-af.org/results/projet.py?projet=RNA+World&application=cmsearch+VM+%28VirtualBox%29+1.0.2) tu vois un max à 700 heures, comme la mienne n'est pas encore finie y'a toujours pas de stat sur OS X (je suis le seul ??)

Je constate que la RAM est très mal reportée, pour Windows ça dit 36 Mo mais ça ne doit pas mesurer la bonne mémoire applicative... pour OS X c'est bien 1,5 Go :) Vu que ça fait un bon moment que je suis passé à 16 Go sur mon i7, ça va (là j'ai la VM T4T et la VM RNA qui tourne + une VM Win7 sous VB pour essayer de récupérer des UTs CPDN pour le win du bureau, plus diverses babioles, et je survis).

Après c'est vrai que les VM consomment pas mal d'espace disque (et de bande passante, forcément) mais chez moi le grand gagnant est de loin CPDN (4,4 Go), après viennent T4T (3 Go) et RNA (2 Go). Mais bon, avec un ADSL "normal" et un DD "récent", même pas mal.
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Philippe06121966 le 14 décembre 2013 à 13:11
OK Merci pour les infos.
Je verrai bien ce que ça donne ...
Ai chargé 1 "cmsearch VM (VirtualBox) 1.0.2 v1.10 (vbox64)"
Et après 54 minutes BM indique 2,415 %
Il resterait 28h45
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 15 décembre 2013 à 15:11
Je pense que le % n'est significatif de rien de vrai, pour le moment. Et je crois que la date limite ne prend pas en compte la prolongation automatique, il faut regarder sur son compte sur le site pour une info plus réaliste (de mémoire : dans le détail de la tâche).
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Philippe06121966 le 15 décembre 2013 à 15:24
Dans les détails de mon compte, rien d'indiqué, si ce n'est :
estimated runtime on reference system   1d 5h 34m 27s (106467.99007819 s)
Référence à une UT calculée en Mai 2010 ...  :pt1cable:

+ sur BM, j'en suis à 73,986 % et 25h18 de calcul ...

Je verrai bien ce soir ou demain ;)

Merci  :jap:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 15 décembre 2013 à 15:55
Ah ben t'as de la "chance" moi c'est "10w 5d 18h 42m 13s (6547333.8843498 s)" et j'en suis à 346h / 7,34%...

Mais bon maintenant j'ai plus peur de rebooter ni rien, donc ça me va.
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Philippe06121966 le 15 décembre 2013 à 16:00
je n'ai pas ta patience  :coffeetime: + trop de risques de plantages  :pt1cable:  .....

 :siflotte:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: chev6791 le 15 décembre 2013 à 18:27
Non c'est justement ca le challenge, je trouve que ca met un peut de piquant au crunch.

Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Philippe06121966 le 15 décembre 2013 à 18:30
Et voilà : http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=6330910

Plus qu'à attendre  :coffeetime: la validation ...  :pt1cable:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 15 décembre 2013 à 19:01
Infos récupérées sur le topic allemand (https://www.rechenkraft.net/phpBB/viewtopic.php?f=76&t=12102&sid=d7262e856e25a081464f5606c469d2c9&p=145073#p145084) de demande de prolongation:

Les UT dans les VM envoient des messages d'état au serveur. Si un message d'état arrive dans les 14 jours avant la deadline [je suppose un message indiquant que la deadline ne suffira pas], l'UT est automatiquement prolongée de 14 jours. Actuellement, cela n'est indiqué que sur votre compte et pas dans le BM. Les admins de RNA sont en négociation avec Berkeley pour que ça puisse aussi être pris en compte dans le BoincManager.

Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 15 décembre 2013 à 21:14
:jap:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 16 décembre 2013 à 20:16
16-Dec-2013 19:11:43 [RNA World] Sending scheduler request: To send trickle-up message.

Ça c'est la VM qui envoie ses tricklets pour dire au serveur qu'elle est en cours et son état d'avancement, comme pour CPDN.

Ça me plait bien :)
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Norman_RKN le 21 décembre 2013 à 05:01
salut,
as you may noticed we have a new version (1.10) with some new little bugfixes and a few new test-workunits. thx for your help and reports.

for all that no want this big xxl-units and have trouble with the VM-version, we have generated brand new and fresh SMALL workunits.
we plan to release this workunits not before 01.01.2014 and that are over 2 millions  :sun:
you will be informed on the rnaworld webpage about the exact date.

i hope the power of AF is on board.
i wish you all a merry christmas and a happy new year in 2014.
merci beaucoup AF.

