Le Forum de l'Alliance Francophone
Boinc et les projets distribués => Biologie => Discussion démarrée par: tibidao le 16 October 2008 à 18:23
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Au fur et à mesure que les projets s'accumulent, je trouve que les différentes catégories de cette section du forum perdent en lisibilité.
Mon idée est donc de faire un bilan des projets, de leur statut... sans faire de doublons avec ce qui est déjà fait.
Pour chaque projet présent dans la catégorie je mettrais le lien du topic dans le forum.
Le but est double : faire un "résumé" des projets du coin, et permettre au gens de (re)trouver les discussions sur chaque projet. :jap:
Dernière mise à jour : 11/05/2016
Projets actifs
- CAS@home (http://casathome.ihep.ac.cn/) :
Plateforme multiprojets.
Statut : Alpha
Un projet à caractère biomédical :
- TreeThreader (http://casathome.ihep.ac.cn/about_scthread.php)
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,3599.0.html
- Citizen Science Grid (http://volunteer.cs.und.edu/csg/) :
Plateforme multiprojets
Statut : beta
Un projet à caractère biomédical :
- DNA@home (http://volunteer.cs.und.edu/csg/dna/)
Sujet DNA@home sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,3498.0.html
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,6236.0.html
- DENIS@home (http://denis.usj.es/denisathome/) :
Statut : Alpha
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,6525.100.html
- EDGes@Home (http://home.edges-grid.eu/home/) (Enabling Desktop Grids for e-Science) :
Plateforme multiprojets
Statut : Alpha
Deux projets à caractère biomédical :
- Autodock 4.2.3 (http://home.edges-grid.eu/home/autodock_desc_en.php)
- Autodock VINA (http://home.edges-grid.eu/home/autodock_desc_en.php)
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,3173.0.html
- FIND@Home (http://boinc.ucd.ie/fmah/index.php) (anciennement FightMalaria@home) :
Statut : Alpha
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,6364.0.html
- GPUGrid (http://www.gpugrid.net/) :
Statut : beta
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2325.0.html
Topic spécial dédié "GPU sur boinc" : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,1588.0.html
- Ibercivis (http://registro.ibercivis.es/index.php) :
Plateforme multiprojets.
Statut : alpha, pas de travail actuellement (pas de nouvelles depuis le 01/06/15)
Cinq applications à caractère biomédical :
- bindsurf : massively parallel drug nanoscale
- Drug liberation simulations at the nanoscale
- GROMACS based calculations
- mcgi : beta application
- soluvel
Informations sur Ibercivis en général
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,702.0.html
- MalariaControl.net (http://www.malariacontrol.net/) (Africa@home) :
Statut : Projet stable
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,1969.0.html
- MindModeling@Home (beta) (http://mindmodeling.org/) :
Statut : beta
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,705.0.html
- NRG (Najmanovich Research Group) (http://boinc.med.usherbrooke.ca/nrg) :
Statut : alpha
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,4573.msg296351.html#msg296351
- POEM (http://boinc.fzk.de/poem/) :
Statut : beta
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2312.0.html
- Ralph (Rosetta ALPHa) (http://ralph.bakerlab.org/) :
Statut : test permanent, alpha
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,1914.0.html
- RNA World (beta) (http://www.rnaworld.de/rnaworld/) :
Statut : beta (virtualbox nécessaire)
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,3273.0.html
- Rosetta@home (http://boinc.bakerlab.org/rosetta/) :
Statut : Projet stable
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2319.0.html
- the Lattice project (http://boinc.umiacs.umd.edu/) :
Statut : beta, projet intermittent
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2292.0.html
- TN-Grid Test Platform (http://gene.disi.unitn.it/test/) :
Statut : Alpha
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,5921.0.html
- World Community Grid (http://www.worldcommunitygrid.org/) (WCG) :
Plateforme multiprojets
Statut : Projet stable
Quatre projets à caractère biomédical
- FightAIDS@Home (http://http://www.worldcommunitygrid.org/research/faah/overview.do)
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,4806.0.html
- FightAIDS@Home - Phase 2 (http://www.worldcommunitygrid.org/research/fahb/overview.do)
Sujet sur le forum :
- Mapping Cancer Markers (https://secure.worldcommunitygrid.org/research/mcm1/overview.do)
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,5828.0.html
- Outsmart Ebola Together (http://www.worldcommunitygrid.org/research/oet1/overview.do)
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,6370.0.html
- Uncovering Genome Mysteries (http://www.worldcommunitygrid.org/research/ugm1/overview.do)
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,6308.0.html
Informations sur WCG
Statut de l'ensemble des projets : http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProjects.do
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,3797.0.html
- Yoyo@home (http://www.rechenkraft.net/yoyo/) :
Sous-projet: Evolution@home
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,690.0.html
Article du portail relatif à Evolution@home: http://www.boinc-af.org/projets-ecologie/865-evolutionhome-yoyohome.html
Sujet sponsorisé par l'Équipe De La Science (EDLS) :D
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Projets terminés/suspendus
- AlmereGrid Boinc Grid (http://boinc.almeregrid.nl/) :
Statut : Inactif
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,689.0.html
- Artificial Intelligence System (AIS) (http://www.intelligencerealm.com/Countries/Local/system.asp) : site inaccessible
Statut : Arrêté à cause d'un certain nombre de "circonstances défavorables" ; le projet était à but lucratif.
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,686.0.html
- BioChemical Library (BCL) (https://boinc.vanderbilt.edu/bcl/) (Ancien CSBP (http://boinc.vanderbilt.edu/CSB/)) : site inaccessible
Statut : Arrêté par manque de budget
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2304.0.html
- Cels (http://celsathome.bme.utexas.edu/cels/) : site inaccessible
Statut : Arrêté, puis repris puis disparu...
