Le Forum de l'Alliance Francophone

Boinc et les projets distribués => Annonces sur Boinc et les projets => Boinc-projets terminés => Discussion démarrée par: popolito le 29 avril 2009 à 21:12

Titre: DrugDiscovery@home
Posté par: popolito le 29 avril 2009 à 21:12
Projet terminer.

Projet à suivre. Prépré-alpha.
http://boinc.drugdiscoveryathome.com/ (http://boinc.drugdiscoveryathome.com/)
Projet russe.




Mis a jour par fzs600 le 26 avril 2020.
Titre: DrugDiscovery@home
Posté par: Heyoka le 29 avril 2009 à 21:27
Le développeur du projet n'est autre que Jack Shultz du projet hydrogenathome
Titre: DrugDiscovery@home
Posté par: fr@ntz le 29 avril 2009 à 21:31
Citation de: Heyoka
Le développeur du projet n'est autre que Jack Shultz du projet hydrogenathome


... et Susa y a ses entrées.
http://forum.boinc.fr/boinc/Lesprojetsdistribues/Boinc/liste-projets-cours-sujet_16_5.htm#t17566

Quelqu'un a déjà créé L'AF et calculé quelques points : damien ?
Titre: DrugDiscovery@home
Posté par: Heyoka le 29 avril 2009 à 21:49
Le champ de recherche :

Citer
??????, ????, ????????, ????????? ??????, ? ????? ? ??????? ????? ????????????? ??????? ?? ???? ???????????


Protéines, cancer, vieillissement, cellules souches, ainsi que la recherche de nouveaux traitements contre différentes maladies.
D'après ce que j'ai compris  :lol:

[cpp]http://distributed.ru/wiki/pro:drugdiscovery[/cpp]

Le projet est mené sous la direction de Andreï Voronkov (Université d'Etat de Moscou : http://www.msu.ru/fr/)
Ils utilisent les applications Autodock (l'application de FightAids@home) et GROMACS (un logiciel de simulation en dynamique moléculaire utilisé par Folding)

Citer
?????? ???? ?? ????? ?????????? ????????? ?? ? ????? ???????????????? ????????? ??? ????????????? ???????????, ? ??????????? ?? ?????????? ? ?? ???? ????????? ?????????-???????????? ?????? ?????????????.


!!! le projet entretient des relations formelles avec une société pharmaceutique mais se développe grâce à l'enthousiasme et avec les moyens personnels d'un groupe de scientifiques russo-américain
Titre: DrugDiscovery@home
Posté par: Hildor le 29 avril 2009 à 21:53

Pour l'instant ils n'acceptent pas de nouveau comptes !
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 11 juin 2009 à 18:48
Bonjour,

Je ne sais pas si le projet a changé depuis que Popo en a parlé, mais à tout hasard:

http://drugdiscoveryathome.com/

Citer
Notre mission est de concevoir et de tester les futurs composés médicamenteux, agissant sur la  régulation des voies de signalisation impliquées dans l'ingénierie des tissus et le cancer.
   
Notre principal intérêt de recherche est le développement de nouvelles thérapies pour le cancer et la gérontologie.

Comme applications, nous utilisons maintenant Autodock4.2 pour le criblage virtuel, couplé à Gromacs pour la dynamique moléculaire. Ces applications sont utilisées pour l'amélioration des structures 3D pour modéliser des bio-cibles, et pour l'élaboration de médicaments basés sur une structure silicone. La principale innovation du projet est l'utilisation de dynamiques moléculaires de haute performance, pour la modélisation de structures de base.

* Traductions très approximatives


Edit: adresse pour s'attacher: http://boinc.drugdiscoveryathome.com/
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 11 juin 2009 à 22:36

Hier j'ai voulu créer un compte mais sur la page Create an account (http://boinc.drugdiscoveryathome.com/create_account_form.php), à la 1ère ligne de l'inscription, il est demandé un Code d'invitation :(... je suis passé par BAM et là "Créer un compte" est grisé :/
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] nico8313 le 11 juin 2009 à 22:46
oh la !

On est mal classé sur ce projet !!!!! :cpopossib:
Va falloir que je m'y mette  :cavachier:
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 11 juin 2009 à 22:58
Hier j'ai voulu créer un compte mais sur la page Create an account (http://boinc.drugdiscoveryathome.com/create_account_form.php), à la 1ère ligne de l'inscription, il est demandé un Code d'invitation :(... je suis passé par BAM et là "Créer un compte" est grisé :/
oups, j'ai oublié de préciser qu'il fallait un code d'invitation  :/

envois un petit mail à Jack, il t'en enverra un  ;)
Titre: Re : Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 11 juin 2009 à 23:29
oups, j'ai oublié de préciser qu'il fallait un code d'invitation  :/

envois un petit mail à Jack, il t'en enverra un  ;)

c'est qui jack ?
Titre: Re : Re : Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: overclockman le 11 juin 2009 à 23:32
c'est qui jack ?

un haricot  pardi, je blague lis plus haut c'est le gérationneur du projet des drogé  :gropet: :sarcastic:
Titre: Re : Re : Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 11 juin 2009 à 23:39
c'est qui jack ?

c'est lui: http://boinc.drugdiscoveryathome.com/view_profile.php?userid=1
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 11 juin 2009 à 23:42
J'ai laisser un message sur le site hydro mais je penses pas avoir de réponses..;
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 12 juin 2009 à 04:35
AH merci Pascal, j'avais pas pensé à lui demander directement. Je vais le faire alors.
Merci !
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 12 juin 2009 à 12:00
Citer
Fri 12 Jun 2009 11:54:00 CEST   DrugDiscovery   Message from server: (reached daily quota of 8 results)
c'est pas beaucoup ça  :cpopossib:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] nico8313 le 12 juin 2009 à 12:04
Bonjour  :kookoo:

On est obligé de passer par jack pour s'inscrire au projet ???   :??:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 12 juin 2009 à 12:30
Et bien, il faut un code d'invitation. Jack est une des personnes en charge du projet. Je lui ai envoyé un MP hier, j'attend.
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 12 juin 2009 à 12:35
Citer
DrugDiscovery@Home is in an early alpha phase and does not have a formal relationship with academia or the pharmaceutical industry.

Le projet est encore en phase "expérimentale", c'est pourquoi la création de comptes est pour le moment très limitée.

Comme tout projet naissant, l'admin a besoin de quelques volontaires pour tester ses UT et applications. Jack travaille d'arrache pied sur les applications, et en parle souvent sur le forum d'Hydrogen.

Toutes mes UT sont parties en erreur au bout de 3 à 7 secondes.

Je me suis abonné au fil de discussion Project Status de DrugDiscovery, et je remonterais l'info dès que la création de comptes sera devenue publique.

Il vous reste toujours la possibilité de demander un code d'invitation, mais ils seront certainement délivrés au compte-goutte, ce qui est compréhensible à ce stade du projet.

 :jap:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] nico8313 le 12 juin 2009 à 12:56
 :jap: Merci Pascal94 pour tes explications !  :jap:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: tristesire le 12 juin 2009 à 14:40
Oui, à ce stade du projet, les volontaires doivent faire plus que calculer, il faut qu'ils prennent un part active enfaisant remonter régulièrement les difficultés qu'ils rencontrent etc...
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 12 juin 2009 à 17:37
J'ai recu mon code d'invitation ! Je m'y met dessus alors !
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 12 juin 2009 à 17:50
cool, un AFien de plus  :oki:
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 12 juin 2009 à 19:15
J'ai recu mon code d'invitation ! Je m'y met dessus alors !


Moi aussi et je viens recevoir deux ut de 20h... on va voir...

J'espére que ce projet russe est sur
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 12 juin 2009 à 22:43
Le projet est encore en phase "expérimentale", c'est pourquoi la création de comptes est pour le moment très limitée.

Comme tout projet naissant, l'admin a besoin de quelques volontaires pour tester ses UT et applications.
Oui, à ce stade du projet, les volontaires doivent faire plus que calculer, il faut qu'ils prennent un part active enfaisant remonter régulièrement les difficultés qu'ils rencontrent etc...

Pour ma part, étant incapable de remonter correctement des infos en anglais :(, j'attendrais que le projet devienne public. :spamafote:

Merci Pascal pour les infos! :jap: ;)
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: fr@ntz le 12 juin 2009 à 23:00
Et bien, il faut un code d'invitation. Jack est une des personnes en charge du projet. Je lui ai envoyé un MP hier, j'attend.

Dis Dudu STP peux tu nous mettre ici l'adresse du Jacquot pour aider les fainéants comme moi à faire leur demande ? merci d'avance  :jap:
Titre: Re : Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 12 juin 2009 à 23:06
Dis Dudu STP peux tu nous mettre ici l'adresse du Jacquot pour aider les fainéants comme moi à faire leur demande ? merci d'avance  :jap:
Je confirme... t'es vraiment fainéant http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2316.msg185756.html#msg185756 (http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2316.msg185756.html#msg185756)! :siflotte:

ÉDIT: Autant pour moi, mais il n'y a pas son adresse courriel. :(

reÉDIT: J'ai trouvé ce lien http://boinc.drugdiscoveryathome.com/forum_thread.php?id=41 (http://boinc.drugdiscoveryathome.com/forum_thread.php?id=41), et ça donne jshultz AT hydrogenathome.org. ;)
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: fr@ntz le 12 juin 2009 à 23:47
J'ai cherché partout sur ce  :grmblbl: de site

bon finalement, j'ai du réfléchir  :idtalacon:
et suis allé poster mon MP de demande sur son autre projet, Hydrogen, où je suis déjà inscrit.

Pénible ce filtrage... :rhaa:

Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 13 juin 2009 à 05:28
Oui je lui ai envoyé un MP via Hydrogen.

Par contre pour ma part, les 12UT (Quota max) sont parti en erreur. Un probleme de librairie je crois sous Linux 64b. Peut etre ca vient de moi, peut etre de l'application. Je ne sais pas. J'ai posté sur le forum.

Al, si tu as des soucis, tu peux poster ici et quelqu'un se chargera de remonter l'info !

En tout cas j'aime beaucoup le but de ce projet et son admin. Il teste meme en ce moment une version CUDA. Super !
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 13 juin 2009 à 11:56
Moi je ne calcul qu'une ut pour voir le temps de calcul réel, pour l'instant le % reste bloqué à 90,09 ! et il reste 17 mn de calcul mais je n'y crois pas...
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 13 juin 2009 à 12:25
C'est du test, c'est donc normal !
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 13 juin 2009 à 12:30
oui mais c'est chiant car j'ai regardé dans le gestionnaire de tâche et le process été à zéro donc cela devrait être en erreur, non ??
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 13 juin 2009 à 12:34
Le projet n'est meme pas ouvert aux inscriptions et comme l'a dit Tristesire : "Oui, à ce stade du projet, les volontaires doivent faire plus que calculer, il faut qu'ils prennent un part active enfaisant remonter régulièrement les difficultés qu'ils rencontrent etc..."
Il faut donc remonter les infos. Pour le moment, on ne crunch pas sur ce projet pour les points.
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: popolito le 13 juin 2009 à 14:06
C'est clair que si vous avez un compte sur ce projet mais que vous n'allez jamais sur leur forum pour leur indiquer les problèmes, détachez-vous et filez votre compte un quelqu'un de motivé...  :priz2tet:
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 13 juin 2009 à 14:15
C'est clair que si vous avez un compte sur ce projet mais que vous n'allez jamais sur leur forum pour leur indiquer les problèmes, détachez-vous et filez votre compte un quelqu'un de motivé...  :priz2tet:

faire remonter les erreurs quand ce n'est pas marqué erreur...
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 13 juin 2009 à 14:22
Ou comportement bizarre.
Tout ce qui est anormal.
Tu peux aussi vérifier dans tes taches effectués, le resultat.
Titre: Re : Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 13 juin 2009 à 14:23
faire remonter les erreurs quand ce n'est pas marqué erreur...

Ne le prends pas mal (popolito est du genre direct :siflotte:), mais il n'a pas tort.
Lis mon précédent message où j'explique que je ne m'incrirais à ce projet seulement quand les phases de tests seront terminées... car je suis incapable avec mon anglais de merde de remonter des infos très utiles aux développeurs. :spamafote:
Titre: DrugDiscovery@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 13 juin 2009 à 14:30
Il faudrait que l'alliance s'y mettent car nous sommes que 7 avec 1824 crédits pour ce projets et c'est boinc stats qui est premier....
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 13 juin 2009 à 16:08
Genre al, ton anglais n'est pas de merde ! Surtout que tu arrives tres bien à lire les différents fofo des projets !!

Boris, il nous faut des testeurs de notre coté aussi. Libre a toi de l'etre ou pas.
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: fr@ntz le 13 juin 2009 à 18:39
Il faudrait que l'alliance s'y mette car nous ne sommes que 7 avec 1824 crédits pour ce projet et c'est boincstats qui est premier....
:non: nan, on est 8 maintenant  :jtevoivnir:
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 13 juin 2009 à 19:56
Genre al, ton anglais n'est pas de merde ! Surtout que tu arrives tres bien à lire les différents fofo des projets
T'es sympa Dudu... mais non!
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 13 juin 2009 à 23:43
Ceux qui ont de grosses bécanes devraient si mettre
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Hildor le 14 juin 2009 à 00:09

boris tu fais exprès ou quoi !  :pt1cable:

Ce projet et en TEST, il n'est donc pas encore question de raid sur ce projet, mais de tester les unités !
Peux-tu le comprendre !
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 14 juin 2009 à 00:25
boris tu fais exprès ou quoi !  :pt1cable:

Ce projet et en TEST, il n'est donc pas encore question de raid sur ce projet, mais de tester les unités !
Peux-tu le comprendre !

Je le comprends mais il faudrait quand même plus de membre dessus pour ces tests
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: popolito le 14 juin 2009 à 09:40
Mais peut-être que ça broute de regarder son boinc manager toutes les demi-heures pour voir si une unité a planté, d'aller sur le message board pour dire "JACK, PLANTED !!"  :bonui:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: tristesire le 14 juin 2009 à 11:49
Citer
Ceux qui ont de grosses bécanes devraient si mettre
Quel rapport avec la phase de beta testing?  seul poste suffirait, c'est un projet qui demande du temps humain plus que tu temps machine. Le serveur est en phase de construction, on pourrait être dernier au rac avec 2 ou 3 points que ca ne changera rien.
Durant cette phase quelques membres bien motivés 3 ou 4 ou même 8 actuellement suffisent. Il s'agit de contribuer à remonter tout comportemet normal ou anormal des unités, de l'atatchement au serveur avec le Bm en passant par le DL des unités, le calcul de ces dernières et l'upload.
Un crunch massif pourrait même gêner, d'ailleurs le fait de devoir demander un code d'accès est une étape en soit. Bref, faire un appel aux bonne volontés c'est bien, faire appel à des participânts pour dépasser les autres équipes, aucun intérêt.
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Jim PROFIT le 14 juin 2009 à 11:55
Entièrement d'accord!

:hello:
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 14 juin 2009 à 12:41
Un crunch massif pourrait même gêner, d'ailleurs le fait de devoir demander un code d'accès est une étape en soit. Bref, faire un appel aux bonne volontés c'est bien, faire appel à des participânts pour dépasser les autres équipes, aucun intérêt.

 :plusun:

D'autant qu'il n'y a que très peu d'UT, le quota étant de 8 UT par jour chez moi, et pour le moment, une seule UT (http://boinc.drugdiscoveryathome.com/workunit.php?wuid=185883) s'est calculée normalement.
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Jim PROFIT le 14 juin 2009 à 13:43
J'ai calculé pas mal de WU's sans erreurs, sauf sur linux!
Pour le moment, j'ai presque tout en pending, car quorum de 3.

:hello:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 14 juin 2009 à 15:54
Ouai sous linux, je suis comme toi. Tout en erreur.
Et quota de 12.
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 14 juin 2009 à 15:59
Ouai sous linux, je suis comme toi. Tout en erreur.
C'est du 64bit?
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 14 juin 2009 à 16:07
Ouai sous linux, je suis comme toi. Tout en erreur.
Et quota de 12.
quota de 12 ? t'as quoi comme proco ?

C'est du 64bit?
moi oui, Ubuntu 9.04 64 bits
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 14 juin 2009 à 16:11
Oui Al en 64b
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 14 juin 2009 à 18:12

En résumé... c'est pas encore au point en 64bit. :D
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 26 juin 2009 à 14:16
ouf.. je viens de recevoir 92 ut...c'est la première fois que j'en ais autant
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 26 juin 2009 à 17:52
alors là, j'en reviens pas:

d'abord Boinc me dit ça:
Citer
Fri 26 Jun 2009 17:48:33 CEST   DrugDiscovery   Message from server: autodock with mgltools scripts is not available for your type of computer.

puis je vois ça dans la rubrique Applications du projet:
Citer
Platform: Microsoft Windows (98 or later) running on an Intel x86-compatible CPU
Version: 1.24
Installation time: 24 Jun 2009 13:55:44 UTC
mais où sont passées les applis pour Linux  :rhaa:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 26 juin 2009 à 23:46
C'est pareil pour moi. C'est en test...parfois j'en reçois...mais c'est toujours en erreur de calcul... il doit avoir pas mal de taff à coder j'imagine. Je lui laisse donc le temps...
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 26 juin 2009 à 23:48
ouais, d'autant plus que Jack se donne à fond  :jap:
Titre: DrugDiscovery@home (Intégration au FB)
Posté par: Sébastien le 07 juillet 2009 à 20:44
Sur le forum du classement FormulaBoinc, un membre de Seti Germany demande pourquoi ce projet n'est pas pris en compte.

Puisque ce projet est en version alpha, quelqu'un pourrait-il demander à l'administrateur du projet si il est d'accord avec l'intégration de ce projet au classement.
Je n'ai pas de compte pour pouvoir poster sur le forum du projet.
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 07 juillet 2009 à 20:57
ce projet est en phase Alpha, autrement dit il n'en est qu'à ses débuts  :jap:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Hildor le 07 juillet 2009 à 21:06

Oui, mais d'après les règles de FB il devrait être intégré si il n'y pas opposition de l'administrateur.
Ce projet à dépassé 1 000 000 de crédit depuis le 15 juin !
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 07 juillet 2009 à 21:08
ha ouais, quand même  :eek:

c'est cool ça  :oki:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Hildor le 07 juillet 2009 à 21:11

Oué, mais ils n'ont toujours pas re-ouvert les inscriptions  :cpopossib:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 07 juillet 2009 à 21:16
ben... Jack préfère que ça reste "restreint" tant qu'il développe les applis pour Hydrogen et Drugdiscovery, mais tu peux demander une invitation si tu souhaites participer  :jap:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Hildor le 08 juillet 2009 à 06:25

bah ! j'attendrais j'ai assez à faire  :D
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 13 juillet 2009 à 11:30
Ahhh ! Ca marche bien maintenant !
Il a fait de gros progres ! Mes UT partaient tous en downloading error, et maintenant ca marche et ca crunch !!

Pas de probleme pour le moment !

Message fusionné: 13 juillet 2009 à 18:10
Comme ses lots d'UT marche tres bien, l'admin de DD souhaiterai plus de participants.
Donc vous pouvez lui demander un code d'invitation en lui envoyant un MP.
Ou meme, je peux lui demander pour vous.

Une UT durent quelques minutes et pese quelques ko, et les UTs se calculent bien plus vite sous Linux que sous Windows.

Parcontre, je me répète, ce projet est en développement !
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 13 juillet 2009 à 20:15

Merci pour les infos Dudu. :jap:
Pour ma part j'attends que l'Admin ouvre les inscriptions... il finira bien par le faire un jour. :coffeetime:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 13 juillet 2009 à 20:31
Sinon je te file un code d'invitation, ca marche aussi !
Mais pas sur qu'il ouvre tout de suite, à cause du coup des spammers...
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 13 juillet 2009 à 21:10
Sinon je te file un code d'invitation, ca marche aussi !
Mais pas sur qu'il ouvre tout de suite

Un même code peut fonctionner pour +sieurs comptes. :??:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 13 juillet 2009 à 21:19
Ba je lui demande tout simplement, il cherche des cruncheurs !
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 13 juillet 2009 à 21:22
Ba je lui demande tout simplement, il cherche des cruncheurs !

Alors... fais pêter! :D
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 13 juillet 2009 à 21:44
Okay c'est demandé !
Je te l'envoi par MP quand je le reçois !
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 13 juillet 2009 à 21:59

Merci Dudu. :jap:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Netrider le 13 juillet 2009 à 22:04
Oui cela serait intéréssant car sur le site je ne vois aucun moyen de contacter jack a moins d'etre déja incrit  :(
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 13 juillet 2009 à 22:13

À la page précédente j'avais mis cette adresse
Citer
jshultz AT hydrogenathome.org
... je ne sais pas si c'est la bonne. :spamafote:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Netrider le 13 juillet 2009 à 22:20
Merci Al@on  :smak: je vient de lui envoyer le mail, y a plus qu'a attendre la réponse :hyperbon:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 13 juillet 2009 à 22:27
Okay, j'ai le code !
Pour 3 personnes,
Al et Netrider, vos MP !

Message fusionné: 13 juillet 2009 à 22:29
Si un autre membre souhaite un code, il m'en reste 1.
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] nico8313 le 13 juillet 2009 à 22:35
Tu m'en donne un dit Dudu  !  :jap: :love:

Merci

EDIT : à moins que le code que tu m'a déjà donné marche ?  :/
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 13 juillet 2009 à 22:43
Donné !

Je n'ai plus de code !
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 13 juillet 2009 à 22:45

Inscrit sur le projet. :p
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] nico8313 le 13 juillet 2009 à 22:46
Inscrit sur le projet. :p

J'arrive j'arrive !!  :D
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: overclockman le 13 juillet 2009 à 22:48
Ji suis aussi.  merci dudu
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 13 juillet 2009 à 22:53

Il pleut des UTs. :hyperbon:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 13 juillet 2009 à 22:55
Parcontre j'ai un probleme avec un de mes PC dessus...
Je n'arrive pas à prendre beaucoup de cache...
Je met genre 1mn par UT mais j'en récupère que une ou 2 par coup d'update... donc en 56k j'ai pas trop de quoi avoir un stock.

