Le Forum de l'Alliance Francophone
Boinc et les projets distribués => Biologie => Discussion démarrée par: pas93 le 17 June 2006 à 14:15
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(https://ralph.bakerlab.org/rah/rah_images/top7_alpha_white.png)
État : actif
Site officiel: http://ralph.bakerlab.org/ (http://ralph.bakerlab.org/)
Application disponible : https://ralph.bakerlab.org/apps.php (https://ralph.bakerlab.org/apps.php)
État du serveur : https://ralph.bakerlab.org/server_status.php (https://ralph.bakerlab.org/server_status.php)
L’alliance francophone : https://ralph.bakerlab.org/team_display.php?teamid=24 (https://ralph.bakerlab.org/team_display.php?teamid=24)
Classement mondial de L'af : https://www.boincstats.com/stats/22/team/list/ (https://www.boincstats.com/stats/22/team/list/)
(http://boincedls.ifrance.com/image2/ralph_at_home_logo.gif)
RALPH@home est le projet alpha officiel d'essai pour Rosetta@home. Des nouvelles versions de l'application, des unités de travail et des mises à jour seront en général évaluées ici avant l'utilisation pour la production. Le but pour RALPH@HOME est d'améliorer Rosetta@home.
Article réalisé par les membres de la Miniteam Equipe de la Science
Mis a jour par fzs600 le 14 mars 2023
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Le projet Rosetta@Home lance son projet en alpha et demande des volontaires
pour aider au developpement de l'appli :
February 15, 2006
Volunteers needed!!
We are seeking volunteers for our new alpha test project, RALPH http://ralph.bakerlab.org
There are a number of recent improvements to the rosetta application but we need volunteers to speed up the process of testing to make the updated application available for production as soon as possible.
If you are interested in helping to improve Rosetta@home and can spare a few extra cycles for testing, please join RALPH@home.
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Bon, j'ai cherché un topic sur Ralph, j'ai trouvé que ça....
J'ai un petit souci, j'ai téléchargé des unités de la nouvelle version, la 5.45, et le calcul se fait mais je reste à 1%...
Du coup je sais pas ce qu'il en est, et sur le forum du projet j'ai rien vu.
Quelqu'un d'autre a ce souci ? je précise à tout hasard que j'utilise toujours la version 5.4.9 :D
Je vais laisser un peu tourner, voir si le calcul se termine...
Ps : dans le titre du sujet, on pourrait pas rendre plus explicite le fait qu'il sagisse du topic pour RALPH ? ;)
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C'est un projet pour tester les applications, donc le but c'est qu'il y ait des bugs et que les personnes qui aient ces bugs postent sur le site de ralph.
Donc, va décrire ton problème sur le message board, c'est la meilleur chose à faire. ;)
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Ben en fait c'est une fausse alerte, j'ai pas fait gaffe mais les calculs se sont bien terminés...
Il semblerait que ce soit juste un problème d'affichage, ça reste à 1% jusqu'à la fin...
Sauvé, je vais pas faire étalage de mon sale niveau en anglais :lol:
Sinon je suis d'accord avec toi, j'aimerais bien savoir s'il est prévu que ça consomme moins à l'avenir. ;)
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Mince, je me suis fait griller sur le message board ralph.
Post un coup, plus il y a de voix qu'il s'élèvent, plus ils se bougeront (ou pas). :D
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ou pas... :lol: c'est ton expression favorite ça.... :D
En fait moi ça me dérange pas énormément, j'ai 768 Mo de ram, mais ça ne participe pas à la démocratisation du projet... à moins de considérer que tout le monde devrait avoir 1 Go de ram... :o
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Voilà la traduction de ce qu'apporte cette nouvelle version :
http://www.boinc-af.org/index.php?option=com_content&task=view&id=396&Itemid=170
Donc ce qu'il faut tester c'est surtout l'écran graphique dans le BoincManager, jouer un peu avec la souris là dedans, puis laisser tourner l'écran de veille.
Puisqu'ils viennent de remettre la visualisation des chaines latérales (les petites ramifications), et la possibilité de faire tourner la protéine avec la souris.
J'ais récupéré 2 unités, on verras ce que ça donne en laissant marcher l'écran de veille
A prioris il ne devrait pas y avoir de problèmes sous Windows, c'est surtout pour les Mac qu'il pourrait y avoir des erreurs à signaler.