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2314.0.html
- correlizer@home (http://svahesrv2.bioquant.uni-heidelberg.de/correlizer/) :
Statut : Suspendu depuis le 20/12/2014
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,4301.0.html
- DNA@Home (http://dnahome.cs.rpi.edu/dna/) : site inaccessible
Statut : Projet fusionné dans la plateforme multiprojets Citizen Science Grid (http://volunteer.cs.und.edu/csg/)
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,3498.0.html
- docking (http://docking.gcl.cis.udel.edu/) :
Statut : Terminé par manque de ressources, le 23 mai 2014
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2323.0.html
- Drug@home (http://59.78.96.61:8082/tst1/) :
Statut : Jamais vraiment lancé, aucune nouvelle depuis 2013
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,5564.0.html
- DrugDiscovery@home (http://boinc.drugdiscoveryathome.com/) :
Statut : Suspendu, migration des serveurs et de la base de données depuis juillet 2014
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2316.0.html
- evo@home (http://boinc.run.montefiore.ulg.ac.be/evo) : site inaccessible
Statut : Projet abandonné
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,4073.0.html
- EvoGrid (http://www.evogrid.org/index.php/Main_Page) :
Statut : Jamais lancé en fait....
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,3122.0.html (http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,3122.0.html)
- GA@home (http://glife.is-a-geek.org/ga/) : site inaccessible
Satut : Projet mort-né
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,3746.0.html (http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,3746.0.html)
- Genetic Life (http://genlife.is-a-geek.org/genlife/) : site inaccessible
Statut : Arrêté par manque de budget
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2322.0.html (http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2322.0.html)
- IGEM@home (http://igemathome.org/igemathome/) : site inaccessible
Statut : projet d'étudiants pour un concours, terminé
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,6271.0.html (http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,6271.0.html)
- MindModeling@PALM_project (http://mindmodeling.org/palm_project/) :
Statut : Projet de test interne de MindModeling, ne délivre pas d'unités de travail
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,4960.0.html (http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,4960.0.html)
- Neurona@home (http://falua.cesfelipesegundo.com/Neurona/) : site inaccessible
Statut : Terminé avec succès
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,4255.msg281367.html#msg281367
- Physiome@home (anciennement identifikace@kofrlab) (http://physiome.lf1.cuni.cz/ident3/physiome/) : site inaccessible
Statut : Suspendu puis disparu (août 2015)
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,6494.0.html
Sujet sur le premier projet au nom imprononçable : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,4162.0.html
- Predictor (http://predictor.chem.lsa.umich.edu/) : site inaccessible
Statut : Terminé, le projet était déconseillé par L'AF
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2300.0.html
- Predictor alpha (http://predictor.scripps.edu/pah/) : site inaccessible
Statut : Terminé, il s'agissait de predictor version test permanent
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2297.0.html
- Proteins (http://biology.polytechnique.fr/proteinsathome/) : site inaccessible
Statut : Terminé
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2326.0.html
- PS3Grid (http://www.ps3grid.net/) :
Statut : L'équipe a abandonné l’application PS3 pour se concentrer uniquement sur l'application GPUGrid
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2306.0.html
- Simap (http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/) : site inaccessible
Statut : Projet arrêté
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2294.0.html
- SimOne@home (http://mmgboinc.unimi.it/) : site inaccessible
Statut : terminé
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,4662.0.html
- Superlink@technion (http://cbl-boinc-server2.cs.technion.ac.il/superlinkattechnion/) : site inaccessible
Statut : Terminé
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2317.0.html
- Synchronised (http://151.97.53.109/synchronised/) : site inaccessible
Statut : terminé
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,5725.0.html
- Tanpaku (http://issofty17.is.noda.tus.ac.jp/doc/Results.html) :
Statut : Terminé avec succès
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2310.0.html
- UCT malaria (http://boinc.cs.uct.ac.za/malaria/) : site inaccessible
Statut : Terminé
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2305.0.html
- Virus Respiratorio Sincitial (VRS) (http://falua.cesfelipesegundo.com/VRS/) : site inaccessible
Statut : Terminé avec succès
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,3598.0.html
- Projets terminés sur World community Grid (http://www.worldcommunitygrid.org/) :
Statut : Terminés avec succès
- Discovering Dengue Drugs - Together (http://www.worldcommunitygrid.org/research/dddt/overview.do) (Ensemble, découvrons un médicament contre la dengue) - Phase 1
Sur le site de L'AF : http://www.boinc-af.org/projets-termines-suspendus/743-ensemble-decouvrons-un-medicament-contre-la-dengue-wcg.html
- Discovering Dengue Drugs - Together (http://www.worldcommunitygrid.org/research/dddt2/overview.do) (Ensemble, découvrons un médicament contre la dengue) - Phase 2
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,4801.0.html
- Drug Search for Leishmaniasis (http://www.worldcommunitygrid.org/research/dsfl/overview.do)
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,4809.0.html
- Genome Comparison (http://www.worldcommunitygrid.org/research/fcg1/overview.do) (Comparaison du Génome)
Sur le site de L'AF : http://www.boinc-af.org/projets-termines-suspendus/670-fiocruz-genome-comparison-wcg.html
- GO Fight Against Malaria (http://www.worldcommunitygrid.org/research/gfam/overview.do)
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,4808.0.html
- Help Conquer Cancer (http://www.worldcommunitygrid.org/research/hcc1/overview.do) (Aider à Vaincre le Cancer)