Norman  :kookoo:



Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 21 décembre 2013 à 10:22
Citer
THX est là pour vous aider.
La bonne traduction serait plutôt: Merci pour votre aide et vos retours ;)
thx = thanks
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Xe120 le 21 décembre 2013 à 11:10
Moi j'en ai une qui tourne depuis 700 heures et qui est à 98,765% depuis une bonne centaine d'heure, j'espère que je l'aurais fini avant Noël, même si elle ne sera pas validé parce que personne ne l'a fini pour l'instant.  :coffeetime:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 21 décembre 2013 à 18:46
Courage, Xe120 !
Mais effectivement si personne n'a encore réussi à la finir, tu risques d'attendre un moment pour la validation.
Un peu comme mon wingman qui attend depuis le 4 juin... et qui devra encore patienter jusqu'à début janvier.
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=6284331

Progression actuelle: 1312h56 / 74.521%
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 22 décembre 2013 à 19:50
la version 1.10 c'est juste pour la VM ?
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 23 décembre 2013 à 23:58
Oui (http://www.rnaworld.de/rnaworld/apps.php).
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 09 janvier 2014 à 20:05
C'est pour cette nuit.....
Titre: Re : Re : RNA World (béta)
Posté par: Philippe06121966 le 09 janvier 2014 à 20:22
C'est pour cette nuit.....

C'est ce qui s'appelle avoir de la patience  :coffeetime:
Chapeau !  :jap:

 :oki:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Xe120 le 09 janvier 2014 à 20:36
Un événement qui mérite le champagne à lui seul!  :05_16:


Au passage la mienne :
14921812   6330777   21136   9 Nov 2013, 18:47:05 UTC   29 Dec 2013, 9:20:01 UTC   Erreur en cours de calculs   2,607,392.94   3,026,362.00   7,822.18   cmsearch VM (VirtualBox) 1.0.2 v1.05 (vbox64)
 :/
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: RLDF le 11 janvier 2014 à 13:08
ne vous réjouissez pas trop vite, il arrive que les XXL finissent bien après les 100%  :priz2tet:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 11 janvier 2014 à 15:12
Eh oui, la mienne est à 100% depuis la nuit où elle devait se terminer... ça fait 1 jour 1/2 maintenant... et pourtant j'ai déjà nettement plus de secondes au compteur que le seul wingman qui a réussi à la mener à terme.
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 12 janvier 2014 à 22:03
J't'avais dit : t'aurais du faire wingman :D
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 24 janvier 2014 à 14:24
Oh surprise, quand je suis revenue sur l'ordi tout à l'heure mon UT RNA avait disparue :bounce:
Mais quelle ne fut pas ma déception de la retrouver dans cet état (http://www.rnaworld.de/rnaworld/results.php?hostid=14498) :cry:
Alors qu'on voit bien encore dans WUprop mon pending:
RNA World    cmsearch XXL (long) 1.0.2   1,115.82   2,186.87

La seule chose qui me reste, ce sont les captures d'écran que j'ai faites :cry:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: ousermaatre le 24 janvier 2014 à 14:35
 :smak:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 24 janvier 2014 à 23:20
Ben vas gueuler sur leur forum !! :)

En plus tu cause le germain, ça t'ouvre les portes à bien plus de parties du forum que le petit bout en anglais qu'ils maintiennent...
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 24 janvier 2014 à 23:55
Merci du conseil Jéjé ;) Comme j'avais fait une autre demande de prolongation pas plus tard qu'hier, je l'ai éditée aujourd'hui pour dire que je n'avais plus besoin de prolongation mais que j'avais les boules. Je verrai bien s'ils répondent
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: chev6791 le 03 février 2014 à 19:12
Le bébé est bientôt arrivé à bon port, 2194h de calcul et 99,49%, arrivée à 100 prévue cette nuit  :hyperbon:

une bonne surprise demain au réveil?  :pt1cable:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 03 février 2014 à 19:19
Ou pas :D La mienne a tourné pendant une dizaine de jours à 100% :siflotte:

Et plus j'y réfléchis, plus je me dis qu'elle est partie en sucette à cause de moi :cry: J'avais suspendu Boinc un moment parce que le net était devenu trop lent, et c'est ce qui a dû causer sa mort :cry:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: chev6791 le 03 février 2014 à 20:16
je suis plus à quelques jours prêt  :lol: :lol:

 :smak:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 03 février 2014 à 21:38
Ben normalement la VM gère bien les arrêts/relances mais ça reste de la bêta... Moi j'en ai une grosse sur le feu, j'espère qu'elle tiendra...
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: chev6791 le 03 février 2014 à 21:40
la VM c'est pour les petits   :siflotte:, là c'est une XXL sans VM  :o
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 03 février 2014 à 23:42
Wé quand t'en as plusieurs qui se sont évaporés après quelques 100aines d'heures de calcul ça finit par calmer...
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: chev6791 le 04 février 2014 à 14:11
Ah la saleté, elle a encore besoin de temps pour murir  :cry:



 :gniak: suis pas pressé, elle finira par tomber  :gniak:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 04 février 2014 à 14:34
(http://tazdanslalune.t.a.pic.centerblog.net/ymf8c6fk.gif) (http://"http://tazdanslalune.centerblog.net")
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: mamouth le 12 mars 2014 à 10:35
 :hello:
Je ne trouve pas l'info sur leur forum en anglais,
est ce que qqun sait +- quand ils vont générer de nouvelles UT ?
Je me souviens qu'un moment on parlais d'UT moins longues sans checkpoint et toujours des XXL avec VM
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: chev6791 le 29 mars 2014 à 19:51
grosse frayeur ce soir en regardant mes unité POEM, plus d'unité RNA en cours  :eek: :cry:  :cavachier:  :rhaa:

petit check sur le site  :D

et bonne surprise elle est finie  :gniak: après près de 3400 heures, presque 3 mois après  avoir atteint les 100%.

Résultats : 246000 pts   :love: :love: :love: :love:

Titre: Re : Re : RNA World (béta)
Posté par: fzs600 le 29 mars 2014 à 19:59
grosse frayeur ce soir en regardant mes unité POEM, plus d'unité RNA en cours  :eek: :cry:  :cavachier:  :rhaa:

petit check sur le site  :D

et bonne surprise elle est finie  :gniak: après près de 3400 heures, presque 3 mois après  avoir atteint les 100%.

Résultats : 246000 pts   :love: :love: :love: :love:
:oki: :oki:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 29 mars 2014 à 22:42
Bravo chev pour ta persévérance ! :oki:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: kasur le 30 mars 2014 à 09:47
 :jap: :jap: presque 3 mois  :bouh:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Philippe06121966 le 30 mars 2014 à 10:09
J'admire ta patience, et la patience de celles et ceux qui font tourner ce projet.
D'ailleurs, tu as validé une UT calculée entre décembre 2012 et mai 2013 !  :coffeetime:

Au fait, pourquoi ne développent-ils pas une appli GPU ? (c'est une vraie question  :jap:)

Ils disent eux-mêmes que la parallélisation sur CPU (MT) permet d'augmenter la vitesse de calcul.
Ils ont fait des tests et une UT tournant sur 4 coeurs met moins de 25 % du temps mis par un seul coeur ... ?

Encore Félicitations ! En plus tu es classé n° 2 dans les stats du projet ;)  :pakitooo:

Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: chev6791 le 30 mars 2014 à 13:16
yes, c'est mon co-cruncher qui est numéro un avec la même Wu, pour me déloger de ce classement là va falloir se lever tôt.

Bon ben maintenant je vais tranquilou pouvoir installer les patch windows et antivirus.

Et ca me libère un core pour le raid  :hyperbon:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: nabz le 26 avril 2014 à 21:17
En ce moment, j'ai une unité : 359 h écoulées, avancement 6,5%, 2.984 h restantes, date limite 25/04.

Ca va être chaud. :siflotte:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 28 avril 2014 à 11:53
Faut que tu demandes la prolongation sur leur fofo, non ?
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: mamouth le 28 avril 2014 à 13:27
Si c'est une UT qui tourne dans une VM la prolongation se fait automatiquement.
La modification de la deadline n'est visible que sur le site pas dans le boinc manager ...


Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 28 avril 2014 à 17:06
Ah oui j'oubliais ce petit détail (bien chiant).
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: nabz le 28 avril 2014 à 22:21
En effet, la DL est passée au 25 mai. :)

Merci pour l'info.
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Xe120 le 17 juin 2014 à 13:18
J'ai ferré une belle bête ce matin, 0,055% en 3h, temps estimé 4185h.  :lol:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Philippe06121966 le 17 juin 2014 à 14:09
Ont-ils déjà évoqué la possibilité ou l'impossibilité de développer une appli GPU ?  :coffeetime:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 17 juin 2014 à 14:26
Les admins de RNA étant les mêmes que ceux de Yoyo, je pense que les réponses de yoyo (l'admin) peuvent aussi s'appliquer à RNA.
Voir ici: http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,5450.0.html ;)
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 17 juin 2014 à 14:27
J'ai ferré une belle bête ce matin, 0,055% en 3h, temps estimé 4185h.  :lol:

