Le Forum de l'Alliance Francophone

Taverne => Projets non-Boinc => Discussion démarrée par: Damien le 06 December 2007 à 16:58

Titre: le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: Damien le 06 December 2007 à 16:58
Projet de l'Université de Washington qui ressemble à du BOINC mais qui n'est pas du BOINC
Ce projet n'altère pas la contribution de puissance allouable à BOINC



Citation de: Heyoka
Il faudrait qu'un maximum de personnes s'inscrivent dans l'AF avant que la presse française ne s'empare du sujet.

voilà la procédure :
Inscription : http://www.fold.it/portal/user/register
Ensuite il faut télécharger le programme (Windows XP ou Vista, Mac OS (Intel)) qui fait ~50 Mo
Puis pour finir rejoindre l'Alliance Francophone : http://www.fold.it/portal/node/61909 (appuyer sur "join this group")
Une fois le logiciel téléchargé, il faut l'installer (Fold It!), puis vous pouvez commencer à vous amusez avec.


Après il va falloir monter des tutos pour expliquer le fonctionnement en français, parce que sinon c'est pas facile à comprendre intuitivement.

Foldit au micro de France Culture:

http://www.franceculture.fr/2011-09-30-ces-jeux-en-reseau-qui-font-progresser-la-science.html

Foldit, article dans Nature traduction suivra  :jap:  23 janvier 2012

http://www.nature.com/news/victory-for-crowdsourced-biomolecule-design-1.9872



Voici la manip pour passer foldit en français (je la poste ici, cela peut éventuellement servir à d'autre)

Citer
1)récuperer le fichier de traduction (foldit.fr.po):
http://dl.free.fr/rRscVRjj7

2)le déposer dans le dossier des fichiers de données de foldit:
(The data files are in different places depending on your OS:
---on Windows:
if you installed after 8/23/2011, they will be in your installation directory (the default is C:\Program Files\Foldit\ or C:\Program Files (x86)\Foldit\)
if you installed prior to 8/23/2011:
on Windows XP at C:\Documents and Settings\All Users\Application Data\Foldit\
on Windows 7 and Vista at C:\ProgramData\Foldit\
---on a Mac, Ctrl-click on the app and choose "Show Package Contents, then go to Contents/Resources
---on Linux, is is the Foldit directory
)
3) modifier le fichier option.txt (du dossier de foldit) en rajoutant la ligne:
"langage":"fr"

4) relancer foldit

(voir ici: https://fold.it/portal/node/989342 )

question d'Augure

- "Mais d'ailleurs, c'est l'algo informatique de Fold'it qui est bon ou l'imagination des joueurs ?"

réponse de jobo 0502 ( admin équipe AF Fold it )

- "Non, le joueur défini la structure, la forme de la protéine et l'algo informatique tente de trouver le meilleur niveau d'énergie à partir de cette conformation, certes, l'ordinateur ne travaille pas pour rien, alors disons que c"est une construction en partenariat cerveau-processeur dont le l'homme est l'architecte et la machine l'entreprise en batiment.
Pour ce qui concerne l'imagination, le jeune qui a trouvé la meilleure structure de la fameuse protéine de l'article de "nature", à la question "Comment avez vous fait?" a répondu :"c'était la forme qui me plaisait le mieux"- citation de mémoire donc non textuelle-.
Il y a aussi une part d'esthétique, d'inspiration, car la logique de la nature nous imprègne et fait que nous la trouvons belle ou adéquate. Le poète rejoint le scientifique. "
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: Heyoka le 09 December 2007 à 23:40
J'ais pas compris, il y a 2 boutond wiggle qui nous font gagner des points sans rien faire, apparement c'est le processeur qui calcule  :lol:
Par contre quand on se met à faire tourner nous même les chaines de la protéine, ça devient tout de suite extrêmement compliqué et on perd tout nos jolis points Bonus obtenus sans rien faire.
C'est vraiment quelque chose pour les gens qui ont beaucoup de patience. Par contre c'est aussi quelque chose qui peut intéresser les gens qui vous verront jouer. Et quand vous leurs répondrez que c'est de la vrai science qui peut aider à mieux comprendre les protéines, là ils seront encore plus intéressés

(http://forum.boinc.fr/mesimages/560/RosettaGame.jpg)
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: rom_185 le 09 December 2007 à 23:47
Ce n'est pas le jeu rosetta dons David Baker nous avait parlé ?
Sinon, l'inscription c'est comme pour les autres projets :??: ?
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: Heyoka le 09 December 2007 à 23:48
Citation de: rom_185
Ce n'est pas le jeu rosetta dons David Baker nous avait parlé ?
Sinon, l'inscription c'est comme pour les autres projets :??: ?


Oui c'est le "jeu" rosetta.
Au lieu de faire calculer les processeurs pour arriver à l'énergie la plus basse, il faut le faire manuellement
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: rom_185 le 09 December 2007 à 23:50
Citation de: Heyoka
Oui c'est le "jeu" rosetta.
Au lieu de faire calculer les processeurs pour arriver à l'énergie la plus basse, il faut le faire manuellement
:bounce:
EDIT : inscrit :jap:.

Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: pas93 le 09 December 2007 à 23:56
Je test aussi :bounce:
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: rom_185 le 09 December 2007 à 23:57
Citer
09/12/2007 23:56:29|rosetta@play|Master file download succeeded
09/12/2007 23:56:35|rosetta@play|Sending scheduler request: Project initialization.  Requesting 1 seconds of work, reporting 0 completed tasks
09/12/2007 23:56:40|rosetta@play|Scheduler request failed: Error 403
09/12/2007 23:57:25|rosetta@play|Sending scheduler request: Requested by user.  Requesting 29 seconds of work, reporting 0 completed tasks
09/12/2007 23:57:30|rosetta@play|Scheduler request failed: Error 403
09/12/2007 23:58:31|rosetta@play|Sending scheduler request: Requested by user.  Requesting 29 seconds of work, reporting 0 completed tasks
09/12/2007 23:58:36|rosetta@play|Scheduler request failed: Error 403
09/12/2007 23:59:36|rosetta@play|Sending scheduler request: Requested by user.  Requesting 29 seconds of work, reporting 0 completed tasks
09/12/2007 23:59:41|rosetta@play|Scheduler request failed: Error 403
:(
Serveur HS ?
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: pas93 le 10 December 2007 à 00:03
L'appli à Bugé 2 fois c'est lourd :o
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: rom_185 le 10 December 2007 à 00:06
Arf, du rosetta tout craché (sens propre, comme figurer :p), je ferme les vannes, pas envie que BOINC plante pendant la semaine :o.
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: Heyoka le 10 December 2007 à 00:18
C'est sure, le jeu ne marche pas avez BOINC.

Il faut s'inscrire : http://biocraft.cs.washington.edu/trial5/create_account_simple.php

Puis télécharger ce logiciel :


Téléchargement - Windows : http://biocraft.cs.washington.edu/trial5/download/app/win/InteractiveRosetta.msi
Téléchargement - OS X, x86 : http://biocraft.cs.washington.edu/trial5/download/app/osx-x86/interactive-rosetta-trial-5-v0.3.tar.gz

Ensuite il faut mettre son email et c'est partie.
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: pas93 le 10 December 2007 à 00:20
Bha oui, c'est bien comme ça que je l'ai installer même :p

Mais je ne sait pas pourquoi, 2 fois ça a planter :o
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: Heyoka le 10 December 2007 à 00:23
Mais d'après moi, c'est n'est pas la version du jeu qui est à jour. Là il n'y a qu'une seule protéine.
Sur le forum de Rosetta@home, ils parlent d'une autre version ou David Baker est bien placé sur la protéine #6

http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=3789

Pour pouvoir y participer, il faut envoyer un mail à rosettaNOmod.SPzilla at yaAMhoo.comERS
Remplacer le "at" par un @ et enlever les lettres NOSPAMERS écrites en majuscule

Et envoyer un message avec ce titre : "Please add me to Rosetta Game beta list"
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: rom_185 le 10 December 2007 à 00:26
Citation de: Heyoka
C'est sure, le jeu ne marche pas avez BOINC.

Il faut s'inscrire : http://biocraft.cs.washington.edu/trial5/create_account_simple.php

Puis télécharger ce logiciel :


Téléchargement - Windows : http://biocraft.cs.washington.edu/trial5/download/app/win/InteractiveRosetta.msi
Téléchargement - OS X, x86 : http://biocraft.cs.washington.edu/trial5/download/app/osx-x86/interactive-rosetta-trial-5-v0.3.tar.gz

Ensuite il faut mettre son email et c'est partie.
A oui... :o
Parti me cacher...

Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: sbmtl le 10 December 2007 à 03:05
Windows n'a pas l'air d'aimer.  L'application plante après quelques manipulation de la molécule.

J'ai réussi à faire un petit bout 65 points bonus.  Je suis 23e au classement.

J'ai aussi tenté de créer L'Alliance sur le projet.  Vais avoir besoin d'aide.

A noter que ce projet utilise presque toute la puissance de l'ordinateur si on ne le limite pas.

Reste à savoir si ça donnera de vrai crédits un moment donné.
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: Thrr-Gilag le 10 December 2007 à 14:28
Tssss, pourquoi ils refont mes cours de modélisation moléculaire ?
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: sbmtl le 11 December 2007 à 00:36
Pour que tu nous montres que tu es le meilleur
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: rom_185 le 16 December 2007 à 20:14
On ne peut pas renvoyer ce que l'on a fait :??:, j'ai eu 324 points bonus :).
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: Heyoka le 16 December 2007 à 23:34
Abandonnez ce projet, ce n'est plus cette version qui est utilisée maintenant.
Pour avoir accès au vrai bêta test il faut suivre cette procédure :

Citer
Mais d'après moi, c'est n'est pas la version du jeu qui est à jour. Là il n'y a qu'une seule protéine.
Sur le forum de Rosetta@home, ils parlent d'une autre version ou David Baker est bien placé sur la protéine #6  
 
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/ [...] hp?id=3789
 
Pour pouvoir y participer, il faut envoyer un mail à rosettaNOmod.SPzilla at yaAMhoo.comERS
Remplacer le "at" par un @ et enlever les lettres NOSPAMERS écrites en majuscule
 
Et envoyer un message avec ce titre : "Please add me to Rosetta Game beta list"


Là vous verrez un nouveau site beaucoup plus évolué, et avec plusieurs types de protéines, et un classement pour chaque protéine. Vous verrez aussi David Baker qui participe au jeu, ce qui montre toute l'importance qu'il donne à cette nouvelle méthode.
Quand ce projet sera officiellement lancé, ça risque d'être un gros buzz sur internet et dans les médias.

Mais pour l'instant l'accès est restreint pour que le site et le jeu soit vraiment parfait lors du lancement officiel.
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: rom_185 le 17 December 2007 à 00:15
J'ai déjà envoyé le mail ;).[spoiler]"Quand ce projet sera officiellement lancé, ça risque d'être un gros buzz sur internet et dans les médias."
Je vais encore pouvoir me venté auprès de mes copains et leurs dire "j'y étais" :).[/spoiler]
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: rom_185 le 17 April 2008 à 13:38
Bon, je pense que l'on peut en parlé en public depuis le temps que ce "projet" existe....
[spoiler] Voir ici : http://forum.boinc.fr/boinc/Zone51/rosetta-sujet_99_1.htm#t11894 [/spoiler]
La nouvelle adresse est : http://game.bakerlab.org/portal/
L'AF est fondée : http://game.bakerlab.org/portal/node/61909
Mais la présentation HTML merde un peut....

Je suis pour l'instant 38eme au général, il faut ce bouger car je suis tout seul :na:...

@Damien : tu peut faire une màj du 1er post STP :) ?
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: rom_185 le 04 May 2008 à 01:27
@ Damien : Merci pour la MàJ :hello: !

Pour les news :
1) Le site est reffet de A à Z.
2) Je n'est plus accès à la page d'édition de L'AF  :??: ...
3) Un classement par points est mis en place pour les équipes.
4) L'AF à deux membres (Heyoka et moi :p) et nous totalisons 1800 points :jap:.
5) Fold It fonctionne sous WINE  :bounce: !
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: Heyoka le 04 May 2008 à 14:07
David Baker a annoncé sur le forum que le site est maintenant public.
Il a également annoncé qu'il fallait s'attendre à entendre parler du Rosetta game dans vos journaux préférés. Donc il prépare un communiqué de presse qui devrait faire du bruit.
C'est le moment de faire une actu sur boinc-af
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: rom_185 le 04 May 2008 à 14:40
Citer
C'est le moment de faire une actu sur boinc-af
Je vais voir ce que je peux faire  :jap: .
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: Caius666 le 08 May 2008 à 19:57
Plus besoin d'invitation pour s'inscrire :)
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: Heyoka le 08 May 2008 à 22:02
Et voilà, les articles dans la presse commencent à affluer :

MIT Technology Review : http://www.technologyreview.com/Biotech/20738/
The Economist : http://www.economist.com/science/displaystory.cfm?story_id=11326188
Science Daily : http://www.sciencedaily.com/releases/2008/05/080508122520.htm
Howard Hughes Medical Institute : http://www.hhmi.org/news/foldit20080508.html

La nouvelle adresse du projet http://www.fold.it/ (http://www.fold.it/)
le projet s'appelle maintenant fold it "résoudre des puzzles pour la science"
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: xter757288 le 08 May 2008 à 22:08
C'est bien sympa que ce projet soit mené à bien.
Bakerlab confirme qu ils sont à la pointe de ce qu il se fait actuellement dans le domaine.
Bravo M. Baker
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: Heyoka le 08 May 2008 à 22:27
Il faudrait qu'un maximum de personnes s'inscrivent dans l'AF avant que la presse française ne s'empare du sujet.

voilà la procédure :
Inscription : http://www.fold.it/portal/user/register
Ensuite il faut télécharger le programme (Windows XP ou Vista, Mac OS (Intel)) qui fait ~50 Mo
Puis pour finir rejoindre l'Alliance Francophone : http://www.fold.it/portal/node/61909 (appuyer sur "join this group")
Une fois le logiciel téléchargé, il faut l'installer (Fold It!), puis vous pouvez commencer à vous amusez avec.


Après il va falloir monter des tutos pour expliquer le fonctionnement en français, parce que sinon c'est pas facile à comprendre intuitivement.
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: xter757288 le 08 May 2008 à 22:36
et l'AF est déja première  :bounce:
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: Heyoka le 08 May 2008 à 23:03
A noter aussi que lorsque l'on joue à un puzzle, il y a un chat pour communiquer avec les participants qui jouent en même temps que nous sur le puzzle. Ce qui permet de s'échanger des conseils par exemple.


Citation de: xter757288
et l'AF est déja première  :bounce:


ça doit être un bug je pense. on a un score de 25 seulement, d'autres équipes ont des scores de plus de 1000 (Berkeley, Illinois,...)
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: xter757288 le 08 May 2008 à 23:08

Ce projet va faire mal, et va je ense apporter beaucoup de notoriété a rosetta
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: Heyoka le 10 May 2008 à 12:09
Information communiquée à Futura-Sciences.
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: al@ON le 10 May 2008 à 12:21
Citation de: Heyoka
Information communiquée à Futura-Sciences.
:jap: Heyoka, pour le coup ça va aider à sa diffusion dans d'autres médias en France.

Perso, avant de me lancer je vais attendre les traductions que vous préparez et peut-être un tuto sur le fonctionnement de ce programme.
Juste une tite question, BOINC peut-il tourner en même temps? :ange:
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: rom_185 le 10 May 2008 à 15:53
Citer
Juste une tite question, BOINC peut-il tourner en même temps? :ange:  
Chez moi les deux tournent en même temps sans problemes :p.
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: oxaolga le 10 May 2008 à 18:09
Je suis en train d'essayer c'est quand même chaud à comprendre
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: rom_185 le 11 May 2008 à 01:03
http://www.youtube.com/user/UWfoldit

;)

Je viens de recevoir ça par un mail automatique de chez foldit :
Citer
| Greetings, rom_185.
|
| Your subscription on Fold It!
| notifies you of an updated post:
|
| Author: rom_185
| Title: L'Alliance Francophone
 

L'Alliance Francophone vous souhaite la bienvenue !


Notre point commun : la langue francaise.
 Notre objectif : developper une equipe francophone autour des projets de calcul sur la plateforme BOINC et d'utilisation des capacités de réflexion humaines.


Notre site internet - Notre forum


 


 


 
| Link: http://game.bakerlab.org/portal/node/61909
Je veux bien le mettre à jour mon post mais quand je fais "Edit Group" je tombe sur un "You are not authorized to access this page."  :fou:  !

Un petit texte en anglais pour exposer mon problème à Mr Adrien Treuille (ou autre) :)...
Merci bien  :jap: .
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: rom_185 le 11 May 2008 à 01:44
Citer
Unable to connect to database server
Site web dans le choux  :lol: !

EDIT : C'est revenu ;).
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: Heyoka le 11 May 2008 à 13:03
Je viens de lire quelque chose de très intéressant à la fin de la traduction de Sveen.

