Aug 15, 2005
Due to SIMAP upgrades the BOINCSIMAP system is out of work at the moment. The compute tasks will start again in september 2005.
Ils n'ont pas forcément le même but, de toute façon on va surement voir arriver une multitude de projet très ressemblant... après il faut fare des choix ! :sweat:
Mais sur ce projet on a déjà de la concurrence :
http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/team_display.php?teamid=31
:D :D :D
tu parles des crédits de chaque projets ou bien je suis à côté de la plaque et ce n'est pas à moi que tu poses la question ? :D
The use of SIMAP is completely free for education and public research.
SIMAP supports many different projects in life sciences. Choosing SIMAP accelerates not only our project but many research projects all over the world.
our project is supported by our university. So we do not need any additional donations (except on CPU time on your computers).
Mise à disposition du nouveau client SIMAP v 5.08 : Comme annoncé la semaine dernière nous avons distribué la version 5.08 du client SIMAP. Le nouveau client sera téléchargé automatiquement sur votre plateforme BOINC. Les clients additionnels Linux et Windows pour les processeurs i386 (sans MMX/SSE) et les clients pour UNIX sont disponibles en téléchargement manuel (voir la page de téléchargement pour connaitre la manière de la faire marcher sur la plateforme anonyme). Le Validateur acceptera la 5.07 pendant une durée de 10 jours - donc jusqu'au 29 Juin- (et ceci pour toutes les plateformes même avec les différences d'arrondie) ainsi que les résultats de la 5.08 (certainement les unités 5.08 calculée avec l'opti de akosf -différences d'arrondie-) , après seule les unités calculées par la v5.08 seront validés. Nous avons examiné la nouvelle version du client sur plusieurs ordinateurs et plateformes : tous les essais ont réussis. Néanmoins il est possible que certain problèmes puissent survenir Si c'est le cas , rapportez les svp dans sur notre message board (http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/forum/)
Ha y es il a répondu :D
Heyoka traduction ? :D
Ce fil de discution décrit très bien les possibilités de coopération entre Rosetta (ou d'autres projets de repliement de protéine) et SIMAP. Dans le cas de la recherche d'une similitude entre séquences, SIMAP est précisément correct. Pour la modélisation 3D, il existe cependant d'autres outils. La question soulevée consistant à comparer FASTA et BLAST est peu opportune, car les deux programmes travaillent de façon semblable par rapport à l'application Smith-Waterman de référence tout en apportant quelques adaptations pour accélèrer la vitesse de traitement (= approche plus exhaustive). Les résultats sont comparables, on ne peut pas en dire autant de PSI-BLAST, qui met en oeuvre une comparaison des séquences non pas par paires mais par des comparaisons entre de multiples séquences. Nous avons choisi FASTA parce qu'on peut l'ajuster à un bon niveau de sensiblilité, c'est pourquoi nous l'utlisons dans nos unités. Car c'est dans la comparaison des sensibilités entre BLAST et Smith-Waterman, que nous tirons comme conclusion qu'elle est clairement mieux que BLAST
salutations
Thomas
The project has currently no work (see below).
The similarity matrix of the SIMAP project is currently up to date. The calculation of new simap workunits containing the novel proteins from october 2006 will start around november 1st.
The initial calculation of protein domains has been finished. The calculation of updates (new sequences and new domains from InterPro 13.0) will start around november 15th.
Les unités actuelles contiennent environ 100.000 nouvelles séquences issues des bases de données Uniprot et Genbank.
Calculation of SIMAP updates will start in the morning of december 2nd.
The approx. 30.000 workunits will contain approx. 65.000 new sequences from the databases Uniprot, RefSeq, PDB and Genbank.
New HMMER workunits postponed: due to the release of a new version of the protein domain database InterPro we will adapt our System to InterPro 14.0 first and then start in the middle of january the new HMMER calculations.
Rappelons qu'un lot de WUs est également prévu début janvier
January 15, 2007
New workunits: the approx. 150.000 new workunits for the HMMER application update the domain information in SIMAP to InterPro 14.0. The workunits contain models from the approx. 200.000 new sequences from the InterPro databases PFAM, PIR, Superfamily, SMART und TIGR
C'est quoi le problème avec les HMMER :??:
Environ 51 minutes sur un E6300 non overclocké en Debian Etch 64 bits
comment on fait pour réglé la quantité de WU qu'on veut stocké?
ben quand on voit le scren de Douglas on voit plein de travail pour simap comment il a fait pour en stocké autant?
Attention les unités partent extrêmement vite.
On en est dejà à la partie 6/8
http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/batchmonitor.php
Demain soir, il ne devrait plus rester de Simap.
C'est le moment de faire des réserves :whistle:
A mon avis, il y a d'autres WU qui arriveront demain :)
New workunits: The calculation of similarities and features of the approx. 350.000 new sequences, that were imported from the databases PDB, Uniprot and RefSeq-genomes during april, and of 10.000 new domains from the new InterPro version 15.0, will start on may 1st (due to a technical problem not on april 30th as announced before).
Ouais mais d'habutude, ça commence le 1er et non le 31, et apparement, ce sont des Wu de mai qui ont été reportées => "Similarities of the 33.000 new sequences in SIMAP, imported in may 2007"
New workunits: The calculation of similarities and features of the approx. 350.000 new sequences, that were imported from the databases PDB, Uniprot and RefSeq-genomes during april, and of 10.000 new domains from the new InterPro version 15.0, will start on may 1st (due to a technical problem not on april 30th as announced before).
j'en ai eu que 3 (bouuuhhhhh) lool.
Sinon le RAID se finissant avec le mois de mai (jolie mai, mois de marie... hummm je m'égare), reste le pending :)
Déjà 2800 points de pending :D
http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/pending.php
:bounce:
Seulement ? :lol: :lol: :lol: :lol: :lol:
Ouais, j'ai que 1000 points qui ont crédités depuis hier 20h
T'es à combien de pending toi ? :)
je rigolais beaucoup moins que toi :cry: mais j'ai surtout des celerons alors avant que ça paie :lol: :lol:
Par contre sur le forum simap ils sont verts : 2 unités par personne dispo et certains en ont 100/core !!! :lol: :lol: :lol:
Sur le temps avec tes 200 ut de plus tu vas me passer mais sur le classement monde en rac on devrait faire un bon coup :whistle: je préfère être 2è ( pas le choix :fou: ) de l'AF mais dans le top 20 mondial et là je pense que c'est faisable ( surtout toi !! ) :bounce: :bounce: :bounce:
pour le pending à peine plus de 1000 :sweat: mais ton V8 sera vide cette nuit alors que mon P3 ..... :lol: :bounce: :lol: :bounce: va passer le week end au chaud [:frederic]
EDIT : j'ai passé commande d'ici 1 mois ou 2 je te grille : http://www.presence-pc.com/actualite/supercalculateur-cray-15858/ :ange:
La plupart des WU téléchargées sur le V8 ont l'air assez longues quand même ;)
c'est vrai qu'elles mettent plus de temps que sur un 6600 :lol: :lol: :lol:
heureusement qu'ils sont 8 , ils s'encourragent :lol: :lol:
Jaloux moi !! non, non, et non :heink:
En plus ce soir ya euromillions :na:
25.5 pts/h c'est pas mal ;) surtout x8 :ouch:
Mais c'est nul à côté de Riesel :p
Sur Riesel, je produis 14,95 points au minimum X8 toutes les 17 minutes en moyenne ! :p
si tu va par là avec seti opti 62.xx pts en 50mn ( x2 et on ne rigole pas merci ) :ouch:
Mouarf moi qui voulait me mettre à Simap, quelle fut pas ma surprise quand je me suis enregistré ce début d'après midi et qu'il y'avait déjà plus de taff :lol: rendez vous le mois prochain :lol: trop nul :(
Tu me fera un signe en passant :lol: :lol:
http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/team_display.php?teamid=37
:ouch:
en plus je suis encore un peu sur le raid WCG ( sinon :non: )
pas trop essayé Riesel, t'es en 64bits ? ça donne quoi en 32 ?
Mouarf moi qui voulait me mettre à Simap, quelle fut pas ma surprise quand je me suis enregistré ce début d'après midi et qu'il y'avait déjà plus de taff :lol: rendez vous le mois prochain :lol: trop nul :(
Ouai :( c'est dègue mais comment ils ont fait? gros cache? vous avez une astuce pour en avoir une tonne pour le mois prochain? :p
Jascooby retiens ton quad !! j'aime pas trop qu'on soit collé derrière moi : http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/top_hosts.php?sort_by=expavg_credit&offset=20 :lol: :lol:
Bon J'ai plus que 374 Mo de WU sur les 1.4 Go téléchargés hier dans le V8 :lol:
Presque plus non plus dans le E4300, par contre encore plein dans le quad en 32 bits :p
Je suis rentré chez moi et je fais des lachers manuels, mais de ttes façon ça renvoi assez vite les WU Simap ;)
j'ai vu, c'est monté d'un coup .
Pour le V8 c'est sur que 800 UT c'était le mini pour etre tranquille :lol: :lol: là à peine plus d'une journée :ouch:
Par contre t'as vu l'accélération quand les célérons ont vidé le cache ? enfin l'unité qu'ils ont mis 5 heures à faire :lol:
Ouais, car même s'ils sont plus lents ils créditent autant une fois la WU terminée :)
Quand vous dites V8, c'est quoi comme bebette ? :d
Bon ça y est, il a bouffé ses 298 Wu ! :lol:
Kyuzo, V8 c'est 2 Xeon quad core.
Ici c'est 8X 2.66 ghz fsb 1333 :love:
A la base c'était des 2.13, il y a juste eu à isoler une pin avec du scotch pour les faire passer de FSB 1066 à FSB 1333 et de donc de 2.13 à 2.66 ghz :)
Ca consomme moins qu'un Bi Operon dual core en full qui n'est pourtant qu'un quad (et qui se fait totalement exploser par le V8)
EDIT : 3676 de pending :D
TOP 20 RAC World :bounce:
Mon changement de mobo m'a pris plus de temps que prévu sur le quad, j'ai diverses conneries comme des pertes de réseau aléatoires au boot, mais tout semble rentrer dans l'ordre !
Ca chauffe pas c'est moins une bouilloire que ma feu P5W :)
Regarde c'est marqué : P5W ;)
Mais non elle a laché suite à un trop fort voltage que je lui avais mis il y a 6 mois.
Bon ça y est, il a bouffé ses 298 Wu ! :lol:
Kyuzo, V8 c'est 2 Xeon quad core.
Ici c'est 8X 2.66 ghz fsb 1333 :love:
A la base c'était des 2.13, il y a juste eu à isoler une pin avec du scotch pour les faire passer de FSB 1066 à FSB 1333 et de donc de 2.13 à 2.66 ghz :)
Ca consomme moins qu'un Bi Operon dual core en full qui n'est pourtant qu'un quad (et qui se fait totalement exploser par le V8)
EDIT : 3676 de pending :D
TOP 20 RAC World :bounce:
Ah ouais, et un seul xeon comme ça coute combien ? :d
:o
http://fr.boincstats.com/charts/chart_fr_simap_compare_credits_users_465;23012;24401.gif
Dépend si tu l'achètes en version classique Box officielle ou si tu te débrouilles à en trouver une au marché noir :D
Les miens sont des 2.13 fsb 1066 avec mod pin soft (scotch isolant) @2.66 fsb 1333
http://prixmateriel.com/processeurs_1/intel_3/detail_41280.html
Dépend si tu l'achètes en version classique Box officielle ou si tu te débrouilles à en trouver une au marché noir :D
Les miens sont des 2.13 fsb 1066 avec mod pin soft (scotch isolant) @2.66 fsb 1333
http://prixmateriel.com/processeurs_1/intel_3/detail_41280.html
Pas bizarre, c'est un mod normal ;)
Cher c'est clair, pour le prix d'un seul on peut en avoir 2 xeon 775 de 4*2.13ghz, seul bémol y'a pas de carte mère bi proc pour le s775 mais les perfs sont identique et c'est bien moin cher :p
Mais j'ai déjà un quad à côté :D
Pour le prix je me suis débrouillé :whistle:
Ouais sinon j'ai 3000 de pending sur Simap et ça crédite plus :(
:) vous avez commencé à surveiller l'horizon pour guetter l'arrivage de juillet?
bizarre que l'excitation ne vous ait pas encore gagnés :lol:
Sisi les vannes sont ouvertes depuis ce matin sur mes PC :p
S'il y a de la quantité, je compte bien faire un "coup" :o
Sisi les vannes sont ouvertes depuis ce matin sur mes PC :p
S'il y a de la quantité, je compte bien faire un "coup" :o
Laisses-nous en, sinon je mets le coyote à tes trousses.
bonjour,
je vais faire ma premiere experience avec simap (enfin je vais essayer si vous me laissez des UT ;)
Comment sont les UT (taille duree, Ram etc?)
pas de particularite?
merci pour les infos
Internet traffic
Some users have slow (dial-up) or limited bandwidth internet connection; internet traffic generated by BOINC projects may be an issue. 3 columns try to delineate demands of each project. Note that when running several projects, you need to average each upon your resource share.
1st WU - download demands on first WU which includes: application + project files (CPDN model inputs, life-science protein database etc) and finally one WU. Usually, there is no need to re-download whole again unless (i) new application is released, (ii) new input files for WUs are deployed, (iii) project reset.
1 WU down/up - first number enumerate size of the WU for download (data for analysis); number after slash is the usual size of WU for upload (results size).
MB/month - when running project on 24/7 basis, 100% dedicated on dual-cored CPU (be it reference machine of AMD or Intel, whatever generates more results - see below), traffic may considerably grows and make it almost impossible to participate for some users. In other words - users provide idle CPU cycles and HD space (see next) but also internet bandwidth.
merci, c'est ce tableau que je cherchais...
il faudrait l'epingler quelque part...
par contre ca veux dire quoi "internet trafic 5500 et juste a cote Gb !!!!
cordialement
Jmdish
L'unité fait 5500 kb en téléchargement et 10 en retour .
oki :jap: je demandais parce que bon en Belgique les connections internet c'est pas ça :(
J'étais déjà vert d'avoir raté les unités de juin, quelques heures plus tôt et ça aurai suffit :p je savais pas que ça partait si vite mdr mais cette fois y'en a bien plus ;)
Attention ça ne va plus tarder
7070101 Similarities of approx. 100.000 new sequences in SIMAP, imported in june 2007 SIMAP@home 0.0 % 0 41158
7070102 Similarities of approx. 27.000 new sequences in SIMAP, imported in june 2007 SIMAP@home 0.0 % 0 9534
7070103 Domains of approx. 100.000 new sequences in SIMAP, imported in june 2007 HMMER@home 0.0 % 0 8100
7070104 Domains of approx. 27.000 new sequences in SIMAP, imported in june 2007 HMMER@home 0.0 % 0 2025
7070105 Domains of all SIMAP sequences compared to 95 new models of the HMMPIR database HMMER@home 0.0 % 0 723
7070106 Domains of all SIMAP sequences compared to approx. 8000 new models of the CATH database HMMER@home 0.0 % 0 28920
Ah bon ? :( Fut un temps je me souviens que vous aviez une certaine avance sur nous, quand nous étions en 512 en 2002 vous étiez déjà en 2 ou 4Mb
En espérant qu'il y en aura beaucoup, quelqu'un a des infos ? :)
En parlant de news:
http://www.boinc-af.org/content/view/661/1/
Comme je l'ais mis sur la news sur boinc-af.
Il y a 4 fois plus d'unités que le mois dernier.
Le mois dernier les unités étaient parties en quelques heures.