C'est une UT dans VM ou une "normale"?
Titre: Re : Re : RNA World (béta)
Posté par: Philippe06121966 le 17 juin 2014 à 14:32
Les admins de RNA étant les mêmes que ceux de Yoyo, je pense que les réponses de yoyo (l'admin) peuvent aussi s'appliquer à RNA.
Voir ici: http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,5450.0.html ;)

Merci  :jap:
Titre: Re : Re : RNA World (béta)
Posté par: Xe120 le 17 juin 2014 à 14:41
J'ai ferré une belle bête ce matin, 0,055% en 3h, temps estimé 4185h.  :lol:

C'est une UT dans VM ou une "normale"?

Heureusement dans une VM sinon j'aurais été plus réticent à la conserver.
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 17 juin 2014 à 14:45
Dommage, j'en aurais bien pris une autre pour aller jusqu'aux 5000h chez Seb :siflotte:

RNA World    cmsearch XXL (long) 1.0.2   3,304.95   0.00
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 18 juin 2014 à 12:00
--> https://www.rechenkraft.net/forum/viewtopic.php?f=75&t=10717&p=149528#p149528

Estimation : plus de 80 jours de calcul. Je m'inquiétais pour la deadline à 10 jours mais en fait "ça le gère". Espérons.
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Xe120 le 18 juin 2014 à 13:20
Avec une VM, ça envoie des trickles et si besoin ça étend la deadline tout seul, par contre il faut vérifier sur le site, celle dans le manager de deadline ne bouge pas.
De plus les UTs qui partent en erreur sont quand même créditées.
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 18 juin 2014 à 14:43
Sauf qu'il y a eu des versions où ça buggait et elles arrivaient quand à expiration. Mais en effet il semblerait que maintenant c'est ok.

C'est quand même bien chiant que boinc ne puisse par récupérer sur le serveur la deadline actualisée...
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: mamouth le 23 juillet 2014 à 08:44
Alerte  :hyperbon:

Des UT de type short sans checkpoint et sans VM sont disponibles.
Durée variable, la majorité moins d' 1heure, j'en ai 2 en cours à + de 3h

+ infos
http://www.rnaworld.de/rnaworld/forum_thread.php?id=114&postid=349#349
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Lic le 23 juillet 2014 à 12:48
C'est une bonne nouvelle. Hâte pour la suite avec un volume plus important de WU :)
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 24 juillet 2014 à 08:01
Yen a déjà plus :cry:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Lic le 24 juillet 2014 à 13:37
RLDF a utilisé son aspirateur à WU lol
J'en ai eu presque une trentaine depuis hier :)
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 24 juillet 2014 à 14:08
21 pour moi ;)
Titre: Re : Re : RNA World (béta)
Posté par: RLDF le 24 juillet 2014 à 14:34
RLDF a utilisé son aspirateur à WU lol
J'en ai eu presque une trentaine depuis hier :)

je suis dégouté, il me manque 355h sur ce sous-projet pour obtenir la 4ième étoile bleue sur le badge WUProp
je suis quand même passé de 2000h à 4645h
il faut que je trouve un autre projet pour passer a 5000h et passer du (http://wuprop.boinc-af.org/img/badge/50000_25000_10000_2500_0.png) au (http://wuprop.boinc-af.org/img/badge/50000_25000_10000_5000_0.png)
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 26 juillet 2014 à 20:31
Quand on en a beaucoup on en a jamais assez :)
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: fzs600 le 11 mars 2015 à 18:48
 :hello:

Power outage simulation on 25th of March 2015 → http://www.rnaworld.de/rnaworld/forum_thread.php?id=117&postid=357#357 (http://www.rnaworld.de/rnaworld/forum_thread.php?id=117&postid=357#357)
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 11 mars 2015 à 19:22
Ça fait juste une éternité que j'ai rien eu sur RNA, mais vu que je pouvais jamais les finir non plus c'est pas trop grave :D
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: mamouth le 26 octobre 2015 à 11:34
Bon accroché à ce projet depuis des lustres
quelle fut ma surprise ce matin en voyant une UT  :love:

RNA World   1.15 cmsearch VM (VirtualBox) 1.0.2 (vbox64)   cmsvm2_GA-p[e30-50MB_Lin64f]_1_Ornithorhynchus-anatinus-(platypus)_CM000409.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1330438623_60396_36   02:38:24 (00:00:10)   

mais après 2:38 de calcul le temps CPU n'est qu'a 10 secondes et je ne vois que 3 cores utilisés dans le gestionnaire de tâches

en pièce jointe une capture qui montre que j'ai une autre UT vLHC avec VM qui fonctionne

Je suis sous seven 64 bit installation récente de boinc 7.6.9 avec virtualbox intégré

alors je la garde ou je la vire ?   :priz2tet:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: fzs600 le 26 octobre 2015 à 12:02
Garde la.