En fait les humains qui vont jouer sur foldit vont permettre de mettre en place des stratégies de repliement plus efficaces que celles actuellement à l'œuvre sur Rosetta@home
Et ces stratégies seront par la suite "enseignées" aux ordinateurs qui calculent sur Rosetta@home.

C'est un apprentissage humain -> machines
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: xter757288 le 11 May 2008 à 17:50
:bounce: c'est passionant
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: rom_185 le 11 May 2008 à 18:16
Forum de l'AF sur foldit : http://game.bakerlab.org/portal/forum/47
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: Heyoka le 11 May 2008 à 20:52
C'est aussi un formidable outil pour intéresser les jeunes à la science.
Pour ceux qui sont à l'école n'hésitez à parler de fold it à vos profs de SVT :)
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: rom_185 le 11 May 2008 à 21:41
Citation de: Heyoka
C'est aussi un formidable outil pour intéresser les jeunes à la science.
Pour ceux qui sont à l'école n'hésitez à parler de fold it à vos profs de SVT :)

C'est vrai...ha j'ai une idée diabolique dans la tête....  :D

J'en reparlerai...  :p
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: Heyoka le 11 May 2008 à 22:16
Oui, au mieux vous pouvez gagner 1 heure au CDI pour plier sur fold it  :p
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: al@ON le 11 May 2008 à 23:14
Citation de: Heyoka
Oui, au mieux vous pouvez gagner 1 heure au CDI pour plier sur fold it  :p
:lol:

Ça va plaire à rom. :D
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: rom_185 le 11 May 2008 à 23:18
 :whistle:
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: Heyoka le 12 May 2008 à 01:20
J'ai amélioré le score de l'AF pour le puzzle 52  :)
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: rom_185 le 12 May 2008 à 01:29
 :bounce:
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: Heyoka le 12 May 2008 à 01:41
Il y a rien à faire pour sauvegarder son score ?
C'est bizarre, ça ne m'a pas donné de point supplémentaire pour mon score global
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: rom_185 le 12 May 2008 à 02:28
Je ne sais pas, attend une MàJ du serveur :spamafote:...
Sinon moi pour le puzzle n°52 Beginner: Bacteria Energy, je viens de me placer 145eme  :D .
Tu es combien ?
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: Heyoka le 12 May 2008 à 02:46
39 ème  :) , 10064 points
J'ai surtout fait des "liaisons élastiques" entre les 4 brins
Clic droit-déplacer, je relie les feuillets puis Wiggle et shake
Clear Locks and Bands
Wiggle et shake
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: rom_185 le 12 May 2008 à 13:27
 :ouch:
Quand même....
Je vais essayer de faire mieux...  :D
J'aurai du mal mais s'pas grave  :na: !
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: Heyoka le 12 May 2008 à 15:18
Le problème, c'est que je suis 38 ème mais j'ai reçu aucun point. Et sur le site je suis classé 10.000 ème , mais avec un score de 10.079 sur le puzzle

http://www.fold.it/portal/node/177288/show_players?page=1



Je sais pas comment est calculé le score global, peut être qu'il faut minimiser le nombres de mouvements.

Il faudrait demander à Caius, ivan_w et Museka quel est leur technique pour arriver à un score global supérieur à 150
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: rom_185 le 12 May 2008 à 16:13
Ca bug :(...
Envois un mail à Adrien Treuille :/
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: Caius666 le 12 May 2008 à 17:19
Citation de: Heyoka

Je sais pas comment est calculé le score global, peut être qu'il faut minimiser le nombres de mouvements.

Il faudrait demander à Caius, ivan_w et Museka quel est leur technique pour arriver à un score global supérieur à 150


Je ne sais pas non plus comment sont attribués ces points, j'ai bien fini tout les puzzles du tuto, après je tripatouille les protéines  :sweat:

J'ai fais une recherche (très rapide) sur leur forum mais je n'ai pas trouvé d'info la dessus...
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: Heyoka le 13 May 2008 à 18:51
Je pense que c'est un bug, il y a plein de joueurs qui sont dans mon cas.

Sinon, Fold It vient de distribuer 3 nouveaux puzzles qui correspondent à des cibles du concours CAPS8 : http://fold.it/portal/view/adobe_list_puzzles
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: Heyoka le 14 May 2008 à 22:11
D'autres sites commencent à parler de Fold it :

Notamment le blog schizodoxe : http://www.schizodoxe.com/2008/05/13/avec-foldit-la-biologie-moleculaire-est-un-jeu-denfants-au-sens-propre/ (très bon blog : http://www.schizodoxe.com/)
L'atelier : http://www.atelier.fr/article.php?artid=36544
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: Heyoka le 14 May 2008 à 22:57
Voilà la réponse que j'ai reçu concernant la traduction du jeu et de la page description :
Citer
Sorry for the delay in responding to your post. We are currently very busy with the release of game, Foldit. We are very interested in your French translation of the science page and would like to post it as soon as possible. Regarding translating the game. We have not thought about multilingual support, but this would be an interesting puzzle. Have you been able to enter accented characters into the chat window?

Adrien


Donc, comme on pouvait s'y attendre, ils sont très occupés par la sortie du jeu. Ils sont très intéressés par la traduction française de svenn.
Par contre, en ce qui concerne le jeu, ils n'avaient pour l'instant pas prévu de le traduire en plusieurs langue
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: Caius666 le 16 May 2008 à 18:55
L'AF fait partie des Top groups pour les Puzzles 50 and 51 "For the beginner version"  :D
http://fold.it/portal/node/214373
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: Heyoka le 17 May 2008 à 12:12
Sortez les joysticks pour la recherche biologique : http://www.bulletins-electroniques.com/actualites/54674.htm
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: xter757288 le 17 May 2008 à 12:18
Merci pour le lien Heyoka. Tu viens de me faire découvrir un super site gouvernemental ;)
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: al@ON le 17 May 2008 à 12:22
Citation de: Heyoka
Sortez les joysticks pour la recherche biologique : http://www.bulletins-electroniques.com/actualites/54674.htm

Très bon article mais ils ont oublié un lien :heink:... celui de L'AF. :D  :p
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: tibidao le 17 May 2008 à 12:24
Citation de: xter757288
Merci pour le lien Heyoka. Tu viens de me faire découvrir un super site gouvernemental ;)

ça fait plusieurs mois que je l'utilise, c'est une excellente source d'informations. D'ailleurs de nombreux sites scientifiques utilisent cette source pour la plupart de leur articles.
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: xter757288 le 17 May 2008 à 12:37
Citation de: tibidao
ça fait plusieurs mois que je l'utilise, c'est une excellente source d'informations. D'ailleurs de nombreux sites scientifiques utilisent cette source pour la plupart de leur articles.

Ca ne m'étonne pas. De ce que j'ai vu, c'est un site assez exaustif, et d'une bonne qualité rédactionnelle. Un trés bon emploi de nos impôts.

edit: d'ailleurs je viens de l'ajouter à mes favoris. :love:
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: rom_185 le 17 May 2008 à 15:38
Citation de: rom_185
C'est vrai...ha j'ai une idée diabolique dans la tête....  :D

J'en reparlerai...  :p

Voila, j'ai donc présenter le jeu foldit à toute ma classe dans le cadre d'un exposer sur "le progrès".
J'ai donc choisi "le progrès dans la lutte contre le SIDA", j'ai parler de rosetta et de foldit avec des captures d'écrans (j'avais fais ça sous forme d'un mini site internet :p).
Mais je crois qu'il n'ont rien compris car aucun ne ma demander de conseilles pour installer soit BOINC, soit foldit soit les deux [:douglas riper:2] .
Dommage, j'aurai essayé :/.
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: Hildor le 17 May 2008 à 16:13

Bah! c'est dur la vie de militant !  :D

obstination, obstination !
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: xter757288 le 17 May 2008 à 16:26
Citation de: rom_185
Voila, j'ai donc présenter le jeu foldit à toute ma classe dans le cadre d'un exposer sur "le progrès".
J'ai donc choisi "le progrès dans la lutte contre le SIDA", j'ai parler de rosetta et de foldit avec des captures d'écrans (j'avais fais ça sous forme d'un mini site internet :p).
Mais je crois qu'il n'ont rien compris car aucun ne ma demander de conseilles pour installer soit BOINC, soit foldit soit les deux [:douglas riper:2] .
Dommage, j'aurai essayé :/.