Par contre sur un P4 en linux 32b, j'en recoit 16 par 16.... pas compris...
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 13 juillet 2009 à 22:56
Euh là c'est carrément une averse! :siflotte:

Déjà 134 et il en tombe encore.
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] nico8313 le 13 juillet 2009 à 23:05
Si je mets mon Pentium4 dessus c'est bon ou pas ???
Je trouve pas non plus sur la page d'accueil les applications réclamé par le projet !

ça tourne sous Linux 32 Bit ?? 
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 13 juillet 2009 à 23:08
J'ai mis mon P4 dessus. Autant essayer.

Parcontre ca a l'air d'etre du 32b compatible 64.

Edit: Nico, tu me diras si tu reçois pas mal d'UT (genre si ca te donne plus de 2UT à la fois) sur ta config 64b  :jap:
Ainsi que les réglages de cache... :smak:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 13 juillet 2009 à 23:17

J'en ai reçu 442 :eek:, cache à 1 jour et PrimeGrid suspendu. :p
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] nico8313 le 13 juillet 2009 à 23:18
Beh la je tourne sur Debian 32 Bit pour l'instant je peux pas mieux !  :/

J'ai reçu 35 unités avec 1 jour dans les paramètres !

EDIT: mais j'ai mis en "pas de nouveaux travail"    :)   je gère !
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 13 juillet 2009 à 23:22

Là il m'en charge sur le portable de ma frangine que j'ai en pension (il faut juste le nourrir en UTs :D).

Via BAM j'alimente aussi les bécanes du boulot. :hyperbon:
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] nico8313 le 13 juillet 2009 à 23:26
Là il m'en charge sur le portable de ma frangine que j'ai en pension (il faut juste le nourrir en UTs :D).

ça c'est un bon pedigree !  Nourrit aux UT  :lol:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 13 juillet 2009 à 23:29
Al, le max est à 500WU en cache. Il faut genre 5-7mn sur un quad en windows.

En, se connecter toute les xxx vous avez quoi ?
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 13 juillet 2009 à 23:34

Avec mon 3400+ sous Linux 64bit, pour l'instant la + rapide 00:59 et la - 03:46.
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] nico8313 le 13 juillet 2009 à 23:34
Sur Debian 32Bit avec le P4 @3,6Ghz  d'après Boinc je mets 5 minutes 15 secondes !


EDIT : Ah ! j'ai des unités à 3 minutes et 5 secondes !  et d'autres à 2 minutes 17 secondes !

C'est très variable !  :/
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 13 juillet 2009 à 23:38
Ah ba ca va avec le P4 ! Bien plus rapide que sous win !

Sinon avec Boinc, vous connaissez le "cest machin" ? pas la peine
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] nico8313 le 13 juillet 2009 à 23:43
Ce qui m'embête c'est que je n'ai pas le projet dans ma barre d'outils favorite  :blbl:


EDIT : j'ai fais une demande pour la barre d'outils !  :D
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 13 juillet 2009 à 23:58
Ce qui m'embête c'est que je n'ai pas le projet dans ma barre d'outils favorite  :blbl:


EDIT : j'ai fais une demande pour la barre d'outils !  :D

Très bonne idée :jap:... je n'aurais pas à le faire! :p

Message fusionné: 14 juillet 2009 à 00:13

Ayez j'ai le quota
Citer
mar 14 jui 2009 00:15:22 CEST|DrugDiscovery|Message from server: No work sent
mar 14 jui 2009 00:15:22 CEST|DrugDiscovery|Message from server: (reached limit of 500 tasks)
:blbl:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Netrider le 14 juillet 2009 à 00:18
En tout cas il commence bien le 14 Juillet  :love:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 14 juillet 2009 à 00:28
Bon je crois qu'ils veulent d'autres membres encore. Si il y a des intéressé, dites le moi ! (ou lui)

Edit :
Bon hop, ils ont besoin de plus de membres, donc libre cours au code d'invitation ! Je vous ai donné à tous le meme code. Libre à vous de le partager.
Evitons que ca traine en partie publique.

Donc ceux qui veulent le code, MP nous !
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: RLDF le 14 juillet 2009 à 00:30
je veux bien :)
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 14 juillet 2009 à 00:38
Ah ! un bon gros diesel dessus ^^ !!
Ils vont etre content.
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] nico8313 le 14 juillet 2009 à 00:41
J'ai pas trouvé le projet dans "BAM"   ????  :??:

Il faut faire quelque chose de spécial ?

Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: RLDF le 14 juillet 2009 à 00:42
il n'y est pas encore, faut demander à willy je crois
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] nico8313 le 14 juillet 2009 à 00:43
il n'y est pas encore, faut demander à willy je crois

Ah d'accord !  :jap:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: overclockman le 14 juillet 2009 à 00:53
Je viens d'en balancer une 100ene de fini là, entre 3min 40 et 4min 15 sur win 64
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 14 juillet 2009 à 00:55
J'ai pas trouvé le projet dans "BAM"   ????  :??:

Il faut faire quelque chose de spécial ?

Connexion aux Projets et une fois la page ouverte au bas du tableau clic sur » Also show projects that do not accept new members. :p
Titre: Re : Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] nico8313 le 14 juillet 2009 à 01:00
Connexion aux Projets et une fois la page ouverte au bas du tableau clic sur » Also show projects that do not accept new members. :p

Impeccable ! Merci AL  :jap:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 14 juillet 2009 à 10:37
J'ai eu des erreurs de calcul tiens sur le PC avec ubuntu 64.... ca ne le fait pas sur ma gentoo... Je dois manquer une lib je pense...
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 14 juillet 2009 à 11:38
J'ai eu des erreurs de calcul tiens sur le PC avec ubuntu 64.... ca ne le fait pas sur ma gentoo... Je dois manquer une lib je pense...

Aucune erreur chez moi (Ubuntu v8.04 64bit) sur ~300 UTs de calculées... je touche du boa.
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 14 juillet 2009 à 11:44
Ca utilise le python...je dois vérifier si ca vient pas de la...
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: la frite le 14 juillet 2009 à 13:40
Salut! ça fait un bout de tmps que j'attends l'ouverture des inscriptions sur ce projet alors je me lance maintnt qu'il a besoin de mondo :P qqun peut m'envoyer le code en mp s'vous plait messieurs :) merci
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: RLDF le 14 juillet 2009 à 13:47
je suis inscrit, j'ai voulu tester avec une petite machine, pour linux, il demande 512Mo, j'en avais que 256 sur cette machine :(
ça ira mieux sur les autres :)
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 14 juillet 2009 à 13:50
Bon un des admin m'a demandé de ne plus donner le code.
Car pour le moment ca marche, mais si apres ca ne marche pas, il faut pas se plaindre. C'est du alpha.
Et il faut remonter les infos.

Le mieux est de demander à Jack directement. Envoyez lui un mail, il répond assez rapidement.
 
Pour ma part, je ne peux plus communiquer le code.
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: overclockman le 14 juillet 2009 à 14:50
Vu que les ut sont super courte, pourquoi l'admin a pas pris le principe de freehal ?
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 14 juillet 2009 à 14:59
Vu que les ut sont super courte, pourquoi l'admin a pas pris le principe de freehal ?

Euh là, je crois que ça va pas être possible... ce n'est pas du tout le même type de projet... FreeHAL prends très peu de ressources CPU alors que DrugDiscovery prend jusqu'à 100% suivant les réglages; rien à voir avec la durée du calcul d'1 UT. :spamafote:

Message fusionné: 14 juillet 2009 à 15:13

ATTENTION!!! Le diesel RLDF à démarré. :lol:

Message fusionné: 14 juillet 2009 à 20:21

Bonne nouvelle pour les détenteurs de CG NVIDIA

Citer
July 14, 2009
Happy Bastille Day! We are now looking at GPU integration for GROMACS. We may need a little help with this integration. Here is a thread I started which includes links to related code. There is a msvc solution for building gromacs and there are various pre-compiled libraries for integrating cuda called OpenMM, read more http://boinc.drugdiscoveryathome.com/forum_thread.php?id=84

Trad: Nous regardons maintenant l'intégration de GPU pour GROMACS. Nous pouvons avoir besoin d'une peu d'aide avec cette intégration. Voici un fil que j'ai commencé qui inclut des liens au code relatif http://boinc.drugdiscoveryathome.com/forum_thread.php?id=84 (http://boinc.drugdiscoveryathome.com/forum_thread.php?id=84).
Titre: Re : Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: RLDF le 15 juillet 2009 à 01:53
ATTENTION!!! Le diesel RLDF à démarré. :lol:
bin quoi ? je ne suis que 11ième avec 160 points  :ange:

au fait, pensez à faire un profil, ya peu de membres, ya moyen de chopper aussi les uotd :)
Titre: DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] nico8313 le 15 juillet 2009 à 03:11
Tiens  d'ailleurs je suis UOTD   :yahoo: :clafete: :bounce: :cetaboir:
http://boinc.drugdiscoveryathome.com/


Génial ! Du GPU en préparation  !!! :love:

(http://www.kirikoo.net/images/7nico8313-20090715-033021.jpg)

Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: RLDF le 15 juillet 2009 à 08:11
Génial ! Du GPU en préparation  !!! :love:
je l'ai déjà dit, c'est pas parce qu'il y a cette case qu'ils vont faire du GPU
cette case est sur tous les projets qui sont passés sur la dernière version du boinc-projet
l'autre fonctionnalité de cette version est l'affichage des tâches par "en cours, validées, en pending, en erreur etc.."
http://boinc.drugdiscoveryathome.com/results.php?userid=714&offset=0&show_names=0&state=3 (http://boinc.drugdiscoveryathome.com/results.php?userid=714&offset=0&show_names=0&state=3)

en revanche, la news sur le GPU est bien réelle donc ils y travaillent vraiment  :pt1cable:
http://boinc.drugdiscoveryathome.com/forum_thread.php?id=84 (http://boinc.drugdiscoveryathome.com/forum_thread.php?id=84)
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 15 juillet 2009 à 10:23
Oui voila.

Pour DD, ils essayent de faire une application GPU.
Des que je recois mes CG, je vais essayer de les aider.

J'adore ce projet moi !!!
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 15 juillet 2009 à 12:55
Tiens  d'ailleurs je suis UOTD   :yahoo: :clafete: :bounce: :cetaboir:
:oki: Bravo nico! :banana:
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] nico8313 le 15 juillet 2009 à 16:49
:oki: Bravo nico! :banana:

Merci AL !  :jap:

Par contre j'arrive pas à prendre de boulot pour GPU ? peut-être parce que je suis en 64Bit ??? et qu'il faut 32 ???
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Extra Ball le 15 juillet 2009 à 17:01
OOOO admin plus que reactif
Demande de code d'invitation par mail et reponse dans les 10 minutes (j'ai dit que je connaissais dudu, ca a dudu aider)
Ca promet
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes>Jip] Elgrande71 le 15 juillet 2009 à 17:01
Bravo nico.
Dis donc, t'es partout, on arrive plus à te suivre.  ;)
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] nico8313 le 15 juillet 2009 à 17:12
Bravo nico.
Dis donc, t'es partout, on arrive plus à te suivre.  ;)

Salut El !  :kookoo:

Merci  :jap:

Disons que j'essaie de jongler entre les projets ! c'est pas facile  :/
Sinon oui ! ça marche pas mal pour moi  :D
Titre: Re : Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 15 juillet 2009 à 17:25
Par contre j'arrive pas à prendre de boulot pour GPU ? peut-être parce que je suis en 64Bit ??? et qu'il faut 32 ???

nico, je ne pense pas qu'il y ait des UTs GPU pour l'instant... ce n'est encore qu'un projet. :spamafote:
Titre: Re : Re : Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] nico8313 le 15 juillet 2009 à 17:29
nico, je ne pense pas qu'il y ait des UTs GPU pour l'instant... ce n'est encore qu'un projet. :spamafote:

Beh tu sais ! j'ai un peu lu le forum ici (Avec google traduction   :D )
http://boinc.drugdiscoveryathome.com/forum_thread.php?id=84

Apparemment il a besoin de volontaires pour le GPU ! bien sur qui n'est pas encore au point ! 
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 15 juillet 2009 à 17:38
Autant pour moi (j'ai mis ce lien hier... mais je ne suis même pas passer le voir :cpopossib:).

AMHA, tu devrais attendre que Dudu s'y mette car
Citer
You can build gromacs for linux with cuda
https://simtk.org/project/xml/downloads.xml?group_id=161 (https://simtk.org/project/xml/downloads.xml?group_id=161)

linux instructions calls for coping the following source files so they mirror the same directory tree of gromacs. They all get copied over to the gromacs kernel directory.
md_openmm.cpp md_openmm.h mc.c

You also need to make sure you have the libraries and headers linked to the pre-compiled openMM libraries and perhaps also link to the cuda sdk.

I will try this again tomorrow.
ça n'a pas l'air très simple... en tout cas pour moi. :D
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 15 juillet 2009 à 21:15
Oui tout à fait ! Ils ont besoin d'utilisateur pour le GPU...
Des que mon PC est monté, je vous tiens au courant, je vais essayer de cruncher en GPU.

Mais je crois qu'il faut compiler sa propre application....
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: supersnoopy le 16 juillet 2009 à 08:50

Salut à tous,

Votre avis sur le fait que ce projet n'est rattaché à aucune université ?

d'autre part, le programme GROMACS qui est utilisé en partie est aussi utilisé par Rosetta... ?

Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Meteore31 le 16 juillet 2009 à 17:20
Quelqu'un pourrait m'envoyer le code d'invitation pour ce projet ? Merci d'avance !
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Extra Ball le 16 juillet 2009 à 17:47
Quelqu'un pourrait m'envoyer le code d'invitation pour ce projet ? Merci d'avance !
Envoie un email a Jack, son adresse a ete donnee qques pages plus haut
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Meteore31 le 16 juillet 2009 à 18:07
il est où son mail ?
sur ce lien il n'apparait pas : http://boinc.drugdiscoveryathome.com/view_profile.php?userid=1
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 16 juillet 2009 à 18:13
Salut à tous,

Votre avis sur le fait que ce projet n'est rattaché à aucune université ?

d'autre part, le programme GROMACS qui est utilisé en partie est aussi utilisé par Rosetta... ?

Edit : l'adresse email de l'admin :
jshultz AT hydrogenathome.org (message d'Al@on page3)

Ce n'est pas un probleme en soi que ca ne vienne pas d'une université. Il faut juste faire plus attention à ce que le projet respecte notre "charte". Resulats publié, etc...
Mais pour info, Jack est également l'admin d'hydrogen@home. Il est tres réactif et tres sympa !
Le code de l'application est ouvert.

Il n'y a rien à craindre.

Parcontre pour la différence avec rosetta... Je n'ai pas pensé à comparer ces 2 projets... j'en n'ai aucune idée.
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: fr@ntz le 16 juillet 2009 à 21:23
il est où son mail ?
sur ce lien il n'apparait pas : http://boinc.drugdiscoveryathome.com/view_profile.php?userid=1
moi je suis passé par Hydrogen dont il est aussi l'administrateur et où on peut lui envoyer un MP.
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Meteore31 le 16 juillet 2009 à 22:08
j'ai envoyé un MP sur Hydrogen, je verrai bien...

Message fusionné: 17 juillet 2009 à 13:22
ok code reçu par MP de Jack
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 18 juillet 2009 à 00:27
Mon probleme est résolu. Sous Linux, il fallait les ia32-libs. Que je n'avais pas installé (32mo les betes...) !
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 18 juillet 2009 à 00:49

Vous l'avez sûrement remarqué mais certaines UT sont beaucoup + longues qu'au début.
Sous Linux 64 c'était du - 4mn et maintenant j'en ai calculé 1 à + de 21mn.
Sous W$ c'est carrément + de 45mn alors que c'était - de 7mn pour les + longues.
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: nabz le 19 juillet 2009 à 00:09
15 minutes entre mon mail à Jack et sa réponse avec le code d'invitation ! :eek:

Bon, ben maintenant, y'a plus qu'à. :hyperbon:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 19 juillet 2009 à 00:53
Oui Al, pareil de mon coté.
Ca m'arrange !! Avant c'était trop court !! (Mon 56k se repose un peu plus maintenant)
Bon j'ai reçu mes CG mais je n'ai aucune idée comment faire. On a demandé à Jack pour avoir des infos. (Zpm a demandé pour win, moi Linux et une autre personne pour PS3 ! Il va avoir du boulot le Jack...deja qu'il en a pardessus la tete ^^)
Je vous tiens informé pour CUDA.
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] nico8313 le 19 juillet 2009 à 04:36
Génial Dudu !

Oui tiens nous au courant pour cuda ! je regarde aussi un peu le fofo de DD !

Ah au fait ! la prochaine fois propose lui plutôt une salade Salade niçoise  :D   :lol:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 19 juillet 2009 à 10:16
Hahahaha ! En tant que Lyonnais...C'est la premiere qui m'est venu !!  :coffeetime:, mais poste la recette si tu veux !
 :siflotte: j'ai été démasqué !
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Netrider le 19 juillet 2009 à 12:07
Moi je ne recois toujours que des 4 minutes sous W64 rien d'autre  :electric:
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Extra Ball le 19 juillet 2009 à 14:20
Moi je ne recois toujours que des 4 minutes sous W64 rien d'autre  :electric:
Les UTs longues sont estampillees *_ga10_*. En gros, elles font 10 passes de l'algorithme et sont sensees ameliorer le degre de prediction de la simulation
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: fabrice le 19 juillet 2009 à 14:36
Bah mince, je lui ai envoyé un MP hier et j'ai pas eu de réponse  :priz2tet:

edit: c'est bon, il m'a répondu  :miam:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 19 juillet 2009 à 19:40
Si il y a des volontaires avec des PS3, Jack aimerai sortir une app pour PS3.
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: fabrice le 20 juillet 2009 à 09:17
Présent :)

J'aime me battre avec ma PS3 et ma télé 4/3  :priz2tet:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 20 juillet 2009 à 11:06
Tu as rattaché ta PS3 au projet ? Il faudra donner le nom de la machine à Jack sur le fofo.
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: fabrice le 20 juillet 2009 à 11:23
Non pas encore, comme je bosse, j'attends d'avoir un peu de temps, surtout que j'ai mon fils en rab sur le dos... et ma femme aujourd'hui en plus  :D

Suffit de rattacher le projet au boinc que j'utilise déjà et de filer le nom de la machine à Jack?
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 20 juillet 2009 à 13:01
Oui tout à fait ! Il a fait un topic spécial pour PS3.
Il aimerait bien tester. J'imagine qu'il va assigner des UT sur ta PS3.
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: fabrice le 20 juillet 2009 à 13:52
Tant qui y'a rien à bidouiller ça va  :priz2tet:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: popolito le 20 juillet 2009 à 16:12
Dommage pour toi, j'ai entendu dire qu'il fallait installer une distrib' linux de 22Go téléchargeable uniquement sur un serveur de Corée du Nord.
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: supersnoopy le 20 juillet 2009 à 17:13
Dommage pour toi, j'ai entendu dire qu'il fallait installer une distrib' linux de 22Go téléchargeable uniquement sur un serveur de Corée du Nord.

une distrib mise au point par l' EXPERT (http://fr.wikipedia.org/wiki/Kim_Jong-il) de l'internet  :lol:

;)
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: fabrice le 20 juillet 2009 à 17:38
 :blbl:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: rom_185 le 20 juillet 2009 à 20:17
:lol: !
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 20 juillet 2009 à 21:20

Je me suis toujours demandé comment pouvait-on devenir dirigeant d'un pays :??:, bin grâce au lien de snoopy j'ai enfin trouvé...

(http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/2/26/Vladimir_Putin_4_August_2001-2.jpg)

il suffit simplement d'avoir un bras + court que l'autre et peu importe si c'est le droit ou le gauche... ça marche avec les 2. :siflotte:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 20 juillet 2009 à 21:29
 :ptdr:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 20 juillet 2009 à 22:40
Hahaha !!!


Bon sinon, CUDA windows et Linux n'est pas du tout au point. Meme pas besoin de testeur. Il n'arrive pas à compiler normalement, il a des erreurs. L'admin a poster un message sur le fofo des dev du kit pour CUDA.

