Le Forum de l'Alliance Francophone

Boinc et les projets distribués => Biologie => Discussion démarrée par: arnaud25 le 17 septembre 2005 à 20:40

Titre: Rosetta@home
Posté par: arnaud25 le 17 septembre 2005 à 20:40
Salut. :hello:
Un nouveau projet: Rosetta@home (http://boinc.bakerlab.org/rosetta/)

EDIT rom_185 :
Projet du laboratoire Backer (http://www.bakerlab.org/), département de Biochimie de l'Université de Washington. (http://www.washington.edu/)
Modélisations de protéines pour à terme aider les chercheurs à développer des traitements pour lutter contre certaines maladies
(Malaria, Anthrax, VIH, Alzheimer, Cancer de la Prostate ,...)       
Le projet expliqué par l'AF (http://www.boinc-af.org/index.php?option=com_content&task=view&id=26&Itemid=219)
Etat des serveurs (http://boinc.bakerlab.org/rosetta/rah_status.php)
Joindre l'AF (http://boinc.bakerlab.org/rosetta/team_join_form.php?id=30)
Mémoire vive recquise : 512 Mo
Durée des unités de 6 heures par défaut quelque soit votre machine
Plateformes : Linux, Mac et Windows
Titre: Rosetta@home
Posté par: intello222222 le 17 septembre 2005 à 21:53
ça à l'air comme predictor non ??
Titre: Rosetta@home
Posté par: Douglas Riper le 18 septembre 2005 à 01:04
il y a déja une AF http://boinc.bakerlab.org/rosetta/team_display.php?teamid=30  :D

Je ne suis pas expert en bio je trouve que la description est proche de ProteinPredictor :o
Titre: Rosetta@home
Posté par: patouchon le 18 septembre 2005 à 08:47
ben vi c'est la reflexion que je me suis fait en moi même, personellement... :heink:
qqun peut nous zespliquer ? :D
Titre: Rosetta@home
Posté par: Setiknocker le 18 septembre 2005 à 17:39
Il y a une autre team : http://boinc.bakerlab.org/rosetta/team_display.php?teamid=37
la team France@Rosetta  :??:  :??:
Titre: Rosetta@home
Posté par: Douglas Riper le 18 septembre 2005 à 19:19
Citation de: Setiknocker
Il y a une autre team : http://boinc.bakerlab.org/rosetta/team_display.php?teamid=37
la team France@Rosetta  :??:  :??:
http://forum.boinc.fr/boinc/LAllianceFrancophone/Public-relations-sujet-59-2.htm#t4394

je me passerai de commentaires on me demande de rester courtois :o
Titre: Rosetta@home
Posté par: Setiknocker le 18 septembre 2005 à 19:43
Oui, tu as raison, j'avoue que pour ma part, ce mec me fait plutôt sourire tellement il a l'air ridicule... :(
Le pôvre... :pfff:
Il a déclaré une guerre ouverte et s'étonne que tout le monde n'adhère pas à ses projets "officiels"...
Bah, Il y a des rêveurs partout...  :heink:
Le but principal est de collaborer, pas de se faire la guerre, qu'il s'amuse  :sol:
En attendant, ses crédits ne sont guère élevés, c'est un digne représentant de ses diverses équipes en bois... :lol:
 :bounce: FCCPU!!! :bounce:
Titre: Rosetta@home
Posté par: Nightbird le 18 septembre 2005 à 21:52
Citation de: patouchon
ben vi c'est la reflexion que je me suis fait en moi même, personellement... :heink:
qqun peut nous zespliquer ? :D

ce sont les mêmes buts
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=7
Citer
Thank you for your interest in helping our and similar projects, like Predictor@home!!!

Titre: Rosetta@home
Posté par: mamouth le 19 septembre 2005 à 13:39
Après avoir survolé le site je me dis que ça ressemble
à prédictor en + beau et plus pro
j'ai pas eu le courage de lire toute les explications compliquées ( en anglais en  + )

ils mentionnent clairement le SIDA et le Cancer dans leur priorités de reherche

Projet intèressant à suivre donc avec des Wu assez longues ( plusieurs dizaines d'heures  )  
Titre: Rosetta@home
Posté par: Douglas Riper le 19 septembre 2005 à 14:09
donc plus comme du folding quoi ?
Titre: Rosetta@home
Posté par: raphcl le 20 septembre 2005 à 21:40
Cela me fait penser au projet "fightaidsathome".
Mais celui ci semble etre different.
Titre: Rosetta@home
Posté par: mamouth le 22 septembre 2005 à 11:24
Alors il y a déjà des articles dans la presse concernant ce projet

http://www.telegraph.co.uk/connected/main.jhtml?xml=/connected/2005/09/21/ecfori21.xml

http://www.hhmi.org/news/baker4.html

Alors le projet se passe à l'université de washington et les chercheurs vont afficher ce genre de poster
(http://boinc.bakerlab.org/rosetta/hfs_posters/HFS_BOINC_POSTER3small.gif)

dans le campus pour inciter les étudiants à utiliser BOINC
Le directeur est même impliqué et il a promis des prix pour les meilleurs
cool non ?


Ma première Wu temps estimé 180 heures 90 % calculé après 10H

2 autres wu en cache temps estimé 4H

je vous tiens au courrant ce soir je devrais avoir 1 ou 2 Wu terminées
Titre: Rosetta@home
Posté par: mamouth le 22 septembre 2005 à 11:56
Tant que j'y suis

Rosetta à le même but que prédictor mais utilise une méthode différente pour y arriver
D'après le site de rosetta leur méthode serait la plus moderne et performante ... je suppose que chez prédictor ils vont dire la même chose

aussi point important les résultats seront publiés
Citer
Q2 - R@H is non-profit and for science, all results will be available to the public. The Rosetta application is licensed to pharma but most of the proceeds go to further research, for example - it funds an annual Rosetta development conference that brings researchers from various universities together. The application is available for free to academic users.
Titre: Rosetta@home
Posté par: Douglas Riper le 22 septembre 2005 à 19:37
j'aime bien l'affiche :)
Titre: Rosetta@home
Posté par: philmo le 22 septembre 2005 à 20:38
Marrant le slogan de celle là : http://www.boinc.bakerlab.org/rosetta/hfs_posters/HFS_BOINC_POSTER1.jpg
Titre: Rosetta@home
Posté par: mab74fr le 22 septembre 2005 à 21:43
j'aime mieux celle citée par mamouth :

(http://boinc.bakerlab.org/rosetta/hfs_posters/HFS_BOINC_POSTER3small.gif)

It's almost as noble as giving blood
- but without the juice and cookies


C'est presque aussi noble que de donner son sang
- mais sans le jus de fruits et les gateaux
Titre: Rosetta@home
Posté par: Douglas Riper le 23 septembre 2005 à 03:21
ca serait pas mal ce genre de truc en français avec un joli boinc.fr :D
Titre: Rosetta@home
Posté par: raphcl le 23 septembre 2005 à 06:04
Je vais demander a mon Proviseur si on ne pourrait pas afficher quelque chose sur Boinc dans mon lycee...
Titre: Rosetta@home
Posté par: Douglas Riper le 23 septembre 2005 à 08:57
Bonne initiative :jap:
Titre: Rosetta@home
Posté par: Djezz le 23 septembre 2005 à 12:07
Pour les affiches, je vais bosser dessus ce week-end.
Titre: Rosetta@home
Posté par: Douglas Riper le 23 septembre 2005 à 12:14
bah pour ce genre d'initiative je propose qu'on en parle dans ce topic http://forum.boinc.fr/boinc/LAllianceFrancophone/Teams-Public-relations-sujet-59-1.htm :o
Titre: Rosetta@home
Posté par: symaski62 le 24 septembre 2005 à 23:16
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/results.php?hostid=1004
 
1667 mhz et avec 256 mo de mémoire vive "seulement"
 
3H00 = 1 wu    
 
alo  ^^
Titre: Rosetta@home
Posté par: raphcl le 25 septembre 2005 à 11:47
Merci symaski62 pour les infos.
Vu la frequence CPU tu dois avoir un 2000+.
Je devrais donc etre assez proche avec mon 2200+ et 512 mo de mémoire vive.
Mais par contre je me demande si le fait de partager les ressources avec un autre projet ne bloque pas Rosetta.
Car j'ai l'impression de ne finir des WU que quand Rosetta est seul.
Titre: Rosetta@home
Posté par: raphcl le 25 septembre 2005 à 12:08
J'ai l'impression que il existait deja un logiciel nomme "HMMSTR/Rosetta Prediction" qui etudiait la structure tertiaire d'une protéine. Mais qui n'avait rien a voir avec le calcul distribue, son but etant l'etude et la visualisation pour les chercheurs.
Voici le site : http://pole-modelisation.univ-bpclermont.fr/prive/fiches_HTML/hmmrosetta.html

Je cherche toujours les differences exactes entre Predictor et Rosetta, quelqun ici pourrais nous expliquer ?

Titre: Rosetta@home
Posté par: yannva le 25 septembre 2005 à 12:43
Rosetta a visiblement du mal avec le partage. En effet si je ne le laisse pas seul ma WU reprend toujours à 83.33 % sans jamais se terminer...
Titre: Rosetta@home
Posté par: mamouth le 25 septembre 2005 à 22:41
même problème , regarder mes logs

24/09/2005 17:44:03||Suspending computation and network activity - running CPU benchmarks
24/09/2005 17:44:03|rosetta@home|Pausing result 1pvaA_abrelax_20533_0 (removed from memory)
24/09/2005 17:44:03|rosetta@home|Pausing result 1pvaA_abrelax_23518_0 (removed from memory)
24/09/2005 17:44:04|rosetta@home|Unrecoverable error for result 1pvaA_abrelax_20533_0 ( - exit code -1073741819 (0xc0000005))
24/09/2005 17:44:04|rosetta@home|Unrecoverable error for result 1pvaA_abrelax_23518_0 ( - exit code -1073741819 (0xc0000005))
24/09/2005 17:44:04||request_reschedule_cpus: process exited
24/09/2005 17:44:05||Running CPU benchmarks
24/09/2005 17:45:02||Benchmark results:
24/09/2005 17:45:02||   Number of CPUs: 2
24/09/2005 17:45:02||   1451 double precision MIPS (Whetstone) per CPU
24/09/2005 17:45:02||   2094 integer MIPS (Dhrystone) per CPU
24/09/2005 17:45:02||Finished CPU benchmarks
24/09/2005 17:45:02||Resuming computation and network activity
24/09/2005 17:45:02||request_reschedule_cpus: Resuming activities
24/09/2005 17:45:02|rosetta@home|Deferring communication with project for 2 seconds
24/09/2005 17:45:02|rosetta@home|Computation for result 1pvaA_abrelax_20533_0 finished
24/09/2005 17:45:02|rosetta@home|Computation for result 1pvaA_abrelax_23518_0 finished
24/09/2005 17:45:02|LHC@home|Restarting result wjun4B_v6s4hhpac_mqx__16__64.2764_59.2927__4_6__6__30_1_sixvf_boinc20913_3 using sixtrack version 4.67
24/09/2005 17:45:02|LHC@home|Restarting result wjun4B_v6s4hhpac_mqx__18__64.2784_59.2947__6_8__6__50_1_sixvf_boinc23820_5 using sixtrack version 4.67


Apparemment rosetta ne gére pas bien le "partage" de projets

une nouvelle version de rosetta est sortie et la durèe  des Wu grandemant diminuée
Titre: Rosetta@home
Posté par: yannva le 25 septembre 2005 à 22:53
je viens de tenter un reset du projet : on verra demain....
Titre: Rosetta@home
Posté par: symaski62 le 25 septembre 2005 à 23:17
Citation de: mamouth
même problème , regarder mes logs

24/09/2005 17:44:03||Suspending computation and network activity - running CPU benchmarks
24/09/2005 17:44:03|rosetta@home|Pausing result 1pvaA_abrelax_20533_0 (removed from memory)
24/09/2005 17:44:03|rosetta@home|Pausing result 1pvaA_abrelax_23518_0 (removed from memory)
24/09/2005 17:44:04|rosetta@home|Unrecoverable error for result 1pvaA_abrelax_20533_0 ( - exit code -1073741819 (0xc0000005))
24/09/2005 17:44:04|rosetta@home|Unrecoverable error for result 1pvaA_abrelax_23518_0 ( - exit code -1073741819 (0xc0000005))
24/09/2005 17:44:04||request_reschedule_cpus: process exited
24/09/2005 17:44:05||Running CPU benchmarks
24/09/2005 17:45:02||Benchmark results:
24/09/2005 17:45:02||   Number of CPUs: 2
24/09/2005 17:45:02||   1451 double precision MIPS (Whetstone) per CPU
24/09/2005 17:45:02||   2094 integer MIPS (Dhrystone) per CPU
24/09/2005 17:45:02||Finished CPU benchmarks
24/09/2005 17:45:02||Resuming computation and network activity
24/09/2005 17:45:02||request_reschedule_cpus: Resuming activities
24/09/2005 17:45:02|rosetta@home|Deferring communication with project for 2 seconds
24/09/2005 17:45:02|rosetta@home|Computation for result 1pvaA_abrelax_20533_0 finished
24/09/2005 17:45:02|rosetta@home|Computation for result 1pvaA_abrelax_23518_0 finished
24/09/2005 17:45:02|LHC@home|Restarting result wjun4B_v6s4hhpac_mqx__16__64.2764_59.2927__4_6__6__30_1_sixvf_boinc20913_3 using sixtrack version 4.67
24/09/2005 17:45:02|LHC@home|Restarting result wjun4B_v6s4hhpac_mqx__18__64.2784_59.2947__6_8__6__50_1_sixvf_boinc23820_5 using sixtrack version 4.67


Apparemment rosetta ne gére pas bien le "partage" de projets

une nouvelle version de rosetta est sortie et la durèe  des Wu grandemant diminuée


ok
 envoyer  :)
Titre: Rosetta@home
Posté par: raphcl le 26 septembre 2005 à 02:38
Citer
robetta,
Forum moderator,
Project administrator

Both projects are similar in that both are trying to improve methods for protein structure prediction. Rosetta@home includes protein design and prediction of complexes. Rosetta@home uses a software package called Rosetta, which has been proven to be one of the best methods out there for protein structure prediction in repeated CASP experiments (See our About page). Rosetta is also being used for the Human Proteome Folding Project, which is trying to predict folds for many proteins in the human genome. While they, in collaboration with us, are applying Rosetta to the human genome and other genomes like malaria (P falciparum), we are trying to conduct research to make it better. David Baker's work has been published in today's issue of Science. It is exciting work. Thank you for your interest in helping our and similar projects, like Predictor@home!!!

Source :  http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=7
Titre: Rosetta@home
Posté par: raphcl le 26 septembre 2005 à 02:41
Sur la page cite ci-dessus, on dispose d'un peu plus d'informations sur le projet Rosetta.
Le but est donc le meme, etudier la structure tertiaire ( repliement physique de la proteine ), mais la methode change.

Citation de: raphcl
J'ai l'impression que il existait deja un logiciel nomme "HMMSTR/Rosetta Prediction" qui etudiait la structure tertiaire d'une protéine. Mais qui n'avait rien a voir avec le calcul distribue, son but etant l'etude et la visualisation pour les chercheurs.
Voici le site : http://pole-modelisation.univ-bpclermont.fr/prive/fiches_HTML/hmmrosetta.html
 

D'apres ce que j'ai lu, le projet Rosetta@home se baserais bien sur le systeme du logiciel nomme "HMMSTR/Rosetta Prediction".
Titre: Rosetta@home
Posté par: raphcl le 26 septembre 2005 à 02:56
Dans le gestionnaire de taches je vois que Rosetta prend souvent 145mo de mémoire vive.
Sans doute pour cela que sur leur site, il est marque que un PC avec 512mo de RAM est recommande.
Titre: Rosetta@home
Posté par: raphcl le 06 octobre 2005 à 19:42
Dans une news recente sur le site de Rosetta, on apprend que le projet est fin pret pour fonctionner sous BOINC 5.xx
Titre: Rosetta@home
Posté par: mamouth le 09 novembre 2005 à 13:31
Très intérressant ce projet

je vous encourage à l'essayer, surtout que l'AF est un peu à la traine

Les scientifiques sont très impliqués dans le projet ils postent presque tous les jours sur les forums
dès qu'il y a un problème ou un résultat positif on est avertit c'est une belle communauté qui est en train de se former

Une autre raison de participer c'est que la science avance aujourd'hui le chef de projet a posté un message expliquant que son équipe a fait une découverte intèressante ce week end.
Titre: Rosetta@home
Posté par: arnaud25 le 22 novembre 2005 à 16:57
Des graphiques pour Rosetta viennent d'apparaître:

(http://www.ussachilles.net/rosetta2.png)
Titre: Rosetta@home
Posté par: jmb59 le 22 novembre 2005 à 20:19
jolis graphiques.
t'as bougé quand t'as pris la photo ? :D
Titre: Rosetta@home
Posté par: arnaud25 le 22 novembre 2005 à 20:35
C'est pas moi, mais un membre de l'équipe CNT (tchèque) :p
Titre: Rosetta@home
Posté par: mamouth le 29 novembre 2005 à 10:11
Credits last 24h  :   1,002,650

Le million de crédits par jour est dépassé

Les graphiques sont passé du statut Béta à production
Titre: Rosetta@home
Posté par: arnaud25 le 28 janvier 2006 à 11:31
Ouverture d'une page Science news (http://boinc.bakerlab.org/rosetta/rah_science_news.php) qui explique les travaux en cours et les résultats obtenus.
Titre: Rosetta@home
Posté par: Heyoka le 10 mars 2006 à 17:15
4 nouveaux découvreur mis en ligne le 9 mars.
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/rah_top_predictions.php
Les heureux gagnant sont:
Dalephi    (Team TeAm AnandTech)
jacekko    (Team Rosetta@Poland)
Team_Gaol~Christian    (Team Dutch Power Cows)
LocalBusinessMen    (Team XtremeSystems)


Personne de l'AF  :(
Titre: Rosetta@home
Posté par: philmo le 10 mars 2006 à 23:38
On est clairement à la traine... :(
Titre: Rosetta@home
Posté par: popolito le 31 mars 2006 à 19:55
Je n'ai que 256mo de RAM donc rosetta sur la touche... :(
Titre: Rosetta@home
Posté par: Heyoka le 31 mars 2006 à 19:57
Citation de: popolito
Je n'ai que 256mo de RAM donc rosetta sur la touche... :(


Essaye Simap, ça demande moins de RAM :)
Titre: Rosetta@home
Posté par: popolito le 01 avril 2006 à 14:21
Citation de: Heyoka
Essaye Simap, ça demande moins de RAM :)

Ouais, je me suis rabattu là-dessus  :bounce:
Titre: Rosetta@home
Posté par: doux reveur le 21 avril 2006 à 20:51
Je suis sur world community grid et sur rosetta.Comment ça se passe pour les crédits?Sont-ils pris en compte pour world community grid ou dans mes stats pour rosetta?et pour boincstats?
Titre: Rosetta@home
Posté par: doux reveur le 25 avril 2006 à 14:51
Encore moi!Voila le problème:je me suis réinscrit au projet rosetta mais maintenant le projet m'attribue 2 ordinateurs alors que je n'en ai qu'un.En plus,y'a pas de lien pour "merger".Comment faire?
 :??:
Titre: Rosetta@home
Posté par: jump400 le 25 avril 2006 à 15:06
Rosetta a desactivé le 22/3 la fonction de merge suite à des pb techniques :

Citer
March 22, 2006
Recently our database server has been crushed repeatedly resulting in webserver slowdowns. Tracking all of this down has been a real challenge. This AM it was noticed that during every slowdown someone was trying to 'merge' two client hosts. After eliminating everything else as a possibility we were left to wonder if this merging of hosts could really be a problem. After disasterously wasteful searching of many unrelated issues, it was discovered that SETI@home had this very problem last month [see the entry for February 1, 2006 on the SETI@home Technical News Page]. We have disabled host merges until we can upgrade the database software.

source : http://boinc.bakerlab.org/rosetta/rah_technical_news.php

Je ne pense pas que cela pose de reel pb d'avoir une machine recensée comme 2 (ou plus). Cela n'impact que les stats de la machine
Titre: Rosetta@home
Posté par: doux reveur le 25 avril 2006 à 19:38
ok!
Titre: Rosetta@home
Posté par: mandrake le 25 avril 2006 à 20:19
Pourquoi réinscrit ?
Titre: Rosetta@home
Posté par: doux reveur le 25 avril 2006 à 20:49
Tu as raison,j'aurais du dire ré-attacher.Je m'étais détaché car je participe à wcg qui travaille notamment pour rosetta et fah donc c'était un moyen de libérer du temps pour d'autres projets...
Seulement pas assez de wus sous wcg alors maintenant je fais les deux.
Titre: Rosetta@home
Posté par: mandrake le 25 avril 2006 à 21:52
pour libérer du temps pour les autres projets il suffit de cliquer sur le bouton suspendre quand tu as sélectionné WCG ou Rosetta.
Titre: Rosetta@home
Posté par: xavier59 le 28 avril 2006 à 15:24
Un des membres de l'Alliance a recement fait une decouverte :

Citer
April 4, 2006 - 1hz6_FA_RLX_hom015

    * [AF>FRANCE>Est>IDF>EDLS] Mephisto94   (Team L'Alliance Francophone)


http://boinc.bakerlab.org/rosetta/rah_top_predictions.php

Joli !!!!  :jap:

Voila qui va encourager les participant de l'alliance !!! (j'aimerais bien faire parti des decouvreurs  :bounce: )
Titre: Rosetta@home
Posté par: mandrake le 28 avril 2006 à 17:16
On l'a même cité dans les infos publiées sur le portail

http://www.boinc-af.org/index.php?option=com_content&task=view&id=120&Itemid=170
Titre: Rosetta@home
Posté par: Heyoka le 28 avril 2006 à 22:23
Pour en savoir plus sur Rosetta, une interview du Dr. David Baker fait par la team Picard
http://www.teampicard.com/profiles/Interview.php?id=4
Titre: Rosetta@home
Posté par: Heyoka le 05 mai 2006 à 12:59
Interview du Dr. David Baker
de Rosetta@home (http://boinc.bakerlab.org/rosetta/)
Université de Washington
28 Avril 2006 - Interview n°4
Projet Boinc qui vise à déterminer la  structure des protéines

http://www.teampicard.com/profiles/Interview.php?id=4





Team Picard:  Quel est le but de Rosseta@Home?
DaveBaker:  C'est de prédire les structures des protéines naturelles, et de créer de toute pièce de nouvelles protéines ayant des principes actifs nouveaux et utiles  

TP:  Le projet et le programme est-il baptisé du nom de la pierre de Rosette? Pourquoi avez-vous chosis Rosetta comme nom?  
DB:  C'est Kim Simons, un étudiant agrégé qui a écrit la première version de Rosetta (il y a bien longtemps), c'est lui qui a choisi le nom basé sur la pierre de Rosette.  Le programme visait à déchiffrer la "signification" du code génétique des acides aminés d'une protéine.
 
TP:  Le programme que le projet exécute par l'intermédiaire du programme de BOINC s'appelle également Rosetta, et est libre pour l'usage scolaire.  Qui l'emploie autrement?
DB:  Il y a des centaines de chercheurs étudiant dans le domaine des protéines à travers le monde qui utilisent rosetta .

TP:  Est-il vrai que plus vous faites tourner cette simulation pour une protéine , et plus vous rapprocher au maximum de la forme la plus précise de l'identité de la protéine naturelle?  Pourquoi?
DB:  Oui.  Car il est plus probable que nous trouvions la plus basse structure d'énergie.  Le projet nécessite de simuler le pliage d'une protéine un nombre important de fois afin de trouver la séquence d'acide aminé ayant une structure nécessitant le minimum d'énergie.  Puisque la structure réelle est la séquence ayant la plus basse structure d'énergie, la plus basse structure d'énergie trouvée devrait être une représentation très précise de la forme de la protéine.  La forme de la protéine détermine la manière dont elle agit en interaction avec les autres protéines, ou encore qu'elle est sa fonction réelle .

TP:  J'ai lu qu'il est possible de découvrir la forme exacte des protéines.  En fait vous les avez comparé à vos résultats trouvés grâce à la simulation pour vous assurer que vos modèles sont précis.  Pourquoi pas simplement déterminer des formes de protéine expérimentalement?  
DB:  Bonne question.  Cela coûte plus de 100.000 dollars (85.000 euros) pour résoudre la structure d'une protéine, et souvent beaucoup d'années de travail.  

TP:  D'accords, laissons de coté la science pendant une minute, parlez nous du projet. Il y a actuellement deux projets qui tournent sur BOINC?  Pourquoi avez-vous lancé Ralph?  

DB:  Ceci est dû au fait que nous essayons continuellement d'améliorer de manière scientifique Rosetta, ainsi que pour mettre en application les souhaits émis par les utilisateurs. de ce fait le programme évolue très souvent, et nous avons eu besoin d'un projet spécifique pour examiner de nouvelles versions du programme sur une petite échelle avec les utilisateurs qui ne s'occupent pas des erreurs que celà peut occasionner.

TP:  De combien de membre est composé votre équipe ?
DB:  Nous sommes actuellement cinq pour dévellopper rosetta@home.

TP:  Vous cherchez activement de nouveaux utilisateurs pour participer au projet.  Je suppose que c'est parce que vos résultats sont meilleurs avec une utilisation plus intensive.  Si chaque nouveau volontaire avait un nouvel ordinateur allumé 24 heures sur 24, sept jours sur sept, de combien de nouveaux utilisateurs auriez-vous besoin?  Si on pouvait exaucer ici et maintenant tout vos souhaits que demanderiez vous?  
DB:  Oui, il nous faudrait beaucoup plus d'utilisateurs, parce que le calcul des structures de grandes protéines exige beaucoup plus de puissance que vous nous accordés actuellement (rappel Rosetta est actuellement proche des 30 teraflops).  Nous nous somme fixé un objectif de 150 teraflops, qui serait 5 à 10 fois plus important que la puissance du projet actuel ceci pourrait être réalisé par 100.000 nouveaux utilisateurs à temps plein. Mais en réalité, pour un objectif plus ambitieux en ce qui concerne la biologie structurale, qui aurait un impact énorme sur le monde, même ceci ne serait pas assez.  Mais le projet continuera pendant un certain nombre années, je prévois, ainsi ce n'est pas trop mal si quelques problèmes ne peuvent pas être résolus en ce moment!  

TP:  Votre page internet attire l'attention.  Vous avez beaucoup d'information mis à disposition de nouveaux utilisateurs pour les tenir au courant de ce que vous faites et ce jusqu'à quelques descriptions très techniques sur ce qui va être fait.  Pourquoi avez-vous décidé de mettre à disposition plus de documentations que les autres projets de calcul partagé?  
DB:  Nous avons voulu mettre à dispostion des gens le maximum de documentation au sujet de ce que nous faisons et dans quel but.  

TP:  Dites-moi au sujet de votre page des "meilleures prédictions".  Qu'est-ce que c'est, pourquoi existe t'elle?
DB:  C'est une partie très importante du site car elle montre les résultats que nous obtenons et comment les gens contribuent aux résultats.  Je renvoie à cette page du site d'autres scientifiques qui veulent se renseigner sur l'état actuel de la prévision de structure de protéine.  

TP:  Comment en êtes vous arrivé à choisir le calcul partagé?
DB:  Au vu des résultats de notre groupe l'année dernière nous nous somme dit que nous pourrions accomplir des progrès signficatifs dans le domaine des prévisions de structure de protéine si nous disposions d'une quantité beaucoup plus grande en terme de puissance de calcul.  Mais il n'y avait tout simplement aucune manière de mesurer notre puissance de calcul individuel de manière significative.  J'avais entendu parler du calcul partagé de par les professeurs Charlie Brooks (Predictor) et Vijay Pande (Folding@home) que je vois de temps à autre.

TP:  Comment BOINC a-t-il mis en place votre projet?  Auriez-vous lancé un projet de calcul partagé sans lui?
DB:  BOINC a été d'une aide inestimable!!  Je ne sais pas si nous aurions pu
 en être arrivé là sans lui.  Je pense que David Anderson et l'équipe de développement de Boinc ont apporté une contribution énorme à notre projet  

TP:  Avez-vous rencontré des problèmes en utilisant la plateforme de BOINC?  
DB:  Non.

TP:  Je trouve que c'est important d'aider les jeunes à s'intéresser aux maths et la Science.  Si vous étiez un professeur et vous vouliez faire tourner ce projet dans la salle informatique de votre lycée en tant que complément aux cours de biologie, comment présenteriez-vous votre projet dans un cours de base de biologie?  Les concepts peuvent être assez durs à comprendre pour un jeune.
DB:  J'en conviens.  Je pense que le projet pourrait être présenté dans un cours de biologie au lycée ou dans des salles informatiques. L'image du plus bas point d'altitude sur un paysage compliqué est je pense le meilleure moyen d'expliquer nos recherches à une large assisatnce (j'ai d'ailleurs essayé de faire comprendre ceci sur la page Web de rosetta@home).  

TP:  Addressés vous aux jeunes, quels types de travaux avez-vous faits?  De quelles études avez-vous eu besoin pour arriver au niveau que vous avez atteinds aujourd'hui?  
DB:  J'ai obtenu une thèse et j'ai fait quelques années de travail postdoctoral avant de devenir un professeur à l'Université de Washington il y a environ 13 ans.  

TP:  Qu'est-ce que peut faire la communauté du calcul partagé (des projets,les utilisateurs et les équipes qui participent aux projets) pour rendre accessible ce passe-temps à tout les utilisateur moyen en informatique?  
DB:  Excellente question -- j'aimerais bien connaitre la réponse!  

TP:  Quels types de choses faites-vous quand vous n'êtes pas au travail?  
DB:  J'ai deux gosses et je passe l'essentiel de mes temps libres avec ma famille.  Nous essayons d'aller en montagnes nous ballader et skier aussi souvent que possible.  

TP:  Vous essayez de poster fréquemmentsur le message board de votre forum.  Que vous incite à faire ceci?
DB:  Beaucoup d'utilisateurs demandent plus de rétroactivité sur la façon dont le projet évolue, et c'est le mimimum que je puisse faire pour remercier les gens de la magnifique contribution qu'ils apportent au projet!!  

TP:  Ce n'est qu'un début que cette interview du projet Rosetta@Home.  Dans les prochaines semaines d'autres membres seront ici pour parler avec nous, nous satisferont ainsi les questions que vous souhaiteriez que je leur pose, et elles seront présentes dans la prochaine interview.  Pour celà vous pouvez utiliser cette forme de contact (http://www.teampicard.com/forum/sendmessage.php) qui n'exige pas de s'enregistrer sur le forum.  Pour finir, nous voudrions remercier tout spécialement le Dr. David Baker d'avoir pris le temps sur son programme chargé de répondre à nos quelques questions.
Titre: Rosetta@home
Posté par: Click le 05 mai 2006 à 21:25
Merci a l'AF et a Mr Baker pour cette interview très rafraîchissante.
Encore bravo, continuez  :jap:

Amicalement, Alex.
Titre: Rosetta@home
Posté par: arnaud25 le 10 mai 2006 à 09:05
vous avez recu la newsletter Rosetta ?
Rosetta a besoin de plus de puissance CPU avec le demarrage du CASP.
Quelque chose est prévu au niveau de l'Alliance ? (genre un petit fight avec une grosse équipe pour motiver les troupes) :D
Titre: Rosetta@home
Posté par: jump400 le 10 mai 2006 à 10:26
Citation de: arnaud25
vous avez recu la newsletter Rosetta ?
Rosetta a besoin de plus de puissance CPU avec le demarrage du CASP.
Quelque chose est prévu au niveau de l'Alliance ? (genre un petit fight avec une grosse équipe pour motiver les troupes) :D


Peux-tu la publier ici, stp ? ou alors un lien (je n'ai pas trouvé sur le site Rosetta)
Merci
Titre: Rosetta@home
Posté par: mandrake le 10 mai 2006 à 11:08
sinon tu peux la publier sur le portail :)
Titre: Rosetta@home
Posté par: arnaud25 le 10 mai 2006 à 12:28
Citer
Dear Rosetta@home Participants,   A wonderful aspect of Rosetta@home for me has been the marvelous contributions of the many dedicated volunteers around the world. We are about to begin the 7th biennial CASP Structure Prediction Experiment and from May 10th until August 1st our need for computing power will be even greater. In a bid to solicit more of your 'crunching time', R@H volunteers have put together the following letter which we are sending to all participants. With all of your collective efforts it should be possible to do wonders!   Thank you!     David Baker
Rosetta@home logo

(http://boinc.bakerlab.org/rosetta/rah_images/rosetta_at_home_logo.gif)Dear Rosetta@home Contributors,
We are writing you to thank you for donating your computer time to Rosetta@home (http://boinc.bakerlab.org/rosetta/). We'd also like to bring you an update on recent improvements as well as ask for your help during this year's Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction (CASP7).

Rosetta@home (http://boinc.bakerlab.org/rosetta/) is working to develop software to accurately predict the folding structure of proteins, which is a key function in developing cures for diseases such as AIDS, cancer, and Alzheimer's. The Rosetta software is used by other scientists and distributed computing projects. Any improvement we can make in this project will benefit other scientists and projects as well.


Cutting-Edge Research with an all new Application package

The Rosetta@home (http://boinc.bakerlab.org/rosetta/) science application has improved greatly in recent weeks. We now have "smarter" software and new techniques which help find the best structures faster. We have also released a number of new features:

   
  • Work unit runtimes based on preference setting (http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=669#10375) can minimize your internet use.
       
  • More frequent saves (checkpointing (http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=1449#14799)), means more science output and more credits for you and your team.
       
  • The "Watchdog (http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=1449#14799)" keeps work flowing by ending work units that appear stuck or hung.
       
  • All work units will receive credit even if they return late or with an error result.


All these improvements guarantee a problem-free and most useful contribution of your valuable computer time.


CASP7 is here - Be part of the competition and the winning team!
(http://www.hhmi.org./research/investigators/images/bakerd.gif)Dr. David Baker - the lead scientist of the project

There are many science teams working on protein studies, and every 2 years they conduct a contest of sorts, to define the current state-of-the-art. Now the 2006 event is underway, and you can help. CASP will present proteins no one has ever seen before and ask the research teams to give their best structure predictions for this computationally intense problem. We are very hopeful the improved Rosetta software, now with the added power of distributed computing, will again find the most accurate predictions.

CASP7 runs from May 10th to August 1st. The more computing power we apply, the better the predictions become. Please be sure to run Rosetta@home, at least during the three month period of the competition. Read more about CASP7 (http://predictioncenter.org/casp7), and check for published results on the Rosetta@home website through the end of the year.


Be a part of the project team with new information and user recognition

A number of new informational features have been added to help you participate with the research team:

   
  • "Dr. Baker's science journal" (http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=1177) where the project's lead scientist posts regular updates and project news.
       
  • Work Unit information (http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=1453) describes the proteins and tests being performed for each work unit type.
       
  • The Application Version Log (http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=1449) explains new features and scientific improvements in the application.

    The project staff is very responsive to questions and suggestions and is working to incorporate them into Rosetta application improvements.


    What you can do to help

       
  • If you discontinued Rosetta for any reason, please attach (http://boinc.bakerlab.org/rosetta/rah_intro.php) again and you will find the application improvements have resolved the problems many were having.
       
  • Dedicate a greater resource share to Rosetta, at least during CASP7.
  • Attach additional computers to the project.
  • Contact your friends and teammates and help them learn more about Rosetta so they will want to crunch more too. Here is a simple explanation (http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=1377#13473) you might use.
       
  • If you are a member of a team, please ask for more Rosetta processing time on your team message boards.


Thank you for your past participation, and we hope you can provide additional support to Rosetta@home (http://boinc.bakerlab.org/rosetta/) in the future.

    Mark, Joachim, Gerry and the Rosetta@home volunteers

P.S.: Still not convinced? Take a look at "10 reasons why I support Rosetta@home and you should too." (http://boinc.bakerlab.org/rosetta/rah_ten_reasons.php)

P.P.S.: Your account preferences suggest that you wouldn't mind recieving our rare newsletters. If this is not true, you can 'opt-out' of future mailings by changing the "Should Rosetta@home send you email newsletters?" setting in your account preferences here: Rosetta@home preferences (http://boinc.bakerlab.org/rosetta/prefs_edit_form.php?subset=project)


edit doug: j'ai fait la mise en page
Titre: Rosetta@home
Posté par: Douglas Riper le 10 mai 2006 à 13:25
j'ai normalement publié qsur boinc-af.org mais bon je ne la trouve pas :whistle:
Titre: Rosetta@home
Posté par: arnaud25 le 10 mai 2006 à 13:55
Tu as oublié de cliquer sur la croix "publier en page d'accueil"...?
Titre: Rosetta@home
Posté par: mandrake le 10 mai 2006 à 15:37
il a verrouillé sa page :p
Titre: Rosetta@home
Posté par: Douglas Riper le 11 mai 2006 à 13:18
'chui un deglingos des fois :o
merci a celui qui l'a publiée :jap:
Titre: Rosetta@home
Posté par: Jacquominot le 11 mai 2006 à 16:16
Bonjour à tous,
Je la trouve bien tranquille la team rosetta de l'AF.
Pas trop de fight avec les autres, pas mal d'utilisateurs qui font des credits et puis plus rien.
Avec mon seul 2800+ je suis toujours dans le top10, depassez moi que diantre lol.

En tout cas ca me fait bien plaisir d'être dans une équipe telle que celle la car il y a la notoriété et la sympathie entre participants.
(Mamouth bouge pas j'arrive derrièere toi même si tu n'es plus la)
Titre: Rosetta@home
Posté par: mamouth le 12 mai 2006 à 08:19
Citation de: Jacquominot
Bonjour à tous,

(Mamouth bouge pas j'arrive derrièere toi même si tu n'es plus la)



Je termine les WU du S4 sur einstein ( j'avais une petite envie de crèdits ) puis je retourne sur rosetta

Sinon on vient de terminer une fight avec l'équipe des Clanger ( fight gagnée bien sur )
Titre: Rosetta@home
Posté par: thomas le 12 mai 2006 à 17:52
je suis sur rosetta moi aussi :p et j'ai pas couper :p

et toc !
Titre: Rosetta@home
Posté par: arnaud25 le 30 mai 2006 à 22:17
Un article dans le journal Seattle times (http://archives.seattletimes.nwsource.com/cgi-bin/texis.cgi/web/vortex/display?slug=homecomputer30m&date=20060530)
Il a l'air cool David !!!(http://yelims3.free.fr/Jesuis/Yeahhh.gif)
Titre: Rosetta@home
Posté par: thomas le 31 mai 2006 à 19:23
y avais pas un client optimisé pour Rosetta ?
Titre: Rosetta@home
Posté par: BlackStar95 le 31 mai 2006 à 19:40
Y en a pour Seti, Einstein, dènierement pour SZTAKI et Simap, mais à ma connaissance aucun pour Rosetta
Titre: Rosetta@home
Posté par: thomas le 31 mai 2006 à 19:43
En faite je sais pas lire .. confond einstein et Rosetta moi .. :/
Titre: Rosetta@home
Posté par: arnaud25 le 03 juin 2006 à 20:28
Une conférence donnée par David Baker où il explique le sujet de ses recherches:
http://norfolk.cs.washington.edu/htbin-post/unrestricted/colloq/details.cgi?id=449
Titre: Rosetta@home
Posté par: thomas le 03 juin 2006 à 21:22
je pige rien a l'anglais :'(

Titre: Rosetta@home
Posté par: Jacquominot le 03 juin 2006 à 21:53
j'ai du mal sur rosetta en ce moment. D'habitude je suis a 400credits par jour et depuis deux semaines je suis qu'a 250 max du coup je descend au classement c po cool.
Quelqu'un sait pourquoi?
Titre: Rosetta@home
Posté par: thomas le 03 juin 2006 à 22:02
je sais pas, moi je continue de monté, je passe a 1040 la
Titre: Rosetta@home
Posté par: ordralfabetix le 03 juin 2006 à 22:24
Citer
Jacquominot a dit
D'habitude je suis a 400credits par jour et depuis deux semaines je suis qu'a 250 max

T'es allé voir si t'as pas du retard dans les pending credit?
 ;)
Titre: Rosetta@home
Posté par: Heyoka le 03 juin 2006 à 23:05
Citation de: thomas
je pige rien a l'anglais :'(


là ça sera difficile à traduire sur le site de l'AF  :D
A moins que quelqu'un soit fort dans les doublage de film en VO :o
J'ais juste mis le lien vers la vidéo conférence sur le sujet Rosetta de l'AF
http://www.boinc-af.org/index.php?option=com_content&task=view&id=26&Itemid=219
Titre: Rosetta@home
Posté par: popolito le 04 juin 2006 à 09:43
Il n'y a pas de pending credit sur rosetta car une wu est calculée une fois seulement ;)
Titre: Rosetta@home
Posté par: Heyoka le 04 juin 2006 à 19:08
Voilà la raison :
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/

Citer
June 3, 2006
We are having problems with our validator. It should be back online later today.


Citer
June 3, 2006
The validator is cranking away now.