Donc là ça devrait durer 1 ou 2 jours, donc au mieux il y aura des unités jusqu'à Lundi. Mais c'est aussi possible que tout parte avant dimanche soir
yes :bounce:
je suis redescendu de 10 jours à 6 et ça roule
C'est quoi le meilleur réglage sur le nombre de jours à mettre ?
[fixed]C'est peut être dû au fait que Simap est optimisé SSE ? [/fixed]
Il y a quelque chose a faire (comme pour Seti) pour l'optimisation ?
J'attends les non renvoyées à temps :p
:lol: :lol: :lol:
Par contre comme ils renvoient une unité en milieu de deadline si toujours pas renvoyé . Il devrait y en avoir quelques'une dans 1-2 jours mais pour les avoir pas évident !!!
> Jascooby : Cela pourra te servir :lol: :lol:
ris bien hein, mais j'ai qd même réussi à en chopper 50 sur mon P4HT avec 0.3 de cache (vu que j'étais pas chez moi pour le changer :p)
Je pense que le Quad aura fini ce soir et le V8 demain :(
Reste plus qu'à espérer :bounce:
Le joli bug :D
Je pense que le Quad aura fini ce soir et le V8 demain :(
Reste plus qu'à espérer :bounce:
CHUT !!!!! :fou:
:D
Meuh non, il s'agit juste d'une uniformisation des CPID (je pense qu'il s'agit de SIMAP qui a intégré ce CPID).
:o
:hello:
Le V8 est en tète du classement sur SIMAP ...
http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/top_hosts.php
J'annulé les hmmer pour ma part car je ne fais que les simap
peut-être à tort mais les hmmer créditaient 50 à 60% moins bien que les SIMAP . est-ce toujours vrai ?
Les Hummers c'est trop lourd :o :D
J'ai annulé les hmmer pour ma part car je ne fais que les simap
ça c'est de l'info :p
moi je n'essaye même plus d'en télécharger, une vraie cata sur mon PC :p
J'ai annulé les hmmer pour ma part car je ne fais que les simap
peut-être à tort mais les hmmer créditaient 50 à 60% moins bien que les SIMAP . est-ce toujours vrai ?
Non depuis 2 ou 3 mois c'est le contraire les Hmmer donnent plus de points
Faut les activer via les options de Simap ?
Non depuis 2 ou 3 mois c'est le contraire les Hmmer donnent plus de points
:(
edit : ce n'est pas ce qui est indiqué sur ton tableau de "points et temps de calcul"
Mon tableau n'est plus mis à jours depuis longtemps :(
Je viens de faire un calcul basé sur 16 unités Hmmer et ça donne 28,23 points/heures, soit 7% de plus que la simap 5.10 :jap:
ok :) la prochaine fois je garderai les hmmer donc :jap: (sauf sur les AMD qui sont très mauvais avec cette appli ça c'est certain)
:hello:
Bon ça y est, mon V8 en a terminé avec ses 800WU depuis 4h du mat !
Tu as vu qu'il y en avait pas mal en erreur de téléchargement ? donc moins de 800 :sweat:
Ah pu j'ai tout pris :p j'en ai eu 18 pas plus :/
Tant mieux pour toi. Le problème est que tu as 6 pc et que moi je n'en ai que 2. Mais n'oublie pas de terminer tes unités du 1 juillet, il t'en reste encore et le deadline est demain. :non: ;) [:marc]
purré ca fait une heure que j'essaie d'en avoir et j'ai que dalle, meme en forcant les MaJ!
Il m'en veut ou quoi? :fou: :fou: :fou:
23 pour moi, pas mal... (1 seul pc).
Bon ben 3 pc en ont récupéré mais je dirais pas combien après on se fait engu.... :D
Sinon leurs serveurs ont du mal à suivre en ce moment :lol:
Tu arrives trop tard, on a tout pris ou presque :o
:p
Pas grave, si on s'y met tous comme ça chaque mois ce million va vite être comblé :)
Le must serai que 50% de l'AF s'y mette tout les mois au moin 3 - 4 jours, faudrai instaurer un truc ainsi :p
4 jours sur 30 uniquement pour simap c'est pas trop demandé si? :) On choppe toutes les Wu et il en reste plus pour les autres teams :lol:
Nouvelle distribution d'UT, dépêchez vous. :bounce:
Surtout que les WU ne durent pas plus que 3-4 jours maxi à calculer :)
C'est gentil mais tu ne serais pas un peu à la bourre :sleep: ? plus que 300 sur les 12000 de départ !!! :D
Faut que tu arrêtes de fréquenter la team ouest :lol: :lol: :lol: :lol:
Je les recois à: 18
07/07/2007 22:18:01|boincsimap|[file_xfer] Started download of file 7070703.012571
07/07/2007 22:18:01|boincsimap|[file_xfer] Started download of file 7070703.012408
07/07/2007 22:18:15|boincsimap|[file_xfer] Finished download of file 7070703.012571
07/07/2007 22:18:15|boincsimap|[file_xfer] Throughput 159393 bytes/sec
07/07/2007 22:18:15|boincsimap|[file_xfer] Started download of file 7070703.012579
07/07/2007 22:18:24|boincsimap|[file_xfer] Finished download of file 7070703.012408
07/07/2007 22:18:24|boincsimap|[file_xfer] Throughput 88199 bytes/sec
07/07/2007 22:18:24|boincsimap|[file_xfer] Started download of file 7070703.012600
07/07/2007 22:18:27|boincsimap|[file_xfer] Finished download of file 7070703.012579
07/07/2007 22:18:27|boincsimap|[file_xfer] Throughput 159259 bytes/sec
Et je poste à 20.
:??: :heink:
> Jascooby :hello:
Tu calcules trop vite ça met tout en pending !!! Laisses nous un peu de temps :lol:
Sinon ce mois-ci tu devrait être le plus gros calculateur de l'AF sur simap ;) :heink: ou au moins le 2ème :sol:
:??: :??:
je ne vois pas ce que tu veux dire ..
Si tu penses réinstaller Windows sur le DD dont on parle , oui, à priori pas de Pb.
July 30, 2007
New workunits: The calculation of similarities and features of the approx. 200.000 new sequences, that were imported from the databases PDB, Uniprot and Genbank in july, will start in the evening of july 31st.
merci
Si on fait comme le mois dernier on devrait doubler une ou deux équipes.
C'est quand l'evenning du 31 pour celui qui le dit sur le site de Simap ?
unsent 126,000
Déjà pleins d'erreurs de téléchargement :( :cry:
Ah Linux quand tu les tiens :lol: :lol: :lol:
Sinon ça télécharge doucement mais en permanence donc déjà de quoi tenir quelques heures :D
Bon ben j'ai mes 50 unités, ça me suffit amplement :)
Celle de mon Quad sous Win déconnent aussi :(
M'en reste plus que sur le Quad, qques unes sous Win et un bon paquet sous Linux :p
Le V8 a déjà tout terminé cette nuit. Le temps d'être N°1 mondial au RAC pour un très court laps de temps :D
Tu as testé ma méthode de changer le DCF ? Pour moi ça marche à tout les coups ^^
J'ai pas eu le temps de voir :sweat: tu peux recommencer :lol:
Pas eu trop d'erreur finalement ?
Edit : je croyais que tu parlais du top user :( ... dans le top computer c'est vrai que ton V8 est premier :D
DCF=duration correction factor ;).
et si on m'expliquait, en profitant de la fin de semaine ? Ou que l'on me donne un lien :jap:
le problème est que je ne reçois qu'un minimum de calculs, quel que soit le projet, donc j'en ai pour six heures d'avance sur mon pc :o
BernardP, http://forum.boinc.fr/boinc/Lesprojetsdistribues/LHC/lhc-sujet_197_8.htm , qqs posts plus haut tu trouvera la réponse. :sol:
Ben non finalement pas d'erreurs et toi ?
Même le PM de mes parents a tout calculé, c'est toujours ça de pris :p
:jap: mais je ne comprends pas pourquoi, que je demande du travail pour 2 ou 6 jours, par exemple sur riesel, j'ai actuellement 13 unités maxi en stock :o 7 heures de travail :ouch:
et sur tous les projets comme ça
mais c koi une bonne valeur pour le DCF ?
Le nouveau système d'attribution des unités devrait avantager l'AF, puisqu'on est plus nombreuix que les autres équipes à calculer sur le projet.
De la daube leur système, je suis limité à 10wu par jour et par core sur mon C2D, je vois pas ou ça avantage l'af ! en tout cas ça n'avantage pas les XTC !
et en plus, ça ne va fonctionner que si on est devant le pc pour cliquer "mettre à jour" :(
bon coté de la chose, les pending vont disparaître :heink:
Il suffit de mettre
se connecter aux serveurs tout les 0,1 jours
Boinc renvoit les unités automatiquement.
Même 1 jours, ça suffit largement, le but est surtout qu'il n'y ait plus persone qui fasse des stocks pour 10 jours de calculs
C'est à dire?
Moi, j'aimais bien l'idée de faire un stock dès la sortie des unités. Ca faisait un peu sport et laissait libre cours à l'imagination de chacun pour essayer d'en capter un max.
De plus, je viens de réessayer ma technique d'avoir plusieurs copie deBoinmanager. En les ouvrant chacun leurs tours et en se connectant au projet Simap, il me donne 20 unités pour chacun (du moins j'ai essayer sur 2). Donc là j'en ai 40 à calculer ... On peut toujours faire le plein...
Mais si le nombre total d'unités est toujours limités alors je suis sur d'en prendre pour jusqu'à la fin des deadline ... 10 jours de boulot quand il n'ya d'unités que pendant 1 ou 2 jours ...
Je ne pense pas etre un enfant gaté ...
OK, je comprends un peu mieux sa phrase en la relisant en séparant les deux premiers morceaux ...
C'est pas normal, comme quoi c'est foireux
Perso sur mon C2D c'est débloqué j'ai le quotat à 100wu apparement mais sur mes autres pc c'est toujours bloqué à 10 ...
Bref une chose est sûr ça me plait pas on ira leur faire savoir sur leur forum :)
Bon ça y est, c'est revenu dans l'ordre, les stats sont là :)
Mon V8 a refait le plein une seconde fois de WU, c'est cool :bounce:
Par contre je me refuse d'utiliser qque méthode, y'a des WU tant mieux, y'en a pas tant pis ;)
Ben c'est clair que si ça passe en projet continue, ça perdra bcp de son charme :(
http://gimli.originet.eu/~jmarc/boinc/images/signatures/cf3e8cfccc89b58dc1771238b5323bcb.jpg
Il n'y a pas qqun pour faire un petit résumé sur les dernières news du projet ?
Ils ont reçu gratuitement un nouveau serveur très puissant de chez Sun ça j'ai compris mais j'ai plus de mal avec le reste notamment le futur du projet
Ben c'est clair que si ça passe en projet continue, ça perdra bcp de son charme :(
Le projet était continu avant... :p
Jascooby si tu arretais de reprendre des unités on pourrait peut-être passer à autre chose !
:lol:
En même temps Hide il a pas prit d'unité au laché du 12 - 13 aout, prob technique ... :p donc aucun mérite :lol:
Lol, le V8 n'arrête pas ! Je vais même dépasser Hide en RAC ! :lol:
C'est fait !!!
Jolie DEUXIEME place :lol: :lol: :lol:
L'enfoiré, t'es repassé premier ! :lol:
Bien joué :) :jap:
Hide et moi on t'attendait !!!!
http://deligne.free.fr/anims/bipbip2.gif
:lol: :lol: :lol:
http://www.miniteam-vtr.org/team/forum/Smileys/ipb/GS_3289321c17.png
:lol:
En attendant vous êtes bien discrets sur Riesle :whistle:
Bon allez, je me laisse jusqu'à fin septembre pour être millionnaire sur Riesle et Seti à la fois :)
250.000 nouvelles séquences à cruncher à partir de demain, c'est le double du mois précédent et 8 fois plus que pour le 1er juillet.Ça va duré une semaine :ouch: .
aller hop a bidouiller le fichier de config de boinc pour en prendre un max ....J'attends quels arrivent :D (c'est quand l'arrivée des WUs ? :heink:)
Normalement ce soir mais le site a l'air out :o
Merci Thrr-Gilag et la team de Xtrem Lab qui nous ont appris à triché :p .
:non: ce n'est pas tricher! C'est utiliser la configuration de Boinc a notre avantage, c'est completement different!Je sais, je vais d'ailleurs le mettre entre guillemet pour évité de porter confusion :jap:.
2007-09-01 13:57:40 [boincsimap] No work from projectJ'ai 4 cores qui s'ennuient. :cry:
Je ne retrouve plus la méthode à thrr-gilag quelqu'un à un lien ? j'aimerais al faire sur mon ubuntu 64 bit :D
Ouai bon allez je la fait sous ubuntu 64 et XP sous mon 5600+X2 puis sur mon sempron3000+ ainsi que mon 3800+ X2.
J'espère ça va quand même engrander ^^
:heink: Donc si je comprend bien le week-end projet de l'EDLS sur Spinhengen est repoussé. J'espère que ce n'est pas abandonné car il y a une place facile à gagner mais aussi une place facile à perdre: http://www.myboinc.com/scores/buildteams_p.php?prjid=26Il faut croire que oui, moi perso j'ai fais 150-200 pnts dessus mais c'est SIMAP et les enfants d'abord donc à la semaine prochaine Spinhengen (à moins que ce ne soit Lattice :heink: ).
Il faut croire que oui, moi perso j'ai fais 150-200 pnts dessus mais c'est SIMAP et les enfants d'abord donc à la semaine prochaine Spinhengen (à moins que ce ne soit Lattice :heink: ).
Je crois que ca marchera pas ce coup ci ...
il me dit No work Sent, Reached daily quotat of 20 results... buuuuuuuuuuuuuu
Chez moi aussi j'ai ça :cry:
Bha je comprend pas la je suit sous Ubuntu 64 bit et j'ai que 20 unités deçu pas une de plus :(
Peut être en attendant un peu.
Je ne comprends pas ... quand j'ai charger (3 jours + 3 jours de cache) SIMAP m'a fournit 100 unités ... donc pas de problème, je suis plutôt bien servit.
Vous n'avez pas de chance de n'en recevoir que 10 par jours.
Parce que tu as participé au lâcher mi aout... c'est tout :p
Je ne sais plsu qui avait dit ça mais bon perso ça m'emm*rde plus qu'autre chose :pJe crois que j'ai trouver qui (cf : milieu de page 9 ), je ne donnerai pas de nom "I am an angel :ange: ".
3,279.22sec claimed:23.19 granted:15.49
:spamafote:....
CPU time (sec) claimed credit granted credit
2,472.59 13.21 16.46
2,561.14 13.68 16.54
Bha vi ...
On dirai qu'ils ont augmenter la taille des wu par 2 mais qu'ils ont oublié d'augmenter les points donnés .... ça fait tâche ou alors ils ont voulu se foutre de nous une ènième fois :sweat:
SIMAP ou comment être dégout d'un projet en quelques heures :kaola:
:o Qui ouvre le topic de protestation ?:o
Par contre soyez constructifs si vous participez au forum du projet.
Ne vous contentez pas de dire les quotas c'est nul et de ne rien proposer à la place.
Il faut avant tout penser qu'on est là pour la recherche.
Proposer qu'on supprime les quotas, oui, tout simplement parce que ça ne satisfait pas le but initial de rendre les unités plus rapidement.
Mais à la place proposez de réduire la deadline à 5 jours, comme le propose Yeti. C'est vraiment la meilleure solution
Comme ça, ça évite que des gens fassent des réserves trop importantes.
Il y aura des unités plus longtemps sur les serveurs, et les ordinateurs puissant pourront calculer plus d'unités qu'avant
Pour rappel/info les pleureuses qui ont déclenchées cela n'ont pas pensé au projet mais au fait qu'elles avaient que 5 unités/ mois alors que leur P4 aurait pu en faire 15 !!!!!