Sur le site de L'AF : http://www.boinc-af.org/content/view/814/219/
- Help Cure Muscular Dystrophy (http://www.worldcommunitygrid.org/research/hcmd/overview.do) (Lutte contre la Dystrophie musculaire) - Phase 1
- Help Cure Muscular Dystrophy (http://www.worldcommunitygrid.org/research/hcmd2/overview.do) (Lutte Contre la Dystrophie Musculaire) - Phase 2
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,4802.0.html
- Lutte contre le cancer (http://www.worldcommunitygrid.org/research/hdc/overview.do) (help defeat cancer)
Sur le site de L'AF : http://www.boinc-af.org/projets-termines-suspendus/669-help-defeat-cancer-wcg.html
- Help Fight Childhood Cancer (http://www.worldcommunitygrid.org/research/hfcc/overview.do) (Aide à la lutte contre le cancer chez les enfants)
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,4803.0.html
- Repliement du protéome humain (http://www.worldcommunitygrid.org/research/proteome/overview.do) (Human proteome Folding) - Phase 1
- Repliement du protéome humain (http://www.worldcommunitygrid.org/research/hpf2/overview.do) (Human Proteome Folding) - Phase 2
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,1922.0.html
- Recherche d'Antiviraux contre la Grippe (http://www.worldcommunitygrid.org/research/flu1/overview.do) (Influenza Antiviral Drug Search)
Sur le site de L'AF : http://www.boinc-af.org/projets-termines-suspendus/1091-recherche-dantiviraux-contre-la-grippe-wcg.html
- Du riz pour l'humanité (http://www.worldcommunitygrid.org/research/rice/overview.do) (Nutritious Rice for the World)
Sur le site de L'AF : http://www.boinc-af.org/projets-sciences-de-la-vie/947-du-riz-pour-lhumanite-wcg.html
- Say No to Schistosoma (http://www.worldcommunitygrid.org/research/sn2s/overview.do)
Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,4807.0.html
Bien entendu, pour ceux qui ont des suggestions de présentation à faire ; s'il y a des erreurs, inexactitudes ou oublis à signaler, n'hésitez pas. ;)
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Beau travail, tibi :jap:
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Rien à dire, très bon travail. Il serait bien si un modo pouvait le mettre en post-it.
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je suis modo, mais je ne savais pas comment on faisait "la mise en post it". Mais après avoir lu ton message j'ai eu de l'inspiration, et j'ai trouvé. [:yada44:5]
merci julien pour ton aide. :D
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Mais de rien :D
Désolé je savais pas que tu étais modo. :)
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mais ça s'étoffe grave dis-don... :)
juste, genetic-life est en version gamma (http://genlife.is-a-geek.org/genlife/) (je savais même pas que ça existait :pt1cable: )
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ha oui, j'avais même pas fait gaffe :lol:
Alpha, beta, gamma... au moins la logique est respectée. ;)
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Petite mise à jour, avec ajout des projets qui manquaient. Reste plus que WCG à mettre, mais comme on dit, "coming soon". :p
Normalement je suis bon au niveau des statuts (notamment si on peut télécharger des unités), mais je ne suis pas sur Genetic life, GPUGrid et PS3Grid. Donc si erreur, merci de me prévenir.
(Je vais d'ailleurs m'inscrire sur genetic life pour me tenir au courant, même s'il m'attire pas trop).
:jap:
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Ah ba je vois pourquoi tu as fais le tri ! :jap: :jap:
Genetic Life marche bien, pas de prob :hello:
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il me semble que aqua est un projet bio mais non recommandé
le sous-projet docking d'ibercivis est bio
le sous-projet evolution de yoyo@home aussi ?
mindmodeling, et artificial intelligence, je ne sais pas si c'est assimilé à du bio
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Aqua c'est pour faire des ordinateurs quantique ;).
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Merci pour les retours... ;)
il me semble que aqua est un projet bio mais non recommandé
le sous-projet docking d'ibercivis est bio
le sous-projet evolution de yoyo@home aussi ?
mindmodeling, et artificial intelligence, je ne sais pas si c'est assimilé à du bio
En fait je me suis basé pour l'instant sur les projets présents dans la catégorie, d'où l'absence de certains projets.
Aqua, effectivement ça semble pas être un projet bio... :heink:
Docking d'ibercivis, et evolution de yoyo sont effectivement à prendre en compte, mais est-ce que sur ibercivis on peut sélectionner ses projets ?
Mindmodeling et artificial intelligence sont particulier, pour moi c'est pas des projets bio... :??: ce qui expliquerait pourquoi ils ne sont pas dans cette catégorie. :)
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mais est-ce que sur ibercivis on peut sélectionner ses projets ?
Waip, comme sur yoyo, c'est tout pareil :).
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Bon, j'ai avancé un peu, j'ai rajouté les projets de WCG. à cause d'une limitation technique du forum, j'ai pas pu présenter les projets comme je l'aurais aimé, j'aime pas trop comme ça mais c'est le moins pire que j'ai trouvé. [:douglas riper:1]
Par contre, pour le lien concernant WCG en général sur le site de l'AF, il faut être inscrit, je me demande bien pourquoi. :??:
Donc il me reste à mettre le statut des projets WCG, que je ne connais pas (à part celui sur la distrophie) ; puis je mettrais les projets bio de yoyo et d'ibercivis. :jap:
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Pour WCG tu as oublié The Clean Energy Project
à ma connaissance actuellement tous les projets actifs de WCG on du travail
Edit : Sauf si tu classes CEP dans les projets écologiques et pas bio :whistle:
Edit 2 : pour le statut d'avancement des projets tu as ça :
http://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread?thread=18277
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:hello: mamouth
Aucune image sur ton lien ne s'affiche chez moi.... :heink:
Pour clean energy project, c'est le projet de WCG qui n'est pas bio, donc je l'ai pas mis.
