Le Forum de l'Alliance Francophone

Boinc et les projets distribués => Biologie => Discussion démarrée par: Heyoka le 15 avril 2008 à 18:45

Titre: Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: Heyoka le 15 avril 2008 à 18:45
Je lance un petit concours du meilleur RMSD et du meilleur score sur Rosetta.

Pour les connaitre, appuyez ici :
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/rah_results.php?login=1

Cliquez sur la colonne Best RMSD user puis Best Score user (des fois que le meilleur score soit différent du meilleur RMSD)


Le top 10 RMSD de l'AF

1. Heyoka : 0.009
2. Kyuzo : 0.038
3. Ousermaatre : 0.061            
4. Dudumomo : 0,093
5. RLDF : 0,101
6. Modesti : 0.554
6. Polynésia : 0.806


Top 10 meilleurs scores de l'AF

1. Julienh : -1407.24
2. Ousermaatre : -1325.58
3. Modesti : -1057.56
4. Kyuzo : -874.282
5. Polynésia : - 864.893
6. Heyoka : -696.254
7. rom_185 : -649.584
Titre: Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: Heyoka le 15 avril 2008 à 18:48
Voilà mon meilleur score :

meilleur RMSD : 0,82 pour une unité du groupe 1elwA_BOINC_CONTROLABRELAX_VF_
meilleur score : -290,85 pour la même unité

J'ai calculé qu'une seule unité de ce type (colonne # Predictions user)

Le meilleur score sur l'ensemble des utilisateurs pour ce groupe d'unités 1elwA_BOINC_CONTROLABRELAX_VF_ a été de 0,5 pour le RMSD (colonne Best RMSD all users) et -302.41 pour le score (colonne Best score users). Au total, 171946 unités de ce type ont été calculées (Colonne # Predictions all users). Dernière mise à jour le 9 avril 2008 (Last Updated)

(http://www.boinc-af.org/images/Rosetta90.jpg)


Le point rouge c'est ma prédiction au milieu des 171946 autres unités calculées par l'ensemble des utilisateurs pour le groupe d'unités 1elwA_BOINC_CONTROLABRELAX_VF_
Sur ce graphique, l'énergie en Ordonné et le RMSD en abscisse. Plus on se rapproche du point (0;-310) et plus la prédiction est bonne

(http://www.boinc-af.org/images/Rosetta91.jpg)
Titre: Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: Hildor le 15 avril 2008 à 18:52

Et bien moi c'est 2.62, -151.63

Ce n'est pas difficile j'en ai qu'1 doit pouvoir faire mieux !
Titre: Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: modesti le 15 avril 2008 à 20:24
Euh, j'ai 8 lignes de prédictions pour 8 groupes différents... mais je sais pas comment mettre l'image ici :spamafote:

En tout cas, merci pour ce topic Heyoka ! :jap:
Titre: Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: rom_185 le 16 avril 2008 à 00:02
RMSD ?  :heink:
random matris simulation day ?
 :pt1cable:  :lol:

[spoiler]Wai google est mon ami...
Root mean square deviation : http://fr.wikipedia.org/wiki/%C3%89cart_type[/spoiler]

Citation de: modesti
En tout cas, merci pour ce topic Heyoka ! :jap:
+10,968  :jap:  !
Tu pourrait mettre les scores de chacun dans ton 1er post STP :).


@Modesti : appuie sur "impr ecran syst", va dans paint, édition, coller, enregistre l'image (dans "type" mets JPEG c'est plus léger ;)), va ici : http://www.hiboox.com/ , selectionne ton image, ta catégorie... et donne nous le lien qui te sera donné en bas de page après l'envoi ;).

Pour moi, RMSD:

(http://images3.hiboox.com/images/1608/lt1nt4z4.jpg)

et le score :

(http://images3.hiboox.com/images/1608/3jfyv9mw.jpg)
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Posté par: laurent02 le 16 avril 2008 à 00:21
1.16; -477.05
Titre: Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: rom_185 le 16 avril 2008 à 00:29
Battu au score  [:douglas riper:3] mais pas au RMSD  [:damien] !
Titre: Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: laurent02 le 16 avril 2008 à 01:21
Citation de: rom_185
Battu au score  [:douglas riper:3] mais pas au RMSD  [:damien] !