Je vous tiens au jus !
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 21 juillet 2009 à 22:55
Alors, il n'y a plus d'UT a envoyer. Il reste 40k unité en cours de calcul.
On a bien aidé aussi !!
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: fr@ntz le 22 juillet 2009 à 01:11
Ahrrgh ! dommage !  :rhaa:
On était super bien partis, à 5 jours de prendre la 2e place de Susa et 6 points FB  :priz2tet:

Regardez cette courbe, on dirait un raid  :miam:
(https://statseb.boinc-af.org/img/FB_DrugDiscovery_total.png)

Susa n'a pas bronché, à croire qu'ils savaient qu'on aurait brutalement plus de carburant en pleine ascension... il ne faudra pas louper le redémarrage.
En attendant, il y a d'autres régates en cours sur Ibercivis, Lattice, Enigma ...
edit :  :cry: y'a pu rin non plus sur Lattice  :priz2tet: :priz2tet: :priz2tet:
edit2: et sur Aqua non plus  :pt1cable:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 22 juillet 2009 à 10:33
Ya mon P4 qui a encore 300UT à finir...fiou il en a encore pour quelques jours ! Mais les autres sont à sec..snif

Le prochain redemmarage sera surement mieux encore ! Et puis si il y a CUDA et PS3, ya moyen de faire pas mal de points !
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Meteore31 le 22 juillet 2009 à 10:57
ça y'est j'ai mes 1ers points sur ce projet !
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 22 juillet 2009 à 19:39
Gogogogo ! L'admin vient de remettre un lot d'UT. Yen a 150k !!!
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Netrider le 22 juillet 2009 à 22:04
C'est un projet Alpha  :jap: ce n'est pas une course  :hyperbon:
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: fr@ntz le 22 juillet 2009 à 22:14
C'est un projet Alpha  :jap: ce n'est pas une course  :hyperbon:
C'est une alphacourse  :D
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 22 juillet 2009 à 22:28
Meme en Alpha, il faut beaucoup de cruncheurs pour reporter les resultats !
Tout ceux qui ont un compte peuvent donc de nouveau recruncher dessus.
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 22 juillet 2009 à 22:55

Chez moi, le portable et mon 3400+ que j' :love: sont pleins comme des œufs. :D
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Meteore31 le 23 juillet 2009 à 09:50
les wus sont beaucoup plus courtes, 3 minutes au lieu de 30 minutes
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 24 juillet 2009 à 22:18
Ahrrgh ! dommage !  :rhaa:
On était super bien partis, à 5 jours de prendre la 2e place de Susa et 6 points FB  :priz2tet:

Regardez cette courbe, on dirait un raid  :miam:
(https://statseb.boinc-af.org/img/FB_DrugDiscovery_total.png)

A ce rythme la, on prend la place a Susa dans moins de 2 jours ! Une belle remonté !!
Par contre pour prendre la premiere place, va falloir attendre que les inscriptions ouvrent et que le projets soient plus stable (Bien que ca tourne bien en ce moment !!)
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: overclockman le 31 juillet 2009 à 16:01
j'ai des ut de plusieurs heurs c'est normal ?
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 31 juillet 2009 à 16:25
Oui moi aussi, les UTs sont bien plus longues ! Tant mieux, yaura plus le problemes des reports d'UTs en masse qui passent pas.
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 31 juillet 2009 à 20:21

Perso j'ai fermé les robinets :(... des centaines d'UTs en "Error while computing". :cry:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 31 juillet 2009 à 20:50
niarf niarf, ca me laisse prendre le large sur ce projet !

Sinon oui, tu as raison, le taux d'erreur sur ce lot est bien plus élevé que le précédent ! Mais ca avance !
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 31 juillet 2009 à 20:50
moi sur Ubuntu 64 ça se passe bien  :p
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 01 août 2009 à 23:47
Le site rencontre quelques problemes.
Probleme de base de données apparement..
Esperons que ca revienne vite !
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 01 août 2009 à 23:53
ouais, j'ai des UT à renvoyer moi  :cavachier:

mais bon, Jack est toujours très réactif  :p
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 02 août 2009 à 01:46

Vous avez tout pêté là! :D

mais bon, Jack est toujours très réactif  :p

Il a aussi beaucoup de taf avec Hydrogen. :/  :cpopossib:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 02 août 2009 à 11:14
Il doit etre maso ! A gerer 2 projets en meme temps !
Enfin comme ça, il se fait vite la main !
Mais ca doit etre du sacré boulot !
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 02 août 2009 à 11:27
Mais ca doit etre du sacré boulot !

Ça ne fait que 2 projets en vrac :D... chez moi j'ai + de 400 UTs que j'ai abandonnées qui me pollue (visuellement :o) le BM et que je ne peux pas renvoyer. :cpopossib:  :(
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 02 août 2009 à 11:33
Dans les prochaines versions de boinc, il va falloir mettre un filtre pour cacher les UTs qu'on ne veut plus voir  :siflotte:

Bon sinon, j'ai regardé sur le fofo d'hydrogen, et il n'y a rien au sujet de la panne de DD.


Al, fait gaffe si tu jettes tes UTs ! Je vais te rattraper d'autant plus vite  :smak:
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 02 août 2009 à 11:41
Al, fait gaffe si tu jettes tes UTs ! Je vais te rattraper d'autant plus vite  :smak:

Pas grave!... je ne donne du temps CPU qu'aux projets qui tiennent un minimum la route... pédaler dans le vide n'est pas un fin en soi et ceci je le fais assez dans la vraie vie... :siflotte:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 06 août 2009 à 06:55
Une bonne nouvelle le site est reviendu... et une pas bonne
Citer
All right, the database went down and somewhere in the process it ate a lot of user accounts. We are very sorry about this, Jack is doing his best in what spare time he has got to fix this problem, but since he has to do it all by hand this is extremely slow work.

So what can you do to help out? Email Jack (http://mailhide.recaptcha.net/d?k=01Vz4AMaHwT5Q13uBwcUFc5Q==&c=0h8l5RwxqofbNeI53hcn1phoVyR7jXfNM6zlSsB6geE=) with the email address you used to sign up with or tell him which email address you used.

When you can remember any of this, add as much information about your account as you can give, such as nick name, account ID number; or if you have it, the account key.

In the mean time, please be patient. Sometimes hardware/software is finicky and just crashes.

Depending on the state of the database we cannot guarantee that everyone can get their account back.
You will have lost your post count and very probably your credit. We're sorry about that.

The DrugDiscovery@Home Team,

Andrey
Jack
Jord
il faut envoyer à Jack le + d'informations possible sur nos comptes (Pseudo, ID du Compte et la Clé du Compte) pour espérer les récupérer.

P*tain, y connaît pas les sauvegardes. :cpopossib:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: fr@ntz le 06 août 2009 à 08:50
merci Al, message envoyé
1 point de moins à la note du projet par mon agence de cotation personnelle : pas très sérieux cette absence de sauvegarde  :rhaa:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 06 août 2009 à 22:22
Ouch... c'est pareil pour moi...plus de compte...Snif..
Bon c'est du alpha.... mais quand meme...C'est bien dommage.
On va voir ce que Jack va faire...
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 06 août 2009 à 22:25
idem  :cpopossib:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 06 août 2009 à 22:32
J'ai envoyé un mail à Jack aussi.
Pour avoir votre account key, il me semble qu'il se trouve dans votre fichier account_boinc.drugdriscovery se trouvant dans votre rep de BOINC.

Bien dommage ca....
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 06 août 2009 à 22:59

Il peut nous rétablir nos crédits car j'ai trouvé dans le dossier BOINC le fichier les contenant "statistics_boinc.drugdiscoveryathome.com.xml".

Dans le Compte BAM! (si vous en avez un!) on peut y trouver tous les accound ID de nos bécanes.

J'espère qu'avec toussa il va pouvoir réparer son erreur. :cavachier:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 06 août 2009 à 23:03
Je lui ai demandé des infos si on pouvait faire des trucs, j'attend ca réponse. Je vais peut etre poster sur le fofo tiens !
Ouai c'est bien dommage qu'il n'ai pas fait plus de sauvegarde de secours....
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 06 août 2009 à 23:07

Dans ton post peux-tu émettre ce que j'écris dans mon précédent message pour voir si d'après lui ça ressemble à une solution. :jap:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 06 août 2009 à 23:11
Je l'aurai bien fait, mais le site est devenu inaccessible... Je retente demain en postant tes infos !
Merci !
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 06 août 2009 à 23:25

P*tain! Il a des machines en carton! :pt1cable:

Merci Dudu. ;)

Message fusionné: 07 août 2009 à 06:43

C'est remoi! :p... bon j'ai presque toufo :desole:
Citer
In your BOINC Data directory you can look in these files:
- the account_boinc.drugdiscoveryathome.com.xml file will contain your account key (authenticator key). You can send that along to Jack.
- the client_state.xml file will contain your user name and hostID for the computer you're attached to DD with.

Do NOT change anything in these files. When asked if you want to save the file, click No.

et un bonne nouvelle
Citer
We got one of the last stats.xml files from Willy over at BOINCStats. With thanks for that. This contains some more data that can help reconstruct people's accounts.

Bonne journée à tous.
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 07 août 2009 à 15:22
Je viens de lire ca. Donc les points ne sont pas perdu. Parcontre, les user oui ! Donc il faut impérativement envoyé un mail à Jack pour son compte !

Sinon, des sauvegarde de la base de données ont bien été faite, mais elles ont été corrompus elles aussi. Il aurait fallu faire une sauvegarde totale qui aurait necessité l'arret de tout systeme (Forum, upload, ...), comme le fait Seti en partie.
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: tibidao le 07 août 2009 à 19:57
Je viens de lire ca. Donc les points ne sont pas perdu. Parcontre, les user oui !

OK, donc si tu envoies un mail à Jack, tu peux lui dire que le compte qui a le plus de points c'est le mien ?  :biglol: :marcp:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 07 août 2009 à 22:49
Hahaha !
Je suis pas sur que ca va marcher..... :lol:

En tout cas j'ai recup mon compte et mes points !
Mais j'ai toujours mon cache d'UT DD en attente de validation. Je vais demander quoi en faire !
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 07 août 2009 à 22:57
En tout cas j'ai recup mon compte et mes points !
pas moi  :/
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 07 août 2009 à 23:03
Tu lui a envoyé tes infos ?
Quand ?
Faut peut etre lui laisser le temps d'effectuer les choses...
Plus ya d'info et plus ca sera rapide.
Titre: Re : Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: fr@ntz le 07 août 2009 à 23:35
pas moi  :/
moi non plus, pourtant je lui ai donné cpid, id , pseudo, adresse mél etc... :cry:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 07 août 2009 à 23:42
je lui ais donné mon email, pseudo, cpid, lien stats boincstats  :spamafote:

mais je ne veux pas le harceler non plus, ça lui fait encore plus de boulot tout ça  :cpopossib:
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 08 août 2009 à 01:01
Mais j'ai toujours mon cache d'UT DD en attente de validation. Je vais demander quoi en faire !

Chez moi je les avais toutes balancées mais au taf j'en ai ~300 qui poireautent. :/
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 08 août 2009 à 12:14
Alors, il faut garder les UTs qu'on a deja calculé, ca sera ca en moins à recalculer et l'admin donnera les points meme si c'est hors délai.
Donc je garde tout ! :lol:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 08 août 2009 à 12:29
moi aussi j'en ai 8 qui attendent de repartir, je les garde au cas ou... mais faudrait déjà récupérer mon compte  :/

Message fusionné: 08 août 2009 à 15:46
un grand merci à Jack qui vient de me rétablir mon compte en direct live  :lestat:

Message fusionné: 08 août 2009 à 20:04
cool mes UT sont enfin reparties  :D
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: overclockman le 08 août 2009 à 21:04
Perso, j'ai un paquet d'ut qui on passé la ménopause et qui parte pas ? quelqun les veux ? j'avais pas envi de les cruncher de toute façon...
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 08 août 2009 à 22:34
Perso, j'ai un paquet d'ut qui on passé la ménopause et qui parte pas ? quelqun les veux ? j'avais pas envi de les cruncher de toute façon...

Impossible de les refiler car la date de péremption est comme qui dirait dépassée. :D
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: overclockman le 09 août 2009 à 15:47
Je voulais vous les donner avant, mais j'était pas cher moi. tenpis...
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 09 août 2009 à 16:31
elles reviendront dans le circuit... une fois que tout remarchera correctement  :jap:

quoi que, tout est au vert (http://drugdiscoveryathome.com/?q=node/30), reste plus qu'à rebalancer du boulot  :hyperbon:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 09 août 2009 à 19:31
moi on me dit que ma clé est pas bonne...
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 09 août 2009 à 19:43

boris lis les messages qui précèdent tu y trouveras la marche à suivre pour récupérer ton Compte.
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 09 août 2009 à 23:04
quelqu'un à le mai lde jack  pour que je puisses récupérer mon compte, merci !
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Meteore31 le 10 août 2009 à 07:56
j'ai récupéré mon compte mais pas mes crédits...
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 10 août 2009 à 08:51
quelqu'un à le mai lde jack  pour que je puisses récupérer mon compte, merci !

http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2316.msg195033.html#msg195033 (http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2316.msg195033.html#msg195033). :electric:
Titre: Re : Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 10 août 2009 à 12:26
quelqu'un à le mai lde jack  pour que je puisses récupérer mon compte, merci !
http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2316.msg195033.html#msg195033 (http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2316.msg195033.html#msg195033). :electric:

je dirais même plus  :cpopossib:
http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2316.msg194539.html#msg194539

une page en arrière, c'est quand même pas la mer à boire  :jap:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 10 août 2009 à 19:32
C'est quand même un sacré bordel depuis le "pétage" de la base :cpopossib:... pour la petite histoire hier j'ai tenté +sieurs fois d'ouvrir la page de mon Compte, j'ai tapé mon Pseudo et mon MdP une page s'ouvre
Citer
Password incorrect

The password you entered is incorrect. Please try again.
dans la soirée j'ai cliqué sur forgot password? (merci Dudu ;)) sur la page qui s'ouvre j'ai copié ma clé de Compte et là cool me v'la rendu sur mon Compte.
Je décide d'y mettre mon MdP habituel, le lien de ma page Web, je rejoins L'AF et je me casse. Ce matin au taf je tente d'y revenir mais toujours impossible avec mon MdP je remets donc le validator et une fois sur la page de mon Compte bin les infos mises la veille ont disparu. :pt1cable:

Je me demande comment je vais pouvoir écrire (en anglais... œuf corse, comme dirait Jerome :D) ça à le Jack. :rhaa:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 10 août 2009 à 19:41
bah j'avais eu le même problème: je me suis connecté avec mon validator, puis j'ai "changé" mon mot de passe, ou en fait j'ai remis exactement le même, et ça a marché.

par contre, entre hier et aujourd'hui il a récupéré des infos, comme par exemple la date d'ancienneté sur le projet.
il est donc fort probable que les modifications que tu as faites hier ont été perdues, du fait d'une re-récupération des comptes et informations attenantes.

moi j'ai du reparamétrer tout mon compte: préférences projet, préférences boinc, préférences de communauté, etc...

mais aujourd'hui tout semble fonctionner  :jap:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 10 août 2009 à 20:16
J'ai remis les infos et là je viens de cliquer sur Créer Profil et sur la page qui s'ouvre bin tout est rempli avec les bonnes infos :??:  :pt1cable: donc clic sur le bouton Création/édition du profil page suivante
Citer
Profil sauvegardé

Félicitations ! Votre profil a été créé avec succès dans notre base de données.
je clique sur le lien Voir votre profil et je vous le donne Émile
Citer
Unable to handle request

This user has no profile
rien ne se passe après +sieurs F5. :o

P*tain je fatigue là! :priz2tet:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 10 août 2009 à 20:22
je viens de revérifier mon compte à tout hasard...

mon profil, il ne me propose que 'créer", mais quand je clique dessus tout est bon, y compris mon avatar  :D

j'ai vérifié également les préférences de calcul/boinc/drugdiscovery, et tout ce que j'ai rempli hier soir est encore là  :p

essaye de recontacter Jack, moi j'ai réussi à le choper en live samedi, et du coup on a tout fait par mail en même pas 15 minutes  :hap:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 10 août 2009 à 20:33

Pascal ton Profil est absent http://boinc.drugdiscoveryathome.com/team_members.php?teamid=7&offset=0&sort_by=total_credit (http://boinc.drugdiscoveryathome.com/team_members.php?teamid=7&offset=0&sort_by=total_credit)... t'es plus chez les De La Science. :??:

J'aime bien aussi Damien qui est le seul chez les rescapés de L'AF à avoir du Crédit moyen. :D
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 10 août 2009 à 20:45
Pascal ton Profil est absent http://boinc.drugdiscoveryathome.com/team_members.php?teamid=7&offset=0&sort_by=total_credit (http://boinc.drugdiscoveryathome.com/team_members.php?teamid=7&offset=0&sort_by=total_credit)
ouais, le profil c'est bizarre parce qu'il y est, quand je clique sur créer il affiche mon profil avec mes citations et mon avatar, mais il fait conne si je n'avais pas de profil  :cpopossib:

Citer
t'es plus chez les De La Science. :??:
heu oui, non, c'est normal  :jap:

Citer
J'aime bien aussi Damien qui est le seul chez les rescapés de L'AF à avoir du Crédit moyen. :D
pourtant de mémoire, hier soir j'avais mes crédits moyens  :heink:

mais bon, mon compte est là, avec mes crédits, c'est le principal, et pis je sais que Jack bosse dur, il fait même de l'humour en franglais  :D

Citation de: Pascal94
hum... Jack, I can't log with my email adress:

"No account with email address xxxxxxxxxx@xxxxxxx.fr exists. Please try again."

Citation de: Jack
c'est dommage, I put it in now.
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 10 août 2009 à 20:50
Si tu as toujours des problemes Al, demain, je peux poster pour toi si tu veux.
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 10 août 2009 à 22:37
Si tu as toujours des problemes Al, demain, je peux poster pour toi si tu veux.

Je viens d'essayer à l'instant de me loguer et ça a fonctionné impeccable... demain je refais un essai, je te tiens au courant. ;)
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Meteore31 le 11 août 2009 à 11:07
par contre j'arrive pas à choper de nouvelles wus, elles partent direct en erreur de téléchargement...
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 11 août 2009 à 20:38

Je viens d'en charger 14 sous Linux et 9 sous Vi$ta et tout c'est bien passé. :spamafote:
L'accès à mon Compte est maintenant tout à fait opérationnel. :biglol:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 11 août 2009 à 20:45
Moi aussi ca marche impec !
On est reparti !
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Meteore31 le 11 août 2009 à 21:52
oui ça roule
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 11 août 2009 à 21:54
yes !!!
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: fr@ntz le 11 août 2009 à 23:39
bin non, moi j'ai toujours pas mon compte  :cry:

12/08/2009 00:10:54   DrugDiscovery   Message from server: Can't find host record
12/08/2009 00:10:54   DrugDiscovery   Message from server: Invalid or missing account key.  Detach and reattach to this project to fix this.

J'ai essayé le detach/reattach J'ai perdu les près de 200 UT calculées de cette machine pour rien. J'attends encore ... :(
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 12 août 2009 à 00:26

Fais pas la gueule frantz :cpopossib:... perso j'en ai perdu 300 dont 240 avec une durée de calcul entre 30 et 45mn sur un E8400 @ 3.00GHz. :rhaa:

Autrement j'ai fini ma 1ère UT sur mon 3400+ sous Linux... et bin c'est 1h de calcul.
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 12 août 2009 à 06:49
Frantz, tu n'arrives pas à te logger sur ton compte ? Tu as envoyé les info qui faut à Jack ?
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 12 août 2009 à 12:12

Un complément d'information à mon précédent message... il y a aussi des UTs très courtes. :p
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Netrider le 17 août 2009 à 15:57
J'ai eut aussi un probleme de logg sur mon compte, ce que j'ai fait sur le site DDH mon compte j'ai remodifier mon mot de passe et c'est repartis mon kiki  :ange:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 18 août 2009 à 21:10
 :bounce: Ayé nos crédits sont enfin pris en compte par les sites de stats. :hyperbon:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Netrider le 23 août 2009 à 07:29
Bonjour  :jap:

j'ai recu un mp du moderateur du forum de DDH qui dit ceci :

i was wondering if you could ask those who are already volunteers from af to come back for some more wu's, so that we can knock these wu's out... i'm not seeing but a hand-full of volunteers...

Si je traduit bien il demande aux anciens volontaires de tenter de revenir sur le projet afin de finir la vague de wu en cours, entre temps il y a eut un détachement de mauvaises wu qui nous ont fait perdre tout notre pending ( 40 000 en ce qui me concerne )  :cry: mais la ca va mieux, de plus jack semble plancher sur les optis Cuda et Ati.

Merci

Edit > on est a 2 000 points d'écart pour la premiere place  :D
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: la frite le 23 août 2009 à 10:44
OK doc' dès que j'ai fini mon cache je me concentre sur ce projet, on va lui montrer qu'il peut compter sur l'AF pour démonter ses réserves (et son serveur? :P)
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 23 août 2009 à 10:46
je suis toujours dessus  :jap:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: popolito le 23 août 2009 à 10:47
Quelqu'un est allé demander sur le forum ce qu'il en est des résultats, qui est derrière ce projet, etc ?
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 23 août 2009 à 12:29
 (http://moe.mabul.org/up/moe/2009/05/14/img-1105374fn89.gif) Netrider... tu es UotD sur DD@H. ;)
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: la frite le 23 août 2009 à 13:00
A popolito: l'admin est le même que pr le projet hydrogen@home, pour ce qui est des résultats j'ai trouvé ce post qui traite du caractère lucratif ou non de son projet et de sa vision des choses sur la recherche de nouveaux médicaments:
http://boinc.drugdiscoveryathome.com/forum_thread.php?id=72

Bravo Netrider!! :)
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: popolito le 23 août 2009 à 13:05
Ah, merci, j'avais cherché tout sauf dans la partie café... Ca m'apprendra !
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Netrider le 23 août 2009 à 13:20
Server disk full, le disque est raz la tronche, ils ont desoin de 1 TO  :siflotte:

Merci Al@on et lafrite  :jap:
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 23 août 2009 à 15:37
il demande aux anciens volontaires de tenter de revenir sur le projet afin de finir la vague de wu en cours, entre temps il y a eut un détachement de mauvaises wu qui nous ont fait perdre tout notre pending ( 40 000 en ce qui me concerne )  :cry:

Je n'avais pas fait gaffe mais j'ai perdu +sieurs 10zaines d'heures de cacul :cry:... Il est bien sympa le Jack de demander aux anciens volontaires de revenir mais il devrait quand même faire en sorte que ceux qui ont fait la démarche (+tôt laborieuse :/) de se réinscrire ne partent pas. :pt1cable:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 23 août 2009 à 18:07
j'ai 15 UT qui veulent rentrer à la maison, et elles ne peuvent pas:

Citer
dim. 23 août 2009 18:04:41 CEST   DrugDiscovery   Reporting 15 completed tasks, requesting new tasks
dim. 23 août 2009 18:04:46 CEST   DrugDiscovery   Scheduler request completed: got 0 new tasks
dim. 23 août 2009 18:04:46 CEST   DrugDiscovery   Message from server: Project is temporarily shut down for maintenance

 :priz2tet:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Netrider le 23 août 2009 à 18:16
http://drugdiscoveryathome.com/?q=node/30
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 23 août 2009 à 18:35

En milieu d'après-midi c'est tout le site qui était en vrac... Pascal j'espère qu'il t'en reste à cruncher.