Meme si elle part en erreur tu aura quand meme des crédits.  :kookoo:
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=6330815 (http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=6330815)
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Maurice Goulois le 19 décembre 2015 à 16:55
Reçu une ut à 120j estimés :) et paf une autre à 85j :) c'est la première saison de crunch où j'accepte les ut avec vm pour rna (je savais même pas qu'ils avaient implémenté des trickles dans le schmilblick  :desole:)
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 20 décembre 2015 à 21:59
Une des raisons du passage en VM de RNA a été l’implémentation des points de reprises qui après explications du gars n'étaient pas possibles dans l'appli historique et n'était possible que via une VM - c'est à dire si j'ai bien compris qu'il fait des snapshots de la VM elle même, qui constituent donc des points de reprise "externes" de cette même appli qui n'est toujours pas capable de faire des checkpoints, et ne le sera jamais (je me souviens l'explication technique, il faudrait relire son forum).

Et c'est bien parce que vu la durée des UT tout le monde se plaignait de l'absence de points de reprise qu'il a fait ça.
Titre: Re : Re : RNA World (béta)
Posté par: Maurice Goulois le 21 décembre 2015 à 02:35
Oui, c'est un des plus que ça permet.

Marius (C@H) en parle dans sa conf, et visiblement docker ajoute un plus pour la gestion de containers et des fichiers résultats (faudrait que je voie docker de plus près).
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: fzs600 le 29 décembre 2015 à 18:52
 :hello:

Play EteRNA - An RNA game.
http://www.rnaworld.de/rnaworld/forum_thread.php?id=125&postid=369#369 (http://www.rnaworld.de/rnaworld/forum_thread.php?id=125&postid=369#369)
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 30 décembre 2015 à 12:08
Voila le genre de "jeu" où je n'accroche pas plus de 10mn... ce qui est très dommage à mon avis, ça a l'air super intéressant...
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 15 octobre 2016 à 23:59
Après des eons sans UT de ce projet, j'en avais chopé une fin août... après des échanges angoissés (https://www.rechenkraft.net/forum/viewtopic.php?f=75&t=16374&start=0) sur leur forum, ils m'avaient convaincu de continuer l'expérience... elle était prévu en 70 jours ("monster WU" qu'ils disaient), elle en a tenu 40 et elle a planté.

:hooga:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: fzs600 le 26 décembre 2016 à 15:27
Donc voila j'ai réussi a en toucher une.  :D
Citer
25 Dec 2016, 18:58:45 UTC    14 Jan 2017, 18:58:45 UTC    In progress    ---    ---    ---    cmsearch VM (VirtualBox) 1.0.2 v1.18 (vbox64)
0,863% après 19H de calcul.

(https://t4.ftcdn.net/jpg/00/80/58/33/500_F_80583347_fkpcHvEoKfSuCCQrE8yYp4A9ZA9xJznp.jpg) Merci.  :coffeetime:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Maurice Goulois le 26 décembre 2016 à 18:18
Pour l'instant j'ai laissé tomber :)

A chaque fois que je chope une ut, la bécane, où elle tourne,  explose avant qu'elle termine.

Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 28 décembre 2016 à 23:54
Sans aucune traduction ni adaptation je vous livre brut de fonderie des échanges que j'avais eu en novembre quand j'avais eu cette UT (pas eu d'autres depuis) en PM avec un fort sympathique teuton qui m'avait expliqué sa technique de backup / contrôle / restore d'une UT RNA.

Je n'ai pas eu l'occasion d'expérimenter tout ça et je ne sais pas si j'aurai le courage de le faire le jour où j'en aurai une...

------------------------------------------

I am hardcore. So ... the following steps, are going to be hardcore. Totally not recommended, unless you are an advanced user that knows exactly what you're doing, and am familiar with every instructions. It's also a fun way to get yourself more familiar with what's going on, behind the scenes with how BOINC manages the VMs, and also inside the VMs.

What I typically do is the following --- it's a bit dangerous, but if you follow the steps exactly, it shouldn't make your task fail. It is risky, though. Use lots of caution, if you decide to attempt!