Faut bien laisser des projets pour les autres catégories :D
Pour le travail, il n'y en a pas qui sont plus ou moins intermittent ? faudrait que je vérifie... ;)
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Tu prends les pré-alpha ?
http://boinc.drugdiscoveryathome.com/
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drugdiscovery, je vais voir ça assez rapidement ;)
Bon, avec la migration il y a quelques petite choses qui changent, dont les liens sur le forum forcément. :D
D'autre part, faut que je vois où se trouvent les limites de se forum ci :jap:
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hé on m'a piqué des projets, ils se trouvent dans la catégorie "boinc et les projets distribués".
Sauf avis contraire, je les rappatrie dans le coin. Non mais :cavachier: :gropet:
EDIT : c'est bon, j'ai rapatrié les projets (CSB, genetic life et Cels) ; j'ai aussi modifié tout les liens vers les sujets, liens qui ont changé avec le changement de forum. J'ai rajouté DrugDiscovery sinon. :jap:
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excellent boulot tibi :jap:
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Merci !!
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Merci pour ton boulot. :jap:
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Ho grand maitre, puis je surveiller ta mise à jour au cas ou j'aurai raté un truc pour le nouveau fofo des projets du domaine bio-medical de l'EDLS que j'essaye de mettre à jour.
:jap:
http://www.boincedls.org/forum/viewforum.php?id=14 (http://www.boincedls.org/forum/viewforum.php?id=14)
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salut toutes et tous
m'enfin... ce topic devrait être scotché quoi !
oualà, c'est tout
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est-ce qu'un admin pourrait épingler ce topic svp
merci :jap:
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sinon tibi, et ça me fait hurler de rire, genetic life (http://genlife.is-a-geek.org/genlife/) est passé en "full Gamma (live) state" ! sont très forts les gars :clafete:
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Il était épinglé à la base, mais j'ai l'impression qu'il y a eu un petit rafraichissement de fait quand les topics sur les "postes à pourvoir" ont été mis en place.
moi même je peux l'épingler, mais j'attendais de voir ce que ça donnais. :jap:
Sinon, concernant genetic life, merci pour l'info, je sais pas par combien de stades ils vont passer comme ça. :D
EDIT : petite mise à jour, j'ai modifié le statut de genetic life, rajouté evolution de yoyo et fait une distonction entre HDMD phase 1 et 2.
Pour docking dibercivis, j'ai demandé un peu de matière, dans le sujet. ;)
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aux dernières nouvelles, il y a des unités sur malariacontrol mais il faut cocher "run test application"
là : http://www.malariacontrol.net/prefs.php?subset=project (http://www.malariacontrol.net/prefs.php?subset=project)
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aux dernières nouvelles, il y a des unités sur malariacontrol mais il faut cocher "run test application"
là : http://www.malariacontrol.net/prefs.php?subset=project (http://www.malariacontrol.net/prefs.php?subset=project)
Chez moi tout est sur YES et pourtant aucune UT à l'horizon. :(
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j'avoue que j'ai basculé il y a 1 semaine sur d'autres projets, depuis peut-être que c'est à sec
EDIT: je reçois peu de WUs mais j'en reçois (déjà 1500 crédits ce jour pour moi)
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Pour malaria, j'en recevais plus, donc par manque de temps j'en ai déduit qu'il n'y avait plus d'UT du tout.
Sinon, j'ai fait une mise à jour : j'ai rajouté docking d'ibercivis, et le projet de WCG recherche d'antiviraux contre la grippe. Le statut d'ibercivis je le connaissais pas, donc je l'ai pas mis (qu'est ce que c'est frustrant de ne pas avoir la bimobarre et tout ses favoris...). Sur ce, je retourne à mes occupations de vacancier :sun:
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:/ :/ :/ :/ :/ :/ :/ :/
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Bon, j'ai repassé l'intégralité du premier post à la loupe...
Donc il y a quelques jours, j'avais intégré neurosim, un projet d'ibercivis.
Aujourd'hui j'ai essentiellement fait du toilettage, quelques petites erreurs à corriger, un peu de mise en page... rien d'extraordinaire.
Quelques choses quand même :
- le site d'UCT malaria ne semble plus accessible, je considère donc qu'il est terminé. Sauf informations ultérieures.
- le site de predictor n'est plus du tout accessible (il l'était encore ? je m'en rappelle déjà plus...) : adieu, tu vas pas nous manquer.
- tanpaku, j'avais noté que le site était inaccessible, mais en fait j'ai retrouvé un bout de site, donc je l'ai mis. :jap:
j'ai retiré la mention "en travaux"
J'épingle donc le sujet. :yahoo:
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j'ai posté sur le fil de Tanpaku la dernière news en date il y a plus d'un mois Tibidao : Tanpaku est définitivement mort. Le site n'est à ma connaissance plus disponible, le projet est arrêté, seuls les résultats ont fait l'objet d'une publication, rien de plus.
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Je sais bien qu'il est mort, mais on peut accéder aux résultats, donc je les ai mis au cas où ça intéresserait quelqu'un.
Au mieux, les gens ne cliquent pas dessus (surtout que j'ai mis le statut "terminé" en dessous), au pire ils tombent sur le résultat donné, ce qui est une information en soi. Et le but de ce récapitulatif c'est de donner pleins d'infos au même endroit... :jap:
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il me semble que UCT malaria, c'est le projet alpha de malariacontrol
ensuite elles passent dans les unités beta de malariacontrol puis en prod
en ce moment, ils ne doivent pas avoir d'unités alpha à tester :(
il y a le même système entre seti et setibeta ou rosetta et ralph :)
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Où sont les résultats?
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Sur le lien en haut il y a : Simulation Results (http://issofty17.is.noda.tus.ac.jp/doc/Results.html)
Moi je cherche pas plus loin, c'est les résultats qu'ils donnent. :jap:
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c'est pas un peu léger pour des résultats à rendre public?