Bonne nouvelle, je n'ai aucune P10 qui parte en erreur. :hyperbon:

C'est maintenant au tour de Nabz d'être UotD... m'en va mettre à jour mon Profil moi! :p
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: nabz le 23 août 2009 à 19:48
A mon avis, c'est le projet qui a voté pour moi.
Une sorte de remerciement pour les centaines d'heures CPU passées par la fenêtre :/.

Mais bon, un UOTD ça fait toujours plaisir :sun: et ça se fête :cetaboir:.
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 23 août 2009 à 19:52

Comment vous avez fait pour créer votre Profil :??: car sur mon Compte je n'y arrive pas. :(
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: nabz le 23 août 2009 à 20:03
La création d'un profil se passe normalement, ensuite par contre tu ne peux pas l'afficher, y'a un bug.
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 23 août 2009 à 20:14

La création d'un profil se passe normalement, ensuite par contre tu ne peux pas l'afficher, y'a un bug.

Wouais! On a juste droit à ce message
Citer
Unable to handle request

This user has no profile

 :pt1cable:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Damien le 23 août 2009 à 20:15
Comment vous avez fait pour créer votre Profil :??: car sur mon Compte je n'y arrive pas. :(

Cher :D ami (http://boinc.drugdiscoveryathome.com/show_user.php?userid=710) il n'y a pas longtemps que la création de profile ne doit plus fonctionner. Des fois quand je ne parviens pas à créer mon profile sur un nouveau projet BOINC, je réessaye, mais sans mettre d'avatar/photo et alors ça marche plus facilement, mais je ne sais pas si c'est également vrai pour Drug.
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 23 août 2009 à 20:20
Cher :D ami (http://boinc.drugdiscoveryathome.com/show_user.php?userid=271) Damien... tu es quand même le seul membre de L'AF à pouvoir l'afficher... maintenant te reste plus qu'à calculer. :siflotte:
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Damien le 23 août 2009 à 20:29
Cher :D ami (http://boinc.drugdiscoveryathome.com/show_user.php?userid=271) Damien... tu es quand même le seul membre de L'AF à pouvoir l'afficher... maintenant te reste plus qu'à calculer. :siflotte:

Merci pour ta précision, j'ai donc bien fait de te répondre sans avoir risqué de supprimer mon profile avant de vainement tenter de le recréer sans image. Je ne calculerai plus trop sur ce projet qui ne m'inspire pas assez confiance.
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 23 août 2009 à 20:34

Damien as-tu d'autres infos sur ce projet que celles-là http://boinc.drugdiscoveryathome.com/forum_thread.php?id=72 (http://boinc.drugdiscoveryathome.com/forum_thread.php?id=72), car comme explication je trouve ça un peu léger. :/
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Damien le 23 août 2009 à 20:40
Damien as-tu d'autres infos sur ce projet que celles-là http://boinc.drugdiscoveryathome.com/forum_thread.php?id=72 (http://boinc.drugdiscoveryathome.com/forum_thread.php?id=72),
:rtfm:
 
car comme explication je trouve ça un peu léger. :/
:plusun:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 23 août 2009 à 20:57

J'ai envie de poster ce message sur le Forum de DD@H
Citer
Jack can you explain us the real goal of this project or if that already were can fact where one find these explanations?
Will the results obtained be put at the knowledge of the public?

Est-ce assez compréhensible et ne faut-il pas étoffer un peu... je suis très nul in english :(, j'utilise donc SYSTRANet (http://www.systran.fr/) pour m'aider. :desole:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 23 août 2009 à 22:24
hummm, ça sent la traduction mot-à-mot ça  :D

mais Jack à de l'humour, il fait pareil en Français  :D
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 23 août 2009 à 22:43

Bin je vais plutôt attendre qu'un + doué que moi en anglais demande à Jack des infos précisant la nature de son projet et si les résultats obtenus seront publiés. :spamafote:
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: fr@ntz le 24 août 2009 à 12:29
Frantz, tu n'arrives pas à te logger sur ton compte ? Tu as envoyé les info qui faut à Jack ?

 :( Nan, toujours pas...

J'avais envoyé un mél direct à Jack avec toutes les infos
Je vais le relancer

Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 25 août 2009 à 20:51
flûte, y'a plus de boulot  :D

on a tout mangé  :hyperbon:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: la frite le 25 août 2009 à 21:52
Euh non je penche plus pour un nouveau problème moi...on a pas pu bouffé 50 000 unités en 5 heures (en début d'aprem il en restait pratiquement ce chiffre en unsent :D), d'ailleurs la preuve que tout a merdé c'est que dans "my account" j'ai d'une perdu tout mon pending, et de deux je vois plus d'unités dans "tasks" alors que dans mon manager y en une cinquantaine en cours :D oups ça sent le roussi tout ça
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 25 août 2009 à 21:58
Citer
User Of The Day

for 25 August 2009: [AF>Occitania] Meteore31

 :cetaboir:

Message fusionné: 25 août 2009 à 22:01
[...]dans "my account" j'ai d'une perdu tout mon pending, et de deux je vois plus d'unités dans "tasks" alors que dans mon manager y en une cinquantaine en cours :D oups ça sent le roussi tout ça

Citer
accessing information, i've sent jack a pm to ask what's up. he did state to me that were now doing once a day db back-ups.

jack made a little mistake, ok not so little but he's trying to correct the problem.

 :warf:

A suivre: http://boinc.drugdiscoveryathome.com/forum_thread.php?id=110&nowrap=true#1069

Message fusionné: 25 août 2009 à 22:06
Citer
mar. 25 août 2009 21:57:40 CEST   DrugDiscovery   Requesting new tasks
mar. 25 août 2009 21:57:50 CEST   DrugDiscovery   Scheduler request completed: got 2 new tasks
mar. 25 août 2009 21:57:52 CEST   DrugDiscovery   Started download of nodelete_23931_ChemDiv_0388-0162.7z
mar. 25 août 2009 21:57:52 CEST   DrugDiscovery   Started download of fzd8min_renum_SS.pdb
mar. 25 août 2009 21:57:55 CEST   DrugDiscovery   Finished download of nodelete_23931_ChemDiv_0388-0162.7z
mar. 25 août 2009 21:57:55 CEST   DrugDiscovery   Started download of P10_TYR52_LEU33_GLN56_ga10.txt
mar. 25 août 2009 21:57:58 CEST   DrugDiscovery   Finished download of P10_TYR52_LEU33_GLN56_ga10.txt
mar. 25 août 2009 21:57:58 CEST   DrugDiscovery   Started download of nodelete_23895_ChemDiv_6216-0172.7z
mar. 25 août 2009 21:58:01 CEST   DrugDiscovery   Finished download of fzd8min_renum_SS.pdb
mar. 25 août 2009 21:58:01 CEST   DrugDiscovery   Finished download of nodelete_23895_ChemDiv_6216-0172.7z
c'est normal que ces UT s'appellent nodelete ?  :pt1cable:
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 25 août 2009 à 22:22
... c'est normal que ces UT s'appellent nodelete ?  :pt1cable:

C'est pour rappeler à Jack que ces UT là il ne doit pas les effacer. :siflotte:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 25 août 2009 à 22:24
je me suis dit la même chose  :D
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Netrider le 29 août 2009 à 19:12
Ca refonctionne, mais pour combien de temps la est la question  :(
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 29 août 2009 à 19:39
le temps que je prenne tout  :D

 :marcp:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Netrider le 29 août 2009 à 19:48
Comme j'avait fait au dernier coup, et j'ai perdu 72 000 de credits  :gno:

Du coup je leve le pieds, ou plutot les procos  :cavapobienmwa:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 29 août 2009 à 20:01
on s'en fout des points  :o    :D
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 29 août 2009 à 22:18
on s'en fout des points  :o    :D

On peut se foutre des points mais pas de l'énergie dépenser pour rien :spamafote:... pour ma part je suis parti vers d'autres aventures et je reviendrai sur ce projet quand Jack aura su le mettre définitevement au point.
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 29 août 2009 à 22:42
le fait de perdre des points c'est pas grave... tant qu'on ne perd pas le travail déjà effectué...  :jap:
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 29 août 2009 à 22:49
... tant qu'on ne perd pas le travail déjà effectué...  :jap:

Bin justement, + de 300 UT finies de perdues lors du grand crash et la semaine dernière +sieurs 10aines d'UT en pending jetées à la poubelle... toussa additionné représente +sieurs jour de crunch pour rien. :(
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 29 août 2009 à 23:16
raaahhh flûte, j'avais pas compris ça comme ça...  :/
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: xipehuz le 02 septembre 2009 à 23:07
Tiens, je viens de perdre les quelques malheureux points que j'avais fait  :/

Apparement, d'après leur forum, une erreur humaine  :spown: est à l'origine d'un nouveau crash de la BDD des users et ils n'ont pu restaurer que le Backup de vendredi dernier.

Je sais que c'est un projet alpha, mais avant de réclamer de nouveaux volontaires en première page de leur site, ils feraient mieux d'améliorer leur gestion des backups car sinon on va finir par se lasser  :jeanphi:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 02 septembre 2009 à 23:17
moi aussi, j'ai vu que ma courbe de crédits avait descendu  :priz2tet:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: tibidao le 02 septembre 2009 à 23:19
J'ai eu raison de ne pas essayer tout de suite de créer un compte alors;..  :siflotte:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Netrider le 03 septembre 2009 à 11:00
Ouaip c'est pas encore au poin ( T ) ( G )  :cpopossib: Le projet
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: xipehuz le 06 septembre 2009 à 22:35
Bon, ben je viens de passer en NNW car je ne reçois plus que des UT cuda qui partent toutes en erreur (chez moi et aussi chez les autres qui crunchent les mêmes UT sous Linux).

On reprendra dans quelques jours pour voir si ça change.
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Netrider le 08 septembre 2009 à 17:28
Ca y est je vient de recevoir mes premieres Wu Cuda sous win, a voir pour les résultats... :hyperbon:

Edit > Plantage sur toute la ligne  :cry:

Sinon ils ont balancé des wu linux et ca a bien fonctionné  :love:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Netrider le 05 octobre 2009 à 15:47
Plus de taf depuis 3 jours  :cry:

Oui je sait on est tellement nombreux a cruncher dessus que ce topic va dépasser celui de Milky  :lol:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 10 octobre 2009 à 09:51
Les admins/Scientifiques de DD commencent à discuter du statut de l'organisation du projet.
Organisation commercial (Avantage des partenaires, facilité à faire, plus de flexibilité,...) ou non commercial (Accès à des bourses de recherche, plus de transparence,...)
Bien entendu j'ai donné mon avis sur leur site pour les intêret de la science et de l'AF.
J'ai donc indiqué que le projet peut etre une organisation à but commercial (Il est naturel de vouloir tirer profit de tout ce travail) mais à condition que les resultats soient publiés et "libre" donc. Apres l'organisation peut sortir un produit basé sur ces recherches et mettre un brevet sur ce produit.

Mais j'ai également indiqué qu'une entité à but non commercial reste tout de même plus transparente.

Je vais suivre de près le forum. Je vous tiens informé !

http://boinc.drugdiscoveryathome.com/forum_thread.php?id=143
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Netrider le 10 octobre 2009 à 11:20
Bien ca   :sun: j'avait meme pas vu ce topic du projet, c'est un peut dur pour nous de faire le tri dans la langue de Schark spire  :lol: Merci Dudu
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 10 octobre 2009 à 12:16

Merci Dudu de suivre l'affaire. ;)
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 13 octobre 2009 à 14:45
Alors comme convenu, je vous tiens informé :
Ralalala  :cpopossib:
Les admins du project viennent d'envisager non plus de devenir une entité à but non lucratif ou à but lucratif, mais peut etre de céder le projet à une société et seulement d'apporter leur support.
Ce qui, de ce fait, rendra le project à but commercial. Puisque la dite société apposera surement un brevet sur les resultats...(On voit mal une société pharmaceutique faire du "non commercial")

Cela gène donc grandement les admins et surtout nous, la communauté j'imagine.
J'ai donc indiqué mon avis (Que ca nuiera au projet, qu'il sera en non recommandé, etc...)

La partie difficile de ce problème réside sur le fait qu'il ne s'agit pas d'un projet "académique", "fondamental" comme SIMAP, Folding, etc... qui eux apportent une solide base à la science pour découvrir des nouveaux remèdes. Ce projet ci, comme son nom l'indique, a pour but de trouver des nouveaux remèdes directement. De ce fait, publier les resultats me semblent peu utile car une entreprise aura vite de les reprendre et directement de mettre un brevet dessus.

Dans ce cas, il faudrait publier les resultats dit "fondamentaux" (Qui peuvent servir comme base)...Mais ca restera tres arbitraire...

J'espere qu'ils vont trouvé une solution qui convient à tous...
Si vous avez des idées/avis, n'hesitez pas. (Ils ont l'air en pleine réfléction)
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] nico8313 le 13 octobre 2009 à 15:10
Ah zut ! j'aime bien ce projet !

J'espère aussi qu'ils trouveront une solution  :/
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: RLDF le 13 octobre 2009 à 17:41
un projet ou la base dégage tous les mois et ils veulent vendre, lol  :siflotte:
depuis que tout a scratché, je n'y suis pas retourné et ce projet m'attire de moins en moins surtout avec ce genre de nouvelles  :coffeetime:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Netrider le 13 octobre 2009 à 18:34
Bon bein j'arrete aussi.... :eek:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 13 octobre 2009 à 19:13
Je pense que c'est en effectuant des erreurs qu'on/qu'ils apprennent.. Deplus le projet est en alpha, etc...
Mais comme tu le dis RLDF, à cause de son instabilité, il n'attire pas encore foule... Et vu que maintenant ils parlent de ca....(L'admin Jack n'a rien dit encore... Seulement le responsable du projet)...C'est encore pire...

J'avais coupé les vannes sur ce projet à cause de WEP. Mais je ne vais pas y retourner tout de suite (Alors que j'aime beaucoup les admins et le projet en lui meme).
Mais si le projet devient commercial, je ne calculerai plus du tout dessus  :rhaa:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 13 octobre 2009 à 19:33
je suis dégouté de lire ça...

moi qui faisais confiance à Jack, je vais revoir mes positions  :cpopossib:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 13 octobre 2009 à 19:53
Je viens de lire la répoinse  Andrew Voronkov (le responsable) et la, j'aurai besoin également de votre opinion.

Citer
It's important to understand what do we want to do here. If we want to make new drugs we should follow some rules. Which rules are more strict? BOINC philosophy or FDA requirements? For any volunteer main reason to volunteer - is to understand that he makes the right thing for good purpose and for good scientific reasons. So if he would contribute to something real useful like making a new drug, this is a plus and real competitive advantage for the project. I place myself as volunteer - I see lots of projects. I do really care on human health and wellness and health related projects are most important for me. I want real output, you know, not lots of scientific papers published, but something which will really help people, like making a drug candidate which enters clinical or preclinical trials. But from other side I don't want to be source of easy money for someone else. So what is the solution? Disclosure, disclosure, disclosure! I want to see where are money going! If you make patent and sell it and invest money from it into development of freely available QSAR and in silico drug design methods and in elaboration of new drugs - I m ok with that.

And in our project the real goal - is to making new drugs and elaborate in silico drug design methods. We just have to follow some rules and we need money for project development, without money it will be really dead.
So we can make next steps:
1) Open financial policy
2) Project will be non-profit, I mean no profit in the end of each year - all money invested in development of in silico drug discovery and project development and new drug elaboration. Everything should be clear.
3) All new technologies, like GPU GROMACS and GPU Autodock, all new software modification, all new algorithms - wll be available for free for all types of organizations.
4) All results will be published (but some after making patents). Non profit organizations like research institutes still make patents. You just can't make a good new drug without it.
If volunteers understand why we want to make such a policy (and it should be approved by volunteers, we won't make a step without them) I'm sure this won't be competitive disadvantage to our project, but vice versa - competitive advantage as for project which really aims to make some real, applicable things.
PS all points 1-4 of course can be done by non-profit too, it also can have patents. So this is why I've started this thread. Main difference for us between non-profit and commercial organization is whether there will be some limitations on projects etc. So maybe we really can have non-profit for same steps and just work like research institute which elaborates new drugs.

Si il faut un traduction, je pourrai le faire plus tard. Mais je n'arriverai pas à transcrire correctement ses dires. Donc la version anglaise est plus que necessaire.
Ca sort un peu des habitudes des projets sous BOINC....
Je demande plus d'info.

Edit : Oui Pascal... je suis très décu de ca....Mais Jack n'a pas l'air de tenir les manettes cette fois ci....

Message fusionné: 13 octobre 2009 à 21:55
Bien entendu les choses ne sont pas figés.
Ils essayent tout de meme de rester "indépendant", mais ils auront besoin de beaucoup d'argent (Pour coder tout ce qu'il faut + des scientifiques) si ils ne choisissent pas d'etre une entité commercial.
Le responsable tient particulièrement à nos avis. Il fera un sondage/vote plus tard pour décider avec les volontaires.

En attendant on essaye de trouver des solutions viables.

Je leur est proposé en plus des bourses pour la recherche disponible (Mais qu'il faut avoir) de peut etre se faire aider par une université, par des partenaires, etc... Puisque c'est bien l'argent qui manque.
Ca serait dommage que le projet s'arrête ou qu'il devienne à but direct lucratif  :cavachier:

Message fusionné: 14 octobre 2009 à 11:27
Citer
Financial problem will be in both cases - in case of LLC and in case of non-profit. But in case of LLC we maybe will be more flexible with partnerships and collaborations, but the non-profit will look better for volunteers maybe, or maybe not so important (you decide), so this choice we want to base on discussions like this.
Everything we're doing we want to do together with our volunteers. If we are going to make some pharma company with great technologies and exceptional new drugs for cancer and several age-related diseases, then we'll do it only on the basis of support from big numbers of volunteers, which want to contribute to this goal.

(Ca sera donc avec nous ou sans ..... eux  :siflotte:)
Forcément ils veulent avoir le support d'un maximum de cruncheurs pour mener à bien leurs recherches. Ils vont surement faire un vote/demande d'opinion, en expliquant les avantages et les inconvénients, sur le statut à avoir
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 14 octobre 2009 à 19:00
Citer
DrugDiscovery@Home.com will be down while Jack moves the project to a new server.

Citer
The move to the IronScale server went without too many flaws, DrugDiscovery@Home.com is back.

ça c'est bien, par contre CA (http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2659.msg203420.html#msg203420) ça ne l'est pas du tout  :cavachier: :rhaa: :gun:

Message fusionné: 14 octobre 2009 à 20:29
User Of The Day

for 14 October 2009: [AF>WildWildWest] RLDF

 :D
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 15 octobre 2009 à 13:41
Bon, le statut possible de DrugDiscovery se précise.
Vu qu'il n'est pas possible de conjuger la découverte de médicaments sans entreprise commercial pour le distribuer (Sauf si le projet obtient une bourse géantissime, ce qui ne sera certainement pas le cas). Une solution afin que le projet ne tombe pas dans les mains d'entités commerciales peu scrupuleuse consisterais à :
Créer une organisation commercial du type LLC (un genre de SARL) ayant le projet DrugDiscovery comme projet non commercial (C'est donc le cas de WCG par exemple).
Il y aura la publication des comptes de cette dites LLC ainsi que des publications scientifiques (Tout ce qui est du fondamental le sera, et ce qui touche directement la découverte/fabrication d'un médicament, ne sera publié qu'apres la fin du brevet, brevet si il y a)... Ca ressemble un peu à Aqua alors il me semble...

Avant de breveté la découverte, le projet prendra en compte les opinions des membres (Libre d'accès, location du brevet, vente du brevet,...)

Le but même du projet à causé ce problème (Car il s'agit de concevoir un médicament et non pas une base de protèines ou de comprendre comme interagit des molécules, bien que cela rentrera en compte bien évidement, mais pas seulement). Donc ils leurs faut faire des essai en laboratoire également. Ce qui reviendra tres chère.

Si c'est cette solution qui est retenu, le projet n'aura donc pas vocation à un profit. Car avec BOINC ce n'est pas le manque de profit qui est le problème (C'est le problème des laboratoires & co) mais celui du manque de liquidité (Fond de roulement)
Il sera donc interessant pour le projet qu'une fois une découverte concrète de faite, publier les resultats du type fondamental (Interaction des protèines, etc...) puis breveté la découverte et vendre ce brevet à une entité commercial. Avec l'argent récolté, reinvestir dans le projet pour continuer, etc...

C'est peut etre une bonne idée de fonctionner ainsi. (Peut etre il y en a t'il des meilleurs encore...??!!).
Mais il est dommage que ce projet ne reste pas aussi..."simple d'esprit" qu'il ne l'était. Heureusement que la team de dev/admin ne changera pas trop quoi qu'il arrive et qu'ils resteront maitre du projet.

Qu'en pensez vous ? Est ce que ca vous semble une bonne idée...

Je n'ai pas encore répondu à son dernier message.
Je ne sais pas trop quoi en penser de son projet (A part que c'est mieux que le "tout commercial")

Ps: Merci Xipehuz pour ta participation sur leur forum  :hello:

Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: xipehuz le 15 octobre 2009 à 22:25
De rien.

Et merci à toi, Dudu, pour tous ces efforts d'explication de part et d'autre de ces deux forums.  :jap:

Tel que je le conçois, le concept de DD@Home se rapproche beaucoup de celui d'Aqua : On utilise Boinc pour modéliser différentes possibilités, on utilise ces résultats pour créer/améliorer un produit commercial (sous forme de brevets ou autre), puis on reverse les résultats à la communauté scientifique à travers des publications dans des revues scientifiques ou des bases de données de résultats.