 :kaola:
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Posté par: rom_185 le 16 avril 2008 à 01:34
[:modesti:4]
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Posté par: sbmtl le 16 avril 2008 à 06:14
(http://img151.imageshack.us/img151/3330/rosettasbmtlko5.jpg) (http://imageshack.us)
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Posté par: modesti le 16 avril 2008 à 07:55
Merci rom_185 pour tes conseils, mais je n'aime pas trop laisser des traces sur le web. Je crois que j'ai trouvé une autre astuce ;) J'ai fait un copier-coller du tableau dans Word :p

Edit: le copier-coller a foiré à cause des liens hypertexte. J'essaie autrement ;)

Best RMSD:
Active Work Units   Best RMSD   Best RMSD   Best Score   Best Score   # Predictions   # Predictions   Last Updated
                         User             all users        user           all users      user                 all users
·  CNTRL_01ABRELAX_SAVE_ALL_OUT_-1ubi_-_filters    2.68   0.86   -148.85   -6975.5   571   48030784   2008-02-01


Best score:
Active Work Units   Best RMSD   Best RMSD   Best Score   Best Score   # Predictions   # Predictions   Last Updated
                         User             all users        user           all users      user                 all users
·  w0x5_1_MolecularRep_1_w0x5_bpdb90-1-2qpw_a_StructuralGenomics_a    4.59   3.19   -302.51   -357.52   1   201031   2008-02-01


Re-edit: modifié selon les conseils de rom_185
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Posté par: rom_185 le 16 avril 2008 à 11:44
@ SBMTL : tu t'ais tromper de colonne :/.
@ Modesti : tu ne veut pas laissez de trace mais tu nous racontes des choses un peut privé sur toi  :whistle: . Mets juste la 1ere ligne pour le score et le RMSD, ça suffit  ;) .
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Posté par: modesti le 16 avril 2008 à 13:54
Message modifié :)
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Posté par: Heyoka le 16 avril 2008 à 21:35
Je vais surement avoir des beaux scores à la prochaine mise à jours  ;)
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Posté par: al@ON le 17 avril 2008 à 14:41

 [:al@on:3], ayant un résultat sous le coude je me permets de participer à ce concours. :p

(http://apu.mabul.org/up/apu/2008/04/17/img-141254p9ss6.png) (http://mabul.org/)



@ modesti [:al@on:3], si tu veux préserver ta vie privée il te faut arrêter de te connecter au Net [:jwhy]...


ce serait quand même dommage pour le Forum de L'AF. [:modesti:3] ;)
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Posté par: modesti le 17 avril 2008 à 23:05
T'es mimi, al@ON :) mais je vais pas vous lâcher de si tôt :p
Et tu me suis de près sur le CNTRL 01ABRELAX SAVE ALL OUT :D
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Posté par: sbmtl le 18 avril 2008 à 02:41
Va falloir se remettre à Rosetta pour reprendre du gallon.
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Posté par: al@ON le 18 avril 2008 à 11:09
Citation de: sbmtl
Va falloir se remettre à Rosetta pour reprendre du gallon.

Et peut-être gagner 2 places au FB. :ange:
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Posté par: Excelsior le 23 avril 2008 à 13:15
J'ai une petite question à ce sujet. La requête tombe en erreur chez moi alors que ça fait 3 jours que mon pc calcule pour rosetta, je comprends pas bien si j'ai raté un truc ou quoi ?
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Posté par: Heyoka le 23 avril 2008 à 17:51
Oui, c'est normal, la dernière mise à jour date du 9 Avril.
Je pense qu'il y a une mise à jour tous les mois
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Posté par: pireleurk le 29 avril 2008 à 09:42
salut tout le monde

Mon best rmsd 0.39
et mon best score -446

je vous donne les screenshots ce soir :)
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Posté par: rom_185 le 07 septembre 2008 à 23:20
Best score : -494.69 et je repasse 1er toutes catégories  [:damien] !
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Posté par: al@ON le 07 septembre 2008 à 23:26
 [:vtr webjo:3] rom pour ta 1ère place. [:al@on:1]