Poorboy et d'autres ont déjà laché l'affaire !!!
Yeti se bat pour que le quota soit viré et au pire que la deadline soit raccourcis à 5 jours vu que c'est la base de calcul du quota ( le jour de prise plus 4 ) . Mais boinc gérant les deadlines ( 7 jours pour simap ) cela ne va pas!!!!!!!!!!
4 Blaireaux très bavard avec des micros de daubes ont réussis à imposer un truc de M..de à des milliers de gens alors :fou:
Edit : Pardon heyoka +1 avec toi ;)
-- donner 5 wu à 3 pauvres types ----
Mais dites moi, vous étiez où quand la discussion a eu lieu sur le forum de Simap ?
CiterMais dites moi, vous étiez où quand la discussion a eu lieu sur le forum de Simap ?
Merci nightbird de faire preuve de bon sens.
Il fallait se réveiller ou il faut aller sur leur forum pour leur expliquer qu'il y a peut-être d'autres solutions mais rester ici pour dire que tous ceux qui ont moins de 1500 de rac sont des blaireaux, ça n'avance à rien.
Désolé, je m'efforce d'être un minimum efficace, voire même de temps en temps constructif (mais pas trop quand même).
dire que tous ceux qui ont moins de 1500 de rac sont des blaireaux, ça n'avance à rien.
faisont plutôt un texte bien rédigé avec un système qui pourrai améliorer les choses et faisont leur part de notre proposition ;)
Mais dites moi, vous étiez où quand la discussion a eu lieu sur le forum de Simap ?
A ce jour, la seule chose que vous savez faire est de tenir des propos injurieux envers ceux qui, de toute évidence, ne roulent pas en Quad Core.
Je vous cite :
---les pleureuses---
---des blaireaux ... avec des micros de daubes---
Je cite un autre de vos équipiers :
-- donner 5 wu à 3 pauvres types ----
:sarcastic:
Dis, t'avais pas quitté l'AF toi ?
Je m'en occupe avec Korn en ce moment je vient vous posté un premier jet du message.
Hello,
I post here to share with you a problem with the new limitation system that was put in place and which gives a base quotat of 10 Wu/Day/core. This impead a significant amount of people to participate to that great project which is SIMAP. The reason of it is that a lot of people are running several BOINC project on their computer pool at work, those persons cannot take too much bandwidth daytime when their co-workers are there and so have to download and upload in the night when no one uses the internet (SIMAP WU are not that light and si it takes a significant bandwidth amount to download and upload them from and to the server).
My proposal is to eliminate the quotas, because it does not serves the initial goal of shared computing : return the results the quickest it can be done; and technically wise, big crunching rigs are not used at their full potential. With the new system it is better to have a large computer pool with moderate computing power than a reduced one made of newer machines generally more powerfull (C2D..). This does not helps to return the work faster to the server.
My proposal is to reduce the deadline to 5 days, as Yeti did. It is by far the best solution. This will reduce o eliminate the issues caused by people storing a large amnount of WU tweaking their caches, and so will keep the WU on the servers available to disponibles machines so the powerfull computers will be able to calculate more Units than before and lower end one will find WUs too.
Thanks in advance
Bon ben rajoute au debut : this message in on the behalf of some active cruncher from l'Alliance Francophone.
Je peut pas éditer ton message :D
Voici le texte en français:
Bonjour,
je vient vous faire part d'un problème avec le nouveaux système de limitation que vous avez mis en place qui donne une limitaton de base de 10 wus par jour et par coeur. Celà contraint un grand nombre de personne à ne pas pouvoir participer à se magnifique projet qui es Simap. . En effet, beaucoup de personne font tourner des projets sur BOINC sur des parc d'ordinateurs à leur travail, seulement il ne peuvent pas trop dépenser de bande apssante en journée quand les employé sont encore la, mais seulement de nuit quand personne n'es sur Internet, car vous comprenez bien que les unités simap ne sont pas si petite en taille ;).
Je vous proposes que l'on supprime les quotas, tout simplement parce que ça ne satisfait pas le but initial de rendre les unités plus rapidement et celà pose aussi quelque problèmes d'ordre technique, comme le bridage des grosses machines. ( avoir un parc important d'ordinateur pas très puissant est plus avantagant que d'avoir un parc d'ordinateur de nouvelle génération ( puissant ) et celà n'arrange en rien de rendre les unités plus vite au serveur.
Je vous propose de réduire la deadline à 5 jours, comme le propose Yeti. C'est vraiment la meilleure solution.
Comme ça, ça évite que des gens fassent des réserves trop importantes.
Il y aura des unités plus longtemps sur les serveurs, et les ordinateurs puissant pourront calculer plus d'unités qu'avant.
Merci d'avance
Veaux est entrainn de le traduire.
Mais dites moi, vous étiez où quand la discussion a eu lieu sur le forum de Simap ?
:sarcastic:
Thanks for your proposal, there has been a similar discussion in the german part of the forum. Currently much more users seem to prefer the static static quota than the new dynamic quota. Therefore (if not surprisingly a new majority pro dynamic quota arises), we will return to the BOINC default - the static workunit quota - with the next calculation batch.
Best regards
Thomas
Eu je croit que bien que s'était Ok, mais seulement 2 membres sont venue posté :(
Je croit que je vais avoir besoin de soutient :bounce: :bounce:
Yeti est de nôtre coté :bounce: :bounce:
Vous pouvez mettre çà au présent.
Et même sans regret à ce jour.
Pour en revenir a simap qui va sur le forum ? et en son nom ou au nom de l'AF ?
:hello:
1h03 par core sur un Q6600@2.9 ghz en 64 bits pour recevoir 16 points, faut arrêter de se foutre de la gu.... du monde.
:hello:
Vous pouvez me citer également.
1h03 par core sur un Q6600@2.9 ghz en 64 bits pour recevoir 16 points, faut arrêter de se foutre de la gu.... du monde.
Je passe en no work from project, c'est fini pour moi Simap.
Je veux bien aider la science, mais il y a des limites !
Pas si tu peu poster pour moi :
5 micros au boulot :
Avant environ 20 à 40 unités par post maintenant 3 à 4 .
Je peux pas m'inscrire :fou:
Ah ah ah...
Dans l'intervention d'un dénommé Ziran sur le forum Simap, si vous n'arrivez pas à choper vos 10 unités par jour, c'est en gros parce que vous êtes des branques, mais pas à cause des quotas :lol:
Et au fait, changer le duration_correction_factor, ça sert à rien non plus d'après lui :D
S'il vous plait, le tapez pas !! ;)
Bah voilà le problème.
Plus tu reste devant ton ordinateur à essayer de forcer le système et moins tu auras d'unité par la suite.
Puisque le but du quota est d'avantager les gens qui rendent les unités le plus rapidement possible.
Moi depuis le début je laisse faire le BoincManager, avec un cache de 1 jours. J'interviens pas du tout
Et j'ais aucun problème d'approvisionnement, les unités rentrent et sortent normalement.
je comprends un peu mieux maintenant que les serveurs ne t'envoient plus d'unité
:jap:
J'en ai repris ce mois ci uniquement pour t'embeter :D mais c'était vraiment à contre coeur :pfff: Ils abusent trop alors si tu arrêtes je te suivrais volontier :D Trop de projets ont besoins de puissance et simap en a trop alors autant laisser tomber !!!!
De toutes façon tu vas me dépasser et je n'ai pas la possibilité en ce moment de te contrer alors ...... on se sera amuser 5 mois :lol:
Ouais en tous cas, on aura vraiment scoré quasi pareil à toutes les sessions ;)
C'est dommage, j'aurais bien visé un top 100 world durable, mais pas grave, j'ai le top 10 world accessible sur Riesel :)
Project status
Calculation of SIMAP updates is currently running.
The current workunits calculate the similarities and features of the approx. 85.000 new sequences imported in september from the databases RefSeq, Uniprot and PDB. Additional simap workunits containing sequences from several environmental sequencing projects will be available in additional batches from october 2nd to october 4th.
Pourquoi boycott ? Ils ont pris en compte les remarques du mois dernier.
Et puis ces histoires de points ne doivent pas faire oublier l'interêt scientifique des projets quand même. ;)
J'en es reçu à l'instant 10 ^^
Comme je t'ai dit sans souci, et je pense que toutes las MT EDLS voudras bien, regarder les stats :D
On est entrain de faire un carton du coté de EDLS sur ce projet :D
http://www.myboinc.com/scores/SIMAP.php
BHa vous travaillez aussi dans de grosse entreprise non ? :heink:
Pendant que Jascooby se goinfre en simap et je ne parle pas de Fred, nous ramons avec nos pauvre ressources sur Simap pour faire bonne figure chez EDLS.Et pendant ce temps, le Raid Rosetta...
Il reste un batch de 220 699 unités qui n'a pas été encore entamé :cry::ouch: Mais il devait en avoir que 85 000 !?!
Il reste un batch de 220 699 unités qui n'a pas été encore entamé :cry:
Susa par exemple comme cela on perdrait des places sur un projet de plus !!! :pfff:
01/11/2007 23:04:28|boincsimap|Sending scheduler request: Requested by user. Requesting 30 seconds of work, reporting 0 completed tasks:heink:
01/11/2007 23:04:33|boincsimap|Scheduler request succeeded: got 0 new tasks
01/11/2007 23:04:33|boincsimap|Message from server: Server error: can't attach shared memory
1/11, c'est peut être tout simplement parce que c'est le premier novembre, pas qu'il va y avoir onze vagues... :p
La vache, on va en avoir pour tout le mois entier j'ai l'impression
Oui :D
Enfin se coup-ci, la plus part des teams pousse beaucoup plus que dès le début que les autres. Je vient de remarqué ça. Aujourd'hui dans la soirée, ou voir demain, la Similarities of environmental sequences, part 2/11 devrait ne plus avoir d'unité à donnée. La c'est 13% qu'il y a d'écrit, mais 13% d'unités calculé, sachant que presque tous le monde fait un petit stock, la 2/11 devrait avoir donnée toutes ses unités. Ont le verra quand les premières unités de la 3/11 seront donné.
Celà est étonnant, les unités sont plus longue que le mois derniers et elle parte encore plus vite, c'est excellent pour se projet :bounce: :bounce:
BHa ouai, mais ce ne sont pas les XTC premier en Rac :whistle:
Ce sera sans moi :p sans Rob et sans Hide aussi :whistle:
5-6 jours après le début, on se retrouve avec même pas la 3ème partie (sur 11) des unités de séquences environnementales de commencer...
Bref, ce projet se retrouve sans le petit piment qui était de chopper au plus vite des unités mais plus dans le cadre d'un projet ayant quasi-constamment des unités à calculer. Bref, il rentre en compétition avec tout les autres, et j'ai d'autre projets à privilégier dans ce cadre là.
En soit c'est pas un problème, c'est qu'il perd son originalité, et que du coup, on le juge sur les mêmes critères que les autres projets.
Sans compter qu'il bouffe de la bande passante le bougre, alors ça pendant un mois :o
Et pour le moment dans la planète Boinc plus de gens ce sont mis sur Simap se mois-ci, ils ont bien comprit.
c est déjà les uniter de décembre qui arrive ? :heink:
Mais il est où ce lapin :??:
Edit: A oui ! saillley, je le vois :lol:
Moi, il me fait un peu peur :heink:
Oh, ja. Wir werden bis in den Januar hinein reichlich Arbeit haben (allerdings nur für die simap app - alle hmmer workunits sind nun schon im Batchmonitor eingestellt). Die Serien 7120101-7120103 waren die simap workunits fuer ca. 1.5 Millionen neue Sequenzen. Es bleiben aber noch fast 10 Mio. weitere, die berechnet werden müssen. Die Workunit-Serien werden wir aber immer step-by-step erzeugen, damit die storage-Kapazitäten ausreichen. Für durchgehende Arbeit ist jedoch gesorgt Wink
Beste Grüße
THomas
Die kommenden simap app-Workunits duerften den Serien 7120101-7120103 sehr ähnlich werden, denn bei den o.g. Serien waren auch schon reichlich Umweltsequenzen aus der GenBank-Datenbank drin. Bei den neuen Serien sind es dann nur noch Umweltsequenzen, also steigt die Berechnungszeit pro Workunit wegen der kürzeren Durchschnittslänge der WUs etwas an. Das ist jedoch in den est_fpops berücksichtigt.
Viel Spaß beim Skifahren und Rückkehr nicht per Helikopter Wink
Beste Grüße
Thomas
Yes, as Jonathan said. Just look at http://mips.gsf.de/simap - the webportal of SIMAP for the scientific community who is using this resource. There you will find the release and usage statistics directly on the portal start page.
The current number of sequences due to the import of the environmental sequences (pre-processed by SIMAPBOINC during the last months) is some more than 17 million. And only 6.3 million of the have been already processed. Therefore these 11 million sequences have to be calculated - which will be continuous work until january; due to the quadratic increase of calculation effort I would expect even until the end of january.
Thanks a lot for crunching!
Regards
Thomas
The number of complete proteins of known origin is about 6 million, but in fact 1-2 million of them are very similar, just representing different variants of certain genes. So this number is continuously growing but not really jumping as the number of environmental sequences, which are generated by high-throughput sequencing methods. These methods are able to generate even millions of sequences from a single project as the global ocean sampling by Craig Venter.
All environmental sequences have to be preprocessed to filter out the genes. This has been done during the last months. Now the filtered genes are imported into SIMAP. After this step, a postprocessing is performed in order to remove artifact sequences that can be recognized directly by using the data in SIMAP.
So we estimate that in february the current environmental sequences will get into their final state in SIMAP. But new projects have been published, e.g. the termite gut analysis. As soon as these sequences become available, they will be imported into SIMAP too.
best regards
Thomas
j'ai hâte de calculer les similarités avec les boyaux de termites :):lol: :lol: :lol: :lol: !!!
Il existe en ce moment une autre piste de recherche (qu’on apelle biocarburant de deuxième génération) sur la production de bioéthanol : la production à partir de cellulose ! On sait déjà aujourd’hui produire du bioéthanol à partir de cellulose, néanmoins le procédé n’est pas rentable (et dans le monde d’aujourd’hui c’est bien la seule chose qui compte), c’est pourquoi des recherches sont en cours pour trouver des enzymes aptes à aider cette réaction. Les deux grandes pistes de recherches sont les enzymes qu’ont trouve dans les boyaux de termites et celles que l’ont trouve dans les bouses d’éléphant (deux animaux qui consomment beaucoup de cellulose). On considère que ce procédé sera vraiment utilisable dans 5 ans (mais il faut toujours ce méfier des prévisions !). Imaginez l’impact de ce procédé : n’importe quel bout de plante pourrait être transformé en éthanol ! Or les déchet de résidus agricoles sont nombreux de part le monde (de maïs aux USA par exemple)…
SIMAP consiste à construire une grande base de donnée des séquences similaires et des domaines de protéine. Cette base de données contiendra à terme toute les protéines tombées dans le domaine publique et sera continuellement mise à jour.
D'ou proviennent les séquences à intégrer dans la base de données ?
A qui s'adresse cette base de données ? Que peut-on faire concrêtement avec cette base de données ?
A-t-on déjà fait quelque chose d'utile provenant des séquences stockées dans cette base de données ? :??:
J'ai l'impression que c'est la course aux projets Boinc, on plie de la protéine à tout va, de différentes façons, par le biais de différents projets.
Mais tous ces projets de travail sur les protéines sont-ils coordonnés ?
S'informent-ils de l'avancement de leurs recherches ?