Le problème dans la validation des crédits n'a pas duré très longtemps


Au fait, vous avez vu les nouvelles affichettes pour proumouvoir Boinc et Rosetta http://boinc.bakerlab.org/rosetta/rah_misc.php
Titre: Rosetta@home
Posté par: popolito le 09 juin 2006 à 09:55
Nouvelle application Rosetta 5.22.
Correction de pas mal de bugs, graphique corrigé (la case "accepted energy" n'apparait pas lorsqu'elle ne sert à rien, les protéines sont mieux centrées) et une version Mac Intel sortie pour l'occasion =D
Titre: Rosetta@home
Posté par: arnaud25 le 09 juin 2006 à 19:51
Salut, :hello:
Je suis sous Linux et je récupère environ 13 crédits pour 10.000 secondes de travail avec le client 5.4.9
Or certains utilisateurs ont 50 points pour environ 10.000 secondes de travail sous Windows avec le client 5.5.0
Y-a-t-il un moyen de booster un peu mes crédits sous Rosetta: J'ai essayé le client Trux mais finalement ça ne change rien...(c'est même pire et les benchmarks sont identiques au client 5.4.9) ?
Merci
Titre: Rosetta@home
Posté par: BlackStar95 le 09 juin 2006 à 21:58
tu peux utiliser un client de BOINC de Crunch3r ou utiliser BOINCstudio fais par docmaboul
Titre: Rosetta@home
Posté par: arnaud25 le 09 juin 2006 à 22:10
Ca change rien, puisque les benchmarks sont les mêmes avec ces deux clients que sur le client officiel et les crédits obtenus sur Rosetta sont directement proportionnels aux benchs puisqu'il le quorum est de 1.
De plus, le client de DocMaboul est super mal documenté: impossible de créer le bs_opts.xml à la main et de passer les options voulues. (en tout cas, je n'ai pas vu de tuto l'expliquant)  :o
Titre: Rosetta@home
Posté par: shann le 10 juin 2006 à 09:07
Si je me souviens, si tu active la correction de crédits avec BoincStudio pour Rosetta, ton claimed crédit va être plus élevé mais cela ressemble à de la triche
Titre: Rosetta@home
Posté par: arnaud25 le 10 juin 2006 à 09:14
Mouais, bon je laisse tomber Rosetta: 2x58 points pour 24h de travail avec le client Trux, ils déconnent carrement là... :o (alors que j'ai un RAC de 350)
Pour le Boinc Studio, il n'y a pas de GUI sous Linux, et je ne sais pas comment créer le bs_opts.xml à la main: tuto inexistant-> Donc Boinc Studio in ze poubelle.
Bon je reviens sur CPDN, au moins on est crédité honnêtement.
Merci quand même pour vos suggestions  :hello:
Titre: Rosetta@home
Posté par: popolito le 10 juin 2006 à 09:38
CPDN est surcrédité ;)
En revanche, c'est bizarre que tes bench soient les mêmes avec le BOINC de Crunch3r... Lorsque j'effectuais les tests de puissances, j'avais une machine de guerre =D
Personnellement, sur mon athlon xp 2200+, j'avais un peu plus de 25 crédits pour 3h avec BOINC 5.4.9.
Surtout, poste ton problème sur le forum de rosetta, ils sont sympas et très proches des crunchers, c'est sûrement un bug (ils ont l'air de faire des maintenances sur les serveurs), faut leur signaler.
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_index.php
Titre: Rosetta@home
Posté par: arnaud25 le 10 juin 2006 à 22:05
Citation de: shann
Si je me souviens, si tu active la correction de crédits avec BoincStudio pour Rosetta, ton claimed crédit va être plus élevé mais cela ressemble à de la triche

Non, selon mon expérience c'est le contraire: la correction de crédit est justement faite pour aligner le claimed credit sur les clients officiels lorsqu'on utilise une appli optimisée (Rosetta n'est pas optimisée mais c'est pareil: le crédit est corrigé à la baisse sur le client Crunch3r, j'en ai fais l'amère expérience avec mes 2x58 points en 24h  sur mon P4 3GHz :lol: )
Ne pas l'activer augmente les claimed crédits.
Titre: Rosetta@home
Posté par: dufutur le 11 juin 2006 à 08:48
Bonjour à tous, pour l'instant aucun problèmes pour Rosetta@home avec mon boinc 5.4.9. Je travaille sur 3 projets et le boinc les à proportionnellements répartis en 33,33% pour chaque projet et cela passe d'un projet à l'autre toutes les 60 minutes. Par contre, quelqu'un peut-il me dire pourquoi sur Rossetta@home le crédit moyen est supérieur au crédit total. Ayant commencé ce projet le 09/06/06 et aprés avoir rendu 2 résultats je me retrouve avec un Total Utilisateur de 8,38 et une moyenne de 13,77  Merci...
Titre: Rosetta@home
Posté par: BlackStar95 le 11 juin 2006 à 12:51
Citer
Ne pas l'activer augmente les claimed crédits.

c'est faux! je m'explique :
boinc calcul le claimed crédit par rapport au temp mis et aux benchmarks.
Si tu as un client optimisé tu admettons calculer les Wus 2x plus vite. Tu auras donc 2x moins de claimed crédit puisque tes benchmark seront idenriques mais avec un temp de calcul 2x moindre.Donc la correction de crédit sert à augmenter le Claimed crédit pour annuler cette déficience à cause de ton temps de calcul.
Le client de crunch3r optimisé pour ton pentuim augmente tes Benchmarks mais comme tu fais toujours tes calcul avec la même vitesse , tu as 2x mois de claimed crédit !!! il ne faut utiliser la correction de crédit qu'avec les clients optimisés dd'Einstein, Seti, Sztaki ,... sinon tu as l'effet inverse
ex :
une machine 2x plus puissante que la tienne calculeras 2x plus vite mais auras un claimed crédit correct.
toi tu as une machine 2x moins puissante mais tes benchmark sont identiques a la 1ère machine . probléme : toi  tu ne calcule pas les unités 2x plus vite  :(  donc ton claimed crédit est divisé par 2  :(  
Titre: Rosetta@home
Posté par: dufutur le 11 juin 2006 à 13:42
Merci beaucoup à toi Nicodu95, car tu es toujours là pour moi et me donner des réponses.  Là, ta réponse est trés technique pour moi, et je ne saisi pas encore la signification de certains mots. Ne sachant pas comment transmettre les images dans mon message, voilà les résultats sur mon Boinc:                                                                            rosetta@home Travail effectué 8,38 Travail moyen 13,77                  Einstein@Home Travail effectué 1604,34 Travail moyen 30,04             SETI@home     Travail effectué     52,87 Travail moyen   0,59             Pour terminer lorsque le travail passe sur rosseta@home, (Application rosseta 5.22), le Temps restant augmente en même temps que le Temps de Travail, mais augmente moins vite. J'en suis rendu à 64,142% d'Avancement et ce n'est que ce midi que le temps de travail à réussi à dépasser le temps restant( qui, celui-ci, je l'indique continu à augmenter). Actuellement pour rossetta@home, voici ce que j'ai d'affiché dans le Boinc: Application 5.22 ;Temps de travail 02:42:25 ; Avancement 64,142% ;Temps restant 02:36:53 .                         Merci pour là, ou les réponses qui pourront m'aider, ou mieux me faire comprendre ce qui ce passe.......
Titre: Rosetta@home
Posté par: arnaud25 le 11 juin 2006 à 13:52
Citation de: nicodu95
Citer
Ne pas l'activer augmente les claimed crédits.

c'est faux! je m'explique :
boinc calcul le claimed crédit par rapport au temp mis et aux benchmarks.
Si tu as un client optimisé tu admettons calculer les Wus 2x plus vite. Tu auras donc 2x moins de claimed crédit puisque tes benchmark seront idenriques mais avec un temp de calcul 2x moindre.Donc la correction de crédit sert à augmenter le Claimed crédit pour annuler cette déficience à cause de ton temps de calcul.
Le client de crunch3r optimisé pour ton pentuim augmente tes Benchmarks mais comme tu fais toujours tes calcul avec la même vitesse , tu as 2x mois de claimed crédit !!! il ne faut utiliser la correction de crédit qu'avec les clients optimisés dd'Einstein, Seti, Sztaki ,... sinon tu as l'effet inverse
ex :
une machine 2x plus puissante que la tienne calculeras 2x plus vite mais auras un claimed crédit correct.
toi tu as une machine 2x moins puissante mais tes benchmark sont identiques a la 1ère machine . probléme : toi  tu ne calcule pas les unités 2x plus vite  :(  donc ton claimed crédit est divisé par 2  :(

J'ai écris: Selon mon expérience....: Je parlais juste pour moi.
Non mes benchs sont identiques avec Crunch3r ou le client officiel (je l'ai déjà dis 2 fois, mais bon...).
Ca vient peut-être du fait que je suis sous Linux.
De plus, sur Rosetta j'ai regardé le Celeron de Shann (une machine 2 ghz comme mon Pentium 2ghz): il obtient 3x plus de crédits que moi pour le même temps de travail et les même Benchmarks. Comment tu expliques ça ?( à moins qu'il ait overclocké son Celeron à mort pour faire chauffage central :D , je ne pense pas qu'il soit 3x plus rapide que mon Pentium)
(J'avoue que j'y comprends pas grand chose, c'est possible que je dise n'importe quoi concernant les clients optimisés et les corrections de crédits: ce serait bien de faire un tuto :p ).

De toute façon pour moi le problème est clos: J'ai finalement décidé de continuer Rosetta parce que je pense que c'est un projet utile scientifiquement, et je m'assois sur les crédits (de toute façon, on peut rien acheter avec :lol: )
Titre: Rosetta@home
Posté par: dufutur le 11 juin 2006 à 15:57
Arnaud tu as tout à fait raison, et moi je suis fier de pouvoir utiliser bénévolement mon ordinateur et le Boinc sur le projet Rosetta, qui j'espère vas permettre de trouver les protèines contre ces maladies encore mortelle, et permettre de sauver biens des vies et d'éviter bien des souffrances. Je suis de plus, trés impliqué... en effet:                  1)J'ai moi même été victime en 1999 d'un CANCER pour lequel j'ai survécu.                                                                                    2)J'ai été employé de bureau dans une grande entreprise de l'état, ou j'avais un collègue ayant la maladie de PARKINSON et j'ai été témoin de ces nombreuses crises.                                                                 3) J'ai eu pendant quelques temps une petite amie avec une SCLEROSE EN PLAQUE ( obligée chaque jour de se faire une piqure dans le ventre)   4) J'ai vu aussi, petit à petit, mon grand-père et une voisine perdre la mèmoire suite à la maladie d'EINZEIMER et finir par en mourir. Donc je connais ces maladies de prés, et il est grand temps que l'on en viennent à bout......  Je dois dire que j'ai longtemps hésitez à participer au projet Rosetta@home, car je pensé qu'il avait un rapport avec la mission Rosetta effectué par les E-U en allant bombarder une comète(projet dangereux et inconcient que j'ai toujours contesté).. Je regrette trés sincèrement de ne pas avoir commencé en premier le projet Rosetta@home (3mois de perdu).....
Titre: Rosetta@home
Posté par: shann le 11 juin 2006 à 18:41
Citer
De plus, sur Rosetta j'ai regardé le Celeron de Shann (une machine 2 ghz comme mon Pentium 2ghz): il obtient 3x plus de crédits que moi pour le même temps de travail et les même Benchmarks. Comment tu expliques ça ?( à moins qu'il ait overclocké son Celeron à mort pour faire chauffage central :D , je ne pense pas qu'il soit 3x plus rapide que mon Pentium)

En fait, il est overclocké à 15 Ghz  :pt1cable: (je déconne!!)
Pour dire vrai, j'ai juste mis le BOINC de DocMaboul et activé la correction de crédits; Résultat mon claimed est beaucoup trop important.
Il faudrait que je retire la correction de crédits pour être honnète mais j'ai pas le temps entre les nouvelles version de Boinc, de BoincStudio, les clients optis qui sortent pour tous les projets, à la fin on n'arrive plus à suivre !!!.Promis je le fait dans la semaine  ;)
Titre: Rosetta@home
Posté par: BlackStar95 le 11 juin 2006 à 22:09
Citer
Non mes benchs sont identiques avec Crunch3r ou le client officiel (je l'ai déjà dis 2 fois, mais bon...).  

donc ça vient surement de linux  :fou:
Titre: Rosetta@home
Posté par: thomas le 11 juin 2006 à 23:14
A mort linux :o



 je me sauve ... :ange:   :d
Titre: Rosetta@home
Posté par: arnaud25 le 12 juin 2006 à 08:15
Méchant  :lol:
Le pingouin vaincra: (http://yelims1.free.fr/Animaux/Pingouin04.gif)
De toute façon, comment veux-tu jouer à l'uptime avec Win XP ?: Je suis forcé d'utiliser Linux  :D  
(http://img.uptime-project.net/img/5/90986.png)
Titre: Rosetta@home
Posté par: philmo le 12 juin 2006 à 09:38
+1 :P
(par contre j'ai pas compris pourquoi il ya des feuilles "bizarres" sur les bannières d'uptime... :whistle: )
Titre: Rosetta@home
Posté par: thomas le 12 juin 2006 à 09:45
Citation de: arnaud25
Méchant  :lol:
Le pingouin vaincra: http://yelims1.free.fr/Animaux/Pingouin04.gif
De toute façon, comment veux-tu jouer à l'uptime avec Win XP ?: Je suis forcé d'utiliser Linux  :D  
http://img.uptime-project.net/img/5/90986.png

qui ta dit que j'utilisais XP :p

2000 Power ! pis la machine que j'ai mit c'es mon serveur :)

malheureusement dans 15 jour, je déménage .. donc je vais tout perdre :(

mais je recommencerais :p
Titre: Rosetta@home
Posté par: power600 le 15 juin 2006 à 12:33
Citation de: arnaud25
Méchant  :lol:
Le pingouin vaincra: http://yelims1.free.fr/Animaux/Pingouin04.gif
De toute façon, comment veux-tu jouer à l'uptime avec Win XP ?: Je suis forcé d'utiliser Linux  :D  
http://img.uptime-project.net/img/5/90986.png

Qu'est ce que je fais? Je jarte ce vilain troll des montagnes pas beau à partir de mon PC sous XP qui affiche 3 petits mois d'uptime?  :o  :ange:

(d'ailleurs va falloir que je pense à faire les mises à jour  :o )
Titre: Rosetta@home
Posté par: arnaud25 le 15 juin 2006 à 13:23
Citation de: power600
Qu'est ce que je fais? Je jarte ce vilain troll des montagnes pas beau à partir de mon PC sous XP qui affiche 3 petits mois d'uptime?  :o  :ange:

Ooohhh! tout de suite on monte sur son grand chevôoO...Faut bien une exception à la règle  :o
Allez, un petit rebootage après les mises à jour et on laisse le troll gambader sur sa banquizzzz :D
Titre: Rosetta@home
Posté par: thomas le 15 juin 2006 à 13:30
moi, je vais devoir l'arrétté a cause du déménagement :'(

d'ailleur ça vas ralentir mon rac pour rosetta ça :(

1 semaine sans net :(

snif :(
Titre: Rosetta@home
Posté par: power600 le 15 juin 2006 à 20:39
Citation de: arnaud25
Ooohhh! tout de suite on monte sur son grand chevôoO...Faut bien une exception à la règle  :o
Allez, un petit rebootage après les mises à jour et on laisse le troll gambader sur sa banquizzzz :D

Linusque y marche pas comme y faut, y a même pas moyen de désactiver le lissage de polices[:nono]
Titre: Rosetta@home
Posté par: power600 le 15 juin 2006 à 20:39
 :ange:  :D  :D
Titre: Rosetta@home
Posté par: arnaud25 le 15 juin 2006 à 21:56
Citation de: power600
Linusque y marche pas comme y faut, y a même pas moyen de désactiver le lissage de polices[:nono]

Rhhhooo, comme c'est bas, ça :o
Dans le Control Center KDE->Apparence->Polices->Lisser les polices de caractères :p (avec la petite croix, là, qu'il faut décocher, telle la flèche de Cupidon). :D
Linusk il lisse la police, si je veux  :kaola:
Titre: Rosetta@home
Posté par: arnaud25 le 15 juin 2006 à 22:05
Faudrait qu'un modo split ce thread car ça n'a plus rien avoir avec Rosetta là :lol:
@+
Titre: Rosetta@home
Posté par: thomas le 16 juin 2006 à 08:44
j'ai eu une erreur rosetta hiere ... instruction je c plus quoi ... c'es la premiere fois que je la voie .. je notterais le code si elle revient ..
Titre: Rosetta@home
Posté par: mamouth le 16 juin 2006 à 08:49
il faut pas se tracasser il y a un nombre d'erreurs assez important sur rosetta
mais je crois que les WU qui plantent sont quand même créditées
Titre: Rosetta@home
Posté par: Jacquominot le 28 juin 2006 à 21:18
ca depend des cas ce que tu dis mamouth, des fois oui des fois non et generalement ca n'est qu'une petite partie des claimed credit que tu recup.
Moi je suis toujours a la rue avec le meme pc je suis passé de 400 a 250 en rac c la fete et je perd des places tous les jours ........
enfin bon c la vie qui veut ca lol
Titre: Rosetta@home
Posté par: arnaud25 le 30 juin 2006 à 20:12
Salut,  :hello:
Probablement en Août, il y aura un "screensaver" Rosetta pour Linux (qui n'en a pas actuellement).
Ce sera testé sur Ralph, dans un premier temps.
Titre: Rosetta@home
Posté par: arnaud25 le 07 juillet 2006 à 10:28
Un article de David Baker, Proteins by Design (http://boinc.bakerlab.org/rosetta/rah_articles/Proteins_by_Design.pdf) fait la couverture du magazine The Scientist (http://www.the-scientist.com/) de ce mois-ci.
Titre: Rosetta@home
Posté par: Heyoka le 07 juillet 2006 à 11:15
C'est une très bonne nouvelle ça Arnaud, on peut espérer que les magazines scientifiques francophones vont commencer à s'intéresser à Rosetta voire plus largement à Boinc et à tout les projets proposés.
Titre: Rosetta@home
Posté par: thomas le 07 juillet 2006 à 11:28
ce serais bien, un peu de pub ne fais jamais de mal :)
Titre: Rosetta@home
Posté par: arnaud25 le 18 juillet 2006 à 20:51
Comment voir votre prédiction:
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/rah_view_predictions.php
Titre: Rosetta@home
Posté par: arnaud25 le 14 août 2006 à 16:18
Citer
Predictor of the day: Congratulations to [AF>HFR>Corsica] DocMaboul (Team L'Alliance Francophone) for predicting the lowest energy structure for workunit t335__CASP7_ABRELAX_SAVE_ALL_OUT_nohistag_hom001__778_0.clean.sc !
 :sol:  
Titre: Rosetta@home
Posté par: arnaud25 le 16 août 2006 à 09:12
Un nouveau système de crédit à partir d'aujourd'hui (ils ne sont plus basés sur les benchmarks de Boinc)
http://ralph.bakerlab.org/forum_thread.php?id=233
Titre: Rosetta@home
Posté par: Heyoka le 19 août 2006 à 23:18
ça a fighté sur le message board de Rosetta.

Il y a des membres de certaines équipes en sont presque venus aux insultes, tout ça parsque Rosetta a mis en place le nouveau systeme de crédit qui évite la triche.

http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=2143

J'ais pas eu le temps de tout lire mais apparement c'est certains membres de la team xtremesystems qui foutent la merde
http://www.xtremesystems.org/forums/showthread.php?t=112106&highlight=baker

Certains d'entre eux sont partie vers d'autres projets qui ont encore l'ancien systeme de crédit et dont les unités sont calculés que par une personne, QMC par exemple.

David Baker est même venus en personne leur répondre sur le forum de leur team
http://www.xtremesystems.org/forums/showthread.php?t=112106&page=2&highlight=baker
http://www.xtremesystems.org/forums/showthread.php?t=112049&highlight=baker
Titre: Rosetta@home
Posté par: BlackStar95 le 19 août 2006 à 23:39
donc ils s'avouent eux même tricheurx non ??
Titre: Rosetta@home
Posté par: Heyoka le 19 août 2006 à 23:45
Non, en fait je me suis trompé c'est d'autres personnes qui ont traité de tricheur certains membres de la xtremesystems, parsqu'ils utilisaient la correction de crédit des BOINC optimisés pour rapporter plus de crédits sur Rosetta.
Ces personnes l'ont mal pris, et vont allez sur QMC, bizarrement un des seuls projets qui a gardé l'ancien systeme de crédit et  qui n'envoye les unités qu'à une seule personne.

C'est suite à tout ça que D. Baker a écrit

Citer
we will NOT be backdating credit totals


Je sais pas trop ce que ça veut dire, il ne va pas postdater le crédit total. Peut être qu'avant il avait décidé de corriger les crédits dejà accumulés des "tricheurs", c'est à dire ceux qui utilisent la correction de crédit des Boinc optimisé initiallement pour Seti et Einstein.


edit : J'essaye un peu de comprendre le truc, mais c'est pas facile, il y a eu des tonnes de messages sur ça sur différents forums.
Et les messages qui ont posés problèmes sur le message board de Rosetta (insultes et autres prises de tête) ont été supprimé par D. Baker et le deuxième modérateur du forum, pour calmer un peu tout le monde.
Comme D. Baker l'a dit sur un post il est biochimiste, mais il est pas sociologue des questions relatives au crédit distribué par le calcul distribué. Et qu'il ne savait pas que changer le systeme de crédit allez poser autant de problèmes et de rivalités
C'est quand même un peu limite de faire perdre son temps comme ça à D. Baker, il a des tonnes de recherches à mener pour faire avancer la science. bref les équipes qui ont fait ça ne devrait pas être fier d'eux.
Titre: Rosetta@home
Posté par: Heyoka le 20 août 2006 à 00:02
Voilà les conditions que Movieman de xtremesystems pose pour qu'il décide de revenir sur le projet
http://www.xtremesystems.org/forums/showpost.php?p=1661580&postcount=8

Notament :
Il veut interdire de poster sur le message board de Rosetta tout ceux qui ont moins de 250 de Rac

D'autres messages de movieman alias XS_Vietnam_Soldiers
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_user_posts.php?userid=49316
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=2076
Titre: Rosetta@home
Posté par: arnaud25 le 20 août 2006 à 10:06
Citation de: Heyoka

Notament :
Il veut interdire de poster sur le message board de Rosetta tout ceux qui ont moins de 250 de Rac

Ya vraiment des tarés sur Terre......  :pt1cable: :lol: C'est la majorité des utilisateurs qui ont moins de 250 de Rac.......
En plus, il est très bien ce nouveau système: mon crédit à doublé :love:
Titre: Rosetta@home
Posté par: Heyoka le 20 août 2006 à 11:46
Moi je vais me mettre à Rosetta quelque temps, pour soutenir David Baker qui s'investie beaucoup dans ce qu'il fait, il vient même sur les forums des équipes pour s'expliquer, et qu'est ce qu'il obtient, des gens qu'ils le traitent de moins que rien sur le forum des xtremesystems.
ça serait dommage qu'il perde tout son travail juste à cause d'un histoire de corrections des crédits
En plus avec le nouveau systeme les gens qui ne "trichent" pas reçoivent un peu plus de crédits.


D'ailleurs ce XS_Vietnam_Soldiers avait un Rac de 15.000 avant le changement de crédit, or avec les corrections de crédits il demandait près de 3 fois trop de crédits
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/results.php?hostid=200590&offset=20
Donc en fait son Rac réel n'est que de 5.000.
Donc c'est pas quelqu'un d'indispensable et c'est pas ce genre de ploucs qui vont faire la loi en imposant leurs conditions pour leur retour.
Il suffit de 25 personnes à 200 de Rac pour compenser son départ

J'ais pas trop cherché mais ça doit être aussi le cas d'autres membres de la xtremesystems
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/team_display.php?teamid=727

WindForce
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/results.php?hostid=161279&offset=20

XS_team_germany
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/results.php?hostid=196435&offset=20

RAMMIE
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/results.php?hostid=260921

A novice1
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/results.php?hostid=202305&offset=100

...

Il y en a aussi pas mal qui cachent leurs résultats
Titre: Rosetta@home
Posté par: bichou le 20 août 2006 à 11:47
Citation de: arnaud25
Ya vraiment des tarés sur Terre......  :pt1cable: :lol: C'est la majorité des utilisateurs qui ont moins de 250 de Rac.......
En plus, il est très bien ce nouveau système: mon crédit à doublé :love:


250 de RAC, monsieur est un poil élitiste  :o ...
Pourquoi ne pas autorisé seulement les donateurs à poster... mais bon dans sa grande bonté , il épargne la rubrique "café" du forum pour les petits RACiens  :o
Titre: Rosetta@home
Posté par: Nightbird le 20 août 2006 à 13:10
Citation de: Heyoka
Moi je vais me mettre à Rosetta quelque temps, pour soutenir David Baker qui s'investie beaucoup dans ce qu'il fait, il vient même sur les forums des équipes pour s'expliquer, et qu'est ce qu'il obtient, des gens qu'ils le traitent de moins que rien sur le forum des xtremesystems.
ça serait dommage qu'il perde tout son travail juste à cause d'un histoire de corrections des crédits
En plus avec le nouveau systeme les gens qui ne "trichent" pas reçoivent un peu plus de crédits.


D'ailleurs ce XS_Vietnam_Soldiers avait un Rac de 15.000 avant le changement de crédit, or avec les corrections de crédits il demandait près de 3 fois trop de crédits
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/results.php?hostid=200590&offset=20
Donc en fait son Rac réel n'est que de 5.000.
Donc c'est pas quelqu'un d'indispensable et c'est pas ce genre de ploucs qui vont faire la loi en imposant leurs conditions pour leur retour.
Il suffit de 25 personnes à 200 de Rac pour compenser son départ

J'ais pas trop cherché mais ça doit être aussi le cas d'autres membres de la xtremesystems
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/team_display.php?teamid=727

WindForce
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/results.php?hostid=161279&offset=20

XS_team_germany
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/results.php?hostid=196435&offset=20

RAMMIE
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/results.php?hostid=260921

A novice1
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/results.php?hostid=202305&offset=100

...

Il y en a aussi pas mal qui cachent leurs résultats

Soyons clair, D.B récolte ce qu'il a semé.
Des wus mais à quel prix !
Durant plusieurs mois, le projet est devenu le plus champ d'expérimentation de la triche sans oublier les crédits "overclaimed" (sans faire plus de travail qu"un client classique) grâce à l'utilisation de clients non officels mais bien connus et ce en toute connaissance de cause.
Cette "histoire de corrections des crédits" est l'un des noeuds des différents flame wars vus sur Rosetta ces derniers temps lorsque certains ont demandé "quand Rosetta arrêtera t'il les tricheurs" ?
La grande erreur de Rosetta fut de ne pas gérer d'une façon équitable pour tous les crédits et ce dès le début du Casp7.
Piètre excuse que de dire nous ne sommes que des scientifiques.
Piètre excuse que de tirer sur Boinc en disant que c'est sa faute puisqu'il est open source.
Piètre excuse que de dire que le projet n'a pas désapprouvé l'utilisation des clients non officiels.
Titre: Rosetta@home
Posté par: Heyoka le 20 août 2006 à 13:53
Oui, Nightbird
Sauf que maintenant le syteme de crédit a été changé sur Rosetta et il vaut mieux encourager les projets qui prennent le risque de le faire quitte à se prendre quelques insultes sur la tronche de la part de ceux qui trichent.
Si les autres projets voient que pénaliser les tricheurs entraine une baisse de la puissance sur le projet, ils ne vont jamais entreprendre un changement des crédits.
Pour l'instant les seuls projets qui ont fait ce changement sont Seti, Einstein et Rosetta.
On peut au moins leur reconnaitre celà

Tout les autres projets n'ont encore rien fait. Biensur pour la plupart, les unités sont calculés par 2 ou 3 personnes, ce qui diminue un peu les effets de la triche, mais ces effets sont quand même toujours présent. Biensur là les crédit des tricheurs ne sont pas multipliés par 300% ou 400% comme c'était le cas sur Rosetta, mais quand même proche de 50%, notament sur les petits projets.

Par contre il y a encore des projets comme QMC ou Xtremlab ou les unités ne sont calculés que par 1 personne avec l'ancien systeme de crédit
Sur Xtremlab, il y a de gros doutes sur l'équipe BOINC@Hull
http://fr.boincstats.com/stats/team_stats.php?pr=xtrem&st=0
Surtout que la plupart des membres de cette équipe ont caché leurs résultats (Computers   hidden)

D'ailleurs c'est pas pour rien que les personnes de XtremeSystems qui partent de Rosetta décident de partir vers QMC, qui va être le nouveau repère des tricheurs.
http://fr.boincstats.com/stats/team_stats.php?pr=qmc&st=0
Titre: Rosetta@home
Posté par: Nightbird le 20 août 2006 à 15:01
Lorsqu'un projet qui se prétend majeur ou est reconnu comme tel adopte un tel mode de fonctionnement, je lui retire la crédibilité.
J'ai arrêté Rosetta, nouveau système ou pas.
Etant aussi d'après leur échelle un petit cruncher "a little guy", comme l'a dit D. B sur un certain forum, je doute fort que je leur manque par ailleurs.
La communication d'accord, des serveurs qui tournent ok ... mais un peu d'éthique ne leur ferait pas de mal...

Quant à QMC, rien d'étonnant que les gars d'XS y aillent, le quorum est de 1 et les crédits "underclaimed" sont acceptés et crédités dans la limite de 1000 et maintenant 2000 points.
J'ai arrêté ce projet depuis quelque temps déjà.

edit : XtremLabs
Jamais fait tourner même s'ils avaient fait qqch pour Win9x et pour la simple raison qu'il ne m'intéresse pas, français ou pas rien à cirer.
S'il y des possibilités de triche, je présume qu'il est aisé pour n'importe quel admin. de faire des requêtes sur la db
Titre: Rosetta@home
Posté par: mamouth le 20 août 2006 à 16:10
Moi aussi je relance rosetta chez moi pour soutenir D. Barker

il le mérite bien
Titre: Rosetta@home
Posté par: Heyoka le 20 août 2006 à 17:31
Nightbird, pourrais-tu écrire plus souvent sur ce forum pour nous faire partager toutes tes connaissances sur les projets Boinc. On est vraiment orphelin sans tes infos et tes analyses avisés sur Boinc et ses projets (http://forum-images.hardware.fr/images/perso/violette.gif)
En plus au contraire de moi tu arrive à comprendre très facilement l'anglais (http://forum-images.hardware.fr/images/perso/klem3i1.gif)
Titre: Rosetta@home
Posté par: Heyoka le 22 août 2006 à 20:08
Quelqu'un arrive t'il à comprendre comment fonctionnera le prochain systeme de crédit :
C'est la partie du milieu non traduite

Citer
J'ai présenté le site Web de Rosetta@home, y compris le forum, à la réunion sur les grilles de calcul de ce matin -- Je pense que c'est la partie de mon exposé que l'auditoir a le mieux compris. Si des personnes sont intéressés, toutes les interventions qui ont eu lieu durant cette réunion seront reportées sur le Web.

Je travaille ce soir avec mon ancien étudiant Rich Bonneau sur un dossier relatif aux résultats de la HPF1 de World Community Grid . Nous avons prédits les structures de toutes les protéines prévues dont une parmis les mieux étudiés est celle d'un organisme eukaryotique--la levure qui fait lever le pain et la bière, nous avons comparé toutes ces prévisions avec d'autres données expérimentales pour ranger ces 500 structures de protéines inconnues dans une famille de structure de protéine. Une fois que ceci sera fait, nous commencerons à travailler sur le rapport relatif aux structures des protéines humaines également obtenues à l'aide de la HPF1. Pour ce travail, la version de rosetta basse résolution avait été employée (c'était la seule chose que nous avions quand le projet HPF a été lancé il y a plusieurs années) ; Naturellement, je suis enthousiaste au sujet de la HPF2 qui emploie le protocole qui avait été amélioré sur rosetta@home (j'ai envoyé à Rich et à ses collaborateurs d'IBM le code du mois de mars de cette année). Le projet devrait alors produire des modèles beaucoup plus précis.



Citer
On the credits front: we have decided to use the average amount of time for producing a structure over all rosetta@home runs for a particular work unit to determine the amount of credit to be awarded for each structure produced for that work unit. so, for example, let us suppose that all rosetta@home computers on average took 1 hour to make 1 structure for a given work unit, and that this corresponds on average to 10 credits using the standard boinc accounting scheme. Then each computer gets 10 credits for each structure returned--a fast computer might be able to do 3 structures in an hour, and get 30 credits per hour, wheras my old slow laptop may require 2 hours to make a single structure so I would only get 5 credits per hour. I think everybody will be happy with this approach in the end, even though nobody may be very happy with it initially (I must emphasize that, contrary to some statements on the boards, no individuals or groups had any more influence on our strategy than any other, so I hope this issue can be laid to rest). I am sorry that the switch to the new system has generated so much conflict, I really didn't anticipate this, and I'm sorry that my attempts to calm things down only made things worse (again, I will post from now on only in this thread and only in this forum). In any event, we are quite set on the new credits plan, which we think will be better for everybody, and please hold off on comments or suggestions for two weeks or so until we all have a clear picture of how things are working--we do not need or want new suggestions at this point. David Kim will be posting the definitive description of the new system tomorrow on the boards.


Citer


Un des résultats positifs des dernières discussions animées est que nous avons recruté un certain nombre de nouveaux modérateurs volontaires qui vous seront présentés bientôt et qui s'assureront que les discutions restent courtoises (aidez svp le projet en évitant de poster des choses qui sont suceptibles d'offenser d'autres participants !). En outre, comme j'ais passé beaucoup de temps à taper sur mon clavier pour correspondre avec des participants par email (ce qui pourrait facilement se transformer en métier à temps plein !), à partir de ce soir si vous avez des questions ,contactez svp les modérateurs par l'intermédiaire du forum ou de l'email et ils me transmettront les questions pour lesquelles ils ne peuvent pas répondre.

OK-- c'est tout pour ce message, mes posts seront de retour dès demain sur la voie de nouvelles découvertes scientifique !
Titre: Rosetta@home
Posté par: arnaud25 le 22 août 2006 à 21:36
C'est un crédit basé sur le temps pour calculer une structure (il me semble que les structures sont les "decoys" que l'on voit dans les pages de résultats, mais je ne suis pas sur: à vérifier).
Donc si t'as un ordi rapide-> structures calculées rapidement-> pleins de crédits
Si t'as un ordi lent->structure calculée lentement-> peu de crédits
Les crédits ne sont plus réclamés par les clients dont les benchmarks sont fantaisistes mais en fonction du travail effectué sur le calcul des structures, le crédit octroyé pour une structure étant apparemment basé sur une moyenne (let us suppose that all rosetta@home computers on average took 1 hour to make 1 structure for a given work unit), par contre, j'ai pas trop compris comment il calcule la moyenne..(edit: apparemment ils prennent une unité, font la moyenne du temps pris pour calculer une structure par tous les utilisateurs de cette unité, et fixe le crédit en fonction de cette moyenne)

M'enfin, c'est ce que je comprends pour l'instant, je dis pas que mon explication est juste ;)
Titre: Rosetta@home
Posté par: arnaud25 le 25 août 2006 à 19:33
The new credit system explained (http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=2194)
Titre: Rosetta@home
Posté par: arnaud25 le 28 septembre 2006 à 10:54
Baker Lab Video (http://www.lauralynngonzalez.com/things/rosettateam/bakerSmall.mpg)
Titre: Rosetta@home
Posté par: Heyoka le 28 septembre 2006 à 16:10
J'ais mis l'info sur Boinc-af : http://www.boinc-af.org/  :)
Titre: Rosetta@home
Posté par: Heyoka le 07 octobre 2006 à 13:43
Les modélisations sont de plus en plus précise.

Voici par exemple une capture d'écran de l'écran de veille, de la fenetre Searching_all_atoms.
C'est l'application rosetta_beta 5.29, et une unité BOINC_ABRELAX_SAVE_ALL_OUT
On voit plein de petites ramifications, je crois que c'était pas le cas avant

(http://archettes.chez-alice.fr/Ralph.jpg)
Titre: Rosetta@home
Posté par: thomas le 09 octobre 2006 à 15:16
Citation de: Heyoka
Les modélisations sont de plus en plus précise.

Voici par exemple une capture d'écran de l'écran de veille, de la fenetre Searching_all_atoms.
C'est l'application rosetta_beta 5.29, et une unité BOINC_ABRELAX_SAVE_ALL_OUT
On voit plein de petites ramifications, je crois que c'était pas le cas avant

http://archettes.chez-alice.fr/Ralph.jpg



heuuu ça peu paraitre con ...

Mais ça sert a quoi ? :d

Bon moi j'utilise jamais les écran de veille.. mon pc n'es jamais en veille ...

Pas tapai :o
Titre: Rosetta@home
Posté par: MarcP le 09 octobre 2006 à 16:35
Pendant la pause café ou pendant que t'es au tel, ca fait un truc joli à regarder :D
Titre: Rosetta@home
Posté par: Douglas Riper le 09 octobre 2006 à 16:54
Ca me rappel les deco en image "fractal"
C'est joli des fois :D
Titre: Rosetta@home
Posté par: Heyoka le 09 octobre 2006 à 18:22
Hier, j'avais une protéine avec plein de ramifications et très complexe, dommage j'ais oublié de la prendre en photo :o
Titre: Rosetta@home
Posté par: Heyoka le 11 octobre 2006 à 14:47
Tout les résultats de l'Alliance Francophone (http://boinc.bakerlab.org/rosetta/rah_results.php?TeamID=30&OrderBy=5)

C'est vraiment pas mal comme nouvelle fonctionnalité

On peut même se faire un concours inter team de celui qui trouve le meilleurs score.
Titre: Rosetta@home
Posté par: popolito le 12 octobre 2006 à 07:10
Tiens, je viens de recevoir une wu PSH_ (lutte contre le sida).
:)
Titre: Rosetta@home
Posté par: Heyoka le 12 octobre 2006 à 12:58
Moi sur Ralph, c'est des DOC_ : amarrage protéine-protéine
Une protéine en bleu et une en rouge
Titre: Rosetta@home
Posté par: Heyoka le 01 novembre 2006 à 13:33
Citer
We are actively considering now several different approaches for building interactivity into rosetta@home which I think will be tremendously exciting. In the simplest scenario, you will be able to propose moves to the computer to try out, for example rotating around a bond you select. In the current version, running on your computers, the computer selects moves at random, and then accepts those moves which reduce the energy. In the interactive version, whenever you have an idea, the computer will try out your move instead of picking randomly. This will let those of you who are interested to become actively involved in the searches, which should be more fun than watching the screensaver, and I'll bet there are some protein folding geniuses out there who will be able to work wonders! We are also thinking of having the 5-10 best models found thus far, and the names of the finders, in a panel on the screen that if you want you can start from and try to improve.


Il va y avoir encore une augmentation de l'interactivité, avec une participation plus active des gens aux recherches.
Pour libérer le génie du pliage de protéine qui sommeille en vous.

Apparement à partir de l'écran de veille on pourra proposer des mouvements (actuellement les mouvements sont choisis au hasard par l'ordinateur, qui ensuite accepte les mouvements qui ont l'énergie la plus basse).
Dans la version interactive, à chaque fois que vous aurez une idée, vous pourrez influer sur le cours des choses en provoquant des rotations autour de points avec la souris pour rapprocher la structure calculée à la structure de la protéine "native", l'ordinateur va tester le mouvement issu de votre idée et l'accepter si l'énergie pour effectuer ce changement est le plus bas.
Comme ça, ceux qui sont interessés pourront participer activement aux recherches, et ça devrait être plus amusant que de simplement regarder l'écran de veille.
Au final les calculs sont toujours basés la plus grosse partis du temps sur le hasard, mais par moment l'utilisateur pourra guider le hasard soit par un présentiment, soit sur des bases scientifiques pour quelqu'un qui s'y connait un peu.

Il y aura un classement des 5 à 10 meilleurs modèles, et le nom des découvreurs.
Titre: Rosetta@home
Posté par: popolito le 01 novembre 2006 à 13:37
C'est génial.
Ils sont très forts quand même sur rosetta@home (Baker a pas mal d'idées et essaie de les mettre en oeuvre).
En revanche, une chose moins géniale : la dernière application bouffe énormément de mémoire (j'ai été obligé de viré rosetta :()
Titre: Rosetta@home
Posté par: Heyoka le 01 novembre 2006 à 13:41
Citation de: popolito
C'est génial.
Ils sont très forts quand même sur rosetta@home (Baker a pas mal d'idées et essaie de les mettre en oeuvre).
En revanche, une chose moins géniale : la dernière application bouffe énormément de mémoire (j'ai été obligé de viré rosetta :()


Je pense que ça devrait plaire à pas mal de monde du forum Futura Science, surtout qu'il y a pas mal de membres du forum Futura qui ont de grosses connaissances scientifiques :)
Le jour ou ça sera mis en place ça mériterait presque une news sur Futura :D

Mais ce n'est encore qu'un projet, il y aura surement pas mal de difficultés pour mettre ça en oeuvre, les premières unités seront très certainement testées sur Ralph dans quelques mois.
Maintenant on sait pourquoi ils ont décidés de détailler les plus possible la structure des protéines sur les écrans de veille, avec toutes les petites ramifications, c'était dans l'optique de faire participer les boinceurs plus activement.
Au final ça bouffe plus de ram, mais si ils arrivent à mettre ça en place la recherche avancera beaucoup plus vite.

C'est comme quand on cherche son chemin, on arrive à un croissement mieux vaut choisir le chemin qu'on va prendre en se basant sur ce qu'on observe autour de nous, plutot que de choisir au hasard le chemin à prendre.
Titre: Rosetta@home
Posté par: popolito le 06 janvier 2007 à 11:43
L'AF vient de passer 14ème sur ce projet
http://www.boincsynergy.com/stats/teams.php?project=rah
Titre: Rosetta@home
Posté par: pas93 le 06 janvier 2007 à 14:08
On monte :bounce:  :bounce:
Titre: Rosetta@home
Posté par: ordralfabetix le 06 janvier 2007 à 14:12
Je sens que je vais jouer les trouble-fêtes.
L'université du wisconsin va nous griller d'ici un mois... :sweat:  :sweat:
Titre: Rosetta@home
Posté par: Heyoka le 06 janvier 2007 à 14:43
Oui mais c'est pas grave, puisque cette année on devrait passer Housing and Food Services, SETI.USA, Team MacNN, et US-Distributed.
Et c'est pas sur que l'Université du wisconsin nous dépasse puisqu'ils viennent calculer sur Rosetta que quand Einstein est en rade :
(http://fr.boincstats.com/charts/chart_fr_rosetta_object_new_teams_2103.gif)
Titre: Rosetta@home
Posté par: ordralfabetix le 07 janvier 2007 à 19:16
Tu as raison bolchoï,mais moi j'ai tendance à voir le verre à moitié vide. :sarcastic:
Et puis,il ne faut pas se reposer sur nos lauriers.

 :hello:
Titre: Rosetta@home
Posté par: mamouth le 07 janvier 2007 à 21:05
en + pas de quoi  être fier d'une 14ième place  :s

on est un peu à la traine sur ce projet super intéressant
qui en plus donne des résultats semble t'il
Titre: Rosetta@home
Posté par: tibidao le 07 janvier 2007 à 21:21
Pour moi, l'AF n'a pas vocation à se retrouver sur le podium sur tout les projets, le top 10 serait bien...
Sur rosetta on a en face de nous des grosses équipes qui ne calculent (quasiment) que sur rosetta, l'AF qui a une vocation généraliste ne peut pas trop lutter.
Et puis il y a pas mal de gens qui préfèrent donner de la puissance aux petits projets...

Titre: Rosetta@home
Posté par: cristilo le 08 janvier 2007 à 02:13
Tout à fait d'accord ! Je participe à plus de 20 projets et je ne voudrais pas en lacher pour arriver à une quelconque place sur un seul. Il faut tendre vers un bon résultat mais ne pas se laisser aveugler par lui.
Titre: Rosetta@home
Posté par: popolito le 10 janvier 2007 à 14:19
http://www.youtube.com/watch?v=GzATbET3g54 <== une vidéo sur rosetta@home :)
Titre: Rosetta@home
Posté par: Heyoka le 10 janvier 2007 à 22:37
Eh, mine de rien Top6 en crédit/jours hier sur Rosetta avec 41,574
http://fr.boincstats.com/stats/team_stats.php?pr=rosetta&co=&st=0&or=12
Encore un petit effort, c'est à dire une petite dizaine d'ordi, et c'est le Top4

Il y a notament Nilux qui fait un gros travail, 5000 points hier, apparement c'est l'Ecole d'Ingénieur de la Rochelle http://eigsi.fr/
Mais il y a aussi Big-Buen, Mephisto94, zebulon57 et Fabos (Normands & Bretons en force) qui font plus de 1000/jours
Titre: Rosetta@home
Posté par: pas93 le 02 mars 2007 à 12:57
Vraiment le projet Rosetta@home veut que on l'aime encore une exelente nouvel

http://www.boinc-af.org/index.php?option=com_content&task=view&id=467&Itemid=170

Encore une exelente nouvel et trouvail, serieusement ont est comblé et ce n'est pas finit vue les 2 écrits qu'il doivent publié.
Titre: Rosetta@home
Posté par: ordralfabetix le 02 mars 2007 à 17:35
C'est génial,ce sera peut-être la fin de cpdn.
Titre: Rosetta@home
Posté par: guillaumeb86 le 07 mars 2007 à 13:09
 :bounce: On a atteint la barre des 1000 créditeurs sur Rosetta :bounce:
Titre: Rosetta@home
Posté par: pas93 le 07 mars 2007 à 20:50
Avec ceci en prime ^^

http://www.boinc-af.org/index.php?option=com_content&task=view&id=474&Itemid=170
Titre: Rosetta@home
Posté par: Cthulhu22 le 07 mars 2007 à 23:36
Bon et bien je remet deux PC à fond sur Rosetta !
Titre: Rosetta@home
Posté par: Kyonyx le 16 mars 2007 à 10:22
Nouveau BOINCeur, après 2 jours sur Proteins@home et Seti, j'ai décidé de ne faire tourner que Rosetta.
Cependant, je vois que le calcul actuel prendra environ 10 heures.
Ma question est celle-ci: Si mon pc est hors-tension avant la fin de ces 10 heures, comment les crédits sont comptabilisés et est-ce que les calculs effectués avant la mise hors-tension sont utiles?

Merci d'avance  :bounce:
Titre: Rosetta@home
Posté par: mamouth le 16 mars 2007 à 11:39
Alors sur rosetta dans les propriètés tu peux choisir la durée de chaque WU
par défaut je crois que c'est 8 ou 10H mais ça peut aller de 1H à 24H

Lorsque tu vas éteindre puis rallumer ton PC les calculs reprendront ou ils étaient arrivés ( ce n'est pas parfaitement exacte mais sache que au pire tu ne perdras que qques minutes de calcul )

Les crédits seront accordés quand la WU sera terminée et renvoyée au serveur
Titre: Rosetta@home
Posté par: Heyoka le 16 mars 2007 à 11:42
Pour régler la durée d'une unité voilà le lien :

http://boinc.bakerlab.org/rosetta/prefs.php?subset=project

Appuyer sur Edit Rosetta@home preferences

Target CPU run time

chosir dans le menu déroulant, ça va de 1 heure à 24h
Titre: Rosetta@home
Posté par: Kyonyx le 16 mars 2007 à 12:02
Voilà qui est fait, merci à toi  :hello:
Titre: Rosetta@home
Posté par: popolito le 02 avril 2007 à 07:16
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=1177&nowrap=true#38812
Hé ben !
Titre: Rosetta@home
Posté par: pas93 le 02 avril 2007 à 11:06
Et Rosetta qui demande de la puissance. Je suis sur trop de projet sinon je foncerais sur rosetta  :o
Titre: Rosetta@home
Posté par: ordralfabetix le 03 avril 2007 à 01:07
Moi,vedredi je passe à 100% sur rosetta.Tant pis pour malaria.Ils n'ont qu'à revoir l'attribution des crédits.
Titre: Rosetta@home
Posté par: pas93 le 05 avril 2007 à 22:51
Moi je finit mes unités Simap et je me remet à Rosetta.
Titre: Rosetta@home
Posté par: pas93 le 07 juin 2007 à 15:30
We are just finalizing a manuscript describing predictions of protein-protein interactions made using rosetta@home during the recent CAPRI international test of protein-protein docking methods. As with our previous papers, we would like to acknowledge participants who produced models which contributed to our final predictions. If you are on the following list, and would like to be acknowledged by your real name rather than your user name, please let us know.

USERID USERNAME SENDEMAIL TEAMID TEAMNAME
5590 SteveK 1 7 BOINC Synergy
112024 Administrator 1
125433 QuickBeam 1 4232 H4xx0rz
3377 devzero 1 5 Free-DC
64398 raptur 1 219 Ohio State University
36366 cyclistgb 1 887 BOINC@Canada
79579 borekv 0 1964 boinc.cz
78679 yopjpeg 1
111834 orion2598 1
147099 MK_I 1 46 Czech National Team

C'est David Bakers qui dit ça. En gros, il demande à ceux qui sont sur la liste si il veulent laisser leur pseudo ou mettre leur vrais nom pour les remerciements.
Titre: Rosetta@home
Posté par: celtar le 07 juin 2007 à 23:16
Pas de membre de l'AF dommage :(
Titre: Rosetta@home
Posté par: pas93 le 07 juin 2007 à 23:22
Non le seul à avoir réussis à être marquer quelques part c'est Mephisto, mais celà remonte à plus d'1 an et l'AF n'a rien eu depuis, même pas dans le prediction of the days :(
Titre: Rosetta@home
Posté par: Tokyrn le 08 juin 2007 à 12:05
jsuis passé 100% rosetta 4 ordi tourne dessus :D
Titre: Rosetta@home
Posté par: pas93 le 08 juin 2007 à 12:17
Coool ça :bounce:
Titre: Rosetta@home
Posté par: pas93 le 03 août 2007 à 19:34
J'ai lancer quelques unités Rosetta à mon retour et j'ai reçu une unité appeler Rosetta_Beta. Quelqu'un à des infos dessus ?
Titre: Rosetta@home
Posté par: pas93 le 03 août 2007 à 19:35
Qu'elle boulet je suit j'avais même pas grilled mdr:

I'm at the annual rosetta developers conference which started yesterday and goes through saturday. There are 90 developers from all over the world attending, and there has been a very exciting mix of new algorithmic developments and exciting applications to important biological and medical problems.

