Le Forum de l'Alliance Francophone
Boinc et les projets distribués => Biologie => Bio-Projets terminés => Discussion démarrée par: Damien le 12 June 2008 à 06:07
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l'URL de Computational Structural Biology Projects: http://boinc.vanderbilt.edu/CSB/ (http://boinc.vanderbilt.edu/CSB/)
L'url du projet qui se nomme officiellement Biochemical Library (BCL) : https://boinc.vanderbilt.edu/bcl/ (https://boinc.vanderbilt.edu/bcl/)
Projet américain basé à l'Université de Vanderbilt, à Nashville dans le Tennessee.
Plus d'infos sur la page de Jens Meiler: http://structbio.vanderbilt.edu/faculty/meiler.php (http://structbio.vanderbilt.edu/faculty/meiler.php)
Beaucoup de photos des membres de l'équipe ici: http://www.meilerlab.org/ (http://www.meilerlab.org/)
L'AF est ici: https://boinc.vanderbilt.edu/bcl/team_display.php?teamid=17 (https://boinc.vanderbilt.edu/bcl/team_display.php?teamid=17)
- Informations utiles sur le projet :
Statut : Terminé.
Sur le site de L'AF :
Classement mondial de L'AF : http://fr.boincstats.com/stats/team_stats.php?pr=bcl&st=0 (http://fr.boincstats.com/stats/team_stats.php?pr=bcl&st=0)
Temps de calcul et points de sauvegarde : http://wuprop.boinc-af.org/results.py?data=duree&projet=Biochemical%20Library (http://wuprop.boinc-af.org/results.py?data=duree&projet=Biochemical%20Library)
(http://wuprop.boinc-af.org/results/img_projet.py?projet=Biochemical%20Library)
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cool du boulot pour les Linuxiens...
J'vais testé ca, meme s'il y a le challenge primegrid aujourd hui
Eh bien pas d'unités envoyées pour l'instant
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Je viens de me brancher dessus. Tiens, on dirait aussi que ce projet est destiné aux OS Linux 64 bits.
A voir. ;)
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Tiens nous au courant si tu essaies ;)
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Ah oui, en effet, je suis en 32 bits, ceic epliquant certainement le non envoi d'unités.
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Tiens nous au courant si tu essaies ;)
Pas de problèmes.
Pour l'instant, je n'ai pas encore reçu d'unités. ;)
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On commence par recevoir des unités traitées par l'application BOINC BCL Fold Protein en version 1.11 . Mes premiers points arrivent. ;)
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tjrs rien pour ce projet apparemment
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Non rien... pas d'info, serveur d'envoi désactivé.
On peut toujours attendre
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:hello:
ça date du début du mois mais bon, ça a l'air de bouger un peu...
Oct 9, 2009
We are still working on migrating services to this new host. Configuration changes are still being made in an effort to block spam issues which have plagued the site. We hope to have these issues resolved quickly.
CSB project has a new home
Oct 5, 2009
The Center For Structural Biology's BOINC project is being migrated to a new and improved BOINC server.
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Merci Jeannot pour ces infos. :jap:
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L'AF n'a pas l'air d'être crée sur ce projet :rhaa:
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C'est parce que c'est une fille. Si tu lui parlais comme à une fille, elle viendrait.
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Chaud bouillant le Jerome :D...
limite obsédé. :siflotte:
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Obsédé par l'orthographe et la grammaire (non, j'ai pas dit "les grand-mères"), pas tout le temps mais ça m'arrive :D
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OK, je corrige :cpopossib:
L'AF n'a pas l'air d'être créée sur ce projet
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Arf il manque un "." à la fin de ta phrase :o
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:electric::gun:
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Moi je trouve ça beaucoup plus beau maintenant :D
(les smileys ça compte comme signe de ponctuation ?)
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bonjour,
Je n'arrives pas à trouver l'alliance francophone pour mis attaché pour ce projet, pourquoi ?
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L'AF est ici: http://boinc.vanderbilt.edu/CSB/team_display.php?teamid=12
RATÉ!!! :cpopossib:... c'est le lien de cette équipe (http://www.hardfolding.com/images/new_banner_hol.gif)
Description [H]ard|OCP is a well known computer hardware website. The DC team is one of the biggest in the world in various projects and our goal is to contribute our resources to help science.
Web site http://www.hardocp.com (http://www.hardocp.com)
:ayalou:
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on a plus d'infos sur ce projet ?
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Le forum est en phase de test (1er essai il y a 4 jours)
J'ai essayé de me connecter, sans succès.
C'est vrai que sous BM le projet auquel je suis attaché pour l'AF est connu sous le nom de BCL@home et comme l'AF n'apparaît pas dans la liste des équipes, j'en tire la conclusion que je n'existe plus non plus !!! :cry:
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Peu d'informations disponibles si ce n'est que le projet est hébergé par l'université Vanderbilt.
L'URL pour s'attacher: https://boinc.vanderbilt.edu/bcl/
L'AF: https://boinc.vanderbilt.edu/bcl/team_display.php?teamid=17
Merci à Markken de m'avoir signalé le projet et à Origin d'avoir crée l'AF.
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inscrit on verra bien ce que cela donnera
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Rien vu au sujet de Boinc sur le site de l'université ou de leur service informatique :/
Est-ce que le projet servirait juste à enregistrer et classifier les bouquins de leur bibliothèque ? :??:
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drapal
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Moi aussi, énormément même... 300
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Moi aussi 14'54" de temps de calcul prévu...
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Mais pas de point de sauvegarde et à rendre demain soir... un peu juste...
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Rien vu au sujet de Boinc sur le site de l'université ou de leur service informatique :/
Est-ce que le projet servirait juste à enregistrer et classifier les bouquins de leur bibliothèque ? :??:
voici ce qui les infos disponibles sur le lien MeilerLab (section research (http://meilerlab.org/web/view.php?section=0&page=0)) sur le portail du projet :
Biologie structurale et chimique @ l'Université Vanderbilt
Objectifs de recherche
Les recherches dans notre laboratoire cherchent à fusionner les efforts de calcul et expérimentations pour étudier les protéines, les molécules fondamentales de la biologie, et leurs interactions avec les substrats de petites molécules, de la thérapeutique, ou des sondes. Nous développons des méthodes de calcul avec trois grandes ambitions à l'esprit: 1) pour permettre l'élucidation de la structure protéique des protéines membranaires, la principale cible de la plupart des produits thérapeutiques et de grands complexes macromoléculaires tels que les virus, 2) la conception des protéines avec une structure nouvelle et/ou la fonction d'explorer de nouvelles approches de protéines thérapeutiques et d'approfondir notre compréhension des voies de repliement des protéines, et 3) comprendre la relation entre la structure chimique et l'activité biologique quantitativement, afin de concevoir des médicaments plus efficaces et plus spécifiques. Un point crucial pour notre réussite est la validation expérimentale de nos approches de calcul que nous poursuivons dans notre laboratoire ou en collaboration avec d'autres scientifiques.
Les applications de recherche actuelles se concentrent sur de nouvelles approches pour a) le développement de médicaments et de sondes pour les troubles neurodégénératifs et les maladies incluant la schizophrénie, la maladie d'Alzheimer et de Parkinson, b) comprendre les déterminants structurels de l'antidépresseur se liant à des transporteurs de neurotransmetteurs, c) une arythmie cardiaque causée par l'interaction complexe de la réglementation des canaux potassiques et les interactions médicamenteuses, d) la résistance multi-médicaments dans le cancer et les cellules bactériennes en relation à des protéines de transport multi-médicaments, et e) les bases structurelles des infections virales et l'activité des anticorps.
La page est largement illustrée, chaque vignette menant à un nouvel article :jap:
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Si c'est la bonne traduction, il faudrait mettre cela dans le premier post...
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vous avez réussi à vous attacher à l'AF ?
je vois pas le lien "Join this Team" :??:
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Pas d'application Gnu-linux :/
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Cela fait plusieurs mois que j'ai un compte et il y avait le lien... mais d'abord valide ton adresse mail peut être...
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Cool du taf :pt1cable: c parti mon kiki :hyperbon:
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La DL est vraiment courte effectivement, aucune indication sur le mode de calcul GPU ou CPU.
Et effectivement, les linuxiens sont oubliés! :cavachier:
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mais d'abord valide ton adresse mail peut être...
déjà fait Boris :jap:
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Cela fait plusieurs mois que j'ai un compte et il y avait le lien...
bah bizarrement, j'y suis rattaché :lol:
Pas d'application Gnu-linux :/
arrrggglll :priz2tet: :priz2tet: :priz2tet:
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vous avez réussi à vous attacher à l'AF ?
je vois pas le lien "Join this Team" :??:
Tu y apparais comme le dernier inscrit (18) avec "La frite"(17).
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A noter, pensez à créer les profils quand les premiers points seront tombés (Enfin pour ceux qui veulent :hello: )
Faut pas leur dire, ils vont me rattraper! :rhaa:
:dsl:
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Je suis utod, on va voir si je le reste 24h...
Edit : j'y suis rester 5 minutes
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On n'est pas nombreux...
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Perdu, c'est moi maintenant :lol:
Et non c'est mon tour!! :siflotte:
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C'est bizarre mon BM commence des uts et il ne les finit pas, il passe à d'autres uts ?!
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voici ce qui les infos disponibles sur le lien MeilerLab (section research (http://meilerlab.org/web/view.php?section=0&page=0)) sur le portail du projet :
La page est largement illustrée, chaque vignette menant à un nouvel article :jap:
Vu la description, il pourrait certainement être classé dans la rubrique "Biologie", non ? :ange:
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C'est bizarre mon BM commence des uts et il ne les finit pas, il passe à d'autres uts ?!
Un problème de RAM peut-être ?
Il est écrit quoi dans la colonne "Etat" ?
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je m'y suis mis
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Et non c'est mon tour!! :siflotte:
Non c'est moi :warf:
Y a plus qu'à mettre le projet dans le FB, les stats etc.
Seb du taff pour toi... :hap:
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Un problème de RAM peut-être ?
Il est écrit quoi dans la colonne "Etat" ?
non cela ne prends pas beaucoup de ram : 12mo
dans la colonne état : calcul en cours ou calcul en attente...
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Alors ne cherche pas à comprendre. Ça arrive parfois. Sur ma bécane j'observe ce phénomène surtout quand je fais tourner DNETC sur le GPU. Avec Milky j'ai pas le souci. :spamafote:
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Pour le moment, pas supporté par BAM.
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Pourquoi l'AF n'est pas dans le classement : https://boinc.vanderbilt.edu/bcl/top_teams.php
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Pourquoi l'AF n'est pas dans le classement : https://boinc.vanderbilt.edu/bcl/top_teams.php
Sa doit etre fait que une fois par jour :sun:
Sinon Felicitation pour ta 1er place de l'af sur ce projet a l'heure actuelle :jap:
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merci
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J'ai comme un doute, sur mon descriptif dans la catégorie bio j'ai un projet :
Computational Structural Biology Projects (CSBP ou CSB), qui a aussi comme nom donné BCL.
Sur le forum EDLS d'ailleurs, il y a un seul topic pour les deux.
Et en fin de descriptif, la signature : Center for Structural Biology
Quelqu'un se demande comme moi s'il nes'agit pas d'un seul et même projet, dont le nom définitif a été choisi, et l'adresse du site légèrement changé en conséquence ? :p :siflotte:
Si un admin ou un modo pouvait arranger tout ça en zone bio, merci beaucoup. :jap:
EDIT : j'ai vérifié, une simple fusion avec changement de titre mettra tout dans l'ordre normalement. :D
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Nouvelle appli bio chemical library beta 2.54...
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Merci Antares pour le déplacement, j'ai juste complété en fusionnant avec l'ancien topic (de CSBP). :jap:
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Le nombre max de wu téléchargeable par le projet; on peut le voir sur notre compte projet ?
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bonjour à tous
j'aimerai savoir quel est le problème avec ce projet car j'ai ce message qui s'affiche
merci de votre aide
16/10/2010 17:47:22 Biochemical Library Message from server: (won't finish in time) BOINC runs 30.2% of time, computation enabled 100.0% of that
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il a peur de ne pas finir l'UT à temps car ton Boinc (ou ton PC) ne tourne que 30.2% du temps :jap:
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Depuis hier j'avais plein d'uts qui partaient en erreur alors j'ai cliqué sur recommencer le projet...
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Et alors ! ça marche mieux !
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non car il n'y a plus d'uts à calculés... :lol:
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Des chercheurs de l'université de Vanderbilt on découvert une nouvelle classe de cristaux liquides :
http://www.vanderbilt.edu/exploration/stories/zwitterion.html?utm_source=vuhomepage&utm_medium=vuhomeslider&utm_campaign=liquidcrystalexploration (http://www.vanderbilt.edu/exploration/stories/zwitterion.html?utm_source=vuhomepage&utm_medium=vuhomeslider&utm_campaign=liquidcrystalexploration)
C'est du sérieux cette université....
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C'est la page des résultats de nos calculs ce qui suit ? http://meilerlab.org/web/view.php?section=0&page=10
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C'est du sérieux cette université...
Ben justement, je viens de relire les 3 pages du thread, la page du projet, la page de l'université, je n'arrive pas à me faire une idée sur la nature financière du projet.
J'apprécie quand on a plus d'infos sur l'engagement d'un projet (particulièrement en biologie) à bien redistribuer ses infos (une partie de en tout cas) dans le domaine public, à partir du moment où ils bénéficient de nos gentils CPU gratuitement.
Souvent les universités sont adossées à des labos privés pour financer les recherches, c'est juste histoire de vérifier où iront les résultats de calculs.
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Tiens un commodore.
Ca faisait longtemps que j'en avais pas vu... :/
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Apparemment, ils vont développer une appli GPU open cl... pour des recherches sur la schizophrénie notamment...
http://meilerlab.org/web/view.php?section=0&page=28
https://boinc.vanderbilt.edu/bcl/forum_thread.php?id=7#12
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Je ne sais pas de quand ça date, mais il y a ça sur la page d'accueil du site :
We are currently expriencing problems on the server after it was upgraded. We are trying to resolve that as soon as possible.
Nous avons actuellement quelques problèmes sur le serveur, consécutifs à une mise à jour effectuée. Nous essayons de résoudre ça au plus vite. :jap:
Forcément, quand je veux créer mon compte... déjà que VRS je peux pas m'y inscrire..... :priz2tet:
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Virtual Campus Supercomputing Center
Powered by BOINC
Thanks for your interest into the Biochemical Library (BCL) project.
Unfortunately we have to disable the Boinc server for BCL for now. We do currently not have sufficient resources that would allow us to maintain and further improve the Boinc server. We plan to reactivate the Boinc server as soon as we can continuously manage it.
We will announce new plans and updates on the Meilerlab website.
Prof. Jens Meiler & The Meiler Lab
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trad: (rapide)
Nous avons débranché le serveur BCL pour Boinc. Nous n'avons actuellement pas suffisamment de ressources afin de maintenir actif notre projet via le serveur BOINC.
Nous pensons réactiver celui.ci dès que nous pourrons à nouveau nous en occupper. (plus de ressources)
Pour le moment, les informations et les nouvelles seront annoncées sur notre site Meierlab.
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merci Ouser, j'ai complètement oublié la trad pour ceux qui ne comprennent pas l'anglais :etmerde:
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:kookoo: pas grave, lorsque c'est simple à traduire, ça va. :D