De cette manière, ce n'est pas directement le fruit de nos calculs qui est vendu ou qui génère du profit, mais ceux-ci servent à la fois à créer un nouveau produit (ordinateur d'un côté, médicament de l'autre) qui sera vendu plus tard et sont également diffusés aux chercheurs, comme le font les projets universitaires.
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 15 octobre 2009 à 22:28
Je peux aussi que ca semble partir sur cette voie
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Netrider le 16 octobre 2009 à 06:32
C'est déja oune peut mieux  :ange:

Mais je me méfie des pharmaceutiques outre atlantique pour y avoir travaillé  :cdmalad:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: fr@ntz le 26 octobre 2009 à 00:06
Attention, les russes déferlent sur la première place de L'Alliance Francophone
https://statseb.boinc-af.org/simulation_FB.py?projet=9&points=5846&equipe=28&points=11899&equipe=11&duree=72
Surveillez les rétroviseurs et n'hésitez pas à appuyer sur la pédale de droite  :)

(https://statseb.boinc-af.org/img/FB_DrugDiscovery_total.png)
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 26 octobre 2009 à 19:33
Scheduled Down time for Drugdiscovery: Per Quantact (http://boinc.berkeley.edu/dev/forum_thread.php?id=3144)

Citer
We are scheduling a hard drive replacement for the failed drive on Monday Oct. 26th, at 10:00pm PST, this evening.

The host server will be down while the hard drive is replaced. The drive replacement should take approximately 15 minutes to complete, at which time all vm's on the host will be booted back up and returned to service.

Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: la frite le 28 octobre 2009 à 16:59
Pinaise vous venez aussi de voir tout votre pending se transformer en "completed, can't validate" ?  ----> O crédits :(

J'attends des explications de leur part! commence à me gonfler ce projet  :cavachier: :rhaa:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: popolito le 28 octobre 2009 à 17:06
D'un côté, il s'agit d'un projet alpha, il faut s'attendre à rencontrer des problèmes.  :cavapabiendantateute:
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 28 octobre 2009 à 23:18
D'un côté, il s'agit d'un projet alpha, il faut s'attendre à rencontrer des problèmes.  :cavapabiendantateute:

Wouais c'est sûr :o... pour ça que j'ai arrêté. :coffeetime:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: samuel debergh le 29 octobre 2009 à 23:21
vous confirmez que ce projet ne prend pas de nouveau compte? cordialement
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 30 octobre 2009 à 08:53
Il faut un code d'invitation pour pouvoir s'inscrire.
Il faut le demander à l'admin du projet (Jack)
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 30 octobre 2009 à 13:02
vous confirmez que ce projet ne prend pas de nouveau compte? cordialement
t'as oublié "Madame, Monsieur,", et aussi "Je vous prie d'agréer, Madame, Monsieur,"...

 :warf:


 :marcp:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: JeromeC le 30 octobre 2009 à 16:36
Nan je vous prie d'agréer on met plus ça de nos jours, moi je mets cordialement partout : mails, courriers. C'est parfait.
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 30 octobre 2009 à 21:57
Nan je vous prie d'agréer on met plus ça de nos jours, moi je mets cordialement partout : mails, courriers. C'est parfait.
moi aussi  :D
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: JeromeC le 31 octobre 2009 à 00:19
On me dit dans l'oreillette qu'il y aurait des exceptions... mmm, qu'en présence de l'avocat, toussa...
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: la frite le 07 novembre 2009 à 12:49
De nouveau des unités :)
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: samuel debergh le 09 novembre 2009 à 08:58
j'arrive pas à participer à ce projet j'ai pourtant envoyer un mail par msn , ça répond pas ???????? :blbl:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 09 novembre 2009 à 09:45
Tu as envoyé un email à Jack ?
Comment il est souvent en déplacement, il peut mettre un certain temps à répondre.

Mais bien qu'il y a encore des UT à calculer, ce projet à fortement ralenti depuis que l'organisation du projet est en discussion.
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: samuel debergh le 10 novembre 2009 à 12:12
ok merci dudumomo ,oui j'avais envoyé un mail à jack , sinon pour le pc portable

ça recommence à  déconner dure, plus d'affichage malgrès que hier ça remarché

jusqu'au re démarrage (installation de Antivir+ 2 logiciel antiviral):cry:! (a 1 h

prêt je failli le vendre pour carte mere hs à 75 euros ! ça faisais 3 mois que j'y

touchais plus vu qu'il n'allait plus)... il coute environ 450 euros actuellement, hp

dv pavillon 6120 eu , je le deconseille car il ya des problemes de fabrication!

:pt1cable: mais merci pour ta proposition d'aide avec teamviewer ça sera  pour

une prochaine fois! lol le temps que j'arrive à redemarrer l'affichage , il ya bien

1 bip long et 2 bip court ce qui veut dire pb de gpu mais hier comme je t'ai dis

le gpu allait bien, je penche donc pour un bios defectueux ( hp avait dit ça à

quelqu'un...) , A tous les coups on va recritiquer mon français aprés ce

message .
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 10 novembre 2009 à 12:20
Bien que ce n'est pas le bon topic, je te conseil tout de même de mettre à jour ton firmware.
Il me semble HP a un bon support et un tas d'application pour entretenir son PC.

Bon courage  :hello:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 10 novembre 2009 à 16:35
Message de   concernant le statut du projet :

Citer
We have concentrated mostly on the research now, the organizational question seems to be not so important as we thought in the begining. The most probable solution - project is non commercial anyway and if we'll need some organization for operations and collaborations then we'll make LLC at the begining as far as it s just cheaper and more easy to operate and if it would be required to volunteers then transfer it to non-profit. All main information disclosure will be provided anyway.

Donc ils se reconcentrent sur leur projet puisque la question de l'organisation du projet ne semble pas aussi importante qu'ils le pensaient au début. La solution la plus probable sera un projet non commercial. Et si vraiment ils ont besoin de finance/collaborations, ils feront une LLC étant donné que c'est ce qui a de moins chère et de moins difficile à effectuer. Et si les volontaires le demandent, le projet sera transférer en organisation à but non lucratif.
De toute façon, tous les documents/informations important, seront fournis.

Il semble donc que le projet soit devenu plus raisonable.
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: la frite le 10 novembre 2009 à 17:01
Une autre nouvelle intéressante:

Citer
We are preparing open beta test now. We are going to send messages about that to as much as possible of team leaders and distributed computing resources administrators. If you can provide us such a contacts of your team or your national web site, please send it to av@drugdiscoveryathome.com
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 10 novembre 2009 à 17:12
Oui en effet, je lui ai envoyé un email tout à l'heure, pour lui dire qu'il n'y a pas de leader dans l'AF et je lui ai transmis l'URL du site et forum, ainsi que le lien direct vers ce topic.
 :hello:
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes>Jip] Elgrande71 le 10 novembre 2009 à 17:41
Oui en effet, je lui ai envoyé un email tout à l'heure, pour lui dire qu'il n'y a pas de leader dans l'AF et je lui ai transmis l'URL du site et forum, ainsi que le lien direct vers ce topic.
 :hello:
Il n'y a pas de leaders dans l'AF ? Puisque c'est comme ça c'est moi le chef .  :D :D :siflotte: :marcp: :dialout:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 10 novembre 2009 à 18:09
Ah!!! ba voila ! On en a 1   :D
J'ai donc transmis ton adresse email  :jap:

 :siflotte:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: samuel debergh le 10 novembre 2009 à 21:30
je peux pas faire ma demande pour participer à ce projet à cette adresse? , ( on dirait pas)
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: JeromeC le 10 novembre 2009 à 23:44
On se calme le globe trotter, on se calme :lol:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 11 novembre 2009 à 11:05
Le scientifique en charge du projet souhaite prendre contact avec toutes les différentes équipes de la communauté BOINC.
Il aimerait donc pouvoir parler par email avec un admin.

Quelqu'un se dévoue ?
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 11 novembre 2009 à 14:45

Dudu pour moi tu es LA personne qui peut représenter L'AF, d'abord tu es inscrit au projet, tu es parfaitement bilingue et surtout tu commences à bien connaître Jack. ;)
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Hildor le 11 novembre 2009 à 15:05

+1
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 11 novembre 2009 à 15:52
+1000
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 11 novembre 2009 à 15:55
 :D Bon, je lui ai dit de me contacter quand il en aura besoin.
Ca sera surement à propos de leur beta

 :kookoo:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 11 novembre 2009 à 16:15

 :jap: Dudu. ;)
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Netrider le 11 novembre 2009 à 17:17
 :ange:   :smak:  :kookoo:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: la frite le 12 novembre 2009 à 20:50
Citer
We've taken the invite code off for the time being in preparation of the beta run..

let the team wars begin i guess... oh wait that is already in progress for some teams... :)

Il parle de nous peut être :D
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 12 novembre 2009 à 20:50
Oula, j'allais justement posté ca !
Plus vite que ton ombre la frite dis donc !

Inscription ouverte  :hello:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: tibidao le 12 novembre 2009 à 21:10
J'étais quelques site plus loin sur le net, quand j'ai senti l'odeur caractéristique du projet qui ouvre ses inscriptions. Me voilà donc....  :siflotte:

Bon, on va dire que je suis un noob : il y a des unités ? ça buggue pas trop ? combien de temps dure une unité , Il y a une application GPU, ou en projet ?
Il y a des unités en permanence ou c'est par saccades ?

Copies ramassées dans 24 heures....  :gniak:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 12 novembre 2009 à 21:29
Et bien il vont bientôt rentré en beta.
Les UTs tournent bien. Pas eu souvent de problème. Mais le projet a deja eu un crash de Base de données avec perte de tous les comptes, et dont l'admin a du les retrouver un à un.

Application CPU uniquement (Pour le moment.) Une version Cuda est en test, mais elle n'a pas eu de succès pour le moment.
Avantage aux Linux en terme de temps de calcul.
Unités en permanance.
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: fr@ntz le 12 novembre 2009 à 21:31
Mais le projet a deja eu un crash de Base de données avec perte de tous les comptes, et dont l'admin a du les retrouver un à un.
Il n'a jamais retrouvé le mien et j'ai perdu pas mal de temps dessus  :cry:
Je viens de me réinscrire.
Pas d'UT dispo pour l'instant
Titre: Re : Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 13 novembre 2009 à 14:49
Il n'a jamais retrouvé le mien et j'ai perdu pas mal de temps dessus  :cry:
Je viens de me réinscrire.

Très beau geste fr@ntz. :jap:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Hildor le 13 novembre 2009 à 18:41

inscrit également !
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: samuel debergh le 14 novembre 2009 à 10:51
tres content que ce projet à reouvert ces inscriptions ( je suis user of the day dessus aujourd'hui :coffeetime: :sun:)
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 14 novembre 2009 à 12:24
tres content que ce projet à reouvert ces inscriptions ( je suis user of the day dessus aujourd'hui :coffeetime: :sun:)
Bravo samuel mais tu radotes un peu :origin: http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,519.msg207623.html#msg207623 (http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,519.msg207623.html#msg207623), non? :D

Je ne risque pas d'être UotD car je n'ai toujours pas de Profil*, pour les épisodes précédents http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2316.msg195234.html#msg195234 (http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2316.msg195234.html#msg195234) et http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2316.msg196553.html#msg196553 (http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2316.msg196553.html#msg196553). :/

*Sur la page d'Accueil du projet (http://boinc.drugdiscoveryathome.com/) je clique sur Profiles (http://) dans cette nouvelle page je clique sur A (http://boinc.drugdiscoveryathome.com/user_profile/profile_A_1.html) et je n'en crois pas mes mirettes :eek: mais al@ON (woui c'est moi! :p) est bien là. :??:  :priz2tet:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: samuel debergh le 14 novembre 2009 à 12:39
non double postage voulu  :ange: gniak? :??:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 14 novembre 2009 à 12:59

samuel t'as reçu ma réponse à ton MP. :??:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: samuel debergh le 14 novembre 2009 à 13:23
oui jvais m'arranger avec tristesire pour avoir un compte chess!
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: tibidao le 15 novembre 2009 à 16:42
Donc, petit compte rendu du "novice".

Les unités sont téléchargées malgré un "no new tasks", les 3/4 partent en "computation error", et quand j'ai regardé mon ordi ce matin il me semblait avoir 25 points. là je rentre, je vois un beau... 0

j'ai mon compte, mais je me détache pour quelque temps là.  :D
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 15 novembre 2009 à 22:41
Vive la beta  :pt1cable:
Je ne m'y suis pas rattaché encore.
Je surveille un peu le projet et les tournures.
Mais une fois le coup de bourre passé niveau FB, je m'attelerai à ce projet je pense  :cavachier:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 15 novembre 2009 à 23:03

Perso, je vais attendre qu'il soit moins bêta. :siflotte:
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 16 novembre 2009 à 21:08
Mais une fois le coup de bourre passé niveau FB, je m'attelerai à ce projet je pense  :cavachier:
:plusun:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 18 novembre 2009 à 09:36
Les nouvelles unités mdrun ont un fort taux d'erreur comme certains ont pu le constater.
Ils planchent dessus.

Vu que 100% des unités sous Linux partent en erreurs, Jack à desactivé l'app pour Linux afin de se concentrer sous windows pour le moment.

Le problème de Linux, viendrait d'un problème de librairie. Il faut qu'ils lient l'app avec la librairie libstdc++
Jack avait testé mais en vain. Augustine va lui filer un coup de main.

Bon crunch
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 18 novembre 2009 à 22:51
merci pour les infos dudu  :jap:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 08 décembre 2009 à 14:17
Le projet fait appel à la communauté pour traduire la section "A propos"
Si des ames charitables veulent donner un coup de main, voici le texte :

Citer
About

DrugDiscovery@Home - distributed computing project which uses the power of personal computers distributed worldwide. The computing time is kindly provided by volunteers worldwide which want to make their impact into discovery of new drugs in the fields of stem cells biology for aging and cancer research.

Our primary research interest is the development of new therapies for aging and cancer by regulation of adult stem cells. Our project is powered by an online community of volunteers who donate their computing power to help model drug interactions. Anyone can participate in the project by registering and downloading software to automatically perform analysis.
One of the advantages of the project is a goal for translational research which we are going to manage from early drug discovery process to the latest stages of drug development. Multiple collaboration with drug discovery institutes and pharmaceutical companies are used to make such collaboration in making new drugs effective as much as possible.
Our project uses the BOINC softwer which you can download here. As basic applications we use virtual screening software, coupled to molecular dynamics software refinement. But our goal is to bring as much as possible in silico drug design software to our platform for effective drug discovery and small molecule properties prediction. These applications are used for refinement of 3D structures for offline modelled biotargets and in silico structure based drug design. Our project is non profit in terms that we don't share profits with project founders and information on any collaborations is disclosed as much as possible to volunteers.

Comme les traductions ne sont pas vraiment mon truc, si d'autres personnes veulent bien traduire ce texte, ca serait parfait  :D (Sinon, je ferai un effort hein  :o)
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Netrider le 08 décembre 2009 à 15:58
vais y mettre le nez des que je peut   :love:

Edit > je vient de regarder sur le site, en fait cela a déja été traduit et inséré, mais surement a cause d'un bug ca a disparu. donc a refaire  :/


trad

À propos de

DrugDiscovery @ Home - projet d'informatique distribué qui utilise la puissance des ordinateurs personnels répartis dans le monde. Le temps de calcul est aimablement fourni par les volontaires du monde entier qui veulent faire de leur impact dans la découverte de nouveaux médicaments dans les domaines de la biologie des cellules souches pour le vieillissement et la recherche contre le cancer.

Notre principal intérêt de recherche est le développement de nouvelles thérapies pour le vieillissement et le cancer par la régulation des cellules souches adultes. Notre projet est alimenté par une communauté en ligne de bénévoles qui font don de leur puissance de calcul pour faciliter les interactions des médicaments modèle. N'importe qui peut participer au projet par l'enregistrement et le téléchargement de logiciels pour effectuer automatiquement l'analyse.
Un des avantages du projet est un objectif pour la recherche translationnelle que nous allons gérer au début du processus de découverte de médicaments aux derniers stades de développement de médicaments. Multiples collaboration avec des instituts de découverte de médicaments et les compagnies pharmaceutiques sont utilisés pour faire une telle collaboration pour faire de nouveaux médicaments efficaces, autant que possible.
Notre projet utilise le softwer BOINC que vous pouvez télécharger ici. Comme les applications de base nous utilisons un logiciel de criblage virtuel, associée au raffinement de la dynamique moléculaire du logiciel. Mais notre objectif est de rapprocher autant que possible dans les logiciels de conception de médicaments in silico à notre plate-forme de découverte de médicaments efficaces et les petites propriétés molécule prédiction. Ces applications sont utilisées pour le perfectionnement des structures 3D pour biotargets offline modélisées et dans la structure in silico based drug design. Notre projet est à but non lucratif dans des termes que nous ne partageons pas les bénéfices avec les fondateurs du projet et des informations sur toutes les collaborations sont communiqués, autant que possible à des bénévoles.

Qui dit mieux ?  :??:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: JeromeC le 08 décembre 2009 à 23:43
Ça me paraît bien compréhensible !
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 17 décembre 2009 à 21:47
y'a du taf  :hyperbon:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 17 décembre 2009 à 21:50
Pour la trad, j'ai corrigé un peu, mais il reste encore des choses à corriger :

À propos de

DrugDiscovery @ Home - projet d'informatique distribué qui utilise la puissance des ordinateurs personnels répartis dans le monde. Le temps de calcul est aimablement fourni par les volontaires du monde entier qui veulent faire de leur impact dans la découverte de nouveaux médicaments dans les domaines de la biologie des cellules souches pour le vieillissement et la recherche contre le cancer.

Notre principal intérêt de recherche est le développement de nouvelles thérapies contre le vieillissement et le cancer par la régulation des cellules souches adultes. Notre projet est alimenté par une communauté en ligne de bénévoles qui font don de leur puissance de calcul pour faciliter les interactions des médicaments modèle. N'importe qui peut participer au projet par l'enregistrement et le téléchargement de logiciels pour effectuer automatiquement l'analyse.
Un des avantages du projet est un objectif pour la recherche translationnelle que nous allons gérer au début du processus de découverte de médicaments aux derniers stades de développement de médicaments. Multiples collaboration avec des instituts de découverte de médicaments et les compagnies pharmaceutiques sont utilisés pour une telle collaboration afin de faire de nouveaux médicaments efficaces, autant que possible.
Notre projet utilise le logiciel BOINC que vous pouvez télécharger ici. Comme les applications de base nous utilisons un logiciel de criblage virtuel, associée au raffinement de la dynamique moléculaire du logiciel. Mais notre objectif est de rapprocher autant que possible dans les logiciels de conception de médicaments in silico de notre plate-forme de découverte de médicaments efficaces et des prédictions des propriétés des petites molécules. Ces applications sont utilisées pour le perfectionnement des structures 3D pour biotargets offline modélisées et dans la conception des structures basées sur les in silico médicaments. Notre projet est à but non lucratif dans le sens que nous ne partageons pas les bénéfices avec les fondateurs du projet et que les informations sur toutes les collaborations sont communiqués, autant que possible aux bénévoles.
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 17 décembre 2009 à 22:30
Ce ne serait pas plutôt contre le vieillissement. :origin:
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 17 décembre 2009 à 22:38
Ce ne serait pas plutôt contre le vieillissement. :origin:

Oups, j'avais pas vu!
 :jap:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 30 décembre 2009 à 21:30
Citer
Posted 29 Dec 2009 18:52:15 UTC (http://boinc.drugdiscoveryathome.com/forum_thread.php?id=9&nowrap=true#2022)

Testing some new workunits now. These workunits will perform multiple docking on a single protein. The protein will have three different conformations. This will give us a better understanding on how well the ligand can attach than a single rigid protein.

Essai de nouvelles UTs actuellement. Ces unités de travail effectueront de multiples amarrages sur une seule protéine. La protéine aura trois conformations différentes. Cela nous donnera une meilleure compréhension de la façon dont le ligand peut s'attacher à une protéine unique et rigide.
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 30 décembre 2009 à 22:13

Pascal, tu fais la dernière tournée des popotes de l'année. :D
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 30 décembre 2009 à 22:17
exact  :D
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: samuel debergh le 01 janvier 2010 à 02:16
pourquoi certain projet limite le nombre de compte? ils ont pas besoin de beaucoup de puissance? pourquoi ne laisse t'il pas plus de compte et font que le projet dure moins longtemps?  je me pose des questions car cette année je veux faire seulement ce projet pour le formula boinc et forcement j'aimerai qu'il serve à quelque chose...
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 01 janvier 2010 à 11:49
DrugDiscovery@Home is in an early alpha phase and does not have a formal relationship with academia or the pharmaceutical industry.

Oui, à ce stade du projet, les volontaires doivent faire plus que calculer, il faut qu'ils prennent un part active enfaisant remonter régulièrement les difficultés qu'ils rencontrent etc...

Ce projet et en TEST, il n'est donc pas encore question de raid sur ce projet, mais de tester les unités !

je te laisse lire la suite ...

 :siflotte:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 16 janvier 2010 à 17:32
Citer
Message 2117 (http://boinc.drugdiscoveryathome.com/forum_thread.php?id=9&nowrap=true#2117) - Posted 14 Jan 2010 2:35:58 UTC

Just updated the linux versions
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] nico8313 le 16 janvier 2010 à 17:38
 :hello:

Ah !   c'est bien Linux reprend du service.

Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 16 janvier 2010 à 17:57
:hello:

Ah !   c'est bien Linux reprend du service.