In a few weeks I will be describing our work on vaccine design at the upcoming HIV vaccine meeting in Seattle: http://www.hivvaccineenterprise.org/conference/program.html, maybe some of you will be there!

Allez je vais traduire.

Enfin, ça n'a pas trop de rapport mais je traduit car c'est une news ^^
Titre: Rosetta@home
Posté par: Damien le 03 août 2007 à 19:52
Citation de: pas93
J'ai lancer quelques unités Rosetta à mon retour et j'ai reçu une unité appeler Rosetta_Beta. Quelqu'un à des infos dessus ?


Est-ce bien le nom de la Wu de Rosetta car c'est aussi le nom de l'application pour calculer les Wus de RALPH qui distribue assez souvent du travail ces derniers jours.
Titre: Rosetta@home
Posté par: pas93 le 03 août 2007 à 20:58
Eu oui, sorry. J'essaye de tenir le coup mais je suis fatigué ^^ 2 h de sommeil plus trajet ^^ Enfin oui pardon je voulait dire l'application. Donc il RALPH c'est finit et tous apsse sur rosetta maintenant ?
Titre: Rosetta@home
Posté par: Damien le 03 août 2007 à 21:14
Citation de: pas93
Donc il RALPH c'est finit et tous apsse sur rosetta maintenant ?

 :??:

Quelques infos complémentaires mais je ne suis pas certain d'avoir tout compris: c'était un envoi de dernières Wus de test, toutes très stables, sur RALPH. Ces unités de travail doivent bientôt, ou même déjà, se retrouver sur les serveur de Rosetta.
Titre: Rosetta@home
Posté par: claude le 03 août 2007 à 22:31
c'est marqué là
Citer
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=1449&nowrap=true#42675

en gros ça dit ceci:
comme on en a assez d'avoir une application stable, on va un peu s'amuser avec une application buggée dont le nom sera quelque chose du genre "rosetta_beta_5.70"  :D

en vrai le post du 26 juin dit ça:
Citer
Rosetta@home a été mise à jour avec la version 5.70. Cette version corrige  quelques bug pour le repliement ab initio de l'ARN, le repliement symétrique et le mode "d'amarrage". Nous avons aussi essayé de corriger quelques uns des "sauts" de la trajectoire rmsd (le rectangle de droite), bien que l'échelle ne soit pas parfaite. Enfin, nous sommes aussi en mesure de modéliser des complexes protéiques avec un nouveau genre de symétrie.  

Autre changement intéresant : nous somme capables d'envoyer des unités de traitement avec l'ancienne application (5.68) et la nouvelle (5.70). C'est avantageux car l'ancienne est "stable" et nous permet d'effectuer des expériences à long terme telles que la recherche des configurations de basse énergie très rares avec des centaines de milliers d'unités de traitement sur plusieurs mois. La nouvelle comprend des correction de bugs pour certains modes ainsi que de nouvelles fonctionnalités. La nouvelle sera appelée "rosetta_beta_5.70" - vous pouvez suivre ce lien http://boinc.bakerlab.org/rosetta/apps.php pour voir ce qui est calculé.

Titre: Rosetta@home
Posté par: Damien le 03 août 2007 à 22:40
Citation de: claude
comme on en a assez d'avoir une application stable, on va un peu s'amuser avec une application buggée dont le nom sera quelque chose du genre "rosetta_beta_5.70"  :D


Merci bien  :jap: RALPH teste presque les mêmes versions, actuellement c'est la 5.73, les derniers bugs corrigés par rapport aux versions précédentes sont mentionnés sur la page d'accueil du projet http://ralph.bakerlab.org/
Titre: Rosetta@home
Posté par: pas93 le 03 août 2007 à 23:07
ok mdr désolé je vais me coucher demain je repart en TGV à 7h -__-
Titre: Rosetta@home
Posté par: Heyoka le 12 août 2007 à 00:25
Robrouge est le Predictor of the day aujourd'hui sur Rosetta !

Pour l'unité CNTRL_01RELAXNATIVE_SAVE_ALL_OUT_-1fkb_-_1801_0

C'est la première fois qu'un membre de l'Alliance Francophone fait la meilleure prévision de la journée  :jap:
Je crois d'ailleurs qu'il devrait jouer au loto, parce qu'être Predictor of the day avec un rac de 19.04 il faut vraiment le faire. Surtout que sur Rosetta, il y a plus de 100.000 unités calculées par jours

http://boinc.bakerlab.org/rosetta/
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/rah_old_potd.php

(http://forum.boinc.fr/mesimages/560/predictor.jpg)
Titre: Rosetta@home
Posté par: pas93 le 12 août 2007 à 01:36
Houla en effet Bravo ROB ont l'attendait et tu la fait :sol:  :sol:  :bounce:  :bounce:  :bounce:
Titre: Rosetta@home
Posté par: XTC_ZeuZ le 12 août 2007 à 03:00
:lol: Excellent, bravo :p
Titre: Rosetta@home
Posté par: _32_Jenkai le 12 août 2007 à 08:05
 :bounce: XTC powww@!  :p

Bravo Rob.
Titre: Rosetta@home
Posté par: Robrouge le 12 août 2007 à 09:01
Hé bé dites donc  :lol:  ça veut dire quoi, que j'ai vraiment contribué à une découverte importante ? Si c'est le cas ça fait plaisir surtout sur Rosetta qui me tient à coeur et que j'ai un peu délaissé ces temps  :)
Titre: Rosetta@home
Posté par: Heyoka le 12 août 2007 à 11:45
Citation de: Robrouge
ça veut dire quoi, que j'ai vraiment contribué à une découverte importante ?


Non, pour l'instant c'est juste la meilleure prévision de la journée.
Après les résultats vraiment intéressant apparaissent dans les publications avec le nom de la personne dans les crédits de l'article.
Mais là il faut être dans les 10 ou 20 meilleures prévisions de l'année, si c'est le cas tu recevra un email au moment de l'écriture des prochaines publications.

Je sais pas si tu peut aller sur ton compte et voire ce que l'unité CNTRL_01RELAXNATIVE_SAVE_ALL_OUT_-1fkb_-_1801_0 a de particulier

Sur la page vos résultats : http://boinc.bakerlab.org/rosetta/rah_results.php?login=1
Titre: Rosetta@home
Posté par: Damien le 12 août 2007 à 12:01
Citation de: Heyoka
Non, pour l'instant c'est juste la meilleure prévision de la journée.


 :jap: Oui, pour l'instant c'est trop tôt pour dire si c'était juste la moins mauvaise de toutes les affreuses prédictions du jour, ou si au contraire c'était une prédiction surpassant d'autres fabuleuses découvertes réalisées cette même journée.
Titre: Rosetta@home
Posté par: Robrouge le 12 août 2007 à 13:06
Ok merci pour vos précisions Heyoka et Damien  ;)
Titre: Rosetta@home
Posté par: popolito le 15 août 2007 à 10:14
Le jeu rosetta : http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=3457
Titre: Rosetta@home
Posté par: Caius666 le 18 août 2007 à 22:59
Je regardais la liste des maladies qui sont en rapport avec boinc (ça donne froid dans le dos rien qu'à la lire), et j'ai vu l'Anthrax pour Rosetta, mais apparament en allant vérifier sur le site de rosetta, si on veut traduire en français ce serait plutôt le "BACILLE DU CHARBON", en français, l'anthrax c'est plutôt ça : http://fr.wikipedia.org/wiki/Anthrax_%28maladie%29 pas très sympathique non-plus.

Lorsqu'il y a eu les enveloppes avec le bacille du charbon, les journalistes on repris le mot anglais pour le qualifier : "anthrax", sans chercher la traduction (d'un autre coté le jour où les journalistes retransmetront des infos correctes...), c'est pourquoi aujourd'hui beaucoup utilisent anthrax à tord pour qualifier le bacille du charbon.

Voilou :)


EDIT : Hum, je crois que je me suis planté de section, j'aurais du poster ça dans traduction...
Titre: Rosetta@home
Posté par: pffrr le 19 août 2007 à 21:13
je reçois des points de contrôle sur Rosetta avec une fréquence variant entre deux minutes et une heure, voire un peu plus...

y a-t-il quelqu'un dans le même cas que moi?

y a-t-il un moyen de remédier à ce problème?

 :jap:

Titre: Rosetta@home
Posté par: rom_185 le 21 août 2007 à 18:21
Citation de: pffrr
je reçois des points de contrôle sur Rosetta avec une fréquence variant entre deux minutes et une heure, voire un peu plus...

y a-t-il quelqu'un dans le même cas que moi?

y a-t-il un moyen de remédier à ce problème?

 :jap:
Rosetta sauvegarde le travail à chaque fin de protéines traité, comme les protéines mettent un temps différent à se calculer, les sauvegardent sont irrégulières.
Titre: Rosetta@home
Posté par: Heyoka le 22 août 2007 à 16:12
Merci de me dire si j'ais bien traduit ce message :
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=1177&nowrap=true#45261
http://www.boinc-af.org/content/category/12/116/303/

J'ai notamment eu du mal avec ces 2 phrases :

Citer
In collaboration with a group at the NIH, we experimented with adding a very small amount of information about protein structures from nuclear magnetic resonance experiments to the rosetta structure prediction process

Citer
this information is fairly easily obtainable, and doesn't seem like it would have much effect, but the results show quite contrary--the models produced are extremely accurate! this has the potential to revolutionize how scientists determine protein 3D structures using NMR data


C'est pas gentil David de faire des phrases de 3 lignes, après on a du mal à comprendre  :o
Titre: Rosetta@home
Posté par: Damien le 22 août 2007 à 20:25
Je trouve que ce message que tu viens de traduire http://www.boinc-af.org/content/view/745/1/ est tellement important, que je ne résiste pas au plaisir d'en mettre une copie (sauf les liens qu'il contient) sur ce forum pour informer ceux qui oublieraient d'aller sur le site de l'AF ou pour ceux qui ne le trouveront pas quand il ne sera plus sur la première page du portail:

Citer
Une nouvelle méthode qui pourrait révolutionner la détermination de la structure 3D des protéines !

 Traduction du message du Dr David Baker, sur le forum du projet Rosetta@home

Les résultats de ces derniers jours de calculs de l'application Rosetta@home sur vos ordinateurs sont tout simplement stupéfiants ! En collaboration avec une équipe du NIH (Instituts nationaux de la santé aux USA), nous avons tenté d'ajouter au processus de prévision des structures de l'application rosetta, un brin d'informations au sujet de la structure des protéines obtenues lors des expériences de résonance magnétique nucléaire. Il est assez facile de se procurer ces informations, on pensait qu'elles n'auraient pas beaucoup plus d'effets, mais les résultats montrent tout le contraire -- les modèles générés sont extrêmement précis ! Ce qui pourrait potentiellement révolutionner la méthode de détermination de la structure 3D des protéines avec l'utilisation des données de résonance magnétique nucléaire. Nous n'aurions jamais pu tester cette idée (qui a été soulevée il y a plusieurs mois lors d'une conversation téléphonique) sans l'ensemble de vos contributions.

Aujourd'hui (lire Hier), j'ai présenté notre travail sur la conception de vaccins lors de la réunion AidsVaccine07. Les scientifiques qui travaillent depuis de nombreuses années sur ce problème très compliqué sont, je pense, extrêmement enthousiastes quant à notre approche qui est quelque chose qui n'avait jamais été tenté auparavant et qui semble théoriquement logique. Bien que nous sommes toujours loin d'un vaccin, nos résultats préliminaires en collaboration avec l'équipe du NIH sont prometteurs. Après mon entretien, j'ai eu une conversation avec une journaliste du Wall Street Journal, et je pense qu'elle serait intéressée pour écrire un article sur rosetta@home et la conception de vaccin contre le VIH.
Titre: Rosetta@home
Posté par: mamouth le 23 août 2007 à 11:54
woa ça donne envie de refaire du rosetta

je croise les doigts pour que le RAID d'automne soit sur ce projet
Titre: Rosetta@home
Posté par: thomas le 23 août 2007 à 11:59
Citation de: mamouth
woa ça donne envie de refaire du rosetta

je croise les doigts pour que le RAID d'automne soit sur ce projet

j'ai jamais eu envie d'arréter :o

Bien la trad!

moi j'ai trop du mal avec l'anglais ... :(

snif :(
Titre: Rosetta@home
Posté par: Robrouge le 23 août 2007 à 14:00
Citation de: mamouth
woa ça donne envie de refaire du rosetta

je croise les doigts pour que le RAID d'automne soit sur ce projet


Je pensais la même chose  :)
Titre: Rosetta@home
Posté par: kyuzo le 26 août 2007 à 02:32
Tiens, suis-je le seul à avoir du pending sur Rosetta, alors que le quorium est toujours de 1 ?
J'en ai avec la version 5.69 et beta 5.77.

EDIT : Apparement, c'est réglé :o
Titre: Rosetta@home
Posté par: Astro le 27 août 2007 à 18:31
Comment savoir sur quel projet Rosetta travail sur BOINC ?
Titre: Rosetta@home
Posté par: rom_185 le 27 août 2007 à 20:07
Astro, Tu veut savoir quel recherche tu aide c'est ça ?
(cancer, SIDA...)
Titre: Rosetta@home
Posté par: Astro le 27 août 2007 à 22:20
Quand Boinc travail j'aimerai savoir sur quel maladie il travaille dans ce code :
http://www.enregistrersous.com/images/70843203920070827224729.jpg
Titre: Rosetta@home
Posté par: claude le 27 août 2007 à 22:35
quand tu appuies sur le bouton "montrer les graphiques" (c'est le même que l'écran de veille) est-ce qu'il ne le dit pas quelque part ?
Titre: Rosetta@home
Posté par: kyuzo le 27 août 2007 à 23:52
Non, on ne sait pas.
Titre: Rosetta@home
Posté par: Hildor le 28 août 2007 à 06:36
Je crois que Rosetta ne travaille pas sur une maladie en particulier, mais leurs recherches peuvent avoir
des implications sur de nombreuses maladies.
Titre: Rosetta@home
Posté par: claude le 28 août 2007 à 10:39
à quoi ça sert que le "magicien" se décarcasse  :o http://www.boinc-af.org/content/view/26/219/ même si on ne sait pas exactement.
Titre: Rosetta@home
Posté par: [AF>Libristes>Jip]Augure le 28 août 2007 à 10:43
Citation de: Damien
Je trouve que ce message que tu viens de traduire http://www.boinc-af.org/content/view/745/1/ est tellement important, que je ne résiste pas au plaisir d'en mettre une copie (sauf les liens qu'il contient) sur ce forum pour informer ceux qui oublieraient d'aller sur le site de l'AF ou pour ceux qui ne le trouveront pas quand il ne sera plus sur la première page du portail:

Citer
Une nouvelle méthode qui pourrait révolutionner la détermination de la structure 3D des protéines !

 Traduction du message du Dr David Baker, sur le forum du projet Rosetta@home

Les résultats de ces derniers jours de calculs de l'application Rosetta@home sur vos ordinateurs sont tout simplement stupéfiants ! En collaboration avec une équipe du NIH (Instituts nationaux de la santé aux USA), nous avons tenté d'ajouter au processus de prévision des structures de l'application rosetta, un brin d'informations au sujet de la structure des protéines obtenues lors des expériences de résonance magnétique nucléaire. Il est assez facile de se procurer ces informations, on pensait qu'elles n'auraient pas beaucoup plus d'effets, mais les résultats montrent tout le contraire -- les modèles générés sont extrêmement précis ! Ce qui pourrait potentiellement révolutionner la méthode de détermination de la structure 3D des protéines avec l'utilisation des données de résonance magnétique nucléaire. Nous n'aurions jamais pu tester cette idée (qui a été soulevée il y a plusieurs mois lors d'une conversation téléphonique) sans l'ensemble de vos contributions.

Aujourd'hui (lire Hier), j'ai présenté notre travail sur la conception de vaccins lors de la réunion AidsVaccine07. Les scientifiques qui travaillent depuis de nombreuses années sur ce problème très compliqué sont, je pense, extrêmement enthousiastes quant à notre approche qui est quelque chose qui n'avait jamais été tenté auparavant et qui semble théoriquement logique. Bien que nous sommes toujours loin d'un vaccin, nos résultats préliminaires en collaboration avec l'équipe du NIH sont prometteurs. Après mon entretien, j'ai eu une conversation avec une journaliste du Wall Street Journal, et je pense qu'elle serait intéressée pour écrire un article sur rosetta@home et la conception de vaccin contre le VIH.


en mem temps c`est des annonces ... faut pas tout croire !
des data de RMN cela serait un peut trop gros pour nous envoyer ( meme en different petit paquet ! )
de plus la RMN (dsl si j`en vexe ... :p ) se limite aux plus petite proteine !
enfin en tout cas ce sont ceux qui se bouge le plus ! et j`ai hate de lire leur publie dans nature :)
peu etre que cela pourrat motiver les labo de s`y mettre ( le mien :p ) et a nous un poid de plus pour motiver des fac ou autre ! :)

Titre: Rosetta@home
Posté par: Thrr-Gilag le 28 août 2007 à 11:15
Bah on arrive bien à faire de la RMN du solide, donc tout est surtout question de temps passé à faire l'acquisition.

Et puis la RMN Proton a un signal qui est quand même très importants par rapport à d'autres... ça aide bcp ^^
Titre: Rosetta@home
Posté par: kyuzo le 29 août 2007 à 23:32
Tiens, j'arrive plus a choper un Wu sur mon c2d depuis près de deux jours (mon cache est presque vide) alors que mon p4 en recoit toujours...
Citer

29/08/2007 23:30:57|rosetta@home|Sending scheduler request: Requested by user
29/08/2007 23:30:57|rosetta@home|(not requesting new work or reporting completed tasks)
29/08/2007 23:31:02|rosetta@home|Scheduler RPC succeeded [server version 509]
29/08/2007 23:31:02|rosetta@home|Deferring communication for 4 min 2 sec
29/08/2007 23:31:02|rosetta@home|Reason: requested by project
Titre: Rosetta@home
Posté par: gulu le 30 août 2007 à 22:00
ouais mais là c'est ton "ordi" qui ne demande pas de nouvelles UT :

29/08/2007 23:30:57|rosetta@home|(not requesting new work or reporting completed tasks)

tu calcules sûrement un autre projet en parallèle non ?
Titre: Rosetta@home
Posté par: kyuzo le 31 août 2007 à 03:57
Ouais, une unitée CPDN.
Titre: Rosetta@home
Posté par: gulu le 31 août 2007 à 16:19
donc en fonction de ton "partage des ressources" (boincmanager onglet projets), rosetta "estime" que tu as assez d'unités et attend avant de t'en envoyer de nouvelles.
Titre: Rosetta@home
Posté par: rom_185 le 31 août 2007 à 19:19
Si tu veut du taf sur rosetta il te suffit juste de maitre CPDN en pose ;).
Titre: Rosetta@home
Posté par: Heyoka le 31 août 2007 à 19:31
Citation de: Astro
Quand Boinc travail j'aimerai savoir sur quel maladie il travaille dans ce code :
http://www.enregistrersous.com/images/70843203920070827224729.jpg


Il faudrait poser la question sur le forum : http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_forum.php?id=1
Seuls les scientifiques du projet pourront y répondre
Il y a un topic sur ça, mais ça fait longtemps qu'il n'a plus été mis à jours : http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=1453
Titre: Rosetta@home
Posté par: tibidao le 06 septembre 2007 à 14:41
Deux nouvelles :

Pour ceux qui n'auraient pas remarqué, le site du projet est en maintenance depuis au moins 24 heures, ne vous étonnez pas si vous n'arrivez pas à rendre des unités. Aucune idée du délai pour le retour à la normale.  :o

Electronic sports league (ESL), qui s'est lancé massivement sur rosetta fin mars est devenu première équipe sur le projet.
Vous me direz, "ça nous fait une belle jambe"... oui mais non : parce qu'en fait ils se demandent si du coup ils vont pas changer de projet, donc affaire à surveiller de près.
Pour peu qu'ils décident de se mettre sur un projet ou L'AF est première, notre place pourrait être menacée...  :sweat:
EDIT : oublié de mettre le lien  :o  : http://www.esl.eu/eu/news/43120/
Titre: Rosetta@home
Posté par: Hildor le 06 septembre 2007 à 15:21
A suivre donc !  :D

Mais ils vont certainement vouloir garder leur première place sur leur projet fétiche, d'où une division de leur force.
Titre: Rosetta@home
Posté par: Caius666 le 09 septembre 2007 à 01:04
J'espère que les serveurs vont remarcher demain car je repars pour une semaine sans internet lundi et j'ai une vingtaine de WU qui vont atteindre leur deadline demain à 15h pour certaines et les autres jeudi, du travail pour rien  :(
Titre: Rosetta@home
Posté par: Damien le 09 septembre 2007 à 10:35
Rosetta est à nouveau fonctionnel mais il peut rester quelques problèmes à corriger après le terrible crash que ce projet vient de connaitre sur du matériel neuf n'ayant correctement fonctionné que pendant 45 jours.

La liste des derniers découvreurs des meilleures structures de protéines grâce à BOINC ne mentionne pas de membres de l'AF (http://www.pnas.org/cgi/data/0703836104/DC1/7),  ;) mais cela pourrait changer si le GGGRRRRAND raid d'automne de notre équipe tombe sur ce projet.

Une publication scientifique sur les derniers résultats, très prometteurs, vient de paraître, en voici le résumé: http://www.pnas.org/cgi/content/abstract/0703836104v1
Titre: Rosetta@home
Posté par: kyuzo le 09 septembre 2007 à 11:35
J'arrive toujours pas à renvoyer mes unitées, ils auraient toujours de problèmes ?
Titre: Rosetta@home
Posté par: gulu le 09 septembre 2007 à 18:32
les miennes ont été envoyées mais pas validées
Titre: Rosetta@home
Posté par: popolito le 09 septembre 2007 à 19:14
http://www.pnas.org/cgi/reprint/0703836104v1.pdf
Lien direct vers la publication :)
Titre: Rosetta@home
Posté par: Heyoka le 10 septembre 2007 à 18:11
J'ais fait un article sur boinc-af : http://www.boinc-af.org/content/view/767/303/

Par contre, je sais pas comment traduire ça :

Fragment assembly of RNA-produced structures.

ça apparait en dessous de l'image ; http://www.pnas.org/misc/highlights.shtml
Titre: Rosetta@home
Posté par: claude le 13 septembre 2007 à 22:43
le serveur est encore planté, c'est pas encourageant pour la suite ça  :o
Titre: Rosetta@home
Posté par: Heyoka le 13 septembre 2007 à 22:45
non, il marche très bien : http://boinc.bakerlab.org/rosetta/rah_status.php
Titre: Rosetta@home
Posté par: pas93 le 13 septembre 2007 à 22:58
+1 ça fonctionne
Titre: Rosetta@home
Posté par: claude le 14 septembre 2007 à 00:25
effectivement, entre le moment où j'ai regardé et le moment où j'ai posté, ils ont tout corrigé les coquins  :whistle:
Titre: Rosetta@home
Posté par: kyuzo le 14 septembre 2007 à 22:04
Tiens, pour les unitées en 64 bits, est-ce que ce sont juste des 32 bits fait pour que ça passe sur du 64 ou elles sont optimisées pour ?
Titre: Rosetta@home
Posté par: claude le 14 septembre 2007 à 22:06
de mémoire, c'est une appli compilée pour le 64bits. pour ce qui est de l'optimisation ...  [:saispas]
Titre: Rosetta@home
Posté par: Heyoka le 14 septembre 2007 à 22:43
Dans ce genre de calcul le 64 bits n'est pas tellement plus performant que le 32bits
Titre: Rosetta@home
Posté par: claude le 19 septembre 2007 à 22:01
Il y a un problème avec les unité qui contiennent CAPRI dans leur nom : elles risquent se figer et se terminer en erreur.
vous pouvez donc les annuler.

http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=3552
Titre: Rosetta@home
Posté par: tibidao le 20 septembre 2007 à 14:08
CAPRI, c'est fini !

Et dire que c'était la ville de mon premier amour....

 [:marcp]
Titre: Rosetta@home
Posté par: celtar le 20 septembre 2007 à 17:28
Citation de: tibidao
CAPRI, c'est fini !

Et dire que c'était la ville de mon premier amour....

 [:marcp]


très bon ! il faut les trouver des comme ça  :D
Titre: Rosetta@home
Posté par: claude le 20 septembre 2007 à 23:17
:lol:
Titre: Rosetta@home
Posté par: claude le 21 septembre 2007 à 14:46
y a un truc qui me chiffonne : les UT beta ne devraient-elle pas être dans RALPH vu que c'est le projet de test ? :heink:
Titre: Rosetta@home
Posté par: pas93 le 21 septembre 2007 à 14:52
Oui c'est la question que je me suit aussi posé. Mais je reçoit de moins en moins de Rosetta beta et vous ?
Titre: Rosetta@home
Posté par: popolito le 21 septembre 2007 à 15:54
En fait, pour certaines unités, ils ont besoin de l'ancienne application et pour d'autres la nouvelle. Je pense que pour éviter des bugs, ils ont donné des noms différents aux 2 applications (rosetta et rosetta beta). Ce n'est qu'une hypothèse bien sûr.
Titre: Rosetta@home
Posté par: popolito le 23 septembre 2007 à 09:45
"While the project needs to run under two versions, one will always need to have a unique name from the other. At this point the word "beta" is used to distinguish the two. All the work performed by Rosetta has previously been tested on Ralph."
Hey, j'avais raison !!
Vous pouvez aussi m'appeler Dieu.
Titre: Rosetta@home
Posté par: claude le 24 septembre 2007 à 23:07
il faut croire qu'ils ont merdé dans les tests  :o
quand je fais ça chez un client, j'en prend plein mon blase.
Là c'est nous les clients  :sol:
Titre: Rosetta@home
Posté par: Heyoka le 29 septembre 2007 à 20:55
Elles sont marrantes les unités af2094_BOINC_MFR-ABRELAX_PICKED
La protéine native est presque entièrement dépliée :

(http://forum.boinc.fr/mesimages/560/abrelax.jpg)
Titre: Rosetta@home
Posté par: modesti le 02 octobre 2007 à 00:43
@ Heyoka:
Citer
Par contre, je sais pas comment traduire ça :
Fragment assembly of RNA-produced structures.

Est-ce qu'il pourrait s'agir d'un ensemble de fragments de structures produites par l'ARN ? Malheureusement, je n'ai pas pu accéder à la photo :(

@ Pas93:
Citer
Mais je reçoit de moins en moins de Rosetta beta et vous ?

Ces derniers temps je ne reçois que ça ! j'en ai encore une en cours et 8 en attente, dont 6 téléchargées aujourd'hui.
D'ailleurs je viens de voir que celle en cours ne s'est pas déchargée de la mémoire quand le Boinc Manager a basculé sur autre chose...  :pfff:  Pas grave, puisque je vais au dodo mtn et que l'ordi va pouvoir bosser tout seul ;)
Titre: Rosetta@home
Posté par: pas93 le 02 octobre 2007 à 09:39
je ne sait pas en ce moment, j'ai aucun PC sur rosetta depuis 2 jours presque ^^ Chez les autres aussi c'est comme ça ? Sinon configure ton Boincmanager.
Titre: Rosetta@home
Posté par: modesti le 02 octobre 2007 à 12:15
j'avoue que ça ne me pose pas de problème. j'ai configuré pour qu'il ne garde rien en mémoire, s'il veut le faire quand même... ça ne me gêne pas dans mon boulot ;)
de toute façon, je n'ai plus que 3 wu rosetta sur mon PC: 1 à rendre avant le 5.10. (en cours), le reste je le garde sous le coude. les autres sont en cours sur mon portable que j'ai activé hier exprès - il ne fera que ça pendant la durée du raid ;) j'ai 14 wu à rendre avant le 11...
Titre: Rosetta@home
Posté par: Hildor le 02 octobre 2007 à 20:22
Citation de: modesti
j'avoue que ça ne me pose pas de problème. j'ai configuré pour qu'il ne garde rien en mémoire, s'il veut le faire quand même... ça ne me gêne pas dans mon boulot ;)


C'est emmerdant quand même, pour le bon déroulement du Raid  :(
Donc attention aux multi-processeurs et aux petites configuration et surtout à ceux qui squatent les PC du boulot  :whistle:
Le projet RCN sera fait pour ceux-là.
Titre: Rosetta@home
Posté par: Thrr-Gilag le 02 octobre 2007 à 20:39
A priori seule les WU rosetta beta restent en mémoire même lors du déchargement des WU... Quitte à les supprimer dès qu'on les reçoit si on s'apperçoit que ça merde.
Titre: Rosetta@home
Posté par: laurent02 le 02 octobre 2007 à 21:22
ça commence mal pour le raid... je voulais commencer a cruncher un peu en attendant samedi et voici le message de rosetta :
Citer
02/10/2007 21:09:16|rosetta@home|Deferring communication for 1 hr 21 min 32 sec
02/10/2007 21:09:16|rosetta@home|Reason: no work from project
Titre: Rosetta@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 02 octobre 2007 à 21:34
PEut etre dans 1h21 et 32s ça sera bon...Souvent ça me fait des choses comme ça. Mais je n'y fait guere attention car j'ai plusieurs projets de secours.

essaye de mettre a jour le projet...Sinon attend un peu...
Titre: Rosetta@home
Posté par: modesti le 02 octobre 2007 à 21:52
Je reviens sur la wu de rosetta beta en mémoire : je l'ai déchargée de force en quittant Boinc et en le redémarrant. Du coup, quand l'ordi s'est remis sur rosetta, les 13% déjà calculés étaient perdus et la wu a redémarré à zéro :/

juste pour info
Titre: Rosetta@home
Posté par: laurent02 le 02 octobre 2007 à 21:55
Citer
PEut etre dans 1h21 et 32s ça sera bon...Souvent ça me fait des choses comme ça. Mais je n'y fait guere attention car j'ai plusieurs projets de secours.
 
essaye de mettre a jour le projet...Sinon attend un peu...

problème déjà resolu... j'ai une wu qui vient d'arriver ! c'est clair qu'il ne vaut mieux pas chercher a comprendre !
Titre: Rosetta@home
Posté par: tristesire le 05 octobre 2007 à 10:58
Perso je doit me rendre à l'évidence :(
J'avais voté pour Rosetta en ayant déjà l'expérience d'avoir fait tourner le projet sur mon pc qui n'est pas une bête de course loin s'en faut.
MAIS je me rendait pas compte de la lourdeur sur un poste qui fait office de poste de travail (bref ordi du taf).
Conclusion, je doit réduire une partie de ma participation sur Rosetta et activer RCN pour participer au raid.
Bien vu BHS
Titre: Rosetta@home
Posté par: chasseur de mammouth le 05 octobre 2007 à 19:37
Je viens de creer un compte rosetta mais je n'arrive pas a "join" l'AF  :??:
A partir de Boinc je clique sur "vos preferences" puis "find a team" ensuite je fais un search "AF" je trouve, je clique sur join this team et il ne se passe rien.... :sweat:
Titre: Rosetta@home
Posté par: Damien le 05 octobre 2007 à 19:51
Citation de: chasseur de mammouth
Je viens de creer un compte rosetta mais je n'arrive pas a "join" l'AF  :??:
A partir de Boinc je clique sur "vos preferences" puis "find a team" ensuite je fais un search "AF" je trouve, je clique sur join this team et il ne se passe rien.... :sweat:


Il faut faire une recherche du mot "francophone" ou cliquer ici directement: http://boinc.bakerlab.org/rosetta/team_join_form.php?id=30
Titre: Rosetta@home
Posté par: chasseur de mammouth le 05 octobre 2007 à 20:04
J'ai pas compris, mais ça marche. Merci  :pt1cable:
Titre: Rosetta@home
Posté par: popolito le 15 octobre 2007 à 20:35
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/result.php?resultid=111029810
Ca c'est de l'unité !
Titre: Rosetta@home
Posté par: pas93 le 15 octobre 2007 à 20:38
En effet :lol:
Titre: Rosetta@home
Posté par: Thrr-Gilag le 15 octobre 2007 à 20:43
This process generated    247 decoys

Et après on va me dire que les calculs rosetta sont bien :-/
Titre: Rosetta@home
Posté par: claude le 15 octobre 2007 à 22:47
je rêve  :ouch:
Titre: Rosetta@home
Posté par: TaxxorbaK le 16 octobre 2007 à 12:28
Citation de: popolito
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/result.php?resultid=111029810
Ca c'est de l'unité !

Passe-la moi, je vais la recalculer pour être sûr ^^
Titre: Rosetta@home
Posté par: modesti le 16 octobre 2007 à 12:36
Citation de: Thrr-Gilag
This process generated    247 decoys

Et après on va me dire que les calculs rosetta sont bien :-/


Euhhhhhhh..... désolée, mais : c'est quoi des "decoys" ????
 :??:  :??:  :??:
Titre: Rosetta@home
Posté par: Thrr-Gilag le 16 octobre 2007 à 12:50
je suis pas trop sûr, à mon avis ce sont des configurations stables de la molécule.

Dans tout les cas, les crédits sont indexés sur le nombre de decoys que tu génères au cours de ton calcul.
Titre: Rosetta@home
Posté par: modesti le 16 octobre 2007 à 13:06
ok. merci pour ce renseignement :jap:
Titre: Rosetta@home
Posté par: Damien le 17 octobre 2007 à 21:53
 :bounce: Parution d'un article sur le projet Rosetta dans la prestigieuse revue Nature: http://www.nature.com/news/2007/071016/full/449765a.html

 :bounce: Depuis trois jours, le meilleur prédicteur du jour figure à nouveau sur la page d'accueil du projet, ça commençait à être temps que ça reprenne.
Titre: Rosetta@home
Posté par: laurent02 le 01 novembre 2007 à 17:22
on a souvent dit que rosetta occupait trop de place en memoire mais là.... c'est le top ! j'ai deux wu qui tournent actuellement et qui occupent chacune plus de 300 Mo..... A quand 1 Go par wu ?  :D
Titre: Rosetta@home
Posté par: Thrr-Gilag le 05 novembre 2007 à 15:13
Seasonal commence à avoir peur de se faire dépasser :o
Titre: Rosetta@home
Posté par: Damien le 06 novembre 2007 à 10:30
Quelques améliorations d'ordre scientifique dans les nouvelles WU Rosetta, mais ça demeure très vague:

Citer
Nov 5, 2007
Rosetta@home has been updated to version 5.81. This version contains small, but essential changes to the scientific protocols.

Citer
Posted 6 Nov 2007 2:14:08 UTC
This version adds a new feature that allows us to properly model disulfide bonds in proteins.

(http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=1449)
Titre: Rosetta@home
Posté par: Rosalie_Mignon le 08 novembre 2007 à 03:28
En attendant, sur un q6600 avec 2Go de mémoire, je tourne à 75%, 2 wu à + de 400Mo, 1 à 130Mo, 2 en attente de mémoire.
Titre: Rosetta@home
Posté par: Thrr-Gilag le 08 novembre 2007 à 11:09
erf, Seasonal EST dépassé :p
Titre: Rosetta@home
Posté par: Hildor le 08 novembre 2007 à 11:26

Rosalie si tu veut calculer 4 Wu en même temps tu peut augmenter la quantité de memoire que tu veux utiliser pour Boinc.
Par défaut c'est 50% soit 1Mo pour toi, mais attention cela cela risque de se ressentir  :D  (cf avancé-> préférences sur Boinc Manager)
Titre: Rosetta@home
Posté par: rom_185 le 09 novembre 2007 à 21:35
Citation de: Hildor
Rosalie si tu veut calculer 4 Wu en même temps tu peut augmenter la quantité de memoire que tu veux utiliser pour Boinc.
Par défaut c'est 50% soit 1Mo( :lol: ) pour toi, mais attention cela cela risque de se ressentir  :D  (cf avancé-> préférences sur Boinc Manager)
Oui, ou alors tu peut diminuer la mémoire pour BOINC, et dans ce cas, rosetta ne t'enverras que des unités qui prennent "seulement" 130Mo...

Titre: Rosetta@home
Posté par: mascotte le 10 novembre 2007 à 08:48
Bonjour,
Je suis un nouvel utilisateur de BOINC, et j'ai beau parcourir les pages de ce forum, je ne trouve aucune information sur un arrêt ou un redémarrage du pc alors qu'un ou plusieurs calculs sont en cours, par exemple pour une mise à jour de l'OS...

Merci par avance à tous les initiés.

Amicalement  
Titre: Rosetta@home
Posté par: Damien le 10 novembre 2007 à 09:30
Citation de: mascotte
Bonjour,
Je suis un nouvel utilisateur de BOINC, et j'ai beau parcourir les pages de ce forum, je ne trouve aucune information sur un arrêt ou un redémarrage du pc alors qu'un ou plusieurs calculs sont en cours, par exemple pour une mise à jour de l'OS...

Merci par avance à tous les initiés.

Amicalement


 :hello: bienvenue Mascotte,

Ta question aurait davantage eu sa place  dans le sous forum des problèmes techniques: http://forum.boinc.fr/boinc/FAQtechniqueBoinc/liste_sujet-1.htm Lorsque le PC redémarre (automatiquement ou volontairement) après (ou d'ailleurs sans) mise à jour de son OS, les calculs en cours peuvent recommencer à zéro ou carrément être perdus sur les unités de travail déjà commencées si elles n'ont pas de point de reprise des calculs, mais il y a de moins en moins de projets BOINC qui ont encore ce problème (surtout si le temps de calcul nécessaire pour achever ces unités est long). Il y a "erreur de calcul" qui s'affiche et l'unité est renvoyée à un autre PC. Heureusement, dans la plupart des cas, les calculs reprennent pratiquement au % d'avancement déjà atteint sur chaque unité de travail. mais si tu es sous Windows Vista, il te faudra peut-être relancer BOINC manuellement après un redémarrage du PC si BOINC ne se lance pas automatiquement.
Titre: Rosetta@home
Posté par: mascotte le 10 novembre 2007 à 09:37
Merci Damien pour cette réponse
amicalement
Titre: Rosetta@home
Posté par: [AF>Libristes>Jip]Augure le 15 novembre 2007 à 14:03
voila une news sur rosetta ... cherchez l'erreur :p

http://www.futura-sciences.com/fr/sinformer/actualites/news/t/astronautique/d/en-bref-2007-vn84-un-asteroide-tres-humain_13576/
Titre: Rosetta@home
Posté par: TaxxorbaK le 15 novembre 2007 à 14:25
Citation de: augure59
voila une news sur rosetta ... cherchez l'erreur :p
Ben c'est toi l'erreur ! :p

EDIT : Une autre news sur Rosetta ;)
http://www.boinc-af.org/content/view/816/1/
Titre: Rosetta@home
Posté par: pas93 le 29 novembre 2007 à 00:32
Citer
The Linux executable has been updated for Rosetta@home; this fixes a small error in the prior update. For details, see this thread.


Ils ont l'air d'avoir trouver l'erreur présente chez les linuxiens.
Titre: Rosetta@home
Posté par: sisi37 le 07 décembre 2007 à 21:05
Bonjour à tous !
Je suis nouveau ici, et je viens de découvrir les projets et m'inscrire à ROSETTA.

Tout d'abord, je voulais savoir comment faites-vous pour avoir des graphiques avec les images ? Je pense que c'est parce que je n'ai pas coché l'écran de veille au démarrage... Y a-t-il une solution ?

De plus, à quoi servent les crédits que je gagne ?

Merci.


Sylvian.
Titre: Rosetta@home
Posté par: TaxxorbaK le 07 décembre 2007 à 21:15
Citation de: sisi37
Bonjour à tous !
Je suis nouveau ici, et je viens de découvrir les projets et m'inscrire à ROSETTA.

Tout d'abord, je voulais savoir comment faites-vous pour avoir des graphiques avec les images ? Je pense que c'est parce que je n'ai pas coché l'écran de veille au démarrage... Y a-t-il une solution ?

De plus, à quoi servent les crédits que je gagne ?

Merci.


Sylvian.


Bonjour,
Alors pour les graphiques, il faut cliquer sur "montrer les graphiques" dans l'onglet "tâches" du boinc manager.

Ensuite, les crédits servent à te récompenser du temps (/puissance de calcul) que tu as accordé aux projets. Ça permet de faire des grands classements en individuel ou par équipe, voir :
http://www.myboinc.com/scores/
ou
http://boincstats.com/
entre autres...

Au passage, as-tu rejoint l'Alliance Francophone ? :jap:
Titre: Rosetta@home
Posté par: sisi37 le 08 décembre 2007 à 23:31
Pour l'Alliance Francophone je l'ai bien sûr rejoint dès mon arrivée, vu que c'est ici que j'ai tout découvert :-) Et merci pour tes explications ! :-)

PS : chez moi "montrer les graphiques" est grisé :-( Avez-vous une idée d'où ça peut venir ?
Titre: Rosetta@home
Posté par: rom_185 le 08 décembre 2007 à 23:36
Citer
chez moi "montrer les graphiques" est grisé :-( Avez-vous une idée d'où ça peut venir ?
Bienvenu  :hello: .
Tu as cliquer sur l'unité rosetta en cour de calcul avant de cliquer sur montrer les graphiques ?
Titre: Rosetta@home
Posté par: sisi37 le 09 décembre 2007 à 11:07
Oui quand même :-)
Et merci pour l'accueil :-))
Titre: Rosetta@home
Posté par: rom_185 le 09 décembre 2007 à 13:28
Et en cliquant sur le milieu de la fenêtre de la "simple view" ?

Titre: Rosetta@home
Posté par: chris39 le 09 décembre 2007 à 14:13
desinstaller boinc et retourner sur la page de berkeley et recharger en cochant avec écran de veille
Titre: Rosetta@home
Posté par: sisi37 le 09 décembre 2007 à 20:32
J'ai réinstallé avec écran de veille, et "afficher les graphiques" est toujours grisé.
En simple view cela ne fonctionne pas non plus.

Cela ne vient pas du fait que je l'ai installé en tant que service ?
Titre: Rosetta@home
Posté par: Yanndoudou le 09 décembre 2007 à 21:28
Tu as essayer sur un autre projet ?
Titre: Rosetta@home
Posté par: rom_185 le 09 décembre 2007 à 21:57
Citation de: sisi37

Cela ne vient pas du fait que je l'ai installé en tant que service ?
Si :p.

Titre: Rosetta@home
Posté par: sisi37 le 09 décembre 2007 à 22:37
Citation de: rom_185
Si :p.


Merci c'était bien ça !!!  :love:

Bon, j'avoue que je ne comprend pas le graphique, mais c'est super joli  :lol:

Je peux m'amuser pour la soirée  :pt1cable:
Titre: Rosetta@home
Posté par: rom_185 le 09 décembre 2007 à 22:57
Pour mieux comprendre l'écran de veille ;) :
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/rah_graphics.php
Titre: Rosetta@home
Posté par: sisi37 le 10 décembre 2007 à 07:24
Merci ! :-)
Titre: Rosetta@home
Posté par: rom_185 le 15 décembre 2007 à 19:50
Citer
Rosetta has been updated to version 5.89. Changes allow us to model proteins with complex symmetries, and improvements in the energy function used to simulate RNA. Please post any issues with the server and site in this thread.


"Rosetta a été mis à jour vers la version 5,89. Les changements nous permettent de modéliser les protéines complexes symétries, et l'amélioration de la fonction de l'énergie utilisée pour simuler l'ARN. Veuillez posté les quelconques problèmes avec le serveur et le site sur le forum."
Titre: Rosetta@home
Posté par: Damien le 02 janvier 2008 à 11:46
Je crois que personne n'avait encore relevé l'info:


Citer
Dec 29, 2007
Predictor of the day: Congratulations to RvP_LaN http://boinc.bakerlab.org/rosetta/show_user.php?userid=176290 (Team L'Alliance Francophone) for predicting the lowest energy structure for workunit HR1958_homo_BOINC_MFR_ABRELAX_PICKED_2041_0 !
Titre: Rosetta@home
Posté par: pas93 le 02 janvier 2008 à 12:25
Excellent :hello:
Titre: Rosetta@home
Posté par: rom_185 le 02 janvier 2008 à 13:14
 :bounce: et de 4 !
Titre: Rosetta@home
Posté par: Heyoka le 02 janvier 2008 à 14:02
Je vais le contacter :jap:
Titre: Rosetta@home
Posté par: rom_185 le 02 janvier 2008 à 14:22
Il a un
Citer
AuthenticAMD
AMD Phenom(tm) 9500 Quad-Core Processor [AMD64 Family 16 Model 2 Stepping 2]
:ouch: !
Titre: Rosetta@home
Posté par: pas93 le 02 janvier 2008 à 15:18
Chanceux :o
Titre: Rosetta@home
Posté par: rom_185 le 29 février 2008 à 19:56
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/rah_view_predictions.php
Un tuto pour voir la structure qu'on a réalisé (enfin si j'ai bien compris  [:douglas riper:3] ).
J'ai tout fait mais je bloque après l'exécution des commandes en batch, il y a 3 fichiers de créés mais je ne vois pas ce que je dois faire avec  [:douglas riper:4] ...
EDIT : Ha si faut utilisé un autre soft... :/
Une petite trad' ça ferait plaisir  [:black hole sun] ...