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Après le fight sur ABC, faudra qu'on mette le paquet sur Rosetta, notre place est en danger
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Le plus moche c'est que l'on est seulement 14ième
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déterrement de topic, mais qqn a-t-il des news sur l'accessibilité?
Deux jours projet hs.
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On est sur le topic de RALPH est on est 5ième au général
sur Rosetta on est 9ième au général et 4ième au FB
:??: :??: :??:
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je sais qu'on est sur le topic de Ralph, le serveur n'envoie plus d'UT, bloqué depuis 2 jours c'était ça ma question ?
Rosetta j'y suis pas de prob de chargement d'Ut. :jap:
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il y a un sujet ouvert sur le forum de rosetta
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=4762
Mais aucun admin n'a encore répondu
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:jap: merci mamouth
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c'est reparti :bounce:
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:bounce: :bounce: :bounce:
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Ouais, depuis le temps :)
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Pour ceux qui veulent, je signale que je chope régulièrement des unités rosetta mini 1.59. Pour ceux que ça intéresse... :p
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Bonjour a tous,
Mon boinc a telecharger une nouvelle appli pour ralph ce matin : Mini_Rosetta 1.03, resultat plantage complet de BOINC :cry:
J ai pas pu le faire repartir, obliger de desinstaller tout et de recommencer. Je vais attendre que ca soit plus stable pour re-accepter Ralph.
Avez-vous eu le meme probleme?
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Ton problème a peut être un lien avec ce que j'ai trouvé :
Ralph had accidentally included a .svn directory in a zip archive, resulting in a lot of read-only files in its slot directories. When the client attempts to delete these files, each delete fails and the client retries for about 5 seconds. This adds up to a delay of about 20 minutes, during which the client (and Manager) appear to be hung.
Solution:
1) if a file delete fails with error ERROR_ACCESS_DENIED, use SetFileAttributes() to clear the read-only flag, then try again.
2) Don't use the 5-second retry mechanism when clearing out slot directories. These can contain unbounded numbers of files, and this can lead to long periods where the client appears hun
Désolé, pas de trad, je ne fais que passer... :hello:
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Pas de soucis, je te remercie.
Je vis a l etranger et j ai l habitude de parler anglais a longueur de journee.
Si tu veux je peux le traduire pour les autres
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Site inaccessible (403 forbidden) je voulais changer les prioritées,zut pas possible. :/
http://ralph.bakerlab.org/ (http://ralph.bakerlab.org/)
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Le site est de nouveau accessible,mais pour le moment pas de taf. :kookoo:
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:jap:
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:hyperbon:
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du taff, du taff !!!! Vite, vite :hyperbon: :hyperbon:
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nouvelle appli mini rosetta 3.0 pour toutes les plateformes...
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:hyperbon:
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nouvelle appli 3.04 mini rosetta....
http://ralph.bakerlab.org/all_news.php#177
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:hyperbon:
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Nouvelle appli Rosetta Mini Beta 3.13
http://ralph.bakerlab.org/apps.php (http://ralph.bakerlab.org/apps.php)
:hyperbon:
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Pourquoi ses nouvelles versions ne sont déjà pas sur le projet rosetta ?
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Parce que, justement RALPH est là pour cela ! :siflotte:
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Ralph est juste un projet pour tester les nouvelles applis de Rosettta, non ?
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RALPH@home is the official alpha test project for Rosetta@home (http://boinc.bakerlab.org/rosetta). New application versions, work units, and updates in general will be tested here before being used for production. The goal for RALPH@home is to improve Rosetta@home (http://boinc.bakerlab.org/rosetta).
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Exactement :jap:
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:hyperbon:
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:hyperbon: :hyperbon:
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:D le gardien des unités Ralph :jap: merci de l'info
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:D le gardien des unités Ralph
J'ai l'impression par moment d'etre le seul au monde a en recevoir :p
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:cavachier: voyou :D
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J'ai l'impression par moment d'etre le seul au monde a en recevoir :p
Mais non, mais non, j'en suis aussi :D
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:hyperbon:
Mais toute les UT partent en erreurs. :/
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bientôt des unités GPU pour Rosetta ?
Ca serait super. Quand on voit le coup de boost que le GPU a apporté à HCC.