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je crois que tu peux remettre le lien pour uct malaria, il est de nouveau accessible :)
http://boinc.cs.uct.ac.za/malaria/ (http://boinc.cs.uct.ac.za/malaria/)
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c'est pas un peu léger pour des résultats à rendre public?
J'en sais rien, je suis pas le maître de stage ou autre responsable, et mon but n'est pas d'analyser si c'est merdique ou pas....
Pour UCT, ça m'apprendra à vouloir aller plus vite que la musique.... :jap:
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- the Lattice project (http://boinc.umiacs.umd.edu/) :
Statut : beta test, actif (pas d'unités en ce moment)
Dernière mise à jour le 06/07/09
Sujet sponsorisé par la MT Biomed :D
Salut Tibi
Un détail pour Lattice : je recois des UT assez régulièrement en ce moment. C'est pas l'avalanche, mais il en tombe quand meme régullièrement toutes les semaines
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Tin j'avais zappé ce topic, super utile. Merci Tibi, excellente initiative. Du coup, tu pourrais compléter chaque projet avec des infos supplémentaires.
Si tu pouvais mettre à jour :)
Simap :
Windows xp 32 bits application 5.10 6.45Mo durée environ 70 mn sur un pentium 4 2.8ghz 7 jours de délai d'envoi, quorum 2
Linux 64 bits : application 5.10 8mo environ durée environ 55 mn sur un e6400 2.13ghz 7 jours de délai d'envoi, quorum 2
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:kookoo: tibidao,
Si tu es encore là, c'est juste pour te donner quelques infos sur les projets wcg :
- Help Fight Childhood Cancer devrait reprendre en aout.
- Nutritious Rice for the World est terminé depuis le 9 avril.
- Discovering Dengue Drugs - Together est terminé, la phase 2 est lancé.
- Influenza Antiviral Drug Search est terminé.
voilou
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Grosse séance de motivation aujourd'hui, j'a décidé de remettre mon nez dans tout ça.
Donc j'ai commencé à mettre le topic à jour.
J'ai rapatrié AIS qui était en divers. Je sais qu'à l'époque je trouvais que c'était pas un projet bio, mais il est terminé et on peut le classer dans les sciences de la vie en général.
J'ai ramené mindmodeling aussi, que j'ai pas intégré encore mais même remarque que pour AIS.
Pour les mises à jour je ne suis arrivé qu'à ibercivis, donc pas arrivé à WCG encore ;)
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:jap:
Si on un article général sur les projets bio sur le portail, on pourrait ptet y mettre un lien vers ce topic (j'ai pas le temps de regarder s'il y a l'équivalent sur les autres catégories de projet, later)
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à ma connaissance il n'y a pas d'équivalents dans les autres catégories, ce serait le rôle des animateurs ? :siflotte:
Normalement j'ai fini ma mise à jour, laborieuse parce que je me suis rendu compte que tous les liens que j'avais mis (à l'origine du topic) vers le portail étaient périmés ; et que les liens wcg vers les projets étaient modifiés, entrainant une redirection systématique.
Si j'ai oublié quelque chose, fait une erreur quelque part, n'hésitez pas à le signaler. :jap:
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Houhouuuu, les animateuuuuurs ??? :D
En tous cas merci pour la maj !
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;)
Bon, j'ai juste oublié d'intégrer quelques nouveaux projets :o
RNA World et VRS c'est fait, je vais voir pour Almere Grid, DNA et Evogrid. :coffeetime:
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Merci tibi. :jap:
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;)
Bon, j'ai juste oublié d'intégrer quelques nouveaux projets :o
RNA World et VRS c'est fait, je vais voir pour Almere Grid, DNA et Evogrid. :coffeetime:
Evogrid !? c'est quoi ce projet ?
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En lisant le forum de ta MT tu y trouveras la réponse.
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merci
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:lol: :warf:
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AlmereGrid Boinc Grid et le projet de test permanent qui l'accompagne almereGrid TestGrid - boinc sont intégrés, ainsi que DNA@Home et EvoGrid (dont la page est de nouveau accessible).
Par contre, après réflexion et discussion avec un autre membre de l'EDLS, j'ai supprimé les liens concernant yoyo. Le sous-projet evolution que j'avais inclus est plus à considérer comme un projet écologique.
D'une part même s'ils parlent de biologie de la conservation, l'article sur wikipédia me paraît clair :
La biologie de la conservation (ou écologie de la conservation) est une discipline traitant des questions de perte, maintien ou restauration de biodiversité.
La biodiversité relève typiquement de l'écologie au sens large.
D'autre part -et je vais reprendre ce que je disais sur notre forum EDLS - pour le projet évolution ce sont des biologistes parce qu'il s'intéressent à l'ADN, mais par rapport à l'interaction avec l'environnement. Je le définirais donc comme du post-darwinisme (darwin qui était naturaliste). :jap:
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"Et toi tu fais quoi dans la vie ?
- Oh moi tu sais je crunche pour un projet post-darwiniste"
Tout de suite ça en jette :D
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:lol:
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Tibi je veux bien te croire lorsque tu dis que Darwin était un naturaliste, tant que tu ne dis pas qu'il était naturiste ... :lol:
Allez je cite WIKI :
Charles Robert Darwin (12 février 1809 – 19 avril 1882) est un naturaliste anglais dont les travaux sur l'évolution des espèces vivantes ont révolutionné la biologie. Célèbre au sein de la communauté scientifique de son époque pour son travail sur le terrain et ses recherches en géologie, il a formulé l'hypothèse selon laquelle toutes les espèces vivantes ont évolué au cours du temps à partir d'un seul ou quelques ancêtres communs grâce au processus connu sous le nom de « sélection naturelle ».
autre déf sur la biodiversité :
Qu’est-ce que la biodiversité ?