 :jap:  :)
Titre: Rosetta@home
Posté par: rom_185 le 29 février 2008 à 20:27
J'ai réussi :p...
:)
Titre: Rosetta@home
Posté par: julienh le 08 avril 2008 à 12:04
Apr 07, 2008
Predictor of the day: Congratulations to sdusart (Team L'Alliance Francophone) for predicting the lowest energy structure for workunit 1jza__BOINC_ABINITIO_SAVE_ALL_OUT-1jza_-nd__2765_0 !

[:al@on:1]
Titre: Rosetta@home
Posté par: rom_185 le 08 avril 2008 à 20:59
 :bounce:
Titre: Rosetta@home
Posté par: al@ON le 09 avril 2008 à 12:50

 [:vtr webjo:3]
Titre: Rosetta@home
Posté par: Damien le 09 avril 2008 à 12:53
 :bounce:

[:vtr webjo:3]
Titre: Rosetta@home
Posté par: supersnoopy le 18 avril 2008 à 10:32

J'ai des unités qui me demandent 400 Mo de mémoire en ce moment.  :ouch:  :heink:

Comme j'ai 4 calculs en parallèle, c'est la panique !

unités en attente de mémoire, ça fait boule de neige, au final j'ai souvent seulement 3 unités qui se calculent vraiment, et la mémoire saturée par des WU qui squattent.

 :fou:

Titre: Rosetta@home
Posté par: al@ON le 18 avril 2008 à 10:57
Citation de: supersnoopy
J'ai des unités qui me demandent 400 Mo de mémoire en ce moment.  :ouch:  :heink:

Comme j'ai 4 calculs en parallèle, c'est la panique !

unités en attente de mémoire, ça fait boule de neige, au final j'ai souvent seulement 3 unités qui se calculent vraiment, et la mémoire saturée par des WU qui squattent.

 :fou:

 [:al@on:3] supersnoopy, peut-être arrêter Rosetta sur 2 cores et mettre 1 ou 2 projets + légers ou acheter de la RAM. [:jwhy]
Titre: Rosetta@home
Posté par: 3Fred9 le 18 avril 2008 à 13:45
Personellement j'utilise Ramboost XP qui permet de libérer de la RAM  ;)
Depuis fini les UT en attente de mémoire pour Rosetta ....  :wahoo:
Titre: Rosetta@home
Posté par: supersnoopy le 18 avril 2008 à 16:10


hmmm, intéressant. Je vais tester...

Titre: Rosetta@home
Posté par: laurent02 le 03 mai 2008 à 01:34
j'aime pas trop la nouvelle appli mini rosetta... et en plus l'ecran de veille est pas top !  :heink:
Titre: Rosetta@home
Posté par: supersnoopy le 03 mai 2008 à 02:19

Perso je n'ai jamais utilisé les écrans de veille.

qu'est-ce qu'elle a cette appli minirosetta ?
Titre: Rosetta@home
Posté par: laurent02 le 03 mai 2008 à 08:39
Citation de: supersnoopy
Perso je n'ai jamais utilisé les écrans de veille.

qu'est-ce qu'elle a cette appli minirosetta ?

Ben on peut même pas participer au concours d'Heyoka sur le meilleur résultat et le meilleur RSMD !  :D
Titre: Rosetta@home
Posté par: julienh le 06 mai 2008 à 14:09
May 06, 2008
Predictor of the day: Congratulations to Big-Buen (Team L'Alliance Francophone) for predicting the lowest energy structure for workunit t027_1_NMRREF_1_t027_1_id_model_06_2934_0 !

 :bounce:
Titre: Rosetta@home
Posté par: al@ON le 06 mai 2008 à 19:55
Citation de: julienh
May 06, 2008
Predictor of the day: Congratulations to Big-Buen (Team L'Alliance Francophone) for predicting the lowest energy structure for workunit t027_1_NMRREF_1_t027_1_id_model_06_2934_0 !

 :bounce:

 [:vtr webjo:3] à Big-Buen (inconnu sur le Forum :p).
Titre: Rosetta@home
Posté par: the layer le 04 juin 2008 à 11:25
Vous avez déjà eu ça :
04/06/2008 11:19:36|rosetta@home|Message from server: No work sent
04/06/2008 11:19:36|rosetta@home|Message from server: (won't finish in time) Computer on 41.1% of time, BOINC on 99.4% of that

Ca veut dire quoi ?
Titre: Rosetta@home
Posté par: xter757288 le 04 juin 2008 à 11:30
ca veut dire que ton PC est allumé 41% du temps , et que sur ces 41%, BOINC est allumé 99% du temps. Basé sur ces stats, le serveur refuse de t'envoyer du travail car il estime que tu n'aura pas le temps de finir les calculs;)
Titre: Rosetta@home
Posté par: the layer le 04 juin 2008 à 20:00
Citation de: xter757288
ca veut dire que ton PC est allumé 41% du temps , et que sur ces 41%, BOINC est allumé 99% du temps. Basé sur ces stats, le serveur refuse de t'envoyer du travail car il estime que tu n'aura pas le temps de finir les calculs;)


Ok merci
Titre: Rosetta@home
Posté par: Veedjee le 16 juin 2008 à 12:16
Bonjour,

Bonjour, il m'arrive regulierement d'avoir des calculs terminés mais bloqués en attente.

j'ai ainsi plusieurs taches en attente à 100% terminées , y a t-il une manip pour conclure le calcul et valider le credit ou bien suffit-il d'attendre (longtemps ??) ?

Le probleme est qu'en general lorsque cela arrive, le calcul se bloque à 100% et ne bascule pas sur une nouvelle tache ce qui empeche de faire avancer le schmilblick... pour continuer je suis obligé de suspendre le calcul et de le reactiver pour passer au suivant...

 :) voila, je ne sais pas si ma description est claire, mais j'aimerais bien trouver une solution, j'en est marre de constater le matin que l'ordi est resté en stand by toute la nuit a cause de ça...

merci pour votre aide. ;)
Titre: Rosetta@home
Posté par: rom_185 le 16 juin 2008 à 12:47
Tu as peut-être un manque de mémoire, quelle est la configuration de ta machine ?
As-tu des messages d'erreurs dans l'onglet messages ?

Fait aussi avancé>lire le fichier de préférences locales et donne le résultat des messages de l'onglet messages ;).
Titre: Rosetta@home
Posté par: Veedjee le 16 juin 2008 à 14:15
Citation de: rom_185
Tu as peut-être un manque de mémoire, quelle est la configuration de ta machine ?
As-tu des messages d'erreurs dans l'onglet messages ?

Fait aussi avancé>lire le fichier de préférences locales et donne le résultat des messages de l'onglet messages ;).

Hello, merci de m'aider ;)

alors pour l'onglet message, rien de particulier a signaler, voila quand meme les resultats de l'onglet:

lun 16 jun 2008 13:36:35 CEST|rosetta@home|Started download of t405_boinc_aad110j17_05.200_v1_3.gz
lun 16 jun 2008 13:37:45 CEST|rosetta@home|Computation for task t405__CASP8_JUMPAB_RES1to192_SAVE_ALL_OUT_BARCODE__3759_49791_0 finished
lun 16 jun 2008 13:37:45 CEST|rosetta@home|Starting d100j_BOINC_CASP8_ABRELAX_range_t405_IGNORE_THE_REST-S25-10-S3-11--d100j-_3747_405_0
lun 16 jun 2008 13:37:45 CEST|rosetta@home|Starting task d100j_BOINC_CASP8_ABRELAX_range_t405_IGNORE_THE_REST-S25-10-S3-11--d100j-_3747_405_0 using minirosetta version 128
lun 16 jun 2008 13:37:47 CEST|rosetta@home|Started upload of t405__CASP8_JUMPAB_RES1to192_SAVE_ALL_OUT_BARCODE__3759_49791_0_0
lun 16 jun 2008 13:37:50 CEST|rosetta@home|Finished upload of t405__CASP8_JUMPAB_RES1to192_SAVE_ALL_OUT_BARCODE__3759_49791_0_0
lun 16 jun 2008 13:43:38 CEST|rosetta@home|Finished download of t405_boinc_aad110j17_05.200_v1_3.gz
lun 16 jun 2008 14:02:29 CEST||General prefs: from rosetta@home (last modified 16-May-2008 14:48:16)
lun 16 jun 2008 14:02:29 CEST||Host location: none
lun 16 jun 2008 14:02:29 CEST||General prefs: using your defaults
lun 16 jun 2008 14:02:29 CEST||Reading preferences override file
lun 16 jun 2008 14:02:29 CEST||Preferences limit memory usage when active to 1510.34MB
lun 16 jun 2008 14:02:29 CEST||Preferences limit memory usage when idle to 1913.10MB
lun 16 jun 2008 14:02:29 CEST||Preferences limit disk usage to 12.11GB


la machine est un q6600 o/c 2gb ram sans soucis et très stable d'ordinaire, je tourne sous ubuntu64 8.04

EDIT: je m'apperçois que le probleme est egalement present sur un autre poste (AMD64) . d'autres ont-ils le meme soucis ?
Titre: Rosetta@home
Posté par: rom_185 le 16 juin 2008 à 14:58
Niveau mémoire c'est OK, c'est peut-être un problème de l'application mini rosetta, je vais prendre une UT et voir si j'ai le même problème ;).
Titre: Rosetta@home
Posté par: rom_185 le 16 juin 2008 à 15:02
Sur le site de rosetta :
Citer
June 10, 2008
The minirosetta application has been updated to version 1.28. This version contains a fix for the graphics application and jumping and loop modeling protocols. Please report bugs in this thread (http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=4149).
Si j'ai le même problème il faudra aller reporter le bug :).
Titre: Rosetta@home
Posté par: Veedjee le 16 juin 2008 à 15:09
Citation de: rom_185
Niveau mémoire c'est OK, c'est peut-être un problème de l'application mini rosetta, je vais prendre une UT et voir si j'ai le même problème ;).


du nouveau, je pense qu'en fait c'est effectivement la ram qui bloque. sous linux ---> fermer le serveurX, rel-log et puis hop, les taches auparavant bloquées à 100% se poursuivent... (retour à 80/85% puis calcul...).  Je pense que le système rentre dans un cercle vicieux. Les taches en attentes semblent s'accumuler dans la ram qui sature, bloquant à nouveau d'autres taches, etc ...

curiosité quand même, il semble que seule les taches commençant par : t405__CASP8_JUMPAB_RES81to192_SAVE_ALL_OUT_BARCODE subissent ce problème...

Si j'avais quelques brouzoufs j'ajouterais bien deux barrettes RAM en plus pour soulager...
Titre: Rosetta@home
Posté par: rom_185 le 16 juin 2008 à 15:15
Ok :jap:, je vais finir mon UT quand même pour voir ;).
Si tu veut tu peut aller poster sur le lien que je t'ai donné, ils pourrons peut-être amélioré l'application comme ça ;).
Titre: Rosetta@home
Posté par: Veedjee le 16 juin 2008 à 15:23
Citation de: rom_185
Ok :jap:, je vais finir mon UT quand même pour voir ;).
Si tu veut tu peut aller poster sur le lien que je t'ai donné, ils pourrons peut-être amélioré l'application comme ça ;).


Merci à toi, avant de poster sur ton lien je vais attendre un peu voir si toutes les taches accumulées se complètent normalement autrement j'irai le signaler.
Titre: Rosetta@home
Posté par: supersnoopy le 16 juin 2008 à 16:17

Pas eu ce problème,

en revanche le problème de saturation de mémoire avec toujours plus d'unités qui se lancent et sont stoppées en attente de mémoire, ça j'ai eu.

depuis 15 jours je n'ai plus ce problème...
Titre: Rosetta@home
Posté par: rom_185 le 16 juin 2008 à 16:54
Ok, bah sous mon ubuntu la mini rosetta c'est calculé sans problème :jap:.
Titre: Rosetta@home
Posté par: Veedjee le 16 juin 2008 à 17:16
Citation de: rom_185
Ok, bah sous mon ubuntu la mini rosetta c'est calculé sans problème :jap:.


c'est maheureusement Rosetta beta 5.96 qui coince, deja 8 tasks bloqués sur 100%

j'en ai 4 autres sur Rosetta Mini qui terminent normalement bientot, on va bien voir...
Titre: Rosetta@home
Posté par: Veedjee le 16 juin 2008 à 18:00
[quotemsg]j'en ai 4 autres sur Rosetta Mini qui terminent normalement bientot, on va bien voir...[/quote]

Rosetta mini passe sans probleme, d'ailleur après verification sur d'autres postes, toutes les taches rosetta beta se "freezent" une fois le calcul arrivé à 100%
Titre: Rosetta@home
Posté par: Heyoka le 16 juin 2008 à 18:18
Je penche aussi sur un manque de mémoire vive, les unités Rosetta peuvent monter jusqu'à 500 Mo de ram chacune.
Donc 75% de 2 Go de ram quand tu calcule 4 unités en même temps ça se remplit vite

Essaye dans le menu en haut :
Avancé -  préférences...
Utilisation du disque et de la mémoire

Use at most 85 ou 90% de la mémoire physique.

Sinon essaye d'associer Rosetta à un autre projet bio-médical qui utilise moins la ram (Docking, POEM, Simap ou Tanpanku).
Par exemple POEM et Rosetta en 50/50. Il y aura toujours 2 unités POEM à 35 Mo max et 2 unités Rosetta à 500 Mo max.

Titre: Rosetta@home
Posté par: rom_185 le 16 juin 2008 à 18:36
Citation de: Veedjee
c'est maheureusement Rosetta beta 5.96 qui coince, deja 8 tasks bloqués sur 100%

j'en ai 4 autres sur Rosetta Mini qui terminent normalement bientot, on va bien voir...
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/result.php?resultid=171695131
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/result.php?resultid=171692589
En mini rosetta comme en rosetta beta tout va bien ici :spamafote:.



Titre: Rosetta@home
Posté par: Veedjee le 16 juin 2008 à 19:05
Citation de: rom_185
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/result.php?resultid=171695131
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/result.php?resultid=171692589
En mini rosetta comme en rosetta beta tout va bien ici :spamafote:.


aie aie aie...

finalement je crois bien que le problème viens de la ram... bizarre pourtant depuis un peu plus d'un mois que je suis sur le projet, je n'avais jamais eu d'ennuis...

tout à l'heure j'ai reçu le message suivant:

lun 16 jun 2008 18:54:45 CEST|rosetta@home|Task t405__CASP8_JUMPAB_RES81to192_SAVE_ALL_OUT_BARCODE__3758_3350_0 exited with zero status but no 'finished' file
lun 16 jun 2008 18:54:45 CEST|rosetta@home|If this happens repeatedly you may need to reset the project.

ceci même après avoir augmenter le pourcentage ram:

lun 16 jun 2008 18:24:13 CEST||Preferences limit memory usage when active to 1812.41MB
lun 16 jun 2008 18:24:13 CEST||Preferences limit memory usage when idle to 1913.10MB
lun 16 jun 2008 18:24:13 CEST||Preferences limit disk usage to 12.11GB


 :(
Titre: Rosetta@home
Posté par: rom_185 le 16 juin 2008 à 20:07
Dans l'onglet projets, sélectionne rosetta et clic sur recommencer le projet ;).
Attention tu perdra tous tes calculs en cour !
Titre: Rosetta@home
Posté par: Veedjee le 16 juin 2008 à 20:14
Citation de: rom_185
Dans l'onglet projets, sélectionne rosetta et clic sur recommencer le projet ;).
Attention tu perdra tous tes calculs en cour !


EDIT: allez hop on reset tout ça, j'espere que cela reglera le probleme
Titre: Rosetta@home
Posté par: supersnoopy le 17 juin 2008 à 09:12
Citation de: Heyoka

Par exemple POEM et Rosetta en 50/50. Il y aura toujours 2 unités POEM à 35 Mo max et 2 unités Rosetta à 500 Mo max.


Moi j'ai pas aimé ce mélange Rosetta / Poem

car Poem passe systématiquement devant (high priority), ce qui fait que je calcule 2 Poem à la fois, puis plus tard, 2 Rosetta.

je ne sais pas si vous avez eu ce souci également
Titre: Rosetta@home
Posté par: Ryzen le 05 août 2008 à 19:28
j ai une petite question: sur le site de l'alliance francophone et en allant sur le projet rosetta on a ça:

"Détail technique : lien pour rêgler la durée d'une unité de calcul. Appuyer sur Edit Rosetta@home preferences. Target CPU run time. Choisir dans le menu déroulant la durée qui vous convient, ça va de 1 heure à 24h. Sauvegarder en appuyant sur Update preferences. "

je peux alors calculer une unité plus rapidement? car la ça me prend 2h40 à peu près. Ou alors ça dépend de mon pc?
Titre: Rosetta@home
Posté par: GuL le 05 août 2008 à 23:24
Citation de: Ryzen
j ai une petite question: sur le site de l'alliance francophone et en allant sur le projet rosetta on a ça:

"Détail technique : lien pour rêgler la durée d'une unité de calcul. Appuyer sur Edit Rosetta@home preferences. Target CPU run time. Choisir dans le menu déroulant la durée qui vous convient, ça va de 1 heure à 24h. Sauvegarder en appuyant sur Update preferences. "

je peux alors calculer une unité plus rapidement? car la ça me prend 2h40 à peu près. Ou alors ça dépend de mon pc?


Salut Ryzen,

Le temps de calcul d'une unité dépends de la puissance de ton proc, mais aussi de la vitesse de ton bus et de la ram, selon les projets.
Si je comprends bien cette option, ça permet juste de télécharger des unités plus courtes en fonction de ta demande.
Bon crunch  :bounce:
Titre: Rosetta@home
Posté par: Ryzen le 05 août 2008 à 23:37
mais des unités plus courtes rapportent moins de crédits c'est ça?
Titre: Rosetta@home
Posté par: GuL le 05 août 2008 à 23:45
Citation de: Ryzen
mais des unités plus courtes rapportent moins de crédits c'est ça?

exactement, mais c'est utile si tu as plusieurs projets par exemple, ou que ton ordi est peu allumé
Titre: Rosetta@home
Posté par: mamouth le 06 août 2008 à 08:37
Non ce n'est pas correct

la même unité peut être calculée en 3h ou en 24h en fonction des préférences du compte

si tu utilises 24h l'application va tenter beaucoup plus de pliage de la protéine qu'en 3 heures. le meilleur résultat est ensuite renvoyé

Les crédits sont +- proportionnel au temps de calcul, normalement ça ne changera pas grand chose de calculer 3h ou 24h

Le gros avantage c'est que tu peux fortement réduire le traffic internet en calculant longtemps sur la même UT
Titre: Rosetta@home
Posté par: Ryzen le 06 août 2008 à 18:03
en gros si je met une 1h quesque ça fait de plus?

"si tu utilises 24h l'application va tenter beaucoup plus de pliage de la protéine qu'en 3 heures. le meilleur résultat est ensuite renvoyé  "

prce qu'en 3h les résultats ne sont pas les mêmes qu'en 24h?

désolé de poser autant de question mais je comprends pas tout là!
Titre: Rosetta@home
Posté par: GuL le 06 août 2008 à 19:42
Citation de: mamouth
Non ce n'est pas correct
 

Merci de la précision Mamouth, ça ne me serais pas venu à l'esprit  :jap:
Titre: Rosetta@home
Posté par: rom_185 le 06 août 2008 à 21:44
Plus tu calculera longtemps une UT, plus ça "précision" sera bonne, mais au bout d'un moment la précision d'une UT n'augmente plus, c'est pour cela que c'est 3H de calcul par défaut.
Si au bout des 3H la précision augmente toujours, l'UT sera renvoyé à une autre personne pour pousser la précision plus loin, sinon son calcul s'arrête.

Pour faire simple  :o.
Titre: Rosetta@home
Posté par: rom_185 le 06 août 2008 à 21:46
L'application Rosetta Mini vient de passer en version 1.32 :).
Titre: Rosetta@home
Posté par: Damien le 06 août 2008 à 23:51
[:czame17:7] [:czame17:7] [:czame17:7]

[spoiler]Voilà votre tête suite à ce que je viens de mettre :

 :sarcastic: [/spoiler]

[spoiler]Voici la tête de Rom_185 suite à ce même message :

 :lol: [/spoiler]
Titre: Rosetta@home
Posté par: rom_185 le 06 août 2008 à 23:58
Non, j'avais pas compris alors j'ai fais " :heink: " :o...
Titre: Rosetta@home
Posté par: kyuzo le 15 août 2008 à 11:44
Citation de: Ryzen
en gros si je met une 1h quesque ça fait de plus?

"si tu utilises 24h l'application va tenter beaucoup plus de pliage de la protéine qu'en 3 heures. le meilleur résultat est ensuite renvoyé  "

prce qu'en 3h les résultats ne sont pas les mêmes qu'en 24h?

désolé de poser autant de question mais je comprends pas tout là!



En regardant les graphiques des temps en temps (oui, je sais j'ai rien d'autre a faire ^^) j'ai remarqué que même sur une unitée de 3 heures, tu calcules plusieurs protéines. et c'est pour cela que les unitées ne sont pas exactement de 3 heures juste, mais ça peut varier entre 2h30 et aller jusque 4 heures.
Titre: Rosetta@home
Posté par: rom_185 le 19 août 2008 à 19:56
Citer
Aug 18, 2008
Predictor of the day: Congratulations to [AF>DoJ]refresh (Team L'Alliance Francophone) for predicting the lowest energy structure for workunit t443__d011a_CASP8_LONGRANGE_JUMP_SAVE_ALL_OUT_BARCODE__4127_0 !
:bounce:
Titre: Rosetta@home
Posté par: supersnoopy le 19 août 2008 à 22:53

Refresh est en vacances en ce moment, mais je vais lui passer l'info ... ça fait toujours plaisir quand même !

bien vu rom ;)

:jap:
Titre: Rosetta@home
Posté par: rom_185 le 19 août 2008 à 23:39
Tu lui dira que je l'ai rajouté postérité en bas de l'article sur Rosetta :p : http://www.boinc-af.org/content/view/26/219/
Titre: Rosetta@home
Posté par: al@ON le 20 août 2008 à 19:58
Citation de: rom_185
Tu lui dira que je l'ai rajouté en pour la postérité ;)  :p en bas de l'article sur Rosetta :p : http://www.boinc-af.org/content/view/26/219/

Titre: Rosetta@home
Posté par: rom_185 le 20 août 2008 à 22:51
Un peut maniaque sur les bords :lol: ;) !
Titre: Rosetta@home
Posté par: al@ON le 20 août 2008 à 23:18
Citation de: rom_185
Un peut maniaque sur les bords :lol: ;) !

 :non:, simplement "en postérité" ça ne veut rien dire. [:jwhy]
Titre: Rosetta@home
Posté par: rom_185 le 21 août 2008 à 01:19
J'ai encore le droit de faire des fautes frappes :na:...
Titre: Rosetta@home
Posté par: kyuzo le 23 août 2008 à 19:03
Tiens, c'est juste pour moi, ou rosetta crédite moins qu'avant, car la je suis à un rac de 1300 et si mes souvenirs sont bons, avant j'avais quand même 1600 à 1700 (avec xp 32 bits à chaque fois).
Optimisation moins bonne avec rosetta mini que rosetta beta?
Titre: Rosetta@home
Posté par: RLDF le 23 août 2008 à 21:08
c'est sur que c'est pas le projet qui crédite le mieux, il faut plutôt taper dans du cels,yoyo,milky ou ps3grid :)
Titre: Rosetta@home
Posté par: kyuzo le 23 août 2008 à 21:17
Mais je suis très bien chez rosetta et je sais que ça n'as jamais été un projet qui crédite énormément, mais j'ai l'impression que c'est moins qu'avant et je voulais juste savoir si c'est juste moi qui croit ça ou si ça crédite encore moins.
Titre: Rosetta@home
Posté par: RLDF le 24 août 2008 à 00:14
c'est étonnant, les chiffres montrent l'inverse
au 17 août, rosetta donnait 76,4% des crédits seti
aujourd'hui il donne 82,2% des crédits seti

sur le site de comparaison (http://boinc.netsoft-online.com/e107_plugins/boinc/get_cpcs.php)
Titre: Rosetta@home
Posté par: kyuzo le 24 août 2008 à 01:10
Ah ouais, bizarre, ptet qu'ils ont fait cette comparaison par rapport a des unitées beta, mais depuis quelques jours, il n'y a quasiment plus que des mini.
Titre: Rosetta@home
Posté par: rom_185 le 24 août 2008 à 01:34
Les crédits SETI ont peut être changés :p.
Titre: Rosetta@home
Posté par: RLDF le 24 août 2008 à 01:47
Citation de: rom_185
Les crédits SETI ont peut être changés :p.


possible aussi
Titre: Rosetta@home
Posté par: Ryzen le 15 septembre 2008 à 12:59
News

Sept 14, 2008
We are currently participating to the first competition for modeling the structure of an important biological receptor. This protein is much larger than all the targets submitted so far and the calculation should last around 3 hours per model on a normal machine. The jobs start with 'AA2A.' If you have a short run time preference and you notice these jobs running past it, please do not abort them.

14 septembre 2008,
Nous participons  actuellement à la première compétition pour modéliser la structure d’un important récepteur biologique. Cette protéine est beaucoup plus grande que toutes les autres cibles présentées à ce jour et son calcul devrait durer environ 3h par modèle sur une machine normal. Les unités commenceront par « AA2A ». Si vous avez une préférence de temps de calcul courte et que vous remarquez que ces unités mettent plus de temps, s’il vous plait, ne les arrêtez pas.


Je ne suis pas sur du sens de la dernière phrase.
Titre: Rosetta@home
Posté par: tristesire le 15 septembre 2008 à 13:30
Je confirme ta traduction Ryzen, bien que je ne soit pas un Kador en Anglais
Titre: Rosetta@home
Posté par: julienh le 22 septembre 2008 à 23:06
Avec un peu de retard...  [:frederic]

Sep 15, 2008
Predictor of the day: Congratulations to [AF>France>Est>Alsace] Thierry (Team L'Alliance Francophone) for predicting the lowest energy structure for workunit t466__CASP8_JUMPAB_CROSSBETA_SAVE_ALL_OUT_SELECT_BARCODE_hom001__4216_0 !

Titre: Rosetta@home
Posté par: supersnoopy le 23 septembre 2008 à 01:04

ça crédite pô des masses ces derniers temps ...

Titre: Rosetta@home
Posté par: al@ON le 23 septembre 2008 à 18:54
Citation de: supersnoopy

ça crédite pô des masses ces derniers temps ...

Pourquoi avant Rosetta créditait :??:... on m'aurait menti! :D
Titre: Rosetta@home
Posté par: RLDF le 18 octobre 2008 à 13:32
rosetta HS chez moi aujourd'hui

tant mieux, ça fera plus d'UT ibercivis en crunch  :lol:
Titre: Rosetta@home
Posté par: al@ON le 18 octobre 2008 à 17:06
Citation de: RLDF
rosetta HS chez moi aujourd'hui

tant mieux, ça fera plus d'UT ibercivis en crunch  :lol:

Wouais! C'est tout bon pour le RAID. :D
Titre: Rosetta@home
Posté par: Ryzen le 18 octobre 2008 à 21:54
Oct 18, 2008
We're having increasing problems with our project's fileserver, causing intermittent outages. We're in the process of building out the replacement system but it is going to take some time to iron out the issues. We apologize for the troubles.

18 oct 2008
Nous avons de plus en plus de problèmes avec notre serveur de données, ce qui provoque des pannes intermittentes. Nous sommes en train de créer un système de remplacement, mais cela va prendre un certain temps pour corriger les problèmes. Nous nous excusons pour les troubles.
Titre: Rosetta@home
Posté par: RLDF le 18 octobre 2008 à 23:17
merci pour les infos  :hello:
Titre: Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 08 novembre 2008 à 02:45
 [:ousermaatre:3]  J'ai un souci, je n'ai plus les diagrammes en vision de rosetta
mais c'est du beta ptetre qu'il n'y a pas d'image visible ?
Titre: Rosetta@home
Posté par: supersnoopy le 08 novembre 2008 à 08:40
 :hello:
Bah moi j'avoue que je ne sais pas ce que c'est que les diagrammes en vision... ?
Titre: Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 08 novembre 2008 à 09:51
 [:ousermaatre:3]  désolé c'est vrai que ce n'est pas très français !
Lorsque le calcul est en travail, on peut voir son évolution dans un graphique-image
Mais pour les unités beta je n'ai pas ce graphique.
Est-ce plus clair ?
Titre: Rosetta@home
Posté par: Hildor le 08 novembre 2008 à 12:23

C'est surement cela, bien que je ne crunch pas sur Rosetta en ce moment !
 :hello:
Titre: Rosetta@home
Posté par: al@ON le 08 novembre 2008 à 12:29
Citation de: ousermaatre
[:ousermaatre:3]  désolé c'est vrai que ce n'est pas très français !
Lorsque le calcul est en travail, on peut voir son évolution dans un graphique-image
Mais pour les unités beta je n'ai pas ce graphique.
Est-ce plus clair ?

En ce moment je ne calcule pas sur ce projet mais même si j'y étais je ne saurais te répondre car à l'install de BOINC je n'ai pas coché "Make BOINC your default screensaver" c'est joli mais ça bouffe trop de ressources. [:jwhy]

ÉDIT: Dans BOINC Manager > Tâches sélectionne Rosetta et si à "Commandes" "Montrer les graphiques" est grisé bin c'est qu'ils n'en ont pas programmés. :ange:
Titre: Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 08 novembre 2008 à 12:38
 :jap: Merci Hildor et al@ON pour les infos.
 :jap:
Titre: Rosetta@home
Posté par: la frite le 09 novembre 2008 à 14:30
Salut! je viens de recalculer qques unités sur le projet après avoir arreter pendant longtmps et j'ai une question.
Comment ça se fait que pour des unités toutes de pratiquement même longueur (10 000s) pour certaines je reçois 40 d'autres 100 et enfin d'autres 140 crédits pour le même temps de travail?!!
Titre: Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 09 novembre 2008 à 20:13
 [:ousermaatre:3] la frite
Je n'ai pas eu ce problème, si c'en est un
Les unités chez moi durent environ 2h30-2h50
Je suis plutôt à 30 crédits.
J'ai vu que certaines duraient un peu plus longtemps, mais jamais jusqu'à 140 crédits.
Désolé de ne pouvoir te répondre.
Titre: Rosetta@home
Posté par: rom_185 le 10 novembre 2008 à 00:58
@ousermaatre : La durée des UT est modifiable dans ton compte, par défaut c'est 3H environs.
@la frite : le nombre de points est calibré sur la précision avec la quelle ton processeur a replié la protéine, plus une protéine est bien repliée plus elle rapporte de points :p.

Titre: Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 10 novembre 2008 à 02:15
Citation de: rom_185
@ousermaatre : La durée des UT est modifiable dans ton compte, par défaut c'est 3H environs.



Merci rom 185
Titre: Rosetta@home
Posté par: fr@ntz le 13 novembre 2008 à 22:23
Si on continue comme ça, on aura 1 point Fb pour Noël... et un autre pour nos étrennes. :D

http://statseb.gotdns.org/details_FB.py?projet=42
Titre: Rosetta@home
Posté par: rom_185 le 14 novembre 2008 à 19:21
 :hello: Frantz, et merci de nous tenir au courant des mouvements du FB :) !
Titre: Rosetta@home
Posté par: supersnoopy le 14 novembre 2008 à 20:24

J'ai encore eu quelques très grosses unités ces deniers temps, genre 300 Mo et plus...

Sur un quad avec seulement 2 Go de RAM, c'est trop juste, du coup....
2 Go supplémentaires vont arriver en renfort ;)
(vu les prix actuels de la DDR2)
Titre: Rosetta@home
Posté par: gregoryd01 le 14 novembre 2008 à 22:52
Citer
November 14, 2008
Outage Notice: the project will be down for maintenance starting at 2:00 PST today.

On an unrelated note: WE ARE PLANNING TO INCREASE THE DEFAULT RUN TIME TO 6 HOURS AND THE MINIMUM TO 3 TO REDUCE THE LOAD ON OUR SERVERS. When and how this will occur has not yet been decided. If you have any concerns or would like to add to the discussion please post to this thread.


November 14, 2008
Our fileserver crashed last night. We are planning to upgrade the system very soon. Sorry for any inconvenience.

En gros, le serveur de fichiers a crashé, et le projet va être stoppé pour maintenance. Ils vont augmenter la durée des WU à 6h et le minimum à 3h, mais on ne sait pas à partir de quand, c'est pas encore décidé.
Titre: Rosetta@home
Posté par: fr@ntz le 21 novembre 2008 à 20:43
Il faudrait que ça revienne vite, on peut encore gratter 2 points avant la ligne d'arrivée du FB 2008 !
Titre: Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 21 novembre 2008 à 20:59
[:ousermaatre:3] lu étant novice, je ne comprends pas trop l'histoire des 2 points ?
Frantz tu m'expliques ? :??:  :??:
Sinon, j'ai fait de rosetta l'activité principale de mon pc après avoir vu la vidéo sur dailymotion, excellent!

Edit: Viens de comprendre en cherchant bien, Formula boinc.
Titre: Rosetta@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 21 novembre 2008 à 22:14
Il y a différents statistiques afin de motiver les participants.
L'AF à fait un site de stats différent des autres, en proposant un classement via points comme en formula : Formula Boinc.
Titre: Rosetta@home
Posté par: al@ON le 21 novembre 2008 à 22:46

Pour compléter les propos de dudumomo ;) je dirais que le FB (projet pensé par otax :love: et mis en œuvre par jump :love:) oblige les équipe voulant y participer à cruncher sur la totalité des projets mais évite par ce fait de délaisser les petits projets ainsi que les moins rémunérateurs en terme de crédits. :ange:
Titre: Rosetta@home
Posté par: rom_185 le 21 novembre 2008 à 23:47
Citation de: frantz
Il faudrait que ça revienne vite, on peut encore gratter 2 points avant la ligne d'arrivée du FB 2008 !
C'est revenu très vite après la panne, je calculai dessus au moment de la panne et rien qu'avec le cache j'ai tenu jusqu'à ce que ça revienne.
Le site indiquait un problème mais lui aussi est vite revenu  :).

Je suis toujours dessus là et aucun problème  :jap:.

Titre: Rosetta@home
Posté par: al@ON le 21 novembre 2008 à 23:59
 [:al@on:3] rom

Citation de: rom_185
C'est revenu très vite après la panne, je calculai dessus au moment de la panne et rien qu'avec le cache j'ai tenu jusqu'à ce que ça revienne.
Le site indiquait un problème mais lui aussi est vite revenu  :).

Je suis toujours dessus là et aucun problème  :jap:.
[spoiler]Pour changer tu devrais essayer de te mettre dessous. :whistle: [/spoiler]


 .......................................... [:douglas riper]
Titre: Rosetta@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 22 novembre 2008 à 10:40
 :lol:  :lol:
Titre: Rosetta@home
Posté par: rom_185 le 22 novembre 2008 à 13:44
 :D kilébête :p !
Titre: Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 24 novembre 2008 à 17:14
 [:ousermaatre:3] Nouveau blem pour moi je n'arrive plus à obtenir de nouvelles unités qqn
a-t-il le même ennui ?
Titre: Rosetta@home
Posté par: Meteore31 le 25 novembre 2008 à 13:09
nous sommes menacés par SUSA sur Rosetta Alpha, un peu d'aide svp...
Titre: Rosetta@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 25 novembre 2008 à 21:04
Sur Rosetta alpha.....Ya pas grand monde dessus...et puis on est encore bien plus menacé sur ABC !!!!
Titre: Rosetta@home
Posté par: fr@ntz le 26 novembre 2008 à 20:34
Citation de: meteore
nous sommes menacés par SUSA sur Rosetta Alpha, un peu d'aide svp...


Les projets Alpha ne comptent pas pour le Formula Boinc
http://www.myboinc.com/FormulaBoinc/FBrules.php

Par contre, sur Rosetta@home, on peut gagner 2 points FB avant la fin du championnat (de quoi compenser ce qu'on risque de perdre sur ABC, avec beaucoup moins d'énergie)  :)
http://statseb.gotdns.org/details_FB.py?projet=42

(http://statseb.gotdns.org/img/FB_Rosetta_total.png)
Titre: Rosetta@home
Posté par: pas93 le 02 décembre 2008 à 01:42
http://www.boinc-af.org/content/view/1063/305/

Cela fait énormément de bien de savoir que l'on ne calcul pas pour rien  :bounce:  :bounce:  [:frederic]
Titre: Rosetta@home
Posté par: supersnoopy le 02 décembre 2008 à 07:56

merci pour ce lien pas.

je pense que je vais l'envoyer a pas mal de personne qui m'entende parler de BOINC et me regardent d'un air amusé ;)

:bounce:
Titre: Rosetta@home
Posté par: pas93 le 02 décembre 2008 à 10:56
 :bounce:  :bounce:  [:frederic]
Titre: Rosetta@home
Posté par: mamouth le 02 décembre 2008 à 18:13
depuis toujours je sais que c'est un des projets qui a le plus haut potentiel pour faire des découvertes importantes
Titre: Rosetta@home
Posté par: pas93 le 02 décembre 2008 à 19:25
Oui, se projet m'a souvent motiver avec ces publications  :bounce:  :bounce:
Titre: Rosetta@home
Posté par: supersnoopy le 02 décembre 2008 à 21:20

Clair que c'est pas leur générosité en points qui motive le plus !  :lol:
Titre: Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 02 décembre 2008 à 21:46
 :love:  :love:  :love:  :love: Sentir qu'un projet est concrètement utile dans le présent
y a rien de mieux.
C'est là toute la motivation à cruncher [:bubletitan]
Titre: Rosetta@home
Posté par: pas93 le 02 décembre 2008 à 23:24
 :bounce:  :bounce:  [:frederic]
Titre: Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 03 décembre 2008 à 00:36
 :bounce:  :bounce:  [:frederic]  [:ousermaatre:4]
Titre: Rosetta@home
Posté par: BLE le 03 décembre 2008 à 15:05
Mes 30 résultats en attentes sont partis
Titre: Rosetta@home
Posté par: Damien le 03 décembre 2008 à 17:39
Citation de: BLE
Mes 30 résultats en attentes sont partis


[:frederic]
Titre: Rosetta@home
Posté par: Ryzen le 10 décembre 2008 à 20:16
l'équipe du projet annonce qu'il recommande d'avoir 512mo de mémoire au lieu des 256Mo d'avant pour faire avancer les calculs.
Titre: Rosetta@home
Posté par: supersnoopy le 11 décembre 2008 à 00:05

 :lol:  cte blague, avec des unités de 200, parfois 300 Mo occupés en mémoire...

Titre: Rosetta@home
Posté par: Flo le 11 décembre 2008 à 20:40
ouais, moi avec mes 512 sous Ubuntu mon PC est un peu lourd à l'usage, je dirais que 512 c'est le minimum
Titre: Rosetta@home
Posté par: Ryzen le 16 décembre 2008 à 09:11
petite question. pendant les vacances j'aurais pas de connexions internet chez moi. Je voulais savoir par exemple si je mets les unités de rosetta à 12h cela augmente aussi la date d'expiration des unités.

j'irais sur wcg autrement.
Titre: Rosetta@home
Posté par: Meteore31 le 16 décembre 2008 à 09:33
met ton cache à 10 jours et télécharge des wus sur des gros projets, style Climate, Einstein, WCG

fais attention aux deadlines
Titre: Rosetta@home
Posté par: Ryzen le 16 décembre 2008 à 10:22
oui, si les deadlines de rosetta ne sont pas assez importantes j'irais sur wcg mais j'aimerais savoir si j'augmente la durée des unités de rosetta les deadlines augmentent elles aussi?
Titre: Rosetta@home
Posté par: supersnoopy le 16 décembre 2008 à 11:03

Je ne sais pas non plus.

D'ailleurs j'aimerais savoir si la taille mémoire des unités augmente également en fonction de la durée de calcul.
et les points rapportés ?

En tout cas lorsqu'il m'est arrivé de devoir prendre le portable pour 10 jours déconnectés, j'ai augmenté le cache comme dit Meteore, et j'avais masse boulot pendant la durée des vacances. Il me semble que le scheduler calcule les deadlines des unités demandées en fonction de ta puissance de calcul.

et je n'avais pas eu de soucis de deadline.

 :jap:
Titre: Rosetta@home
Posté par: mamouth le 16 décembre 2008 à 13:40
Sur Rosetta les deadlines restent les même peut importe la durée de l'UT
Titre: Rosetta@home
Posté par: Ryzen le 16 décembre 2008 à 15:39
ok merci mamouth donc go to wcg
Titre: Rosetta@home
Posté par: tibidao le 16 décembre 2008 à 20:04
Concernant les deadlines des projets, il y a un article sur le sit de L'AF :

http://www.boinc-af.org/content/view/737/149/

Bon j'ai l'impression que c'est pas tout à fait à jour, va falloir qu'on vérifie ça, mais ça donne déjà des pistes.  ;)
Titre: Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 19 décembre 2008 à 23:02
 [:ousermaatre:6] hello
j'ai obtenu une UT d'environ 5h30, est-ce les nouvelles unités dont
les créateurs du projet ont parlé dernièrement?
Titre: Rosetta@home
Posté par: GuL le 28 décembre 2008 à 19:27
Citation de: tibidao
Concernant les deadlines des projets, il y a un article sur le sit de L'AF :

http://www.boinc-af.org/content/view/737/149/

Bon j'ai l'impression que c'est pas tout à fait à jour, va falloir qu'on vérifie ça, mais ça donne déjà des pistes.  ;)

Super info, je ne la connaissais pas :jap:
Titre: Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 05 janvier 2009 à 15:04
Re  [:ousermaatre:3]  à tous
Je comprends pas celà fait plusieurs jours que je reçois plus d'Ut du projet , malgré mes demandes incessantes, avez-vous une solution?
Titre: Rosetta@home
Posté par: supersnoopy le 05 janvier 2009 à 15:15
Salut, pareil ici.

En fait, si tu vas sur le site du projet, il n'y a plus de "ready to send".

http://boinc.bakerlab.org/rosetta/rah_status.php

ici les deux "make work" sont stoppés.

la solution c'est de basculer sur POEM ... (ou autre)  :D

edit :

ou bien sur ABC (projet de maths) sur lequel se déroule un bras de fer final entre l'AF et SUSA avant la fin du projet.

Titre: Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 05 janvier 2009 à 16:44
Merci supersnoopy :jap:  :jap:
Titre: Rosetta@home
Posté par: supersnoopy le 05 janvier 2009 à 20:40

C'est reparti maintenant. un "mettre à jour" pour gagner du temps sur le "communication différée" et c'est OK.

Titre: Rosetta@home
Posté par: viny le 06 janvier 2009 à 00:33
Citation de: supersnoopy
Salut, pareil ici.

En fait, si tu vas sur le site du projet, il n'y a plus de "ready to send".

http://boinc.bakerlab.org/rosetta/rah_status.php

ici les deux "make work" sont stoppés.

la solution c'est de basculer sur POEM ... (ou autre)  :D

edit :

ou bien sur ABC (projet de maths) sur lequel se déroule un bras de fer final entre l'AF et SUSA avant la fin du projet.



La solution c'est d'être sur les deux.

Tu rajoutes Docking et WCG et tu deviens un EDLS, voir même un Biomed.

 [:modesti:1]

 :hello:

Titre: Rosetta@home
Posté par: pas93 le 06 janvier 2009 à 14:09
Oui, mais aucune avec assez de travail :(
Titre: Rosetta@home
Posté par: fr@ntz le 23 février 2009 à 11:31
Comme sur d'autres projets, l'AF est menacée au FB par l'équipe CANADA. (http://statseb.gotdns.org/details_FB.py?projet=42)
Ne nous faisons pas bouter hors du podium par ces affreux anglophones ! Aidons les Québequois à résister, il manque quand même près de 25300 points de Rac  [:yada44:4]
Titre: Rosetta@home
Posté par: alipse le 23 février 2009 à 11:33
C'est presque une attaque organisée, là ou les Ricains ne sont pas...
Titre: Rosetta@home
Posté par: fr@ntz le 05 mars 2009 à 06:56
Citation de: alipse
C'est presque une attaque organisée, là ou les Ricains ne sont pas...


Faut pas non plus être parano. Les gaulois sont juste un peu bordéliques et ne connaissent que 2 modes : la sortie d'attaque en masse façon Astérix à laquelle peu de légions peuvent résister, et le saupoudrage spontané au petit bonheur sans coordination : si ça répond à la demande, tant mieux, si c'est mal réparti comme actuellement, tant pis  [:jwhy].
Donc malgré notre puissance de feu, nous sommes vulnérables à la moindre petite opposition organisée (c'est le cas ici, le Canada nous a doublé), voire à l'initative d'un seul gros cruncher (ex de Ralp des BS sur Virtual prairie)
Titre: Rosetta@home
Posté par: JeromeC le 06 mars 2009 à 09:24
Ben je préfère de loin mon statut de gaulois c'est beaucoup plus fun que les légions romaines :-)
Titre: Rosetta@home
Posté par: Pascal94 le 11 mars 2009 à 23:18
Citer
March 11, 2009

Take a look at the recent work you've made possible with your contributions! D. Baker discusses the six (6!) manuscripts that the group is publishing, having used the computing power-house that is R@H, in the Rosetta@home Journal (http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=1177).