De toute facon, on sait trés bien que personne n'écoute les exposés  :sarcastic:
Plus sérieusement, c'est une première approche. On ne peut pas obliger les gens à participer, mais le plus important c'est d'en parler et je suis persuadé que petit à petit, l'idée de la science participative (BOINC, fold it, etc...) va se répandre.
Aprés tu as peut etre trop insisté sur l'aspect technique et pas assez sur le fait que n'importe qui peut participer, et surtout eux (je suppose). Il vaut veiller à ne pas etre trop technique sous peine de perdre l'attention de l'auditeur.
Autre conseil à d autres personnes qui souhaitent faire des exposés: donner une feuille avec des liens internet pour s inscrire et pour de l'info.
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: rom_185 le 17 May 2008 à 18:23
Citer
Aprés tu as peut etre trop insisté sur l'aspect technique et pas assez sur le fait que n'importe qui peut participer, et surtout eux (je suppose). Il vaut veiller à ne pas etre trop technique sous peine de perdre l'attention de l'auditeur.
C'était donc ça !  [:mab74fr]
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: al@ON le 17 May 2008 à 18:26

 [:al@on:3] rom, tu as été noté pour ce travail?
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: Hildor le 17 May 2008 à 18:49

Si le prof n'a rien compris non plus  :pt1cable:

Aye ! la note
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: al@ON le 17 May 2008 à 18:54
Citation de: Hildor
Si le prof n'a rien compris non plus  :pt1cable:

Aye ! la note
[spoiler]Ce n'était pas écrit mais oral. :whistle: [/spoiler]
Je suis déjà dehors!!!............................................................................... [:douglas riper]
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: xter757288 le 17 May 2008 à 19:12
Citation de: Hildor
Si le prof n'a rien compris non plus  :pt1cable:

Aye ! la note



Ca dépend, déja le prof était pas en grève, ce qui est une bonne chose pour essayer de comprendre l'exposé  :D
Il peut trés bien comprendre et mettre une bonne note, ou ne pas comprendre et mettre une bonne note parce qu il a eu l'impression que c'était intelligent
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: rom_185 le 17 May 2008 à 19:27
Citation de: al@ON
[:al@on:3] rom, tu as été noté pour ce travail?
Je sais pas encore :p.

Citation de: al@ON
[spoiler]Ce n'était pas écrit mais oral. :whistle: [/spoiler]
Je suis déjà dehors!!!............................................................................... [:douglas riper]
Bah.. les deux en fait puis que j'ai du donné la page Oueb à la fin  ;).
 
Citer
Ca dépend, déja le prof était pas en grève, ce qui est une bonne chose pour essayer de comprendre l'exposé  :D  

C'était hier donc pas de grèves, de toute façon aucun de mes cours n'ont sautés  :kaola: ....
Citer
Il peut trés bien comprendre et mettre une bonne note, ou ne pas comprendre et mettre une bonne note parce qu il a eu l'impression que c'était intelligent
:lol:
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: Caius666 le 18 May 2008 à 12:14
Concernant le nombre de points attribués et le classement :

Citer

Our servers have been having trouble dealing with  the overwhelming influx of users, and we temporarily disabled ranking and global scores. (They required surprisingly expensive database queries.). We will reenable them soon, and all your rankings and scores will be computed retroactively correctly.

The way it will work is this: every time a puzzle expires, everyone's top score and rank are frozen. Then global points (betwee 1 and 100) will be assigned to each player depending on thier ranking. Those points accumulate across all puzzles, determing your global game rank.



Pour résumer, l'afflux de nouveaux joueurs fait que l'établissement du score et du classement surcharge les serveurs, ils ont donc préféré les désactiver pour l'instant. Plus tard en les réactivant tout le monde devrait avoir son score mis à jour correctement.
A chaque fois qu'un puzzle se termine, le score et le classement sont bloqués, les points reçus pour le classement sur le site de Fold.it vont de 0 à 100 et son attribués en fonction de la place finale pour le puzzle.
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: xter757288 le 21 May 2008 à 14:27
http://www.futura-sciences.com/fr/sinformer/actualites/news/t/internet/d/en-video-foldit-le-puzzle-pour-aider-la-science-en-jouant_15589/

Article sur futura-sciences :)
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: Heyoka le 26 May 2008 à 18:09
ça y est l'affichage du score fonctionne, mais le classement général ne marche par encore

Voici le top5 de l'AF :

1. Bolby : 369
2. Heyoka : 302
3. Svenn : 252
4. Caius Corp. : 241
5. Kaddict : 177
5. Miseka : 177
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: rom_185 le 30 May 2008 à 19:44
Je viens de recevoir cet MP :
Citer
From: philou.canaillou (#218)
To: rom_185 (#354)
Subject: Erreur au moment de la connection au serveur
Date: Fri, 05/16/2008 - 18:04

Bonjour
pourquoi quand je me connecte à Fold It je rencontre l'erreur suivante:
Response code 404 from url "https://fold.it/portal/comm/whoami.cvs"

Merci d'avance

Philou
C'est son par feu ?
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: Heyoka le 01 June 2008 à 20:50
Un article du journal le monde :

Si tous les joueurs du monde... voulaient aider la recherche (http://www.lemonde.fr/technologies/article/2008/05/31/si-tous-les-joueurs-du-monde-voulaient-aider-la-recherche_1052192_651865.html)

Le classement marche, L'Alliance Francophone est 6ème : http://fold.it/portal/view/adobe_list_groups
Il est maintenant possible de partager ses solutions avec les autres membres de l'équipe.
Il faut aller dans Files, Open/Share Solutions.

D'autres nouveautés :
la possibilité d'ouvrir un chat avec les membres de l'équipe, les personnes jouant sur le même puzzle que nous
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: pas93 le 05 June 2008 à 12:22
http://boincedls.free.fr/forum/viewtopic.php?t=784

Quelqu'un peut lui donner des infos ?
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: xter757288 le 06 June 2008 à 18:41
http://www.bulletins-electroniques.com/actualites/54674.htm

petite news sur fold it sur le site bulletins electroniques :)
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: TaxxorbaK le 01 July 2008 à 15:26
Je me suis inscrit dans l'AF (nous sommes désormais 103)  :)

J'ai fini les tutoriels et j'ai commencé mes premiers vrais pliages ! (que d'émotions  [:frederic] !)
Pour l'instant, j'ai pas encore de point, mais je pense qu'il faut attendre une mise à jour comme pour Boinc
Et là, j'ai fait un honorable :
8ème place (AF est 3ème avec mon score) sur
63 Beginner: Spinach Protein
et un :
26ème rang (AF 7ème : pas moi !) sur
62 Beginner: Halorhodopsin

Et finalement, je trouve que c'est assez addictif comme petit jeu !
J'y retournerai ce soir, alors améliorez vos scores ! :p
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: rom_185 le 01 July 2008 à 17:17
 :hello:
 :jap: Taxx !
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: TaxxorbaK le 02 July 2008 à 14:30
Tiens, un gars vient de remarquer qu'il y a des petits malins qui n'arrêtent pas de changer d'équipe !!  :sweat:
Y'en a un par exemple qui a appartenu à au moins 5 équipes (dont l'AF). Je dis au moins 5 car j'ai regardé son profil rapidement et quelques unes des meilleures équipes et il apparait à chaque fois ou presque.
Il semble qu'il veuille se servir des meilleurs modèles.
Enfin si y'en a un qui le fait, il doit pas être tout seul à y avoir pensé.


Comme je veux laisser le bénefice du doute, j'ai pensé à deux options.

1 : Il rejoint l'équipe qui a le meilleur modèle, l'améliore (juste pour lui) ou non, prend les points et basta ! Il fait ça uniquement pour le score. Dans ce cas, on peut dire que c'est un tricheur, c'est un parasite.

2 : Il rejoint l'équipe qui a le meilleur modèle, l'améliore s'il peut, upload le meilleur modèle dans tous les cas (et il peut aussi uploader dans d'autres équipes quand il change). Bref, il diffuse l'information, améliore les modèles et donc fait avancer la recherche, ce qui est dans ce cas son but premier ! Alors là, on peut pas vraiment lui reprocher de changer d'équipe, bien que ça ne "paraisse" pas fairplay.