----- Gracefully suspend and exit BOINC
- Suspend BOINC
- Monitor Task Manager, for all CPU activity to stop
- Exit BOINC
- Monitor Task Manager, for all VBoxHeadless* and VBoxWrapper* processes to gracefully exit
- Monitor Task Manager, for boinc.exe to gracefully exit
- In Task Manager, find VBoxSVC.exe, and use "End Task" on it

----- Optionally backup your Data folder
- Find your BOINC data folder
- Save a copy of it somewhere else, just in case. I do this every time I'm testing an OS upgrade or a VirtualBox upgrade.

----- Clone the VM
- Launch "Oracle VM VirtualBox". Note: I NEVER manually launch this, while BOINC is running. I make sure BOINC is all closed, before manually running this.
- If BOINC is NOT installed as a service, you should already see the machine in the list
- If BOINC is installed as service, use "Machine -> Add" to add the machine using the slot's .vbox file.
- Right-click the machine, and use Clone. Make sure to use "Full Clone" and "Current machine state".
- I typically have 3-4 weekly backups, so I append a number. My clones usually end with a name like "Clone 52".
- If BOINC is installed as a service, right-click the machine you added, and choose "Remove", and then "Remove Only". It's VERY important that you DO NOT choose "Delete all files"!

----- Inspect the clone
- Select the clone
- On the clone's snapshots tab, Right-click the top node, and choose "Restore snapshot", making sure to uncheck "Create a snapshot of the current state" before clicking Restore.
- Now right-click the clone, and choose Start. If you get a submenu next to Start, choose "Normal Start".
- In the new VM window, if it's all black, hit CTRL to "wake" the VM's display.
- Inspect the display for correctness. Nothing should look abnormal or look like an error.
- Hit CTRL+C, which will leave the cmsearch task running, but give you a command prompt.
- Type "top" in all lower-case, and hit enter. This launches the linux task manager.
- "cmsearch" should be near the top of the list. Make a note of it's "TIME+" column. This is the number of hours it has logged.
- Close the clone's window, and choose "Power off the machine", making sure to uncheck "Restore current snapshot".
- Close "Oracle VM VirtualBox", and monitor Task Manager, for VBoxSVC.exe to gracefully exit.

----- Determine if the VM is making progress
- Usually you can look at the progress.txt file in the slot folder, but if it's already 98.765%, then you can't rely on that.
- If you're worried that you may have screwed something up, make sure to go OFFLINE (by disabling all network adapters), before launching BOINC. This is so that the projects can't be notified of any task failures!
- Launch BOINC
- Resume BOINC, and let the tasks run for a couple hours.
- Repeat all of these steps, from the beginning (starting with Suspend BOINC), in order to get a 2nd clone to compare against.
- If all goes well, your second clone should show, in "top", that it has logged more time, than the first clone.

----- BOINC Data Recovery (if needed)
- If you had a problem while you were offline, and have a backup data folder, you can use it to recover.
- While BOINC is closed, move your current data folder to somewhere else
- Copy your backup data folder, to be the same folder location that you usually use for your data folder
- Test BOINC again, while offline.
- Keep testing until things look great.
- Then, while BOINC is closed, you can re-enable all your network adapters, then restart BOINC.


-----------------

Citer
JeromeC wrote:
- cloning the VM : excellent, I didn't know this could be done that way

Yes. Again, just be absolutely sure that BOINC is closed, the BOINC processes gracefully exit, then you kill VBoxSvc.exe, before you launch VirtualBox VM Manager to manually play with or clone VMs.

Citer
JeromeC wrote:
- looking at the console status and the slot text file : interesting, but this can be done on the actual running task, you are not obliged to see this in the clone, right ?

In BOINC, I only use "Show Console" to get the VM's forecast estimate or to see that it still looks okay without errors. I only ever hit "Ctrl" to wake the VM, and I never type anything else. And that's what I recommend - Never typing anything into that "Show Console" window!

To monitor status, you can look at the BOINC Progress %, which in most cases matches the progress.txt file, but... Christian coded things a bit poorly, such that, it can get to 100%, then fall back to 98.765%, and not get any new values into progress.txt. So, when that happens, usually the task is still healthy, and still updating the timestamp of progress.txt, but you have to "investigate using top within a clone" if you want to see if the VM is still logging useful time with the cmsearch application.