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:hyperbon: :hyperbon:
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:jap:
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23 Apr 2014 17:39:17 UTC 23 Apr 2014 17:45:36 UTC Over Client error Compute error 4.80 0.04
23 Apr 2014 17:39:17 UTC 23 Apr 2014 17:45:36 UTC Over Client error Compute error 5.08 0.05
23 Apr 2014 17:39:17 UTC 23 Apr 2014 17:45:36 UTC Over Client error Compute error 4.66 0.04
:cry:
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Je viens de me créer un compte sur ralph et impossible de trouver l'AF dans les teams :??:
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Essaye là : http://ralph.bakerlab.org/team_display.php?teamid=24
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Merci :) la recherche est donc foireuse :gno:
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Essaie soit d'agrandir (Ctrl++) soit de réduire (Ctrl+-) la taille de la page et il devrait apparaître
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:hello:
Une nouvelle version pour Android est disponible "Rosetta Mini for Android" : http://ralph.bakerlab.org/apps.php (http://ralph.bakerlab.org/apps.php)
Mais ça part en erreur :
21 Jan 2016 6:20:27 UTC 21 Jan 2016 6:34:24 UTC Over Client error Compute error 611.50 2.86 ---
21 Jan 2016 6:20:27 UTC 21 Jan 2016 6:38:44 UTC Over Client error Compute error 170.50 0.80
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Merci je v essayer :hyperbon:
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Pas de x86 comme d'hab, sisi il y a des android x86, j'aimerais diversifier ma GT3 :cry:
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:hello:
Il y a des UT pour Android de disponible.
application Rosetta Mini for Android
2 Dec 2016 7:07:36 UTC 2 Dec 2016 13:15:13 UTC Over Success Done 20,765.46 108.97 108.97
2 Dec 2016 7:07:36 UTC 2 Dec 2016 13:27:12 UTC Over Success Done 21,390.75 112.25 112.25
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Merci pour l'info
Je m'y attache :hyperbon: :hyperbon: :hyperbon:
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Parfait :kookoo:
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Le site du projet a fait peau neuve. :love: :love:
https://ralph.bakerlab.org/ (https://ralph.bakerlab.org/)
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Chouette chouette :D
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Une application est disponible pour le PI. :kookoo:
https://ralph.bakerlab.org/apps.php (https://ralph.bakerlab.org/apps.php)
31 Mar 2020, 7:41:40 UTC 10 Apr 2020, 7:41:40 UTC En cours --- --- --- Rosetta for Portable Devices v4.12
aarch64-unknown-linux-gnu
Il semblerait que l'appli est gourmande en RAM ce qui peut générer des erreurs de calcul. :/
J'ai chopé 4 UT je vais voir ce qu'il se passe.
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:hyperbon:
31 Mar 2020, 7:41:40 UTC 31 Mar 2020, 9:42:03 UTC Terminé et validé 6,989.36 6,912.08 49.24 Rosetta for Portable Devices v4.12
aarch64-unknown-linux-gnu
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:hyperbon:
31 Mar 2020, 7:41:40 UTC 31 Mar 2020, 9:42:03 UTC Terminé et validé 6,989.36 6,912.08 49.24 Rosetta for Portable Devices v4.12
aarch64-unknown-linux-gnu
DietPi1
6748 ralph@home 31-Mar-20 15:41:37 Message from server: This project doesn't support computers of type arm-unknown-linux-gnueabihf
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Dites, j'ai un souci. J'ai chopé du ralph sous Windows et Linux.
J'ai vu que sous Windows j'avais 4 tâches en cours hier matin. Je ne m'en suis pas occupée et hier soir je suis allée sur mon compte (suis encore sous Charity Team) et aucune de renvoyée alors que les tâches affichaient seulement entre 45 min et 1h05 d'avancement. Avant de quitter l'ordi, j'ai sélectionné ces 4 tâches pour qu'elles restent en surbrillance. Normalement, ce matin je n'aurais plus dû avoir de surbrillance: eh ben elles étaient toujours là toutes les 4 avec +- 1h de calcul. Je les ai annulées et je suis repartie sur les 4 suivantes.
Du coup, ce matin j'ai vu que j'en avais 2 en cours sous Linux, j'ai fait pareil - des fois que.
Ça vous est déjà arrivé?
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Pour éviter la surbrillance il faut mettre de la poudre sur le nez.
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:lol:
C'est fait esqueprès ici :p
Edit: et ça aide ;)
Sous Linux: plus qu'une tâche en surbrillance, ça veut dire que l'autre s'est terminée d'une manière ou d'une autre.
Sous Windows: les 4 sont toujours en surbrillance mais une seule affiche 1h28, les trois autres affichent des temps de calcul entre 7 et 10 minutes :pt1cable:
Edit 2:
Sous Linux: 2 tâches prêtes à valider au bout de 59 minutes et quelques secondes :clafete:
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Sur Ralph, Rosetta passe de la version 4.15 à la 4.18 (Windows) et 4.19 (Linux) !
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Il y a du boulot en ce moment, sous Windows et sous Linux mais mes Android ne chopent plus rien, pas grave : 72 tâches en cours :hyperbon:
D'ailleurs l'application est passée en 4.20 sur l'ensemble des plate-formes: Windows/Linux/Mac/Android-ARM/Linux-ARM.
:hello:
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Je n'arrive plus à joindre le projet (un message d'erreur concernant le certificat), ni à le rattacher.
Pourtant la page de statut du serveur semble dire que tout est OK... :??:
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Il y a un problème avec le contenu du ficher ca-cert.bundle. Les projets ralph, rosetta et numberfields sont inaccessibles par BOINC sous Windows
Une des solutions (https://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=14006&postid=96882) est d'arrêter le client BOINC, éditer le fichier ca-bundle.crt (Il est dans le répertoire c:\Program Files\BOINC) et redémarrer BOINC.
L'edition du fiichier consiste en supprimer les lignes suivantes (en mode administrateur):
AddTrust External Root
======================
-----BEGIN CERTIFICATE-----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-----END CERTIFICATE-----
Tu peux aussi télécharger le fichier ca-bundle.crt ici (https://statseb.boinc-af.org/dl/ca-buncle.crt)
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:hyperbon: :hyperbon:
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:hyperbon: :hyperbon:
Oui de temps en temps ça arrive.
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Hop, 34 UT récupérée (et en cours) sous Linux (Ubuntu) avec mon serveur Joes ! :coffeetime:
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Je découvre à l'occasion des 311 uts que j'ai récupérées que minirosetta 4.20 semble être l'appli qui met le plus à mal mes bécanes (il y a ~1,5 To de bases de données) et j'ai des à-coups dans les mises à jour entre les clients et BoincTasks :( chose que je n'ai eu qu'avec nanoHub (en beaucoup pire :eek:).
J'ai 5/8 Go ram utilisés et plus ou moins 380 Go de swap "affectés", pas le pb à priori, mais beaucoup d'e/s sur le disque. Ca concerne surtout LCruncher et LCruncher2 qui sont mes "petites" bécanes :)
Normal :??: pas trouvé de références à ce genre de souci sur le fofo ralph ou rosetta.
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Bizarre, sur LCruncher les nouvelles uts tournent à 33% sur chaque cpu :??: y a que cette bécane qui fait çà; j'ai vérifié les températures, rien de critique mais on est à la valeur de "high", il n'y a que 3/4 cores en calcul cpu pour cause de gtx970; et il n'y a que ralph qui me fait ça.
Ca donne des scores étonnants :)
Sur LCruncher, temps fonctionnemt 41,318.41, temps cpu 13,853.43, points 504.72
Maurice2 (Dell), temps fonctionnement 14,463.99, temps cpu 13,903.82, points 108.32
ZCruncher (Z400), temps fonctionnement 14,355.83, temps cpu 14,306.00, points 90.02
LCrucnher2, temps fonctionnement 14,051.28, temps cpu 13,989.52, points 115.03
Pas de copilote, je suppose qu'ils "paient" le temp de fonctionnement et non le temps de calcul :) ça me fait plus d'heures wuprop aussi :love:
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:hyperbon: :hyperbon: par intermittence depuis quelques jours. Je ne vois jamais les tâches, que les points dans mes stats.
La demande forcée à du bon :ange:
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Une bonne journée pour moi hier sur ce projet!! :bounce:
Presque 19000 pts!! :gniak: :siflotte:
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Sous macOS ?
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:kookoo:
Yes man!!
Je suis un pommeux pur jus :lol: pas de windaube ou autre n'a le droit de cité sur mes machines!!
Même pas avec des VMs! ;-)
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Tu pourras essayer kryptos, ils ont une bonne appli Mac qui est bien stable, sous VB.
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Je viens de voir de nouvelles tâches Ralph sur mon ordi - nouvelle appli: rosetta python projects 0.00 (vbox64)
Nom des tâches: ralph_local_test_15xx_xxxx
Deadline: dimanche 21/2/21
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Je viens de voir de nouvelles tâches Ralph sur mon ordi - nouvelle appli: rosetta python projects 0.00 (vbox64)
Nom des tâches: ralph_local_test_15xx_xxxx
Deadline: dimanche 21/2/21
Merci pour l'info :kookoo:
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Pas terrible le résultat :(
https://ralph.bakerlab.org/results.php?hostid=44699&offset=0&show_names=0&state=0&appid=
Elles sont toutes en erreur de calcul. Et celles qui s'affichent en timeout, sont en fait encore en cours de calcul chez moi, depuis près de 4 jours (3j 16h pour l'une, 3j 18h pour les 3 autres) :pt1cable:
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Pas terrible le résultat :(
https://ralph.bakerlab.org/results.php?hostid=44699&offset=0&show_names=0&state=0&appid=
Elles sont toutes en erreur de calcul. Et celles qui s'affichent en timeout, sont en fait encore en cours de calcul chez moi, depuis près de 4 jours (3j 16h pour l'une, 3j 18h pour les 3 autres) :pt1cable:
Être ATA c'est ça. :D
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Les miennes sont également parties en erreur, je pensais que ça venait de ma machine mais peut-être pas en fait ! :D
:hello:
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J'ai eu des unités à base de python sous VirtualBox qui prenaient 7Go de RAM mais je n'arrive pas à les renvoyer.... :(
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J'ai chopé un lot de tâches mais c'est pas fameux-fameux: Temps de calcul très court (quelques minutes seulement), mais plus d'erreurs de calcul que de valides
https://www.dropbox.com/s/t07pkjep46k1hz0/Capture%20d%27%C3%A9cran%202021-08-25%2017.02.08.png?dl=0
D'après le nom des tâches, je dirais qu'on calcule encore sur du Sars-Cov-2
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Je viens d'en toucher une nouvelle fournée de 61 sur une de mes machines.
On verra demain matin :bonui: :aulit:
:hello:
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Apparemment le projet est terminé. :cavapobienmwa:
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Ou en sommeil jusqu'au prochain développement d'une appli ;)
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Il y a encore de la vie ici. :kookoo:
1 Dec 2023, 10:52:27 UTC 1 Dec 2023, 21:18:12 UTC Terminé et validé 30,458.58 30,189.88 276.55 rosetta python projects v0.21 (vbox64)
windows_x86_64
1 Dec 2023, 10:51:42 UTC 1 Dec 2023, 21:17:24 UTC Terminé et validé 31,252.99 30,106.17 277.56 rosetta python projects v0.21 (vbox64)
windows_x86_64
1 Dec 2023, 10:51:42 UTC 1 Dec 2023, 21:17:24 UTC Terminé et validé 30,898.12 30,076.61 319.57 rosetta python projects v0.21 (vbox64)
windows_x86_64
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Houla, à base de VBox donc. La version "python" de rosetta donc, des tests, donc. Ce qui est bizarre c'est que la version de l'appli annoncée sur le site ralph date de 2021. Ou alors ils se fichent de maintenir la page à chaque (rare) fois qu'ils bricolent ?
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Je viens de choper un peu de taf. Franchement, ils exagèrent avec les fichiers à télécharger !!!
[ This attachment cannot be displayed inline in 'Print Page' view ]
Mais je ne vais pas me plaindre, avant de redémarrer l'ordi, le projet me disait que VBox n'était pas installé :pt1cable:
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Ouais!! J’ai eu la même!!!
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Je viens de choper un peu de taf. Franchement, ils exagèrent avec les fichiers à télécharger !!!
[ This attachment cannot be displayed inline in 'Print Page' view ]
Mais je ne vais pas me plaindre, avant de redémarrer l'ordi, le projet me disait que VBox n'était pas installé :pt1cable:
Les joies des VM ... :siflotte:
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S'ils faisaient l'effort ils pourraient tout à fait faire une VM optimisée en prenant une distrib light et juste ce qu'il leur faut en plus... et je suis sûr que ça pourrait tenir en moins de 5,5 Go... mais bon après si t'installes un bon gros jeu récent ça se chiffre par dizaines de Go, et à chaque MaJ il en rajoute quelques Go...