Parce que si chacun bosse dans son coin, sans se tenir informer de ce que font les autres, ni de savoir ou ils en sont, ça sert strictement à rien. :pfff:
Avant qu'il y ait ce genre de base de données, les chercheurs calculaient chacun dans leur coin pour rechercher des protéines homologues. Donc les même calculs étaient effectués des milliers de fois de façon privée par chaque groupe de recherche.
Donc c'est vraiment quelque chose d'inefficace, l'accès à une base de donnée permet de libérer toute cette puissance de calcul qui était un peu gaspillée
Difficile à dire puisque n'importe qui peut accéder librement à la base de donnée et faire sa propre recherche.
C'est un peu comme si tu te demandais si Wikipédia a déjà servie à quelque chose d'utile, il n'y a que la personne qu'il l'utilise qui pourra le dire.
Par contre, entre les poèmes qui restent et les LHC chopées la semaine dernière, ça va être chaud-chaud ! :sweat:
enfin, quoi qu'il en soit, ça ne suffira pas pour atteindre mon objectif personnel sur simap ce mois-ci :'(
je viens de m'inscrire pour aider à récup un max d'unité pour l'AF, ça sera pour le prochain lâché même si j'ai réussi a chopper une unité hier (19points c'est un bon début) :)
je viens de m'inscrire pour aider à récup un max d'unité pour l'AF, ça sera pour le prochain lâché même si j'ai réussi a chopper une unité hier (19points c'est un bon début) :)Excellente initiative RLDF + L'AF récupèrera d'UT - les autres équipes pourront s'approvisionner, car l'on peut raisonnablement penser prendre la 2ème place au FB d'ici la fin de l'année :bounce:... si bien sûr SUSA mais surtout S^G restent toujours derrière nous sur ce projet :o.
Simap, c'est 7 jours ;)
http://www.boinc-af.org/content/view/737/149/
vu que mon pentiumD est à la ramasse sur Protéin, j'ai autorisé du nouveau travail sur SIMAP, j'espère qu'il va choper quelques UT [:saispas]
AMHA les UT ne tomberons pas avant une 20aine d'heures. ;)
1000 WUs en cours de calcul :)M'en a filé 79 :heink:... pour l'instant. :)
Ensembl est un système bio-informatique d'annotation automatique de génomes. C'est un projet conjoint de l'European Bioinformatics Institute (EBI) et du Wellcome Trust Sanger Institute dont l'idée centrale est d'organiser de vastes champs d'information biologique autour de séquences génomiques.
M'en a filé 79 :heink:... pour l'instant. :)
Merci modesti pour les infos. :jap:
j'en suis a 5825 WUs ce matin :)
:ouch: la vache :ouch:[spoiler]Wouais mais... diesel!!! :lol: [/spoiler]
j'en suis a 5825 WUs ce matin :)
y'a trop de lignes pour compter, j'en ai sur les 2 ordis :D
Tu vas simplement sur Your account > Computers on this account et tu fais l'addition. ;)
Plop :hello:
Vu que simap n'est pas un projet permanent je viens vous aider à cruncher quelques UT de plus :p
Je me suis inscrit il y a quelques jours et j'ai pu recup un poil plus de 600 ut
Merci pireleurk de nous avoir rejoints sur SIMAP, tu ne seras pas de trop! ;)
Merci pireleurk de nous avoir rejoint* (http://\":heink:\) sur SIMAP, tu ne seras pas de trop! (http://\";)\)[HS] T'es sûr de ton coup, al@ON ? A mon avis, t'avais juste le premier coup ;) COD placé avant l'auxiliaire, l'accord se fait avec "nous" :whistle: [/HS]
ÉDIT: Ne prends pas de s. :D
[HS] T'es sûr de ton coup, al@ON ? A mon avis, t'avais juste le premier coup ;) COD placé avant l'auxiliaire, l'accord se fait avec "nous" :whistle: [/HS]
Professeur Chemouni, je vous remercie de nous avoir rejoint au Théâtre National de la Colline.extrait de ce document PDF http://www.colline.fr/revue/assets/09/fichiers/entretien-chemouni.pdf. [:jwhy]
regardez dans vos rétros, j'arrive :bounce:[spoiler]J'ai senti un grand souffle :heink:... mais j'ai rien vu! :lol: [/spoiler]
[spoiler]J'ai senti un grand souffle :heink:... mais j'ai rien vu! :lol: [/spoiler]
RLDF si tu le peux reste sur SIMAP (encore 250 000 UT à calculer :sweat:) et une 2ème place au FB en vue. ;)
Voilà le lien : http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/batchmonitor.php
Apparemment il ne reste plus que 150.000 à 200.000 unités qui n'ont pas encore été distribuées.
Euh ! si je fais la différence ente les "total Wus in batch" et les "finished Wus in batch" je trouve qu'il reste encore 470 000 unités et pas 150 à 200 !
Est-ce que je regarde au bon endroit ? Faut-il compter les lignes 8060402 et 8060501 ?
Encore merci.
:bounce: :bounce: :bounce: L'AF a pris la 2èmme place au FB! :bounce: :bounce: :bounce:
[:vtr webjo:3] à ceux qui calculent sur SIMAP. [:al@on:1]
j'espere que c'est pas de ma faute :ouch:
The similarity matrix of the SIMAP project is currently up to date. All workunits from the last calculation period are distributed, thanks to all users for chrunchig them.
The calculation of new simap workunits containing the novel proteins from june 2008 (simap app) and their domains (hmmer app) will start around july 1st.
June 30, 2008
New Workunits: The calculation of similarities and features of approx. 300.000 new sequences, that were imported from the databases PDB, GenBank and Uniprot in june 2008, will start in the evening (UTC) of july 1st. Several members of the BOINCSIMAP team will be attending a scientific conference in denmark this week, thus we apologize for possible delays in providing new workunits. Additionally, we will test a new version of dynamic quotas, making the daily amount of results per host dependent on its average turnaround time. All hosts will start from the same daily quota and average turnaround time. Thus we hope to have a better start of the new batches, without the usual overloading of our servers. Please give us feedback and report problems with the daily quota in our message boards.
Et en pus un quota de 40 par jour!Pour toi qui a un 4cœurs... pour moi c'est
mar 01 jui 2008 17:43:16 CEST|boincsimap|Message from server: (reached daily quota of 10 results):(
Modesti, visiblement Heyoka a été plus rapide que toi
http://www.boinc-af.org/content/view/972/290/
L'est dur à suivre le bonhomme, hein ? [:douglas riper] .......... [:douglas riper]
Par contre, ça montre un problème de coordination niveau trad. Parce que c'est dommage de faire doublon. :(
Pour toi qui a un 4cœurs... pour moi c'estCitermar 01 jui 2008 17:43:16 CEST|boincsimap|Message from server: (reached daily quota of 10 results):(
Au moins cette fois-ci il va en rester aussi pour les retardataires. :D
a priori, il n'y a déjà plus d'unités disponible[:al@on:3] RLDF, il y en a - que prévues :(
c'est déjà fini :cry:
July 1st, 2008Perso je laisse ouvert en // avec TANPAKU... on ne sait jamais. [:jwhy]
New Workunits: There has been a typo in the yesterdays announcement: in june we have imported 130.000 (not 300.000) new sequences. The workunits are ready and their distribution has just started.
July 28, 2008
New Workunits: The calculation of similarities and features of the new sequences, that were imported from the databases PDB, RefSeq and Uniprot in july 2008, will start in the evening (UTC) of next monday, august 4th. Additional workunits will contain sequences from approx. 100 new environmental sequencing projects. With the new calculation period we will limit the number of workunits in progress to max. 30 per CPU, in order to distribute the work more homogeneously. We hope this limitation will work properly, for feedback and reporting problems with it, please use our message boards.
je suis au taquet, encore 6 jours à attendre au lieu de 3 :(
Bon, ce mois-ci la récolte est bonne pour moi, 30 UT @ work, 60 sur portable bicore et sur mon AMD 30 (Ubuntu 64) + 15 (XP, étrangement il n'a pas voulu m'en donner + :() soit un total de 135 UT. :bounce:
désolé, j'ai piqué les dernières UT :D
rdv en septembre pour la suite :lol:
tu as investie ! :D
Il me semblait que tu avais que des mono-core !
je crois que j'ai cassé le serveur simap [:douglas riper] [:jwhy]
August 6, 2008
No more workunits in August: The workunits for the preprocessing of the new environmental sequences caused several problems. The most serious issue is that some of the workunits had huge result files that had to be uploaded. For that reason we will not distribute the remaining workunits of this type, but crunch them locally on our servers. The integration of the preprocessed sequences into the main SIMAP database will then be prepared. It will be part of the next batch, starting on September 1st.
Je ne sais pas pourquoi mais je n'imagine pas une seconde que le projet Proteins reprendra début Septembre. [:jwhy]
dis pas ça, c'est le seul projet franco-français :(
August 23, 2008
New Workunits: One week earlier than expected we could prepare the new workunits for the 2 million environmental sequences from the preprocessing batches. The calculation of these workunits will therefore already start in the evening (UTC) of august 24th. Additional workunits have been prepared for the calculation of similarities and features of the 400.000 new sequences, that were imported from the databases PDB, GenBank, ENSEMBL and Uniprot in august 2008.
C'est fou ça. Plus je calcule du Simap, plus j'en télécharge. C'est redevenu un peojet continu, ou personne n'en a chargé ce mois?
C'est fou ça. Plus je calcule du Simap, plus j'en télécharge. C'est redevenu un peojet continu, ou personne n'en a chargé ce mois?
ça nous arrange pas pour la poussée yoyo/ogr
C'est clair !
Chez moi, Simap tourne sur le portable en parallèle avec Enigma ou RCN et Yoyo tournera sur le PC
:D:whistle:
Pour la news sur le site de l'AF, je pense que c'estHeyokaRom_185 :jap: qu'il faut remercier - comme d'hab - car je n'y ai jamais rien publié personnellement. Je me contente de mettre les trads sur le forum.
September 30, 2008
New Workunits: the calculation of similarities and features of the new sequences, that were imported from protein databases into SIMAP in september, will start in the evening (UTC) of october 1st.
Attention que 120 000 unités. Ca ve etre la guerre pour en obtenir :D
Project status
The project has currently no work (see below).
The similarity matrix of the SIMAP project is currently up to date. All workunits from the last calculation period are distributed, thanks to all users for chrunchig them.
The calculation of new simap workunits containing the novel proteins from october 2008 (simap app) and their domains (hmmer app) will start around november 1st.
October 28, 2008Donc : début de distribution des nouvelles unités le 30 octobre au soir. Vu la faible quantité, ça ne tiendra pas plus longtemps que début octobre, soit 2 jours :(
New Workunits: the calculation of similarities and features of approx. 100.000 new sequences, that were imported from protein databases into SIMAP in october, will start in the evening (UTC) of october 30th.
[spoiler]RLDF, tu serais gentil de nous en laisser quelques-unes :whistle:
............[:douglas riper][:czame17:5][/spoiler]
ouais d'abord :kaola: :D
jeu 30 oct 2008 13:53:07 CET|boincsimap|Sending scheduler request: To fetch work. Requesting 2445 seconds of work, reporting 0 completed tasksQuelle émotion! :whistle:
jeu 30 oct 2008 13:53:12 CET|boincsimap|Scheduler request succeeded: got 1 new tasks
jeu 30 oct 2008 13:53:15 CET|boincsimap|Started download of 8110101.002977
jeu 30 oct 2008 13:53:22 CET|boincsimap|Finished download of 8110101.002977
Je pensais être la première à vous l'annoncer [:thomas:1] je vois que d'autres avaient aussi ouvert les vannes ;)
[spoiler]RLDF, tu serais gentil de nous en laisser quelques-unes :whistle:
............[:douglas riper][:czame17:5][/spoiler]
je me suis gavé [:mysti13]
j'ai lu le msg trop tard [:jwhy]
Project status
The project has currently no work (see below).
The similarity matrix of the SIMAP project is currently up to date. All workunits from the last calculation period are distributed, thanks to all users for chrunchig them.
The calculation of new simap workunits containing the novel proteins from november 2008 (simap app) and their domains (hmmer app) will start around december 1st.
A nous jeter sur les UT comme la misère sur le monde, ya déjà plus rien à cruncher !Même pas eu le temps d'en pécho au taf. [:al@on:2]
Bon ben, :hello: et au mois prochainPas mieux!!! :D :p
Calculation of SIMAP updates is currently running.
The current workunits calculate the similarities and domains of approx. 300.000 new sequences from public databases imported in november 2008.
After these calculations are finished, next workunits are expected around jabuary 1st.
CiterCalculation of SIMAP updates is currently running.
The current workunits calculate the similarities and domains of approx. 300.000 new sequences from public databases imported in november 2008.
After these calculations are finished, next workunits are expected around jabuary 1st.
Ça y est : les vannes sont ouvertes ! 3x plus que les mois précédents, y en aura peut-être pour tout le monde ;)
A l'attaque ! :bounce:
a pu ?
ah bah en fin de compte, j'envois des UT terminées, et je ne reçois plus rien en retour :jap:"The project has currently no work (see below)"
New Workunits: an additional batch of workunits has been started for the calculation of similarities and features of approx. 1.500.000 new sequences, that were imported from metagenomes.[:jeromec:6][:jeromec:6][:jeromec:6]
December 14, 2008
New Workunits: an additional batch of workunits has been started for the calculation of similarities and features of approx. 1.500.000 new sequences, that were imported from metagenomes.
WORKUNITS Approximate #
in database 17,345
with canonical result 261
waiting for validation 0
waiting for assimilation 0
waiting for deletion 0
RESULTS Approximate #
in database 35,153
unsent 0
in progress 33,315
waiting for deletion 0
deleted 613
valid 561
Oldest Unsent Result no results left
Je savais que ça te ferai plaisir :lol: !
mais bon, pour moi, simap avant tout :lol:
j'en est pris sur mon linux 64bMoi qui pensait m'éloigner de toi grâce au gain de SIMAP en x64 c'est raté :whistle:.
Moi qui pensait m'éloigner de toi grâce au gain de SIMAP en x64 c'est raté :whistle:.
"The project has currently no work (see below)"
The similarity matrix of the SIMAP project is currently up to date. All workunits from the last calculation period are distributed, thanks to all users for chrunchig them.
The calculation of new simap workunits containing the novel proteins from december 2008 (simap app) and their domains (hmmer app) will start around january 1st.