Citation de: pireleurk

je vous donne les screenshots ce soir :)
Il est parti chercher des cigarettes, en fait il est parti... :p
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Posté par: RLDF le 07 septembre 2008 à 23:38
j'ai trouvé ça :

Active Work Units
# 1dcj__JUMP_NAT_HAIRPINS_SAVE_ALL_OUT-1dcj_-
Best RMSD user : 1.741
Best Score user : -63.383

je ne sais pas ce que ça veut dire
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Posté par: rom_185 le 07 septembre 2008 à 23:48
Pas super :/...
T'as été là : http://boinc.bakerlab.org/rosetta/rah_results.php?login=1 et t'a cliqué sur le haut de la colonne best score user ?
Sinon, bah regarde la valeur de la 1ere ligne c'est la meilleur ;) !
Et fait pareil pour le RMSD :) !
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Posté par: RLDF le 07 septembre 2008 à 23:54
ah j'avais pris la première ligne mais j'avais pas cliqué sur les tri par colonnes
voila mes résultats :
Active Work Units CFR_B_d3_relax                 
Best RMSD user   0.12
Best RMSD all users   0.1
Best Score user   -128.21
Best Score all users   -128.76

Active Work Units s099_1_homologymodel_strictosidine_synthase
Best RMSD user   1.69
Best RMSD all users    0.2
Best Score user   -566.96
Best Score all users   -599.62

               

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Posté par: rom_185 le 08 septembre 2008 à 00:04
 :cry: :'(
Ma première place TOUTES catégories :( ...
Titre: Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: RLDF le 08 septembre 2008 à 00:57
désolé, j'aurais pas dû lire ce post  :(
Titre: Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: xter757288 le 08 septembre 2008 à 11:35
J'ai 0.8 en best RMSD et -120 en score :)
Titre: Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: rom_185 le 13 septembre 2008 à 21:43
Citation de: RLDF
désolé, j'aurais pas dû lire ce post  :(
Mais je ne t'en veux pas  :D !!!
C'est le jeu :).

Titre: Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 17 septembre 2008 à 23:47
Allé je veux la place N°3 et N°2 ; j'ai 0.73  et    -510.84

EDIT:  :D  Merci  :whistle:
Titre: Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 08 décembre 2008 à 09:16
 [:ousermaatre:3] bonjour à tous
best RMSD: 0,21
best score user: -582,827
Titre: Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: RLDF le 08 décembre 2008 à 09:36
je profite du up de ce post pour mettre à jour mon score  :lol:
# hombench_mtyka_foldcst_simple_foldcst_simple_t312__
   0.101   0.067   -168.614   -236.796   26   25065   2008-11-08
# AA2A_20_modeling_1_AA2A_1_AA2A_2VTA_SAVE_ALL_OUT_align
   4.45   3.2   -587.59   -632.84   7   139922   2008-10-29
Titre: Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 08 décembre 2008 à 11:07
Itou : :whistle:
# hombench_mtyka_foldcst_boinc_test3_foldcst_simple_t312__
   0.14   0.1   -226.406   -257.28   9   18091   2008-10-29
# AA2A_20_modeling_1_AA2A_1_AA2A_2VTA_SAVE_ALL_OUT_align
   4.79   3.2   -551.42   -632.84   1   139922   2008-10-29
Titre: Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: Heyoka le 09 décembre 2008 à 18:29
La compétition devient rude  :o
Titre: Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: rom_185 le 13 décembre 2008 à 00:03
Best score de -649.584  :D !
Best RMSD de 0.57  :o...
Titre: Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 13 décembre 2008 à 02:00
Ohoh joli score (Sauf RMSD)
Titre: Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 13 décembre 2008 à 02:05
Citation de: rom_185
Best score de -649.584  :D !
Best RMSD de 0.57  :o...

