Le Forum de l'Alliance Francophone

Boinc et les projets distribués => Biologie => Discussion démarrée par: tibidao le 16 October 2008 à 18:23

Titre: Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: tibidao le 16 October 2008 à 18:23
Au fur et à mesure que les projets s'accumulent, je trouve que les différentes catégories de cette section du forum perdent en lisibilité.
Mon idée est donc de faire un bilan des projets, de leur statut... sans faire de doublons avec ce qui est déjà fait.
Pour chaque projet présent dans la catégorie je mettrais le lien du topic dans le forum.
Le but est double : faire un "résumé" des projets du coin, et permettre au gens de (re)trouver les discussions sur chaque projet.  :jap:


Dernière mise à jour : 11/05/2016



 Projets actifs




Sujet sponsorisé par l'Équipe De La Science (EDLS)   :D
Titre: Récapitulatif des projets de la catégorie \
Posté par: tibidao le 20 October 2008 à 16:53
 Projets terminés/suspendus

Bien entendu, pour ceux qui ont des suggestions de présentation à faire ; s'il y a des erreurs, inexactitudes ou oublis à signaler, n'hésitez pas.  ;)
Titre: Récapitulatif des projets de la catégorie "biologie"
Posté par: modesti le 20 October 2008 à 17:31
Beau travail, tibi :jap:
Titre: Récapitulatif des projets de la catégorie "biologie"
Posté par: julien76100 le 20 October 2008 à 17:34
Rien à dire, très bon travail. Il serait bien si un modo pouvait le mettre en post-it.
Titre: Récapitulatif des projets de la catégorie "biologie"
Posté par: tibidao le 20 October 2008 à 17:38
je suis modo, mais je ne savais pas comment on faisait "la mise en post it". Mais après avoir lu ton message j'ai eu de l'inspiration, et j'ai trouvé.   [:yada44:5]

merci julien pour ton aide.  :D
Titre: Récapitulatif des projets de la catégorie "biologie"
Posté par: julien76100 le 20 October 2008 à 18:04
Mais de rien  :D
Désolé je savais pas que tu étais modo.  :)
Titre: Récapitulatif des projets de la catégorie "biologie"
Posté par: gulu le 20 October 2008 à 18:13
mais ça s'étoffe grave dis-don...    :)

juste, genetic-life est en version gamma (http://genlife.is-a-geek.org/genlife/) (je savais même pas que ça existait  :pt1cable: )
Titre: Récapitulatif des projets de la catégorie "biologie"
Posté par: tibidao le 20 October 2008 à 19:18
ha oui, j'avais même pas fait gaffe  :lol:
Alpha, beta, gamma... au moins la logique est respectée.  ;)
Titre: Récapitulatif des projets de la catégorie "biologie"
Posté par: tibidao le 26 April 2009 à 17:30
Petite mise à jour, avec ajout des projets qui manquaient. Reste plus que WCG à mettre, mais comme on dit, "coming soon".  :p
Normalement je suis bon au niveau des statuts (notamment si on peut télécharger des unités), mais je ne suis pas sur Genetic life, GPUGrid et PS3Grid. Donc si erreur, merci de me prévenir.
(Je vais d'ailleurs m'inscrire sur genetic life pour me tenir au courant, même s'il m'attire pas trop).

 :jap:
Titre: Récapitulatif des projets de la catégorie "biologie"
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 26 April 2009 à 18:11
Ah ba je vois pourquoi tu as fais le tri !  :jap:  :jap:
Genetic Life marche bien, pas de prob  :hello:
Titre: Récapitulatif des projets de la catégorie "biologie"
Posté par: RLDF le 26 April 2009 à 23:11
il me semble que aqua est un projet bio mais non recommandé
le sous-projet docking d'ibercivis est bio
le sous-projet evolution de yoyo@home aussi ?
mindmodeling, et artificial intelligence, je ne sais pas si c'est assimilé à du bio
Titre: Récapitulatif des projets de la catégorie "biologie"
Posté par: rom_185 le 26 April 2009 à 23:41
Aqua c'est pour faire des ordinateurs quantique ;).
 
Titre: Récapitulatif des projets de la catégorie "biologie"
Posté par: tibidao le 27 April 2009 à 00:19
Merci pour les retours...  ;)

Citation de: RLDF
il me semble que aqua est un projet bio mais non recommandé
le sous-projet docking d'ibercivis est bio
le sous-projet evolution de yoyo@home aussi ?
mindmodeling, et artificial intelligence, je ne sais pas si c'est assimilé à du bio


En fait je me suis basé pour l'instant sur les projets présents dans la catégorie, d'où l'absence de certains projets.
Aqua, effectivement ça semble pas être un projet bio...  :heink:
Docking d'ibercivis, et evolution de yoyo sont effectivement à prendre en compte, mais est-ce que sur ibercivis on peut sélectionner ses projets ?
Mindmodeling  et artificial intelligence sont particulier, pour moi c'est pas des projets bio...  :??:  ce qui expliquerait pourquoi ils ne sont pas dans cette catégorie.  :)