Bof... j'ai dû stopper mon 3400+ que j' :love: http://boinc.drugdiscoveryathome.com/forum_thread.php?id=117&nowrap=true#2125 (http://boinc.drugdiscoveryathome.com/forum_thread.php?id=117&nowrap=true#2125). :/
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] nico8313 le 16 janvier 2010 à 18:01
Ah ok !!!!   :jap:

Jack a encore du boulot !  :cpopossib: 
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 20 février 2010 à 16:32
Help Wanted - build gpu autodock (http://boinc.drugdiscoveryathome.com/forum_thread.php?id=79)
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 20 février 2010 à 20:19

J'espère que Jack n'attends pas après moi. :pt1cable:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 20 février 2010 à 20:21
moi non plus... j'ai pas de GPU  :D

edit: mais je lui prête mon CPU ;)
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: louchio le 26 février 2010 à 12:49
On m'averti que les inscriptions sont ouvertes sur le projet DrugDiscovery et qu'il y a du travail à la masse. Profitez en pour y participer.

Pour rejoindre le projet:  http://boinc.drugdiscoveryathome.com/
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: alipse le 26 février 2010 à 17:22
Je n'ai quasi aucune de mes UT qui est validée. plus de 6K de pending. Je switch. Tant pis pour eux :/
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: sbmtl le 26 février 2010 à 23:47
Je n'ai quasi aucune de mes UT qui est validée. plus de 6K de pending. Je switch. Tant pis pour eux :/

Moins de gens qui calcule, plus la validation des unités est longue
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: alipse le 27 février 2010 à 20:15
J'ai l'impression de patiner. j'y retournerai sans doute après. Je n'ai pas dis mon dernier mot :D
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 18 mars 2010 à 18:19
Citer
Jack made another batch and it's sitting on the server, that's partly due to the MDrun wu's which are taking forever but slowly they are being reported.

Jack a fait un autre lot qui reste sur le serveur, c'est en partie dû aux UT MDrun qui prennent une éternité, mais qui sont lentement reportées.
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 22 mars 2010 à 19:57
Citer
New App released, MDrun 7.42 for windows.
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: samuel debergh le 01 septembre 2010 à 10:12
peu crunch sur ce projet pourquoi ? on crunch bien pour des scientifiques compétents dessus? merci et le theme du projet est sympa non?
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Netrider le 01 septembre 2010 à 10:21
Oui c'est un bon projet, mais depuis quelques mois il y a tres peut de boulot, et de plus souvent les ut en pending ne sont jammais crédités, on se demande ce que fait l'admin, parti chercher de l'aide sans doute  :/
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 15 octobre 2010 à 20:44
petit rappel pour ceux qui sont intéressés, les anti c'est pas la peine de vous manifester  :D

Citer
Message 34698 (http://boinc.berkeley.edu/dev/forum_thread.php?id=6046&nowrap=true#34698) - Posted 16 Sep 2010 15:36:51 UTC

Drugdiscovery@home in combination with Hydrogen@home is looking for volunteers/testers to help with development of Nvidia and ATI GPU Based applications.

Currently in development is a Nvidia App, which we need testers to make sure that the app is working across the board and on several computers besides the developer's and my computers.

Anyone wishing to help further these two projects please go to these forums: http://hydrogenathome.org/forum_forum.php?id=2

Thank You,
Tim Turner

Citer
Message 34734 (http://boinc.berkeley.edu/dev/forum_thread.php?id=6046&nowrap=true#34734) - Posted 18 Sep 2010 20:46:33 UTC - in response to Message 34698.

we need more testers with 2 or more cards on one system to test this. theirs a question as to why the system stops the test on the first card and goes on to the next.

le projet recherche des testeurs possédant plusieurs CG Nvidia sur leur bécane, la question étant de savoir pourquoi le système arrête le test sur la première carte et passe ensuite à l'autre.  :jap:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 15 octobre 2010 à 22:31
Si ça fonctionne aussi bien que les applis CPU de ces 2 projets, bin ça promet. :/
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] nico8313 le 15 octobre 2010 à 22:38
Y a déjà 1 an qu'on avait fait des essais pour cuda ! Jack reprend du service  :siflotte:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 07 novembre 2010 à 18:36
coucou là dedans  :kookoo:

tout à l'heure, trop content d'avoir chopé 1 UT, je regarde l'onglet messages pour savoir s'il y en avait eu d'autres, et je vois ceci :

dim. 07 nov. 2010 17:47:25 CET DrugDiscovery Sending scheduler request: To fetch work.
dim. 07 nov. 2010 17:47:25 CET DrugDiscovery Requesting new tasks
dim. 07 nov. 2010 17:47:29 CET DrugDiscovery Scheduler request completed: got 1 new tasks
dim. 07 nov. 2010 17:47:31 CET DrugDiscovery Started download of autodock_mgl_1.417_x86_64-pc-linux-gnu
dim. 07 nov. 2010 17:47:31 CET DrugDiscovery Started download of autogrid_1.401_x86_64-pc-linux-gnu
dim. 07 nov. 2010 17:47:50 CET DrugDiscovery Finished download of autodock_mgl_1.417_x86_64-pc-linux-gnu
dim. 07 nov. 2010 17:47:50 CET DrugDiscovery Started download of make_sitecustomize_1.401_x86_64-pc-linux-gnu
dim. 07 nov. 2010 17:47:52 CET DrugDiscovery Finished download of make_sitecustomize_1.401_x86_64-pc-linux-gnu
dim. 07 nov. 2010 17:47:52 CET DrugDiscovery Started download of LICENSES_1.414_x86_64-pc-linux-gnu
dim. 07 nov. 2010 17:47:53 CET DrugDiscovery Finished download of LICENSES_1.414_x86_64-pc-linux-gnu
dim. 07 nov. 2010 17:47:53 CET DrugDiscovery Started download of unzip_1.412_x86_64-pc-linux-gnu
dim. 07 nov. 2010 17:47:57 CET DrugDiscovery Finished download of autogrid_1.401_x86_64-pc-linux-gnu
dim. 07 nov. 2010 17:47:57 CET DrugDiscovery Finished download of unzip_1.412_x86_64-pc-linux-gnu
dim. 07 nov. 2010 17:47:57 CET DrugDiscovery Started download of autodock_1.410_x86_64-pc-linux-gnu
dim. 07 nov. 2010 17:47:57 CET DrugDiscovery Started download of MGLToolsPckgs_1.416_x86_64-pc-linux-gnu.zip
dim. 07 nov. 2010 17:48:04 CET DrugDiscovery Finished download of autodock_1.410_x86_64-pc-linux-gnu
dim. 07 nov. 2010 17:48:04 CET DrugDiscovery Started download of zip_1.412_x86_64-pc-linux-gnu
dim. 07 nov. 2010 17:48:11 CET DrugDiscovery Finished download of zip_1.412_x86_64-pc-linux-gnu
dim. 07 nov. 2010 17:48:11 CET DrugDiscovery Started download of AD4_parameters_1.401_x86_64-pc-linux-gnu
dim. 07 nov. 2010 17:48:13 CET DrugDiscovery Finished download of AD4_parameters_1.401_x86_64-pc-linux-gnu
dim. 07 nov. 2010 17:48:13 CET DrugDiscovery Started download of 7za_1.405_x86_64-pc-linux-gnu
dim. 07 nov. 2010 17:48:28 CET DrugDiscovery Finished download of 7za_1.405_x86_64-pc-linux-gnu
dim. 07 nov. 2010 17:48:28 CET DrugDiscovery Started download of 24437_ChemDiv_8004-9_1289147580075038000.txt
dim. 07 nov. 2010 17:48:29 CET DrugDiscovery Finished download of 24437_ChemDiv_8004-9_1289147580075038000.txt
dim. 07 nov. 2010 17:48:29 CET DrugDiscovery Started download of receptor.pdb_1289147580075038000.txt
dim. 07 nov. 2010 17:48:32 CET DrugDiscovery Finished download of receptor.pdb_1289147580075038000.txt
dim. 07 nov. 2010 17:48:32 CET DrugDiscovery Started download of job_10_1289147580075038000.txt
dim. 07 nov. 2010 17:48:34 CET DrugDiscovery Finished download of job_10_1289147580075038000.txt
dim. 07 nov. 2010 17:48:34 CET DrugDiscovery Started download of receptor.psf_1289147580075038000.txt
dim. 07 nov. 2010 17:48:35 CET DrugDiscovery Finished download of receptor.psf_1289147580075038000.txt
dim. 07 nov. 2010 17:48:35 CET DrugDiscovery Started download of ligand.psf_1289147580075038000.txt
dim. 07 nov. 2010 17:48:36 CET DrugDiscovery Finished download of ligand.psf_1289147580075038000.txt
dim. 07 nov. 2010 17:48:36 CET DrugDiscovery Started download of ligand.pdb_1289147580075038000.txt
dim. 07 nov. 2010 17:48:37 CET DrugDiscovery Finished download of ligand.pdb_1289147580075038000.txt
dim. 07 nov. 2010 17:54:02 CET DrugDiscovery Finished download of MGLToolsPckgs_1.416_x86_64-pc-linux-gnu.zip

je remarque plus particulièrement ceci :
Citer
dim. 07 nov. 2010 17:47:52 CET   DrugDiscovery   Started download of LICENSES_1.414_x86_64-pc-linux-gnu
dim. 07 nov. 2010 17:47:53 CET   DrugDiscovery   Finished download of LICENSES_1.414_x86_64-pc-linux-gnu

alors, je vais voir, et voici le contenu :

        MGLTools LICENSE AGREEMENTS:
----------------------------------------------------------------------------

Unless otherwise specified, this software is licensed by
Michel F. SANNER and The Scripps Research Institute.
Certain pieces of software in this package provide their own licensing
scheme which you will find below.

    ______________________________________________________________
    |Packages |        SOFTWARE LICENSES                   |
    |           |_________________________________________________|     
    |           |   ACADEMIC         |       COMMERCIAL        |
    |___________|_______________________|_________________________|
    |mslib |  Free for Academic    | Contact Michel Sanner   |
    |           |                       | (sanner@scripps.edu)    |
    |___________|_______________________|_________________________|
    |UTpackages |  Free for Academic    | Contact Chandrajit Bajaj|
    |           |                       |(bajaj@cs.utexas.edu)    |
    |___________|_______________________|_________________________|

All the components not specifying their own license are under the
Mozilla open source license.

Although this licensing scheme allows the re-distribution of this software
we would appreciate if people using it would download it from our site.
This helps us keep track of who is using it which is a strong argument when
trying to get money to work on this. Thanks !
If you have any questions please contact Michel SANNER (sanner@scripps.edu).

---------------------------------------------------------------------------
       MGLTOOLS SOFTWARE LICENSE AGREEMENT.
---------------------------------------------------------------------------

  1. Grant Of Limited License; Software Use Restrictions. The programs
     received by you will be used only for NON COMMERCIAL purposes.
     This license is issued to you as an individual.

     For COMMERCIAL use done with the software please contact Michel F.
     Sanner for details about commercial usage license agreements.
     
     For any question regarding license agreements, please contact
             Michel Sanner:
     TSRI, Molecular Biology Department, TCP 26,
     10550 North Torrey Pines Road, La Jolla, CA 92037
     sanner@scripps.edu
     tel (858) 784-7742
     fax (858) 784-2341

  2. COMMERCIAL USAGE is defined as revenues generating activities. These
     include using this software for consulting activities and selling
     applications built on top of, or using this software. Scientific
     research in an academic environment and teaching are considered
     NON COMMERCIAL.

  3.  Copying Restrictions. You will not sell or otherwise distribute commercially
     these programs or derivatives to any other party, whether with or without
     consideration.

  4. Ownership of Software. You will not obtain, and will not attempt to
     obtain copyright coverage thereon without the express purpose written
     consent of The Scripps Research Institute and Dr. Sanner.

  5. IN NO EVENT SHALL THE AUTHORS OR DISTRIBUTORS BE LIABLE TO ANY PARTY
     FOR DIRECT, INDIRECT, SPECIAL, INCIDENTAL, OR CONSEQUENTIAL DAMAGES
     ARISING OUT OF THE USE OF THIS SOFTWARE, ITS DOCUMENTATION, OR ANY
     DERIVATIVES THEREOF, EVEN IF THE AUTHORS HAVE BEEN ADVISED OF THE
     POSSIBILITY OF SUCH DAMAGE.

  6. THE AUTHORS AND DISTRIBUTORS SPECIFICALLY DISCLAIM ANY WARRANTIES,
     INCLUDING, BUT NOT LIMITED TO, THE IMPLIED WARRANTIES OF MERCHANTABILITY,
     FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE, AND NON-INFRINGEMENT.  THIS SOFTWARE
     IS PROVIDED ON AN "AS IS" BASIS, AND THE AUTHORS AND DISTRIBUTORS HAVE
     NO OBLIGATION TO PROVIDE MAINTENANCE, SUPPORT, UPDATES, ENHANCEMENTS, OR
     MODIFICATIONS.


----------------------------------------------------------------------------
MOZILLA OPEN SOURCE LICENSE AGREEMENT
----------------------------------------------------------------------------
Mozilla open source license version 1.1
http://www.opensource.org/licenses/mozilla1.1.php


----------------------------------------------------------------------------
MSLIB LICENSE AGREEMENT
----------------------------------------------------------------------------
FOR COMMERCIAL USE OF MSLIB PLEASE CONTACT Michel SANNER (sanner@scripps.edu)
 
THE SCRIPPS RESEARCH INSTITUTE SOFTWARE LICENSE AGREEMENT
 
1. Grant Of Limited License: Software Use Restrictions. You are free to use the
 program (MSMS) ONLY FOR NON-COMMERCIAL SCIENTIFIC RESEARCH. This license is
issued to you as an individual. For institution wide use or commercial use of
the software you will have to follow the official registration procedure. To do
 so you can contact us by e-mail (sanner@scripps.edu), mail (Michel Sanner,
TSRI,Molecular Biology Department, TCP26, 10550 North Torrey Pines Road, 92037
La Jolla) or fax (858) 784-2341.

2.Credits: WE REQUEST THAT YOU AGREE TO ACKNOWLEDGE THE USE OF THE MSMS
SOFTWARE THAT RESULTS IN ANY PUBLISHED WORK, INCLUDING SCIENTIFIC PAPERS,
FILMS AND VIDEOTAPES BY CITING THE FOLLOWING REFERENCE:
Sanner, M.F., Spehner, J.-C., and Olson, A.J. (1996) Reduced surface: an
efficient way to compute molecular surfaces. Biopolymers, Vol. 38, (3),
305-320.

3. Copying Restrictions: You will not sell or otherwise distribute commercially
these programs  or derivatives to any other party, whether with or without
consideration.

4. Ownership of Software: You will not obtain, and will not attempt to obtain
copyright coverage thereon without the express purpose written consent of The
Scripps Research Institute.

5. Limitation Of Liability: You will hold harmless from all or any expenses you
may incur as a result of or arising from your use, direct or indirect, of
these materials. You understand that no other right or license to this program
or its derivatives is granted or implied as a result of our transmission of
same to you.


END OF TERMS AND CONDITIONS

------------------------------------------------------------------------------
PYTHON IMAGING LIBRARY (PIL) LICENSE AGREEMENT
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The Python Imaging Library (PIL) is
    Copyright © 1997-2004 by Secret Labs AB
    Copyright © 1995-2004 by Fredrik Lundh

By obtaining, using, and/or copying this software and/or its associated
documentation, you agree that you have read, understood, and will comply with
the following terms and conditions:

Permission to use, copy, modify, and distribute this software and its
associated documentation for any purpose and without fee is hereby granted,
provided that the above copyright notice appears in all copies, and that both
that copyright notice and this permission notice appear in supporting
documentation, and that the name of Secret Labs AB or the author not be used
in advertising or publicity pertaining to distribution of the software without
specific, written prior permission.

SECRET LABS AB AND THE AUTHOR DISCLAIMS ALL WARRANTIES WITH REGARD TO THIS
SOFTWARE, INCLUDING ALL IMPLIED WARRANTIES OF MERCHANTABILITY AND FITNESS. IN
NO EVENT SHALL SECRET LABS AB OR THE AUTHOR BE LIABLE FOR ANY SPECIAL,
INDIRECT OR CONSEQUENTIAL DAMAGES OR ANY DAMAGES WHATSOEVER RESULTING FROM LOSS
OF USE, DATA OR PROFITS, WHETHER IN AN ACTION OF CONTRACT, NEGLIGENCE OR OTHER
TORTIOUS ACTION, ARISING OUT OF OR IN CONNECTION WITH THE USE OR PERFORMANCE
OF THIS SOFTWARE.


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 APBS License
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Primary author: Nathan A. Baker <http://agave.wustl.edu/>
(baker@biochem.wustl.edu <mailto:baker@biochem.wustl.edu>)
Department of Biochemistry and Molecular Biophysics
Center for Computational Biology
Washington University in St. Louis
Additional contributing authors <authors.html> listed in the code
documentation.

Copyright (c) 2002-2005. Washington University in St. Louis.
All Rights Reserved.
Copyright (c) 1999-2002. The Regents of the University of California.
Portions Copyright (c) 1995. Michael Holst.

This program is free software; you can redistribute it and/or modify it
under the terms of the GNU General Public License
<http://www.gnu.org/licenses/gpl.html> as published by the Free Software
Foundation; either version 2 of the License, or (at your option) any
later version.

This program is distributed in the hope that it will be useful, but
WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU General
Public License <http://www.gnu.org/licenses/gpl.html> for more details.

You should have received a copy of the GNU General Public License
<http://www.gnu.org/licenses/gpl.html> along with this program; if not,
write to the Free Software Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330,
Boston, MA 02111-1307 USA

j'avais jamais remarqué ça avant...
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 13 novembre 2010 à 12:28
 :hyperbon: :hyperbon: :hyperbon:

Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 13 novembre 2010 à 13:18
J'ai attaché les 2 bécanes du taf qui sont équipées de CG Quadro FX 580, mais le projet ne veut visiblement pas m'envoyer d'UTs "MDRUN CUDA OPENCL" à cruncher. :/
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 13 novembre 2010 à 14:56
Jack doit créer ce week-end le "class plan" pour que l'on puisse tester d'ici une à deux semaines l'application opencl (ATI/NVIDIA)...

http://boinc.drugdiscoveryathome.com/forum_thread.php?id=9&nowrap=true#2474 (http://boinc.drugdiscoveryathome.com/forum_thread.php?id=9&nowrap=true#2474)

Mais en attendant il y a à cette heure plus de 13 000 unités CPU à calculer...
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Netrider le 13 novembre 2010 à 15:47
Et j'ai perso toujours 50 000 de pending en attente depuis un an  :o :cavachier:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 13 novembre 2010 à 15:49
t'as MP Jack à ce sujet ?
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: ste le 13 novembre 2010 à 16:26
J'ai une Mdrun ATI OPENCL 0.06 (ati_opencl) qui est en cours de téléchargement.

Je vous dirais quoi plus tard  :)


Edit : parti en erreur au bout de 3s  :/
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 13 novembre 2010 à 18:24
...
Edit : parti en erreur au bout de 3s  :/

Toujours aussi fort le Jack. :siflotte:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 13 novembre 2010 à 18:36
 :blbl: :blbl: :blbl:



 :D
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: toTOW le 13 novembre 2010 à 18:41
Faudra que je teste, mais dans les applications, je voie pas de références à ATI ...
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 13 novembre 2010 à 18:49
Faudra que je teste, mais dans les applications, je voie pas de références à ATI ...

Mdrun ATI OPENCL
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: toTOW le 14 novembre 2010 à 13:30
Oulà oui, je devais pas être très réveillé ... :/
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: toTOW le 14 novembre 2010 à 17:37
J'ai testé ... il y a pas l'air d'y avoir beaucoup de WUs :(
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 14 novembre 2010 à 17:39
Ils y en avaient dans les 13 000 hier, elles peuvent être presque toutes parties...
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: toTOW le 14 novembre 2010 à 18:04
Bah mon ATI se tourne les pouces :(
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 14 novembre 2010 à 18:27
Jack doit créer ce week-end le "class plan" pour que l'on puisse tester d'ici une à deux semaines l'application opencl (ATI/NVIDIA)...

http://boinc.drugdiscoveryathome.com/forum_thread.php?id=9&nowrap=true#2474 (http://boinc.drugdiscoveryathome.com/forum_thread.php?id=9&nowrap=true#2474)

Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: toTOW le 14 novembre 2010 à 20:08
Viiiiiiite ! :priz2tet:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 22 novembre 2010 à 09:22
Les bécanes du taf (XP Pro 32 bits - NVIDIA Quadro FX 580 (511MB)) ont reçues 1 UT MDRUN CUDA OPENCL v0.03 (cuda_opencl) chacune :hyperbon:... à suivre donc. :gno:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Infomat le 22 novembre 2010 à 11:27
Ce qui élimine toutes les gpu non open_cl

Donc routes les anciennes CG.
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 22 novembre 2010 à 12:07
Il existe une appli cuda ne t'inquiète pas...

L'appli opencl pour NV est sortie hier... j'ai hâte de voir comment cela tourne...
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 22 novembre 2010 à 19:40
Pas de bol, elles partent en erreur...  :cavachier: :rhaa:

<core_client_version>6.12.6</core_client_version>
<![CDATA[
<message>
 - exit code 195 (0xc3)
</message>
<stderr_txt>
wrapper: starting
12:22:08 (3616): wrapper: running mdrun.exe (-v -x -c -o -e -cpi md.cpt -cpt 1 -deffnm md --device 0)
                         :-)  G  R  O  M  A  C  S  (-:

                   Groningen Machine for Chemical Simulation

                 :-)  VERSION 4.0.99_development_20090421  (-:


      Written by David van der Spoel, Erik Lindahl, Berk Hess, and others.
       Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
             Copyright (c) 2001-2008, The GROMACS development team,
            check out http://www.gromacs.org for more information.

         This program is free software; you can redistribute it and/or
          modify it under the terms of the GNU General Public License
         as published by the Free Software Foundation; either version 2
             of the License, or (at your option) any later version.