Citer
JeromeC wrote:
"- If you're worried that you may have screwed something up, make sure to go OFFLINE (by disabling all network adapters), before launching BOINC. This is so that the projects can't be notified of any task failures!"
What do you mean, if the task hasn't crashed yet but you suspect it could ? because there are some stuff looking like errors in the console ? anyway if the task has crashed you agree it's already too late ? (most probably already notified to the project)

I do some pretty crazy things while running RNA World tasks, like ... testing newer versions of Windows 10 Insider Preview builds (I'm on the "Fast Ring", but VirtualBox has problems quite often there), and testing newer versions of Oracle VirtualBox itself.

So ... For instance, if I get a new Windows 10 Build, it's standard practice for me to suspend BOINC, shutdown BOINC, install new Windows 10 build, BOINC will start up suspended, close BOINC, disconnect the network, make a backup copy of the BOINC folder, start BOINC, verify if tasks will run successfully .... and if tasks fail, I can close BOINC, restore my data folder, keep the RNA World tasks suspended, reconnect network, start BOINC.

In fact, when VirtualBox has problems with new Windows 10 Insider Builds (like 14971, released 2 days ago) ... I actually have a separate "Windows 10 Release" partition I can use, and the data folder is on a partition that they share. So, tonight for instance, I'll: uninstall BOINC from Insider partition, reboot into Release partition, install BOINC in Release partition, and start crunching RNA World tasks again from that partition.

Citer
JeromeC wrote:
- restore : your process would restore all projects backup in the data directory, since i run several projects all the time, so I couldn't do that... I'd need to be able to restore only RNA task... (meaning not only RNA data directory but being able to edit and modify various xms boinc status files... I did that in the past but it was very complicated and risky)

The backup process is applicable for the ENTIRE data folder. You are basically: going offline, then taking a snapshot of that entire folder, then manipulating it any way you think you need to, testing it, restoring if if you screw it up, retesting it, then if you're confident it's correct, going online.

I am a BOINC Alpha tester, and I too am connected to many projects -- in fact, I'm attached to ~60, and routinely do work for ~15. What you are not understanding is: When you go offline, then take a backup of the data folder, then ... anything you do to that folder (any work, any file modifications, any task failures, anything) is NOT communicated to the projects. So, if I had gone offline, and made a copy of my data folder, I could for instance, start BOINC, abort all the tasks for my ~15 projects. And then realize "oh that's not what I wanted", then close BOINC, restore the data folder, restart BOINC, verify the tasks are working again, close BOINC, enable the network adapters, then start BOINC. .... Basically, as soon as BOINC is running with the network enabled, you "invalidate" your offline backups, so you better be very sure things are exactly how you want them, before you allow BOINC to talk to the projects :)
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: jm91160 le 05 mars 2018 à 23:53
Je viens de choper une unité. Je suis à 2,6% après 48h de calcul... Aucune chance de finir avant le 21 mars....  :pt1cable:
Un conseil? je garde? je jette l'éponge?
Titre: Re : Re : RNA World (béta)
Posté par: fzs600 le 06 mars 2018 à 06:59
Je viens de choper une unité. Je suis à 2,6% après 48h de calcul... Aucune chance de finir avant le 21 mars....  :pt1cable:
Un conseil? je garde? je jette l'éponge?
Il faut ABSOLUMENT la garder jusqu'au bout, même si elle part en erreur de calcul tu aura des crédits.

La mienne est a 22% après 42 jours de calcul.  :kookoo:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 06 mars 2018 à 10:06
C'est étonnant que ta deadline soit aussi courte. J'en ai chopé une fin janvier avec une deadline fin juillet.
Avancement: 10% après 2j10h et qq (temps restant théorique 11j14h)
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: mamouth le 06 mars 2018 à 12:04
La deadline se met à jour automatiquement si j'ai bonne mémoire

à vérifier
Titre: Re : Re : RNA World (béta)
Posté par: fzs600 le 06 mars 2018 à 14:06
C'est étonnant que ta deadline soit aussi courte. J'en ai chopé une fin janvier avec une deadline fin juillet.
Avancement: 10% après 2j10h et qq (temps restant théorique 11j14h)
Une deadline courte c'est ce permet à UT d'être en priorité haute comme ça elle se calcule en permanence sans s'arrêter
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 06 mars 2018 à 14:38
La deadline se met à jour automatiquement si j'ai bonne mémoire

à vérifier
Il me semble aussi qu'elle est prolongée automatiquement mais uniquement sur le site du projet, pas dans le BM.
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 06 mars 2018 à 15:24
Oui c'est ça, il faut avoir la foi, ou aller voir sur le site du projet :D