J'ai mis un message similaire sur le forum du jeu.
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: power600 le 26 December 2008 à 12:02
A priori on ne peut pas "emmener" un modèle d'un team à une autre.
Je viens de rejoindre l'AF et ma belle molécule de sans team est irrécupérable  :o

Bon, ceci est un up déguisé mais chut  :o  :D
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: samuel debergh le 10 January 2010 à 11:53
je n'arrive pas à m'inscrire le @ ne marche pas ! aider moi sil vous plais. ( c'est bon je me suis inscript via le site)
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: LOCTET SetiOne le 10 January 2010 à 18:38
je n'arrive pas à m'inscrire le @ ne marche pas ! aider moi sil vous plais. ( c'est bon je me suis inscript via le site)
Décembre 2008 à ... aujourd'hui + question & réponse = magnifique déterrage (http://www.europe-tp.com/img_vi/1/6/129677-pelle_sur_chenilles-occasion_th.jpg)

 :marcp:
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: samuel debergh le 11 January 2010 à 00:21
je m'autosuffis parfois  ^^. (décembre 2008) ton humour n'a pas de limite!
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: julien76100 le 26 August 2010 à 20:56
Petit article qui date de 20 jours, paru dans le Monde.fr. Dommage, aucun mot sur Boinc.

http://playtime.blog.lemonde.fr/2010/08/08/la-biochimie-est-un-jeu-de-briques/#xtor=RSS-3208 (http://playtime.blog.lemonde.fr/2010/08/08/la-biochimie-est-un-jeu-de-briques/#xtor=RSS-3208)
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: JeromeC le 02 June 2011 à 18:25
Ca marche toujours ce truc ou c mort et enterré ?
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: al@ON le 03 June 2011 à 01:37
Il te suffit de cliquer sur le lien que j'ai mis dans ce message http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2323.msg280079.html#msg280079 (http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2323.msg280079.html#msg280079) pour le savoir... vu les dates affichées pour les news le site à l'air bien vivant.
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: JeromeC le 03 June 2011 à 16:59
Il te suffit de cliquer sur le lien que j'ai mis dans ce message
Non merci :D
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: luger11 le 23 September 2011 à 23:48
fold it fait avancer la recherche contre le sida

http://www.maxisciences.com/vih/une-enigme-du-virus-du-sida-resolue-par-les-adeptes-d-039-un-jeu-en-ligne_art17088.html
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: JeromeC le 25 September 2011 à 12:56
Excellent ! Cool ! Glop glop ! :bounce:
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: [AF>Libristes>Jip]Augure le 01 October 2011 à 00:16
 :kookoo:
merci de l'avoir déplacé... je le trouvais pas (j'ai du faire une faute de frappe)... j'allais le recréer !  :electric:

bon, ben je vais rejoindre la petite AF la dessus... tiens d'ailleurs si l'on pouvait se servir de cette plateforme pour réunir les 2 AF se serai mignon nan ?
(AFBoinc et AF51)

mais faudrait aussi changer le texte de présentation du coup...


enfin, je vais m'inscrire et jouer un peu !
(cela me changera de Pymol et de Coot pour ceux qui connaissent  :D )
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: Ryzen le 07 November 2011 à 22:36
Pour les personnes intéressées, il y a un article du développeur de foldit:

http://lemonde-educ.blog.lemonde.fr/2011/11/03/zoran-popovic-les-jeux-scientifiques-vont-revolutionner-les-apprentissages/

Perso j'ai tenté d'y jouer et j'ai pas tout compris...  :siflotte:
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: jobo0502 le 21 November 2011 à 23:34
Bonjour,

Nous sommes un certain nombre, membres de l'AF, jouant sous foldit, a regretter l'absence de maintenance de la page de l'AF sur le site Foldit.
Nous aimerions savoir comment faire pour qu'un nouvel administrateur soit mis en place afin de revitaliser notre présence.

Pourriez vous me faire savoir ce qu'il convient de faire afin de redonner vie a cet espace francophone.

Cette page a été mise en place par rom_185 qui ne semble plus actif maintenant

Merci de vos suggestions
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: ousermaatre le 22 November 2011 à 00:36
 :hello:

très bonne question, je fusionne ton message avec le topic adéquat.  :jap:

relai de ta question à a CàA, également.

Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: JeromeC le 24 November 2011 à 21:40
Il semblerait que ça peut se faire, jobo0502 es-tu candidat pour avoir ce rôle ? sinon qui ?
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: jobo0502 le 25 November 2011 à 15:21
Bonjour,

Oui, je suis candidat  après discussion avec plusieurs membres du groupe actifs régulierement
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: ousermaatre le 25 November 2011 à 16:48
Ce qui pourrait être sympa également, c'est que dans en temps, vous puissiez venir ici poster des nouvelles du "jeu".  :jap:
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: jobo0502 le 25 November 2011 à 17:53
Pourquoi pas, on fera peut être des adeptes addictes  :lol:
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: ousermaatre le 25 November 2011 à 17:53
 :D :D
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: jobo0502 le 25 November 2011 à 18:02
Pour commencer, Foldit au micro de France Culture:

http://www.franceculture.fr/2011-09-30-ces-jeux-en-reseau-qui-font-progresser-la-science.html
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: ousermaatre le 25 November 2011 à 18:18
je mets ton lien sur le premier post du topic, merci.  :hello:
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: [AF>Libristes>Jip]Augure le 25 November 2011 à 22:27
dés que j'aurai réinstaller mon Win, je vous rejoindrais ;)
(bien, que je peux peu être déjà rattacher mon compte à l'AF... pas besoin du soft pour cela !)

mais faudra que je me dérouille car cela doit bien faire 2ans que je  n'y ai plus toucher ! :D
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: jobo0502 le 26 November 2011 à 10:36
Toutes les bonnes volontés sont les bienvenues. :kookoo:
Foldit tourne aussi sous unix et mac
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: JeromeC le 26 November 2011 à 15:13
Je transmets à Rom, jobo y'a un pseudo sur ce site? Le tien est le même qu'ici?
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: [AF>Libristes>Jip]Augure le 26 November 2011 à 16:56
tu dis Unix, tu veux dire Linux ?

alors je pourrais le réinstaller ! :D

je connais même plus le mdp de mon compte, le pseudo doit être proche de celui sur le forum par contre ! :D

Citer
note pour plus tard:
penser à un nouveau pseudo car pas mal d'américains me le pique ! :/
enfin c'est pas pire que le sauvage qui était sur "un site de rencontre" avec MON pseudo et qui à 40ans cherchais des demoiselles de 18 à 20ans... merci pour la répute !  :rhaa:
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: jobo0502 le 26 November 2011 à 17:29
Augure, oui je voulais dire Linux (et non unix, des vieux souvenirs qui ressurgissent :hyperbon:)
JeromeC ,oui, même pseudo,  partout pareil sauf, parfois,  les mdp :/
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: al@ON le 26 November 2011 à 17:42
Me suis inscrit hier, installé la "bête" sous GNU/Linux.
Je fais l'Intro Puzzles et j'en suis au 13/32 mais j'avoue ne pas comprendre grand chose, il faut bien dire que les astuces (en anglais) ne m'aide qu'à peine. :/

Si toussa pouvait être traduit... :ange:
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: jobo0502 le 26 November 2011 à 17:46
Augure, je ne vois pas de joueur "Augure" dans l'AF Foldit ??? :??:
Tu peux peut être de recréer un compte ? :priz2tet:
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: jobo0502 le 26 November 2011 à 17:51
al@on, il y a des tchats pour le groupe ou pour le monde (il y a des intervenants de langue française, ex : Marie Suchard) sur lesquels tu peux demander de l'aide pour démarrer
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: jobo0502 le 26 November 2011 à 17:59
al@ton, tu ne semble pas d'être inscrit à l' AF sur Foldit, c'est une erreur qu'il te faut réparer  :ange:
Titre: Re : Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: [AF>Libristes>Jip]Augure le 26 November 2011 à 18:49
Augure, je ne vois pas de joueur "Augure" dans l'AF Foldit ??? :??:
Tu peux peut être de recréer un compte ? :priz2tet:

effectivement, je ne trouve plus rien et ils ne connaissent pas non plus mon mail ! :??:

je vais me réinscrire ! ;)
Titre: Re : Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: al@ON le 26 November 2011 à 19:02
al@ON :rhaa:, tu ne semble pas d'être inscrit à l' AF sur Foldit, c'est une erreur qu'il te faut réparer  :ange:

Je viens de trouver le lien (pas facile :gno:) pour rejoindre L'AF.