Le grand scientifique américain, Edward O. Wilson, considéré comme l’inventeur du mot biodiversity, en donne la définition suivante : « la totalité de toutes les variations de tout le vivant »
Selon les scientifiques, la biodiversité est la dynamique des interactions dans des milieux en changement. Elle se décline en diversité écologique (les milieux ), diversité spécifique (les espèces), et diversité génétique.
Le mot écologique apparait bien ...
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Je me suis lancé dans une grosse mise à jour, dans le premier message de se sujet mais aussi en premier message de tout les projets de la catégorie.
Je commence à intégrer le statut du projet : alpha, bêta ou opérationnel.
Dans les sujets des projets, j'ai commencé à parcourir les sujets complets pour noter, toujours dans le premier message, ce qui peut être utile à savoir et qui à force se trouve dispersé.
Comme il faut lire l'intégralité des messages, et que j'ai pas tout le temps que je voudrais devant moi, ça prendra un peu de temps. Pour l'instant je suis arrivé à DNA.
S'il y a des infos que je n'ai pas noté, et que vous trouvez utile, n'hésitez pas à le signaler. :jap:
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Tu veux finir l'année en feu d'artifice ! Merci :D
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mise à jour du 1er post par Poly, :jap:
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Je commence juste :desole: :desole:
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J'ai un peu mis à jour la liste, il manque sans doute encore des projets... :desole:
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Tu devrais maintenir à jour la date de mise à jour du post (celle écrite bien lisiblement en début et en fin de post), ça donnerait plus confiance :)
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merci c'est corrigé...
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Premier post à mettre à jour pour ajouter le nouveau projet WCG Mapping Cancer Markers.
Il faudrait faire une passe aussi sur les sujets WCG qui sont terminé comme HCC, HPF2 ... et les passer dans la sous section projet terminé ;)
Merci à celui qui aura le temps ^_^
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Bien, je vois qu'on laisse mon topic en sommeil... :o
Je vais voir comment améliorer ça, actualiser un peu.
Le problème c'est que pour l'instant je suis plus dans le coup, quelqu'un peut m'aider en commençant à me donner des infos sur la santé des projets ?
Merci aux volontaires (s'il y en a :cavachier: )
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Dans BAM, tu as la liste des projets terminés
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Merci antares, mais j'utilise pas bam, ou sam, ou autres, donc je trouverais l'info ailleurs ;)
En passant, ils sont de plus en plus fourni les placards qui affichent les badges sour les messages (connais même plus les noms). Pour quelqu'un qui suit pas, ça représente plus rien :eek:
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Ce n'est pas BAM!, en fait je crois qu'il voulait dire BOINCstats :
http://boincstats.com/fr/stats/-5/user/detail/15829/projectList
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Oui oui...
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Sur BoincStats (intéressant) la grande barre de menu de gauche regroupe les projets actifs et en bas les projets retirés.
Sur le (merveilleux) site de statseb tu as une page qui récapitule les badges par projet (et les membres de l'AF qui les ont), la souris sur l'image du badge te donne ses seuils.
Sur le (formidable) site de SetiBZH tu as une page avec le statut des projets (accessible depuis le portail d'ailleurs) mais plus orientée temps réel, je crois de mémoire que les gens sont retirés et les rouges ça peut être temporaire, à vérifier.
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Les formidables sites des équipes de l'AF...
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En parcourant la liste du premier post voici les mises à jour qui pourraient être faites (à recroiser bien entendu je n'ai pas la science infuse lol).
AlmereGrid Boinc Grid : inactif depuis un bon moment. Pas de nouvelles des admins du projet.
DNA@Home : a été intégré à Citizen Science Grid et est de nouveau actif.
Docking : projet terminé.
Donate@home: projet terminé.
DrugDiscovery@home : On peut toujours accéder au site et la dernière news date de juillet 2014 mais pas beaucoup d'activités sur le forum ni de WU.
FightMalaria@Home : projet terminé. Migration vers FiND@Home.
the Lattice project : projet actif mais WU fournies par intermittence.
Neurona@home : site inaccessible.
NRG : inactif. Les admins ont confirmés que le projet n'était pas mort.
Simap : projet terminé.
Superlink@technion : site inaccessible.
Virus Respiratorio Sincitial : site inaccessible.
WCG sous projet HFCC : projet terminé.
WCG sous projet HCC : projet terminé.
WCG sous projet DDDT2: projet terminé.
WCG sous projet HCMD2: projet terminé.
WCG sous projet HPF2: projet terminé.
Pour WCG, on peut ajouter les sous projets DSFL, GFAM et SNS qui sont tous les trois également terminé.
Par contre niveau sous projet bio actif, il y a les sous projets UGM et OET.
D'autres projets à ajouter :
DENIS@home : projet actif.
Drug@Home : inactif il me semble. Le site du projet est accessible mais pas de news.
TN-Grid Test platform : projet actif, beta (besoin d'un code d'invitation pour rejoindre le projet)
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:hello:
Merci Lic, je vais voir tout ça dès que possible ;)
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A noter que Citizen Science Grid n'est pas un projet bio en soi, seul DNA est un sous-projet bio, il inclut aussi les sous-projets wildlife (éco) et subsetsum (maths).
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Superlink est retiré/terminé
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Sur BoincStats, la page statistiques détaillées, l'onglet Mes projets donne la liste des projets retirés auxquels tu étais attaché et as produit des résultats, pour moi ça donne:
ABC Lattices @Home
ABC@home
AlmereGrid Boinc Grid
Correlizer
DistrRTgen
Donate@Home
eOn
Genetic Life
Goldbach's Conjecture Project
Mersenne@home
OProject@Home
OPTIMA@HOME
Predictor@Home
Proteins@home
QMC@Home
Rectilinear Crossing No
RieselSieve
Rioja Science
RSA Lattice Siever (2.0)
SHA-1 Collision Search Graz
SIMAP
SimOne@home
Spinhenge@home
Sudoku project
Sudoku@vtaiwan
Superlink@Technion
VTU@Home
XtremLab
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J'ai avancé un petit peu, j'ai déjà ma liste.