                              :-)  mdrun.exe  (-:

Option     Filename  Type         Description
------------------------------------------------------------
  -s         md.tpr  Input        Run input file: tpr tpb tpa
  -o         md.trr  Output       Full precision trajectory: trr trj cpt
  -x         md.xtc  Output, Opt! Compressed trajectory (portable xdr format)
-cpi         md.cpt  Input, Opt!  Checkpoint file
-cpo         md.cpt  Output, Opt. Checkpoint file
  -c         md.gro  Output       Structure file: gro g96 pdb
  -e         md.edr  Output       Energy file: edr ene
  -g         md.log  Output       Log file
-dgdl        md.xvg  Output, Opt. xvgr/xmgr file
-field       md.xvg  Output, Opt. xvgr/xmgr file
-table       md.xvg  Input, Opt.  xvgr/xmgr file
-tablep      md.xvg  Input, Opt.  xvgr/xmgr file
-tableb      md.xvg  Input, Opt.  xvgr/xmgr file
-rerun       md.xtc  Input, Opt.  Trajectory: xtc trr trj gro g96 pdb cpt
-tpi         md.xvg  Output, Opt. xvgr/xmgr file
-tpid        md.xvg  Output, Opt. xvgr/xmgr file
 -ei         md.edi  Input, Opt.  ED sampling input
 -eo         md.edo  Output, Opt. ED sampling output
  -j         md.gct  Input, Opt.  General coupling stuff
 -jo         md.gct  Output, Opt. General coupling stuff
-ffout       md.xvg  Output, Opt. xvgr/xmgr file
-devout      md.xvg  Output, Opt. xvgr/xmgr file
-runav       md.xvg  Output, Opt. xvgr/xmgr file
 -px         md.xvg  Output, Opt. xvgr/xmgr file
 -pf         md.xvg  Output, Opt. xvgr/xmgr file
-mtx         md.mtx  Output, Opt. Hessian matrix
 -dn         md.ndx  Output, Opt. Index file

app exit status: 0xc000000d
12:22:37 (3616): called boinc_finish


**********
**********

Memory Leaks Detected!!!

Memory Statistics:
0 bytes in 0 Free Blocks.
1015 bytes in 7 Normal Blocks.
592 bytes in 3 CRT Blocks.
0 bytes in 0 Ignore Blocks.
0 bytes in 0 Client Blocks.
Largest number used: 6992 bytes.
Total allocations: 24503 bytes.

Dumping objects ->
{90} normal block at 0x02491D88, 71 bytes long.
 Data: <-v -x -c -o -e -> 2D 76 20 2D 78 20 2D 63 20 2D 6F 20 2D 65 20 2D
{87} normal block at 0x02495500, 96 bytes long.
 Data: <a -y out.7z Liga> 61 20 2D 79 20 6F 75 74 2E 37 7A 20 4C 69 67 61
{86} normal block at 0x02495230, 672 bytes long.
 Data: <        mdrun.ex> 00 00 00 00 CD CD CD CD 6D 64 72 75 6E 2E 65 78
{78} normal block at 0x02491A68, 84 bytes long.
 Data: <<project_prefere> 3C 70 72 6F 6A 65 63 74 5F 70 72 65 66 65 72 65
c:\documents and settings\jshultz\my documents\visual studio 2008\projects\boinc\api\boinc_api.cpp(196) : {77} normal block at 0x02491A38, 4 bytes long.
 Data: <    > 00 00 1E 00
..\lib\parse.cpp(153) : {76} normal block at 0x024919B8, 84 bytes long.
 Data: <<project_prefere> 3C 70 72 6F 6A 65 63 74 5F 70 72 65 66 65 72 65
{69} normal block at 0x02491940, 4 bytes long.
 Data: <  I > E8 14 49 02
Object dump complete.


</stderr_txt>
]]>

 
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: toTOW le 22 novembre 2010 à 22:00
Toujours rien pour ATI en OpenCL ... :/
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 23 novembre 2010 à 23:20
Citer
2784310    717861    21 Nov 2010 21:56:53 UTC    23 Nov 2010 17:34:01 UTC    Error while computing    68,783.31    37.67    0.20    ---    MDRUN CUDA OPENCL v0.03 (cuda_opencl)

Toujours égal à lui-même le Jack. :cpopossib:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 29 novembre 2010 à 19:33
lun. 29 nov. 2010 12:18:47 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 13:11:14 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 13:15:31 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 13:23:12 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 13:29:07 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 13:33:47 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 13:41:46 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 13:47:36 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 13:53:28 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 14:04:06 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 14:08:17 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 14:13:50 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 14:21:01 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 14:25:29 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 14:34:00 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 14:34:59 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 14:40:22 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 14:49:32 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 14:54:16 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 15:00:46 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 15:12:04 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 15:17:26 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 15:23:19 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 15:34:19 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 15:39:40 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 15:48:44 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 15:52:42 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 15:58:06 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 16:02:56 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 16:03:59 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 16:09:38 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 16:18:29 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 16:23:27 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 16:30:56 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 16:39:51 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 16:45:02 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 16:51:39 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 17:01:53 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 17:09:12 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 17:14:21 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 17:21:52 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 17:27:35 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 17:33:48 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 17:40:10 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 17:46:22 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 17:51:13 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 17:55:37 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 18:02:30 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 18:10:17 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 18:28:11 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 18:36:38 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 18:41:58 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 18:50:51 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 19:00:09 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 19:09:29 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 19:16:47 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 19:22:55 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks
lun. 29 nov. 2010 19:31:05 CET | DrugDiscovery | Scheduler request completed: got 1 new tasks

quand y'en a plus, y'en a encore  :hyperbon:    :D
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 29 novembre 2010 à 20:16
c'était une GPU ?
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 29 novembre 2010 à 20:47
ah non, moi c'est que du CPU  :D
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 30 novembre 2010 à 20:20
c'était une GPU ?

Si c'est pour moi la question, bin woui... c'est marqué dessus.
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 05 janvier 2011 à 19:36
 :hyperbon: :hyperbon: :hyperbon:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Ryzen le 05 janvier 2011 à 19:44
ça crunch??
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 05 janvier 2011 à 19:48
j'en ai chopé 4 (mais que 4, alors que ce projet a une priorité de 1000 chez moi)  :jap:

http://boinc.drugdiscoveryathome.com/results.php?hostid=308
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 05 janvier 2011 à 22:37
T'as remarqué qu'il y a - de 3 jours pour 1 et 7 jours pour les autres. :pt1cable:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 06 janvier 2011 à 12:47
la première est déjà retournée, une autre est presque terminée, et la dernière même pas commencée  :D
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Netrider le 06 janvier 2011 à 19:44
J'ai que des 1.69 et zéro en GPU  :cavapobienmwa:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 06 janvier 2011 à 19:46
il y a déjà plus de taf....  :desole:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 17 février 2011 à 21:56
 :hyperbon: :hyperbon: :hyperbon:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 07 juin 2011 à 20:10
 :hyperbon: :hyperbon: :hyperbon:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: kasur le 07 juin 2011 à 20:14
toi t'as découvert une drogue...
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: kasur le 07 juin 2011 à 20:15
 :D :D :D
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 07 juin 2011 à 20:18
:hyperbon: :hyperbon: :hyperbon:

... et ça donne quoi niveau stabilité maintenant. :??:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 07 juin 2011 à 20:18
toi t'as découvert une drogue...
:chuidac:    :D
Titre: Re : Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 07 juin 2011 à 20:20
... et ça donne quoi niveau stabilité maintenant. :??:
comme d'hab'  :spamafote:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: fzs600 le 07 juin 2011 à 20:34
Deja plus de taf !!  :rhaa:
Titre: Re : Re : Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 07 juin 2011 à 20:35
comme d'hab'  :spamafote:

Merci de l'info Pascal... ce sera donc sans moi. :/
Titre: Re : Re : Re : Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 07 juin 2011 à 20:50
Merci de l'info Pascal... ce sera donc sans moi. :/
de rien Al'  :jap:

je précise toutefois que les UT se calculent sans soucis... mais le projet est souvent HS...

d’ailleurs Hydrogen@Home est OUT depuis un bon moment  :/
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: popolito le 08 juin 2011 à 11:07
toi t'as découvert une drogue...
tu as dû lire "drugs", c'est un faux-ami   :kookoo:
drugs se traduit par médicament, la drogue se dit dope.

(http://www.komrod.com/wp-content/uploads/2011/03/Troll-Face.png)
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: kasur le 08 juin 2011 à 11:36
Salut

merci Popolito tu as entièrement raison, j'ai travaillé sur une traduction ou j'ai pu voir ça, un extrait:

I Need Drugs (http://vimeo.com/6519588)

 :kookoo:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 09 juin 2011 à 12:44
viiite fzs600  :hyperbon: :hyperbon: :hyperbon:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: fzs600 le 09 juin 2011 à 12:53
C'est fait  :desole:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] nico8313 le 09 juin 2011 à 12:55
Z'auriez du m'en laisser un peu y en a plus !!!!  :cry:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 09 juin 2011 à 18:46
 :léjonti:

 :D


 :smak:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 06 juillet 2011 à 12:52
 :hyperbon:

(1 seule  :D)
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 23 août 2011 à 21:56
 :hyperbon: :hyperbon:   (2 U  :D)
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: fzs600 le 09 septembre 2011 à 09:29
Des nouvelles applications sont disponibles et notamment  des appli 32 bits pour Gnu-linux.
http://boinc.drugdiscoveryathome.com/apps.php (http://boinc.drugdiscoveryathome.com/apps.php) 

 :jap:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: samuel debergh le 09 septembre 2011 à 09:37
j'ai tellement d'objectif a boinc que je reporte mais plutard apres le raid et les badges pour moi :electric:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: fzs600 le 27 septembre 2011 à 08:48
Des nouvelles applications : vina     1.12   :kookoo:
http://boinc.drugdiscoveryathome.com/apps.php (http://boinc.drugdiscoveryathome.com/apps.php)

Citer
27 Sep 2011 6:24:46 UTC    27 Sep 2011 6:43:05 UTC    Completed, waiting for validation    617.02    23.67    0.13    pending    vina v1.12
   27 Sep 2011 6:24:31 UTC    27 Sep 2011 6:40:41 UTC    Completed, waiting for validation    939.39    16.09    0.09    pending    vina v1.12
   27 Sep 2011 6:37:57 UTC    27 Sep 2011 6:42:11 UTC    Completed, waiting for validation    237.14    12.55    0.10    pending    vina v1.12

 :jap:


Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 27 septembre 2011 à 12:56
merci fzs  :kookoo:
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: fzs600 le 27 septembre 2011 à 13:22
merci fzs  :kookoo:
hello pascal

Je me doutais bien que cela t'interesserais   :D
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 27 septembre 2011 à 18:39
wé, c'est gentil  :smak:

en plus, je rentre du taf et j'en ai 4  :hyperbon:

 :bounce:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 27 septembre 2011 à 22:18
Troooooooooop taaaaaaaaaard!!!
Citer
Results ready to send   0

 :/
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: fzs600 le 27 septembre 2011 à 22:43
Troooooooooop taaaaaaaaaard!!!
 :/
Ca veut rien dire il y a encore du taf laisse les vannes ouvertes.   :kookoo:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 28 septembre 2011 à 19:03
Tu en reçois toi. :??:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 28 septembre 2011 à 19:08
j'en ai eu, mais j'en ai plus  :kookoo:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 28 septembre 2011 à 19:32
 :jap:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: fzs600 le 16 octobre 2011 à 15:00
J'ai plus de 100 UT comme cela : 0 credit accordé   :/

Citer
2 Oct 2011 | 2:53:12 UTC    2 Oct 2011 | 3:58:53 UTC    Terminé et validé    3,204.30    18.96    0.00    vina v1.12
   2 Oct 2011 | 1:30:09 UTC    2 Oct 2011 | 2:53:25 UTC    Terminé et validé    4,253.00    19.73    0.00    vina v1.12

Est-ce que je suis le seul dans ce cas ?   :??:

Non je ne suis pas le seul.
http://boinc.drugdiscoveryathome.com/forum_thread.php?id=272#2693 (http://boinc.drugdiscoveryathome.com/forum_thread.php?id=272#2693)

Merci.

 :jap:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 16 octobre 2011 à 23:35
Marche toujours aussi bien le projet à le Jack :cpopossib:... perso, je n'en ai reçu aucune.
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Pascal94 le 17 octobre 2011 à 12:55
J'ai plus de 100 UT comme cela : 0 credit accordé   :/

Est-ce que je suis le seul dans ce cas ?   :??:

et non...  :/

Citer
3395216    901227    8 Oct 2011 | 8:55:22 UTC    8 Oct 2011 | 9:12:33 UTC    Terminé et validé    999.62    8.81    0.00    vina v1.12
3395215    901226    8 Oct 2011 | 8:55:22 UTC    8 Oct 2011 | 9:36:10 UTC    Terminé et validé    2,392.09    8.88    0.00    vina v1.12
3395194    901119    8 Oct 2011 | 8:30:42 UTC    8 Oct 2011 | 8:44:42 UTC    Terminé et validé    600.36    9.51    0.00    vina v1.12
3395193    901117    8 Oct 2011 | 8:30:42 UTC    8 Oct 2011 | 8:41:42 UTC    Terminé et validé    417.60    10.92    0.00    vina v1.12
3349883    893257    27 Sep 2011 | 14:45:52 UTC    27 Sep 2011 | 15:07:51 UTC    Terminé et validé    197.63    11.04    0.08    vina v1.12
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: fzs600 le 03 février 2014 à 18:06
 :hello:

Des UT font leurs apparitions.  :hyperbon:
Citer
    3 Feb 2014, 16:52:00 UTC    10 Feb 2014, 16:52:00 UTC    En cours    ---    ---    ---    vina v1.12
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Hildor le 03 février 2014 à 19:54
La plupart partent en erreur, mais j'en ai 2 validées hier avec 0 crédit  :/

Apparemment, il n'y a pas eu d'unités depuis la création des stats de Seb, ça date !  :siflotte:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: nabz le 03 février 2014 à 20:31
Lu sur la page d'accueil du projet.

Citer
Project restart
Hello everybody! I am trying to restart the project. Would be nice to get together again all people interested in it.
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: JeromeC le 03 février 2014 à 21:35
Il va lui falloir quelques temps pour rassembler tous les gens qui furent intéressés mais c'est bon de savoir qu'un projet renait de ses cendres :jap:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: fzs600 le 22 décembre 2016 à 07:43
 :hello:

Le projet a ressuscité.  :hyperbon: :hyperbon:
Citer
22 Dec 2016, 6:42:03 UTC    27 Dec 2016, 6:42:03 UTC    In progress    ---    ---    ---    DrugDiscovery TEST short_app v3.00
x86_64-pc-linux-gnu
22 Dec 2016, 6:42:03 UTC    27 Dec 2016, 6:42:03 UTC    In progress    ---    ---    ---    DrugDiscovery TEST short_app v3.00
x86_64-pc-linux-gnu
22 Dec 2016, 6:42:03 UTC    27 Dec 2016, 6:42:03 UTC    In progress    ---    ---    ---    DrugDiscovery TEST short_app v3.00
x86_64-pc-linux-gnu


Un grand merci a Sébastien pour l'info.  :jap: :jap:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Maurice Goulois le 22 décembre 2016 à 07:54
Youpi, un projet que j'ai raté grâce à mes multiples interruptions! Vivement que je puisse créer un compte :)

En plus il redémarrent avec un boinc récent tout beau tout neuf (si on en juge par le design du site :) )
Titre: Re : DrugDiscovery@home - [Projet suspendu]
Posté par: fzs600 le 22 décembre 2016 à 08:13
Citer
22 Dec 2016, 7:05:36 UTC    22 Dec 2016, 7:10:28 UTC    Completed and validated    102.50    0.02    0.92    DrugDiscovery TEST short_app v3.00
windows_intelx86
22 Dec 2016, 7:05:36 UTC    22 Dec 2016, 7:10:28 UTC    Completed and validated    102.69    0.02    0.92    DrugDiscovery TEST short_app v3.00
windows_intelx86
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: fzs600 le 22 décembre 2016 à 11:14
Apparemment la création de compte est ouverte au public.
http://boinc.drugdiscoveryathome.com/forum_thread.php?id=2035&postid=4537#4537 (http://boinc.drugdiscoveryathome.com/forum_thread.php?id=2035&postid=4537#4537)
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Maurice Goulois le 22 décembre 2016 à 11:38
Je confirme, c'est fait :) mais par le site parce que captcha
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: fzs600 le 23 décembre 2016 à 13:47
 Nouvelle application pour Gnu-linux uniquement.  :hyperbon:
http://boinc.drugdiscoveryathome.com/server_status.php (http://boinc.drugdiscoveryathome.com/server_status.php)

Citer
23 Dec 2016, 12:38:58 UTC    23 Dec 2016, 12:42:26 UTC    Completed, waiting for validation    4.40    0.01    pending    TEST dd_short_gmx v2.00
x86_64-pc-linux-gnu
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: fzs600 le 30 décembre 2016 à 19:36
 :hello:

Citer
Dear Community members, we are looking for volunteers with different language backgrounds for translation of the project-related texts. Please PM me.
http://boinc.drugdiscoveryathome.com/forum_thread.php?id=2039&postid=4555#4555 (http://boinc.drugdiscoveryathome.com/forum_thread.php?id=2039&postid=4555#4555)
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: fzs600 le 04 janvier 2017 à 16:36
 :hyperbon: :hyperbon: :hyperbon:

Est-ce qu'un admin pourrait éditer le topic et retirer : [Projet suspendu] ?

Merci.  :kookoo:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Antares le 04 janvier 2017 à 17:42
Vite des applis Windows!
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Sébastien le 04 janvier 2017 à 17:53
:hyperbon: :hyperbon: :hyperbon:

Est-ce qu'un admin pourrait éditer le topic et retirer : [Projet suspendu] ?

Merci.  :kookoo:
C'est fait :jap:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: fzs600 le 21 janvier 2017 à 22:15
 :hello:

Dorénavant on peux choisir l'application que l'on veux dans les préférence de son compte.
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Jakez Sulli le 22 janvier 2017 à 11:37
 :kookoo: Merci pour l'info fzs600  :jap:
J'ai actualisé les paramètres  :hyperbon:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: PhilTheNet le 24 janvier 2017 à 06:17
J'ai demandé sur leur forum s'ils comptaient mettre en place un système de badges,

la réponse vient de tomber :

Yes, I think we do it this week.Krzysztof 'krzyszp' Piszczek

 :gno:

Edit : Badges en place, comme quoi demander çà coute rien...  :gno:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: JeromeC le 24 janvier 2017 à 23:29
Plus dure sera la chute :D
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Jakez Sulli le 17 février 2017 à 07:51
 :kookoo: le détail des crédits pour les badges https://boinc.drugdiscoveryathome.com/forum_thread.php?id=2083#4771 (https://boinc.drugdiscoveryathome.com/forum_thread.php?id=2083#4771)
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: naz le 19 février 2017 à 12:45
Du coup ils sont où ces fameux badges?
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Xe120 le 04 avril 2017 à 17:09
Citer
Apologise
Due to some fraud made by part of the team, Me and Goofyx decides to cancel our activity on this project and finish all cooperation with rest of the team.
So, apologise to all volunteers but we had lost half year of work here, and I'm afraid than you too :(

Apologise...

Très mauvaise nouvelle, le projet a été fermé par les administrateurs.
Apparemment la plateforme SONM.IO avec laquelle ils avaient un accord, les a écarté pour utiliser leur travail pour monter un projet de scam pour collecter de l'argent.
L'application était compilée par un admin donc pas de soucis au niveau des calculs effectués, ils sont juste perdus.
 :/
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: modesti le 12 avril 2017 à 20:37
Trouvé chez nos amis de SG:
Citation de: https://www.seti-germany.de/forum/threads/3189-DrugDiscovery-home?p=297010&viewfull=1#post297010
THIS IS OFFICIAL STATEMENT FROM ANDREY VORONKOV, Lead of DrugDiscovery@home project and former lead of SONM project.

Dear Community members, project SONM was started by me and Sergey Ponomarev during summer 2016. The initial idea of the project was to build it on BOINC platform and develop P2P BOINC technology. Therefore Krzysztof Piszczek and Krzysztof Faryna were invited to make both DrugDiscovery@home and SONM project. DrugDiscovery@home was supposed to be a prototype for SONM project. However, during interaction of our lead developer Krzysztof Piszczek and SONM CTO Sergey Ponomarev different views on technology have started to arise. Sergey Ponomarev has decided to avoid BOINC usage further. As a CEO I tried to unite the team, rather than identify the issue as soon as possible. That was my mistake. Early stage separation of team into two could be a solution. This has led to current team separation. I am convinced that team of Sergey Ponomarev, Alexey Antonov and other team members (russian part basically) can make a successful ICO and a valuable decentralised general-purpose computing platform SONM. Therefore I have signed an agreement with them, which upgrade our technological map and invite new members in the SONM platform.
Project DrugDiscovery@home exists since 2009. Until now the team of Krzysztof Piszczek and Krzysztof Faryna were the best BOINC administrators team, which was managing the project. However, as a CEO I did a mistake and invited the same team into two different projects, which raised issues with another part of the team in the second project. The second project, where our colleagues from Poland were involved was SONM.
Krzysztof Piszczek and Krzysztof Faryna were mostly involved in DrugDiscovery@home project and therefore are very welcome to proceed with its development. All rights on scripts, related to DrugDiscovery@home project are transferred by Sergey Ponomarev to the project DrugDiscovery@home and its team (Krzysztof Piszczek and Krzysztof Faryna). I am ready and happy to ask Krzysztof Piszczek and Krzysztof Faryna to continue their work on DrugDiscovery@home and ready to transfer to them a leading role in DrugDiscovery@home project instead of me.
All efforts and suggestions from BOINC and Blockchain communities to unite the team and prevent destruction of the projects are welcome!