Autrement j'ai farfouillé dans le dossier Foldit et à ce chemin /home/alacon/Foldit/cmp-resources-00000000000000000000000000000000/resources/locale il y a le fichier foldit.fr.po (traduction de l'interface du jeu), mais nulle part dans les menus du jeu je n'ai su trouver le choix du changement de langue. :??:
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: [AF>Libristes>Jip]Augure le 26 November 2011 à 19:09
moi je suis allé dans le classement des équipes, et l'AF à été très facile à trouver car dans le TOP10 ! :D
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: al@ON le 26 November 2011 à 19:20
Je ne parlai pas de trouver l'équipe, mais de la rejoindre. :p
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: [AF>Libristes>Jip]Augure le 26 November 2011 à 19:23
ben comme chez boinc, sur la page de l'équipe tu as un icon "rejoindre", enfin le principale est que nous y soyons ! ;)

sinon, je pense que l'AF peu viser la 6ème place nan ? :D
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: al@ON le 26 November 2011 à 19:25
Pour ça il va falloir que je m'entraîne encore beaucoup, beaucoup. :D
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: jobo0502 le 26 November 2011 à 19:34
al@ON
Effectivement; l'instal de foldit ne propose pas la langue par défaut.
Un post sur le  forum de l"AF indique comment franciser l'interface.
Cette " francisation " est partielle car dépendant des volontaires, des bonnes volontés et des capacités de bilinguisme.
Personnellement, je suis plein de bonne volonté mais un quart bilingue, ce qui est un sacré handicap dans ce monde anglo-saxon (et cela malgré mes efforts...., je ne suis pas 'doué' pour les langues :o)
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: jobo0502 le 26 November 2011 à 19:57
Augure,
Je pense en effet que nous pouvons faire mieux que cette 8eme place actuelle...
Notre problème est le manque de participation.
En l'état actuel de nos connaissance, aucun algorithme ne peut décrire la structure 3D d'une protéine.
Seuls le nombre et la diversité nous permettent d'y approcher.
La découverte récente est affaire de  "coup de pot".
Ce qui est à la fois inhibiteur mais aussi plein d'espoir.
 Foldit, ce n''est pas du poker,
 Foldit, c'est une graine dans le vent...


Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: [AF>Libristes>Jip]Augure le 26 November 2011 à 20:09
juste comme ca... mais cela n'a rien à voir !

Il existe pas mal d'algorithme qui peuvent prédire des structures (dont 2 très bien optimisé et codé par les initiateur de Fold'it ;) ).
et si tu as une prot dont la structure est connue (Cristalo ou RMN) avec une séquence proche (30% d'homologie) alors pas mal de prog peuvent être TRES précis ! ;)

... c'est mon ancien boulot !  :D

je veux pas perdre la main, d'où mon envie de plier un peu à la main ! :p
Titre: Re : Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: al@ON le 26 November 2011 à 20:13
al@ON
Effectivement; l'instal de foldit ne propose pas la langue par défaut.
Un post sur le  forum de l"AF indique comment franciser l'interface.
Cette " francisation " est partielle car dépendant des volontaires, des bonnes volontés et des capacités de bilinguisme.
Personnellement, je suis plein de bonne volonté mais un quart bilingue, ce qui est un sacré handicap dans ce monde anglo-saxon (et cela malgré mes efforts...., je ne suis pas 'doué' pour les langues :o)

Peux-tu me donner ce lien car j'ai effectué une recherche et n'ai rien su trouver. :spamafote:
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: jobo0502 le 27 November 2011 à 11:54
Voici la manip pour passer foldit en français (je la poste ici, cela peut éventuellement servir à d'autre)

1)récuperer le fichier de traduction (foldit.fr.po):
http://dl.free.fr/rRscVRjj7

2)le déposer dans le dossier des fichiers de données de foldit:
(The data files are in different places depending on your OS:
---on Windows:
if you installed after 8/23/2011, they will be in your installation directory (the default is C:\Program Files\Foldit\ or C:\Program Files (x86)\Foldit\)
if you installed prior to 8/23/2011:
on Windows XP at C:\Documents and Settings\All Users\Application Data\Foldit\
on Windows 7 and Vista at C:\ProgramData\Foldit\
---on a Mac, Ctrl-click on the app and choose "Show Package Contents, then go to Contents/Resources
---on Linux, is is the Foldit directory
)
3) modifier le fichier option.txt (du dossier de foldit) en rajoutant la ligne:
"langage"="fr"

4) relancer foldit

(voir ici: https://fold.it/portal/node/989342 )
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: ousermaatre le 27 November 2011 à 12:23
merci jobo, ajout au premier post.
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: [AF>Libristes>Jip]Augure le 27 November 2011 à 13:22
j'ai modifié aussi un peu-t'i-peu le premier post (j'ai rien changé à part l'ordre des choses pour que le plus important soit visible en premier... mais vous pouvez me demander de revenir en arrière ! ;) ) !

manque 5lignes pour expliquer ce que c'est à mon avis... sinon c'est nickel :jap: !
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: JeromeC le 27 November 2011 à 22:45
@jobo: j'ai transmis, à suivre.
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: al@ON le 27 November 2011 à 23:33
Merci jobo pour les liens :jap:... mais ça ne change pas grand chose. :spamafote:
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: jobo0502 le 01 December 2011 à 17:10
A partir du 2 décembre foldit participe au CASP ROLL ( http://predictioncenter.org/news.cgi#107 ) .

Le CASP est un projet dont l'objectif est d'évaluer de manière critique les différentes méthodes permettant la prévision de la structure des protéines.

Depuis 1994, le "Protein Structure Prediction Center" ( http://predictioncenter.org/index.cgi ) met donc en compétition différentes équipes scientifiques dont le passe temps favoris est de trouver le moyen de savoir à quoi ressemble une protéine. Ensuite, le Centre critique, évalue les méthodes (algorithmes)  utilisées et propose des axes d’amélioration.

Foldit participe à cette  compétition afin de voir si l'imagination, l'inspiration de petits bonhommes joueurs (dont la plupart ne connait rien à la biologie) peut par leurs prédictions, rivaliser  avec des grosses machines bourrées d'algorithmes rationnels.

Voici les résultats de foldit à la dernière session : http://fold.it/portal/node/989010

L'on peut constater que si ce n'est pas toujours brillant, des joueurs humains font mieux que les machines dans certains cas.
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: [AF>Libristes>Jip]Augure le 01 December 2011 à 21:26
si mes souvenirs sont bon, es créateurs de fold'it la gagne depuis plusieurS années cette compète ! ;)

mais d'ailleurs, c'est l'algo informatique de Fold'it qui est bon ou l'imagination des joueurs ?
car au final, nous ne faisons que jouer avec un program informatique qui nous dit si oui ou non nos prot sont bien !

alors je suis pas sur que nous pouvons dire que c'est l'homme contre le machine ! ;)
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: JeromeC le 02 December 2011 à 07:26
@jobo : "Fait ! Qu'il me dise si ça marche !"
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: jobo0502 le 02 December 2011 à 18:19
@JeromeC: Ça marche, je suis admin. Merci beaucoup.
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: jobo0502 le 02 December 2011 à 18:44
@Augure: Foldit a été en tête pour certaines des protéines en compétition (2 je croies pour le dernier CAPS 9), bien placé pour pas mal, et aux confins pour le reste, en moyenne c'est pas trop mal.

mais d'ailleurs, c'est l'algo informatique de Fold'it qui est bon ou l'imagination des joueurs ?

Non, le joueur défini la structure, la forme de la protéine et l'algo informatique tente de trouver le meilleur niveau d'énergie à partir de cette conformation, certes, l'ordinateur ne travaille pas pour rien, alors disons que c"est une construction en partenariat cerveau-processeur dont le l'homme est l'architecte et la machine l'entreprise en batiment.
Pour ce qui concerne l'imagination, le jeune qui a trouvé la meilleure structure de la fameuse protéine de l'article de "nature", à la question "Comment avez vous fait?" a répondu :"c'était la forme qui me plaisait le mieux"- citation de mémoire donc non textuelle-.
Il y a aussi une part d'esthétique, d'inspiration, car la logique de la nature nous imprègne et fait que nous la trouvons belle ou adéquate. Le poète rejoint le scientifique :love:
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: Maurice Goulois le 03 December 2011 à 01:03
Magnifiquement dit  :jap:
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: JeromeC le 03 December 2011 à 19:34
Pouet pouet ! J'avais essayé le pliage, une fois, environ 10mn :D

Mais bon j'ai des enfants alors je préfère les plier eux, c'est plus gratifiant.
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: jobo0502 le 03 December 2011 à 21:01
@JeromeC
l y a aussi une part d'esthétique, d'inspiration à plier des enfants car la logique de la nature nous imprègne et fait que nous la faisons belle et adéquate. Le père  rejoint le poète et l'architecte... :??:
Bon, enfin, de futures recrues :lol:
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: JeromeC le 04 December 2011 à 00:15
Bon pour le moment ils sont pas trop partis pour être des férus en info, pour ce qui est du pliage c'est plutôt les avions qui les intéressent, mais c'est peut-être un commencement ?
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: jobo0502 le 04 December 2011 à 16:02
@ousermaatre,

Pourrais tu rectifier dans le premier poste pour la traduction de foldit il ne s'agit pas de "langage"="fr" mais "langage":"fr" (2 points au lieu de égal).
Je me suis trompé :priz2tet:
Merci d'avance
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: ousermaatre le 04 December 2011 à 17:06
 :hello: fait.
Titre: Re : Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: fzs600 le 04 December 2011 à 17:27
:hello: fait.
Et oui !! on vous l'avait bien dit ma bonne dame,les Christian ...........c'est les meilleurs.  :lol:
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: ousermaatre le 04 December 2011 à 17:27
 :hello:  :D
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: jobo0502 le 23 January 2012 à 14:57
Nouvel article dans Nature:

http://www.nature.com/news/victory-for-crowdsourced-biomolecule-design-1.9872
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: ousermaatre le 23 January 2012 à 15:24
 :hello:
jobo0502

merci

l'un d'entre vous, va-t-il le traduire en français ?