Par contre, j'ai un souci technique : sur mon premier post, la moindre modification m'entraine au delà des 20 000 caractères, et j'ai que 26 projets sur les 47 que j'ai relevés :pt1cable:
ça va vraiment pas le faire ; à la rigueur j'aurais pu m'étaler sur le deuxième post si je l'avais réservé, mais c'est pas le cas.
Question aux modos/admins : Vous pouvez supprimer le post de gulu qui est en deuxième ? ou alors je crée un deuxième topic ? Merci ! :jap:
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Au fait, tu veux que je retire mon post précédent, je vois qu'il y pratiquement aucun projet bio dans mes retirés, si tu veux nettoyer le topic?
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Message enlevé
Question aux modos/admins : Vous pouvez supprimer le post de gulu qui est en deuxième ? ou alors je crée un deuxième topic ? Merci ! :jap:
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Au fait, tu veux que je retire mon post précédent, je vois qu'il y pratiquement aucun projet bio dans mes retirés, si tu veux nettoyer le topic?
T'embête pas, j'ai trié les infos... :D
Merci poly ! :jap:
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J'avance petit à petit, le temps de relire tous les topics, de retrouver tous les sujets... :coffeetime:
Du coup il faut regarder les deux premiers posts, le premier pour les projets actifs, le deuxième pour les projets arrêté/suspendus/fusionnés.
Il y a encore du boulot (j'ai déjà dû arranger le bordel dans le bbcode :priz2tet: ), j'en suis arrivé à docking. :etmerde:
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Allez, 24 projets sur les 44 que j'ai, j'en suis arrivé à neurona... :gno:
j'ai une grosse majorité de projets terminés/suspendus/disparus pour l'instant...
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:jap: :jap:
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Le turn over des projets est assez impressionnant, ça commence, ça s'arrête... Il y a quelques grosses planètes stables et pas mal de comètes qui sillonnent l'azur boinc...
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Mettre en place un projet Boinc, ce n'est pas une sinécure... je n'entre pas dans la description de ce que ça requiert :D Des initiatives comme EDGEs ou SZTAKI sont nécessaires mais pas suffisantes; pour la plupart des projets ça reste du one man show.
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Ouf, ça y est j'ai fini mes mises à jour (juste deux petite modifs à faire dans la présentation) !!! :kermit:
J'espère que j'ai rien loupé, n'hésitez pas à signaler s'il y a des erreurs, oublis...
On a donc au final :
- 10 projets actifs, plus 4 plateformes multiprojets
- 30 projets inactifs/terminés/suspendus/mort vivants :siflotte: , plus les projets terminés de WCG...
:jap:
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Euh... je crois que tu peux passer FightAIDES@Home en projet terminés, il reste encore qqs unités en re-send mais normalement c'est fini!
:hello:
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Tant qu'il y a quelques unités, même en re-send... :D
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Petite mise à jour aujourd'hui, j'ai remis TN-Grid dans les projets actifs vu que, malgré le fait qu'ils aient remercié tout le monde et fait une publication, il y a des unités de travail en circulation :pt1cable:. Merci fzs600 pour l'info. :jap:
Sinon j'ai fait le statut de l'ensemble des projets arrêtés/suspendus/abandonnés/disparus/en migration interminable. :siflotte:
Pour physiome, je pense qu'il va définitivement rester dans cette catégorie, j'arrive même plus à accéder au site. :jap:
J'ai rapatrié les projets dispersés dans d'autres partie de forum, et fait quelques transferts dans la partie bio-projets terminés. :coffeetime:
Normalement on est pas mal...
PS : pour fightAIDS@home, un des responsables a dit ça aujourd'hui :
The project is not complete until the fat lady sings, as was stated before! There are multiple possibles to include Intermittent state.
Traduction : le projet n'est pas terminé jusqu'à ce que la grosse dame chante, comme il a été dit avant. Il y a de multiple possibilités d'inclure l'état d'intermittent.
Donc je laisse en actif, j'attends le chant de la grosse dame... :lol:
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:jap: :jap:
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Merci pour cette liste.
Il manque le sous projet Evolution de Yoyo dans la liste récapitulative.
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ajouté, merci pour la remarque :kookoo:
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Le projet Poem@Home est arrêté. :/
Le dernier message en page d'accueil de leur site indique en date du 4 octobre 2016 :" We [...] will gradually empty the queue and shutdown the server daemons after approximately 2 months".
Bonjour chez vous
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Oui nous en parlâmes dans le topic de poem, qui a d'ailleurs été déplacé dans les projets terminés :spamafote:
edith : heu c'est ce que je croyais, mais je le trouve plus du tout le topic de poem (à part un topic sur "poem test")... ?
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Oui nous en parlâmes dans le topic de poem, qui a d'ailleurs été déplacé dans les projets terminés :spamafote:
edith : heu c'est ce que je croyais, mais je le trouve plus du tout le topic de poem (à part un topic sur "poem test")... ?
http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2312.0.html (http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2312.0.html) :kookoo:
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Ah il n'est pas dans "projets bio terminés" (contrairement à poem test) mais dans les "projets terminés" tout court... c'est un peu confusant.
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Il faudrait alors le retirer de la liste des projets actifs présentés dans le premier message et le rajouter à la liste des projets terminés/suspendus. Savez-vous qui peut réaliser cette modification ?
Bonsoir chez vous
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Tout simplement un modérateur .