 [:czame17:8]  rom185
Titre: Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 15 mars 2009 à 14:09
Best RMSD : 0.093  :D
Best score User :-629.627  :o
Titre: Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 15 mars 2009 à 19:43

 0.081 0.074 -233.949 -242.713 4 11257 2009-01-21

 :whistle:  :whistle:
Titre: Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 16 mars 2009 à 00:21
Rahhhhh !!!  :D
Titre: Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 16 mars 2009 à 08:22
d'ailleurs, j'y pense ça fait quelques temps qu'on a pas vu Heyoka, des nouvelles ?
Titre: Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 16 mars 2009 à 09:26
Non.. je ne l'ai pas trop vu non plus sur le forum...
Titre: Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: Hildor le 16 mars 2009 à 09:43

Il a fait un bref passage sur le topic de WCG et une news sur le projet concernant le dystrophie musculaire !

J'espère bien, comme beaucoup de monde, qu'il reviendra peu à peu sur ce forum !
Titre: Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 16 mars 2009 à 11:48
Citation de: Hildor

Il a fait un bref passage sur le topic de WCG et une news sur le projet concernant le dystrophie musculaire !

J'espère bien, comme beaucoup de monde, qu'il reviendra peu à peu sur ce forum !


 [:al@on:5]
Titre: Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 16 mars 2009 à 19:52
 [:ousermaatre:3] Heyoka qui est passé en coup de vent  :jap:  :jap:
Titre: Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 01 mai 2009 à 01:56
0.585 0.032 -635.256 -639.762              99 85891 2009-04-29

en gras mes chiffres, alors la meilleure unité, c'est l'Alliance Francophone qui l'a prédite ?
Titre: Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 01 mai 2009 à 01:57
-635...grrr tu m'as encore dépassé !!
Titre: Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 01 mai 2009 à 02:01
 :lol:  :lol:
j'en fais au moins deux à trois unités par jour, ptetre ça vient de là, ou de la chance de tomber sur les bonnes unités de travail. :jap:
Titre: Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 01 mai 2009 à 09:25
Je reviendraiiii !!!!
Titre: Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 01 mai 2009 à 09:32
1ctf__BOINC_ABINITIO_IGNORE_THE_REST-MOO43--1ctf_-_10770_100 voici les unités qui rapportent en ce moment  :jap:
Titre: Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: kyuzo le 01 mai 2009 à 18:46
Best RMSD    0.038   0.038   -605.173   -606.333   99   87079   2009-04-30
et meilleur score :    3   2.292   -874.282   -876.683   68   30127   2009-04-30
Bon, ou pas bon?
Titre: Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 01 mai 2009 à 19:01
(http://forum.boinc.fr/mesimages/3285/hiphourra.gif)(http://forum.boinc.fr/mesimages/3285/hiphourra.gif)
excellent !!!!!! kyuzo
Titre: Re : Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: Netrider le 15 mai 2009 à 11:55
2.798 2.798 -15.138 -84.658 115 9970 2009-04-30  :??:
Titre: Re : Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: Heyoka le 16 mai 2009 à 16:34
 :yahoo:

Best RMSD : 0,009 (abinitio_norelax_homfrag_natfrag_129_B_5croA_SAVE_ALL_OUT)
Best score : -610,116 (ccf_fair_filt_0.5_chunk_1_8_hb_t326__)
(http://forum-images.hardware.fr/images/perso/pinhead.gif)

Même si d'après les graphiques je crois que pas mal de monde a eu les mêmes scores que moi pour ces 2 types d'unité

(http://forum.boinc-af.org/index.php?action=dlattach;topic=2318.0;attach=615)
(http://boinc.bakerlab.org/rosetta/rah_results.php?BatchID=6252&SubBatchName=abinitio_norelax_homfrag_natfrag_129_B_5croA_SAVE_ALL_OUT&UserID=7547&OrderBy=2&stdZoomX=0&stdZoomY=0&image=1)

(http://forum.boinc-af.org/index.php?action=dlattach;topic=2318.0;attach=617)
(http://boinc.bakerlab.org/rosetta/rah_results.php?BatchID=10666&SubBatchName=ccf_fair_filt_0.5_chunk_1_8_hb_t326__&UserID=7547&OrderBy=4&stdZoomX=0&stdZoomY=0&image=1)
Titre: Re : Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: Heyoka le 18 mai 2009 à 01:25
-696.254 (http://forum-images.hardware.fr/images/perso/cerveau%20dawak.gif) : iRp40_S_3d85_ip40_2ije.pdb.gz_00000008_fa_dock.xml_score12_pert38_DOCK