Titre: Rosetta@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 12 mars 2009 à 00:24
Merci Pascal.
C'est bien interessant leurs découvertes !
Titre: Rosetta@home
Posté par: fafa_at_work le 31 mars 2009 à 00:41
Citation de: frantz
Comme sur d'autres projets, l'AF est menacée au FB par l'équipe CANADA. (http://statseb.gotdns.org/details_FB.py?projet=42)
Ne nous faisons pas bouter hors du podium par ces affreux anglophones ! Aidons les Québequois à résister, il manque quand même près de 25300 points de Rac  [:yada44:4]
Au RAC, on est repassé devant le canada et on talonne le team UK  :bounce:  :bounce:  :bounce:
5e! :sol:  :sol:  :sol:  :sol:  :sol:
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/top_teams.php
Titre: Rosetta@home
Posté par: RLDF le 31 mars 2009 à 08:22
j'ai mis un peu de puissance dessus, on va y arriver :)
Titre: Rosetta@home
Posté par: fafa_at_work le 01 avril 2009 à 00:02
Citation de: RLDF
j'ai mis un peu de puissance dessus, on va y arriver :)


  :ouch:  :ouch: ouah c'est toi le mammouth qui est 5e de l'AF???
ben effectivement ça se sent que tu as mis "un peu de puissance" puisqu'on est passé 4e!!!!  :bounce:  :bounce:  :bounce:
devant le team UK et canada!! :bounce:
ça serait bien que l'AF le mette dans la page d'accueil ou dans les news, que l'AF sur Rosetta est passé de la 6e place à la 4e en à peine 2jours!!!  :ouch:  :ouch:  :bounce:  :bounce:  :bounce:  :bounce:
Titre: Rosetta@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 01 avril 2009 à 00:25
Seulement en RAC. On est toujours 9eme au général, mais ca remonte. On pourrai bien passer dans un futur pas trop loin, 7eme voir 6eme !
Titre: Rosetta@home
Posté par: supersnoopy le 01 avril 2009 à 10:13

Depuis hier j'ai une bonne poignée d'UT Rosetta en erreur sur la machine qui fait du milkyway-GPU en même temps.
 :(
Titre: Rosetta@home
Posté par: fr@ntz le 01 avril 2009 à 10:57
On retrouve (provisoirement) le podium FB sur ce projet : http://statseb.gotdns.org/details_FB.py?projet=42

 :jap: merci les gars / les filles  :jap:
Titre: Rosetta@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 01 avril 2009 à 16:05
Bientot 3eme du podium... !
Faudrait garder ce rythme ^^
Titre: Rosetta@home
Posté par: Netrider le 04 avril 2009 à 19:17
Citation de: supersnoopy

Depuis hier j'ai une bonne poignée d'UT Rosetta en erreur sur la machine qui fait du milkyway-GPU en même temps.
 :(



Rosetta ne supporte pas l'OC j'en ai fait la triste expérience donc j'ai mis au max 10 % d'OC sur mes pc, au delas ca coince
De plus je tourne avec Milky en // cpu et gpu, et ca roule en boule. ( Milkshake a la rose ) :lol:
j'ai que du bidulemachin 64 bits et 4 go ram ca aide peut etre aussi je sait pas

 :hello:
Titre: Rosetta@home
Posté par: supersnoopy le 04 avril 2009 à 20:25

je pense que l'o/c n'a rien à voir là dedans... :o

d'une part parce qu'une machine oc stable tourne très bien avec Rosetta (j'ai un Q6600 qui a tourné 1 an @ 3,6 GHz sans erreur)

d'autre part parce que la machine en question est un Dell du boulot qui tourne @ stock (quel dommage d'ailleurs ! mais bios trop limité pour permettre l'o/c)

pour tes PC o/c je te suggère de tester leur stabilité avec OCCT pendant au minimum 30 minutes.

...

Si je suis le seul a avoir eu des erreurs, il s'agit peut-être d'un "pas de bol"

:jap:
Titre: Rosetta@home
Posté par: Netrider le 05 avril 2009 à 06:19
J'ai passé occt sur la plupart de mes machines et au delas de 10 % il y en a la moitiée en erreur  :sweat: Ram pas assez balaise de la 800 au lieu de la 1066 pour la plupart. Ca se répêrcute sur certains projets mais pas tous, exemple Primgrid je peut faire tourner a fond sans soucis.

Ptetre une question de ficelage des wu il doit y en avoir de plus sérrées que d'autres  :hello:
Titre: Rosetta@home
Posté par: supersnoopy le 05 avril 2009 à 08:57

SI tu pense que c'est la Ram qui limite la montée du Fsb, tu peux essayer de la désynchroniser vers le bas ou relâcher les timings.

J'ai eu ce souci sur une machine Q6600 qui pouvait monter assez haut, mais le kit 2 * 2 Gb ne pouvait pas du tout tenir plus que 800 (genre 810 ça plante).
Quand j'ai compris que c'était la ram, hop désynchro pour qu'elle reste en dessous de 800, et ça a tenu 3.2 GHz presque sans augmentation de voltage cpu.
\o/
Titre: Rosetta@home
Posté par: Hildor le 05 avril 2009 à 12:05
Je ne crois pas que ce soit raisonnable de faire tourner des PC qui ne passe le test de OCCT, même si ça marche sur certain projets !

Sinon +1 avec Snoopy ! c'est tj un peu difficile d'OC les RAM au dessus de leur spécifications
Titre: Rosetta@home
Posté par: tristesire le 06 avril 2009 à 10:55
Pour exemple, j'ai un 6400 2.13ghz o/c a 2.53ghz (donc désynchro je crois) et q6600 2.4ghz oc a 2.7ghz.
Je n'ai pas eu d'erreur notable sur Rosetta. Es-tu sûr que le refroidissement est correct? Sinon pour Rosetta, il est conseillé voire nécessaire d'avoir 1 go/core.
Titre: Rosetta@home
Posté par: fafa_at_work le 15 avril 2009 à 03:47
Citation de: fafa_at_work

Au RAC, on est repassé devant le canada et on talonne le team UK  :bounce:  :bounce:  :bounce:
5e! :sol:  :sol:  :sol:  :sol:  :sol:
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/top_teams.php

Le canada nous est repassé devant  :fou: pour juste 592 de RAC  :fou:
Titre: Rosetta@home
Posté par: fr@ntz le 17 avril 2009 à 19:42
Citation de: fafa_at_work

Le canada nous est repassé devant  :fou: pour juste 592 de RAC  :fou:

2200 points de différence de Rac maintenant.

et la Russie menace à son tour mais pour 10 x plus (23 000 points de RAC)
https://statseb.boinc-af.org/details_FB.py?projet=42

Puisque Seti est planté, on va pouvoir rabattre quelques moyens (mais ça urge aussi ailleurs : y'a du rouge dans les tableaux de Seb (https://statseb.boinc-af.org/comparatif_FB.py) !  :sweat:
Titre: Rosetta@home
Posté par: Netrider le 17 avril 2009 à 20:45
Vingt dieux j'avait pas vu les effets de la vodka  :sweat:
Titre: Rosetta@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 17 avril 2009 à 21:10
Fiiouu ca devient dure la...attaqué de partout...et parfois pas des gros !!.... Va falloir faire une petite campagne de pub pour l'AF et BOINC !!!! :D
Titre: Rosetta@home
Posté par: supersnoopy le 17 avril 2009 à 22:27

je vais tenter de rajouter un petit quad 45 nm sur Rosetta...

mais à condition de le trouver !

si je ne le trouve pas d'occasion, le weekend prochain j'en prends un "neuf"
(environ € 130 le Q8200 neuf)

verdâtre j'ai vu passer un Q9300 à € 130 d'okkaz
Titre: Rosetta@home
Posté par: RLDF le 17 avril 2009 à 23:16
j'ai mis un peu de puissance sur rosetta comme seti est dans les choux :)
Titre: Rosetta@home
Posté par: RLDF le 18 avril 2009 à 20:50
bon bah voilà nous avons repris provisoirement notre 3ième place à canada au FB (https://statseb.boinc-af.org/classement_FB.py?projet=42) :D
en revanche, il faudrait trouver 20k/j de plus avant 10j si nous ne voulons pas être mangés par l'équipe "TSC! Russia"  :ouch:
Titre: Rosetta@home
Posté par: Hildor le 18 avril 2009 à 23:51

RDLF la force brute !  :D
Titre: Rosetta@home
Posté par: laurent le 20 avril 2009 à 12:27
bonjour,
j'ai relancer rosetta,
laurent
Titre: Rosetta@home
Posté par: RLDF le 20 avril 2009 à 15:38
Citation de: Hildor

RDLF la force brute !  :D

ça y est, j'ai dépassé la barre que je m'étais fixé sur rosetta : 1.000.000  :bounce:
Titre: Rosetta@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 20 avril 2009 à 18:51
Bravo RLDF !!
A quand les 2 ?
Titre: Rosetta@home
Posté par: RLDF le 20 avril 2009 à 18:54
heu pas pour tout de suite :)
Titre: Rosetta@home
Posté par: Hildor le 20 avril 2009 à 20:49
Citation de: RLDF

 ça y est, j'ai dépassé la barre que je m'étais fixé sur rosetta : 1.000.000  :bounce:


Bah, moi ce sera simplement 100.000 !  :D


Titre: Rosetta@home
Posté par: RLDF le 20 avril 2009 à 21:53
Citation de: Hildor


Bah, moi ce sera simplement 100.000 !  :D


Bravo !  :bounce:

c'est chaud mais on tient :
(http://statseb.gotdns.org/graphe.py?graph_id=e177bb0bd29a31e850b0f1aed2c2f622)
Titre: Rosetta@home
Posté par: Hildor le 21 avril 2009 à 22:01
Citation de: Hildor


Bah, moi ce sera simplement 100.000 !  :D




Mais ce n'est pas encore fait  :(
Titre: Rosetta@home
Posté par: laurent le 26 avril 2009 à 12:18
bonjour,
j'ai stopper geneticlife, et suis sur rosetta à fond 100/100
de CPU

laurent
Titre: Rosetta@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 26 avril 2009 à 12:23
Ah ba tiens, au moment je me decide de m'y remettre à fond pour quelques jours avant l'action PrimeGrid !
Un petit duel de RAC ?  ;)
 :bounce:  :bounce:  :bounce:
Titre: Rosetta@home
Posté par: laurent le 26 avril 2009 à 14:34
ok,
allez go go go

primegrid c'est quand et combien de temps ???
Titre: Rosetta@home
Posté par: Fabrice.ltn le 29 avril 2009 à 15:27
Pour compenser la perte de milky et le manque de wu seti, j'ai repris rosetta en passant le pourcentage de mon petit 20 pour cent à 60 pour cent. Mon quad AMD black édition devrait apporter une petite aide pour garder notre place et creuser un petit écart... Et voilà 4 taches en cours de téléchargement, ça ne devrait plus tarder à calculer...
Titre: Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 30 avril 2009 à 00:31
 [:ousermaatre:3] à tous.
Petit souci pour moi sur Rosetta, bcp d'unités partent en pending, vous aussi ?
Titre: Rosetta@home
Posté par: Fabrice.ltn le 30 avril 2009 à 11:14
pareil pour moi, 4 résultat en erreur de calcul et deux autres en pending pour le moment... On verra bien dans les jours à venir.

je me souviens pourquoi j'avais quitté, j'avais enregistré trop d'erreurs de calcul. Si je suis le seul dans ce cas, c'est peut-être mon quad qui ne lui convient pas. En ce cas, je basculerai mon calcul sur mon seul portable, une fois qu'il se sera sorti des unités longues qu'il a prises sur d'autres projets.
Titre: Rosetta@home
Posté par: supersnoopy le 30 avril 2009 à 11:58

une erreur de calcul pour moi hier, mais ça reste rare.
Titre: Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 30 avril 2009 à 15:19
effectivement erreur de calcul, rare chez moi aussi,  ;)  4-5 unités en pending
Titre: Rosetta@home
Posté par: Fabrice.ltn le 30 avril 2009 à 19:13
Bon je confirme encore aujourd'hui, 50% d'erreurs de calcul... Je ne vais donc pas continuer sur mon fixe et je consacrerai un peu plus de ressources sur mon portable à rosetta... De toutes façons les autres commencent à être trop longue pour lui (en comparaison du fixe bien évidemment).
Titre: Rosetta@home
Posté par: supersnoopy le 30 avril 2009 à 22:29

ah oui là, 50% d'erreur, ça ne vaut pas le coup.

POEM est également un projet BIO, utilisant beaucoup moins de ram que Rosetta...
Titre: Rosetta@home
Posté par: Fabrice.ltn le 01 mai 2009 à 21:42
avec 3 Go de ram je pense que je peux voir venir rosetta l'esprit tranquille, mais je constate qu'aujourd'hui j'ai eu moins d'erreur... On verra à l'usure. En tout cas c'est clair que 50% c'est carrément pas valable.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Pascal94 le 15 mai 2009 à 00:15
Alzheimer's news other than that related to amyloids or zinc (http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=4808&nowrap=true#61181)

Citer
Gene Key To Alzheimer's-like Reversal Identified: Success In Restoring Memories In Mice Could Lead To Human Treatments

http://www.sciencedaily.com/releases/2009/05/090506144309.htm

Doesn't appear to have been tested on humans yet, but may eventally point the way to a successful treatment for humans.

Gènes-clés type Alzheimer identifiés: le succès dans le rétablissement de souvenirs chez les souris pourrait conduire à des traitements humains.

Il ne semble pas qu'il y ait eu des tests sur les humains, mais c'est peut-être une voie vers un traitement efficace pour l'homme.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 15 mai 2009 à 00:26
Super news !
Trop bien ton avatar Pascal !
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: Pascal94 le 15 mai 2009 à 10:05
Trop bien ton avatar Pascal !

merci :jap:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: kyuzo le 08 juin 2009 à 19:12
Tiens, j'ai de nouvelles unités, et elle paie plutôt pas mal :)
Entre 65 et 78 points pour 10500 secondes environ pour mon Q6600 donc un rac 2139 à 2567  :eek:
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: LOCTET SetiOne le 08 juin 2009 à 21:06
Tiens, j'ai de nouvelles unités, et elle paie plutôt pas mal :)
Entre 65 et 78 points pour 10500 secondes environ pour mon Q6600 donc un rac 2139 à 2567  :eek:
oui mais déjà 2 sur 10 en erreur après quelques temps, est ce ponctuel, à voir  :/
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: kyuzo le 08 juin 2009 à 22:35
Ouais, j'ai oublié de dire ce détail, les unités qui durent plus de 3 heures, sont foireuses, annule les toutes :)
Mais celles juste après  :love:
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: LOCTET SetiOne le 09 juin 2009 à 21:51
Ouais, j'ai oublié de dire ce détail, les unités qui durent plus de 3 heures, sont foireuses, annule les toutes :)
Mais celles juste après  :love:
Merci du conseil ! Un peu genant pour les PC à longue distance toutefois  :(
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 11 juin 2009 à 12:23
Yep ! Tout le monde  :jap:

Les unités dont tu parles Kyuzo, j'ai trouvé un moyen de les achever quand même.
Un peu pénible, mais bon !
Lorsque l'UT s'arrêtait d'avancer en poucentage, j'éteignais et rallumais mon ordi, l'unité repartait et se terminait correctement.
 :jap:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: kyuzo le 11 juin 2009 à 15:22
Ouais, mais la, j'en ai plus, car, j'ai plus d'unités du tout, le serveur est mort je crois :/
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 11 juin 2009 à 19:29
Revenu !!!  :bounce:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: julienh le 18 juillet 2009 à 21:34
Jul 17, 2009
Predictor of the day: Congratulations to fmo (Team L'Alliance Francophone) for predicting the lowest energy structure for workunit lr5_E_rama_map_all_ss_iter01_notsq_rlbd_1acf_SAVE_ALL_OUT_12822_0 !

 :cetaboir:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 18 juillet 2009 à 21:53
 :bounce: :bounce: :bounce:
Julienh regarde dans le topic des meilleures prédictions de l'AF si la tienne est encore meilleure :
là: http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2318.0.html
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Heyoka le 18 juillet 2009 à 22:14
Julienh c'est toi fmo ?

Tu peux faire une capture d'écran du graphique de cette prédiction pour voir où se situe une top prédiction journalière
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: julienh le 18 juillet 2009 à 22:26
Et non !
fmo est fmo, julienh est julienh  :D

Je viens de regarder sur le site de Rosetta : il n'y a pas de lien pour cette prediction
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 27 juillet 2009 à 15:55
 :jap: lut tous

j'ai un souci pour télécharger les ut, en ce moment je n'ai que des mess d'erreurs pour les ir8 et ir13

avez-vus également ce problème ?
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: JeromeC le 27 juillet 2009 à 22:04
Anéfé (ir8)

Citer
Mon 27 Jul 18:13:39 2009   rosetta@home   [error] File minirosetta_database_rev31588.zip has wrong size: expected 29091359, got 0
Mon 27 Jul 18:13:39 2009   rosetta@home   Started download of minirosetta_database_rev31588.zip
Mon 27 Jul 18:16:13 2009   rosetta@home   Finished download of minirosetta_database_rev31588.zip
Mon 27 Jul 18:16:14 2009   rosetta@home   [error] Signature verification error for minirosetta_database_rev31588.zip
Mon 27 Jul 18:16:14 2009   rosetta@home   [error] Checksum or signature error for minirosetta_database_rev31588.zip
Mon 27 Jul 18:27:46 2009   rosetta@home   Finished download of minirosetta_1.86_i686-apple-darwin
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 27 juillet 2009 à 22:22
merci Jeromec
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: JeromeC le 28 juillet 2009 à 07:59
Ben de pas grand chose pour le moment...  :spamafote:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: misterinpact le 24 août 2009 à 22:20
Bonsoir tous le monde !

Je sais pas si ça a été évoqué ici ou ailleurs (j'ai pas vu après une rapide recherche) mais dans le Courrier International de la semaine il y a un article d'une page sur Foldit :)

Si ça en intéresse je pourrais l'uploader une fois l'étape "récupération de mon appareil photo détenu par ma mère" :D
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 25 août 2009 à 20:44
 :jap: :jap: :jap: oui avec impatience
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: xipehuz le 25 août 2009 à 23:40
Attention, Hadopi vous surveille  :electric:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 26 août 2009 à 11:53
Attention, Hadopi vous surveille  :electric:

Maman j'ai peur !! :bouh: :bouh: :bouh: :bouh:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: NicoX900 le 26 août 2009 à 12:29
Au secours!!!!
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: misterinpact le 26 août 2009 à 20:02
Voila le lien :)
C'est pris avec un apn je préviens, c'est largement lisible mais c'est pas optimale ;)
http://dl.free.fr/g4upEs8IE (http://dl.free.fr/g4upEs8IE)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 26 août 2009 à 22:09
 :jap: :jap: :jap: Merci bcp  :jap: :jap: :jap:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: NicoX900 le 27 août 2009 à 08:29
merci  :jap:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Meteore31 le 27 août 2009 à 10:38
article sympa
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: moustic le 10 septembre 2009 à 12:15
je suis le seul à avoir un pending croissant depuis quelques jours ou pas ?
(j'en suis à + de 50 ut pour plus 3000 crédits)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 11 septembre 2009 à 08:17
idem
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: modesti le 11 septembre 2009 à 10:37
forcément, tout le monde est occupé ailleurs :siflotte: donc personne pour faire le(s) co-calculateur(s) sur vos UT :spamafote:

mais ne vous inquiétez pas : les crédits finiront par tomber ;)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: mamouth le 11 septembre 2009 à 11:36
Il n'y a pas de réplication des WU dans Rosetta
C'est juste un problème de validateur qui est déjà réglé mais qui doit rattraper le retard

Tout sera rentré dans l'ordre d'ici peu
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: moustic le 11 septembre 2009 à 12:21
merci pour l'info
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: rom_185 le 18 octobre 2009 à 16:09
Citer
Oct 10, 2009         
Predictor of the day: Congratulations to Jean Nouzeilles (http://boinc.bakerlab.org/rosetta/show_user.php?userid=3207) (Team L'Alliance Francophone (http://boinc.bakerlab.org/rosetta/team_display.php?teamid=30)) for predicting the lowest energy structure for workunit lr5_score12_hackelec_run01_rlbd_1nps_SAVE_ALL_OUT__14669_0 !
:hyperbon: :hyperbon: :hyperbon:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: BoinceurDu44 le 20 novembre 2009 à 17:39
Bonjour,
alors je n'ai pas lu les post précédents!

Mon problème la "Rosetta Mini 2.0" fait planter mon système! je suis sous 7 x64 home prem, a chaque fois qu'il calcul après quelques mns, mon PC crach.

j'ai le droit a des 0x0000000A, ou 7E ou 7A, j'ai écarter la chauffe du CPU, les barettes de RAM, le disque dur, le GPU, et les autres projets BOINC.

Je suis AFFIRMATIF, c'est Rosetta Mini 2.0 qui plante mon PC.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Pascal94 le 20 novembre 2009 à 21:40
tu t'es renseigné sur le forum du projet ?
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: luger11 le 30 décembre 2009 à 15:54
bonjour


est ce normal que je ne reçois plus rien de rosetta  :cry: :cry:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 30 décembre 2009 à 16:30
 :hello:

Voilà un début d'explication :  Statut du serveur  (http://boinc.bakerlab.org/rosetta/rah_status.php)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: JeromeC le 30 décembre 2009 à 16:32
Ready to send : 742, y'a pas foule, mais il devrait y en avoir...

Y'a pas mal de vert (http://boinc.bakerlab.org/rosetta/rah_status.php) dans le statut (les rouges étant visiblement des serveurs surnuméraires), y'a même une mise à jour récente de l'application mini  (http://boinc.bakerlab.org/rosetta/apps.php)pour toutes les plateformes, donc ça devrait marcher...


Edit : grilled, mais justement je suis pas d'accord : y'en a assez en vert pour que ça puisse marcher, à mon avis.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: luger11 le 31 décembre 2009 à 00:27
je ne comprend pas j'ai le projet qui me cherche des unite mais ne trouve rien et donc se relance a chaque fois et ne trouve rien
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: modesti le 31 décembre 2009 à 00:57
Les UT qui sont "ready to send" ne sont peut-être pas des UT pour ton OS :spamafote: Ça m'était arrivé une fois sur Virtual Prairie.

Faut pas chercher à comprendre, mais plutôt choisir un autre projet qui te plaît à faire tourner en parallèle ;)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: louchio le 31 décembre 2009 à 01:03
As tu d'autres projets en cours parce que parfois si c'est le cas il donne la priorité aux autres. suspend les autres projets et refait une demande de mise à jours pour rosetta cela va peut etre régler le problème. Sinon le problème vient d'ailleur
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: luger11 le 01 janvier 2010 à 23:47
oui j'ai d'autres projets et je les ai suspendu toujours rien :D :D

bonne annee
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: supersnoopy le 03 janvier 2010 à 22:02

pas d'UT rosetta pour moi (constat de mon retour de vacances)

grâce à logmein (free) je bascule mes diverses machines sur POEM en attandant
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: LOCTET SetiOne le 04 janvier 2010 à 12:46
pas d'UT rosetta pour moi (constat de mon retour de vacances)

grâce à logmein (free) je bascule mes diverses machines sur POEM en attendant
Certes la prise en mains à distance est dans certains cas nécessaire, mais là BAM devrait te suffire pour ajouter, retirer, mettre en pause etc des projets sur tes machines distantes ou pas, comme le basculement entre Rosetta et POEM ?
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: supersnoopy le 04 janvier 2010 à 15:45

j'ai commencé à utiliser LogMeIn pour pouvoir suspendre des UT de GPUGrid qui plantaient mon pc distant.

j'ai un compte BAM mais je n'ai pas aimé ou compris l'interface...

Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: LOCTET SetiOne le 04 janvier 2010 à 21:44
j'ai commencé à utiliser LogMeIn pour pouvoir suspendre des UT de GPUGrid qui plantaient mon pc distant.

j'ai un compte BAM mais je n'ai pas aimé ou compris l'interface...
Pour la suspension de WU je suis d'accord, pas d'autre alternative que l'accès à distance, par contre utiliser BAM a des avantages entre autres pour stopper et/ou lancer un projet "en masse" sur toutes les machines d'un compte, à ta dispo en MP pour avancer si tu le souhaites et dans la marge modeste de mes connaissances de cet outil
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: fafa_at_work le 05 janvier 2010 à 02:27
pas d'UT rosetta pour moi (constat de mon retour de vacances)

grâce à logmein (free) je bascule mes diverses machines sur POEM en attandant
idem pas d'UT depuis plusieurs jours  :hyperbon:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Prof le 05 janvier 2010 à 06:32
a y'est c'est reparti on dirait :-) !!
Titre: Re : Re : Re : Rosetta@home
Posté par: supersnoopy le 05 janvier 2010 à 10:46
Pour la suspension de WU je suis d'accord, pas d'autre alternative que l'accès à distance, par contre utiliser BAM a des avantages entre autres pour stopper et/ou lancer un projet "en masse" sur toutes les machines d'un compte, à ta dispo en MP pour avancer si tu le souhaites et dans la marge modeste de mes connaissances de cet outil

 :jap: :jap: :jap:
merci pour cette aimable proposition.
je le note pour le jour où j'en ai besoin ;)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: luger11 le 05 janvier 2010 à 11:49
oui ça refonctionne :) :)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: gregoryd01 le 07 janvier 2010 à 20:22
J'ai plusieurs WU Mini 2.03 qui ne se terminent jamais (j'ai suspendu après plus de 35h !). C'est normal ?  :??:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: gregoryd01 le 10 janvier 2010 à 01:33
Ben finalement j'ai suspendu le projet et repris : les WU se sont terminées normalement. Comprend pas, mais bon  :pt1cable:
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: LOCTET SetiOne le 10 janvier 2010 à 09:58
Ben finalement j'ai suspendu le projet et repris : les WU se sont terminées normalement. Comprend pas, mais bon  :pt1cable:
:hello: Petit clin d'oeil à l'Est = elles patinaient dans la choucroute ou le verglas  :lol:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: gregoryd01 le 10 janvier 2010 à 12:10
pfff  :lol:
C'est encore arrivé pour un WU ... Je termine les WU en stock et j'arrête ce projet  :rhaa:

 :hello:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: LOCTET SetiOne le 10 janvier 2010 à 18:15
Vu le temps passé pour les voir partir en co...bipbip..lles à la fin, sûr que je ferais la même chose  :rhaa:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 10 janvier 2010 à 20:47
 :hello:

Ne serait-ce pas dû à une charge d'unités trop importantes pour ta mémoire vive ?

En diminuant le nombre d'unités FreeHAL, le souci pour Rosetta, qui était le même que toi, s'est résolu. :spamafote:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: gregoryd01 le 10 janvier 2010 à 22:02
Tu as peut-être raison.

2Go de ram, Vista 32b, 5 Freehal et 2 rosetta ...
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 10 janvier 2010 à 22:49
Presque pareil, essaie une unité rosetta à la fois, peut-être ??

Moi 12 unités freehal, une rosetta et une edges, en ce moment. :jap:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Prof le 10 janvier 2010 à 23:08
Sur mon Mac une unité Rosetta utilise entre 400 et 500Mo de Ram!!!
Alors peut être qu'effectivement c'est l'explication???
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: JeromeC le 11 janvier 2010 à 15:43
Là j'en ai une en train de tourner sous win elle me prend 215 Mo, j'en ai eu 2 / 3 autre sur ce poste depuis la semaine dernière, et une 10aine sur le mac (où je n'ai pas vérifié l'occupation mémoire), toutes terminées en success (en parallèle d'autres projets sur les 2 postes).
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: fr@ntz le 15 avril 2010 à 23:23
Citer
15/04/2010 23:21:40   rosetta@home   Message from server: Server error: can't attach shared memory
  :cry:

edit : reviendu  :siflotte:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: al@ON le 17 avril 2010 à 14:38

modesti UotD. :banana: :clafete:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: popolito le 20 avril 2010 à 07:42
Rosetta@home has been used to design a protein which may neutralize the flu virus. See David Baker's journal (http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=1177&nowrap=true#65767) for details.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: louchio le 21 avril 2010 à 14:44
mes dernières ut de Rosetta en était a 12% après 9hrs de crunches est-ce normale d'habitude une unité me prenait environ 6hrs.????
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: modesti le 21 avril 2010 à 15:18
ça dépend des réglages que tu as fait sur ton compte dans "Rosetta@Home preferences". Tu peux choisir le temps (approximatif) que prendront les UT sur ta (tes) bécane(s)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: supersnoopy le 21 avril 2010 à 16:18

je n'ai pas observé d'augmentation anormale des temps de calcul ces derniers jours.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 24 avril 2010 à 15:18
Une news de rosetta qui serait intéressant de mettre plus en avant sur le portail de l'AF :

Apr 19, 2010         

Rosetta@home has been used to  design a protein which may neutralize the flu virus. See David  Baker's journal (http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=1177&nowrap=true#65767) for details.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 24 avril 2010 à 15:20
Celle-là aussi tiens :

This survey request is from David Anderson, the creator of BOINC, and  Oded Nov from NYU
 
 Dear Rosetta@home volunteer:
 
 We are conducting a survey of Rosetta@home volunteers in order to
 better understand why people participate in volunteer computing and
 contribute computer resources.

en français :

Cette demande d'enquête est de David Anderson, le créateur de BOINC, et  Oded novembre de NYU
 
 Chers volontaires Rosetta @ home:
 
 Nous menons une enquête auprès des bénévoles Rosetta @ home, afin de
 mieux comprendre pourquoi les gens participent au calcul bénévole et
 ressources informatiques contribuent.
 
 Nous serions très reconnaissants si vous pouviez nous aider en  remplissant un
 questionnaire. Si vous n'êtes pas intéressé, ignorer le reste de cette
 e-mail.
 
 L'enquête est au http://boinc.berkeley.edu/survey/ Il ne devrait pas  prendre
 plus de 10-15 minutes. Vos réponses seront utilisées pour la recherche
 buts et à améliorer BOINC.
 
 Nous serons heureux de partager nos découvertes avec vous, et ils seront
 disponibles une fois que nous aurons terminé la collecte de données et  d'analyse.
 
 Avec Merci beaucoup -
 
 We would be extremely grateful if you could help us by filling out a
 questionnaire. If you are not interested, ignore the rest of this
 email.
 
 The survey is at http://boinc.berkeley.edu/survey/ (http://boinc.berkeley.edu/survey/) It should take no
 more than 10-15 minutes. Your responses will be used for research
 purposes and to improve BOINC.
 
 We will be happy to share our findings with you, and they will be made
 available once we complete the data collection and analysis.
 
 With many thanks -
 
 Dr. David P. Anderson
 Director, BOINC
 University of California, Berkeley
 email: davea at ssl.berkeley.edu
 
 Prof. Oded Nov
 Polytechnic Institute of New York University
 email: onov at poly.edu
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 24 avril 2010 à 15:27
ayé j'ai répondus au questionnaire et vous ?
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: modesti le 24 avril 2010 à 16:18
ce qui me chiffonne, c'est qu'ils demandent l'identifiant et le mot de passe. j'ai pas pour habitude de donner ce genre d'info, même sur un site que je connais a priori. trop de risques de phishing.
donc pour moi c'est niet. désolée
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: popolito le 24 avril 2010 à 17:02
Rosetta@home has been used to design a protein which may neutralize the flu virus. See David Baker's journal (http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=1177&nowrap=true#65767) for details.
Une news de rosetta qui serait intéressant de mettre plus en avant sur le portail de l'AF :

Apr 19, 2010         

Rosetta@home has been used to  design a protein which may neutralize the flu virus. See David  Baker's journal (http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=1177&nowrap=true#65767) for details.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: al@ON le 24 avril 2010 à 17:07

 (http://moe.mabul.org/up/moe/2009/06/17/img-0034554cpyr.gif)... me semblait bien avoir déjà lu cette niouz quelque part. :gno:
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 24 avril 2010 à 19:55
ce qui me chiffonne, c'est qu'ils demandent l'identifiant et le mot de passe. j'ai pas pour habitude de donner ce genre d'info, même sur un site que je connais a priori. trop de risques de phishing.
donc pour moi c'est niet. désolée

Tu n'as qu'à changer ton mot de passe après
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: popolito le 25 avril 2010 à 16:41
Lancement du CASP9 dans peu de temps : http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=5308
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 25 avril 2010 à 18:56
Lancement du CASP9 dans peu de temps : http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=5308 (http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=5308)

intéressant...
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: JeromeC le 30 avril 2010 à 23:13
Ca veut dire que c'est une appli qu'ils vont diffuser automatiquement via le compte rosetta / boinc existant ?

Sinon pour la survey de berkeley, c'est nul la liste de mini projet qu'ils proposent pour commencer le questionnaire !!
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: popolito le 01 mai 2010 à 18:59
Il y a encore du boulot sur rosetta, recherche sur tout ce qui concerne les énergies fossiles : http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=1177&nowrap=true#65902
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 01 mai 2010 à 20:05
ceci à l'air intéressant :

We got some good news today in an announcement by Vice President Biden:
 
 http://arpa-e.energy.gov/NewsMedia/News/tabid/83/vw/1/ItemID/21/Default.aspx (http://arpa-e.energy.gov/NewsMedia/News/tabid/83/vw/1/ItemID/21/Default.aspx)
 
 We were funded to work with three other research groups to develop a  completely new pathway for using solar energy to transform CO2 into the  large molecules that the world has grown to depend on (fuels, etc)--this  if successful could greatly reduce dependence on fossil fuels and  contribute to removing CO2 from the atmosphere.
 
 While the large majority of rosetta@home calculations will remain  focused on biomedical problems, expect to see from time to time work  units relating to design of enzymes for CO2 capture and conversion.



Mais après capture de ces grosse molécules, ils vont les convertir en quoi ? énergie ?
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: JeromeC le 01 mai 2010 à 22:27
Il dit qu'il veut transformer du CO2 en pétrole.

La nouvelle pierre philosophale :D

A mon avis il va bientôt avoir la visite de quelques groupe pétroliers...
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Antares le 01 mai 2010 à 22:45
BP en priorité...



 :warf:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: JeromeC le 01 mai 2010 à 23:03
Bah si on se prends des gouttes de pétroles dans la gueule dès que quelqu'un recrache du CO2 ça risque de faire désordre :lol:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: supersnoopy le 04 mai 2010 à 09:49

[ mode râleur ]


vraiment ils abusent rosetta, ce matin j'ai 2 UT de presque 400 Mo chacune, la moitié de la ram dispo est bouffée...

et donc hop ! une des UT est "en attente de mémoire"...



ce qu'il manque à boinc c'est de donner une limite de coeur par projet (et non pas en %)

comme ça on pourrait dire :

1 coeur pour Rosetta
1 coeur pour tel autre projet...

alors que si on dit 100% et 100% dans les priorités, il passe d'un projet à l'autre


[ voilà ]
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 04 mai 2010 à 18:20
Bah si on se prends des gouttes de pétroles dans la gueule dès que quelqu'un recrache du CO2 ça risque de faire désordre :lol:


 :gno: :gno:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Fabrice.ltn le 04 mai 2010 à 20:31
Il dit qu'il veut transformer du CO2 en pétrole.

La nouvelle pierre philosophale :D

A mon avis il va bientôt avoir la visite de quelques groupe pétroliers...
ouais, ça serait une bonne chose, mais les molécules d'hydrocarbures sont très complexes, casser du CO2 avec le soleil d'accord... à l'image des plantes d'ailleurs... mais reconstruire des chaines d'hydrocarbures....

Ont-ils déjà lancé l'appli ?
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: popolito le 06 mai 2010 à 18:49
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=1177&nowrap=true#65964
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: popolito le 10 mai 2010 à 17:53
Le CASP9 est parti, ils vont envoyer la purée donc si vous voulez aider Rosetta, c'est le moment de s'attacher !
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: modesti le 10 mai 2010 à 18:00
ça tombe drôlement bien avec le Pentathlon... :D
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 10 mai 2010 à 18:04
Le CASP9 est parti, ils vont envoyer la purée donc si vous voulez aider Rosetta, c'est le moment de s'attacher !

Dsl tu peux rappeler ce qu'est le casp9 car comme j'ai bloqué mes uts rosetta dans le fichier hostn je ne peux m'y connecté ...
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: modesti le 10 mai 2010 à 18:06
Boris, please, remonte de quelques posts dans ta lecture :coffeetime:
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 10 mai 2010 à 18:37
Boris, please, remonte de quelques posts dans ta lecture :coffeetime:

Dsl mais je ne vois pas dans un ancien post ce qu'est CASP9 et je ne peux aller sur le site puisque j'ai bloqué dans le fichier host les uts rosetta
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 10 mai 2010 à 18:49
Dommage que Rosetta n'utilise pas les GPUs...
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Hildor le 10 mai 2010 à 19:53

CASP9 c'est une sorte de "compète" entre chercheurs mais essaye de faire une recherche (un carré blanc à coté d'une loupe en haut de la page :D ) dans ce topic pour en savoir plus.
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 10 mai 2010 à 19:57
CASP9 c'est une sorte de "compète" entre chercheurs mais essaye de faire une recherche (un carré blanc à coté d'une loupe en haut de la page :D ) dans ce topic pour en savoir plus.

j'ai vus qu'il fallait un compte sur predictor center ?
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: supersnoopy le 10 mai 2010 à 22:53
Dommage que Rosetta n'utilise pas les GPUs...

+1

pour les projets bio y'a rien sur Boinc, ailleurs on a Folding... mais chuis trop accro à Boinc pour changer ;)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: modesti le 10 mai 2010 à 22:55
j'ai vus qu'il fallait un compte sur predictor center ?
:cpopossib:

Malheureusement la page n'est qu'en anglais ou en russe http://en.wikipedia.org/wiki/Caspase-9
Ça n'a rien à voir avec predictor center en particulier. L'an dernier, si je me souviens bien, Rosetta, Poem et un troisième projet Bio de BOINC (Docking?) participaient au CASP8. Je ne sais pas quels projets, en dehors de Rosetta, vont y participer cette année.

Un petit article en français : http://eu.ixquick-proxy.com/do/highlight.pl?l=francais&c=hf&cat=web&q=casp9&rl=NONE&rid=LHLMRNPMOPPR&hlq=http%3A%2F%2Fixquick.com%2Fdo%2Fmetasearch.pl%3Fcat%3Dweb%26language%3Dfrancais%26query%3Dcasp9%26pl%3Dff&u=http%3A%2F%2Fwww.snv.jussieu.fr%2Fldv%2Fpages-LdV02%2Fsujets2008%2Fall_PRET_Anne_Marie_txt.html&nwwndw=1
Titre: Re : Re : Re : Rosetta@home
Posté par: RLDF le 11 mai 2010 à 13:36
+1

pour les projets bio y'a rien sur Boinc, ailleurs on a Folding... mais chuis trop accro à Boinc pour changer ;)

et GPUGRID, c'est pas du bio ?
c'est même le premier projet GPU sous boinc !!!
anciennement appelé PS3GRID ...
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: popolito le 11 mai 2010 à 17:26
Le truc, c'est que rosetta sur GPU, c'est sûrement trop compliqué (en plus, le but du projet est d'optimiser l'application en permanence, et c'est sûrement plus difficile de faire ce que l'on veut sur GPU), il ne faut pas oublier que sur folding, il n'y a qu'une partie des protéines qui sont crunchées sur GPU si mes souvenirs sont bons.. ;)
Titre: Re : Re : Re : Re : Rosetta@home
Posté par: supersnoopy le 11 mai 2010 à 17:32
et GPUGRID, c'est pas du bio ?
c'est même le premier projet GPU sous boinc !!!
anciennement appelé PS3GRID ...

 :o :o :o

honte sur moi j'avais oublié ! j'ai même du million sur ce projet... mais pas de carte Nvidia  :(
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: popolito le 17 mai 2010 à 16:58
Citer
We are absolutely delighted by the recent increase in the total throughput of rosetta@home, which could not come at a more critical time! we are having to make very difficult choices between CASP9 structure prediction calculations and the next generation of pathogen inhibiting proteins building on our success with the flu virus inhibitor, and the new contributions of computer power many of you are making are helping immensely. Thank you very much!
Baker qui dit merci aux nouveaux participants car entre le CASP9 et le travail sur le virus de la grippe, ils ne savent plus où donner de la tête.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: [AF>Libristes] nico8313 le 17 mai 2010 à 17:11
ça fait plaisir !  :jap:
Je vais rester un peu sur ce projet histoire aussi de prendre quelques points  :D
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: modesti le 17 mai 2010 à 17:25
Apparemment le Pentathlon venait à point nommé :D
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Armand le 22 mai 2010 à 19:57
Salut   :sun:

Je viens de charger un nouveau type de  Wus ( du moins pour moi) , que je trouve hyper rapides -- "rs_stg0........."  :D
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: popolito le 06 juin 2010 à 16:57
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=1177&nowrap=true#66435 <== ça bosse dur sur une protéine.  :kookoo:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: fr@ntz le 10 juin 2010 à 11:32
Départ aujourd'hui d'un défi sur Rosetta
http://fr.boincstats.com/bam/challenges.php?action=details&chid=36

Nous sommes en tête mais les Italiens qui poussent fort derrière nous, vont nous doubler dans 4 jours au FB
https://statseb.boinc-af.org/details_FB.py?projet=42

 :cavachier:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 10 juin 2010 à 13:15
j'ai mis deux cœurs dessus...
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 10 juin 2010 à 17:33
GO GO GO

On va être dépassé par Boinc Poland : http://fr.boincstats.com/bam/challengeChat.php?chid=36
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: supersnoopy le 10 juin 2010 à 20:22

retour de 2 quad et de 2 duals sur Rosetta, suite à la fin du batch SIMAP

je voudrais bien basculer un i7 mais la conso mémoire de Rosetta est trop délirante ( 300 Mo par UT )
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: mcroger le 11 juin 2010 à 12:59
retour de 2 quad et de 2 duals sur Rosetta, suite à la fin du batch SIMAP

je voudrais bien basculer un i7 mais la conso mémoire de Rosetta est trop délirante ( 300 Mo par UT )

Et si tu désactive l'hyper threading, histoire d'avoir moins de WU en parallèle, ça n'irait pas ?
Titre: Re : Re : Re : Rosetta@home
Posté par: supersnoopy le 11 juin 2010 à 18:07
Et si tu désactive l'hyper threading, histoire d'avoir moins de WU en parallèle, ça n'irait pas ?

 :eek:

mais je n'oserai jamais faire ça à mon i7, ce serait comme arracher 4 pattes à une araignée  :pt1cable:

en fait j'attends au choix :
un hypothétique baisse de la ram pour passer à 8 Gb
ou bien
une évolution de BOINC permettant d'attribuer un nombre de core maximum à un projet
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: mcroger le 11 juin 2010 à 20:24
:mdr:

Bah,  sinon 4 VM pour Rosetta avec la RAM qui va bien, et les 4 cores sur... ce que tu veux.

(bon, un peu chipo, sais pas si je le ferais moi-même, quoique, avec un i7 :ange: ...)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: fr@ntz le 13 juin 2010 à 15:44
La squadra azura nous double dans la journée au FB :/ : https://statseb.boinc-af.org/details_FB.py?projet=42

Pourtant on fait la course en tête, http://fr.boincstats.com/bam/challengeChat.php?chid=36
mais l'Italie ne semble pas inscrite, et les RAC sont très différents.

Boinc Italy va continuer son effort jusqu'à la fin du mois : http://www.boincitaly.org/index.php?option=com_content&task=view&id=214&Itemid=1

Mais comme l'a dit MacRoger, on devrait pouvoir les rattraper avant la fin de l'année...si on le veut vraiment.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: popolito le 23 juin 2010 à 11:58
Baker est content car il y a pas mal de publis à venir : http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=1177&nowrap=true#66617
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 23 juin 2010 à 14:32
j'ai dus supprimer tout les fichiers de mon dossier rosetta car apparemment cela bloqué boinc avec un ralentissement mon PC...
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Antares le 23 juin 2010 à 14:48
Des fois quand ça bloque, je fais un petit nettoyage du PC et ça va mieux...
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 23 juin 2010 à 14:50
des dossiers boinc ?
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Antares le 23 juin 2010 à 17:09
Non fichiers temporaires etc.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 23 juin 2010 à 19:36
ok j'essayerai si cela recommence
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: popolito le 24 juin 2010 à 01:04
Baker est content car il y a pas mal de publis à venir : http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=1177&nowrap=true#66617
J'voulais pas me faire bas de pager !
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 24 juin 2010 à 13:59
go go go sur le challenge...
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Ryzen le 09 août 2010 à 17:49
Rosetta@home related advances have been featured in the national media twice in the last month. The first advance was the design of a protein catalyst that joins two molecules in a way not found in Nature; this was reported in Science magazine in July. The second advance is the finding that FoldIt players can solve hard structure prediction problems; this was reported in Nature magazine this week. These advances were covered in the New York Times, the LA times, and likely in your local newspaper. Thanks to all of you for your contributions to Rosetta@home!

Des avancées liées au projet Rosetta@home ont été publiées dans les médias nationaux deux fois le mois dernier. La première avancée était le design d'un catalyseur de protéine qui joint deux molécules dans une voie non trouvée dans la Nature; cela a été annoncé dans le magazine Science en juillet. La deuxième avancée est la découverte que les joueurs de FoldIt  peuvent résoudre des problèmes de prédiction de structure difficiles; cela a été publié dans le magazine Nature cette semaine. Ces avancées ont été couvertes par le New-York Times, le LA Times et probablement par votre journal local. Merci à vous tous pour vos contributions à Rosetta@home!
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 09 août 2010 à 18:47
merci pour la trad....
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 22 septembre 2010 à 12:38
Nouvelle application mini rosetta 2.15 est parue hier pour ajouter de  nouveaux protocoles pour oligomères symétriques et des protéines membranaires .