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Pas de modérateur pour mettre un coup de balai sur le premier post ? Dans l'état, s'il n'est pas un minimum à jour, le topic ne sert à rien :smak:
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Bonjour :hello:
Apparemment je suis toujours modérateur, je pourrais y jeter un œil :jap:
Laissez moi quelques jours pour me renseigner :coffeetime:
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Perso ce qui m’intéresse c'est un projet bio GPU autre que GPUGrid. Il y a avait POEM mais c'est fini.
:hello:
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Idem sinon Folding@home (mais qui n'est pas Boinc).
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Salut à tous, savez vous quel projet de biologie rapporte le plus en points journaliers ? Je ne sais pas sur quoi calculer avec ma machine, avant le raid de printemps sur primegrid j'étais pendant de longues années sur WCG, j'aimerais participer sur autre chose pour aider un autre projet.
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:kookoo:
Il y a GPUGrid qui plie des protéines en GPU et qui paie bien, par contre il a l'air intermittent, je ne sais pas si faire du cache suffit a ne pas avoir de temps mort.
En CPU tu as SiDock qui fait la même chose mais sans GPU pour l'instant, il paie pas bien mais pas mal non plus normalement.
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Il y a aussi Denis, mais il est aussi intermittent.
WCG vient aussi de couper les livraisons ce matin.
En biologie, tout semble intermittent !
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ok merci, j'ai oublié de préciser que c'était pour mes cpus (core i7 13700KF) que je cherchais, pour mon gpu je vais l'utiliser comme un porc sur les projets qui payent le plus, amicale numbers je crois
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ok merci, j'ai oublié de préciser que c'était pour mes cpus (core i7 13700KF) que je cherchais, pour mon gpu je vais l'utiliser comme un porc sur les projets qui payent le plus, amicale numbers je crois
Nan, pour les GPUs, GPUGrid paye plus !
Et SRBase aussi, sous projet TF.
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Je me permets un message, en pseudo-spécialiste des projets Biologie :siflotte:
Si tu as un GPU assez puissant (> série 1000 de nVidia), je te conseille de laisser les vannes ouvertes sur GPUGrid qui est le projet référence en termes d'utilité (le nombre de publications est impressionnant et on connait son % de participation à chaque publi scientifique, c'est sympa).
Après y'a WCG qui est en pente descendante mais il y a quand même du Mapping Cancer Markers (en CPU) et du OpenPandemics (en GPU) à faire. Idem, beaucoup de publications scientifiques, on connait les équipes de recherches derrière, c'est transparent.
Rosetta (CPU) est en train de publier de nouvelles unités en Beta donc ça laisse penser qu'il se passe des choses. Attention cependant avec ce projet qui prend pas mal de RAM et d'espace disque. Ils ont eu leurs heures de gloire pendant le Covid mais c'est retombé depuis. C'est le labo Bakerlab, c'est du sérieux aussi.
Denis (CPU) est effectivement en intermittent mais avec un peu de cache, on arrive à faire le pont. Basé à Zaragosse (Espagne), l'idée est de modéliser le cœur pour travailler sur les maladies cardiaques.
Je suis plus réservé sur Sidock (CPU) car une partie du projet semble porté par des Russes, et j'ai du mal avec ça, quand bien même les Universitaires n'y sont pour rien dans ce bordel. Le code est open-source donc ça rassure toutefois un peu sur les calculs effectués.
Comme évoqué par Jean-Luc, il y a beaucoup d'intermittence en biologie car souvent les scientifiques font des contrôles entre chaque lot. Si tu ouvres les vannes un peu partout, tu devrais réussir à alimenter tes CPU/GPU en continu.
J'ai arrêté depuis longtemps cette histoire de points, considérant que rien n'est comparable, je me contente d'aider et j'espère que ce post y contribue. :jap:
:hello:
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je me contente d'aider et j'espère que ce post y contribue.
C'est la cas. :kookoo:
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ok je bascule mon GPU sur GPUGrid, je reçois pas de WUs pour l'instant...
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ok je bascule mon GPU sur GPUGrid, je reçois pas de WUs pour l'instant...
Je crois qu'actuellement il n'y a que des tâches GPU qui fonctionnent sur Linux uniquement.
Donc si tu es sur Windows tu ne recevra rien.
Kali.
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ok je bascule mon GPU sur GPUGrid, je reçois pas de WUs pour l'instant...
Je crois qu'actuellement il n'y a que des tâches GPU qui fonctionnent sur Linux uniquement.
Donc si tu es sur Windows tu ne recevra rien.
Kali.
Par intermittence il y ausi des UT pour Windows pour ATM er ATMbeta https://www.gpugrid.net/apps.php (https://www.gpugrid.net/apps.php) pour faire simple il faut laissé les vannes ouvertes en permanence. :kookoo:
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J'ai arrêté depuis longtemps cette histoire de points, considérant que rien n'est comparable, ...
Oui, les points c'est grisant !
Mais moi aussi, je lance assez souvent des projets qui ne rapportent pas grand chose.
C'est pas le nombre de points qui fait l'intérêt scientifique d'un projet.
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Une bonne pinte de bière me grise plus que des crédits boinc cependant :lol: :cetaboir:
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Sinon sur Folding@Home, il y a toujours du taf ... :siflotte:
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ok j'ai laissé les vannes ouvertes sur GPUGrid, je verrai bien sur windows ce que je reçois par intermittence...
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En ce moment, tu devrais en recevoir tout de suite, il y en a plein.
Si tu n'en reçois pas, je crains que ce soit grillé pour toi avec Windows !
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En ce moment, tu devrais en recevoir tout de suite, il y en a plein.
Si tu n'en reçois pas, je crains que ce soit grillé pour toi avec Windows !
merci mais je ne suis pas chez moi et le pc est éteind, rallumage vers 16h30, crunchage en semaine de 16h30 à 7h et le week-end full crunch.