Titre: Récapitulatif des projets de la catégorie "biologie"
Posté par: rom_185 le 27 April 2009 à 00:22
Citer
mais est-ce que sur ibercivis on peut sélectionner ses projets ?
Waip, comme sur yoyo, c'est tout pareil :).
Titre: Récapitulatif des projets de la catégorie "biologie"
Posté par: tibidao le 27 April 2009 à 14:24
Bon, j'ai avancé un peu, j'ai rajouté les projets de WCG. à cause d'une limitation technique du forum, j'ai pas pu présenter les projets comme je l'aurais aimé, j'aime pas trop comme ça mais c'est le moins pire que j'ai trouvé.  [:douglas riper:1]

Par contre, pour le lien concernant WCG en général sur le site de l'AF, il faut être inscrit, je me demande bien pourquoi.  :??:

Donc il me reste à mettre le statut des projets WCG, que je ne connais pas (à part celui sur la distrophie) ; puis je mettrais les projets bio de yoyo et d'ibercivis.  :jap:
Titre: Récapitulatif des projets de la catégorie "biologie"
Posté par: mamouth le 27 April 2009 à 15:52
Pour WCG tu as oublié The Clean Energy Project

à ma connaissance actuellement tous les projets actifs de WCG on du travail


Edit : Sauf si tu classes CEP dans les projets écologiques et pas bio  :whistle:

Edit 2 : pour le statut d'avancement des projets tu as ça :
http://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread?thread=18277
Titre: Récapitulatif des projets de la catégorie "biologie"
Posté par: tibidao le 27 April 2009 à 17:38
 :hello:  mamouth

Aucune image sur ton lien ne s'affiche chez moi....  :heink:

Pour clean energy project, c'est le projet de WCG qui n'est pas bio, donc je l'ai pas mis.
Faut bien laisser des projets pour les autres catégories  :D

Pour le travail, il n'y en a pas qui sont plus ou moins intermittent ? faudrait que je vérifie...  ;)
Titre: Récapitulatif des projets de la catégorie "biologie"
Posté par: fr@ntz le 27 April 2009 à 21:39
Tu prends les pré-alpha ?
http://boinc.drugdiscoveryathome.com/


Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie \
Posté par: tibidao le 10 May 2009 à 21:33
drugdiscovery, je vais voir ça assez rapidement ;)
Bon, avec la migration il y a quelques petite choses qui changent, dont les liens sur le forum forcément.  :D
D'autre part, faut que je vois où se trouvent les limites de se forum ci  :jap:
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie \
Posté par: tibidao le 24 May 2009 à 20:19
hé on m'a piqué des projets, ils se trouvent dans la catégorie "boinc et les projets distribués".
Sauf avis contraire, je les rappatrie dans le coin. Non mais  :cavachier: :gropet:

EDIT : c'est bon, j'ai rapatrié les projets (CSB, genetic life et Cels) ; j'ai aussi modifié tout les liens vers les sujets, liens qui ont changé avec le changement de forum. J'ai rajouté DrugDiscovery sinon.  :jap:
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: modesti le 25 May 2009 à 10:29
excellent boulot tibi :jap:
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: [AF>Libristes] Dudumomo le 25 May 2009 à 11:31
Merci !!
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: [AF>Libristes>Jip] Elgrande71 le 25 May 2009 à 11:43
Merci pour ton boulot.  :jap:
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: viny le 26 May 2009 à 19:19
Ho grand maitre, puis je surveiller ta mise à jour au cas ou j'aurai raté un truc pour le nouveau fofo des projets du domaine bio-medical de l'EDLS que j'essaye de mettre à jour.

 :jap:

http://www.boincedls.org/forum/viewforum.php?id=14 (http://www.boincedls.org/forum/viewforum.php?id=14)

Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: gulu le 28 May 2009 à 23:50
salut toutes et tous

m'enfin...    ce topic devrait être scotché quoi !

oualà, c'est tout
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: gulu le 02 June 2009 à 14:06
est-ce qu'un admin pourrait épingler ce topic svp

merci :jap:



------------------------------
sinon tibi, et ça me fait hurler de rire, genetic life (http://genlife.is-a-geek.org/genlife/) est passé en "full Gamma (live) state" ! sont très forts les gars    :clafete:
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: tibidao le 02 June 2009 à 18:38
Il était épinglé à la base, mais j'ai l'impression qu'il y a eu un petit rafraichissement de fait quand les topics sur les "postes à pourvoir" ont été mis en place.
moi même je peux l'épingler, mais j'attendais de voir ce que ça donnais.  :jap:

Sinon, concernant genetic life, merci pour l'info, je sais pas par combien de stades ils vont passer comme ça.  :D

EDIT : petite mise à jour, j'ai modifié le statut de genetic life, rajouté evolution de yoyo et fait une distonction entre HDMD phase 1 et 2.
Pour docking dibercivis, j'ai demandé un peu de matière, dans le sujet. ;)
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: RLDF le 06 June 2009 à 23:13
aux dernières nouvelles, il y a des unités sur malariacontrol mais il faut cocher "run test application"
là : http://www.malariacontrol.net/prefs.php?subset=project (http://www.malariacontrol.net/prefs.php?subset=project)
Titre: Re : Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: al@ON le 06 June 2009 à 23:25
aux dernières nouvelles, il y a des unités sur malariacontrol mais il faut cocher "run test application"
là : http://www.malariacontrol.net/prefs.php?subset=project (http://www.malariacontrol.net/prefs.php?subset=project)