Ils sont en avance par rapport à leur dernière annonce que j'ai reprise le 4/12
:bounce: :D
c'est un batch supplémentaire, ça ne remplace pas celui de janvier ;)
bon j'ai finalement reçu des unités... j'ai mis la limite de cache à 10 jours, et voyant que mon boinc en était là:
"dim 14 déc 2008 23:36:04 CET|boincsimap|Sending scheduler request: Requested by user. Requesting 0 seconds of work, reporting 0 completed tasks"
...et que aucune limite de nombre d'ut en cache n'était instaurée ou du moins atteinte, j'ai annulé 2 ut commencées de 2 autres projets suspendus pour laisser la place à simap...je pensais que ça libérerais 8h de calcul et que mon boinc en demanderais donc autant en plus à simap... pourtant il continue a demander "0 second of work" ; ça signifie que quand les projets sont suspendus, leurs unités ne sont pas prises en compte dans le total du temps de travail en cache? :??: :heink:
17.12.08 10:26:26|boincsimap|Message from server: No work sent
17.12.08 10:26:26|boincsimap|Message from server: (reached per-CPU limit of 30 tasks)
[:al@on:3] Flo,
en fait, simap n'aime pas les requêtes à la demande de l'utilisateur (Requested by user) : dans ce cas, il ne demande pas de travail. Il faut juste le laisser faire ;)
workunits in database: 211,561
d'accord c'est donc pas moi qui me suis enregistré n'importe comment sur simap!
le site de origin c'est donc setibzh?... il est pas mal, mais un peu plus lourd et surtout: quand on clique sur un team on n'a que ses stats générales, on n'a pas la liste des membres avec un aperçu des leurs stats (RAC, etc...) et un clique suffit pour avoir les stats détaillées d'un membre...enfin ce qu'on a sur jump quoi^^ ce que je trouvais assez pratique...
je crois qu'il n'y a plus d'unités :(
December 30, 2008
New Workunits: the calculation of similarities and features of approx. 400.000 new sequences, that were imported from protein databases into SIMAP in december, will start in the morning (UTC) of december 31st.
seulement 400 000?!! mais c'est pas grand chose à se mettre sous la dent comparé aux 1,5millons du 15dec! en 3 jours c'est terminé ^^
bah alors, qu'est-ce que tu fais ? il en reste encore 234,949 à 18h35 :lol:
The calculation of new simap workunits containing the novel proteins from January 2009 (simap app) and their domains (hmmer app) will start around February 1st.
vivi :ange: je guette le départ depuis hier...
et depuis hier je me demande quelle bécane je vais faire cruncher dessus, parce qu'avec le Charity je sais plut trop où donner de la tête :pt1cable:
charity c'est même jusqu'au 8/02 :hebe:Exact ! Merci modesti j'ai bien fait de mettre une machine supplémentaire qu'avec POEM :sol:
je pense que je vais mettre le portable sur simap, il avait pas aimé les poèmes par le passé donc il crunche de toute façon sur autre chose ;)
Calculation of SIMAP updates is starting soon.
The calculation of new simap workunits containing new sequences from public databases imported in January 2009 (simap app) and their domains (hmmer app) will start in the evening (UTC) of February 1st.
January 31, 2009
New Workunits: the calculation of similarities and features of approx. 300.000 new sequences, that were imported from protein databases into SIMAP in January, will start in the evening (UTC) of February 1st.
January 31, 2009
New Workunits: the calculation of similarities and features of approx. 200.000 new sequences, that were imported from protein databases into SIMAP in January, will start in the evening (UTC) of February 1st.
January 31, 2009
New Workunits: the calculation of similarities and features of approx. 250.000 new sequences, that were imported from protein databases into SIMAP in January, will start in the evening (UTC) of February 1st.
dim 01 fév 2009 22:30:39 CET|boincsimap|Message from server: (Project has no jobs available):(
in database 5,000
02.02.09 05:21:00|boincsimap|Sending scheduler request: To fetch work. Requesting 26914 seconds of work, reporting 0 completed tasks
02.02.09 05:21:20|boincsimap|Scheduler request succeeded: got 0 new tasks
02.02.09 05:21:20|boincsimap|Message from server: No work sent
02.02.09 05:21:20|boincsimap|Message from server: (reached per-CPU limit of 30 tasks)
02.02.09 05:21:20|boincsimap|Message from server: (Project has no jobs available)
mes caches sont bien garnis aussi :)
RESULTS Approximate #
in database 202,304
unsent 10,871
in progress 133,086
Project status (http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/)
Calculation of SIMAP updates is starting soon.
The calculation of new simap workunits containing new sequences from public databases imported in February 2009 (simap app) and their domains (hmmer app) will start in the evening (UTC) of February 28th.
New Workunits in the evening (UTC) of February 28th
February 27, 2009
New Workunits: the calculation of similarities and features of approx. 200.000 new sequences, that were imported from protein databases into SIMAP in February, will start in the evening (UTC) of February 28th.
New Workunits in the evening (UTC) of March 31Démarrage ce soir, vu la faible quantité ce sera probablement torché d'ici le raid - surtout avec l'aide de notre ami RLDF :whistle: ;)
March 30, 2009
New Workunits: the calculation of similarities and features of approx. 260.000 new sequences, that were imported from protein databases into SIMAP in March, will start in the evening (UTC) of March 31st.
Démarrage ce soir, vu la faible quantité ce sera probablement torché d'ici le raid - surtout avec l'aide de notre ami RLDF :whistle: ;)
surtout avec l'aide de notre ami RLDF :whistle: ;)
[HS]
:hello: rompiq, tu ne voudrais pas venir nous voir dans notre espace réservé (http://forum.boinc.fr/boinc/LAllianceFrancophone/admission-demandes-forum-sujet_360_1.htm#t56083) ?
[/HS]
je mets le porte avion en mode pacman [:rldf:1]
je crois que j'en ai pas vu une seule HMMER :lol:
31/03/2009 22:35:14|boincsimap|Sending scheduler request: Requested by user. Requesting 20523 seconds of work, reporting 0 completed tasks
31/03/2009 22:35:19|boincsimap|Scheduler request completed: got 0 new tasks
31/03/2009 22:35:19|boincsimap|Message from server: (Project has no jobs available)
vite vite vite, j'ai déjà mangé200300Wus [:rldf]
chopé 2 HMMER sur le portable et 13 "normales" sur l'ordi du boulot :)
le 3è se bat encore avec les FreeHal (que je vire 20 par 20 dans le gestionnaire des tâches, mais il en reste toujours ~300 :sweat: ) donc pas de simap pour lui ce mois-ci :(
j'ai vraiment du mal à en avoir (que 250 pour l'instant)200 au total pour ma part :D
et la plupart de mes machines sont à sec :(
New Workunits in the evening (UTC) of June 01Dans vos starting-blocks ! Et avec 650.000 UT, on en aura peut-être pour un peu plus de 2 jours :siflotte: :lol:
May 30, 2009
New Workunits: the calculation of similarities and features of approx. 650.000 new sequences, that were imported from protein databases into SIMAP in May, will start in the evening (UTC) of June 1st.
Niarf Niarf ! J'ai pris ta place donc :blbl:Wouais wouais... mais toujours pas au général!!! :siflotte:
Généralement les UT sont envoyés à quelle heure? :??:
23h ? :miam:
:up: :DDans vos starting-blocks ! Et avec 650.000 UT, on en aura peut-être pour un peu plus de 2 jours :siflotte: :lol:ptet :lol:
ils ont dit "in the evening", dans la soirée, attention nuance! ^^allez, je dis 20h (heure française)
d'autant plus que la soirée GMT commence deux heure plus tard que notre soirée à nous...
moi je dis: 19h
qui parie avec moi? :D
17H00 :Dbravo tu as gagné, j'en ai déjà reçu 30 :eek:
01/06/2009 18:40:55 boincsimap Sending scheduler request: Requested by user.
01/06/2009 18:40:55 boincsimap Requesting new tasks
01/06/2009 18:41:00 boincsimap Scheduler request completed: got 0 new tasks
01/06/2009 18:41:00 boincsimap Message from server: (Project has no jobs available)
Vous en avez reçu une trentaine parce que vous ne faites que ce projet ou parce que vous avez de grosses bécanes ?J'ai remplis le cache de mon mono-core pour trois jours. :o
rien recu pour le moment :cry:
tous les autres projets sur chaque machine sont stoppés et les WU en cours (avec deadline longue) suspendues, et préf à 1000 :coffeetime:
Que veux tu dire préf à 1000 ? Dsl mais je ne maitrise pas boinc et ces fonctions
C'est les "Resource share", un truc que tu peux régler sur ta page sur le site de chaque projet.
ok c'est vrai que mes projets sont tous à 100 sauf seti, cosmo, qmc et climat qui sont à 200...1000 est le max, si tu met plus, il ne prend que 1000
Mais j'ai vus que 1000 est pas le max apparemment...
Est ce que j'ai bien réglé cela d'apprêt cette image les projets que j'ai... car je ne sais pas vraiment si cela change quelques choses de mettre 100 ou 200
Moi j'en ai reçu 30 à 17H01 et depuis il ne veut plus m'en envoyer :??:... alors qu'il en reste un max! :rhaa:
@ boris, AMHA tu devrais calculer sur moins de projets à la fois car tu vas finir par avoir des problèmes de deadline (date limite d'envoi) sur certaines UT. ;)
Moi j'en ai reçu 30 à 17H01 et depuis il ne veut plus m'en envoyer :??:... alors qu'il en reste un max! :rhaa:
@ boris, AMHA tu devrais calculer sur moins de projets à la fois car tu vas finir par avoir des problèmes de deadline (date limite d'envoi) sur certaines UT. ;)
j'ai l'impression que tu as peut-etre atteint la limite :(http://moe.mabul.org/up/moe/2009/05/14/img-1105374fn89.gif) Krest!
6/1/2009 11:02:44 PM|boincsimap|Message from server: (reached per-CPU limit of 30 tasks)
lun 01 jun 2009 22:49:41 CEST|boincsimap|Message from server: (Project has no jobs available)
dommage qu'il y ait la limitation à 30 par CPU parce que je trouve que ça enfourne bien :hyperbon:Ça doit permettre à ceux qui enfournent moins de pouvoir calculer sur ce projet. :p
Non, ça c'est la puissance estimée en Tflop :)Ca c'est les WUs mais avec le quorum de 2 il y a + d' 1M de calcul à faire :)
Il y a en total pour ce mois ci 515613 + 21240 unités ce mois-ci.
site et serveur HS :/ On a fait péter la boutique :cry::hello:
BOINCSIMAP simap application 60.4 % 311347 515613
BOINCSIMAP hmmer application 0.0 % 0 21240
Euh! Vous êtes sûr que c'est fini. :??:aucune hmmer non plus, mais je ne reçois plus d'UT aujourd'hui...
Perso je n'ai reçu aucune UT "hmmer". :(
Euh! Vous êtes sûr que c'est fini. :??:c'est indiqué sur leur page d'accueil, prochaines UT au 1er juillet :
Perso je n'ai reçu aucune UT "hmmer". :(
Project status
The project has currently no work (see below).
The similarity matrix of the SIMAP project is currently up to date. All workunits from the last calculation period are distributed, thanks to all users for chrunchig them.
The calculation of new simap workunits containing the novel proteins from June 2009 (simap app) and their domains (hmmer app) will start around July 1st.
c'est indiqué sur leur page d'accueil, prochaines UT au 1er juillet :Merci RLDF :jap:... mais que nous indique le Batchmonitor (http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/batchmonitor.php). :??:
Merci RLDF :jap:... mais que nous indique le Batchmonitor (http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/batchmonitor.php). :??:
Qu'aucune HMMER n'a encore été rendues, c'est pas pour ça qu'elles n'ont pas été distribuées, perso j'en ai reçu
:D , dommage qu'il n'y en a pas plus des HMMER, elles créditent plus que les SIMAP :jeboude:
Par contre sous win32 avec un core2 je ne sais pas ce que ça donne
En plein RAID, durudur dilemme :cry:, surtout s'il n'y a pas de quoi tenir plus de 5 jours.:hello:
mer 01 jui 2009 22:35:19 CEST|boincsimap|Sending scheduler request: To fetch work. Requesting 189920 seconds of work, reporting 0 completed tasks:rhaa:
mer 01 jui 2009 22:35:24 CEST|boincsimap|Scheduler request succeeded: got 0 new tasks
mer 01 jui 2009 22:35:24 CEST|boincsimap|Message from server: (Project has no jobs available)
The current workunits calculate the similarities and domains of approx. 400.000 new sequences from public databases imported in June 2009.On ne va pas me faire croire que la distribution est déjà finie. :cpopossib:
02/07/2009 18:43:06 boincsimap Message from server: No work sent
02/07/2009 18:43:06 boincsimap Message from server: (reached limit of 60 tasks)
En plus, je viens de remarquer ça ce soir sur mon Boinc Manager
Donc ça sert même à rien d'augmenter son cache, pfff :/
A rajouter dans les critères de choix des dates de Raid :origin::
éviter les quelques jours de lâcher d'UT Simap en début de mois
J'te rassure, al@ON, j'ai pas eu grand-chose non plus - et je n'ai pas participé au raid :cpopossib:
Ça me console... je suis sûr d'une chose, ce n'est pas ce mois-ci que tu me doubleras sur SIMAP. :siflotte: :desole:Euh, à moins que tu n'abandonnes Simap pendant
edit : Nous n'avons pas les mêmes valeurs :garf:
Calculation of SIMAP updates is starting soon.
The calculation of new simap workunits containing new sequences from public databases imported in July 2009 (simap app) and their domains (hmmer app) will start in the evening (UTC) of July 31st.
je serais en service minimum pour ce lâché, c'est les vacances, je vous laisse le reste :hap:Sur que l'on va être un certain nombre dans ce cas là, je n'emmène qu'un portable (dans le Limousin ...) le reste pratiquement en mode Off
J'ai rallumé le portable pour ça.... :siflotte:J'ai fait de même d'ailleurs pour un de mes vieux portable. ;)
Oh déjà plus rien! à quand le plat suivant?? :P
Oups en fait après avoir modifié mon <on_frac>??</on_frac> dans le client_state.xml j'ai pu en avoir plein plein plein donc je retire ce que j'ai dis, viendez tous en profiter!! :)Quelles valeurs as tu mises ?
<time_stats>
<on_frac>0.129887</on_frac>
:bounce: Simap a du taf :bounce:
200 000 UT viennent d'être mises en pature pour calculer les similarités de domaines de super-familles :hyperbon:
August 24, 2009
New Workunits: Approx. 200.000 new workunits are that calculate the similarities of domain superfamilies. This dataset has been prepared in co-operation with the Gene3D team and initiates a novel aspect of SIMAP. If the test using the current approx. 200.000 workunits will be successful, we will maintain this dataset as part of SIMAP. It will be used to construct new versions of the Gene3D database.
(http://moe.mabul.org/up/moe/2009/05/14/img-1105374fn89.gif) les AFond... vous avez remarqué que ces UT sont + longues à calculer... environ 15 mn de + sur mon 3400+ que j' :love:.
Calculation of SIMAP updates and SIMAP workunits of a new type are currently running.
The current workunits calculate the similarities and domains of approx. 100.000 new sequences from public databases imported in August 2009. Further workunits calculate the similarities of domain superfamilies. This dataset has been prepared in co-operation with the Gene3D team and initiates a novel aspect of SIMAP. It will be used to construct new versions of the Gene3D database.
August 28, 2009
New Workunits: the calculation of similarities and features of approx. 100.000 new sequences, that were imported from protein databases into SIMAP until the end of July, has been started.
New Workunits of a new SIMAP dataset available
bienvenue au club très élitiste des cruncher de simap ... Et en plus le boulot est limité à 30 WU par core en cache ... donc il faut du H24 et beaucoup de puissance de calcul disponible pour avoir beaucoup de boulot!
Allez dans l'onglet "projets" mettez "suspendu" sur tous vos projets actifs (sauf SIMAP of course) et lancez la mise à jour du projet SIMAp :electric: infaillible, même si gérable que pour les machines sous le coude :cry:Je me cite pour mémoire, car la différence du nombre de WU reçues est sans aucune mesure avec une simple mise à jour automatique :coffeetime:
c'est clair :D mais faut faire gaffe aux deadlines des UT qu'on a déjà en cache :siflotte:Tout a fait et si le délai de retour est en gros de 6/7 jours rien que sur 3 machines que j'ai sous la main at home, le temps de calcul va de 6h (un tout jeune P400Mhz :eek: ) à 00h54 sur un AMD 5400 (les autres bécanes sont distantes)
Project status
The project has currently no work (see below).
The similarity matrix of the SIMAP project is currently up to date. All workunits from the last calculation period are distributed, thanks to all users for chrunchig them.
The calculation of new simap workunits containing the novel proteins from September 2009 (simap app) and their domains (hmmer app) will start around October 1st.
je confirme :cry:RV avec Susa aussi , qui nous a dans le viseur.