Si personne le fait, je le traduirais volontiers.
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: jobo0502 le 24 January 2012 à 00:15
 :kookoo:

Je n'ai qu'une offre pour une traduction partielle alors si tu veux bien t'y mettre, la Francophonie entière t'en sera reconnaissante  :hap:
(si tu peux poster ta traduc sur le forum foldit de l'AF, se serait génial)
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: ousermaatre le 24 January 2012 à 00:27
je traduirais "crowdsourced" par  le "code source"  ou de "souche" ( native )

quelqu'un pense à autre chose ?

le titre donnerait :

"Victoire dans la conception du code source de biomolécules"
ou
"Victoire dans la conception de biomolécules souches"
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: Maurice Goulois le 24 January 2012 à 01:37
Crowsourcing pour moi c'est ça : http://fr.wikipedia.org/wiki/Crowdsourcing (http://fr.wikipedia.org/wiki/Crowdsourcing)

C'est le fait de faire participer un grand nombre de personnes à la conception/exécution... d'un projet (typique de BOINC :) et autres grids). Ca s'applique à tous les domaines, pas seulement le calcul distribué.

"participation des masses" serait une approximation :); "externalisation ouverte", c'est pas clair pour la plupart des gens.

"Victoire pour la conception de biomolécules par participation volontaire massive", c'est approchant, mais pas très réussi côté esthéthique :)

ou

"Victoire pour la conception de biomolécules par participation massive du public", le sens est là, la formule peut-être pas.

La notion de masse n'est pas forcément utile, le concept de base c'est crowd/foule (et donc pas nécessairement professionelle du domaine visé).

"Victoire pour la conception de biomolécules par participation du grand public", pourrait mieux convenir.
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: ousermaatre le 24 January 2012 à 01:45
Victoire dans la conception de biomolécules grâce à une participation massive de bénévoles.

12 janvier 2012

par Jessica Marshall


Des joueurs assidus ont réussi à dépasser, avec leurs ordinateurs, les recherches des scientifiques
pour améliorer un modèle standard d'enzyme, selon ces chercheurs, il s'agit de la première refonte
complète  d'une protéine grâce aux travaux de bénévoles.

Le jeu en ligne Fold It, développé par l'équipe universitaire Washington de Seattle , sous la direction
conjointe de Zoran Popovic, directeur du "Center for Science Game" et  du biochimiste David Baker, permet
aux joueurs de replier harmonieusement des protéines sur leur ordinateur personnel à la recherche
des meilleures configurations possibles et ainsi de découvrir celle qui dépense le moins d'énergie.

Les chercheurs avaient déjà parlé du succès important des joueurs de Fold It sur les travaux du repliement
des protéines. Plus récemment ils ont décidé d'intensifier le travail sur Fold It dans le domaine de la conception
de protéines, un problème fastidieux, mais abordable pour la majorité des utilisateurs.
Une série de puzzles complexes a été dévoilée aux plieurs. Puis les chercheurs ont testé les variations sur les
meilleurs dessins des joueurs en laboratoire, et, ainsi ils ont créé une enzyme avec une activité énergétique plus
utile (bénéfique) que l'original. Le travail est publié aujourd'hui dans la revue Nature Biotechnology .

" J'ai travaillé pendant deux ans afin d'améliorer ces enzymes, mais je n'y suis pas arrivé, explique Justin Siegel, un
chercheur postdoctorant travaillant en biophysique dans l'équipe de D.Baker. Les plieurs de Fold It ont été capables
d'effectuer un saut énorme pour l'avancée de la conception structurelle des protéines et je n'ai pas encore compris
totalement comment ils ont réussi ce coup de maître."

Le projet a progressé de manière exponentielle, grâce aux bénévoles qui ont fait don de puissance (ordinateur) pour la
recherche, sur la structure des protéines. Afin également de prédire activement les structures protéiques
et, maintenant, pour la conception de nouvelles protéines de rechange sur leurs ordinateurs. Le jeu a 240 000 joueurs
inscrits et 2 200 nouveaux plieurs depuis la semaine dernière.

Le dernier effort à produire impliquait une enzyme augmentant la vitesses de réaction (catalyseur enzymatique) en chimie
de synthèse appelée réaction de Diels-Alder. Les membres de cette grande famille des réactions sont utilisés dans l'Industrie
pour la synthèse allant des médicaments aux pesticides, mais les enzymes qui catalysent la réaction de Diels-Alder
sont restées insaisissables. En 2010, Baker et son équipe ont signalé qu'ils avaient conçu une enzyme Diels–Alderase
fonctionnelle informatiquement à partir de scratch3, mais, a dit alors Baker:  " Ce n'est pas une enzyme adéquate ".
La poche de liaison pour la paire de réactifs est trop ouverte et l'activité est trop faible.
Après que leurs tentatives pour améliorer l'enzyme plafonnèrent, les scientifiques se sont tournés vers Foldit.

Les chercheurs de FoldIt ont demandé aux utilisateurs de remodeler une des quatre boucles d'acides aminés de l'enzyme
pour augmenter le contact avec les réactifs, sur un puzzle. Sur une autre de ces structures, les joueurs ont été invités
à concevoir une enzyme qui stabiliserait la nouvelle boucle. Les chercheurs étudieront près de 70 000 dessins pour le
premier puzzle et 110 000 pour le deuxième, puis ils ont synthétisé un certain nombre d'enzymes de test basé sur les
meilleurs dessins, entraînant finalement l'enzyme finale, 18-fois-plus-active.

La science intuitive


"C'est un apport rafraîchissant sur le génie enzymatique", explique Stefan Lutz, chimiste à l'Université Emory
à Atlanta, en Géorgie, qui n'était pas impliqué dans la recherche.
"L'aide des joueurs de Foldit permet aux chercheurs d'utiliser l'intuition humaine à une échelle qui est sans précédent."

Le jeu Foldit permet aux plieurs d'explorer et d'opérer des changements plus radicaux de la protéine grâce à l'aide de
méthodes standards, tel que l'évolution dirigée ( en injectant une importante quantité d'enzymes aléatoires mutantes
qui amélioreront sensiblement l'original). Ces mutations sont généralement des subtituts d'acides aminés, et donc, les
plieurs ne testent pas les 13 acides aminés principaux en même temps. Ce qui amenerait pour chaque puzzle d'énormes
changements, il faudrait alors tester un nombre astronomique de protéines.

"Vous pouvez explorer les choses les plus folles. Lorsque nous avons  vu cette conception particulière, nous pensions
que celà était impossible et carrément dingue," explique Donald Hilvert, biochimiste à l'Ecole polytechnique fédérale
de Zurich (Suisse), qui collabore avec les chercheurs de l'équipe Baker afin d'affiner la protéine par évolution dirigée.

A ce jour, il n'y a aucune appliquation immédiate de cette découverte sur l'enzyme de Diels-Alder, par comparaison avec
des enzymes naturelles qui catalysent les réactions, elle n'est pas très active. Mais elle marque une étape importante
en démontrant que la participation massive de bénévoles peut aider sérieusement la science.

David baker et son équipe sont maintenant à la recherche de cibles plus utiles. L'équipe a signalé l'an dernier qu'ils avaient
conçu des inhibiteurs de petites protéines qui se lient à et bloquent le virus 4 d'une pandémie de grippe de 1918.
"Maintenant, les joueurs de Foldit travaillent afin de construire des inhibiteurs plus puissants", résume Baker.
"Ceux-ci sont intéressants car ils pourraient devenir des médicaments."
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: JeromeC le 24 January 2012 à 12:51
Splendide :jap:
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: Maurice Goulois le 24 January 2012 à 14:53
Nickel  :jap:
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: al@ON le 24 January 2012 à 18:50
 :oki:
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: JeromeC le 25 January 2012 à 21:52
Nickel, y'a plus qu'à publier maintenant ! Bon c'est pas du boinc... ça aurait sa place sur le portail ?
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: al@ON le 25 January 2012 à 22:11
En faisant une recherche sur le Portail j'ai trouvé 5 articles sur Fold It.