Chez moi tout est sur YES et pourtant aucune UT à l'horizon. :(
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: RLDF le 06 June 2009 à 23:26
j'avoue que j'ai basculé il y a 1 semaine sur d'autres projets, depuis peut-être que c'est à sec

EDIT: je reçois peu de WUs mais j'en reçois (déjà 1500 crédits ce jour pour moi)
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: tibidao le 09 June 2009 à 19:50
Pour malaria, j'en recevais plus, donc par manque de temps j'en ai déduit qu'il n'y avait plus d'UT du tout.
Sinon, j'ai fait une mise à jour : j'ai rajouté docking d'ibercivis, et le projet de WCG recherche d'antiviraux contre la grippe. Le statut d'ibercivis je le connaissais pas, donc je l'ai pas mis (qu'est ce que c'est frustrant de ne pas avoir la bimobarre et tout ses favoris...). Sur ce, je retourne à mes occupations de vacancier  :sun:
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 09 June 2009 à 20:30
 :/ :/ :/ :/ :/ :/ :/ :/
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: tibidao le 06 July 2009 à 16:28
Bon, j'ai repassé l'intégralité du premier post à la loupe...
Donc il y a quelques jours, j'avais intégré neurosim, un projet d'ibercivis.
Aujourd'hui j'ai essentiellement fait du toilettage, quelques petites erreurs à corriger, un peu de mise en page... rien d'extraordinaire.
Quelques choses quand même :
- le site d'UCT malaria ne semble plus accessible, je considère donc qu'il est terminé. Sauf informations ultérieures.
- le site de predictor n'est plus du tout accessible (il l'était encore ? je m'en rappelle déjà plus...) : adieu, tu vas pas nous manquer.
- tanpaku, j'avais noté que le site était inaccessible, mais en fait j'ai retrouvé un bout de site, donc je l'ai mis.  :jap:

j'ai retiré la mention "en travaux"
J'épingle donc le sujet.  :yahoo:
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: tristesire le 06 July 2009 à 17:40
j'ai posté sur le fil de Tanpaku la dernière news en date il y a plus d'un mois Tibidao : Tanpaku est définitivement mort. Le site n'est à ma connaissance plus disponible, le projet est arrêté, seuls les résultats ont fait l'objet d'une publication, rien de plus.
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: tibidao le 06 July 2009 à 17:47
Je sais bien qu'il est mort, mais on peut accéder aux résultats, donc je les ai mis au cas où ça intéresserait quelqu'un.
Au mieux, les gens ne cliquent pas dessus (surtout que j'ai mis le statut "terminé" en dessous), au pire ils tombent sur le résultat donné, ce qui est une information en soi. Et le but de ce récapitulatif c'est de donner pleins d'infos au même endroit...  :jap:
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: RLDF le 06 July 2009 à 18:29
il me semble que UCT malaria, c'est le projet alpha de malariacontrol
ensuite elles passent dans les unités beta de malariacontrol puis en prod
en ce moment, ils ne doivent pas avoir d'unités alpha à tester :(

il y a le même système entre seti et setibeta ou rosetta et ralph :)
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: tristesire le 06 July 2009 à 20:21
Où sont les résultats?
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: tibidao le 06 July 2009 à 20:26
Sur le lien en haut il y a : Simulation Results (http://issofty17.is.noda.tus.ac.jp/doc/Results.html)

Moi je cherche pas plus loin, c'est les résultats qu'ils donnent.  :jap:
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: tristesire le 06 July 2009 à 23:53
c'est pas un peu léger pour des résultats à rendre public?
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: RLDF le 06 July 2009 à 23:59
je crois que tu peux remettre le lien pour uct malaria, il est de nouveau accessible :)
http://boinc.cs.uct.ac.za/malaria/ (http://boinc.cs.uct.ac.za/malaria/)
Titre: Re : Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: tibidao le 07 July 2009 à 00:02
c'est pas un peu léger pour des résultats à rendre public?

J'en sais rien, je suis pas le maître de stage ou autre responsable, et mon but n'est pas d'analyser si c'est merdique ou pas....

Pour UCT, ça m'apprendra à vouloir aller plus vite que la musique....  :jap:
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: Krest le 15 July 2009 à 08:11

  • the Lattice project (http://boinc.umiacs.umd.edu/) :
    Statut : beta test, actif (pas d'unités en ce moment)


    Dernière mise à jour le 06/07/09


    Sujet sponsorisé par la MT Biomed   :D
Salut Tibi

Un détail pour Lattice  : je recois des UT assez régulièrement en ce moment.  C'est pas l'avalanche, mais il en tombe quand meme régullièrement toutes les semaines
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: tristesire le 03 February 2010 à 17:41
Tin j'avais zappé ce topic, super utile. Merci Tibi, excellente initiative. Du coup, tu pourrais compléter chaque projet avec des infos supplémentaires.
Si tu pouvais mettre à jour :)

Simap :
Windows xp 32 bits application 5.10  6.45Mo durée environ 70 mn sur un pentium 4 2.8ghz 7 jours de délai d'envoi, quorum 2
Linux 64 bits : application 5.10  8mo environ  durée environ 55 mn sur un e6400 2.13ghz 7 jours de délai d'envoi, quorum 2
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: julien76100 le 16 June 2010 à 16:10
 :kookoo: tibidao,

Si tu es encore là, c'est juste pour te donner quelques infos sur les projets wcg :

- Help Fight Childhood Cancer devrait reprendre en aout.

- Nutritious Rice for the World est terminé depuis le 9 avril.

- Discovering Dengue Drugs - Together est terminé, la phase 2 est lancé.

- Influenza Antiviral Drug Search est terminé.

voilou
 
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: tibidao le 21 September 2010 à 15:52
Grosse séance de motivation aujourd'hui, j'a décidé de remettre mon nez dans tout ça.
Donc j'ai commencé à mettre le topic à jour.
J'ai rapatrié AIS qui était en divers. Je sais qu'à l'époque je trouvais que c'était pas un projet bio, mais il est terminé et on peut le classer dans les sciences de la vie en général.
J'ai ramené mindmodeling aussi, que j'ai pas intégré encore mais même remarque que pour AIS.

Pour les mises à jour je ne suis arrivé qu'à ibercivis, donc pas arrivé à WCG encore ;)
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: JeromeC le 21 September 2010 à 18:30
:jap:

Si on un article général sur les projets bio sur le portail, on pourrait ptet y mettre un lien vers ce topic (j'ai pas le temps de regarder s'il y a l'équivalent sur les autres catégories de projet, later)
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: tibidao le 24 September 2010 à 12:15
à ma connaissance il n'y a pas d'équivalents dans les autres catégories, ce serait le rôle des animateurs ?  :siflotte:

Normalement j'ai fini ma mise à jour, laborieuse parce que je me suis rendu compte que tous les liens que j'avais mis (à l'origine du topic) vers le portail étaient périmés ; et que les liens wcg vers les projets étaient modifiés, entrainant une redirection systématique.

Si j'ai oublié quelque chose, fait une erreur quelque part, n'hésitez pas à le signaler.  :jap:
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: JeromeC le 24 September 2010 à 14:26
Houhouuuu, les animateuuuuurs ??? :D

En tous cas merci pour la maj !
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: tibidao le 24 September 2010 à 14:30
;)

Bon, j'ai juste oublié d'intégrer quelques nouveaux projets  :o
RNA World et VRS c'est fait, je vais voir pour Almere Grid, DNA et Evogrid.  :coffeetime:
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: al@ON le 24 September 2010 à 21:04
Merci tibi. :jap:
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 24 September 2010 à 21:12
;)

Bon, j'ai juste oublié d'intégrer quelques nouveaux projets  :o
RNA World et VRS c'est fait, je vais voir pour Almere Grid, DNA et Evogrid.  :coffeetime:

Evogrid !? c'est quoi ce projet ?
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: al@ON le 24 September 2010 à 21:19
En lisant le forum de ta MT tu y trouveras la réponse.
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 24 September 2010 à 22:54
merci
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: Netrider le 28 September 2010 à 11:56
 :lol:   :warf:
Titre: Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: tibidao le 29 September 2010 à 13:34
AlmereGrid Boinc Grid et le projet de test permanent qui l'accompagne almereGrid TestGrid - boinc sont intégrés, ainsi que DNA@Home et EvoGrid (dont la page est de nouveau accessible).

Par contre, après réflexion et discussion avec un autre membre de l'EDLS, j'ai supprimé les liens concernant yoyo. Le sous-projet evolution que j'avais inclus est plus à considérer comme un projet écologique.
D'une part même s'ils parlent de biologie de la conservation, l'article sur wikipédia me paraît clair :
Citer
La biologie de la conservation (ou écologie de la conservation) est une discipline traitant des questions de perte, maintien ou restauration de biodiversité.
La biodiversité relève typiquement de l'écologie au sens large.
D'autre part -et je vais reprendre ce que je disais sur notre forum EDLS - pour le projet évolution ce sont des biologistes parce qu'il s'intéressent à l'ADN, mais par rapport à l'interaction avec l'environnement. Je le définirais donc comme du post-darwinisme (darwin qui était naturaliste).  :jap:
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: JeromeC le 29 September 2010 à 13:53
"Et toi tu fais quoi dans la vie ?
- Oh moi tu sais je crunche pour un projet post-darwiniste"

Tout de suite ça en jette :D
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: al@ON le 29 September 2010 à 23:13
 :lol:
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: viny le 30 September 2010 à 00:37
Tibi je veux bien te croire lorsque tu dis que Darwin était un naturaliste, tant que tu ne dis pas qu'il était naturiste ...  :lol:

Allez je cite WIKI :
Citer
Charles Robert Darwin (12 février 1809 – 19 avril 1882) est un naturaliste anglais dont les travaux sur l'évolution des espèces vivantes ont révolutionné la biologie. Célèbre au sein de la communauté scientifique de son époque pour son travail sur le terrain et ses recherches en géologie, il a formulé l'hypothèse selon laquelle toutes les espèces vivantes ont évolué au cours du temps à partir d'un seul ou quelques ancêtres communs grâce au processus connu sous le nom de « sélection naturelle ».
autre déf sur la biodiversité :
Citer
Qu’est-ce que la biodiversité ?
Le grand scientifique américain, Edward O. Wilson, considéré comme l’inventeur du mot biodiversity, en donne la définition suivante : « la totalité de toutes les variations de tout le vivant »
Selon les scientifiques, la biodiversité est la dynamique des interactions dans des milieux en changement. Elle se décline en diversité écologique (les milieux ), diversité spécifique (les espèces), et diversité génétique.

Le mot écologique apparait bien ...

Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: tibidao le 14 December 2010 à 13:16
Je me suis lancé dans une grosse mise à jour, dans le premier message de se sujet mais aussi en premier message de tout les projets de la catégorie.

Je commence à intégrer le statut du projet : alpha, bêta ou opérationnel.

Dans les sujets des projets, j'ai commencé à parcourir les sujets complets pour noter, toujours dans le premier message, ce qui peut être utile à savoir et qui à force se trouve dispersé.

Comme il faut lire l'intégralité des messages, et que j'ai pas tout le temps que je voudrais devant moi, ça prendra un peu de temps. Pour l'instant je suis arrivé à DNA.
S'il y a des infos que je n'ai pas noté, et que vous trouvez utile, n'hésitez pas à le signaler.  :jap:
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: JeromeC le 14 December 2010 à 22:39
Tu veux finir l'année en feu d'artifice ! Merci :D
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: ousermaatre le 15 April 2012 à 00:21
mise à jour du 1er post par Poly,  :jap:
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 15 April 2012 à 00:23
Je commence juste :desole: :desole:
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 24 February 2013 à 13:12
J'ai un peu mis à jour la liste, il manque sans doute encore des projets... :desole:
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: JeromeC le 24 February 2013 à 17:03
Tu devrais maintenir à jour la date de mise à jour du post (celle écrite bien lisiblement en début et en fin de post), ça donnerait plus confiance :)
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 24 February 2013 à 19:44
merci c'est corrigé...
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: Lic le 08 November 2013 à 22:19
Premier post à mettre à jour pour ajouter le nouveau projet WCG Mapping Cancer Markers.

Il faudrait faire une passe aussi sur les sujets WCG qui sont terminé comme HCC, HPF2 ... et les passer dans la sous section projet terminé ;)

Merci à celui qui aura le temps ^_^
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: tibidao le 26 May 2015 à 23:06
Bien, je vois qu'on laisse mon topic en sommeil...  :o

Je vais voir comment améliorer ça, actualiser un peu.

Le problème c'est que pour l'instant je suis plus dans le coup, quelqu'un peut m'aider en commençant à me donner des infos sur la santé des projets  ?

Merci aux volontaires (s'il y en a  :cavachier: )
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: Antares le 26 May 2015 à 23:18
Dans BAM, tu as la liste des projets terminés
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: tibidao le 26 May 2015 à 23:26
Merci antares, mais j'utilise pas bam, ou sam, ou autres, donc je trouverais l'info ailleurs ;)

En passant, ils sont de plus en plus fourni les placards qui affichent les badges sour les messages (connais même plus les noms). Pour quelqu'un qui suit pas, ça représente plus rien  :eek:
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: [AF>Libristes] Pascal le 26 May 2015 à 23:44
Ce n'est pas BAM!, en fait je crois qu'il voulait dire BOINCstats :
http://boincstats.com/fr/stats/-5/user/detail/15829/projectList
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: Antares le 27 May 2015 à 06:52
Oui oui...
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: JeromeC le 27 May 2015 à 07:03
Sur BoincStats (intéressant) la grande barre de menu de gauche regroupe les projets actifs et en bas les projets retirés.

Sur le (merveilleux) site de statseb tu as une page qui récapitule les badges par projet (et les membres de l'AF qui les ont), la souris sur l'image du badge te donne ses seuils.

Sur le (formidable) site de SetiBZH tu as une page avec le statut des projets (accessible depuis le portail d'ailleurs) mais plus orientée temps réel, je crois de mémoire que les gens sont retirés et les rouges ça peut être temporaire, à vérifier.
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: Antares le 27 May 2015 à 08:07
Les formidables sites des équipes de l'AF...
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: Lic le 27 May 2015 à 11:09
En parcourant la liste du premier post voici les mises à jour qui pourraient être faites (à recroiser bien entendu je n'ai pas la science infuse lol).

AlmereGrid Boinc Grid : inactif depuis un bon moment. Pas de nouvelles des admins du projet.

DNA@Home : a été intégré à Citizen Science Grid et est de nouveau actif.

Docking : projet terminé.

Donate@home: projet terminé.

DrugDiscovery@home : On peut toujours accéder au site et la dernière news date de juillet 2014 mais pas beaucoup d'activités sur le forum ni de WU.

FightMalaria@Home : projet terminé. Migration vers FiND@Home.

the Lattice project : projet actif mais WU fournies par intermittence.

Neurona@home : site inaccessible.

NRG : inactif. Les admins ont confirmés que le projet n'était pas mort.

Simap : projet terminé.

Superlink@technion : site inaccessible.

Virus Respiratorio Sincitial : site inaccessible.

WCG sous projet HFCC : projet terminé.

WCG sous projet HCC : projet terminé.

WCG sous projet DDDT2: projet terminé.

WCG sous projet HCMD2: projet terminé.

WCG sous projet HPF2: projet terminé.

Pour WCG, on peut ajouter les sous projets DSFL, GFAM et SNS qui sont tous les trois également terminé.
Par contre niveau sous projet bio actif, il y a les sous projets UGM et OET.

D'autres projets à ajouter :

DENIS@home : projet actif.

Drug@Home : inactif il me semble. Le site du projet est accessible mais pas de news.

TN-Grid Test platform : projet actif, beta (besoin d'un code d'invitation pour rejoindre le projet)

Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: tibidao le 27 May 2015 à 12:34
 :hello:

Merci Lic, je vais voir tout ça dès que possible ;)
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: JeromeC le 27 May 2015 à 13:38
A noter que Citizen Science Grid n'est pas un projet bio en soi, seul DNA est un sous-projet bio, il inclut aussi les sous-projets wildlife (éco) et subsetsum (maths).
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: Antares le 27 May 2015 à 13:55
Superlink est retiré/terminé
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: Maurice Goulois le 27 May 2015 à 14:28
Sur BoincStats, la page statistiques détaillées, l'onglet Mes projets donne la liste des projets retirés auxquels tu étais attaché et as produit des résultats, pour moi ça donne:

ABC Lattices @Home
ABC@home
AlmereGrid Boinc Grid
Correlizer
DistrRTgen
Donate@Home
eOn
Genetic Life
Goldbach's Conjecture Project
Mersenne@home
OProject@Home
OPTIMA@HOME
Predictor@Home
Proteins@home
QMC@Home
Rectilinear Crossing No
RieselSieve
Rioja Science
RSA Lattice Siever (2.0)
SHA-1 Collision Search Graz
SIMAP
SimOne@home
Spinhenge@home
Sudoku project
Sudoku@vtaiwan
Superlink@Technion
VTU@Home
XtremLab
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: tibidao le 31 May 2015 à 18:20
J'ai avancé un petit peu, j'ai déjà ma liste.

Par contre, j'ai un souci technique : sur mon premier post, la moindre modification m'entraine au delà des 20 000 caractères, et j'ai que 26 projets sur les 47 que j'ai relevés  :pt1cable:

ça va vraiment pas le faire ; à la rigueur j'aurais pu m'étaler sur le deuxième post si je l'avais réservé, mais c'est pas le cas.

Question aux modos/admins : Vous pouvez supprimer le post de gulu qui est en deuxième ? ou alors je crée un deuxième topic ? Merci !  :jap:
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: Maurice Goulois le 31 May 2015 à 18:30
Au fait, tu veux que je retire mon post précédent, je vois qu'il y pratiquement aucun projet bio dans mes retirés, si tu veux nettoyer le topic?
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: Jaehaerys Targaryen le 31 May 2015 à 18:40
Message enlevé

Question aux modos/admins : Vous pouvez supprimer le post de gulu qui est en deuxième ? ou alors je crée un deuxième topic ? Merci !  :jap:

Titre: Re : Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: tibidao le 31 May 2015 à 19:02
Au fait, tu veux que je retire mon post précédent, je vois qu'il y pratiquement aucun projet bio dans mes retirés, si tu veux nettoyer le topic?

T'embête pas, j'ai trié les infos...  :D

Merci poly !   :jap:
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: tibidao le 05 June 2015 à 18:06
J'avance petit à petit, le temps de relire tous les topics, de retrouver tous les sujets... :coffeetime:

Du coup il faut regarder les deux premiers posts, le premier pour les projets actifs, le deuxième pour les projets arrêté/suspendus/fusionnés.

Il y a encore du boulot (j'ai déjà dû arranger le bordel dans le bbcode  :priz2tet: ), j'en suis arrivé à docking.  :etmerde:
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: tibidao le 11 June 2015 à 22:25
Allez, 24 projets sur les 44 que j'ai, j'en suis arrivé à neurona...   :gno:

j'ai une grosse majorité de projets terminés/suspendus/disparus pour l'instant...
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: LOCTET SetiOne le 12 June 2015 à 19:12
 :jap: :jap:
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: JeromeC le 13 June 2015 à 19:00
Le turn over des projets est assez impressionnant, ça commence, ça s'arrête... Il y a quelques grosses planètes stables et pas mal de comètes qui sillonnent l'azur boinc...
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: Maurice Goulois le 14 June 2015 à 00:13
Mettre en place un projet Boinc, ce n'est pas une sinécure... je n'entre pas dans la description de ce que ça requiert  :D Des initiatives comme EDGEs ou SZTAKI sont nécessaires mais pas suffisantes; pour la plupart des projets ça reste du one man show.
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: tibidao le 25 June 2015 à 16:22
Ouf, ça y est j'ai fini mes mises à jour (juste deux petite modifs à faire dans la présentation) !!!  :kermit:

J'espère que j'ai rien loupé, n'hésitez pas à signaler s'il y a des erreurs, oublis...

On a donc au final :
- 10 projets actifs, plus 4 plateformes multiprojets
- 30 projets inactifs/terminés/suspendus/mort vivants  :siflotte: , plus les projets terminés de WCG...

 :jap:
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: [AF] fansyl le 25 June 2015 à 16:41
Euh... je crois que tu peux passer FightAIDES@Home en projet terminés, il reste encore qqs unités en re-send mais normalement c'est fini!

 :hello:
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: tibidao le 25 June 2015 à 16:58
Tant qu'il y a quelques unités, même en re-send...  :D
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: tibidao le 07 July 2015 à 19:02
Petite mise à jour aujourd'hui, j'ai remis TN-Grid dans les projets actifs vu que, malgré le fait qu'ils aient remercié tout le monde et fait une publication, il y a des unités de travail en circulation  :pt1cable:. Merci fzs600 pour l'info.  :jap:

Sinon j'ai fait le statut de l'ensemble des projets arrêtés/suspendus/abandonnés/disparus/en migration interminable.  :siflotte:

Pour physiome, je pense qu'il va définitivement rester dans cette catégorie, j'arrive même plus à accéder au site.  :jap:

J'ai rapatrié les projets dispersés dans d'autres partie de forum, et fait quelques transferts dans la partie bio-projets terminés.  :coffeetime:

Normalement on est pas mal...

PS : pour fightAIDS@home, un des responsables a dit ça aujourd'hui :
The project is not complete until the fat lady sings, as was stated before! There are multiple possibles to include Intermittent state.

Traduction : le projet n'est pas terminé jusqu'à ce que la grosse dame chante, comme il a été dit avant. Il y a de multiple possibilités d'inclure l'état d'intermittent.

Donc je laisse en actif, j'attends le chant de la grosse dame...  :lol:
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: LOCTET SetiOne le 07 July 2015 à 20:13
 :jap: :jap:
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: titidestroy le 11 May 2016 à 14:23
Merci pour cette liste.

Il manque le sous projet Evolution de Yoyo dans la liste récapitulative.

Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: ousermaatre le 11 May 2016 à 14:44
ajouté, merci pour la remarque  :kookoo:
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: Scrat65 le 03 December 2016 à 13:56
Le projet Poem@Home est arrêté. :/
Le dernier message en page d'accueil de leur site indique en date du 4 octobre 2016 :" We [...] will gradually empty the queue and shutdown the server daemons after approximately 2 months".

Bonjour chez vous
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: JeromeC le 03 December 2016 à 14:25
Oui nous en parlâmes dans le topic de poem, qui a d'ailleurs été déplacé dans les projets terminés :spamafote:


edith : heu c'est ce que je croyais, mais je le trouve plus du tout le topic de poem (à part un topic sur "poem test")... ?
Titre: Re : Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: fzs600 le 03 December 2016 à 15:26
Oui nous en parlâmes dans le topic de poem, qui a d'ailleurs été déplacé dans les projets terminés :spamafote:


edith : heu c'est ce que je croyais, mais je le trouve plus du tout le topic de poem (à part un topic sur "poem test")... ?
http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2312.0.html (http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2312.0.html) :kookoo:
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: JeromeC le 03 December 2016 à 15:30
Ah il n'est pas dans "projets bio terminés" (contrairement à poem test) mais dans les "projets terminés" tout court... c'est un peu confusant.
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: Scrat65 le 03 December 2016 à 17:12
Il faudrait alors le retirer de la liste des projets actifs présentés dans le premier message et le rajouter à la liste des projets terminés/suspendus. Savez-vous qui peut réaliser cette modification ?

Bonsoir chez vous
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: [AF>Libristes>Jip] Elgrande71 le 09 December 2016 à 18:13
Tout simplement un modérateur .
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: Maeda le 25 February 2018 à 14:16
Pas de modérateur pour mettre un coup de balai sur le premier post ? Dans l'état, s'il n'est pas un minimum à jour, le topic ne sert à rien :smak:
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: tibidao le 23 June 2018 à 16:50
Bonjour  :hello:

Apparemment je suis toujours modérateur, je pourrais y jeter un œil  :jap:

Laissez moi quelques jours pour me renseigner  :coffeetime:
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: [AF] fansyl le 23 June 2018 à 16:57
Perso ce qui m’intéresse c'est un projet bio GPU autre que GPUGrid. Il y a avait POEM mais c'est fini.

 :hello:
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: Maeda le 23 June 2018 à 21:05
Idem sinon Folding@home (mais qui n'est pas Boinc).
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: Jejerotto le 01 March 2024 à 10:23
Salut à tous, savez vous quel projet de biologie rapporte le plus en points journaliers ? Je ne sais pas sur quoi calculer avec ma machine, avant le raid de printemps sur primegrid j'étais pendant de longues années sur WCG, j'aimerais participer sur autre chose pour aider un autre projet.
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: kasur le 01 March 2024 à 10:30
 :kookoo:

Il y a GPUGrid qui plie des protéines en GPU et qui paie bien, par contre il a l'air intermittent, je ne sais pas si faire du cache suffit a ne pas avoir de temps mort.

En CPU tu as SiDock qui fait la même chose mais sans GPU pour l'instant, il paie pas bien mais pas mal non plus normalement.
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: [AF>Amis des Lapins] Jean-Luc le 01 March 2024 à 11:07
Il y a aussi Denis, mais il est aussi intermittent.

WCG vient aussi de couper les livraisons ce matin.