Prochain rendez-vous vers le 1er octobre
September 30, 2009
New Workunits: the calculation of similarities and features of approx. 430.000 new sequences, that were imported from protein databases into SIMAP until the end of September, will start in the evening (UTC) of September 30. We will also calculate a batch of new environmental sequences.
Hein ? il y a des UT pour le GPU ?
NAN je plaisantais :lol: mais bon je pensais avoir plus de réactions que ça ...:ayalou:
01/10/2009 12:48:28 boincsimap Requesting new tasks for GPU:coffeetime:
N'empêche que même si depuis ce PC avale les WU, un moment de temps j'ai lu ça : :coffeetime:c'est normal, tous les projets qui utilisent la derniere version de boinc-server donne ce message, appli GPU ou pas, ça le met quand même :gno:
c'est normal, tous les projets qui utilisent la derniere version de boinc-server donne ce message, appli GPU ou pas, ça le met quand même :gno:Danke RLDF bien noté :etmerde:
After these calculations are finished, next workunits are expected around November 1st.
déjà??? :eek: :eek:
Tant mieux !
Erf ça a été rapide :eek:
bon, si c'est ça je vais m'inscrire :oet bien changer à temps, tes paramètres de connexion réseau et taille du cache, le vider si besoin, mettre le reste en mode suspendu, préf à 1000 sur SIMAP enfin tout pour plaire au serveur :hyperbon: , la distribution ne dure jamais longtemps ! Sinon bienvenue à tes 12 cores :smak:
sam 31 oct 2009 17:52:37 CET|boincsimap|Message from server: No work sentque mon cache soit réglé à 2 ou 10 jours :??:... je n'ai en tout et pour tout que 5 UTs NFS@Home (150mn de crunch) et 4 de SIMAP (200mn). :pt1cable:
sam 31 oct 2009 17:52:37 CET|boincsimap|Message from server: (won't finish in time) BOINC runs 100.0% of time, computation enabled 100.0% of that
Je reçois sans arrêt ce message dans le BMque mon cache soit réglé à 2 ou 10 jours :??:... je n'ai en tout et pour tout que 5 UTs NFS@Home (150mn de crunch) et 4 de SIMAP (200mn). :pt1cable:Mets en pause tes WU NFS@Home et update SIMAP, 10 fois, 20 fois et un moment de temps ça tombera :coffeetime:
Mets en pause tes WU NFS@Home et update SIMAP, 10 fois, 20 fois et un moment de temps ça tombera :coffeetime:
Il va y en avoir pour un bon mois de calcul alors va faloir soutenir l'effort si l'on ne veut pas se faire rattraper et si l'on veut rattraêr UTGIl faudrait un peu (beaucoup) plus de monde si on veut rattraper quelqu'un !
arg, on peut pas avoir plus de 240 WU en même temps :/:hello:
tant pis :/
hmmm sloughi tu disposes donc d'un V16 :miam:
oui :):adonf: :D
Les premières stats du mois ne sont pas bonne.UTG nous avait déjà passé. Le risque est derrière nous avec Susa qui peut nous faire tomber d'1 point FB mais pour l'instant ils sont en retrait.
utg calcule 35% d'unités de plus que nous
http://fr.boincstats.com/stats/team_stats.php?pr=simap&st=0
L'AF : 10.364
utg : 13.975
Ben non, il reste encore les 5 millions d'UT de séquences environnementales à venir. :spamafote:
The other simap workunits for the 5 mio environmental sequences are created step by step (due to disk space limitations), thus we don't know their number so far. I'd guess a number of 2 million workunits for them (corresponding to 2..3 weeks of work), but this is a very rough estimate.
best regards
Thomas
Il va falloir faire gaffe, parce que Susa a vraiment l'air très présent ce mois-ci sur Simap :
http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/top_teams.php
Je viens de rejoindre L'AF ... ~3000/j.Bienvenue Al@ON :hello:
J'arriverai jamais à te dépasser en nombre de post :cavachier:Bin là faut en écrire des conneries (des tas)... et je sais de quoi je parle. :D
(http://moe.mabul.org/up/moe/2009/05/14/img-1105374fn89.gif) Dudu... juste un tit coup de main.
Bin là faut en écrire des conneries (des tas)... et je sais de quoi je parle. :D
8 millions de wus en plus, yes !Noooooooooo!!! :D
9110302 Similarities of new environmental sequences, part 1/5 BOINCSIMAP simap application 8,088,035 0.0 % 0 428051 <-- je crois plutôt qu'il faut tenir compte de ce nombreMais bon, dans la logique, il va y en avoir d'autres puisque cette série est la 1/5.
oui c'est correct à l'heure H, y'à pas encore les infos des 2/5 à 5/5
Ce qui sera tout de même un sacré record en matière de durée de diffusion de WU Simap, on aura peut être un jour un projet permament :love:
Donc les serveurs devraient être à sec dans 2 semaines (Samedi 21 novembre)
9110701 Similarities of new environmental sequences, part 2/5 BOINCSIMAP simap application 0.0 % 0 409862
News
SIMAP featured in the 2010 Database Issue of Nucleic Acids Research
November 12, 2009
SIMAP in the news: a new scientific publication reports on the progress and new features of the SIMAP database. The fulltext article in the 2010 Database Issue of Nucleic Acids Research is freely available online.
New Workunits in the morning (UTC) of October 31 and Win64 simap app
Il ne manque pas la courbe de utg ?volontairement omis parce qu'ils sont dans les choux en 5e position derrière Susa avec une prod qui baisse encore
stef deSuper stef, désolé pour le retard. :hello: :kookoo:NiceMacon (http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/user_profile/images/26978_sm.jpg) UotD today. :p
Enigma étant fini, je viens vous donner un petit coup de main :hyperbon: (modeste quand même, j'ai pas 200k de RAC)Tout aide est la bienvenue, si modeste soit elle.
Nan c'est un projet pour puristes :Det sans OGM, euh pardon, sans GPU :cetaboir:
Nan c'est un projet pour puristes :D
et sans OGM, euh pardon, sans GPU :cetaboir:(http://moe.mabul.org/up/moe/2009/06/17/img-0034554cpyr.gif)
On a de quoi nourrir nos fermes de pc pendant encore 8 jours ?Je viens de mettre tous mes quads sur Simap en voyant que le délai de dépassement ne baissait pas rapidement. J'espère que mes vieux portables tiendront la barraque sur WEP. :/
https://statseb.boinc-af.org/graphe.py?graph_id=b1eec77b30dd35208da1bec1eaa27840
On va avoir du Simap en décembre ?
After these calculations are finished, next workunits are expected around December 1st.
on devrait les dépasser début décembre! on a en tout cas une courbe assez sympa :sun:
https://statseb.boinc-af.org/graphe.py?graph_id=b1eec77b30dd35208da1bec1eaa27840
mais susa ..... va récup son point FB aussinous aussi :sodo: go go on saute ... le pas :sun:
ce serait pas UT hmmer, par hasard ? car elles sont bcp plus longues
sam 05 déc 2009 21:22:24 CET|boincsimap|Sending scheduler request: To fetch work. Requesting 5424 seconds of work, reporting 0 completed tasks
sam 05 déc 2009 21:22:29 CET|boincsimap|Scheduler request succeeded: got 1 new tasks
sam 05 déc 2009 21:22:31 CET|boincsimap|Started download of 9112201.518583
Best wishes for 2010
The BOINCSIMAP team wishes all partipants a merry xmas and a happy new year. Thank you for supporting our project and helping to keep the largest database of protein similarities and protein features up-to-date.
23 Dec 2009 0:00:00 UTC
c'est un camembert comme un autre...:non:, il est fait avec du lait de vaches occitanes. (http://moe.mabul.org/up/moe/2009/05/30/img-22462020udx.gif) :D
:non:, il est fait avec du lait de vaches occitanes. (http://moe.mabul.org/up/moe/2009/05/30/img-22462020udx.gif) :DCa ne vaut pas celles de la Normandie ... à l'Ouest donc :lol:
c'est un camembert comme un autre, c'est toujours optimisable ou faisable différemment...Il est très bien ton camembert SIMAP :sun:
New Workunits: the calculation of similarities and features of new sequences, that were imported from protein databases into SIMAP until the end of January, will start in the morning (UTC) of January 31.
T'as l'air d'être assez bien foutu, vu comme ça :DSur que c'est du lourd avec RLDF :p
The current workunits calculate the similarities and domains of approx. 200.000 new sequences from public databases imported in January 2010, and the similarities of approx. 2 million environmental sequences. After these calculations are finished, next workunits are expected on March 1st.
Project status
The project has currently no work (see below).
The similarity matrix of the SIMAP project is currently up to date. All workunits from the last calculation period are distributed, thanks to all users for chrunchig them.
The calculation of new simap workunits containing the novel proteins from February 2010 (simap app) and their domains (hmmer app) will start around March 1st, 2010.
01/03/2010 20:37:56 boincsimap Message from server: Project has no jobs available
01/03/2010 20:42:13 boincsimap Requesting new tasks
01/03/2010 20:42:18 boincsimap Scheduler request completed: got 18 new tasks
01/03/2010 20:42:28 boincsimap Requesting new tasks
01/03/2010 20:42:33 boincsimap Scheduler request completed: got 0 new tasks
01/03/2010 20:42:33 boincsimap Message from server: Project has no jobs available
Calculation of SIMAP updates is currently running.
The current workunits calculate the similarities and domains of approx. 200.000 new sequences from public databases imported in February 2010. After these calculations are finished, next workunits are expected on April 1st (no joke ;-).
ready !
steady !
Toutes les wus ont été distribuées, vous pouvez retourner sur vos projets habituels...ça a été vite torché cette fois-ci ! :eek:
New Workunits in the morning (UTC) of March 31
New Workunits: the calculation of similarities and features of approx. 1,200,000 new sequences, that were imported from protein databases and metagenomes into SIMAP until the end of March, will start in the morning (UTC) of March 31.
Pas de désespoir, Sarko l'aime pas :blbl: :gniak:c'est réciproque, il n'aime pas la planète/l'écologie :blbl:
4900 dont 1530 validées pour l'instant
Comment sais tu que tu fais 4900 uts ?Tu vas sur ton compte SIMAP et regarder dans "task/tâches" tu peux ensuite faire le tri (ou pas) sur en cours de validation/ de calcul etc
pas de graphique Simap ce mois ci? unité totale, à faire et celles déjà traitées
The calculation of new simap workunits containing the novel proteins from April 2010 (simap app) and their domains (hmmer app) will start around May 1st, 2010.Merci pour l'info ! :jap:
dim. 02 mai 2010 22:18:08 CEST boincsimap Message from server: (won't finish in time) BOINC runs 85.2% of time, computation enabled 100.0% of that
Tu ne peux t'en prendre qu'à toi ou à BOINC à la rigueur. :blbl:enfoirécoquin, je suis sûr que tu l'as fait exprès :gno: :cavachier:
Edit : tu es sûr que tu ne veux pas faire le Pentathlon, plutôt ... :gniak:J'y serais, mais pas avant le 5. :cavachier:
J'ai bien mis pourtant dans les préférences "Se connecter tous les : 10 jours" et "Réserve de travail supplémentaire : 10 jours", mais je n'ai que 4 UT en cours sur mon Quad, et aucune d'avance[...]
dim. 02 mai 2010 23:43:38 CEST boincsimap Message from server: (reached limit of 120 tasks in progress)
Tiens, je suis UOTD sur Simap.
Vive moi :banana:
...
Ben y'a la super page de jip : http://jip.web.free.fr/uotd.xml (http://jip.web.free.fr/uotd.xml)
New Workunits in the evening (UTC) of June 1
New Workunits: the calculation of similarities and features of approx. 200,000 new sequences, that were imported from protein databases and metagenomes into SIMAP until the end of May, will start in the evening (UTC) of June 1. 31 May 2010 11:59:59 UTC · Commentaire
oui pas avant demain dans la soirée...
mar. 01 juin 2010 19:20:21 CEST boincsimap Sending scheduler request: To fetch work.
mar. 01 juin 2010 19:20:21 CEST boincsimap Requesting new tasks
mar. 01 juin 2010 19:20:26 CEST boincsimap Scheduler request completed: got 10 new tasks
j'en ai déjà absorbé 7500 et ça continue :pt1cable:
30 min sur mon Q9450 o/c à 3,6Ghz
je précise en 64bits, application Simap 5.12
moi c'était : 5.12, +/- 1H, 2.8Mhz
Bizarre je suis en 64bits, mais avec Simap 5,10 et les wus durent +/-1h30 sur mon Q9450 (certes seulement à 2.8Mhz)
simap 5.12 for Windows64
Comment vous avez chopper la 5.12 :??:
:cavachier: PRUNCHEU!!! :p
:hello: salut !
Les 5.12 c'est pour du windo 64Bits !
http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/apps.php
EDIT
GRILLED par al :desole:
Je sais, mais justement je suis en 64bits comme dit plus haut
Alors je vois qu'une chose ! tu as du installer Boinc en version 32Bits :spamafote:
New Workunits in the evening (UTC) of July 1
New workunits: the calculation of similarities and features of approx. 170,000 new sequences, that were imported from protein databases and metagenomes into SIMAP until the end of June, will start in the evening (UTC) of July 1. 30 Jun 2010 8:31:56 UTC ·
j'ai le pleinC jamais assez :gniak: :gniak:
1H PAR UT....
alors mon pc est lent alors...
faut pas désespérer : ça va viendre ;)
RESULTS Approximate #
in database 388,662
unsent 0
tu n'as pas fait de cache ?si 1 jours,mais le mois dernier j'en avais en continu;la j'ai plus rien du tout a calculer
je ne recois plus d'ut,il ni a deja plus rien? :rhaa:et dire qu'il y a trois jours je disait ca. :siflotte:
Mais il n'y a plus rien !
A 10h30 :ils doivent lâcher encore 3,5 millions d'unités, allez on se gave ce mois-ci et après on pourra se reposer !
(http://www.kirikoo.net/images/7jerome31-20100717-102958.jpg)
ils doivent lâcher encore 3,5 millions d'unités, allez on se gave ce mois-ci et après on pourra se reposer !
bon, alors on transforme ça en véritable attaque pour passer n°1 au FB ?
Pourquoi pas ? La 2ème place est accessible d'ici 5 jours, pour la 1ère place ça va être plus dur...C'est sur, il va falloir un peu plus de puissance pour rattraper le 1er au FB ... :coffeetime:
Pourquoi pas ? La 2ème place est accessible d'ici 5 jours, pour la 1ère place ça va être plus dur...
ne pas se décourager ça va revenir... j'ai du stock pour environ 15 heures
21/07/2010 21:57:50 boincsimap [error] Error reported by file upload server: can't open log file '../log_leo/file_upload_handler.log' (errno: 9)edit : ça roule
:/edit : ça rouleDans quel sens ? :lol:
22/07/2010 08:20:22 boincsimap Scheduler request completed: got 0 new tasks
22/07/2010 08:20:22 boincsimap Message from server: (Project has no jobs available)
pas vraiment...
23/07/2010 18:47:59 boincsimap Reporting 3 completed tasks, not requesting new tasks
23/07/2010 18:48:00 Project communication failed: attempting access to reference site
100 000 wus terminées par jour environ, dans 5 jours c'est réglé :/, avant la fin du challenge à ce rythme.C'est pas plutôt 227 http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/team_display.php?teamid=37 (http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/team_display.php?teamid=37). :coffeetime:
Waouww je pèse pour 0,12 % :) des 24 participants de l'AF.
...
avec batch 7/10, servez-vous !