Pas le temps (ni la tête) pour traduire là, mais en gros:
Andrey Voronkov et Sergey Ponomarev ont lancé le projet SONM en 2016. Ils ont invité Krzysztof Piszczek et Krzysztof Faryna pour faire les projets DrugDiscovery et SONM, le premier devant être un prototype pour le 2e. Mais au cours de la collaboration il y a eu des points de vue différents quant à la technologie à utiliser. Au lieu de tenter d'identifier la source du problème, A. Voronkov a laissé les choses en l'état jusqu'à la séparation des équipes des deux projets.
Pour A. Voronkov les deux Krzysztof sont la meilleure équipe d'admins Boinc à gérer le projet DrugDiscovery depuis ses débuts en 2009. Il voudrait bien qu'ils continuent à gérer le projet à sa place et tous les droits sur les scripts etc. en rapport avec le projet sont transférés au projet et à son équipe (les deux Krzysztof).
Toutes les suggestions des communautés Boinc et Blockchain sont les bienvenues pour unir l'équipe et prévenir une destruction des projets.
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: JeromeC le 13 avril 2017 à 12:14
==> https://boinc.drugdiscoveryathome.com/forum_thread.php?id=2091

ça commence par les polonais qui disent "on est parti car ils sont très méchants avec nous" mais le russe intervient aussi et dit "c'est pas comme ça" et en gros le russe dit que c'est eux (les polonais) qui ont rompu les accords et ont eu des actions dommageables pour le projet.

Bref un joli sac de nœuds.
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: fzs600 le 12 juillet 2017 à 06:46
DrugDiscovery@Home is back : https://boinc.drugdiscoveryathome.com/forum_thread.php?id=2093&postid=4858#4858 (https://boinc.drugdiscoveryathome.com/forum_thread.php?id=2093&postid=4858#4858)

 :hyperbon:
Citer
   12 Jul 2017, 1:08:46 UTC    12 Jul 2017, 4:46:40 UTC    Completed and validated    33.95    29.75    0.25    smina_mol2 v0.04
x86_64-pc-linux-gnu
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: al@ON le 01 août 2017 à 16:40
 :hyperbon:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: MortelKni le 22 août 2017 à 19:53
Bonsoir !

Petite question concernant le lien entre ce projet et Digital BioPharm ? Pas trop de risque de cruncher juste pour les beaux yeux du labo ?
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Pascal le 17 octobre 2017 à 23:50
 :kookoo:
Nouvelle application pour le projet :

gromacs pour gpu nVidia sous OS MS Win et GNU/Linux

N.B. nécessite l'installation de du paquet gromacs pour GNU/Linux.

Bon  :hyperbon:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Maurice Goulois le 19 octobre 2017 à 07:09
Curieux :)

Sur la même machine, deux tâches d'à peu près 24000 sec, la première récolte 228 970 pts, la seconde 19 439 pts, ils utilisent New Credit  :??:

Pas trouvé de remarques à ce sujet dans leur fofo pour l'instant.
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: [AF>Libristes] Pascal le 19 octobre 2017 à 07:30
Je suppose que l'une a été calculée sur GPU, l'autre uniquement sur CPU. :)
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Maurice Goulois le 19 octobre 2017 à 07:46
C'est très confus, dans chaque tâche:

Running on 1 node with total 8 cores, 16 logical cores, 1 compatible GPU
Hardware detected:
  CPU info:
    Vendor: Intel
    Brand:  Intel(R) Xeon(R) CPU E5-2670 0 @ 2.60GHz
    SIMD instructions most likely to fit this hardware: AVX_256
    SIMD instructions selected at GROMACS compile time: SSE2

  Hardware topology: Basic
  GPU info:
    Number of GPUs detected: 1
    #0: NVIDIA GeForce GTX 1060 3GB, compute cap.: 6.1, ECC:  no, stat: compatible

Compiled SIMD instructions: SSE2, GROMACS could use AVX_256 on this machine, which is better.

Ça fait penser qu'il a préféré utiliser le cpu plutôt que la GTX-1060. WTF !!! (les deux tâches ont la même durée à 1000 s près)

J'ai lu qu'il faut cuda 8, mais rien n'indique que c'est un problème de version de cuda  :priz2tet:

Edit: bon après balade sur le fil gromacs gpu, il semble qu'il ne soit pas vraiment mûr :), mais ça n'explique pas les différences de crédits  :coffeetime:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Maurice Goulois le 19 octobre 2017 à 08:11
30% utilisation de la GPU  :cpopossib:

+-----------------------------------------------------------------------------+
| NVIDIA-SMI 375.66                 Driver Version: 375.66                    |
|-------------------------------+----------------------+----------------------+
| GPU  Name        Persistence-M| Bus-Id        Disp.A | Volatile Uncorr. ECC |
| Fan  Temp  Perf  Pwr:Usage/Cap|         Memory-Usage | GPU-Util  Compute M. |
|===============================+======================+======================|
|   0  GeForce GTX 106...  Off  | 0000:03:00.0     Off |                  N/A |
| 36%   51C    P2    39W / 120W |     77MiB /  3012MiB |     30%      Default |
+-------------------------------+----------------------+----------------------+

+-----------------------------------------------------------------------------+
| Processes:                                                       GPU Memory |
|  GPU       PID  Type  Process name                               Usage      |
|=============================================================================|
|    0     28065    C   gmx                                             75MiB |
+-----------------------------------------------------------------------------+

Ça a l'air de démarrer avec ce pilote 375, je me demande si le besoin de cuda 8 est effectif.

Edit: les release notes de gromacs 5.1.2 qui est le paquet par défaut de ubuntu 16.04 LTS parlent du support de cuda 9, pas d'un prérequis.
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: PhilTheNet le 19 octobre 2017 à 08:29
UC 1:
12331773    11648812    7115    18 Oct 2017, 7:21:05 UTC    19 Oct 2017, 3:17:54 UTC    Terminé et validé    36,751.55    36,620.20    9,838.47    gromacs v0.23 (cuda23)
windows_x86_64

UC 2:
12313798    11707911    9934    18 Oct 2017, 6:17:50 UTC    18 Oct 2017, 16:42:09 UTC    Terminé et validé    36,661.97    36,532.38    43,391.56    gromacs v0.23 (cuda23)
windows_x86_64

55% d'utilisation du GPU sur UC1 (GTX850M)

 :/
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Maurice Goulois le 19 octobre 2017 à 08:30
Oui, ça a encore du chemin à faire, mais c'est là, c'est un début  :D

Même ceux qui ont fait l'effort de mettre à jour leurs drivers pour cuda 8 ont des perfs similaires, c'est un gromacs beta, sisi  :desole:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: DocPhilou1966 le 19 octobre 2017 à 08:35
 :hello:

Chez moi ça donne ça :

Impossible de faire tourner sur 2 GPU (NB CUDA 23 ?)
Reçu 69 UT dont 65 parties en erreur

Et côté crédits pour les 4 qui sont passées :

PS Dans le compte, il y a une rubrique "Tokens to withdraw (prototype!)" :  :??:

Citer
12565664    11649331    2718    18 Oct 2017, 20:09:10 UTC    19 Oct 2017, 3:39:32 UTC    Terminé et validé    26,929.61    26,678.90    58,597.14    gromacs v0.23 (cuda23)
windows_x86_64
12421590    11650354    2718    18 Oct 2017, 12:25:51 UTC    18 Oct 2017, 20:08:58 UTC    Terminé et validé    27,696.12    24,045.56    60,265.02    gromacs v0.23 (cuda23)
windows_x86_64
12276526    11651994    2718    18 Oct 2017, 1:17:33 UTC    18 Oct 2017, 15:01:37 UTC    Terminé et validé    49,303.29    32,390.11    1,072,808.59    gromacs v0.23 (cuda23)
windows_x86_64
12255337    11708170    2718    18 Oct 2017, 1:17:33 UTC    18 Oct 2017, 11:50:47 UTC    Terminé et validé    37,892.30    24,492.95    824,512.66    gromacs v0.23 (cuda23)
windows_x86_64
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Maurice Goulois le 19 octobre 2017 à 08:38
Au moins ont plutôt gâtés côté crédits, c'est pour compenser la phase de galères initiales  :lol:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: PhilTheNet le 19 octobre 2017 à 08:44
Pour les erreurs 195 c'est un dll manquant:
"The program can't start because MSVCP110.dll is missing from your computer".

 :kookoo:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Maurice Goulois le 19 octobre 2017 à 08:48
Pour les tokens, c'est de la cryptomonnaie que tu es sensé pouvoir transférer dans un porte-monnaie "numérique" (wallet).

Ils annoncent ça dans ce groupe Google (https://groups.google.com/forum/#!topic/boinc-android-testing/jT5_oumJ-rc) (première référence que j'ai trouvé vite fait).

C'est l'influence de Gridcoin :)
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: damotbe le 19 octobre 2017 à 08:50
1 GPU user-selected for this run.
Mapping of GPU ID to the 1 PP rank in this node: 0


NOTE: GROMACS was configured without NVML support hence it can not exploit
      application clocks of the detected Tesla K20m GPU to improve performance.
      Recompile with the NVML library (compatible with the driver used) or set application clocks manually.


NOTE: Thread affinity setting failed. This can cause performance degradation.
      If you think your settings are correct, ask on the gmx-users list.


ça explique la mauvaise occupation GPU...
Les crédits sont étranges !
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Maurice Goulois le 19 octobre 2017 à 08:54
Pour les erreurs 195 c'est un dll manquant:
"The program can't start because MSVCP110.dll is missing from your computer".

 :kookoo:

Va télécharger et installer Redistribuable Visual C++ pour Visual Studio 2012 Update 4  (https://www.microsoft.com/fr-FR/download/details.aspx?id=30679), qui manque ou a eu un problème.
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Maurice Goulois le 19 octobre 2017 à 09:00
...
ça explique la mauvaise occupation GPU...
Les crédits sont étranges !

Gromacs c'est un de ces outils avec un nombre astronomique d'options de compilation et de paramètres, sans parler des fichiers de conf éventuels (usine à gaz  :desole:)

Je prévois un certain temps pour que ça s'améliore voire même un temps certain  :D

Les crédits sont folkloriques, c'est pas le premier délire qu'on connait :lol:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: fzs600 le 19 octobre 2017 à 09:17
 :o
Citer
État: Tous (353) · En cours (92) · Validation en attente (0) · Validation non concluante (0) · Valide (4) · Invalide (0) · Erreur (257)
Application: All (353) · gromacs (353) · smina_mol2 (0) · smina_pdbqt (0) · smina_sdf (0) · vina (0)
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Maurice Goulois le 19 octobre 2017 à 09:39
Carrément  :/ je viens juste de reprendre, on va voir  :coffeetime:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Maurice Goulois le 19 octobre 2017 à 09:42
Je me demande pourquoi cuda alors que https://streamhpc.com/blog/2014-11-01/ported-gromacs-cuda-opencl/ (https://streamhpc.com/blog/2014-11-01/ported-gromacs-cuda-opencl/)

Edit: paf, Krzysztof a posté ça le 18,  Linux Gromacs compilation (https://boinc.drugdiscoveryathome.com/forum_thread.php?id=2111), simple dit-il  :lol:, je vais voir si j'ai envie d'essayer
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Maurice Goulois le 19 octobre 2017 à 10:23
Déjà, le gmx, fourni par apt install gromacs sur ubuntu 16.04, si on fait gmx --version, ça donne:

GROMACS version:    VERSION 5.1.2
Precision:          single
Memory model:       64 bit
MPI library:        thread_mpi
OpenMP support:     enabled (GMX_OPENMP_MAX_THREADS = 32)
GPU support:        disabled
OpenCL support:     disabled
invsqrt routine:    gmx_software_invsqrt(x)
SIMD instructions:  SSE2
FFT library:        fftw-3.3.4-sse2-avx
RDTSCP usage:       enabled
C++11 compilation:  enabled
TNG support:        enabled
Tracing support:    disabled
Built on:
Built by:           buildd@debian [CMAKE]
Build OS/arch:      Linux x86_64

...

GPU support:        disabled
OpenCL support:     disabled
Euh, pas de gpu, pas d'opencl, comment il fait alors pour utiliser 30% de ma gpu  :??:

Y a un rpm (fedora) gromacs-opencl, mais je vais pas me prendre la tête avec ça, je vais essayer la compil sur la machine qui a la r9 280x qui peut pas faire de cuda de toutes façons, et où je n'ai donc pas installé gromacs.

Edit: bien sûr sot que je suis, c'est le fichier gmx_16_x86_64-pc-linux-gnu__cuda23 qui se trouve dans le répertoire du projet, mais il fait l'impasse sur ce fichier dans son explication. Installer Gromacs n'avait d'intérêt que pour des librairies éventuellement manquantes, pff :desole:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: damotbe le 19 octobre 2017 à 16:21
je suis curieux avec leur histoire de wallet, smart conttract,  d'Ethereum blockchain et tout et tout...
C'est quoi la monnaie qu'on a dans le wallet ?

Du coup, j’enquête et je vais essayer de tester Ethereum (le réseau, pas le minage) et Mist (apparemment une interface pour Ethereum....).
Je vous tiens au jus si je trouve quelque chose d'intéressant pour récupérer les Tokens qui valent très probablement rien  :lol:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Maurice Goulois le 19 octobre 2017 à 17:11
Mauvais plan pour opencl pour la r9 280x, la config utilise déjà un pilote made in dev (pseudo fglrx) et la compil à besoin de l'opencl toolkit, prise de tête assurée, je vais attendre un peu avant de tout casser  :D

Pour la machine avec la GTX 1060, j'ai fait l'install de cuda 9 toolkit en passant par nvidia (https://developer.nvidia.com/cuda-toolkit); ça m'a installé au passage le pilote 384.81

A suivre...

Edit: ça m'a aussi foutu le souk dans la config X qui me charge nouveau malgré tous les blacklist et autres... pas grave, ça crunche quand même  :rhaa:

Edit2: j'ai eu le plaisir de rencontrer le bug d'ubuntu 16.04 qui m'empêche de signer les modules (sur une machine non EFI) avec les utilitaires fournis qui n'existent pas en version non EFI  :priz2tet: Il faudrait que je compile le noyau et les prochaines versions du noyau moi-même avec les bonnes options. J'attendrais d'avoir le temps de mettre cette machine sous Gentoo  :rhaa:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: JulienL le 19 octobre 2017 à 20:34
Salut j'ai vu qu'il fallait mettre un wallet pour obtenir c'est fameux token es ce quelqu'un c'est quelle wallet faut t'il ? un pour les bitcoin? ou autre monai ?
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: damotbe le 20 octobre 2017 à 07:36
ce sont des Token de la blockchain Ethereum. J'ai installé Mist, j'ai entré le code du Token, il faut maintenant que ça se synchronise avec la blockchain, apparemment une quinzaine de Go à télécharger... to be continued   :miam:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: nafrayou le 20 octobre 2017 à 10:27
et bien il y a de l animation ici c est dernier temps ....................

j attend la réponse de damotbe avant d envoyer mes GPU dans cette histoire !
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: JulienL le 20 octobre 2017 à 17:10
ce sont des Token de la blockchain Ethereum. J'ai installé Mist, j'ai entré le code du Token, il faut maintenant que ça se synchronise avec la blockchain, apparemment une quinzaine de Go à télécharger... to be continued   :miam:
ok donc je vais test de me faire un wallet pour ethereum puis je verai bien mais sa me parrai bizarre qu'il offre des Tokens gratuitement , je trouve sa louche j'espère qu'il ce cache pas derrière DrugDiscovery pour nous faire miner de la cryptomonai
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: PhilTheNet le 20 octobre 2017 à 18:21
Effectivement affaire à suivre...

Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: damotbe le 20 octobre 2017 à 19:39
Bon bah, rien ne se passe au sujet des tokens... Probablement un test pour voir comment fonctionne les "smarts contracts" et autres Tokens.

En gros, le minage concerne les Ethereum, mais n'importe qui peut créer des Tokens associés à la blockchain. Ceux qui vérfie la cohérence du truc (les mineurs gagnent des ethereums), les autres gagnent des Tokens propres au projet auquel il participe (stockage, jeu, hébergement, etc...). Du coup, en faisant du Gromacs Pour DrugDiscovery, on gagne des tokens  DrugDiscovery qui n'ont aucune valeur, vu qu'il s'agit d'un projet qui ne génère pas de "marché" ni levée de fond ou autre joyeuseté économico-masturbatoire...
Bref, ça utilise la blockchain pour que notre score en Token soit gravée à tout jamais dans l'histoire de la blockchain (qui peut être perçues comme une base de donnée distribuée et sécurisée blablabla).

C'est pas bête comme concept ! mais j'imagine que l'admin à d'autres chats à fouetter  :lol: :lol: :lol:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: toTOW le 22 octobre 2017 à 00:09
Pour en revenir au sujet, Gromacs en GPU ça a toujours été assez foireux et peu efficace. C'est d'ailleurs pour ça que Stanford ne l'ai pas utilisé et a préféré développer OpenMM pour le GPU.

Gromacs marche par contre très bien sur CPU en SMP en utilisant le multi thread. Par contre en multi processus avec MPI, c'était pas fameux non plus).
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: PhilTheNet le 22 octobre 2017 à 11:31
Drugdiscovery Gpu part en erreur au bout de 0 secondes... il y a une biblio à charger ?

Merci d'avance pour la réponse.

 :kookoo:

Si Erreur 195 c'est un dll manquant:
"The program can't start because MSVCP110.dll is missing from your computer".

 :kookoo:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Sébastien le 22 octobre 2017 à 11:59
Drugdiscovery Gpu part en erreur au bout de 0 secondes... il y a une biblio à charger ?

Merci d'avance pour la réponse.

 :kookoo:
Sous Windows, le GPU doit être compatible CUDA 2.3 et le CPU doit accepter les instruction AVX256: https://boinc.drugdiscoveryathome.com/forum_thread.php?id=2108&postid=5001
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: DocPhilou1966 le 22 octobre 2017 à 12:08
90 % des UT's que j'ai reçues sont parties en erreur. Les valides n'apparaissent plus sur mon compte.
Citer
<core_client_version>7.8.2</core_client_version>
<![CDATA[
<message>
(unknown error) - exit code -148 (0xffffff6c)
</message>
<stderr_txt>
21:43:48 (1380): wrapper (7.9.26016): starting
21:43:48 (1380): wrapper: running gmx.exe (mdrun -nt 1 -deffnm md -gpu_id 1)
can't run app: Acc&#232;s refus&#233;.

 (0x5)
Error: command is '"gmx.exe" mdrun -nt 1 -deffnm md -gpu_id 1'
Error: exec_dir is ''
21:44:22 (1380): called boinc_finish(-148)

</stderr_txt>
]]>
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: DocPhilou1966 le 22 octobre 2017 à 12:21
Merci pour l'info  :jap:

Vais redémarrer tout le bazar aujourd'hui ;)
Hier j'ai du en annuler une qui a tourné > 24h, et est passée de 99,415 % à 9,75 % en 4 ou 5h

Mais si j'ai bonne mémoire : c'est du BETA, et quelqu'un a fait référence au développeur
qui utilisait CUDA alors que OpenCL semblerait plus adapté pour le soft qu'il utilise ?

Enfin, pour moi, c'est du chinois :)

Si ça ne marche pas, on se remettra sur GPUGRID ;)

 :hello: :kookoo:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Maurice Goulois le 22 octobre 2017 à 14:34
Sous Windows GPU-Z (https://www.techpowerup.com/gpuz/) est universellement adopté :)
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Maurice Goulois le 22 octobre 2017 à 18:58
C'est la capacité de calcul de la carte, j'ai répondu un peu trop vite :) essaie plutôt cuda-z (http://cuda-z.sourceforge.net/) qui indique aussi la version cuda du pilote  :desole:

Edit: C'est vraiment du test; l'admin change pas mal de choses en cours, pas "stable" pour le moment  :lol: (y a d'un côté les limitations et contraintes de gromacs et de l'autre le choix du développeur du projet pour son appli). J'ai qu'une machine qui réponds aux crritères du projet: Intel E2670 + Nvidia GTX 1060, ubuntu 16.04 + cuda 9

A priori CC 3.0 ça devrait suffire.
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Sébastien le 22 octobre 2017 à 20:58
Ton CPU ne supporte pas les instruction AVX  :/
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Maurice Goulois le 22 octobre 2017 à 21:33
Pas vraiment, l'admin/dev va devoir faire pas mal de tests et erreurs avant de maitriser.

Par curiosité, j'ai ajouté ma machine principale win7 x64, amd fx8350 + gtx 970, et pour l'instant ce passe bien; un coeur utilisé et entre 33% et 45% d'utilisation de la gpu. A suivre, le temps que ça termine et valide, ou pas  :lol:
Titre: Re : Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Maurice Goulois le 22 octobre 2017 à 21:34
Ton CPU ne supporte pas les instruction AVX  :/
Oui, y a pas mal de contraintes sur cette appli  :/
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Maurice Goulois le 23 octobre 2017 à 15:15
Dommage :desole:

Alors, pour info, test windows ok.

Mais crédits toujours dans le bizarre  :gno:

fx8350 + gtx970, win64: temps cpu 31 909,26 crédits 49 555,46
E2670 + gtx1060, linux64: ------- 25 904,00 ------- 16 655,14

 :pt1cable:
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: JulienL le 23 octobre 2017 à 22:29
Bon j'ai pas encore reçus de token pourtant j'ai bien mis on wallet j'attend je verrai bien faut peut être un certain montant
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: Maurice Goulois le 23 octobre 2017 à 22:46
C'est une fonctionnalité en test, typiquement le genre de choses qu'un admin peut activer/désactiver sans crier gare.
Titre: Re : DrugDiscovery@home
Posté par: damotbe le 24 octobre 2017 à 10:04
Quand on regarde sur les explorateurs de blockchain, on se rend compte qu'il n'y a pas de transaction de Token depuis plus de 250jours. Je pense que c'est au moins en pause  :kookoo: