Le Forum de l'Alliance Francophone

Boinc et les projets distribués => Annonces sur Boinc et les projets => Boinc-projets terminés => Discussion démarrée par: fzs600 le 05 February 2019 à 17:35

Titre: Brainstorm@home
Posté par: fzs600 le 05 February 2019 à 17:35
                                                                                     (https://pix.toile-libre.org/upload/original/1549487982.png)


                                                                                                                                                      (https://www.virtualbox.org/graphics/vbox_logo2_gradient.png)



Infos utiles.
Pour le projet l'installation de Virtualbox est fortement recommander : https://www.virtualbox.org/ (https://www.virtualbox.org/)
Projet de recherche sur les bases moléculaires des maladies liées au cerveau.
Projet affilier a Université Pompeu Fabra : https://www.upf.edu/ (https://www.upf.edu/)



Statut : A l’arrêt
URL du projet : http://brainstormhome.org/ (http://brainstormhome.org/)
Application disponible : http://brainstormhome.org/apps.php (http://brainstormhome.org/apps.php)
État du serveur : http://brainstormhome.org/server_status.php (http://brainstormhome.org/server_status.php)
L'alliance francophone : http://brainstormhome.org/team_display.php?teamid=13 (http://brainstormhome.org/team_display.php?teamid=13)
Classement mondial de L'af : pas de données


Résumé.

Mis a jour par fzs600 le 28 avril 2020

 
Titre: Re : Brainstorm@home
Posté par: naz le 05 February 2019 à 19:15
Je pense que c'est ca : https://fr.wikipedia.org/wiki/R%C3%A9cepteur_NMDA
Titre: Re : Brainstorm@home
Posté par: franky82 le 05 February 2019 à 19:32
Ce projet m'intéresse mais j'ai jamais réussi à finir de tâche VirtualBox !  :/
et toutes les applications sont VBox / MT...
Titre: Re : Re : Brainstorm@home
Posté par: naz le 05 February 2019 à 19:51
Ce projet m'intéresse mais j'ai jamais réussi à finir de tâche VirtualBox !  :/
et toutes les applications sont VBox / MT...

As-tu Java à jour?
Titre: Re : Brainstorm@home
Posté par: franky82 le 05 February 2019 à 20:04
Oui, je mets Java à jour régulièrement !
Titre: Re : Brainstorm@home
Posté par: franky82 le 05 February 2019 à 20:45
5 UT "testsim" finie en 1 mn 15 à 2 mn 15, en attente de validation...
quorum 2 - 
J'ai fait 2 tâches (2 fois) avec le même ordi mais pas validées
Titre: Re : Brainstorm@home
Posté par: toTOW le 05 February 2019 à 22:48
Ca a l'air intéressant ... mais bon VitrualBox quoi ... :/
Titre: Re : Brainstorm@home
Posté par: Antares le 06 February 2019 à 10:59
Virtualbox = Pas pour moi...
Titre: Re : Brainstorm@home
Posté par: JeromeC le 06 February 2019 à 14:11
VirtualBox = pour moi !!!

Je ferai des tests dès que possible :D
Titre: Re : Brainstorm@home
Posté par: Ceclo le 06 February 2019 à 21:23
Chez moi, sur un PC les UT ne sont même pas téléchargées, même après réinstallation Boinc et VB et sur un autre, erreur de téléchargement... Apparemment c'est un projet quelque peu capricieux! :/
Titre: Re : Brainstorm@home
Posté par: nafrayou le 06 February 2019 à 21:32
Hello 

pas d équipe pour l AF pour le moment ?
Titre: Re : Re : Brainstorm@home
Posté par: fzs600 le 06 February 2019 à 21:35
Hello 

pas d équipe pour l AF pour le moment ?
J'ai essayé mais pour le moment c'est impossible.  :/
Titre: Re : Brainstorm@home
Posté par: JeromeC le 06 February 2019 à 22:30
C'est ce qu'on appelle un projet en "alpha test" on dirait :)

Tiens une jolie nimage pour le 1er post du topic :

(http://pix.toile-libre.org/upload/original/1549487982.png)

La news de la page d'accueil date... du 05/09/2018 oO

Notre recherche (http://grib.imim.es/research/gpcr-drug-discovery/research-lines/) :

Citer
Découverte de médicaments dans le cadre du RCPG

Profilage in-silico multirécepteurs des antipsychotiques.

L'efficacité clinique des antipsychotiques a été attribuée à une interaction complexe composée de cibles multiples (en particulier les récepteurs couplés aux protéines G, RCPG) et de mécanismes multiples (p. ex. biais de signalisation, diaphonie des récepteurs) qui déterminent ensemble un modèle distinct de signalisation cellulaire. Dans ce contexte, notre groupe se concentre sur le décryptage des mécanismes moléculaires de cette interaction complexe des antipsychotiques actuels qui sont responsables de leur efficacité clinique. Enfin, nous visons la découverte de nouvelles interventions pharmacologiques et la conception de nouvelles structures principales pour la thérapie antipsychotique.

Les dimères du RCPG comme cible médicamenteuse pour le traitement de la schizophrénie.

Des études récentes ont décrit la dimérisation des récepteurs comme un mécanisme pertinent pour la signalisation médiée par les RCPG. Nous étudions ce phénomène dans le contexte de l'action des antipsychotiques. Notre groupe apporte son soutien à la conception de ligands bivalents qui ciblent sélectivement un dimère GPCR spécifique. D'une part, de telles sondes moléculaires sont extrêmement utiles pour interroger la contribution des dimères aux états psychotiques. D'autre part, ces sondes nous permettent de valider l'utilité des dimères de RCPG comme cible médicamenteuse dans le traitement de la schizophrénie. Une fois qu'une cible est validée, nous appliquons divers outils de calcul pour obtenir d'abord de petites molécules de type médicament (à base de structure/ligand) vers cette cible.

Effets des membranes à médiation lipidique sur la signalisation GPCR.

La composition lipidique des membranes cellulaires peut moduler la fonction de protéines membranaires clés telles que les récepteurs couplés aux protéines G (RCPG). Comme plusieurs maladies ont suggéré de modifier les propriétés biophysiques pertinentes des membranes, comme la densité ou la fluidité, la compréhension du rôle de l'environnement membranaire sur la dynamique et la fonction des RCPG est devenue une priorité de recherche. Nous abordons cette question importante en étudiant les effets directs et indirects des membranes sur les monomères et les dimères des récepteurs à l'aide de configurations de simulation tout atome et à grain grossier.

Base de données sur la dynamique du RCPG.

La mission principale de ce projet est de fournir un aperçu dynamique des récepteurs cristallisés sur une plateforme accessible au public. Les principales caractéristiques comprennent le dépôt et le stockage des données de MD, les outils d'interrogation, la visualisation des MD pour les caractéristiques pertinentes ainsi que les outils d'analyse de base. Il est important de noter que la base de données est conçue pour permettre non seulement aux experts en médecine dentaire, mais aussi aux chimioinformaticiens ou aux chimistes médicinaux de parcourir et d'utiliser facilement des informations dynamiques sur les RCPG. GPCRmd sera intégré dans la base de données GPCRdb (http://gpcrdb.org/). Cette intégration facilitera le processus de popularité et accélérera le dépôt de nouvelles simulations de DM et peut apporter une contribution importante à la découverte de nouveaux médicaments pour cette importante classe cible. Plus d'informations (http://www.gpcrmd.org/)

Notre équipe (http://grib.imim.es/research/gpcr-drug-discovery/people/?LAB=15) : ils sont tous super jeunes mais je vote pour Mariona :)

Pour l'instant le serveur status (http://brainstormhome.org/server_status.php) est pas délirant et aucune réponse / support sur les quelques premiers messages de crunchers rapportant des erreurs.

Ca sent bon le projet universitaire :D
Titre: Re : Brainstorm@home
Posté par: franky82 le 08 February 2019 à 13:53
Un UT "MD sim" terminée et validée !  :kookoo:

Un petit message dans le Stderr output :
Citer
2019-02-08 11:46:49 (289532): Guest Log: GROMACS reminds you: "Your Bones Got a Little Machine" (Pixies)



(et toujours pas de team AF... !? )
Titre: Re : Brainstorm@home
Posté par: JeromeC le 08 February 2019 à 14:11
Y'a de gros doutes (https://www.reddit.com/r/OutOfTheLoop/comments/3c473g/what_is_a_bone_machine/) sur la signification de cette expression :D

Toutefois Genius (https://genius.com/11729604) est plus explicite :

Citer
What Francis is describing as a bone machine could very well be the human skeleton. Francis is imagining examining all the intricate pieces of Carol’s skeleton in some cruel form of torture/revenge. He said in Select, in 1997:

The imagery is a reference to female anatomy – the pelvis as a sexual area of life. It’s an area that people move and swing when they dance

It could also be a sexual reference referring to a woman’s pelvis as a “bone machine”, as explained in this interview for Fa Onrust (A Dutch Music Program) in 1988.

Citer
Ce que Francis décrit comme une machine à os pourrait très bien être le squelette humain. Francis s'imagine en train d'examiner tous les morceaux complexes du squelette de Carol dans une forme cruelle de torture/ vengeance. Il a dit dans Select, en 1997 :

"L'imagerie est une référence à l'anatomie féminine - le bassin en tant que zone sexuelle de la vie. C'est un endroit où les gens bougent et se balancent quand ils dansent."

Il pourrait également s'agir d'une référence sexuelle faisant référence au bassin d'une femme en tant que "machine à os", comme expliqué dans cette interview pour Fa Onrust (A Dutch Music Program) en 1988.

Tout ceci en sortie d'une tâche boinc, c'est original :D
Titre: Re : Brainstorm@home
Posté par: franky82 le 08 February 2019 à 14:21
J'ai cherché d'autres UT terminées et j'ai trouvé d'autres phrases :
Citer
GROMACS reminds you: "You Fill Me With Inertia" (The Long Blondes)
Citer
GROMACS reminds you: "Ich war schwanger, mir gings zum kotzen" (Nina Hagen)
Citer
GROMACS reminds you: "Documentation is like sex: When it's good it's great, and when it's bad it's better than nothing." (Linus Torvalds)
...

 :??:  :hap:
Titre: Re : Brainstorm@home
Posté par: GuL le 08 February 2019 à 15:57
Citer
GROMACS reminds you: "You Fill Me With Inertia" (The Long Blondes)

Ça sent bon l'humour d'informaticien :
$ apt-get moo
         (__)
         (oo)
   /------\/
  / |    ||
 *  /\---/\
    ~~   ~~
...."Have you mooed today?"...
$ apt-get --help | grep 'Super Cow Powers'
                       This APT has Super Cow Powers.
Titre: Re : Brainstorm@home
Posté par: JeromeC le 08 February 2019 à 19:15
:lol:

J'adore la citation de Linus !!!

Et les apt-get sont pas mal non plus :)
Faudra que je teste sur un linux !!
Titre: Re : Brainstorm@home
Posté par: toTOW le 08 February 2019 à 22:12
Ah les citations de GROMACS ... on avait ça sur FAH à une époque, mais certaines sont pas passées auprès de certains plieurs, alors ils les ont désactivées ...
Titre: Re : Brainstorm@home
Posté par: JeromeC le 10 February 2019 à 12:12
J'avais pas fait gaffe à la citation de Nina Hagen :

"J'étais enceinte, j'ai commencé à vomir"

LOOOOOVE !!!! :lol:

My kind of humor !
Titre: Re : Brainstorm@home
Posté par: nafrayou le 10 February 2019 à 14:17
Hello

j ai une WU en ( MT ) qui tourne avec 9 cpu's depuis 1 jour 13 heures 20 mins ....... elle n est qu a 92%  !! !! !! !! !!    :priz2tet:

qui a déjà réussi a en finir une ?   :cavachier:
Titre: Re : Re : Brainstorm@home
Posté par: fzs600 le 10 February 2019 à 17:08
Hello

j ai une WU en ( MT ) qui tourne avec 9 cpu's depuis 1 jour 13 heures 20 mins ....... elle n est qu a 92%  !! !! !! !! !!    :priz2tet:

qui a déjà réussi a en finir une ?   :cavachier:
Moi j'en ai fini plein.  :kookoo:

Citer
État: Tous (52) · En cours (0) · Validation en attente (28) · Validation non concluante (0) · Valide (24) · Invalide (0) · Erreur (0)

Titre: Re : Brainstorm@home
Posté par: JeromeC le 10 February 2019 à 18:06
Et ça y est maintenant les app tournent / terminent sans planter / créditent ?

Je suppose que ce projet est pas encore comptabilisé dans les diverses stats, ou si ?
Titre: Re : Re : Brainstorm@home
Posté par: franky82 le 10 February 2019 à 21:18
Je suppose que ce projet est pas encore comptabilisé dans les diverses stats, ou si ?
Non, pas encore !
(et toujours pas de team AF)
Titre: Re : Re : Re : Brainstorm@home
Posté par: fzs600 le 10 February 2019 à 21:35
Je suppose que ce projet est pas encore comptabilisé dans les diverses stats, ou si ?
Non, pas encore !
(et toujours pas de team AF)
Impossible de créer une équipe quelque soit cette équipe Française étrangère ou mème martienne pour le moment.  :kookoo:
Titre: Re : Brainstorm@home
Posté par: JeromeC le 11 February 2019 à 11:28
Surtout que martienne c'est quand même dommage qu'on puisse pas... :/
Titre: Re : Brainstorm@home
Posté par: nafrayou le 14 February 2019 à 15:55
bon je crève le plafond :

Au bout de 5 jous 3 heures 31 mins ma WU est a 99,981% il ne reste plus que  1 min 22 !   

mais bon il a 2 jous il ne restait plus que 5 min 38 ...... est je n y suis toujours pas !

FZS600 tu les fini en combien de temps  ?
Titre: Re : Re : Brainstorm@home
Posté par: fzs600 le 14 February 2019 à 18:01
bon je crève le plafond :

Au bout de 5 jous 3 heures 31 mins ma WU est a 99,981% il ne reste plus que  1 min 22 !   

mais bon il a 2 jous il ne restait plus que 5 min 38 ...... est je n y suis toujours pas !

FZS600 tu les fini en combien de temps  ?
Voir ici : http://brainstormhome.org/results.php?hostid=39 (http://brainstormhome.org/results.php?hostid=39)
Et ici : http://brainstormhome.org/results.php?hostid=40 (http://brainstormhome.org/results.php?hostid=40)
Titre: Re : Brainstorm@home
Posté par: nafrayou le 15 February 2019 à 19:18
ok merci pour l info
tu les fini en 1 jour  + ou -

j en suis a plus de 6 ...... toujours pas fini

j ai vu que la WU utilise 9 CPU's mais la charge du PC est tout simplement ridicule ... de 4 a 7 % de charge CPU autant dire que les 9 CPU monopolisé ne travaillent pas  !
Titre: Re : Re : Brainstorm@home
Posté par: fzs600 le 15 February 2019 à 19:50

tu les fini en 1 jour  + ou -
Toute mes UT fini dans la même journée.  :kookoo:
Titre: Re : Brainstorm@home
Posté par: franky82 le 25 February 2019 à 12:38
Après quelques jours avec un serveur out, c'est revenu : j'ai pu renvoyer mes UT terminées !
(pas de nouvelles tâches, pour l'instant)
Titre: Re : Brainstorm@home
Posté par: naz le 26 February 2019 à 19:00
Les créations d'équipes sont ouvertes  :kookoo:
Titre: Re : Re : Brainstorm@home
Posté par: franky82 le 26 February 2019 à 19:10
Les créations d'équipes sont ouvertes  :kookoo:
Chouette ! On attend donc un admin de l'AF !  :jap:
Titre: Re : Re : Re : Brainstorm@home
Posté par: fzs600 le 26 February 2019 à 19:47
Les créations d'équipes sont ouvertes  :kookoo:
Chouette ! On attend donc un admin de l'AF !  :jap:
Voila la demande a été faite a la personne concerner.  :kookoo:

C'est maintenant une question de temps et de patience.  :D
Titre: Re : Brainstorm@home
Posté par: naz le 26 February 2019 à 20:47
 :smak:
Titre: Re : Brainstorm@home
Posté par: JeromeC le 27 February 2019 à 09:46
C'est maintenant une question de temps et de patience.  :D
Ça tombe bien, "patience et longueur de temps font plus que force ni que rage" :jap:
Titre: Re : Re : Brainstorm@home
Posté par: fzs600 le 27 February 2019 à 14:18
Devise des constipés, je le rappelle. :capello:
Devise a haute valeur scientifique même.  :siflotte:
Titre: Re : Re : Re : Brainstorm@home
Posté par: fzs600 le 27 February 2019 à 17:17
Les créations d'équipes sont ouvertes  :kookoo:
Chouette ! On attend donc un admin de l'AF !  :jap:
Voila c'est fait l'équipe est créer .

Merci a Damien.   :jap:
Titre: Re : Brainstorm@home
Posté par: naz le 27 February 2019 à 17:28
merci  :jap:
Titre: Re : Brainstorm@home
Posté par: JeromeC le 27 February 2019 à 18:15
Merci a Damien.   :jap:
C'est qui Damien ?

Ce Damien (https://forum.boinc-af.org/index.php?action=profile;u=619) ??
Titre: Re : Re : Brainstorm@home
Posté par: fzs600 le 27 February 2019 à 18:25
Merci a Damien.   :jap:
C'est qui Damien ?

Ce Damien (https://forum.boinc-af.org/index.php?action=profile;u=619) ??
Oui ce Damien la. :kookoo:
Titre: Re : Brainstorm@home
Posté par: JeromeC le 28 February 2019 à 14:35
Ah ben ça fait 10 ans qu'il est pas revenu nous causer, alors forcément, loin des yeux... ;)
Titre: Re : Re : Brainstorm@home
Posté par: fzs600 le 28 February 2019 à 17:11
Ah ben ça fait 10 ans qu'il est pas revenu nous causer, alors forcément, loin des yeux... ;)
Je suis régulièrement en contact avec lui, Il gère les comptes fondateurs et je passe toujours par lui pour cela.  :kookoo:

Mais c'est vrai que sur le fofo il ne passe plus trop. 
Titre: Re : Brainstorm@home
Posté par: JeromeC le 28 February 2019 à 18:23
Apparemment il s'est connecté hier ! Mais dernier message 30/08/2009 (https://forum.boinc-af.org/index.php?action=profile;area=showposts;u=619) :/

Vous avez "un autre forum" où il se manifeste ?
Titre: Re : Re : Brainstorm@home
Posté par: fzs600 le 28 February 2019 à 18:25
Apparemment il s'est connecté hier ! Mais dernier message 30/08/2009 (https://forum.boinc-af.org/index.php?action=profile;area=showposts;u=619) :/

Vous avez "un autre forum" où il se manifeste ?
Seulement en message privée pour la création des équipes.
Titre: Re : Brainstorm@home
Posté par: JeromeC le 01 March 2019 à 09:22
Alors snif... :/
Titre: Re : Brainstorm@home
Posté par: fzs600 le 23 July 2020 à 20:44
Il y aurait encore de la vie.  :electric:
http://brainstormhome.org/forum_thread.php?id=15&postid=61 (http://brainstormhome.org/forum_thread.php?id=15&postid=61)
Titre: Re : Brainstorm@home
Posté par: JeromeC le 25 July 2020 à 15:01
Il y en avait eu en mars (http://brainstormhome.org/forum_thread.php?id=12) :

Citer
Nous travaillons à l'amélioration de Brainstorm@home et prenons note de tous les problèmes qui sont signalés dans les forums. Malheureusement, nous ne pouvons pas encore les aborder. Nous devons nous concentrer sur les aspects scientifiques de Brainstorm@home pendant un certain temps, et nous préférons attendre de pouvoir travailler à plein temps sur Brainstorm@home plutôt que de nous y précipiter maintenant. Nous aborderons alors des questions telles que le certificat SSL, le listing BoincStats et FreeDC, l'amélioration de la création d'équipes, la résolution des erreurs dans les WU... etc.
Continuez à commenter sur le forum si vous trouvez quelque chose d'autre à aborder !

Et visiblement de temps à autres (http://brainstormhome.org/forum_thread.php?id=7) il y a du travail.