7416363 3556814 27 Jul 2010 22:43:20 UTC 28 Jul 2010 17:39:29 UTC Error while computing 0.00 14,060.98 54.05 75.00
7456920 3606963 28 Jul 2010 18:18:21 UTC 28 Jul 2010 22:14:47 UTC Error while computing 11,354.16 11,284.45 58.14 75.00
Une question à 2 balles : Y'en a encore bps des WUs???Meteore a dû se barrer en week-end mais demain matin il devrait nous poster une jolie image dont il a le secret. :D
A 22h45 : nouveau batch (non compris dans les 10/10)
Je te remercie Modesti, j'avais déjà regardé ces liens, le problème c'est que ce n'est qu'une constatation et pas de solutions!!
Enfin j'ai réglé le problème en annulant toutes les WUs 10080103.xxxxxx et puis voilà!!!
J'en conviens, c'est un peur radical mais calculer pour rien et payer EDF pour rien ça me gonfle un peu!!!
Merci encore.
A 11h20 avec batch 9/10 :
RESULTS Approximate #
in database 550,989
unsent 18,877
Moi, j'obtiens toujours plus, mais ça ne dépasse pas les 30 crédits.
C'est l'effet Modesti... Elle est passée de 300 à 3000 / jour :siflotte:oui,et ont a bien sentient l'effet "courant d'air" la pluie est de retour :desole:
HFR...:D :D :D :D
Donc, commence par aller prier chez eux, on en reparle ensuite.
les projets rosetta , simap , folding , et poem sont complémentaires? merci
Les WU de septembre sont tombées du coup ? Ou on est encore sur celle d'Aout ? Merci !
[AF>WildWildWest] RLDF User of the Day :bounce:merci :ange:
Eh oui le ventre mou de l'AF dort sur ses projets.Le ventre mou souhaiterait peut-être que vous passiez aussi 3 mois sur leurs projets !
.../...
Ben moi j'ai dit que je restais sur SIMAP jusqu'au bout et je m'y tiens!!!
Si ça finit avant le 01/10/10 ben je basculerai sur Einstein!!
Ca fait maintenant 2 mois et 1 semaine que je suis à fond sur ce projet, c'est pas le moment d'arrêter!!!
428500 pts durant ce laps de temps!!
eh ben on n'est pas rendus ... :dingue:
Ce qui compte c'est le chemin, pas le but.
:siflotte:
En revanche, si ça devient permanent et que vous autres fondus continuez à fond dessus, ben vous ne ferez plus que du simap :/en cpu oui, mais en gpu on a d'autres projets, et puis ça n'empêche pas de faire du WUProp en même temps :smak:
Boincstats n'a pas l'air de vouloir reprendre sa 2ième place au FB :clafete: :bounce: :lestat: :banana: :adonf:
New Workunits in the evening (UTC) of October 8
New workunits: the calculation of similarities and features of approx. 270,000 new sequences, that were imported from protein databases and metagenomes into SIMAP until the end of September, will start delayed (for technical reasons regarding the finalization of the many workunits containing environmental sequences) in the evening (UTC) of October 8.
Calculation of SIMAP updates is currently running.
The current workunits calculate the similarities and domains of approx. 200,000 new sequences from public databases imported in September 2010. After these calculations are finished, next workunits are expected on November 1st.
Powerdown on Oct 6/7
Due to a series of power losses of the complete building, our project was offline for almost a day. Unfortunately the repeated power losses caused a serious crash of the BOINC database. Thus we had to recover the database from backup, reverting it to the status by Oct 6, 0:00 a.m. We have manually recovered the result table from the crashed database and thus have granted all credits for results that have been successfully validated between the date of the last backup and the crash.
Sorry for the trouble,
best regards
Thomas 7 Oct 2010 11:24:06 UTC
Batch Name short Description Application sum of estimated TFPOPS of WUs in Batch Batch Progress # of finished WUs in Batch # of total WUs in Batch
10091501 Similarities of new sequences from metagenomes (remaining from July and August), part 1/2 BOINCSIMAP simap application 11,154,363 99.8 % 291112 291604
10091502 Similarities of new sequences from metagenomes (remaining from July and August), part 2/2 BOINCSIMAP simap application 10,880,297 92.9 % 264329 284440
10100101 Similarities of new sequences from public databases BOINCSIMAP simap application 3,786,796 0.0 % 2 234156
10100102 Domains of new sequences from public databases BOINCSIMAP hmmer application 62,420 0.0 % 0 3150
08/10/2010 16:47:33 boincsimap Sending scheduler request: To fetch work.
08/10/2010 16:47:33 boincsimap Requesting new tasks for CPU
08/10/2010 16:47:35 boincsimap Scheduler request completed: got 1 new tasks
08/10/2010 16:47:38 boincsimap Started download of 10091502.276458
08/10/2010 16:47:39 boincsimap Giving up on download of 10091502.276458: file not found
08/10/2010 16:47:46 boincsimap Sending scheduler request: To fetch work.
08/10/2010 16:47:46 boincsimap Requesting new tasks for CPU
08/10/2010 16:47:48 boincsimap Scheduler request completed: got 3 new tasks
08/10/2010 16:47:50 boincsimap Started download of 10091502.235381
08/10/2010 16:47:50 boincsimap Started download of 10091502.235503
08/10/2010 16:47:51 boincsimap Giving up on download of 10091502.235381: file not found
08/10/2010 16:47:51 boincsimap Giving up on download of 10091502.235503: file not found
08/10/2010 16:47:51 boincsimap Started download of 10091502.282777
08/10/2010 16:47:53 boincsimap Giving up on download of 10091502.282777: file not found
Ah oui ?? tiens ??
Un remaniement de Juillet et Août ???
http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/batchmonitor.php
User of the day:clafete:
[AF>Quebec]sbmtl
@ Météore : t'aurais pas une guerre de retard toi ? :siflotte:
11/10/2010 20:18:02 boincsimap Started upload of 10100101.186600_1_0
11/10/2010 20:18:07 boincsimap [error] Error reported by file upload server: Maintenance underway: file uploads are temporarily disabled.
11/10/2010 20:18:07 boincsimap Temporarily failed upload of 10100101.186600_1_0: transient upload error
11/10/2010 20:18:07 boincsimap Backing off 1 min 56 sec on upload of 10100101.186600_1_0
SIMAP est une base de données publique des similitudes pré-calculées de protéines qui joue une fonction clé dans beaucoup de méthodes de bio-informatique.
Hop encore une ! :D
The project has currently no work (see below).=> pas de taf jusqu'en janvier 2011 => positions FB figées d'ici la :spamafote:
Due to a series of problems with the recent hardware we decided that BOINCSIMAP should be moved to a new location onto new hardware. The project will therefore have no work until January 2011.
BOINCSIMAP will move to a new location onto new hardware
Due to the move of parts of the BOINCSIMAP crew to Vienna in 2010, this project is now a joint project of the Technical University Munich and the University of Vienna.
The recent series of power faults, combined with defects of the UPS devices in our Munich facilities, has motivated us to move BOINCSIMAP now immediately to new hardware at the University of Vienna. This hardware is brand new and became available last week. We will now setup the new boinc servers (BOINC server, download-/upload server and database server) and run a first small test in December 2010. If everything works fine, the first full run of the new servers will start around January 7, 2011 after the new year holidays. We expect then 1..2 months of continuous work, as there are the new proteins of three months plus a couple of new metagenomes.
There will be a new URL for the project, but we will also keep the current URL operational for a longer period.
Thanks to all friends of SIMAP for your great work, help and the many discussions in the previous years. We look forward to another productive era starting next year.
Best regards from Vienna
Thomas 27 Oct 2010 20:25:27 UTC
Que de bonnes nouvelles je trouve (toujours voir les côtés positifs bande de petits scarabées :léjonti: ).
D'une, ça va vite passer. Un peu pus de deux mois, sachant qu'on va avoir les fêtes de fin d'année entre temps, on n'aura même pas le temps de s'en rendre compte. :clafete:
De deux, leur matériel sera amélioré, apte à subir la déferlante quand on va se ruer dessus comme des drogués. :gno:
De trois, on aura plein de boulot à rattraper, il y aura plein d'UT :hyperbon:
De quatre.... non c'est tout en fait :siflotte:
Les hyper fans de simap devraient se mettre sur rosetta car il y a plus 1 600 000 unités, je crois à calculer...Rosetta est un projet permanent, il y aura toujours des unités sauf pannes
zut, on aurait pu gratter 1 place au FB (ou en perdre 1)
Chui à fond ... mais punaise, ca rapporte pas des masses leurs WUs quand même :/
75% du batch SIMAP et 35% du batch HMMER ... ca avance tranquilement ... et ca m'étonnerait que ca tienne les deux semaines qu'ils avaient prévues :ange:
Pourtant, il y a apparemment plus 195 000 unités encore à faire...:non: ce qui compte c'est la ligne "unsent" dans RESULTS :o
http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/server_status.php
d'autant plus que dans les dernières HMMER que j'ai reçues j'ai déjà le n° 199579 alors que le batch en compte 199994. la distribution est donc presque finie :ange:
194 000 ce n'est pas ce qui reste à calculer ?en fait ce sont les unités du paquet actuel, là dessus, 94216 ont été validés
24/11/2010 20:47:28 http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/ Message from server: Server error: feeder not running
on est passé 3ème sur Simap et personne en parle !!!si si, on en parle en zone anisée et aussi plus loin :ange:
en décembre faisons un petit effort pour reprendre notre 2ème place... à partir du 6/12
si si, on en parle en zone anisée et aussi plus loin :ange:Dans la galaxie du sombrero ? :D------------------------->>>>>>> je suis déjà loin......
Project status
The project will move to a new master URL soon (see below).
We have recently moved the project to new hardware. A new website has been created and a new project URL will be activated soon. The renewed project will enter production mode with new work by Dec 6, 2010.
Scheduled date for change of master URL to "http://boincsimap.org/boincsimap": Mon, Dec 6 (6 p.m. UTC)
New project URL on Mon, Dec 6 approx. 6 p.m. UTC
The renewed project will move to the new project URL "http://boincsimap.org/boincsimap" on Mon, Dec 6 approx. 6 p.m. UTC. Thereafter, new work will be available for about 2..3 months.
After the project has changed its URL, please disconnect and reconnect your boinc client to the new URL. Sorry for this - this URL change to the new (institution independent) domain will remain an once-in-the-lifetime event for BOINCSIMAP.
Best regards and thanks for your support
Thomas 5 Dec 2010 21:27:42 UTC
se rattacher :o (on est sur le forum francophone tout de même)
Sans vouloir te viser toi en particulier car tu n'est pas le seul a le faire, ne seriat-il pas plus judicieux et plus sympa de souligner les fautes d'hortographes par mp?
Ne prend pas cela comme une attaque mais une question a l'ensemble des membres.
:kookoo:
Sans vouloir te viser toi en particulier car tu n'est pas le seul a le faire, ne seriat-il pas plus judicieux et plus sympa de souligner les fautes d'hortographes par mp?
Ne prend pas cela comme une attaque mais une question a l'ensemble des membres.
:kookoo:
pas de guéguerre s'il vous plaît, restons concentrés sur le projet qui doit redémarrer aujourd'huije plussoie météore, même si tout celà se passe dans une humeur joyeuse :kookoo:
Le Bi Nehalem est en attente :) prêt à stocker 10 jours de Wu :)
j'y met 22 coeurs dessus dès que possible !
Ah... 22 ...
hum ... bon ok je vais m'y mettre aussi, je me demande si ils vont être capable d'absorber la demande :/
Ils disent avoir une matériel plus puissant qu'avant....je ne doute pas,
pareil :/ ça pédale dans la semoule pour l'instant ... :sarcastic:
06/12/2010 22:16:36 boincsimap You used the wrong URL for this project
06/12/2010 22:16:36 boincsimap The correct URL is http://boincsimap.org/boincsimap/
06/12/2010 22:16:36 boincsimap Using the wrong URL can cause problems in some cases.
06/12/2010 22:16:36 boincsimap When convenient, detach this project, then reattach to http://boincsimap.org/boincsimap/
C'est parti ici, toutes les machines sont chargées :)
les stats de Simap ne remontent pas chez StatsBZH, c'est à cause du changement d'url ?
Suffit de demander... https://statseb.boinc-af.org/classement_membres.py?projet=48&sort=jour (https://statseb.boinc-af.org/classement_membres.py?projet=48&sort=jour). :D
Suffit de demander... https://statseb.boinc-af.org/classement_membres.py?projet=48&sort=jour (https://statseb.boinc-af.org/classement_membres.py?projet=48&sort=jour). :D
Project status: running
Hosts active: 11,313
Work distributed: 3 %
Remaining: 105 days
J'aimerais bien participer aux festivitées mais impossible de me detacher/attacher au projet
dans l'onglet "projet" le bouton "se detacher" est grisé :cpopossib:
Tu dois quand même pouvoir récupérer du travail, fzs600. Sur le forum de Simap, l'admin a dit que les 2 adresses vont fonctionner pendant quelque temps en parallèleabsolument je recois du taf
Fzs600,as-tu pensé à cliquer sur le projet "SIMAP" avant de vouloir t'en détacher???oui
T'avais la flemme de lire les 4 pages depuis ta dernière intervention ? :p Faut suivre un peu, Antares :lol:
[snip] Je ne fais que survoler.
@fzs600 : c'est ptet juste que t'avais des ut en cours non ?je n'avais aucune ut simap en cour
Ca y'est, on attaque le batch 20101202 ... déjà complet à 0.7% ... et 60.6% pour le 20101201 (ya du monde qui a des machines qui se trainent à renvoyer les résultats ... :siflotte: ).
... ou qui ont trop pris trop de stock! :D
20101204 New protein sequences from metagenomes, part 1/7 simap 21,718,616 0.0 % 0 1075524
Lun 13 déc 20:31:41 2010 Account manager: Delayed detach from SIMAP, project changed URL. After detaching project will reattach with new URL on next communication!
Lun 13 déc 20:31:41 2010 Account manager contact succeeded
Lun 13 déc 21:30:59 2010 boincsimap update requested by user
Lun 13 déc 21:31:02 2010 boincsimap Sending scheduler request: Requested by user.
Lun 13 déc 21:31:02 2010 boincsimap Reporting 9 completed tasks, not requesting new tasks
Lun 13 déc 21:31:03 2010 boincsimap Scheduler request completed
Lun 13 déc 21:31:03 2010 boincsimap You used the wrong URL for this project
Lun 13 déc 21:31:03 2010 boincsimap The correct URL is http://boincsimap.org/boincsimap/
Lun 13 déc 21:31:03 2010 boincsimap Using the wrong URL can cause problems in some cases.
Lun 13 déc 21:31:03 2010 boincsimap When convenient, detach this project, then reattach to http://boincsimap.org/boincsimap/
Lun 13 déc 21:31:08 2010 boincsimap Resetting project
Lun 13 déc 21:31:08 2010 boincsimap Detaching from project
Lun 13 déc 21:31:42 2010 Contacting account manager at http://bam.boincstats.com/
Lun 13 déc 21:31:43 2010 Account manager: BAM! User-ID: 43952
Lun 13 déc 21:31:43 2010 Account manager: BAM! Host-ID: 208020
Lun 13 déc 21:31:43 2010 Account manager: Number of BAM! connections for this host: 5539
Lun 13 déc 21:31:43 2010 Account manager contact succeeded
Lun 13 déc 21:31:43 2010 Attaching to http://boincsimap.org/boincsimap/
Lun 13 déc 21:31:58 2010 boincsimap Scheduler request completed: got 1 new tasks
Lun 13 déc 21:32:00 2010 boincsimap Started download of simap_5.10_i686-apple-darwin
Lun 13 déc 21:32:00 2010 boincsimap Started download of 20101201.009466
Lun 13 déc 21:32:05 2010 boincsimap Finished download of simap_5.10_i686-apple-darwin
Lun 13 déc 21:32:14 2010 boincsimap Finished download of 20101201.009466
moi j'ai 22 cœurs dessus jusqu'à minimum la fin de l'année...