Ca doit faire plusieurs éons que j'ai pas eu de RNA... et j'ai toujours eu des expériences compliquées avec RNA.
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: jm91160 le 06 mars 2018 à 20:37
Merci pour vos réponses et vos encouragements  :jap:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: fzs600 le 24 juin 2018 à 10:46
UT a 80 % après 152 jours de calcul.  :hyperbon: :hyperbon: je continue.  :D :hap:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: naz le 24 juin 2018 à 11:12
bravo! :jap:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 24 juin 2018 à 11:18
Les fois où j'ai réussi à tenir plusieurs dizaines de jours (c'est à dire quelques fois sur de nombreuses années) elles ont fini en erreur de calcul, ça fait tellement longtemps que j'ai plus eu de tâche... au début il distribuait des tâches "normales", j'avais quand même réussi à atteindre 160000 points... mais au début il avait pas de points de reprises, avant de passer à VB, si je me souviens bien.
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: fzs600 le 24 juin 2018 à 11:50
Ut que je calcul est partie de très très nombreuses fois en erreur et beaucoup d'abandon ( en tout 78 )

Quorum de 2 : le deuxième a calculer UT est  TBone un membre de SETI.Germany.
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 24 juin 2018 à 12:08
Félicitations fzs et :croisedoigts:

J'aimerais bien ne serait-ce que récupérer une nouvelle tâche...
Titre: Re : Re : RNA World (béta)
Posté par: fzs600 le 09 septembre 2018 à 21:48
UT a 80 % après 152 jours de calcul.  :hyperbon: :hyperbon: je continue.  :D :hap:

Voila ut est partie en erreur.
Citer
22 Jan 2018, 6:00:05 UTC    8 Sep 2018, 23:33:47 UTC    Error while computing    19,824,448.16    19,622,510.00    59,473.34    cmsearch VM (VirtualBox) 1.0.2 v1.19 (vbox64)

Mais ca crédite pas mal quand meme.  :sun:

J'attend la prochaine avec impatience.  :miam:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 10 septembre 2018 à 18:25
229 jours de calcul :eek:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 10 septembre 2018 à 18:31
j'en voudrais bien une comme ça... :love:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 10 septembre 2018 à 18:37
Oui enfin bon si c'est juste pour le plaisir d'avoir des crédits et que ça serve à 0 côté scientifique...
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 10 septembre 2018 à 18:54
Il me semble que l'admin avait dit que même si les tâches partent en sucette, il y a des bouts qui sont utilisables. C'est pour ça qu'il accorde des crédits.
Titre: Re : Re : RNA World (béta)
Posté par: fzs600 le 11 septembre 2018 à 10:16
Il me semble que l'admin avait dit que même si les tâches partent en sucette, il y a des bouts qui sont utilisables. C'est pour ça qu'il accorde des crédits.
Oui mème si UT part en erreur ça sert a quelque chose et ça crédite.  :jap:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 12 septembre 2018 à 11:10
Au fait, un grand MERCI à toi, fzs. :jap:

Grâce à tes points, l'AF est à nouveau rentrée dans les points au FB sur ce projet: http://statseb.boinc-af.org/top_FB.py?projet=110
Titre: Re : Re : RNA World (béta)
Posté par: fzs600 le 12 septembre 2018 à 17:06
Au fait, un grand MERCI à toi, fzs. :jap:

Grâce à tes points, l'AF est à nouveau rentrée dans les points au FB sur ce projet: http://statseb.boinc-af.org/top_FB.py?projet=110
:yaya:
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: JeromeC le 13 septembre 2018 à 00:13
Je dirais même plus, tu es le seul de toute l'AF avec un RAC positif sur ce projet :lol:

En revanche tu vas avoir du boulot pour rattraper Frederic Abussan ;)
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: Alan St-Pierre le 08 août 2019 à 03:02
Bon ce projet recommence à envoyer des tâches, mais normal que j'en ai une de 65 jours !? :eek: Taille estimée de la tâche: 19 323 267 GFLOPs
Titre: Re : RNA World (béta)
Posté par: modesti le 12 août 2019 à 09:08
Je confirme: elles sont très longues. Il ne faut d'ailleurs pas s'inquiéter de la deadline qui ne colle pas avec la durée estimée: elle est prolongée sur  le serveur du projet au fur et à mesure.

J'ai eu une tâche prévue de durer 51 jours et dont la deadline était fixée initialement au 17 août (toujours affiché dans le BM). Courant de la semaine dernière elle avait déjà été repoussée au 31 août sur le serveur. En allant dans l'historique de l'UT, j'ai vu qu'elle avait été envoyée la première fois en 2013!

L'avantage, c'est qu'on reçoit des crédits si la tâche plante.