En biologie, tout semble intermittent !
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: Jejerotto le 01 March 2024 à 13:56
ok merci, j'ai oublié de préciser que c'était pour mes cpus (core i7 13700KF) que je cherchais, pour mon gpu je vais l'utiliser comme un porc sur les projets qui payent le plus, amicale numbers je crois
Titre: Re : Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: [AF>Amis des Lapins] Jean-Luc le 01 March 2024 à 14:06
ok merci, j'ai oublié de préciser que c'était pour mes cpus (core i7 13700KF) que je cherchais, pour mon gpu je vais l'utiliser comme un porc sur les projets qui payent le plus, amicale numbers je crois
Nan, pour les GPUs, GPUGrid paye plus !
Et SRBase aussi, sous projet TF.
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: [AF] fansyl le 01 March 2024 à 20:35
Je me permets un message, en pseudo-spécialiste des projets Biologie  :siflotte:

Si tu as un GPU assez puissant (> série 1000 de nVidia), je te conseille de laisser les vannes ouvertes sur GPUGrid qui est le projet référence en termes d'utilité (le nombre de publications est impressionnant et on connait son % de participation à chaque publi scientifique, c'est sympa).

Après y'a WCG qui est en pente descendante mais il y a quand même du Mapping Cancer Markers (en CPU) et du OpenPandemics (en GPU) à faire. Idem, beaucoup de publications scientifiques, on connait les équipes de recherches derrière, c'est transparent.

Rosetta (CPU) est en train de publier de nouvelles unités en Beta donc ça laisse penser qu'il se passe des choses. Attention cependant avec ce projet qui prend pas mal de RAM et d'espace disque. Ils ont eu leurs heures de gloire pendant le Covid mais c'est retombé depuis. C'est le labo Bakerlab, c'est du sérieux aussi.

Denis (CPU) est effectivement en intermittent mais avec un peu de cache, on arrive à faire le pont. Basé à Zaragosse (Espagne), l'idée est de modéliser le cœur pour travailler sur les maladies cardiaques.

Je suis plus réservé sur Sidock (CPU) car une partie du projet semble porté par des Russes, et j'ai du mal avec ça, quand bien même les Universitaires n'y sont pour rien dans ce bordel. Le code est open-source donc ça rassure toutefois un peu sur les calculs effectués.

Comme évoqué par Jean-Luc, il y a beaucoup d'intermittence en biologie car souvent les scientifiques font des contrôles entre chaque lot. Si tu ouvres les vannes un peu partout, tu devrais réussir à alimenter tes CPU/GPU en continu.
J'ai arrêté depuis longtemps cette histoire de points, considérant que rien n'est comparable, je me contente d'aider et j'espère que ce post y contribue.  :jap:

 :hello:
Titre: Re : Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: fzs600 le 01 March 2024 à 21:11
je me contente d'aider et j'espère que ce post y contribue.
C'est la cas.  :kookoo:
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: Jejerotto le 02 March 2024 à 09:50
ok je bascule mon GPU sur GPUGrid, je reçois pas de WUs pour l'instant...
Titre: Re : Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: [AF] Kalianthys le 02 March 2024 à 10:01
ok je bascule mon GPU sur GPUGrid, je reçois pas de WUs pour l'instant...

Je crois qu'actuellement il n'y a que des tâches GPU qui fonctionnent sur Linux uniquement.

Donc si tu es sur Windows tu ne recevra rien.

Kali.

Titre: Re : Re : Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: fzs600 le 02 March 2024 à 10:47
ok je bascule mon GPU sur GPUGrid, je reçois pas de WUs pour l'instant...

Je crois qu'actuellement il n'y a que des tâches GPU qui fonctionnent sur Linux uniquement.

Donc si tu es sur Windows tu ne recevra rien.

Kali.
Par intermittence il y ausi des UT pour Windows pour ATM er ATMbeta https://www.gpugrid.net/apps.php (https://www.gpugrid.net/apps.php) pour faire simple il faut laissé les vannes ouvertes en permanence.  :kookoo:
 
Titre: Re : Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: [AF>Amis des Lapins] Jean-Luc le 02 March 2024 à 11:30
J'ai arrêté depuis longtemps cette histoire de points, considérant que rien n'est comparable, ...

Oui, les points c'est grisant !
Mais moi aussi, je lance assez souvent des projets qui ne rapportent pas grand chose.
C'est pas le nombre de points qui fait l'intérêt scientifique d'un projet.
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: JeromeC le 02 March 2024 à 12:45
Une bonne pinte de bière me grise plus que des crédits boinc cependant :lol: :cetaboir:
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: toTOW le 03 March 2024 à 12:04
Sinon sur Folding@Home, il y a toujours du taf ... :siflotte:
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: Jejerotto le 04 March 2024 à 10:21
ok j'ai laissé les vannes ouvertes sur GPUGrid, je verrai bien sur windows ce que je reçois par intermittence...
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: [AF>Amis des Lapins] Jean-Luc le 04 March 2024 à 10:41
En ce moment, tu devrais en recevoir tout de suite, il y en a plein.
Si tu n'en reçois pas, je crains que ce soit grillé pour toi avec Windows !
Titre: Re : Récapitulatif des projets de la catégorie biologie
Posté par: Jejerotto le 04 March 2024 à 13:05
En ce moment, tu devrais en recevoir tout de suite, il y en a plein.
Si tu n'en reçois pas, je crains que ce soit grillé pour toi avec Windows !
merci mais je ne suis pas chez moi et le pc est éteind, rallumage vers 16h30, crunchage en semaine de 16h30 à 7h et le week-end full crunch.