Faut juste spécifier que c'est un projet non BOINC. :spamafote:
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: ousermaatre le 25 January 2012 à 22:28
 :hello:

oui, on pourra le publier sur le portail, comme vient de dire al@ON, il existe une section projet non-boinc.

En revanche, je n'ai pas encore terminé la traduction, me reste la moitié, environ.
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: JeromeC le 25 January 2012 à 22:39
Ah ok, let us know.
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: ousermaatre le 25 January 2012 à 22:43
 :smak:   :hello:
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: ousermaatre le 06 February 2012 à 18:04
Voilà, la traduction de l'article est complétée, j'espère avoir éclairci et rendu au mieux son contenu :

Victoire dans la conception de biomolécules grâce à une participation massive de bénévoles.

12 janvier 2012

par Jessica Marshall


Des joueurs assidus ont réussi à dépasser, avec leurs ordinateurs, les recherches des scientifiques
pour améliorer un modèle standard d'enzyme, selon ces chercheurs, il s'agit de la première refonte
complète  d'une protéine grâce aux travaux de bénévoles.

Le jeu en ligne Fold It, développé par l'équipe universitaire Washington de Seattle , sous la direction
conjointe de Zoran Popovic, directeur du "Center for Science Game" et  du biochimiste David Baker, permet
aux joueurs de replier harmonieusement des protéines sur leur ordinateur personnel à la recherche
des meilleures configurations possibles et ainsi de découvrir celle qui dépense le moins d'énergie.

Les chercheurs avaient déjà parlé du succès important des joueurs de Fold It sur les travaux du repliement
des protéines. Plus récemment ils ont décidé d'intensifier le travail sur Fold It dans le domaine de la conception
de protéines, un problème fastidieux, mais abordable pour la majorité des utilisateurs.
Une série de puzzles complexes a été dévoilée aux plieurs. Puis les chercheurs ont testé les variations sur les
meilleurs dessins des joueurs en laboratoire, et, ainsi ils ont créé une enzyme avec une activité énergétique plus
utile (bénéfique) que l'original. Le travail est publié aujourd'hui dans la revue Nature Biotechnology .

" J'ai travaillé pendant deux ans afin d'améliorer ces enzymes, mais je n'y suis pas arrivé, explique Justin Siegel, un
chercheur postdoctorant travaillant en biophysique dans l'équipe de D.Baker. Les plieurs de Fold It ont été capables
d'effectuer un saut énorme pour l'avancée de la conception structurelle des protéines et je n'ai pas encore compris
totalement comment ils ont réussi ce coup de maître."

Le projet a progressé de manière exponentielle, grâce aux bénévoles qui ont fait don de puissance (ordinateur) pour la
recherche, sur la structure des protéines. Afin également de prédire activement les structures protéiques
et, maintenant, pour la conception de nouvelles protéines de rechange sur leurs ordinateurs. Le jeu a 240 000 joueurs
inscrits et 2 200 nouveaux plieurs depuis la semaine dernière.

Le dernier effort à produire impliquait une enzyme augmentant la vitesses de réaction (catalyseur enzymatique) en chimie
de synthèse appelée réaction de Diels-Alder. Les membres de cette grande famille des réactions sont utilisés dans l'Industrie
pour la synthèse allant des médicaments aux pesticides, mais les enzymes qui catalysent la réaction de Diels-Alder
sont restées insaisissables. En 2010, Baker et son équipe ont signalé qu'ils avaient conçu une enzyme Diels–Alderase
fonctionnelle informatiquement à partir de scratch3, mais, a dit alors Baker:  " Ce n'est pas une enzyme adéquate ".
La poche de liaison pour la paire de réactifs est trop ouverte et l'activité est trop faible.
Après que leurs tentatives pour améliorer l'enzyme plafonnèrent, les scientifiques se sont tournés vers Foldit.

Les chercheurs de FoldIt ont demandé aux utilisateurs de remodeler une des quatre boucles d'acides aminés de l'enzyme
pour augmenter le contact avec les réactifs, sur un puzzle. Sur une autre de ces structures, les joueurs ont été invités
à concevoir une enzyme qui stabiliserait la nouvelle boucle. Les chercheurs étudieront près de 70 000 dessins pour le
premier puzzle et 110 000 pour le deuxième, puis ils ont synthétisé un certain nombre d'enzymes de test basé sur les
meilleurs dessins, entraînant finalement l'enzyme finale, 18-fois-plus-active.

La science intuitive


"C'est un apport rafraîchissant sur le génie enzymatique", explique Stefan Lutz, chimiste à l'Université Emory
à Atlanta, en Géorgie, qui n'était pas impliqué dans la recherche.
"L'aide des joueurs de Foldit permet aux chercheurs d'utiliser l'intuition humaine à une échelle qui est sans précédent."

Le jeu Foldit permet aux plieurs d'explorer et d'opérer des changements plus radicaux de la protéine grâce à l'aide de
méthodes standards, tel que l'évolution dirigée ( en injectant une importante quantité d'enzymes aléatoires mutantes
qui amélioreront sensiblement l'original). Ces mutations sont généralement des subtituts d'acides aminés, et donc, les
plieurs ne testent pas les 13 acides aminés principaux en même temps. Ce qui amenerait pour chaque puzzle d'énormes
changements, il faudrait alors tester un nombre astronomique de protéines.

"Vous pouvez explorer les choses les plus folles. Lorsque nous avons  vu cette conception particulière, nous pensions
que celà était impossible et carrément dingue," explique Donald Hilvert, biochimiste à l'Ecole polytechnique fédérale
de Zurich (Suisse), qui collabore avec les chercheurs de l'équipe Baker afin d'affiner la protéine par évolution dirigée.

A ce jour, il n'y a aucune appliquation immédiate de cette découverte sur l'enzyme de Diels-Alder, par comparaison avec
des enzymes naturelles qui catalysent les réactions, elle n'est pas très active. Mais elle marque une étape importante
en démontrant que la participation massive de bénévoles peut aider sérieusement la science.

David baker et son équipe sont maintenant à la recherche de cibles plus utiles. L'équipe a signalé l'an dernier qu'ils avaient
conçu des inhibiteurs de petites protéines qui se lient à et bloquent le virus 4 d'une pandémie de grippe de 1918.
"Maintenant, les joueurs de Foldit travaillent afin de construire des inhibiteurs plus puissants", résume Baker.
"Ceux-ci sont intéressants car ils pourraient devenir des médicaments."
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: JeromeC le 06 February 2012 à 20:36
J'l'ai publié, je voulais mettre cette jolie nimage

(http://fold.it/portal/site_files/theme/science/thumb-competition.png)

mais j'arrive pas à la mettre en "cartouche" avec le texte à droite, et donc c'est moche, et donc j'l'ai pas mise.

Si y'en a qui savent comment qu'on fait, please siouplait merci.
Titre: Re : Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: polaris_AF le 06 February 2012 à 23:12
...
Si y'en a qui savent comment qu'on fait, please siouplait merci.
:kookoo: C'est fait !
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: JeromeC le 08 February 2012 à 07:55
:jap:
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: ousermaatre le 08 February 2012 à 14:30
merci à Jérôme et Polaris  :smak:

Si vous voulez rajouter un petit mot au texte :

Le jeu Fold It est en relation directe avec le support BOINC, David Baker, administrateur du projet Rosetta@home et Ralph@home, fait le lien entre ces trois

projets. Les puzzles créés par les plieurs de Fold It sont régulièremnet testés par nos ordis grâce au projet Rosetta@home,

Je ne me souviens plus du nom de ces unités, mais le mois dernier quelques unes ont été calculées par nos ordis.
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: JeromeC le 08 February 2012 à 23:23
Ouala.
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: Jejerotto le 02 March 2012 à 15:11
j'ai pas trop pigé le but de Folt it ? il faut déplier les protéines ? il faut arriver à faire le score marqué en haut ?
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: JeromeC le 05 March 2012 à 22:38
J'avoue que quand j'avais essayé (y'a fort longtemps), ça ne m'avait pas passionné et je n'avais pas été très persévérant. Mais visiblement y'en a que ça passionne, comme quoi il faut de tout pour faire un monde :jap:
Titre: Re : le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")
Posté par: fzs600 le 18 January 2015 à 17:44
 :hello:

Ebola puzzle 1000 → http://fold.it/portal/node/2000209 (http://fold.it/portal/node/2000209)