(http://forum.boinc-af.org/index.php?action=dlattach;topic=2318.0;attach=631)
(http://boinc.bakerlab.org/rosetta/rah_results.php?BatchID=11891&SubBatchName=iRp40_S_3d85_ip40_2ije.pdb.gz_00000008_fa_dock.xml_score12_pert38_DOCK&UserID=7547&OrderBy=4&stdZoomX=0&stdZoomY=0&image=1)
Titre: Re : Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: kyuzo le 18 mai 2009 à 02:23
Ouf, j'ai eu chaud  :D
Titre: Re : Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: Netrider le 18 mai 2009 à 09:09
(http://images3.hiboox.com/images/2109/2bff82a961c4ac15e4adda36c65ddca9.jpg) (http://www.hiboox.fr/go/images/informatique/recrosetta,2bff82a961c4ac15e4adda36c65ddca9.jpg.html)
Titre: Re : Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: Heyoka le 18 mai 2009 à 18:41
Bien joué Netrider  :jap:

Tu peux me donner le score pour que je le rajoute en première page
Titre: Re : Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: julienh le 18 juillet 2009 à 22:05
Best RMSD : 0.188 0.155 -256.69 -287.929 9 25052 2009-07-18
Best Score : 1.212 0.354 -889.381 -898.039 99 73902 2009-07-10
Titre: Re : Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 18 juillet 2009 à 22:32
 :eek: :eek: :eek: :eek: :eek:
Ahhhh........ je vais diparaître du classement :D
Titre: Re : Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: symaski62 le 11 novembre 2009 à 21:52
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/rah_results.php?UserID=506

 :siflotte:
Titre: Re : Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: modesti le 08 novembre 2010 à 11:57
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/rah_results.php?userid=199869

Je crois bien que j'ai réussi à faire une "meilleure prédiction" :siflotte:
Titre: Re : Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 08 novembre 2010 à 15:25
 :kookoo:
la puce

tu peux voir sur le premier post de ce topic les meilleurs scores des membres.
Titre: Re : Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: modesti le 08 novembre 2010 à 15:35
oui, je sais - sauf que c'est toutes UT confondues, donc on peut être amené à comparer des torchons et des serviettes.  :jeboude:
mais là, visiblement, dans la première ligne mon best score correspond au best score de tous les utilisateurs :p c'est ça que je voulais dire.

et puis, de toute façon, avec mon -1057.56 je détrône largement julienh dans les meilleurs scores :p :gniak: :sun:
Titre: Re : Re : Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: julienh le 08 novembre 2010 à 16:10

et puis, de toute façon, avec mon -1057.56 je détrône largement julienh dans les meilleurs scores :p :gniak: :sun:

 :hello: ma belle,
Ce post mérite effectivement un petit dépoussiérage et une actualisation des résultats...

...avec mon -1407.24 je détrône largement modesti dans les meilleurs scores :p :gniak: :sun:

 :hap:
Titre: Re : Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 08 novembre 2010 à 16:15
Best RMSD user = 0.806
Best Score user = - 864.893
Titre: Re : Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 08 novembre 2010 à 16:29
ok je m'y attelle  :kookoo:
Titre: Re : Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 08 novembre 2010 à 16:36
comme quoi, je devrais regarder un peu plus  :miam:

 30.635 3.281        -1325.58      best scores Ousermaatre :D :D   


mem_widd_run01_B_2kdc_SAVE_ALL_OUT_             17.321           best rmsd user  :D    0.061           
Titre: Re : Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: ousermaatre le 08 novembre 2010 à 16:41
J'attends vos scores, les amis  :jap: :jap:
Titre: Re : Vos meilleurs prédictions Rosetta@home
Posté par: modesti le 08 novembre 2010 à 17:42
Si Polynésia/Boris est 6è en RMSD avec 0.806, je suis devant lui avec 0.554 :ange:

A part ça, entre le PDLS sur eOn et le challenge sur WCG à partir du 16, Rosetta devra attendre encore un peu :p