Edit : durée 32 minutes environs pour 11 pts.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Pascal94 le 27 septembre 2010 à 12:48
Boris, ça tombe a cheval sur la fin du Raid, c'est pas cool de faire de la débauche comme ça  :jap:

 :cavachier:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: [AF>Libristes] nico8313 le 27 septembre 2010 à 13:17
Sur collatz ok ! car en GPU !!!

Mais la sur CPU Pascal à raison !!! pas de débauche le RAID n'est pas finit  :cavachier: :cavachier:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 27 septembre 2010 à 13:27
C'est juste à titre d'infos, je n'insite personne à quitter le RAID...
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Hildor le 27 septembre 2010 à 14:11

Oui ! bien sur, c'est évident  :siflotte:
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: Pascal94 le 27 septembre 2010 à 18:46
C'est juste à titre d'infos, je n'insite personne à quitter le RAID...
snip

en rouge et en gras, j'appelle ça du rameutage de troupes Boris  :non:, et c'est pas cool vu qu'on a déjà du mal à mobiliser sur le raid.

il ne reste que quelques jours, c'est pas le moment de se barrer sur les challenges de Boincstats  :jap:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 27 septembre 2010 à 19:46
S'il y en à qui déserte le RAID c'est vraiment qui n'ont rien compris, alors...
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Pascal94 le 27 septembre 2010 à 20:43
pour la peine t'auras autant de coups de pagaie que de crunchers détournés du Raid  :cavachier:


 :D
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: tristesire le 27 septembre 2010 à 23:45
/tristesire s'empare d'une pagaie
/tristesire arme la pagaie
/Boris Aiiiiiee....!!!!

Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 27 septembre 2010 à 23:54
 :cavachier: je l'attends
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: tristesire le 27 septembre 2010 à 23:59
 :giligili:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: viny le 28 septembre 2010 à 00:12
Toute publicité ou message pouvant détourner des cruncheurs du raid devrait être immédiatement supprimée par un méchant modo !

 :rhaa:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 28 septembre 2010 à 00:13
je peux supprimer mon post, si tu veux ?!
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: viny le 28 septembre 2010 à 00:15
Je te laisse le choix.  :ange:

Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 28 septembre 2010 à 00:18
Je te laisse le choix.  :ange:



ok effacé
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: viny le 28 septembre 2010 à 01:09
 :jap:

A remettre  une fois le raid terminé (ainsi que sur not' fofo).   :lol:

Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: Antares le 28 septembre 2010 à 07:05
S'il y en à qui déserte le RAID c'est vraiment qui n'ont rien compris, alors...

Ben non! Je ne participe à aucun raid! Ca ne m'intéresse pas.
Je suis libre de faire ce bon me semble.
Titre: Re : Re : Re : Rosetta@home
Posté par: mcroger le 28 septembre 2010 à 07:28
Ben non! Je ne participe à aucun raid! Ca ne m'intéresse pas.
Je suis libre de faire ce bon me semble.

Ben si tu ne participes pas, tu ne peux donc pas déserter, par définition.   :D
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: tibidao le 28 septembre 2010 à 08:19
Polynésia, tu as effacé ton message, mais il reste la citation que pascal94 a faite.

Pascal94 ! Alors comme ça on incite à la débauche pendant un raid ?!  :rhaa:  :gniak:
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 28 septembre 2010 à 09:14
Polynésia, tu as effacé ton message, mais il reste la citation que pascal94 a faite.

Pascal94 ! Alors comme ça on incite à la débauche pendant un raid ?!  :rhaa:  :gniak:
  :lol: :lol:
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: Pascal94 le 28 septembre 2010 à 12:58
Polynésia, tu as effacé ton message, mais il reste la citation que pascal94 a faite.

Pascal94 ! Alors comme ça on incite à la débauche pendant un raid ?!  :rhaa:  :gniak:

mais de quoi vous parlez ?  :siflotte:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: viny le 28 septembre 2010 à 13:07
Polynésia, tu as effacé ton message, mais il reste la citation que pascal94 a faite.

Pascal94 ! Alors comme ça on incite à la débauche pendant un raid ?!  :rhaa:  :gniak:

LOL c'est Pascal94 qui a maintenant été pris en faute.

Allez Poly et Pascal94, tous les 2 au coin !

 :lol:

En tout cas, maintenant, ni vu ni connu ...   :)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: [AF>Libristes] nico8313 le 28 septembre 2010 à 13:16
N'abusez pas trop du flashouilleur (neuralizer)  :D
http://www.youtube.com/watch?v=ymSEibHKOgo

Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Pascal94 le 28 septembre 2010 à 13:17
 :lol: :lol: :lol:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 12 octobre 2010 à 18:57
Nouvelle application 2.16...
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Andromede33 le 14 octobre 2010 à 02:16
Bonjour,

Ben moi j'ai jamais suivi les RAID et je viens à l'instant de réinstaller Rosetta !

De plus je crois que Rosetta calcul en entier mais une chose de sur c'est qu'il tourne en 64-bit !

(http://img826.imageshack.us/img826/473/boinc63.th.jpg) (http://img826.imageshack.us/i/boinc63.jpg/)

@+
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: [AF>Libristes] nico8313 le 14 octobre 2010 à 02:57
Dis donc Andromede !  toujours pas couché ??? file dans ta chambre  :D :lol:

Merci pour l'info  :jap:

Tu peux voir les applications directement sur le site du projet aussi !  :)
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/apps.php

Bon beh moi je vais au dodo ! bonne nuit  :hooga:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: symaski62 le 25 octobre 2010 à 20:47
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/results.php?userid=506

 :coffeetime:    1 jour   :)   

:)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: toTOW le 25 octobre 2010 à 21:08
No access ... :/
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: modesti le 25 octobre 2010 à 21:15
symaski, si tu veux nous faire passer un lien vers un ou des résultats, dans ton compte, clique sur "View" à côté de "Computers on this account", puis sélectionne l'ordinateur qui va bien. Le lien que tu obtiendras est lisible par tout le monde.
L'autre possibilité, si c'est pour un résultat en particulier, c'est de sélectionner l'UT en question en cliquant dans la colonne "Work unit ID" et de mettre le lien ici.
:jap:
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: symaski62 le 25 octobre 2010 à 21:31
symaski, si tu veux nous faire passer un lien vers un ou des résultats, dans ton compte, clique sur "View" à côté de "Computers on this account", puis sélectionne l'ordinateur qui va bien. Le lien que tu obtiendras est lisible par tout le monde.
L'autre possibilité, si c'est pour un résultat en particulier, c'est de sélectionner l'UT en question en cliquant dans la colonne "Work unit ID" et de mettre le lien ici.
:jap:

http://boinc.bakerlab.org/rosetta/rah_results.php?UserID=506   

:)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: al@ON le 25 octobre 2010 à 23:42
symaski, c'est à ce lien http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2318.0.html (http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2318.0.html) qu'il faut poster ses résultats de Rosetta. ;)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: symaski62 le 27 octobre 2010 à 01:23
BAH !  top ?!

http://boinc.bakerlab.org/rosetta/rah_results.php?UserID=506

gris et gris clair 

 :siflotte:

Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: al@ON le 27 octobre 2010 à 01:30
symaski, c'est à ce lien http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2318.0.html (http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2318.0.html) qu'il faut poster ses résultats de Rosetta. re ;)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: popolito le 31 octobre 2010 à 19:01
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=1177&nowrap=true#68287
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 31 octobre 2010 à 19:31
Message intéressant, puisqu'ils vont essayer de faire moins  chère et plus robuste leurs Kits de diagnostique pour le virus de la grippe (et d'autres agents pathogènes).
 
Si j'ai bien compris...

Ce projet devient de plus en plus intéressant… 
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: toTOW le 31 octobre 2010 à 21:40
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=1177&nowrap=true#68287

Ce serait pas mal de développer un peu plutot que de balancer des liens comme ca ...
Titre: Re : Re : Re : Rosetta@home
Posté par: al@ON le 31 octobre 2010 à 22:41
Ce serait pas mal de développer un peu plutot que de balancer des liens comme ca ...

popolito essaie de faire court à cette heure là... l'apéro n'attend pas! :siflotte:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: supersnoopy le 31 octobre 2010 à 23:08

ils ont découvert une molécule se liant à une protéine de surface du virus H1N1 ; or cette molécule est très proche d'une molécule réelle découverte par les chercheurs.

confiants dans leur modèle de repliement, ils vont maintenant se rapprocher d'autres équipes pour essayer de produire cette molécule pour des tests viraux moins chers que ceux utilisant les traditionnels anti-corps.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 31 octobre 2010 à 23:10
Merci pour tes précisions...
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Ryzen le 04 novembre 2010 à 23:25
je viens de remarquer que j'ai une petite unité rosetta où je suis rendu à 44h et il reste 83h... je la garde ou pas? Ca serait pas une unité à 1 million de points  :D
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: JeromeC le 05 novembre 2010 à 23:50
Pourquoi tu te poses la question ? tu trouves ça trop long ?
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Ryzen le 06 novembre 2010 à 02:13
bah oui... normalement les rosetta font 3h, donc c'est byzarre
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: modesti le 06 novembre 2010 à 08:41
Tu peux régler la durée de calcul que tu veux accorder aux UT Rosetta dans tes préférences sur le site du projet. Par contre, il y aura toujours l'une ou l'autre UT qui sortira du cadre. :spamafote:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: toTOW le 09 décembre 2010 à 21:20
C'est tout cassé, le site répond plus :(
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: symaski62 le 10 décembre 2010 à 01:30
C'est tout cassé, le site répond plus :(

Dec 9, 2010
Today's heros are Keith and Darwin, our systems administrators and hardware architects. Yesterday, our main filesystem crashed hard. There were warning lights flashing behind every disk on the SAN and it looked pretty grim. Thankfully, Keith and Darwin were able to pinpoint the problem to two redundant laser modules for the fiber optic loops (it was amazing and unlucky that both failed). The laser modules have since been replaced and the filesystem is back up. We'll be starting up the project again shortly. Thanks for your patience.

bah !   :)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: toTOW le 10 décembre 2010 à 02:45
C'est reparti, mes WUs sont rentrées à la maison :)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: JeromeC le 10 décembre 2010 à 09:33
Ben dis donc, ils ont pas une architecture de lopette, c'est star wars !
Titre: Re : Re : Re : Rosetta@home
Posté par: al@ON le 11 décembre 2010 à 19:30
Dec 9, 2010
Today's heros are Keith and Darwin, our systems administrators and hardware architects. Yesterday, our main filesystem crashed hard. There were warning lights flashing behind every disk on the SAN and it looked pretty grim. Thankfully, Keith and Darwin were able to pinpoint the problem to two redundant laser modules for the fiber optic loops (it was amazing and unlucky that both failed). The laser modules have since been replaced and the filesystem is back up. We'll be starting up the project again shortly. Thanks for your patience.

bah !   :)

Merci pour la trad symaski... :biglol:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: symaski62 le 12 décembre 2010 à 00:32
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=5338

http://www.miketyka.com/data/mtyka_dkeedy_2010.pdf

12 pages :) 1Mo fichier :)

 :jap:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: symaski62 le 15 décembre 2010 à 15:29
:)   image    rosetta@home  :)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: JeromeC le 15 décembre 2010 à 23:42
Heu, c'est très beau, mais encore ?
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: popolito le 16 décembre 2010 à 12:33
Moi j'aperçois Jésus dans ces screens.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: JeromeC le 16 décembre 2010 à 22:27
Mmmm je dirais plutôt son foie ou ses poumons :D

A moins qu'il ne s'agisse de... 6 6 6 THE NUMBER OF THE BEAST ! Hell and fire was spawned to be released !!!! (c) I.M.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: popolito le 17 décembre 2010 à 07:35
Mmmm je dirais plutôt son foie ou ses poumons :D

A moins qu'il ne s'agisse de... 6 6 6 THE NUMBER OF THE BEAST ! Hell and fire was spawned to be released !!!! (c) I.M.
Sac'é Jé'omeC (http://s2.noelshack.com/old/up/sacweeiouberttinygd-93fe4e1644.jpg)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: symaski62 le 26 décembre 2010 à 18:20
http://www.youtube.com/watch?v=XysoVkwn9WI 

720p  HD  :)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: JeromeC le 27 décembre 2010 à 00:29
T'as quand même réussi à avoir 21 visites :lol:
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: symaski62 le 27 décembre 2010 à 00:56
T'as quand même réussi à avoir 21 visites :lol:

:p    photo  coolpix  S5100   :)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: popolito le 27 décembre 2010 à 10:16
Wasabi.
Titre: Re : Re : Re : Rosetta@home
Posté par: Pascal94 le 27 décembre 2010 à 12:06
:p    photo  coolpix  S5100   :)

je me demandais ce que tu voulais qu'on regarde... maintenant j'ai compris...  :jap:

c'est la qualité de ton Coolpix S5100  :p

cadeau du papa noël ?
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: symaski62 le 27 décembre 2010 à 21:38
oui   ^^
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: al@ON le 27 décembre 2010 à 22:48
C'est carrément le buuuuuuuuuuuuzzzzzzzzzzzzzzzzzzz de cette fin d'année :siflotte:... gaffe symaski tu vas finir sur 50 minutes inside et chez Morandini. :gno:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: supersnoopy le 04 janvier 2011 à 17:20
 :hello:

Que se passe-til avec Rosetta, aucune production depuis plusieurs jours.... ???

Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: modesti le 04 janvier 2011 à 17:25
la réponse est ailleurs (http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,4036.msg266391.html#msg266391) ;)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: supersnoopy le 04 janvier 2011 à 17:40

ah ok merci :jap:

étrange que rien n'en soit dit sur le site de rosetta....
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: [AF>Libristes] ℯ.clℯmℯnt le 10 janvier 2011 à 20:51
En plus il parait qu'il n'y a pas de souci à se faire (http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=3752&nowrap=true#69133) avec les unités qu'on ne peut pas envoyer. Il semblerait qu'il y ai eu de gros problèmes avec les serveurs ces derniers temps, attendons que tout revienne en ordre (j'espère juste que mes WUs ne vont pas périmer entre temps ;) ).
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: al@ON le 10 janvier 2011 à 22:44
Quand il y a des problèmes de ce genre les projets valident le travail fait même si celui-ci arrive après la date de péremption.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: popolito le 11 janvier 2011 à 07:46
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=5308&nowrap=true#69175
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: tristesire le 12 janvier 2011 à 23:51
Merci pour le lien Popolito, toutefois il serait plus profitable à tous qu'au lieu de linker comme tu le fais souvent, tu mette à disposition par citation ce que tu veux nous dire.
Et lorsqu'il s'agit d'un texte en lague étrangère, à défaut d'une traduction littérale, un bref résumé ne serait pas de trop.

Citer
The CASP9 meeting was very interesting.

The general consensus of the assessors this year was that there were a number of groups "at the top", but there were no outright winners-there is a bit of bunching up and many groups did very well by successfully picking from among the models submitted by automated servers (you can imagine this led to a lot of discussion at the meeting). While no group clearly outperformed other groups by a significant margin, the best ab initio structure prediction at the meeting stood out quite clearly. This was a Rosetta@home product entirely-the rosettaServer this year sent jobs out to rosetta@home and then submitted models from the lowest energy clusters. this was without a doubt the best automated ab initio structure prediction in casp.

In contrast to our approach with rosetta@home which carries out a large scale search for the lowest energy structure, other groups have developed methods that cleverly exploit information present in the protein structure database, and with the increase in the size of this database, these methods keep working better. I am now very interested in using such information to help guide the search for the lowest energy structure (which is very hard for large proteins), in the same way we have been using experimental data to guide search. Some of the jobs going out in the next months on rosetta@home will be testing approaches for taking advantage of this information.

I apologize for the recent system crash. we are beefing up our servers considerably so hopefully this won't happen again for a long time to come.

Je suppose que tu voulais signaler la dernière phrase dans laquelel David Baker s'excuse pour les désagrément engendrés par l'amélioration actuelle des sefveurs de Rosetta@home, en espérant qu'ils n'auront pas besoin de les retoucher avant longtemps.


J'ai pour ma part pu uploader certaines unités, mais pas toutes. Ca fait près d'une semaine que les serveurs sont ainsi.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: toTOW le 12 janvier 2011 à 23:58
J'ai une WU terminée qui veut pas rentrer chez elle ...  "Project file upload handler is missing" :/
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: tristesire le 13 janvier 2011 à 00:22
Question/réponse tirée du forum de Rosetta ici :http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=5502
Citer
Hmmm.....strange.......
From eight jobs, five uploaded normaly, but 3 won't upload.
12-1-2011 20:22:46   rosetta@home   Started upload of patrick_test_01_rlbn_1fkb_IGNORE_THE_REST_NATIVE_22848_37_0_0
12-1-2011 20:22:47   rosetta@home   Project file upload handler is missing
12-1-2011 20:22:47   rosetta@home   Backing off 1 hr 1 min 31 sec on upload of patrick_test_01_rlbn_1fkb_IGNORE_THE_REST_NATIVE_22848_37_0_0

They're all 'patrick_test' jobs!
Maybe that's the thruth meaning of 'ignore the rest'?

Should I delete the stuff?


Citer
Should I delete the stuff?


No.


Un peu de patience.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: toTOW le 13 janvier 2011 à 21:07
Apparement elle a finit par passer :)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: [AF>Libristes] ℯ.clℯmℯnt le 14 janvier 2011 à 13:27
Bonheur, 3 WUs sont rentrés à la maison à l'instant !
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: philippe76 le 08 avril 2011 à 07:07
hello pour moi les wu's recommence et recommence et recommence plusieurs fois quelqu'un pourrais me dire pourquoi? merci d'avance
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: popolito le 08 avril 2011 à 13:27
hello pour moi les wu's recommence et recommence et recommence plusieurs fois quelqu'un pourrais me dire pourquoi? merci d'avance
Pourquoi.

Pas d'quoi.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: fzs600 le 08 avril 2011 à 14:11
 :warf:
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 08 avril 2011 à 14:57
hello pour moi les wu's recommence et recommence et recommence plusieurs fois quelqu'un pourrais me dire pourquoi? merci d'avance

Je ne suis pas, en ce moment, sur Rosetta et j'ai un peu cherché sur le forum Rosetta, mais rien de concluant.

Si tu comprends l'anglais, tu peux poser une question là : http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_help_desk.php

Sinon, essaie de suspendre les wu et de recommencer le projet  :/

désolé de ne pas avoir de solutions. 
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: popolito le 08 avril 2011 à 16:38
Tout simplement car les checkpoints se font à chaque fin de simulation, donc la durée entre chaque checkpoint est très variable et peut aller jusqu'à la durée de l'unité, donc si tu éteins ton pc toutes les 20 min, il reprend du début.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: philippe76 le 09 avril 2011 à 08:06
 :cry: j'ai regarder sur le forum de rosetta mais moi et l'anglais ca fais 2,j ai 3 pc qui tourne 24/24 ,+3000 points/j  merci  pour le pquoi 
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: popolito le 14 avril 2011 à 17:44
Le boulanger est content car il va faire d'la drogue : http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=1177&nowrap=true#70008
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: popolito le 07 mai 2011 à 18:09
Papier dans Nature : http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=1177&nowrap=true#70246
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: RLDF le 07 mai 2011 à 19:10
Le boulanger est content car il va faire d'la drogue : http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=1177&nowrap=true#70008
tu as dû lire "drugs", c'est un faux-ami  :kookoo:
drugs se traduit par médicament, la drogue se dit dope.

c'est comme "library" qui n'est pas une librairie mais une bibliothèque
ou bien "excited" n'est pas "excité" mais "passionnant
ou bien "actually" n'est pas "actuellement" mais "réellement" ("actuellement" se traduisant par "currently")

 :siflotte:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Prof le 07 mai 2011 à 20:19
Tiens??!! J'ai trouvé un petit problème dans les préférences de calcul de ce projet!!
On ne peut pas mettre "0" dans le partage des ressources!!! Il remet automatiquement 100 quand on sauvegarde après modification!!
Pas cool!! Moi qui voulait régler ça comme ça pour que Rosetta prenne doucement le relais de WCG au fur et à mesure que mon cache se viderait!!!
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: JeromeC le 07 mai 2011 à 21:01
@rldf : je crois que t'es fait piéger, il y avait une caméra cachée :D
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: RLDF le 07 mai 2011 à 21:47
Tiens??!! J'ai trouvé un petit problème dans les préférences de calcul de ce projet!!
On ne peut pas mettre "0" dans le partage des ressources!!! Il remet automatiquement 100 quand on sauvegarde après modification!!
Pas cool!! Moi qui voulait régler ça comme ça pour que Rosetta prenne doucement le relais de WCG au fur et à mesure que mon cache se viderait!!!
sur la plupart des projets, on ne peut pas mettre 0
mais sur BAM, on peut :)
j'utilise BAM pour centraliser la gestion des projets et ça marche nickel  :sun:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: modesti le 07 mai 2011 à 21:48
sinon, ya toujours moyen de mettre 1 ;)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Prof le 07 mai 2011 à 21:49
Oui mais "1" ça ne bloque pas le travail!!
Il passe qq WUs au travers des mailles!! ;) :D
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: al@ON le 07 mai 2011 à 22:59
Prof si tu a réglé à 0 un projet pour lequel il te reste des UTs à cruncher, il me semble que ce paramètre n'empêchera pas BOINC de les calculer mais seulement de ne pas en charger de nouvelles tant que tes autres projets ouverts reçoivent du travail.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Prof le 07 mai 2011 à 23:03
c'est exactement ça et c'est exactement ce que je voudrait faire car je serai absent lors du basculement entre WCG et Rosetta!!
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: al@ON le 07 mai 2011 à 23:14
C'est donc WCG que tu dois régler à 0 le souci est que ce paramétrage ne fonctionne pas avec ce projet, il y a quelques temps j'avais essayé par BAM! et par ma page de Compte et j'avais fini par le mettre à 1. :spamafote:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Prof le 07 mai 2011 à 23:24
Ben non!! Ce que je veux c'est que mes UTs WCG finissent et que Rosetta prenne la suite. Donc c'est bien Rosetta qu'il faut mettre à "0"!!
Un projet réglé à "0" ne prend du travail, ou calcule ses WUs que s'il y a des cores de libres.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: al@ON le 07 mai 2011 à 23:41
Oui bien sûr, faut juste bien calculer le cache pour WCG.
Titre: Re : Re : Re : Rosetta@home
Posté par: popolito le 08 mai 2011 à 10:42
tu as dû lire "drugs", c'est un faux-ami  :kookoo:
drugs se traduit par médicament, la drogue se dit dope.
T'es sûr ?  :miam:

@rldf : je crois que t'es fait piéger, il y avait une caméra cachée :D
Chut, dis rien  :D
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: JeromeC le 08 mai 2011 à 11:59
 :ange:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: modesti le 12 mai 2011 à 21:55
vraiment pas rentable sur i7 sous Win7 pro 64b http://boinc.bakerlab.org/rosetta/results.php?hostid=1361965&offset=160 :cpopossib:
non seulement à cause des nombreuses erreurs de calcul (bon, si je divise les crédits accordés par 2 pour en tenir compte, ça me donne à peu près les mêmes crédits que sur mon Athlon 64 3000+ sous WinXP pro 32b), mais alors 10 points pour >12h de calcul :eek: :bouh: :eek: doit y avoir au moins une erreur de virgule qq part
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: JeromeC le 13 mai 2011 à 09:40
T'as pas de chance, moi mon i7 il ne fait aucune erreur. Bon, pas le même OS, certes...
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 13 mai 2011 à 13:10
T'as pas de chance, moi mon i7 il ne fait aucune erreur. Bon, pas le même OS, certes...

Moi non plus il ne fait pas d'erreur mon i7 sous win7 64b....
Titre: Rosetta@home - Update
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 16 juin 2011 à 15:04
http://www.boinc-af.org/breves/1258-rosetta-mersernne-et-ideologiashome.html
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: samuel debergh le 16 juin 2011 à 16:02
bon travail , mr des îles.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: popolito le 19 juin 2011 à 10:08
Le boulanger est excité : http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=1177&nowrap=true#70577
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: [AF>Libristes] ℯ.clℯmℯnt le 20 juin 2011 à 09:24
merci popolito pour ces infos et ces traductions
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: JeromeC le 20 juin 2011 à 15:26
C'est clair qu'il utilise tout le temps le mot "excited", c'est dégueu son clavier doit être tout collant maintenant :gno:

Et sinon ben il dit que rosetta, ça sert à quelque chose, finalement.

 :warf:
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: RLDF le 20 juin 2011 à 20:16
C'est clair qu'il utilise tout le temps le mot "excited", c'est dégueu son clavier doit être tout collant maintenant :gno:

Et sinon ben il dit que rosetta, ça sert à quelque chose, finalement.

 :warf:
"excited", c'est un faux-ami, ça se traduit par "passionnant"  :smak:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: JeromeC le 20 juin 2011 à 22:34
Merci beaucoup pour la leçon :jap:

Ah, j'oubliais, il s'agissait de 2nd degré rapport au post de popolito, qui en était également :p

('tention là, je veux pas dire "qu'il en est" hein, n'allez pas croire...  :blbl: )
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: popolito le 21 juin 2011 à 22:10
(http://nsm05.casimages.com/img/2011/01/19/1101190154251156837495313.gif)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Hildor le 22 juin 2011 à 19:28

Elle dit quoi !  :ange:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 22 juin 2011 à 20:18
troller en boucle.  :o
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: toTOW le 24 juillet 2011 à 18:17
Rosetta@Home et Folding@Home : des projets complémentaires (http://fr.fah-addict.net/news/news-0-465+rosetta-home-et-folding-home-des-projets-complementaires.php)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Pascal94 le 24 juillet 2011 à 18:20
ah bah c'est bien ça  :jap:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 24 juillet 2011 à 18:48
 :D oui, très bonne info, merci ToTOW  :hello:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 24 juillet 2011 à 19:52
Peut être la mettre sur le portail  ?
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 24 juillet 2011 à 20:03
portail boinc, faire de la pub pour fah ? si approbation de la CàA ou du CD5.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Pascal94 le 24 juillet 2011 à 20:30
demandez à Vijay de nous faire de la pub sur le blog Folding :warf:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: JeromeC le 24 juillet 2011 à 21:31
De la pub pour rosetta oui on peut.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: toTOW le 24 juillet 2011 à 22:19
C'est de la pub croisée :ange:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 24 juillet 2011 à 23:15
ni voyez pas une quelconque réticence de ma part, mais bien une approbation des "hautes" sphères.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: modesti le 25 juillet 2011 à 08:03
Peut être la mettre sur le portail  ?

Je n'en vois pas vraiment l'intérêt.
Que ce soit publié ici, c'est très bien. C'est d'ailleurs une excellente nouvelle de voir que les plate-formes ne font pas que se tirer dans les pattes :D mais de là à en faire une news... bof
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Cocagne le 25 juillet 2011 à 08:12
c'est une information qui concerne F@H pas Boinc, elle n'a pas sa place sur le portail pour moi
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 25 juillet 2011 à 10:28
ok ok les filles....
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Pascal94 le 25 juillet 2011 à 12:51
compris Boris  :cavachier: :cavachier: :cavachier:

 :lol: :lol: :lol:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: JeromeC le 26 juillet 2011 à 07:47
Et qu'on ne le répète pas 2 fois :p
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: symaski62 le 01 août 2011 à 22:49
Jul 28, 2011
Predictor of the day: Congratulations to BF (Team L'Alliance Francophone) for predicting the lowest energy structure for workunit T572_bd_rs_stg0_lrlxMultiCst_t000__casp9__aln1_SAVE_ALL_OUT_28073_0 !


bravo !
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 13 octobre 2011 à 16:01
6 Octobre 2011
Journal post de David Baker


Un récent numéro de Nature décrit un résultat passionnant de Rosetta@home, en collaboration avec le laboratoire de spectroscopie NMR de Lewis Kay à Toronto.
Sur presque toutes les unités de travail, les protéines, afin de remplir leurs fonctions, ont modifié quelque peu leur conformation, mais il a été extrêmement difficile de déterminer la nature de ces changements.
Le groupe de Lewis Kay a développé de nouvelles méthodes pour obtenir des informations expérimentales sur la plus haute énergie des protéines et leurs conformations . Ces données ne sont pas suffisantes pour déterminer la structure de ces conformations « état excité » à l'aide de méthodes conventionnelles.
Cependant, comme celà est développé dans l'article, nous pouvons utiliser ces données expérimentales pour guider les calculs de structure Rosetta et Rosetta@home et ainsi reproduire des modèles de ces états.
Nous sommes allés encore un peu plus loin que cela dans le document à l'aide de calculs de conception de Rosetta pour stabiliser l'état excité et les expériences subséquentes ont confirmé la validité du modèle.
Cette combinaison des données expérimentales de la RMN, des calculs de structure de Rosetta et de la conception de Rosetta devrait être très intéressante pour comprendre comment les protéines remplissent leurs fonctions.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 23 octobre 2011 à 18:41
trad perso.

22 Octobre 2011
Journal de bord de David Baker


Il est question aujourd'hui du magazine "Science", celui-ci  décrit une  nouvelle approche pour la conception de vaccin contre le VIH à l'aide de Rosetta.
Contrairement aux autres virus comme la poliomyélite et la grippe,  le VIH inactivé ou les protéines  VIH  n'ont pas fonctionné comme  vaccins possibles, et donc, comme vous le savez il n'existe actuellement aucun vaccin efficace contre le VIH.
Notre approche de la conception d'un possible vaccin est la suivante :
On prend les morceaux de surface de la protéine du VIH, là où se forme les anticorps des malades et à l'aide du greffon Rosetta, sur ses échafaudages stables, on pourra potentiellement créer en grandes quantités des anticorps qui pourraient être utiles pour le vaccin.
Nous avons montré plus tôt que cela peut se faire directement avec Rosetta si les morceaux de la protéine du VIH sont contigus le long de la séquence.
Mais il est encore plus difficile de le réaliser, de discerner ses anticorps au sein d'une protéine en trois dimensions.
Dans cet article, nous montrons comment ces epitopes (http://fr.wikipedia.org/wiki/%C3%89pitope) « discontinus » peuvent être transférés du gp120 du VIH à une protéine d'échafaudage simple.
Plus de travail sera nécessaire afin de  déterminer si les molécules conçues ou d'autres seront efficaces en utilisant cette approche contre le VIH.

Laissez-nous l'espoir d'y croire !  :)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 26 octobre 2011 à 22:09
mise à jour du logiciel Rosetta@Home,  vers la version 3.17.  :jap:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: toTOW le 27 octobre 2011 à 01:46
Changelog ? Enfin un PPD potable ?
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 27 octobre 2011 à 02:28
ce sont les unités qui changent de version, elles passent de la 3.14 à la 3.17,

pas d'informations sur les améliorations apportées, pour l'instant.  :/
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: fzs600 le 27 octobre 2011 à 07:29
ce sont les unités qui changent de version, elles passent de la 3.14 à la 3.17,

pas d'informations sur les améliorations apportées, pour l'instant.  :/
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=5833#71498 (http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=5833#71498) :kookoo:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 27 octobre 2011 à 11:03
 :kookoo:  :jap: :jap: merci fzs600
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: toTOW le 13 novembre 2011 à 18:03
La conso mémoire de ce projet est quand même abusée :/
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: Prof le 13 novembre 2011 à 18:36
La conso mémoire de ce projet est quand même abusée :/

T'as raison!!! :electric:
Sur mon 24 cores et 20 Go de Ram, des fois il n'arrive à en faire que 21 ou 22 en même tps!!! :cpopossib:
Les autres sont "en attente mémoire"!!
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: toTOW le 13 novembre 2011 à 19:11
Ben avec mes 2 Go, j'ai un i7 qui a planté :(
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: foo_fight le 13 novembre 2011 à 23:19
C'est vrai que ça rigole pas.

Environ 480 Mo de RAm pour une UT (réglage à 12H de calculs).

J'en fais pas plus de 2 à la fois.

Enfin en même temps la RAM n'est pas très chère depuis pas mal de temps alors c'est pas trop un problème je pense.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: toTOW le 14 novembre 2011 à 11:54
Bah je suis toujours en 32 bits, alors je vais pas mettre plus de 3 Go ... :siflotte:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Fabrice.ltn le 14 novembre 2011 à 22:14
Pour ma part, mon quad amd confirme la panne... il renvoie toujours des paquets d'UT en erreur. Je ne vais pas le laisser calculer dessus, mon portable en revanche amène ses calculs jusqu'au bout... alors CQFD !!!
Titre: Rosetta@home
Posté par: mcroger le 04 janvier 2012 à 07:37
Le serveur ne répond plus :??:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: fzs600 le 04 janvier 2012 à 07:43
Le serveur ne répond plus :??:
Celui de RALPH non plus et depuis plusieurs jours.
http://ralph.bakerlab.org/ (http://ralph.bakerlab.org/)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: modesti le 04 janvier 2012 à 09:34
J'avais vu un message chez les Teutons qui informait que les serveurs de Rosetta déménagent à l'intérieur du campus et qu'ils seront par conséquent inaccessibles pendant quelques jours. Ils en profitent pour faire des mises à jour.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: foo_fight le 04 janvier 2012 à 23:49
Ceci explique cela.

Plus qu'à attendre alors.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: mcroger le 08 janvier 2012 à 20:39
C'est fait mais au niveau DNS y a un serveur dont la nouvelle adresse n'est pas encore à jour.

Résultat, on peut avoir des UT qui n'arrivent pas à partir.

Solution 1: attendre

Solution 2: mettre dans ses "hosts" la ligne suivante : 128.95.160.145 srv6.bakerlab.org

Source: http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=5880

J'ai fait la solution 2 (ben voyons) et ça tourne, puis j'ai réédité le fichier pour le remettre comme avant.
(sous OS X, un bon tuto simple à suivre (http://www.switchingtomac.com/tutorials/how-to-edit-the-hosts-file-in-os-x/))

:kookoo:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: JeromeC le 24 mars 2012 à 17:08
Rosetta fait plein de "no finished files errors" depuis quelques temps chez moi, j'en ai causé sur leur forum (http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=5914&nowrap=true#72582) et il semble que ça vienne de l'utilisation de boinc 7.x - sous Mac OS X du moins.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: foo_fight le 30 mars 2012 à 08:03
Question : elle vient d'où la version 7? Sur le site la dernière version en date est la 6.12.34.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: RLDF le 30 mars 2012 à 08:18
de là : http://boinc.berkeley.edu/dl (http://boinc.berkeley.edu/dl)  :kookoo:
ce sont des versions beta (de test)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: nabz le 30 mars 2012 à 13:02
ou de là http://boinc.berkeley.edu/download_all.php (http://boinc.berkeley.edu/download_all.php)

ça c'est la page des joueurs, mais pas trop.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: foo_fight le 30 mars 2012 à 14:31
Ok merci pour l'info.

Je vais néanmoins rester à la version recommandée.
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: nabz le 30 mars 2012 à 16:18
Je vais néanmoins rester à la version recommandée.

C'est clairement le bon choix pour le moment, sauf si on a besoin des nouvelles fonctions de la version 7.

Pour ma part, je suis passé à la 7.0.x pour le support openCL sur une machine Ati et pour la fonction <exclude_gpu> sur une machine nVidia.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: JeromeC le 31 mars 2012 à 14:26
Moi aussi, sauf que pour mac os x même avec lion ça le fait toujours pas, je pense qu'il faut avoir un mac pro, et la c'est un peu trop!

Donc effectivement je pourrais revenir à la version recommandée finalement, et relancer rosetta... Mais bon c'est pas les projets qui me manquent non plus hein...
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: JeromeC le 11 avril 2012 à 20:08
Etant passé sous la dernière 7.0.25, nouvelle version stable / recommandée, je me suis dit que j'allais dégeler rosetta pour voir, et bien m'en a pris puisque ça remarche.

Ça crédite toujours aussi peu (http://boinc.bakerlab.org/rosetta/results.php?hostid=1349340), mais ça remarche :D
(j'aime beaucoup l'écart entre le petit "claimed" et le minuscule "granted")

Mais bon on y va pas pour les crédits hein, sinon ça se saurait  :siflotte:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Spica le 11 avril 2012 à 23:31
Maintenant que j'ai mis 10Go sur mon PC, je vais peut-etre pouvoir en faire de nouveau avec mon i7 (vu la memoire que ca devore par unit!). Pour les credits, il y a les projets GPU qui compensent !!! C'est aussi faible que Leiden.... :priz2tet:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: JeromeC le 12 avril 2012 à 07:30
Une info en passant sur le fofo de rosetta où le project admin/dev/scientist a répondu à un autre gars après mon post :

"Ralph and Rosetta@home are intended to be basically the same. Ralph just gets applications and new jobs slightly before Rosetta does, so we can hopefully avoid pushing bad jobs/applications to Rosetta@home. The whole point of Ralph is things which would give errors on Rosetta@home would show errors on Ralph first."

Il confirme que ralph et rosetta font la même chose mais que ralph le fait avant et permet de voir les problèmes en premier.
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: toTOW le 12 avril 2012 à 09:52
Maintenant que j'ai mis 10Go sur mon PC, je vais peut-etre pouvoir en faire de nouveau avec mon i7 (vu la memoire que ca devore par unit!). Pour les credits, il y a les projets GPU qui compensent !!! C'est aussi faible que Leiden.... :priz2tet:

D'ailleurs, vu la quantité de RAM que ca consomme, ils pourraient offrir un petit bonus de points supplémentaires pour remercier les cruncheurs ...
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Prof le 29 avril 2012 à 13:47
 :kookoo: TLM!!

Tiens ben puisque l'on parle pas mal de Rosetta en ce moment, il vient d'y avoir une mise à jour de toutes les applis Rosetta mini (v3.30) hier!!

Quelque chose à voir avec le BOINC PENTATHLON???

Edit 15h10:

Je ne sais pas si ce n'est que chez moi mais il y a un gros problème avec cette version de l'appli!!!!!!

Cela faisait longtemps que je n'avais pas calculé pour Rosetta et là du coup de la nouvelle appli et avant le Pentathlon je teste.......
Enfin j'essaie!!! Que des erreurs, les tâches n'arrivent pas à se lancer (initialiser??) et tournent dans le vide!!!

Je me détache et me rattache, résultats...... Pareil, des erreurs à répétition de ce genre:

Dim 29 avr 15:07:23 2012 | rosetta@home | Task rb_04_28_31019_62140__t000__2_C1_SAVE_ALL_OUT_IGNORE_THE_REST_49285_696_0 exited with zero status but no 'finished' file
Dim 29 avr 15:07:23 2012 | rosetta@home | If this happens repeatedly you may need to reset the project.
Dim 29 avr 15:07:23 2012 | rosetta@home | Restarting task rb_04_28_31019_62140__t000__2_C1_SAVE_ALL_OUT_IGNORE_THE_REST_49285_696_0 using minirosetta version 330 in slot 14
Dim 29 avr 15:07:24 2012 | rosetta@home | Task rb_04_28_31019_62140__t000__2_C1_SAVE_ALL_OUT_IGNORE_THE_REST_49285_696_0 exited with zero status but no 'finished' file
Dim 29 avr 15:07:24 2012 | rosetta@home | If this happens repeatedly you may need to reset the project.
Dim 29 avr 15:07:24 2012 | rosetta@home | Restarting task rb_04_28_31019_62140__t000__2_C1_SAVE_ALL_OUT_IGNORE_THE_REST_49285_696_0 using minirosetta version 330 in slot 14
Dim 29 avr 15:07:25 2012 | rosetta@home | Task rb_04_28_31019_62140__t000__2_C1_SAVE_ALL_OUT_IGNORE_THE_REST_49285_696_0 exited with zero status but no 'finished' file
Dim 29 avr 15:07:25 2012 | rosetta@home | If this happens repeatedly you may need to reset the project.
Dim 29 avr 15:07:25 2012 | rosetta@home | Restarting task rb_04_28_31019_62140__t000__2_C1_SAVE_ALL_OUT_IGNORE_THE_REST_49285_696_0 using minirosetta version 330 in slot 14
Dim 29 avr 15:07:26 2012 | rosetta@home | Task rb_04_28_31019_62140__t000__2_C1_SAVE_ALL_OUT_IGNORE_THE_REST_49285_696_0 exited with zero status but no 'finished' file
Dim 29 avr 15:07:26 2012 | rosetta@home | If this happens repeatedly you may need to reset the project.
Dim 29 avr 15:07:26 2012 | rosetta@home | Restarting task rb_04_28_31019_62140__t000__2_C1_SAVE_ALL_OUT_IGNORE_THE_REST_49285_696_0 using minirosetta version 330 in slot 14
Dim 29 avr 15:07:27 2012 | rosetta@home | Task rb_04_28_31019_62140__t000__2_C1_SAVE_ALL_OUT_IGNORE_THE_REST_49285_696_0 exited with zero status but no 'finished' file
Dim 29 avr 15:07:27 2012 | rosetta@home | If this happens repeatedly you may need to reset the project.
Dim 29 avr 15:07:27 2012 | rosetta@home | Restarting task rb_04_28_31019_62140__t000__2_C1_SAVE_ALL_OUT_IGNORE_THE_REST_49285_696_0 using minirosetta version 330 in slot 14

Et pour vous, ça donne quoi??
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: foo_fight le 29 avril 2012 à 15:24
Tiens j'avais pas fait attention au changement d'appli.

Pas de pb de mon côté avec ces UT.

Edit : i7 2600k Windows 7 64bits
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Excelsior le 29 avril 2012 à 15:31
Moi non plus, pas de problèmes avec un core i5 sous 7 x64.

Faudrait voir si le problème de Prof affecte d'autres personnes avec le même couple proco / OS
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: JeromeC le 29 avril 2012 à 23:21
Ben tu lis quelques msgs plus haut et c'est exactement le problème que j'avais en mars et qui c'était résolu tout seule, apparemment, via upgrade boinc...

Faudrait que je reteste ...
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 29 avril 2012 à 23:42
ce projet prends tjrs autant de ram : plus 500 mo par unité
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: toTOW le 30 avril 2012 à 00:25
Et n'accorde pas de bonus de points en compensation :/
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Jeannot Le Tazon le 08 mai 2012 à 17:43
Petite nouvelle que chacun lira avec plaisir :
May 8, 2012
Journal post from David Baker

A big THANK YOU to all of you who have scaled up your contributions to Rosetta@Home-this is a record level of computing power for us and is super well timed. THANKS!!!

PS :le pentathlon se déroule en même temps que CAPS 10...
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: JeromeC le 08 mai 2012 à 18:38
Question consommation de RAM, en ce moment j'ai 3 de mes 8 WU qui tournent au dessus de 800 Mo sur le mac :eek:
dont une à 930 et aucune au dessous de 400...
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: modesti le 08 mai 2012 à 18:50
PS :le pentathlon se déroule en même temps que CAPS 10...

Je n'ai aucune UT pour le CAPS10, uniquement des UT "normales" et CAPS9 :spamafote:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: foo_fight le 08 mai 2012 à 19:17
C'est quoi CAPS9 et CAPS10?
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: toTOW le 08 mai 2012 à 19:21
C'est ca : http://en.wikipedia.org/wiki/CASP
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: foo_fight le 08 mai 2012 à 19:45
Ok merci.

Et elles sont mieux "payés" les CAPS10?
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: Jeannot Le Tazon le 08 mai 2012 à 21:59
Je n'ai aucune UT pour le CAPS10, uniquement des UT "normales" et CAPS9 :spamafote:

Les CASP 10 commencent par rb
En vrac du fofo Rosetta : " If your work unit starts with the label rb you're running a CASP 10 target! rb is short for Robetta which is our publicly available server for structure prediction"
We'll be using CASP 9 to test our system while CASP 10 runs. We know what the correct solution for CASP 9 is but won't know the solutions for CASP 10 for a couple weeks.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: [AF>Libristes] nico8313 le 08 mai 2012 à 22:07
Merci Jeannot   :jap:

J'en ai donc une petite dizaine sur une machine  :D  cool  :)

ça fait aussi plaisir que le projet Rosetta soit content de nous  :sun: :hyperbon:
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: Jeannot Le Tazon le 08 mai 2012 à 22:11
Et elles sont mieux "payés" les CAPS10?
Non. Je crois pas.
ça dépend aussi bcp du temps de crunch choisi (1,2,3,...20h ou 1 journée).
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: modesti le 08 mai 2012 à 22:16
Les CASP 10 commencent par rb
En vrac du fofo Rosetta : " If your work unit starts with the label rb you're running a CASP 10 target! rb is short for Robetta which is our publicly available server for structure prediction"
We'll be using CASP 9 to test our system while CASP 10 runs. We know what the correct solution for CASP 9 is but won't know the solutions for CASP 10 for a couple weeks.

ok, alors j'en ai un paquet :D Merci pour l'info Jeannot :jap:
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: toTOW le 09 mai 2012 à 11:37
ça fait aussi plaisir que le projet Rosetta soit content de nous  :sun: :hyperbon:

Ils feraient mieux de nous le montrer en augmentant les points par WUs ...
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: [AF>Libristes] nico8313 le 09 mai 2012 à 11:43
Oui ce serait bien !!!

Histoire d'aller chatouiller un peu les projets mathématique par exemple  :D
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: al@ON le 09 mai 2012 à 23:27
C'est con pour David Baker, mais faudrait passer à WCG là... :siflotte:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: JeromeC le 19 juin 2012 à 13:42
Citer
Jun 10, 2012
Journal post from David Baker

Many common materials such as silk and wool are made out of regular repeating arrays of proteins, and symmetric protein arrays make up the coats of viruses and many other assemblies inside cells. The ability to robustly design self assembling materials made out of proteins would have huge numbers of applications-the naturally occurring assemblies are useful, but imagine if we could make custom materials for 21st century problems. In this weeks Science magazine, we describe the use of Rosetta to design self assembling protein nano structures with very high accuracy. We are now attempting to create many different types of symmetric materials, and you will be seeing more symmetric calculations on your rosetta@home screen server. Thank you for making possible this completely new approach to nanotechnology!

Citer
10 juin 2012
Message du journal de David Baker

De nombreux matériaux courants tels que la soie et la laine sont fabriqués à partir de répétitions  régulières de tableaux de protéines, et des tableaux de protéines symétriques forment les couches des virus et de nombreux autres assemblages à l'intérieur des cellules. La capacité à concevoir de façon robuste des matériaux auto-assemblés fabriqués à partir de protéines aurait un très grand nombre d'applications, les ensembles naturels sont utiles, mais imaginez si nous pouvions fabriquer des matériaux personnalisés pour les problèmes du 21e siècle.

Dans le magazine Science de cette semaine, nous décrivons l'utilisation de Rosetta pour concevoir des nano-structures de protéines auto-assemblées avec une précision très élevée. Nous sommes en train d'essayer de créer de nombreux types de matériaux symétriques, et vous allez voir de plus en plus de calculs symétriques sur votre économiseur d'écran rosetta@home.

Merci d'avoir rendu possible cette approche complètement nouvelle de la nanotechnologie!

Tant qu'à faire, je l'ai mis sur le portail, ça mange pas de virus :)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: [AF>HFR>RR] liegeus le 21 juin 2012 à 15:45
Bonjour Je viens de voir (mieux vaut tard que jamais) que dans les préférences de rosetta  on peut modifier la durée des unités de calcul entre 1h et 1 jour (avec une durée de 3h par défaut)

je me demande quels sont les avantages/inconvénients... quelle est l'influence de ce paramètre ? je n'ai pas trouvé de réponse à cette question...

merci de vos lumières !
@+
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: modesti le 21 juin 2012 à 17:14
Peut-être un début de réponse :
Il y a quelque temps, je suis passée de la durée par défaut à 6h. En fait, l'ordinateur a le temps d'effectuer davantage de calculs pendant cette durée plus longue - et donc tu récoltes davantage de points.

C'était flagrant chez moi quand j'ai comparé un résultat calculé avec mon Athlon 64 3000+ et un autre calculé sur mon i7 860 : En +/- 6h l'Athlon a généré 4 "decoys" (sur une autre UT c'était 7) pour 63 crédits, quand le i7 a généré 16 "decoys" pour  ~123 crédits.
Athlon: http://boinc.bakerlab.org/rosetta/result.php?resultid=512618402
i7: http://boinc.bakerlab.org/rosetta/result.php?resultid=513480841
(j'ai choisi des UT similaires, càd des rb_06_xxx)

J'en conclus, que pour un même ordi, plus tu crunches, plus tu génères de résultats, plus tu gagnes de crédits - et plus tu as de chances de trouver la "meilleure prédiction".
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Prof le 21 juin 2012 à 17:28
C'est certain que si tu passes plus de temps sur une même unité de travail tu vas générer plus de crédits mais en regardant tes propres chiffres, si tu fais une moyenne horaire tu en reviens toujours à la même chose entre 20 et 23 pts par heure.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: modesti le 21 juin 2012 à 17:43
Euh, pas vraiment, l'UT de l'Athlon n'a rapporté que 12.5 pts/heure par rapport à 21.7 pts/h pour le i7 :spamafote:
Mais bon, autour de 20 pts/h je trouve que c'est déjà bien - par rapport aux projets qui distribuent entre 7 et 13 pts/h
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: Xe120 le 21 juin 2012 à 18:48
Euh, pas vraiment, l'UT de l'Athlon n'a rapporté que 12.5 pts/heure par rapport à 21.7 pts/h pour le i7 :spamafote:
Mais bon, autour de 20 pts/h je trouve que c'est déjà bien - par rapport aux projets qui distribuent entre 7 et 13 pts/h

Ca doit dépendre de la puissance, un core d'i7 doit être plus puissant qu'un core d'athlon donc faire plus de calcul dans le même laps de temps.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Hildor le 21 juin 2012 à 20:12

Oui, il faut comparer, ce qui est comparable  :D
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: modesti le 21 juin 2012 à 22:33
Ca doit dépendre de la puissance, un core d'i7 doit être plus puissant qu'un core d'athlon donc faire plus de calcul dans le même laps de temps.
C'est exactement ce que j'expliquais dans mon message au-dessus :ange: :siflotte:

Pour comparer ce qui est comparable, je n'ai malheureusement plus d'UT de +/- 3h dans la liste de travail du projet :spamafote:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Andromede33 le 22 juin 2012 à 21:24
Bonjour,

Je crois bien que c'est la 1ère fois que j'interviens dans ce sujet ...
Je vous avais dit qu'à cause de la chauffe excessive de mon GPU je pouvais plus faire tourner de projets GPU ...
Alors j'ai recherché un prjet intéressant à la place qui tourne que sur mon Phenom ...
Et j'ai trouvé Rosetta qui à 100% (boitier fermé) 24/24 ne chauffe qu'à 58° sur mon Phenom.

Et pour répondre à la question de je ne sais plus qui ...
1er résultat = 4h06
2ème résultat = 4h05
3ème résultat = 4h10
Sur un Phenom II 3600@3800
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: modesti le 17 novembre 2012 à 11:13
Déterrage de topic :desole:

Pour aider au FB (et pour mes objectifs personnels), j'ai mis Rosetta sur mon i7. Les premières UT sont en train de se calculer et elles ouvrent systématiquement - et sans que je leur ai demandé quoi que ce soit - une fenêtre censée contenir les graphiques, mais il n'y a que le "masque" (càd la trame, les chiffres et textes, mais pas les protéines). Ça fait déjà plusieurs fois que je ferme ces fenêtres et elles reviennent automatiquement.
Win7 64, Boinc 7.0.28, Rosetta Mini 3.43

Vous avez le même problème ?
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: foo_fight le 17 novembre 2012 à 11:24
Non pas chez moi. Même version de BOINC et Windows et Rosetta 3.45.

JJ'ai jamais eu ce problème avec ls anciennes versions de Rosetta.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: modesti le 17 novembre 2012 à 11:41
Ben, si j'en crois l'historique de BoincLogX sur la bécane en question, j'ai déjà fait des minirosetta 2.17, 3.30, 3.31 et 3.41 et je n'ai jamais eu ce problème de "pop-up" :spamafote:
En plus, le temps de calcul (pas le temps écoulé) est toujours à 0 et l'avancement aussi. :priz2tet: Je me demande si c'est pas un bug :(

Si c'est ça, je peux mettre 239 UT à la benne :rhaa: :cry:


Edit: Ouf ! Je n'avais que 36 UT en version 3.43, les autres sont des 3.45 qui elles fonctionnent normalement (http://factoryjoe.s3.amazonaws.com/emoticons/emoticon-0141-whew.gif)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: LOCTET SetiOne le 17 novembre 2012 à 11:45
 :kookoo: Modesti
Idem même rosetta 3.43, même version de Boinc mais seven x86
La case montrer les graphiques est même grisée  :??:

Edit : j'ai des 3.45 en attente, à voir
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: modesti le 17 novembre 2012 à 12:16
Chui :ayalou:
Je viens de faire le test inverse sur la version 3.45: J'ai cliqué sur "montrer les graphiques". Une fenêtre s'est ouverte, puis refermée toute seule sans rien afficher :lol: Heureusement, ça n'a pas affecté l'évolution de l'UT  :D

Z'ont dû se planter sur le codage des graphiques dans l'appli entre la 3.43 et la 3.45  :jeanphi:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: toTOW le 17 novembre 2012 à 23:20
Dommage que ca prenne de plus en plus de RAM par WUs ce projet, ca me fait swapper toutes mes machines :/
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: JeromeC le 17 novembre 2012 à 23:28
C'est clair que quand je me prends 8 UT de 430 Mo c'est douloureux... :gni:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: sebastien11 le 17 novembre 2012 à 23:36
hou, les p'tites chochottes   :siflotte:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: JeromeC le 17 novembre 2012 à 23:37
Bah quand je faisais du Evo je me payais des UT à 1,3 Go la bête, c'est pas la question, mais quand même...
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: toTOW le 17 novembre 2012 à 23:39
J'ai pas beaucoup de RAM sur mes machines (ayant été conçues pour tourner sous XP 32 bits à l'origine).
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: sebastien11 le 17 novembre 2012 à 23:43
Je comprends, c'était une petite pique, pour rire, qui sont susceptibles  :siflotte: :D :D
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: modesti le 18 novembre 2012 à 08:22
C'est pas pire que FreeHal côté RAM :spamafote:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: LOCTET SetiOne le 18 novembre 2012 à 10:37
Au delà de la RAM, la taille des éléments à télécharger pour constituer des WU est importante, tout est relatif, sur une connexion ADSL ça ne se voit pas, par contre pour mon PC at work, compte tenu d'un proxy très bien paramétré (...) j'utilise le modem d'un smartphone, et là on a le temps d'observer ces éléments en DL  :coffeetime:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: nafrayou le 18 novembre 2012 à 20:56
ho y a pas mieux que Neurona pour tester votre RAM  ! la c est de la folie  et c est qu une seul WU par machine meme sur les i7 !
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: JeromeC le 18 novembre 2012 à 22:13
Ah tiens j'avais pas pensé à ça, essayer de partager la connexion du samsung avec un cable USB... bon sachant que je capte pratiquement rien dans le bureau et que tout est blindé sur PC, c'est pas gagné quand même... je sens que la valse des unités sur clé USB a de beaux jours devant elle...

Pour Neurona en effet, WUProp montre du 1,6 Go sur win, mais bon avec de la RAM tu peux en faire tourner plusieurs...

Mais tout ceci commence à être pas mal hors sujet, on va bientôt se faire modérer :D
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Maurice Goulois le 29 novembre 2012 à 10:34
Ah oui effectivement, le fb est une épreuve pour les projets :)
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: fr@ntz le 07 décembre 2012 à 23:54
Ah oui effectivement, le fb est une épreuve pour les projets :)
fb = facebook ?
Rosetta y a sa page : https://www.facebook.com/pages/Rosettahome/161671540539170
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: toTOW le 08 décembre 2012 à 02:00
Formula Boinc voyons !
Titre: Re : Re : Re : Rosetta@home
Posté par: LOCTET SetiOne le 08 décembre 2012 à 08:03
fb = facebook ?
Rosetta y a sa page : https://www.facebook.com/pages/Rosettahome/161671540539170

Formula Boinc voyons !
Tu as vu qui "pose" cette question  :JC:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Maurice Goulois le 08 décembre 2012 à 12:54
C'est l'effet (http://img1.picmix.com/output/stamp/thumb/6/8/0/9/29086_de531.gif)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 22 janvier 2013 à 14:36
la raison ici:

http://boinc.bakerlab.org/rah_status.php
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: foo_fight le 17 février 2013 à 20:24
Depuis ce matin impossible d'envoyer le résultat de mes UT.

Je suis le seul?

Pourtant sur mes autres projets pas de problème.

J'ai aussi "retrait de projet" d'inqiqué dans la colonne état, ça veut dire quoi?
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 17 février 2013 à 20:25
même souci, je pense que ça va revenir....  :hello:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: foo_fight le 17 février 2013 à 21:50
ok merci pour l'info.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 18 février 2013 à 11:51
Tous ceux qui ont des soucis pour renvoyer les résultats, prenez votre mal en patience...

En effet, dans les discussions du forum Rosetta@home, il ressort que les admins du projet risquent de ne pas passer avant mardi pour s'apercevoir du problème, car aujourd'hui est un jour férié aux USA.
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: fzs600 le 18 février 2013 à 12:04
car aujourd'hui est un jour férié aux USA.
http://www.guidedesfetes.com/le-jour-de-georges-washington-63-f.html (http://www.guidedesfetes.com/le-jour-de-georges-washington-63-f.html)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: JeromeC le 18 février 2013 à 14:07
Comme quoi y'a pas que chez nous qu'il y a des ponts tout le temps :D
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 18 février 2013 à 19:36
C'est reviendu,  :hyperbon: :hyperbon:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: amine548 le 18 février 2013 à 19:46
 :jap: Bonne nouvelle.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Fabrice.ltn le 12 avril 2013 à 17:18
Tient, depuis le début du PD2S je n'avais pas eu d'erreur de calcul et depuis hier ça recommence, y a une UT sur deux qui part en erreur de calcul.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Prof le 14 avril 2013 à 11:30
Ben là on dirait que le serveur à pris un abonnement au Crash Server Tour!!! :cpopossib:
Les Wus partent plus, les crédits ne sont plus relevés (ou presque), depuis le 11 sur statbzh, au compte goutte chez Seb, rien depuis 3 jours aussi chez Boincstats!!
A suivre...
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: [AF>Libristes] Pascal le 14 avril 2013 à 11:45
Oui, il va falloir basculer sur autre chose... si ça dure plus de 10 heures. :/
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: LOCTET SetiOne le 14 avril 2013 à 13:27
yoyo  :gniak:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: ordralfabetix le 14 avril 2013 à 20:34
14/04/2013 20:23:16 | rosetta@home | Server error: feeder not running :gno:
késako un feeder???
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 14 avril 2013 à 20:38
le chargeur d'unités?
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: toTOW le 14 avril 2013 à 22:42
C'est le programme qui génère les unités de travail.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: LOCTET SetiOne le 14 avril 2013 à 22:52
tout est hs
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: [AF>Libristes] Pascal le 14 avril 2013 à 22:52
Je ne dirais pas vraiment ça :

Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Prof le 14 avril 2013 à 22:54
 :capello:

 :D
Titre: Problème inscription rosetta@home
Posté par: alinthda le 15 avril 2013 à 00:10
Bonjour a tous

Comme dis dans le titre je n'arrive pas a me créer un compte chez rosetta.

Depuis BAM je reçois le message suivant: Email address not unique si j'utilise chercher un compte il ne trouve rien.

J'ai donc essayé de créer un compte moi même sous debian avec la commande: --create_account URL email passwd name
La connexion au serveur s'établie correctement puis je reçois le message: database lookup not unique

J'ai essayé un tas de mail différent dont je suis sur qu'ils n'ont jamais été utilisés et toujours les même messages.

J'ai essayé un --lookup_account URL email passwd et je reçois le message: no database rows found in lookup/enumerate

A votre avis? Leur base de données pour l'inscription est out ou je mis prend mal?

merci d'avance
Titre: Re : Problème inscription rosetta@home
Posté par: alinthda le 15 avril 2013 à 00:20
Merci de cette réponse rapide, j'ai trouvé aussi cette page mais je n'ai pas su identifié quel serveur héberge la base de données, peux tu m'éclairer?
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: [AF>Libristes] Pascal le 15 avril 2013 à 08:45
 :kookoo: C'est revenu.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: kasur le 01 janvier 2014 à 15:05
J'ai arrêté le projet, à coup de Alt+Ctrl+Supp et suppressions de répertoires, ça calculait plus rien et ralentissait mon PC régulièrement depuis quelques jours, comme si je manquais de mémoire (16Go pour 12 threads).

Sur leur site on peut voir sur le forum que certaines unités demandent 4Go de mémoire vive + 2 de physique... et le projet propose de calculer ailleurs si on a pas la configuration requise... c'est vraiment dommage qu'un projet aussi populaire n'ai pas un systeme qui permette de calculer ou non sur ces unités ou d'en choisir le nombre maximum  :(

 :hello: Rosetta
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: kasur le 01 janvier 2014 à 19:23
ça tourne bien aussi la plupart du temps mais des fois non, je pense que ces des unités foireuses qui trainent, en tous cas c'est incalculable :(
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: foo_fight le 01 janvier 2014 à 21:00
4 Go pour 1 UT?!!!  :eek:

Chez moi ça n'a jamais dépassé les 400 Mo par UT.

Edit : je viens d'en choper une à plus de 800 Mo.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: toTOW le 11 janvier 2014 à 19:34
C'est pas la première fois que je rale après les exigences de ce projet ... qui en plus crédite ridiculement en contrepartie, ce qui n'est pas très juste pour les crunchers :(
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: LOCTET SetiOne le 11 janvier 2014 à 20:07
Tu n'as pas tord  :lol:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: JeromeC le 12 janvier 2014 à 22:03
"Sauf que les projets bio ça crédite pas des masses" (dixit un utilisateur de projet bio :) )
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: nabz le 03 août 2014 à 00:20
J'ai environ 200 UT calculées que mes machines n'arrivent pas à renvoyer.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: julienh le 03 août 2014 à 09:28
 :hello:
Il y avait un problème de débit sur le réseau sur le site de l'université.
C'est réparé : toutes mes unités sont envoyées depuis cette nuit.
J'en ai également récupéré qq unes.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Xe120 le 08 octobre 2014 à 00:25
Citer
Android running on ARM   3.58    15 Sep 2014 23:32:29 UTC

Quelqu'un a essayé de faire tourner l'application ?  :hello:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: [AF>Libristes] Pascal le 08 octobre 2014 à 08:15
 :kookoo: J'en ai une en cours de calcul. 25% de fait en 3 heures de calcul.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: [AF>Libristes] Pascal le 08 octobre 2014 à 16:27
Unité terminée en 12880 secondes (8,42 heures pour wuprop) pour 27,98 points.
Ça m'a ouvert une nouvelle ligne d'application dans wuprop --> je termine asteroid avant de reprendre ce projet.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Xe120 le 08 octobre 2014 à 23:33
Merci du retour, j'imagine que c'est sur le Raspberry Pi.  :jap:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: [AF>Libristes] Pascal le 09 octobre 2014 à 05:48
Non, pour le RasPi il faut une application spécifique, l'OS du RasPi n'est pas de l'android, c'est du Debian pour ARMv6 (raspbian).
Ça a été fait sur une tablette android.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Xe120 le 11 octobre 2014 à 11:59
Citer
695498502   626584898   8 Oct 2014 23:16:30 UTC   11 Oct 2014 9:48:14 UTC   Over   Success   Done   168,690.40   205.00   281.45

Effectivement ça a l'air de fonctionner et ça suit la règle de durée fixer dans les options. :hello:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: [AF]KirkPitaineK le 12 octobre 2014 à 09:00
Salut à tous !
Je viens de changer de matériel (core i7 4790k sur une Asus Maximus Hero vi) et j'ai des soucis de BSOD provoqués par Rosetta (un à deux par jour). Je précise que je n'ai effectué aucun overclocking et que le système est stable pour tout autre projet BOINC et en utilisation courante.
D'autres ont-ils des problèmes avec ce type de matos et Rosetta ?

Voici un aperçu du crash dump :
*******************************************************************************
*                                                                             *
*                        Bugcheck Analysis                                    *
*                                                                             *
*******************************************************************************

WHEA_UNCORRECTABLE_ERROR (124)
A fatal hardware error has occurred. Parameter 1 identifies the type of error
source that reported the error. Parameter 2 holds the address of the
WHEA_ERROR_RECORD structure that describes the error conditon.
Arguments:
Arg1: 0000000000000000, Machine Check Exception
Arg2: ffffe0012fe13028, Address of the WHEA_ERROR_RECORD structure.
Arg3: 00000000bf800000, High order 32-bits of the MCi_STATUS value.
Arg4: 0000000000000124, Low order 32-bits of the MCi_STATUS value.

Debugging Details:
------------------

Page 129038 not present in the dump file. Type ".hh dbgerr004" for details

BUGCHECK_STR:  0x124_GenuineIntel

DEFAULT_BUCKET_ID:  WIN8_DRIVER_FAULT

PROCESS_NAME:  minirosetta_3.

CURRENT_IRQL:  f

ANALYSIS_VERSION: 6.3.9600.17237 (debuggers(dbg).140716-0327) amd64fre

STACK_TEXT: 
ffffd000`4b3e4df8 fffff802`61e41213 : 00000000`00000124 00000000`00000000 ffffe001`2fe13028 00000000`bf800000 : nt!KeBugCheckEx
ffffd000`4b3e4e00 fffff802`62039f71 : 00000000`00000001 ffffe001`2b4ab480 ffffe001`2b4ab480 ffffe001`2fe13028 : hal!HalBugCheckSystem+0xcf
ffffd000`4b3e4e40 fffff802`61e416a0 : 00000000`00000728 00000000`00000003 ffffd000`4b3e5230 00000000`00000000 : nt!WheaReportHwError+0x22d
ffffd000`4b3e4ea0 fffff802`61e41a0d : ffffe001`00000010 ffffe001`2b4ab480 ffffd000`4b3e5048 ffffe001`2b4ab480 : hal!HalpMcaReportError+0x50
ffffd000`4b3e4ff0 fffff802`61e418f8 : ffffe001`2b4aad50 00000000`00000001 00000000`00000003 00000000`00000000 : hal!HalpMceHandlerCore+0xe1
ffffd000`4b3e5040 fffff802`61e41b42 : 00000000`00000008 00000000`00000001 00000000`00000000 00000000`00000000 : hal!HalpMceHandler+0xe4
ffffd000`4b3e5080 fffff802`61e41ccf : ffffe001`2b4aad50 ffffd000`4b3e52b0 00000000`00000000 00000000`00000000 : hal!HalpMceHandlerWithRendezvous+0xce
ffffd000`4b3e50b0 fffff802`61fd87bb : 00000000`00000000 00000000`00000000 00000000`00000000 00000000`00000000 : hal!HalHandleMcheck+0x40
ffffd000`4b3e50e0 fffff802`61fd8571 : 00000000`00000000 00000000`00000000 00000000`00000000 00000000`00000000 : nt!KxMcheckAbort+0x7b
ffffd000`4b3e5220 00000000`00f0cd04 : 00000000`00000000 00000000`00000000 00000000`00000000 00000000`00000000 : nt!KiMcheckAbort+0x171
00000000`035fd9cc 00000000`00000000 : 00000000`00000000 00000000`00000000 00000000`00000000 00000000`00000000 : 0xf0cd04


STACK_COMMAND:  kb

FOLLOWUP_NAME:  MachineOwner

MODULE_NAME: GenuineIntel

IMAGE_NAME:  GenuineIntel

DEBUG_FLR_IMAGE_TIMESTAMP:  0

IMAGE_VERSION: 

FAILURE_BUCKET_ID:  0x124_GenuineIntel_PROCESSOR_CACHE

BUCKET_ID:  0x124_GenuineIntel_PROCESSOR_CACHE

ANALYSIS_SOURCE:  KM

FAILURE_ID_HASH_STRING:  km:0x124_genuineintel_processor_cache

FAILURE_ID_HASH:  {4c8f3f5e-1af5-ed8b-df14-d42663b1dfa7}

Followup: MachineOwner
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: kipoos le 12 octobre 2014 à 09:06
j'ai eu 2 écrans bleu sur Rosetta en début de P2DS sur une machine avec un xeon e3-1220 v2 (ivy bridge).

dans un souci de conso, j'avais abaissé la tension de ma ram.
je l'ai remonté un p'tit peu : depuis plus aucun souci.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: toTOW le 12 octobre 2014 à 12:46
Un petit coup de Memtest s'impose en effet ...
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Chuck Maurice le 04 novembre 2014 à 10:13
 :hello:
Comment fait-on pour mettre à zero le partage des ressources sur Rosetta? :coffeetime:

Mettre à zero ou laisser la case vide ne fonctionnant pas. :priz2tet: :rhaa:

Merki. :)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: modesti le 04 novembre 2014 à 10:35
Je crois que pour Rosetta il faut mettre sur 1. Comme la version serveur est "un peu ancienne", le zéro ne passe pas.
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: Chuck Maurice le 04 novembre 2014 à 10:41
Je crois que pour Rosetta il faut mettre sur 1. Comme la version serveur est "un peu ancienne", le zéro ne passe pas.

Par défaut j'ai mis 0,1 au lieu de supprimer le projet de ma liste... :/

En tout cas merci, j'ai la réponse maintenant.  :smak:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Hildor le 05 novembre 2014 à 21:12

Tu peux aussi mettre "pas de nouveau travail"
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: fzs600 le 16 mars 2015 à 09:24
 :hello:

Pas moyen de recevoir UT pour Android.  :/
Citer
android_86f9ec63    0.00    0    ARMARMv7 Processor rev 0 (v7l)    Android3.4.0-2210443 (Android 4.3)    0    16 Mar 2015 8:20:10 UTC

Quelqu'un en recois ?

Merci.



Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: naz le 16 mars 2015 à 10:42
Perso j'en ai jamais recu sur mes android...
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: fzs600 le 16 mars 2015 à 10:53
Perso j'en ai jamais recu sur mes android...
OK.

Je vais voir si je trouve plus d'infos ici : http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=6468#76853 (http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=6468#76853)

 :jap:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: toTOW le 21 mars 2015 à 15:55
Jamais eu non plus, mais vu ce que ca consomme en RAM et le peu que ça rapporte sr PC, je suis pas sur qu'il y ait grand chose à tirer des smartphones sur ce projet ... :/
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: fzs600 le 21 mars 2015 à 22:35
Jamais eu non plus, mais vu ce que ca consomme en RAM et le peu que ça rapporte sr PC, je suis pas sur qu'il y ait grand chose à tirer des smartphones sur ce projet ... :/
C'est pas pour les points,c'est pour aider a développer une nouvelle application et........................ pour le fun.   :D
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: pasglop le 28 décembre 2015 à 13:43
Je m'y suis recollé au projet ac mon nouveau i7 acheté d'occaz lol. bah,ça fait du bien de voir les crédits remonter.
Je sais pas,j'ai l'impression que c'est pas trop un projet aimé,alors,j'ai décidé de m'y mettre.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: JeromeC le 30 décembre 2015 à 12:02
Clair que Roseta on en entend pas souvent parler, pour autant si tu regardes leur sites y'a des news régulières, même si pas fréquentes, le projet est loin d'être inactif et le forum est (relativement) animé.

C'est juste que c'est un projet qui marche quoi :)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: PhilTheNet le 30 décembre 2015 à 12:21
Allez je m'y recolle, je crois que c'est mon deuxième projet après seti quand j'ai découvert le monde boinc il y a deja plus d'un an

 :gno:
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: Spica le 31 décembre 2015 à 11:10
Je m'y suis recollé au projet ac mon nouveau i7 acheté d'occaz lol. bah,ça fait du bien de voir les crédits remonter.
Je sais pas,j'ai l'impression que c'est pas trop un projet aimé,alors,j'ai décidé de m'y mettre.
Si Rosetta distribuait des badges, je pense qu'il y aurait plus d'amateurs, à mon avis c'est tout.
C'est un projet historique de BOINC (le 3ième ou 4ième après SETI)  et qui roule très bien
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: toTOW le 31 décembre 2015 à 12:25
S'il revalorisaient un peu les points aussi, ce serait plus intéressant ...
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Matt11 le 01 janvier 2016 à 15:48
Y a-t-il une différence de rendement (en terme de points/h) suivant la durée des unités ?
En gros faut-il privilégier les longues unités ou les courtes ?
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: MDodier le 01 janvier 2016 à 16:42
Avec mes préférences je ne reçois que des "mini".  (- de 2 heures)

Sur un ordinateur I7 en 64 bits après la remise de 13 unités voici mes stats pour la version mini

23 heures et un total de 583.42 points
ou
25.4 points à l'heure
et
1 heure 46 minutes par unité pour 44.9 points
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: toTOW le 01 janvier 2016 à 20:20
En gros, ça a que peu d'influence ...
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Matt11 le 01 janvier 2016 à 23:21
oui normalement ça ne devrait pas trop varier mais certain projet aime récompenser d'avantage les longues unités.
Merci  :jap:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: toTOW le 02 janvier 2016 à 15:46
C'est ce genre de petit bonus qui manquent ici :/
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: naz le 10 février 2016 à 23:58
Pour les androids... des mini sont sortie :hyperbon:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: fzs600 le 11 février 2016 à 05:26
Merci pour l'info.  :kookoo:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: fzs600 le 12 février 2016 à 09:13
Sous android les UT partent en erreurs et donc l'application a été suspendu.  :/
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=6787&nowrap=true#79516 (http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=6787&nowrap=true#79516)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: naz le 12 février 2016 à 09:56
il m'en reste 3... Et ca calcul bien! bizarre  :??:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: naz le 12 février 2016 à 22:52
Encore maintenant... :kookoo:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: hydrosaure le 27 avril 2016 à 17:21
Tiens donc

(http://i.imgur.com/kVNMY36.png)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: ordralfabetix le 27 avril 2016 à 19:35
bravo à jakez sulli pour le uotd. :jap:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Jakez Sulli le 27 avril 2016 à 21:38
 :kookoo:  :hyperbon:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: hydrosaure le 22 mai 2016 à 20:25
et aujourd’hui

(http://i.imgur.com/C5iyNvE.png)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: toTOW le 22 mai 2016 à 23:07
Je croyais qu'ils avaient enfin décidé de mieux payer sur ce projet ... mais non :siflotte:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: ordralfabetix le 27 juin 2016 à 22:37
depuis ce soir,impossible de me connecter au projet.Dans le journal des évènements,j'ai erreur 403.
késako??
 :gno:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: [AF>Libristes] Pascal le 27 juin 2016 à 23:09
 :kookoo: Tu devrais trouver en partie la réponse sur cette page :
https://fr.wikipedia.org/wiki/Liste_des_codes_HTTP (https://fr.wikipedia.org/wiki/Liste_des_codes_HTTP)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: ordralfabetix le 28 juin 2016 à 18:06
problème résolu. :)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: DocPhilou1966 le 22 septembre 2016 à 19:21
 :cry:

22/09/2016 19:19:29 | rosetta@home | work fetch resumed by user
22/09/2016 19:19:30 | rosetta@home | update requested by user
22/09/2016 19:19:34 | rosetta@home | Sending scheduler request: Requested by user.
22/09/2016 19:19:34 | rosetta@home | Requesting new tasks for CPU and Miner ASIC and NVIDIA GPU
22/09/2016 19:20:18 | rosetta@home | Scheduler request completed: got 0 new tasks
22/09/2016 19:20:18 | rosetta@home | No work sent
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Oncle Bob le 22 septembre 2016 à 19:49
Desktop

3470 rosetta@home 22/09/2016 19:49:10 Project is temporarily shut down for maintenance
Titre: Re : Re : Re : Rosetta@home
Posté par: Jakez Sulli le 22 septembre 2016 à 20:32
C'est à cause des crédits de folie qu'ils distribuent ! :nexath:

Non c'est comme moi, je me payerais bien une super config à 5000 €, mais j'ai pas une tune...

http://www.ldlc.com/fiche/PB00167673.html

 :cry:

 :kookoo: Et par ici http://absolutepc.fr/configurations/20639847-station-bi-xeon-v3-16-cores-32-threads.html (http://absolutepc.fr/configurations/20639847-station-bi-xeon-v3-16-cores-32-threads.html) tu peux  :??:  :hyperbon:
Titre: Re : Re : Re : Re : Re : Rosetta@home
Posté par: ordralfabetix le 26 septembre 2016 à 15:22
Mais si vous pouvez me financer pour celle là;

http://absolutepc.fr/configurations/20639847-station-bi-xeon-v3-16-cores-32-threads.html#/boitier-corsair_obsidian_900d_fenetre/lecteur_optique-asus_bw_16d1ht_graveur_blu_ray/carte_graphique-pny_quadro_m6000_12go/stockage_donnees-samsung_1to_850_evo_ssd/stockage_systeme-samsung_1to_850_evo_ssd/carte_reseau_d_extension-carte_wifi_802_11n/souris-razer_ouroboros/montage_et_garantie-compris_avec_tests_et_garantie_3_ans_pieces_mod/systeme_d_exploitation-sans_systeme_d_exploitation/refroidissement-double_corsair_h60_watercooling/memoire_vive-kingston_ddr4_2133_ecc_64go_4_x_16go/alimentation-corsair_hx1200i_1200w_80_platinum/carte_mere-asus_z10pe_d16_ws/clavier-corsair_k95_rgb_mx_red/moniteur-asus_rog_pg348q_g_sync_21_9_34/carte_son-asus_essence_stx_ii_7_1/processeur-bi_xeon_e5_2699_v4_44c_88t_a_44_x_2_23_6_ghz

 :sun:
:eek:
Titre: Re : Re : Re : Rosetta@home
Posté par: zOU le 26 septembre 2016 à 19:46
C'est à cause des crédits de folie qu'ils distribuent ! :nexath:

Non c'est comme moi, je me payerais bien une super config à 5000 €, mais j'ai pas une tune...

http://www.ldlc.com/fiche/PB00167673.html

 :cry:

ou pour 10x moins cher, une config 16cores....
http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,6209.msg444429.html#msg444429
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Oncle Bob le 27 septembre 2016 à 01:35
Ouais. C'est capricieux et ça n'est généralement supporté que par une poignée de cartes maman.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Maeda le 27 septembre 2016 à 19:00
+ voir le prix de ces cartes maman, ça décourage.

Petite question au passage, savez-vous comment les UT sont gérées ? J'ai mis une target CPU à 1 jour, et du coup les UT durent 24h, y a-t-il un rapport de point avec une UT complétée en 24h par un petit processeur et par un gros ? C'est le contenu qui est jugée je suppose ? Déjà que les points sont vraiment faibles, je me demande quels points obtient un petit CPU sur ce projet :??:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: zOU le 27 septembre 2016 à 19:17
   
Target CPU run time doit être  égal à la durée de calcul de ton PC /jou

Si tu choisis 1j et que tu arrêtes ton PC après 8h tu perds l'UT

http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=4908&nowrap=true#61366

Voilà en gros
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Maeda le 27 septembre 2016 à 19:22
Dis donc c'est important ça :gno:.
J'avais mis ça pour le pentathlon, je vais changer ce réglage de ce clic :cavachier:. Merci pour l'info.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: modesti le 27 septembre 2016 à 19:38
Petite question au passage, savez-vous comment les UT sont gérées ? J'ai mis une target CPU à 1 jour, et du coup les UT durent 24h, y a-t-il un rapport de point avec une UT complétée en 24h par un petit processeur et par un gros ? C'est le contenu qui est jugée je suppose ? Déjà que les points sont vraiment faibles, je me demande quels points obtient un petit CPU sur ce projet :??:

Pas grand chose. Sur l'AMD 64 3000+ je touche en gros une 60aine de points pour une UT de 8h alors que l'i7 860 fait facilement le double. Tout dépend du travail accompli pendant les 8h (c'est le target CPU time que j'ai réglé)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Maeda le 27 septembre 2016 à 19:41
OK, le ratio est quand même là, ce n'est que justice :siflotte:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Maeda le 27 septembre 2016 à 20:03
A l'instant sur l'accès au compte :

Citation de: Rosetta@home
This page requires database access. Our database server is temporarily shut down for maintenance. Please try again later.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Oncle Bob le 29 septembre 2016 à 23:25
Plop

J'ai un soucis sur un i3 sous Debian : souvent 1 ou deux unités se mettent en suspend pour "Attente de mémoire" et aucune UT ne prend le relais.

Y a 6 GB de RAM libre et ma partoche la plus remplie l'est à hauteur de 6% (95 GB de libre).
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Maeda le 30 septembre 2016 à 07:17
Salut !
Qu'as-tu comme paramètre pour l'utilisation mémoire et sa limite dans Boinc ?
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: JeromeC le 30 septembre 2016 à 12:33
Monte les au max sans réfléchir, genre 95% voire plus !
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: [AF] fansyl le 30 septembre 2016 à 22:15
   
Target CPU run time doit être  égal à la durée de calcul de ton PC /jou

Si tu choisis 1j et que tu arrêtes ton PC après 8h tu perds l'UT

http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=4908&nowrap=true#61366

Voilà en gros

J'ai pas tout compris, pour une machine allumée h24, on peut mettre 1 jour, ça améliore le RAC ?
 :hello:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: DonPanic le 04 novembre 2016 à 18:25
Bonjour
Rosetta a-t-il de son l'économiseur d'écran ?

C'est parce qu'il plante, et j'aimerais savoir comment le virer après installation. (sous win 7 pro)

Merci de vos réponses
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: modesti le 04 novembre 2016 à 18:52
:hello: DonPanic,

Tu fais un clic droit sur le bureau > Personnaliser et en bas à droite tu as Ecran de veille. Là tu choisis ce que tu veux. Perso je n'en ai pas, quand je quitte l'ordi j'éteins l'écran. Ça économise des ressources ;)
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: ordralfabetix le 04 novembre 2016 à 22:32
Perso je n'en ai pas, quand je quitte l'ordi j'éteins l'écran. Ça économise des ressources ;)
idem chez moi. :hello:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Antares le 09 mars 2017 à 07:04
Adresse du site  introuvable
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: [AF>Libristes] Kao le 09 mars 2017 à 21:03
A ce qu'il parait il y a un problème avec leur nom de domaine, j'ai cru lire sur BAM peut être une expiration du domaine, et il n'a pas encore été renouvelé, un oubli ? Attendons :/
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: naz le 11 mars 2017 à 09:22
Tout est ok! On peu  :hyperbon:  :hyperbon: :hyperbon:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: zOU le 12 mars 2017 à 07:33
102eme de l'AF, j'ai presque atteint mon objectif d'etre dans le top 100 :)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: modesti le 25 juin 2017 à 18:43
Message du 20/06/17:
Citer
Rosetta@home: Outage notice
Outage notice. The project will be down for a day or so starting tomorrow as we transition to new servers using the latest BOINC server software.
20.06.17 01:00:00

Information de coupure. Le projet sera arrêté pendant environ un jour à partir de demain pendant que nous déménageons sur de nouveaux serveurs avec le dernier logiciel serveur de BOINC.

Apparemment, le déménagement est fait, car un de mes ordis a chopé de nouvelles UT.
Et du coup, il y a des clés faibles maintenant (qu'il n'y avait pas avant). C'est tout bon pour le compte générique :D
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Xe120 le 21 octobre 2017 à 22:41
Y a de la news depuis le début du mois sur rosetta.
Pis même qu'ils disent qu'on est très fort et nous remercient beaucoup.  :coffeetime:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: toTOW le 22 octobre 2017 à 00:10
Ils se sont toujours pas décidés à etre un peu plus généreux sur les points sur ce projet depuis le temps ?
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: modesti le 22 octobre 2017 à 10:59
Ils se sont toujours pas décidés à etre un peu plus généreux sur les points sur ce projet depuis le temps ?

Grosso modo entre 21 et 28 pts/h sur i7 860. Ça s'est un peu arrangé, il me semble que ça tournait plutôt autour de 16 pts/h avant.
https://boinc.bakerlab.org/rosetta/results.php?hostid=1673128&offset=0&show_names=0&state=4&appid=

En tout cas, ils ont mis le site à jour avec la dernière version du "package Boinc". Ça change!
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: [AF>Libristes] Kao le 22 octobre 2017 à 15:27
C'est clair que ça change de l'ancienne page buguée qui revenait toujours en espagnol...
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: JeromeC le 16 janvier 2018 à 21:02
Toutes les rosetta 4.06 plantent sous macOS (https://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=12242&postid=88081).
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: modesti le 28 avril 2018 à 12:13
Article découvert via le flux RSS de SG.
http://www.ipd.uw.edu/2018/04/open-philanthropy-project-awards-11-3-million-to-institute-for-protein-design-at-uw-medicine-to-unlock-the-secrets-of-proteins-and-seek-a-universal-flu-vaccine/

Open Philanthropy Project attribue 11,3 millions de dollars à l'Institute for Protein Design de l'UW Medicine.

Gift recherche un vaccin antigrippal universel et fera progresser le logiciel Rosetta.       

Seattle - L'Institute for Protein Design (IPD) de l'UW Medicine à Seattle a reçu 11,3 millions de dollars du Open Philanthropy Project pour soutenir la révolution technologique de l'institut dans la conception de protéines et soutenir ses travaux sur le développement d'un vaccin universel contre la grippe.

L'Open Philanthropy Project est basé à San Francisco, Californie. Le cadeau est :


Le cadeau vient en deux parties :


"Nous sommes enthousiastes à l'idée d'aider à faire avancer la science d'une façon jamais vue auparavant avec les protéines, qui sont essentielles à la vie. Cette subvention reconnaît que UW Medicine est à l'avant-garde dans le déverrouillage des clés de l'utilisation des protéines en milieu médical ", affirme Chris Somerville, agent de programme pour la recherche scientifique au Open Philanthropy Project. "Le vaccin universel contre la grippe est un casse-tête difficile à casser, mais David Baker a montré qu'il est capable de faire œuvre de pionnier dans la recherche scientifique qui change la vie. Qu'un vaccin antigrippal universel soit mis au point ou non, ce don permettra d'élaborer des techniques et des technologies qui feront progresser la science et auront une grande variété d'implications en médecine et dans l'industrie.

Les protéines sont les chevaux de travail de toutes les créatures vivantes, suivant les instructions de l'ADN. Les protéines existantes sont les produits de milliards d'années d'évolution et remplissent toutes les fonctions importantes de notre corps : digérer les aliments, construire les tissus, transporter l'oxygène à travers la circulation sanguine, diviser les cellules, tirer les neurones et alimenter les muscles.

"Ce don accélère une révolution technologique dans la conception des protéines. Notre équipe peut maintenant concevoir des protéines sur mesure à partir de zéro, créant des molécules entièrement nouvelles qui peuvent être utilisées pour de nouveaux traitements, de nouveaux diagnostics et de nouveaux biomatériaux. Le généreux don de l'Open Philanthropy Project transformera notre capacité à concevoir des protéines à partir de zéro ", a déclaré David Baker, directeur de l'institut ainsi que professeur de biochimie à la faculté de médecine de l'Université de Washington et chercheur de l'Howard Hughes Medical Institute. Baker est le Henrietta and Aubrey Davis Endowed Professor in Biochemistry.

Conception informatisée de protéines


Ce don permettra d'accélérer les efforts de l'institut pour faire progresser la conception de protéines sur ordinateur avec le logiciel Rosetta développé à l'origine dans le laboratoire de Baker. M. Baker a dit que le don transformera la capacité de l'institut à concevoir des protéines sur ordinateur, à les tester en créant les protéines réelles dans le laboratoire, puis à répéter le processus à une échelle énorme. "En accélérant ce cycle de conception, de construction et d'essais, nous serons en mesure d'améliorer systématiquement les méthodes de conception des protéines ", a dit M. Baker.

Les résultats et le nouveau logiciel Rosetta seront partagés avec la communauté scientifique par le biais de Rosetta Commons. Le Rosetta Commons est une collaboration fondée par Baker avec près de 100 développeurs de 23 universités et laboratoires qui contribuent régulièrement et partagent le code source de Rosetta, actuellement plus de 3 millions de lignes.

Ce projet est réalisé en collaboration avec Frank DiMaio, professeur adjoint de biochimie à la faculté de médecine de l'Université de Washington.

Vaccin universel contre la grippe

Les vaccins antigrippaux actuels sont destinés à protéger uniquement contre les souches actuellement en circulation, ce qui exige que les vaccins soient reformulés chaque année au fur et à mesure que le virus mute, et ne sont que partiellement protecteurs. Avec l'appui du Open Philanthropy Project, Baker et ses collaborateurs, Neil King et David Veesler, tous deux professeurs adjoints de biochimie à l'École de médecine de l'Université de Washington, dirigeront un effort pour concevoir des vaccins candidats universels contre la grippe qui offrent une protection durable contre de multiples souches de virus, y compris les souches qui ont le potentiel de provoquer des flambées pandémiques. Les vaccins candidats seront basés sur la technologie des nanoparticules de protéines auto-assemblées que Baker et King ont développée. Pour s'assurer que les candidats vaccins sont testés de manière approfondie et efficace, ils travailleront en étroite collaboration avec les groupes du Dr Barney Graham et du Dr Masaru Kanekiyo au Centre de recherche sur les vaccins du National Institute of Allergy and Infectious Diseases des National Institutes of Health.

L'objectif est de concevoir un vaccin à nanoparticules qui peut déclencher une réponse immunitaire efficace contre de nombreuses souches de grippe existantes ainsi que de nouvelles souches qui pourraient apparaître à l'avenir. Les chercheurs espèrent qu'un tel vaccin universel ne devrait pas être administré plus de tous les cinq ans, ce qui mettrait fin à la nécessité de vaccinations annuelles contre la grippe.

L'Institute for Protein Design, fondé en 2012 à l'UW Medicine à Seattle, est un centre de recherche qui se concentre sur la création de protéines sur mesure pour améliorer la santé humaine et relever les défis du 21e siècle dans les domaines de la médecine, de l'énergie, de l'industrie et de la technologie. Dans le corps humain, les protéines sont des chaînes d'acides aminés dirigées par des gènes pour exécuter des fonctions vitales essentielles dans chaque cellule, y compris dans le cerveau, les muscles et les organes internes. Les protéines ont également des implications pour la conception de nouveaux matériaux en dehors du corps humain, tels que de nouveaux types de fibres. L'équipe de 120 professeurs, membres du personnel, boursiers postdoctoraux et étudiants diplômés de l'Institut travaillent à la conception de protéines entièrement nouvelles pour créer, par exemple, de nouveaux vaccins et traitements plus sûrs et plus puissants pour prévenir ou traiter les personnes atteintes de maladies graves. L'institut a réuni quelques-uns des meilleurs experts mondiaux en protéomique, en informatique, en biochimie et structure biologique, en pharmacologie, en immunologie et en médecine clinique.

A propos de l'Open Philanthropy Project

L'Open Philanthropy Project identifie les possibilités de dons exceptionnels, accorde des subventions, suit les résultats et publie ses conclusions. Ses principaux bailleurs de fonds sont Cari Tuna et Dustin Moskovitz, co-fondateur de Facebook et Asana.

Voir les nouvelles dans la salle de presse de l'UW Medicine. Pour plus d'informations sur l'IPD, regardez cette vidéo !

Traduit avec www.DeepL.com/Translator (par JeromeC)

Texte original:
Citer
Open Philanthropy Project Awards $11.3 Million to Institute for Protein Design at UW Medicine

Gift seeks universal flu vaccine and will advance Rosetta software       

Seattle — The Institute for Protein Design (IPD) at UW Medicine in Seattle has been awarded $11.3 million from the Open Philanthropy Project to support the institute’s technological revolution in protein design and support its work on the development of a universal flu vaccine.

The Open Philanthropy Project is based in San Francisco, California. The gift is:

    • One of Open Philanthropy Project’s largest awards in the sciences to date.
    • Its first scientific gift in the Seattle area.
    • Its first investment at UW Medicine.

The gift comes in two parts:

    • $5.6 million to refine and advance Rosetta, the software platform for protein design originally developed at UW
    • $5.7 million for the institute’s program to develop a universal flu vaccine.

“We’re excited to help move science forward in ways not seen before with proteins, which are essential to life. This grant recognizes that UW Medicine is at the forefront of unlocking the keys to the use of proteins in medical settings,” says Chris Somerville, a Program Officer for Scientific Research at the Open Philanthropy Project. “The universal flu vaccine is a tough nut to crack, but David Baker has shown the ability to pioneer life-changing scientific research. It’s exciting that whether a universal flu vaccine is developed or not, this gift will build techniques and technologies that will advance science and have a huge variety of implications in medicine and industry.”

Proteins are the workhorses of all living creatures, fulfilling the instructions of DNA. Existing proteins are the products of billions of years of evolution and carry out all the important functions in our body—digesting food, building tissue, transporting oxygen through the bloodstream, dividing cells, firing neurons, and powering muscles.

“This gift is speeding up a technological revolution in how we design proteins. Our team can now custom design proteins from scratch, creating entirely novel molecules that can be used for new treatments, new diagnostics and new biomaterials. The Open Philanthropy Project’s generous gift will transform our ability to design proteins from scratch,” said David Baker, the institute’s director as well as professor of biochemistry at the University of Washington School of Medicine and Howard Hughes Medical Institute investigator. Baker is the Henrietta and Aubrey Davis Endowed Professor in Biochemistry.

Computer-based protein design

The gift will accelerate the institute’s efforts to advance protein design on computers with the Rosetta software originally developed in Baker’s lab. Baker said the gift will transform’s the institute’s ability to design proteins on computers, test them by creating the actual proteins in the lab, and then repeat the process at an enormous scale. “By speeding up this cycle of design, building and testing, we will be able to systematically improve protein design methods,” Baker said.

The results and new Rosetta software will be shared with the scientific community through the Rosetta Commons. The Rosetta Commons is a collaboration founded by  Baker with almost 100 developers from 23 universities and laboratories who regularly contribute to and share the Rosetta source code, currently over 3 million lines.

This project is in collaboration with Frank DiMaio, assistant professor of biochemistry at the University of Washington School of Medicine.

Universal flu vaccine

Current flu vaccines are intended to protect only against currently circulating strains, requiring the vaccines to be reformulated every year as the virus mutates, and are only partially protective. With Open Philanthropy Project support, Baker and his collaborators, Neil King and David Veesler, both assistant professors of biochemistry at the University of Washington School of Medicine, will be leading an effort to design universal flu vaccine candidates that provide durable protection against multiple virus strains, including strains that have the potential to cause pandemic outbreaks. The vaccine candidates will be based on the self-assembling protein nanoparticle technology Baker and King have developed. To ensure that the vaccine candidates are thoroughly and efficiently tested, they will work in close collaboration with the groups of Dr. Barney Graham and Dr. Masaru Kanekiyo at the Vaccine Research Center of the National Institute of Allergy and Infectious Diseases at the National Institutes of Health.

The goal is to design a nanoparticle vaccine that can trigger an effective immune response to many existing flu strains as well as new strains that might appear in the future. Researchers hope such a universal vaccine might need to be administered no more than every five years, ending the need for annual flu vaccinations.

The Institute for Protein Design, founded in 2012 at UW Medicine in Seattle, is a research center that focuses on creating custom-designed proteins to improve human health and address 21st-century challenges in medicine, energy, industry and technology. In the human body, proteins are chains of amino acids directed by genes to perform essential life functions in every cell including in the brain, muscles and internal organs. Proteins also have implications for the design of new materials outside of the human body such as new kinds of fibers. The institute’s team of 120 faculty, staff, postdoctoral fellows and graduate students work on designing entirely novel proteins from scratch to create, for example, new, safer and more potent vaccines and therapeutics to prevent or treat people with serious diseases. The institute has assembled some of the world’s top experts in protein science, computer science, biochemistry and biological structure, pharmacology, immunology and clinical medicine.

About the Open Philanthropy Project

The Open Philanthropy Project identifies outstanding giving opportunities, makes grants, follows the results, and publishes its findings. Its main funders are Cari Tuna and Dustin Moskovitz, a co-founder of Facebook and Asana.

See news in UW Medicine Newsroom (https://newsroom.uw.edu/news/researchers-receive-113-million-seek-universal-flu-vaccine). For more information on the IPD check out this video (https://www.youtube.com/watch?v=jBNCj2vqau0)!
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Maeda le 02 mai 2018 à 23:56
Plantages des Rosetta 4.07 (https://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=12242&postid=88775#88775) sur les récents noyaux Linux (par exemple Archlinux, noyau en version 4.16.4-1, avec glibc 2.27.
Une recompilation de l'application Rosetta semble nécessaire.

D'autres ont le problème ?

P.S. : s'ils ne se bougent pas rapidement, ça va vite se plaindre, WCG par exemple est déjà touché (https://forum.boinc-af.org/index.php/topic,3797.msg470662.html#msg470662).
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: toTOW le 03 mai 2018 à 12:08
Je crois qu'il y a une option de boot à ajouter pour que ça marche ... mais je ne sais pas laquelle ...
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Maeda le 03 mai 2018 à 13:14
Oui, celle-ci (https://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread?thread=40668&offset=10#568217), mais ce n'est pas une solution, ça réactive des failles systèmes...
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: [AF] fansyl le 14 mai 2018 à 22:21
Vraiment une très bonne nouvelle ce don ! Aussi bien pour Rosetta que pour les autres projets bio qui réutilisent parfois le code, comme MIP du WCG si je ne me trompe pas.

 :hello:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: pasglop le 25 janvier 2019 à 22:51
Ouais! je vais bientôt atteindre le Million sur ce projet!!
Normalement dans 1 semaine,mais que ce fut long! :hyperbon:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 26 janvier 2019 à 01:57
Felicitations!!! Pas evident en effet!  :hello:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Maeda le 26 janvier 2019 à 12:50
Ils ont mis des badges sur ce projet ?
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Antares le 26 janvier 2019 à 17:36
Non
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: [AF] fansyl le 27 janvier 2019 à 16:52
Ouais! je vais bientôt atteindre le Million sur ce projet!!
Normalement dans 1 semaine,mais que ce fut long! :hyperbon:

Bravo à toi, un très beau projet !
 :hello:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: [AF] fansyl le 27 février 2019 à 07:15
Il y a des tâches pour Android en ce moment !  :hyperbon:

 :hello:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: fzs600 le 27 février 2019 à 07:23
Merci pour l'info.  :kookoo:
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: franky82 le 27 février 2019 à 09:36
Il y a des tâches pour Android en ce moment !  :hyperbon:
Ah oui, mes 2 Android ont fait le plein !  :kookoo:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: naz le 27 février 2019 à 18:18
idem! Merci  :smak:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: [AF] fansyl le 27 février 2019 à 18:55
Et si on se faisait un petit fight Android ?   :siflotte:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: naz le 27 février 2019 à 19:58
très bonne idée!! Lance le fight  :kookoo:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Jakez Sulli le 16 juillet 2019 à 07:50
 :kookoo: Des nouvelles du projet : https://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=13196 (https://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=13196)

"La semaine dernière, le Baker Lab en collaboration avec le laboratoire De Yoreo du PNNL a publié dans Nature un rapport décrivant la conception de réseaux de protéines synthétiques qui s'assemblent à la surface du mica, un minéral cristallin commun et exceptionnellement lisse. Ce travail fournit une base pour comprendre comment les interactions protéine-cristal peuvent être systématiquement programmées. Bien que R@h n'ait pas été directement utilisé pour cette recherche, les sous-unités précédemment conçues ont été validées en utilisant R@h. Félicitations à tous les bénévoles de R@h et merci pour vos contributions continues.

Traduit avec www.DeepL.com/Translator"
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Jakez Sulli le 16 juillet 2019 à 07:51
 :kookoo: D'autres nouvelles du projet : https://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=13197 (https://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=13197)

"La semaine dernière, un rapport a été publié dans Science décrivant l'identification de centaines d'interactions protéine-protéine non caractérisées auparavant dans E. coli et la bactérie pathogène M. tuberculosis. Il s'agit à la fois de complexes protéiques jusque-là inconnus et de composants de complexes connus qui n'étaient pas caractérisés auparavant. Cette recherche a été menée par un boursier postdoctoral Qian Cong et comprenait l'ancien étudiant diplômé du laboratoire Baker Sergey Ovchinnikov, maintenant titulaire d'une bourse John Harvard Distinguished Science Fellow à Harvard. Rosetta@home a été utilisé pour une grande partie de l'informatique nécessaire à ce travail. Félicitations et merci à tous les bénévoles de R@h.

Traduit avec www.DeepL.com/Translator"
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: JeromeC le 16 juillet 2019 à 08:55
"titulaire d'une bourse John Harvard Distinguished Science Fellow à Harvard"

Tout de suite ça pose un homme (où une femme) :)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Jakez Sulli le 17 juillet 2019 à 10:12
 :kookoo: Encore des nouvelles du projet : https://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=13199 (https://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=13199)

"Comme vous l'avez peut-être entendu, l'Institute for Protein Design a récemment été sélectionné dans le cadre de The Audacious Project. Cette collaboration philanthropique à grande échelle, qui succède au Prix TED, fait émerger et finance des projets ayant le potentiel de changer le monde.

Par conséquent, nous élargissons notre équipe de scientifiques et d'ingénieurs basée à Seattle qui travailleront ensemble pour faire progresser Rosetta, notre logiciel de conception et de prédiction de la structure des protéines. Le financement nous permettra également d'investir dans l'équipement, les fournitures et l'espace de laboratoire nécessaires pour concevoir et tester des millions de protéines synthétiques.

Quels défis devrons-nous relever ? Regardez mon TED parler pour le savoir.

Tout ce travail - comme tout ce que nous faisons - dépendra de vous, les participants de Rosetta@home. Qu'il s'agisse de créer des nanomatériaux personnalisés ou des thérapies anticancéreuses plus sûres, nous nous appuyons sur la plate-forme informatique distribuée Rosetta@home. Nous ne vous remercierons jamais assez d'avoir pris le temps de participer à cette recherche passionnante, et nous espérons que vous direz à au moins un ami qu'eux aussi peuvent jouer un rôle dans la révolution du design des protéines en dirigeant Rosetta@home.

Je vous remercie,

David Baker
Directeur, Institute for Protein Design"

Traduit avec www.DeepL.com/Translator
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: [AF] fansyl le 17 juillet 2019 à 19:59
Souhaitons leur bonne chance !

Un petit RAID d'automne pour leur filer un coup de main ?  :D

 :hello:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: naz le 10 octobre 2019 à 22:22
Depuis 1h il y a des UT sous Android  :hyperbon: :hyperbon: :hyperbon:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: [AF] fansyl le 11 octobre 2019 à 07:21
Cool, j'ai une AndroidBox qui en a chopé 8, elles sont en cours  :hyperbon:

J'espère qu'il y aura d'autres lots avant peut-être une dispo permanente.

 :hello:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: franky82 le 11 octobre 2019 à 10:30
Bon, mes 2 Android (smartphone et tablette) en croix avec Rosetta : impossible de cruncher du Rosetta !  :/
ça me fait un gag avec les préférences de BOINC : "calcul suspendu - 100 % de batterie - le calcul reprendra quand la batterie aurra atteint 20 %" (un truc dans le genre) !?   :pt1cable:
J'ai remis mes 2 Android sur WCG, projet avec lequel ça fonctionne parfaitement !
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: naz le 11 octobre 2019 à 11:36
Rentre ces paramètres... :kookoo:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: franky82 le 11 octobre 2019 à 12:10
J'ai essayé ces réglages mais ça n'a rien voulu savoir !  :/
Tant pis, j'ai assez avec mes ordis pour finir le Raid (en bonne position) !  :D
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: [AF] fansyl le 16 mars 2020 à 21:34
Pour ceux que ça intéresse, Rosetta a introduit certaines UTs en rapport avec le COVID-19 : https://www.ipd.uw.edu/2020/02/rosettas-role-in-fighting-coronavirus/

 :hello:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: [AF>Amis des Lapins] Jean-Luc le 17 mars 2020 à 09:01
Merci pour l'info !

Je termine proprement mes WUs NumberFields pour le raid et je bascule sur Rosetta avec mon CPU d'ici 3-5 jours.
Tant pis pour mon classement dans le raid.

Je vais aussi essayer de mobiliser des amis, qui ne font jamais de calcul partagé.
Peut-être auront-ils envie de "se battre" contre le virus de cette manière, en fait, la seule  dont nous soyons capable.
Je ne vois pas ce que je peux faire d'autre contre ce virus.
Je me dis que peut-être, si beaucoup de monde se mobilise, la recherche peut gagner 1, 2 ou 3 jours ou 1, 2 ou 3 semaines dans le combat, j'en sais rien ?
Et ce petit délai aura peut-être une certaine importance ?

En tout cas, je crois que je me sentirai un peu mieux si je me lance dans Rosetta...

Et dans GPUGrid s'ils proposent plus tard comme annoncé des tâches GPU contre le virus.

Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: naz le 17 mars 2020 à 09:19
Perso de mon coté j'ai fais un don à https://pasteur-lille.iraiser.eu/Cancer2020/~mon-don?utm_source=bing&utm_medium=cpc&utm_campaign=2020%20-%20Don%20-%20Marque&utm_term=pasteur%20don&utm_content=Pasteur (https://pasteur-lille.iraiser.eu/Cancer2020/~mon-don?utm_source=bing&utm_medium=cpc&utm_campaign=2020%20-%20Don%20-%20Marque&utm_term=pasteur%20don&utm_content=Pasteur)

Bien rappelé que c'est eux qui on isolés les souches du coronavirus 2019-nCoV pour les transmettre au monde entier  :jap: Il ne faut pas oublier que se sont les particulier comme nous qui finançons les recherches à hauteur de 75%

Après je trouve ca très bien de faire don de ses CPU pour lutter contre ce virus. Je basculerais dessus après le Raid  :jap:
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: Contender le 17 mars 2020 à 11:42
Je me suis remis boinc sur mon pc de bureau perso et pas pro, ça faisait longtemps que je n'avais pas touché à Rosetta :hello:
Bon, mes 2 Android (smartphone et tablette) en croix avec Rosetta : impossible de cruncher du Rosetta !  :/
ça me fait un gag avec les préférences de BOINC : "calcul suspendu - 100 % de batterie - le calcul reprendra quand la batterie aurra atteint 20 %" (un truc dans le genre) !?   :pt1cable:
J'ai remis mes 2 Android sur WCG, projet avec lequel ça fonctionne parfaitement !
Perso il ne me télécharge aucunes tâches sous android, pas grave.

Titre: Re : Re : Re : Rosetta@home
Posté par: franky82 le 17 mars 2020 à 11:52
Je me suis remis boinc sur mon pc de bureau perso et pas pro, ça faisait longtemps que je n'avais pas touché à Rosetta :hello:
Perso il ne me télécharge aucunes tâches sous android, pas grave.
ça fait un moment qu'il n'y a plus aucune tâche Android
https://boinc.bakerlab.org/rosetta/server_status.php
Titre: Re : Re : Re : Rosetta@home
Posté par: naz le 17 mars 2020 à 12:18
Je me suis remis boinc sur mon pc de bureau perso et pas pro, ça faisait longtemps que je n'avais pas touché à Rosetta :hello:
Bon, mes 2 Android (smartphone et tablette) en croix avec Rosetta : impossible de cruncher du Rosetta !  :/
ça me fait un gag avec les préférences de BOINC : "calcul suspendu - 100 % de batterie - le calcul reprendra quand la batterie aurra atteint 20 %" (un truc dans le genre) !?   :pt1cable:
J'ai remis mes 2 Android sur WCG, projet avec lequel ça fonctionne parfaitement !
Perso il ne me télécharge aucunes tâches sous android, pas grave.

Y'en a pas! Parcontre il y a du yoyo! Si tu fais une tache de numberfield et tu laisse tourner ton android sur yoyo t'es parti pour participer au raid  :kookoo:
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: Maeda le 17 mars 2020 à 23:21
Perso de mon coté j'ai fais un don à https://pasteur-lille.iraiser.eu/Cancer2020/~mon-don?utm_source=bing&utm_medium=cpc&utm_campaign=2020%20-%20Don%20-%20Marque&utm_term=pasteur%20don&utm_content=Pasteur (https://pasteur-lille.iraiser.eu/Cancer2020/~mon-don?utm_source=bing&utm_medium=cpc&utm_campaign=2020%20-%20Don%20-%20Marque&utm_term=pasteur%20don&utm_content=Pasteur)

Bien rappelé que c'est eux qui on isolés les souches du coronavirus 2019-nCoV pour les transmettre au monde entier  :jap: Il ne faut pas oublier que se sont les particulier comme nous qui finançons les recherches à hauteur de 75%

Après je trouve ca très bien de faire don de ses CPU pour lutter contre ce virus. Je basculerais dessus après le Raid  :jap:
J'hésite aussi à switcher sur du Rosetta + Folding@home pour le GPU (et stopper Collatz). Avec le rapport du Raid, ma CG risque d'être plus utile à Folding qu'à Collatz.

Je me tâte tellement que je pense le faire :)

Mais 75% me paraît énorme ! S'ils utilisaient certains supercalculateurs GPU ou CPU (disponibles en France) pendant ne serait-ce qu'une demi-journée, je suis sûr qu'ils plieraient largement plus que tout ce qu'ils ont en ce moment.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: [AF>Amis des Lapins] Jean-Luc le 20 mars 2020 à 18:38
Ça y est : j'ai reçu plein de WUs intitulées "COVID-19" sur Rosetta.
C'est la première fois en ce qui me concerne...
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: franky82 le 20 mars 2020 à 18:46
Les serveurs doivent saturer un peu : j'ai des UT en attente de fin de téléchargement ou en attente de renvoi...

Ça y est : j'ai reçu plein de WUs intitulées "COVID-19" sur Rosetta.
C'est la première fois en ce qui me concerne...
Ah ! et à quoi on peut les reconnaître ? ça s'affiche en clair ou c'est codé ?
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: [AF>Amis des Lapins] Jean-Luc le 20 mars 2020 à 21:20
Je t'invite à regarder la capture d'écran jointe.
C'est dans le nom, colonne de droite, mais tu dois déplacer la barre pour les voir, l'image est très grande et c'est sur la partie cachée à droite.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: franky82 le 20 mars 2020 à 21:25
Ah oui !
Du coup, j'ai regardé sur mes ordis et j'en ai quelques-un également !
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: [AF>Amis des Lapins] Jean-Luc le 22 mars 2020 à 10:50
Mes tâches sur Rosetta :

26 valides
7 erreurs

WAOUH !
Le taux d'échec est énorme !
Et ce n'est pas comme pour Collatz, ça ne se met pas en erreur au bout de 2 secondes.
Ça calcule parfois pendant 25000 secondes avant de planter.

MAIS, j'ai remarqué que les noms des WUs qui plantent ont tous l'intitulé "IGNORE_THE_REST".
Les autres ne semblent pas partir en erreur.
Je vais purger les "IGNORE_THE_REST" de mon BM.
Je ne vois pas d'autre solution. Mais ce sera laborieux !!!

AVEZ-VOUS LE MÊME PROBLÈME CHEZ-VOUS ?

Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: franky82 le 22 mars 2020 à 11:13
Oui, quelques erreurs de temps en temps mais ça reste raisonnable...

J'ai un autre soucis, ce sont les UT qui ne finissent pas de se télécharger : "Erreur en cours de téléchargement (sens download)"
alors que d'autres UT se chargent sans problème, celles-là se mettent en attente et ne finissent pas de charger, même si on force dans le BM...
quand je m'en aperçois, je les annule.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Oncle Bob le 22 mars 2020 à 11:24
Les Rosetta mini prennent plus de temps que les Rosetta "tout court" chez moi (~8H00 contre 7) sur mon 2600K@4,00 GHz.

Pareil chez vous où j'ai un soucis de config ?
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: modesti le 22 mars 2020 à 11:51
La durée par défaut des UT chez Rosetta est +- 8h. Il se peut que certaines mettent moins de temps. Je crois que les "mini" c'est juste parce qu'elles bouffent moins de RAM.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: JeromeC le 22 mars 2020 à 13:12
On pouvait pas paramétrer la durée des tâches sur le compte rosetta ? ou je confonds avec un autre projet ?
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: modesti le 22 mars 2020 à 13:20
Si on peut, mais généralement les gens oublient :)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: JeromeC le 22 mars 2020 à 15:25
Ben tu vois certains vieux n'oublient pas :origin:
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: [AF>Amis des Lapins] Jean-Luc le 22 mars 2020 à 17:41
Oui, quelques erreurs de temps en temps mais ça reste raisonnable...

J'ai un autre soucis, ce sont les UT qui ne finissent pas de se télécharger : "Erreur en cours de téléchargement (sens download)"
alors que d'autres UT se chargent sans problème, celles-là se mettent en attente et ne finissent pas de charger, même si on force dans le BM...
quand je m'en aperçois, je les annule.

Pas de souci de téléchargement pour moi pour me moment.
Tes UT en erreur, est-ce que tu peux regarder s'il te plaît, leur nom et voir si ce sont aussi uniquement des noms avec "IGNORE_THE_REST" dedans ?
Titre: Re : Re : Re : Rosetta@home
Posté par: franky82 le 22 mars 2020 à 17:49
Tes UT en erreur, est-ce que tu peux regarder s'il te plaît, leur nom et voir si ce sont aussi uniquement des noms avec "IGNORE_THE_REST" dedans ?

Oui, les 10 UT en erreur sont bien "IGNORE_THE_REST" mais il y en a aussi dans les UT validées !
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Maeda le 22 mars 2020 à 17:51
Idem chez moi, toutes celles en erreur sont (en tout cas), des IGNORE THE REST.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: [AF>Amis des Lapins] Jean-Luc le 22 mars 2020 à 17:53
Et tu as combien d'erreurs et combien de valides s'il te plaît ?

(Histoire de voir si ma bécane déconne ou si ça vient d'eux...)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: franky82 le 22 mars 2020 à 17:56
Valides : 748 - erreurs : 10 (sur 3 ordis et demi)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: ordralfabetix le 22 mars 2020 à 22:33
Gros problème sur mon lenovo ideapad L340.
Tous les calculs finissent en erreurs:
"exited with 0 status but no'finished' file" :gno: :gno: :gno:
du coup je me suis mis sur tn-grid.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: [AF>Amis des Lapins] Jean-Luc le 22 mars 2020 à 22:37
OK, bon.
Mon taux d'erreur est hyper élevé donc.
Même un invalide entre temps !
Je vais encore attendre et voir ce que je vais faire...
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Maeda le 03 avril 2020 à 07:41
Vous avez remarqué que les noms des UT Covid-19 ont légèrement changé ? Il y a "Junior_Halfroid_vs_COVID-19" dedans.
Pour la petite info :
Citation de: Admin Rosetta
These are Brian's scaffold designs for COVID-19. The database is the rosetta database and includes N-methylated amino acid rotamer libraries for designing cyclic peptides which can be therapeutics.
Source (https://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=13533&postid=93150)

En français (DeepL) :
Citer
Ce sont les dessins d'échafaudage de Brian pour COVID-19. Il s'agit de la base de données Rosetta qui comprend des bibliothèques de rotamer d'acides aminés N-méthylés pour la conception de peptides cycliques pouvant être thérapeutiques.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 03 avril 2020 à 21:48
"Avec la récente épidémie du COVID-19, Rosetta@home a été utilisé afin de prédire la structure des protéines importantes pour la maladie ainsi que pour produire de nouvelles mini-protéines stables à utiliser comme traitements et diagnostics potentiels.

Pour aider nos recherches, nous sommes heureux d'annoncer une nouvelle mise à jour de l'application, et grâce à l'aide de la communauté de développement de Arm, y compris Rex St. John, Dmitry Moskalchuk, David Tischler, Lloyd Watts et Sahaj Sarup, nous sommes heureux d'inclure également la plate-forme Linux-ARM. Avec cette mise à jour, nous continuerons à fabriquer des liants protéiques pour COVID-19 et les cibles connexes en utilisant la dernière source Rosetta.

Merci aux bénévoles de R@h pour leur soutien continu à ce projet. Vos heures de CPU sont utilisées non seulement pour modéliser avec précision les structures des protéines importantes, mais aussi pour en concevoir de nouvelles. Regroupons nous et combattons COVID-19 !"

traduction with deepl/
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Xe120 le 03 avril 2020 à 22:55
https://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=13695 (https://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=13695)

Augmentation de la durée des tâches par défaut ?
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Prof le 04 avril 2020 à 01:38
Salut!  :hello:

Toutes mes wus partent en erreur!!!  :/
Détaché, rattaché... même chose... Projet suspendu!!!  :blbl: :priz2tet:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: modesti le 04 avril 2020 à 09:00
https://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=13695 (https://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=13695)

Augmentation de la durée des tâches par défaut ?
Oui, mais deux messages plus tard il fait à nouveau marche arrière. Quoi qu'il en soit, si on laisse la durée par défaut, il peut y avoir de grandes variations (entre 1h min et 24h max pour les 8h initiales, entre 2h et 36h pour les 16h annoncées). En revanche, ils ont passé les deadlines à 3 jours, donc ne vous inquiétez pas si vos ordis s'affolent, il faut quelques jours pour que le BM retrouve ses marques et vous risquez de voir des tâches annulées par le serveur.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: zOU le 04 avril 2020 à 09:54
Perso j'a i repasse les pref de 8h a "not selected".
je les laisse gérer
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: toTOW le 04 avril 2020 à 11:51
Vu toutes les exigences de ce projet, ça mériterait plus de points part WU ... :/
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: titidestroy le 05 avril 2020 à 23:05
J'ai bien rattaché mon android mais le projet ne m'envoie aucune tâche
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Prof le 05 avril 2020 à 23:36
 :kookoo:
Pour celles et ceux qui comme moi ont des soucis avec ce projet sur Mac/Linux, sachez qu'ils font des test pour ça sur RALPH@home!
Ils demandent des volontaires Mac/Linux pour essayer de résoudre le problème!
Rejoignez-les si vous voulez...

https://ralph.bakerlab.org (https://ralph.bakerlab.org)
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: titidestroy le 06 avril 2020 à 00:26
J'ai bien rattaché mon android mais le projet ne m'envoie aucune tâche

Ok j'ai trouvé pas assez de RAM dédiée vu que j'étais à 50% d'autorisation.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: [AF>Amis des Lapins] Jean-Luc le 06 avril 2020 à 10:42
Ce matin, j'ai eu 120 tâches Rosetta COVID.
Je les attendais.
Et bien elles partent toutes en erreur, à 100% !!!
Et ce n'est pas un problème de manque de RAM, ce coup-ci.
J'ai bien surveillé.
J'ai purgé et je passe à autre chose pour le moment.

Je suppose que dans ces conditions, il est inutile que je tente ralph@home.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: [AF] fansyl le 06 avril 2020 à 10:47
Si tu peux tenter, ce sont des UTs différentes.

Il y a aussi du boulot sur Boinc@TACC si le fait d'avoir VirtualBox ne te rebute pas.

 :hello:
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: fzs600 le 06 avril 2020 à 10:48
Ce matin, j'ai eu 120 tâches Rosetta COVID.
Je les attendais.
Et bien elles partent toutes en erreur, à 100% !!!
Et ce n'est pas un problème de manque de RAM, ce coup-ci.
J'ai bien surveillé.
J'ai purgé et je passe à autre chose pour le moment.

Je suppose que dans ces conditions, il est inutile que je tente ralph@home.
Sur le même PC ?

Chez moi.
Citer
État: Tous (898) · En cours (646) · Validation en attente (0) · Validation non concluante (0) · Valide (252) · Invalide (0) · Erreur (0)
Titre: Re : Re : Re : Rosetta@home
Posté par: [AF>Amis des Lapins] Jean-Luc le 06 avril 2020 à 11:56
Ce matin, j'ai eu 120 tâches Rosetta COVID.
Je les attendais.
Et bien elles partent toutes en erreur, à 100% !!!
Et ce n'est pas un problème de manque de RAM, ce coup-ci.
J'ai bien surveillé.
J'ai purgé et je passe à autre chose pour le moment.

Je suppose que dans ces conditions, il est inutile que je tente ralph@home.
Sur le même PC ?

Chez moi.
Citer
État: Tous (898) · En cours (646) · Validation en attente (0) · Validation non concluante (0) · Valide (252) · Invalide (0) · Erreur (0)

Oui, sur le même PC.
T'as du bol, chez toi, ça tourne nickel !

Si tu peux tenter, ce sont des UTs différentes.

Il y a aussi du boulot sur Boinc@TACC si le fait d'avoir VirtualBox ne te rebute pas.

 :hello:

Franchement, les VB perturbent beaucoup trop le fonctionnement de tout le reste : GPU, autres projets et même travaux hors BOINC.

Merci pour votre aide.
Mais je vais réessayer de Rosetta d'ici quelques jours, en espérant qu'entre temps, le projet WCG sorte !
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Prof le 06 avril 2020 à 16:05
Il semble que ça marche de nouveau avec la version 4.15 de l'application Rosetta!!  :D :bounce:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: [AF] fansyl le 06 avril 2020 à 16:52
J'ai encore des 4.07 et 4.12 !!!  :eek:

Ah les 4.15 sont uniquement pour Mac !!!  :love:

 :hello:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: nabz le 06 avril 2020 à 16:59
J'ai reçu quelques 4.15 pour Windows via Ralph, mais certaines partent en erreurs de calculs, d'autres sont annulées par le serveur.

État: Tous (381) · En cours (2) · Validation en attente (0) · Validation non concluante (0) · Valide (328) · Invalide (0) · Erreur (51)
Application: All (381) · Rosetta (381) · Rosetta for Portable Devices (0) · Rosetta Mini (0)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: zOU le 06 avril 2020 à 18:02
État: Tous (1609) · En cours (1367) · Validation en attente (0) · Validation non concluante (0) · Valide (230) · Invalide (0) · Erreur (12)
Application: All (1609) · Rosetta (1503) · Rosetta for Portable Devices (70) · Rosetta Mini (36)

les 12 en erreur sont des 4.07/4.12 pour windows
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: fzs600 le 19 avril 2020 à 17:47
Message important.
https://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=13826&postid=94811 (https://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=13826&postid=94811)
Citer
Dans sa quête de connaissances sur COVID et d'autres protéines, R@h s'adapte pour relever le défi.

Je voulais essayer d'aider tout le monde à prendre conscience que le projet prépare certaines des plus grandes UGF de protéines qui fonctionnent même sur R@h. Celles-ci prendront beaucoup plus de temps à fonctionner par modèle que les protéines plus petites. Il sera donc très difficile de montrer avec précision la "durée d'exécution restante estimée". Cela augmentera la probabilité que les tâches soient exécutées plus longtemps que votre préférence de durée d'exécution WU, surtout si votre préférence de durée d'exécution est inférieure à la valeur par défaut de 8 heures. Pour tenir compte de cette situation, le chien de garde fera une sieste plus longue qu'auparavant. Seules les UGF terminées qui ont fonctionné plus de 10 heures de CPU de plus que la durée d'exécution préférée sont prises en compte.

Ces modèles de longue durée vont entraîner une grande variation de la durée d'exécution entre les tâches. Vous pourriez voir une tâche se voir accorder près de deux fois plus de crédit qu'une autre. Cela s'explique par le fait qu'elle a fait tourner deux modèles plutôt qu'un seul. Le crédit doit généralement être proportionnel au temps CPU investi dans la tâche.

Cette forte variation de la durée d'exécution va représenter un défi pour le responsable de BOINC qui devra décider de la quantité de travail à demander. Vous pouvez aider le gestionnaire BOINC à éviter d'abattre trop de travail si vous ajustez vos préférences quant à la quantité de travail à stocker pour qu'elle soit inférieure à un jour.
Par ailleurs, plusieurs d'entre vous ont récemment signalé des unités de travail qui ont été achevées avant leur préférence de durée d'exécution. Cela va également devenir plus courant avec ces modèles de longue durée. Par exemple, si vous avez une préférence de durée d'exécution de 8 heures par défaut et que le premier modèle prend 5 heures pour être terminé, alors 5 heures est la durée pendant laquelle il s'arrêtera et fera rapport parce qu'un deuxième modèle dépasserait la préférence. L'équipe de projet préfère que vous laissiez la préférence de durée d'exécution non définie, ce qui se traduit actuellement par une durée d'exécution de 8 heures. Mais si ces fortes variations dans les durées d'exécution vous posent des problèmes, je dois souligner que la définition d'une préférence de durée d'exécution plus longue se traduira généralement par des durées d'exécution plus cohérentes. Attention, les changements de préférence de durée d'exécution sont appliqués à vos unités de travail téléchargées existantes ainsi qu'aux nouvelles demandes de travail. Je vous suggère donc de ne faire des changements que lorsque vous avez des paramètres pour un petit cache de travail, et de ne modifier la préférence de durée d'exécution que quelques crans à la fois, afin que le gestionnaire BOINC ait le temps de voir les unités de travail achevées avec les nouvelles durées d'exécution. Cela l'aide à demander la quantité de travail qui correspond à vos préférences.

Les unités de travail qui exécutaient des modèles très courts et qui se terminaient lorsqu'elles atteignaient 1 000 modèles (avant leur préférence de durée d'exécution), ou d'autres nombres très ronds, ont été ajustées pour permettre un plus grand nombre maximum de modèles. Cela les aidera à remplir leur préférence de durée d'exécution, en utilisant le temps supplémentaire pour calculer plus de modèles. Cela aidera les durées d'exécution de ce type d'unité de travail à être plus cohérentes.


Traduit avec www.DeepL.com/Translator (version gratuite)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: JeromeC le 19 avril 2020 à 18:49
C'est pas super clair cette affaire... il faut mieux augmenter la durée des tâches sur le site et réduire la demande de travail, c'est ça ?

Moi sur le joe j'ai l'impression qu'elles se mettent toutes en exécution prioritaire et sont fort proches des deadlines...
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: chev6791 le 01 mai 2020 à 08:57
Cette consommation mémoire de Rosetta  :eek: :eek:
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: [AF>Libristes] Davlabedave le 01 mai 2020 à 09:26
Cette consommation mémoire de Rosetta  :eek: :eek:
Et que dire de steam .....
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: chev6791 le 01 mai 2020 à 09:41
certes :lol:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: [AF] fansyl le 01 mai 2020 à 10:10
Grosse config chev6791 !!! :eek:

R9 3950X ? 32Go de RAM ?
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Oncle Bob le 01 mai 2020 à 10:43
3950X/32 Go, oui (http://wuprop.boinc-af.org/show_host_detail.php?hostid=162206)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: chev6791 le 02 mai 2020 à 08:01
 :D oui
me reste un petit travail d'optimisation, mais c'est déjà pas mal à la base
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Oncle Bob le 02 mai 2020 à 09:55
Consommation à la prise ? :o
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: erik le 02 mai 2020 à 10:02
Nouvelle URL chez Rosetta:

sam. 02 mai 2020 09:38:55 CEST | Rosetta@home | This project is using an old URL.  When convenient, remove the project, then add https://boinc.bakerlab.org/rosetta/

Je ne sais pas de quand ça date. Peut être est-ce moi qui ne suis pas à jour.
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: fzs600 le 02 mai 2020 à 10:13
Nouvelle URL chez Rosetta:

sam. 02 mai 2020 09:38:55 CEST | Rosetta@home | This project is using an old URL.  When convenient, remove the project, then add https://boinc.bakerlab.org/rosetta/

Je ne sais pas de quand ça date. Peut être est-ce moi qui ne suis pas à jour.
C'est un message qui s'affiche dans les notifications de BM il ne faut en tenir compte URL n'ayant pas changer.  :kookoo:
Il y a le même message concernant Ralph@home.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: erik le 02 mai 2020 à 10:25
Si, il y a le "s" en plus:

https: //boinc.bakerlab.org/rosetta/  :capello:

J'ai remarqué par ailleurs que quand on se rattache via BM ce n'était pas à jour  :kookoo:

Trouvé sur le site:

Citer
Switch to using SSL (Secure Socket Layer)

We updated our project to use SSL. The project URL has thus been changed to https://boinc.bakerlab.org/rosetta. You can reattach the project using this updated URL at your convenience. Please post any issues regarding this update in the discussion thread.

1 May 2020, 21:25:30 UTC ·

@modesti: il faudrait peut-être modifier le 1er post du Pentatlon?  :jap:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: franky82 le 02 mai 2020 à 11:04
Oui, ça date de hier pour Rosetta, le httpS !
Pour Ralph, ça fait quelques jours !  :kookoo:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: modesti le 02 mai 2020 à 12:39
@modesti: il faudrait peut-être modifier le 1er post du Pentatlon?  :jap:
Merci pour le tuyau, m'en occupe.
C'est vrai que j'ai vu le message hier aussi, mais je n'ai pas tilté.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: JeromeC le 04 mai 2020 à 17:38
L'admin m'a parlé depuis le ciel (https://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=12242&postid=95994) :

Citer
The mini tasks should soon be gone forever since we have deprecated the app. There was however a batch that was submitted recently but I imagine most of those tasks have completed by now.

Citer
Les tâches mini devraient bientôt disparaître à jamais puisque nous avons terminé l'application. Un lot a cependant été soumis récemment, mais j'imagine que la plupart de ces tâches sont maintenant terminées.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Maeda le 04 mai 2020 à 17:44
Ah, ça devrait simplifier les app_config.xml (ce n'était pas les mini qui mangeaient moins de mémoire ?).
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: JeromeC le 04 mai 2020 à 18:09
Si. Mais ça, c'était avant.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: [AF>HFR>RR] liegeus le 14 mai 2020 à 22:06
Bonjour à tous, j'ai un message sur le boinc manager me disant que ce projet utilise une ancienne URL, sue je dois supprimer le projet et rajouter une nouvelle URL.
(This project is using an old URL. When convenient, remove the project, then add https://boinc.bakerlab.org/rosetta/)

Et je suis bien emmerdé avec tout ça... quand je sélectionne le projet rosetta, je ne peux pas le supprimer, la case est grisée (et je n'ai plus de travail en stock j'ai vérifié)

Je n'ose pas cliquer sur "recommencer le projat" aucune idée de ce que ça va faire et j'ai pas envie de tout perdre :)

Une idée ? merci !
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: [AF] fansyl le 14 mai 2020 à 22:15
Si tu n'as plus aucune UTs en cours, tu peux détacher le projet (= supprimer dans BoincManager) et le rattacher de nouveau avec la bonne URL.

Tu ne perdras pas tes points ou ce genre de choses. En revanche la machine concernée devra re-télécharger les fichiers pour les calculs. Un peu long pour Rosetta car il y a une database en local.

:hello:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: cougarpelardou le 14 mai 2020 à 23:28
Et ensuite stoker du Ibercivis pour le sprint qui commence le 16 mai  :D
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: Xe120 le 15 mai 2020 à 06:50
Et je suis bien emmerdé avec tout ça... quand je sélectionne le projet rosetta, je ne peux pas le supprimer, la case est grisée (et je n'ai plus de travail en stock j'ai vérifié)

Si tu n'as plus aucune UTs en cours, tu peux détacher le projet (= supprimer dans BoincManager) et le rattacher de nouveau avec la bonne URL.

 :cpopossib:

Si tu utilises un gestionnaire de projet, ça peut venir de là
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: [AF>HFR>RR] liegeus le 15 mai 2020 à 17:44
put... ça me gonfle à un point... vous imaginez même pas... :cavachier:

effectivement j'utilise le gestionnaire de projet statseb... alors j'ai enlevé ce gestionnaire, j'ai enlevé le projet de dans et dans mon boinc maa,ger, je l'ai rajouté avec la bonne url, je l'ai remis dans le gestionnaire, j'ai re associé le gestionnaire,

ça a bien retéléchargé la database et tout pour l'appli rosetta et ben vous savez quoi ? si je demande une Maj j'ai encore ce même put... de message  :pt1cable: :priz2tet:

donc je crois que je vais laisser en l'état et si un jour rosetta fonctionne plus... j'aviserai ou pas d'ailleurs y a d'autres projets  :sun:

merci et @+ ! :-)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: [AF>HFR>RR] liegeus le 15 mai 2020 à 17:46
ah ben maintenant j'ai 2 lignes "rosetta" dans mon boinc manager.. une que je peux supprimer et une que je peux pas (j'imagine que cette dernière vient du gestionnaire..) je vais supprimer celle que je peux...
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: JeromeC le 15 mai 2020 à 20:06
Bon c'est pas la peine s'énerver autant, quand on utilise un gestionnaire de compte il faut

- voir s'il connait déjà la nouvelle URL ou pas
- si oui, enlever le projet de la machine à partir du gestionnaire / syncrhoniser la machine / remettre le projet / synchroniser
- sinon ça ne sert à rien de se prendre le chou surtout que C'EST PAS GRAVE le projet continue de tourner (et rosetta a déjà dit que ça continuera de fonctionner comme ça assez longtemps)


Sur SAM ce n'est pas encore le cas : sur la page Vos projets on voit que l'URL de rosetta est http://boinc.bakerlab.org/rosetta/ donc il manque encore le s.

Donc Seb tu peux mettre à jour l'URL s'te plait ??
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: maxymus83 le 15 mai 2020 à 20:10
 :kookoo: Seb nous a dis qu'il mettrait à jour dès la fin du pentathlon, pour pas gêner, sinon cela détacherait le projet automatiquement.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: [AF>HFR>RR] liegeus le 16 mai 2020 à 14:02
en effet :) c'est la version non sécurisé sur statseb encore

merci à tous !

je vieillis, quand j'étais plus jeune ça me dérangeais pas de passer des heures à chercher comment et pourquoi sur ce projets leurs config leurs optimisations etc... maintenant plus ça va, plus ça me gonfle  :siflotte: :sun: :D
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Playmogeek le 16 mai 2020 à 19:14
Bonjour,

Vous avez encore des UT? Moi je n'ai plus rien.
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: franky82 le 16 mai 2020 à 19:18
Oui, juste ce qu'il faut !  :D
Pourtant il y en a en stock : https://boinc.bakerlab.org/rosetta/server_status.php
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: Playmogeek le 16 mai 2020 à 19:25
Oui, juste ce qu'il faut !  :D
Pourtant il y en a en stock : https://boinc.bakerlab.org/rosetta/server_status.php

Bon ben j'ai détaché et rajouté rosetta: j'ai de nouveau de l'UT
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: JeromeC le 17 mai 2020 à 18:59
je vieillis, quand j'étais plus jeune ça me dérangeais pas de passer des heures à chercher comment et pourquoi sur ce projets leurs config leurs optimisations etc... maintenant plus ça va, plus ça me gonfle  :siflotte: :sun: :D
Toutafey, je confirme :lol:

Moi c'est par vague : parfois je veux plus en entendre parler, parfois je me motive et je retrouve du plaisir à bidouiller, ça varie :)
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: Maeda le 17 mai 2020 à 22:54
Arrêtez, je vais me croire vieux aussi :siflotte:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: JeromeC le 20 mai 2020 à 19:41
Ce qui est cool avec boinc (quand tu testes et bidouilles un minimum) c'est que ça permet de garder les pieds sur terre et de te rappeler ce qu'est un ordinateur, alors que de plus en plus de gens (ignorants, pas nécessairement bêtes) pensent que l'informatique c'est un truc magique où tout se résout tout seul, ces mêmes gens qui se font gaver en permanence du mot "IA" dans les médias (ignorants) et qui pensent que ça va devenir encore plus magique à l'avenir, et qui sont bien préparés à tout gober en bavant dans la société de contrôle du futur (et déjà du présent, mais ça ne fera qu'empirer).

Mais je digresse (gresse).

Viva la revolución, viva boinc.
Titre: Re : Re : Rosetta@home
Posté par: [AF>HFR>RR] liegeus le 21 mai 2020 à 00:56
Viva la revolución, viva boinc.

una mattina...
mi sono alzato ...  :siflotte:
Titre: Re : Rosetta@home
Posté par: JeromeC le 21 mai 2020 à 19:09
E questo è il fiore Del partigiano
Morto per la libertà.