20101205 New protein sequences from public databases, imported in December simap 1,744,614 0.0 % 0 105720
20101206 New protein sequences from public databases hmmer 1,663,674 0.0 % 0 83524
Sicituradastra met de la puissance sur Simap, à surveiller...:hello:
ils font eux aussi des PDLS, les courbes durent 7 jours :)Ils ont des gens motivés alors pour les PDLS, nous on a déjà fait plusieurs PDLS sur Simap et ça ne se voit même pas, on a beaucoup a apprendre :D
Ils ont des gens motivés alors pour les PDLS, nous on a déjà fait plusieurs PDLS sur Simap et ça ne se voit même pas, on a beaucoup a apprendre :Dils sont peu nombreux avec de gros rac chacun, nous c'est l'inverseou alors on n'est pas une équipe motivée(http://smileys-fr.com/smileys/tusort/icon_27.gif)
Ils ont des gens motivés alors pour les PDLS, nous on a déjà fait plusieurs PDLS sur Simap et ça ne se voit même pas, on a beaucoup a apprendre :Dou alors on n'est pas une équipe motivée(http://smileys-fr.com/smileys/tusort/icon_27.gif)
Ce qui me fait craindre qu'on enchaine directement sur les WUs d'avril!!!Exactly :D
Ce qui me fait craindre qu'on enchaine directement sur les WUs d'avril!!!
Je n'ai pas vu passer celles de février ni de mars ....
Number of pending results: 1005
Pending credit: 19,633.60
Source: SIMAP - Similarity Matrix of Proteins (http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/)
Mardi, 31 Mai 2011 14:14
The workunits for the about 400.000 new protein sequences (for the June release of SIMAP) will be available from Wed, Jun 1. We estimate that the batch for June will need about one week of work.
Best,
Thomas
Je suis déjà à fond ... :oun peu trop je trouve :D, t'envisagerais pas de bouffer une place au classement
:hello:
pas à fond mais un peu (c'est fou comme rentrer dans l'AF peut multiplier votre liste de projet).
Par contre je regarde le System Statut régulièrement et les Unsent sont loin de diminuer. Il n'y en a vraiment que pour une semaine ce mois ci?
purée j'ai zappé les 2 jours passés, autant pour moi :jap:
11 jours pour 400k sequences ... :bonui:c'est pour ça tout n'est pas mis en unsent, je regardai pas au bon endroit
Project is down
The project's database server is down. Please check back in a few hours.
Il reste plus qu'a faire un(e) raid/PD2S de défense un mois de gros stock.
moi que 76 en pending, il faut dire que ce mois-ci je n'ai que 4 cœurs à 100% sur simap, les 2 pc du boulot ont été éteints suite à une coupure électrique (et je suis en vacances 7 semaines), ça m'enlève 16 cœurs ! j'ai ceux de ma sœur et de mes parents qui bossent un peu mais pas en 24h/24... allez tous à fond !
Work distributed: 84 %
Remaining: 35 hrs
un peu oui, j'espère bien te dépasser ce mois-ci :ange:
de 5 jours de travaux restants on est passé à 10 :
Plus que 3 jours ... aurai-je rétabli une connexion suffisante pour en faire un peu d'ici là ?oui vas-y fonce, sers toi !
merci à tous, il faut du monde, ce serait dommage de perdre la 1ère place que nous occupons depuis le début de cette année !
les fidèles seront toujours là ;)Yessssssssssss :D
on fait c'qu'on pneu, on travaille pas chez Michelin :spamafote:
elles sont distribuées 3 fois ? je pensais 2
Avec un peu de chance, pour le batch de décembre ils vont nous remettre des méta-génomes qui nous tiendront chaud jusqu'en janvier ou février :ange: comme les années précédentesça serait mauvais pour nous parce que pour le coup, le 2ième au FB finira 1er au FB a notre place au 31/12 :cry:
C'est vrai qu'aujourd'hui on a fait une belle pointe.Le temps que nos diésel montent en température :hyperbon:
http://statsbzh.boinc-af.org/listteams.php?project_id=simap&
J'ai dans les 300 UT en stock mais je vais pas pouvoir le terminer à temps !Ha non alors !! :non: quand le vin est tirer il faut le boire nico :D
Tenez-vous prêts à les récupérer dans 3 jours :o
Mes caches sont à sec ... rendez vous dans 15 jours :)
Bonsoir
UTG est la confirmation que la répartition des tâches n'est pas équitable entre les cruncheurs.
Il est anormal que, plus l'on a de puissance, plus gros est le quota d'unités à calculer.
Si cela se confirme, et je ne vois pas ce qui pourrait l'infirmer, ce projet n'a rien à faire dans le FB.
Bonsoir
UTG est la confirmation que la répartition des tâches n'est pas équitable entre les cruncheurs.
Il est anormal que, plus l'on a de puissance, plus gros est le quota d'unités à calculer.
Si cela se confirme, et je ne vois pas ce qui pourrait l'infirmer, ce projet n'a rien à faire dans le FB.
The workunits for the about 500.000 new protein sequences (for the December release of SIMAP) will be available from Thu, Dec 1. We estimate that the batch for December will need about two week of work.
Sur mon i7 je n'ai mis que 7 jours de cache (deadline des UT simap), mais je ne chope pas plus de 300 UT après j'ai comme message "This computer has reached a limit on tasks in progress" :spamafote:
Sur l'Athlon et le portable, je crois que la limite est de 30 UT (pour moi), mais ça fait déjà un joli roulement, parce que généralement c'est une renvoyée pour une nouvelle reçue.
Tu fais ca comment Nico (de manière simple) ? :jap: sous Windows sans ralentir le système et manger trop de memoire. Mon expérience est que ca ralentissait le crunch des units, vu qu'il faut passer par des 'intermédiaires' ... Je me trompe ? :??:
N'oubliez pas non plus les Machine virtuelle pour faire du stock :D :D :D
Tu fais ca comment Nico (de manière simple) ? :jap: sous Windows sans ralentir le système et manger trop de memoire. Mon expérience est que ca ralentissait le crunch des units, vu qu'il faut passer par des 'intermédiaires' ... Je me trompe ? :??:
Work distributed: 77 %
Remaining: 2 days
T'es sûr de ta DLC, Bill ? D'habitude, les UT simap ont une deadline de 7 jours seulement.
si si, avec un petit script qui va bien, il m'en récupère encore quelques unes, à rendre avant le 19/12...c'est ou qu'on le trouve ton petit script qui va bien, Meteore??? :jap:
http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,3240.0.html (http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,3240.0.html)Merci, :jap: :jap: :jap:
J'en ai eu ... une :siflotte:
J'en ai eu ... une :siflotte:moi aussi.... :cry:
Bah pour moi c'est toujours vide ... :(avec le script on en récupère de temps en temps, pas à chaque fois...
Mit der neuen Server-Software release, welche Ende Januar installiert wurde, beobachten wir dass deutlich mehr workunits an die Hosts verteilt werden als früher. Wir untersuchen dies gerade, es ist möglich dass Einstellungen zur Projektkonfiguration durch die neue Serversoftware anders interpretiert werden. Um ein massives Überladen der Hosts durch SIMAP workunits zu vermeiden, haben wir die tägliche Maximalanzahl von workunits pro Host zunächst auf 300 begrenzt. Wir werden dieses Limit in den nächsten Tagen ständig überwachen und wenn nötig anpassen.
Beste Grüße
Thomas
Le communiqué de nouveau serveur logiciel, qui a été installé à la fin de Janvier, nous avons observé que les unités de travail sont nettement plus distribué aux hôtes qu'auparavant. Nous étudions ce droit maintenant, il est possible que les paramètres de configuration du projet sont interprétées par le logiciel serveur de nouvelles différemment. Pour éviter une surcharge massive des hôtes par les unités de travail SIMAP, nous avons limité le nombre maximum quotidien d'unités de travail par hôte initialement à 300. Nous allons suivre cette limite dans les prochains jours et constamment ajuster si nécessaire.
Cordialement
Thomas
The workunits for the about 485.000 new protein sequences (for the March release of SIMAP) will be available from Wed, Feb 29 (evening). We estimate that the batch for March will need about one..two weeks of work.
Je mets 40 cores à 2.7 GHz ce mois ci ...merci, on en a bien besoin !
Et il est pret ton 2700K ??oui il est réparé (c'est la carte mère qui merdait)
Sur le Win, j'arrive pas à en avoir!!!
Suspends le(s) projet(s) avec les deadlines les plus longues (genre SETI, Sirtaki...), mets tous les autres en "pas de nouveau travail", augmente le cache (3/7 marche très bien) et attends que le cache se remplisse. J'en ai chopé 400 en 2 minutes hier sur le i7 comme ça :DLes manip habituelles quoi, mais il y en a qui ne suivent pas, heureusement que Modesti est là hein Antares :gniak:
Work distributed: 100 %
Remaining: 0 min
Project status: preparing new workUTs demain matin dimanche vers 8h :pt1cable:
Scheduled start: Sun, Jul 1 (06:00 UTC)
The workunits for the about 380.000 new protein sequences (for the July release of SIMAP) will be available from Sun, July 1 (morning). We assume that the July batch will need about one week of work.
The workunits for the about 480.000 new protein sequences (for the August release of SIMAP) will be available from Mon, Jul 30 (morning). We estimate that the August batch will need about one week of work.
Best,
Thomas
Scheduled start: Mon, Jul 30 (06:00 UTC)
We are starting the integration of new metagenomes such as from the Human Microbiome Projecte into SIMAP. This will require additional SIMAP calculations for two subsequent stages of processing. We will start with a batch of workunits that will need about 2 weeks for its calculation. Further batches will follow after the regular workunits in the beginning of September.
SIMAP workunits from environmental sequences and metagenomes are characterized by shorter average sequence lengths. Therefore more sequences are packed into each workunit, resulting in longer calculation time and higher credits per workunits.
Problème résolu sur ma connexion 3G ... SIMAP consomme beaucoup plus de données que LHC ;)on pourra même proposer Simap en PD2S... dans 8 jours...
8321043 3895465 181640 26 Sep 2012 | 15:41:44 UTC 27 Sep 2012 | 23:06:51 UTC Terminé et validé 6,973.36 6,936.55 527.78 BOINCSIMAP simap application v5.12:eek:
8321042 3895451 181640 26 Sep 2012 | 15:41:44 UTC 27 Sep 2012 | 22:30:57 UTC Terminé et validé 7,001.30 6,966.91 535.07 BOINCSIMAP simap application v5.12
8321041 3895449 181640 26 Sep 2012 | 15:41:44 UTC 27 Sep 2012 | 23:11:53 UTC Terminé et validé 6,981.03 6,947.97 535.46 BOINCSIMAP simap application v5.12
8321040 3895445 181640 26 Sep 2012 | 15:41:44 UTC 27 Sep 2012 | 23:27:44 UTC Terminé et validé 7,012.44 6,983.38 533.59 BOINCSIMAP simap application v5.12
8321039 3895444 181640 26 Sep 2012 | 15:41:44 UTC 27 Sep 2012 | 22:35:14 UTC Terminé et validé 6,936.79 6,905.91 537.90 BOINCSIMAP simap application v5.12
Oui oui en envoi ... j'ai pas trop compris pourquoi c'était si gros ... mais bon ca a été accepté :)Bon et bien prochainement on va faire chauffer aussi les tuyaux :lol:
Et apparement, ca paye en conséquence !
:eek:
En plus, les 3 semaines ne sont que pour le batch d'octobre. Avec les métagéonomes on devrait en avoir pour nettement plus longtemps.Avec les
The workunits for the about 720.000 new protein sequences (for the November release of SIMAP) will be available directly after the last October batch has been distributed. Additionally, we will calculare further workunits of environmental sequences. We estimate that the November batch will need about four weeks of work.
Oui d'ailleurs j'ai baissé ma priorité que j'avais sur ce projet, j'avais mis une valeur très haute pour être sûr d'en avoir en début de mois mais maintenant j'en ai tout le temps, c'est pas équitable et ça me déplait, j'ai coupé.Coupé ? J'ai par contre supprimé la sur priorisation et plus de cache à 10 j
Bon allez, 44 cores sur SIMAP, un ptit coup de pouce à l'AF :D :jap:merci à toi !
Bon allez, 44 cores sur SIMAP, un ptit coup de pouce à l'AF :D :jap:
@jascooby: Ce serait bien que tu te rattaches à WUprop aussi avec tes bécanes :siflotte: Je vois dans tes stats que tu as déjà calculé dessus... ;)surtout qu'il y a un challenge auquel l'AF participe et qui commence demain.... :gniak:
Et accessoirement tu lis le topic wuprop pour comprendre pourquoi ce projet est si utile tout en ne coûtant rien et en rapportant un peu !Voir aussi ceci: http://boinc-af.org/projets-autres/1215-wuprophome.html (http://boinc-af.org/projets-autres/1215-wuprophome.html) :kookoo:
On a dit maintes fois qu'il devrait être obligatoire mais j'hallucine toujours quand je vois des membres de l'AF qui ne le connaissent pas alors que c'est Seb son créateur !
Un bandeau sur le portail voilà ce qu'il mérite.
C'est bizarre, vu le nommage des batchs on dirait que ce sont encore des vieux trucs différents des MAJ mensuelles de la BDD ...Oui, ce sont toujours des méta-génomes. Si on n'a pas de batch "régulier" en février, celui de mars risque d'être assez conséquent :gniak: :gniak:
trop a mon goût :/
Project status: running
Hosts active: 8,103
Work distributed: 5 %
Remaining: 68 days
During the last week we have imported more than 5.5 million new proteins into SIMAP. This was due to a major change in the structure of the NCBI RefSeq database, which is covered by SIMAP.
The workunits for these many new protein sequences will be available from Sun, Sep 1. Due to the unusually many new proteins we expect about three months of continuous work for SIMAP.
Best,
Thomas
Non on peut pas, mais... Sph3re... tu continues... je sens que tu vas bientôt faire l'objet d'une fatwa !! (au vrai (https://fr.wikipedia.org/wiki/Fatwa) sens du terme ;) )
:suri:
.... Alors dire "ah non je peux pas cruncher sur le projet B car je dois finir d'abord toutes mes unités du projet A" n'est pas un argument valide, ...
C'est votre droit le plus strict, vous crunchez pour ce que vous voulez, même en temps de RAID bien entendu, quelle que soit la raison et même si on vous rappelle l’existence le RAID en rigolant+
Un truc que je dis pas pour toi mais pour tout le monde
What's new?
SIMAP develops a new application version: master thesis project available! During almost 10 years of successful SIMAP maintenance based on the initial simap application, many ideas and requests have been collected for a new application version. We are currently working on the new app, which provides unique opportunities for a master thesis. We invite Biology or Computer Science students to join our project. Main goal is a re-implemented application replacing FASTA heuristics by the exact Smith-Waterman algorithm. This will be implemented on two different versions supporting both CPUs and GPUs. Furthermore we will change the scoring model for alignment calculation to composition-dependent score adjustment. If interested, please contact Thomas for further information.
Rien n'a bougé du coté de cette appli pour l'instant ...
Sinon c'est moi ou leurs pages web et la validation et demande de WUs rament ?
Petit, mais costaud. L'i7 c'est rien qu'un grand mou. Cqfd.
Hello ! :hello:C'est l'effet HT ca ... n'oublie pas que en 2350 secondes, ton i7 va faire deux WUs ... donc au final, il va plus vite :D
Il y a une chose qui m'étonne avec ce projet :
Temps moyen d'exécution d'1 UT =
1800 secondes sur un AMD Phenom(tm) II X4 955 Processor @ 3.2 GHZ
et
2350 secondes sur un i7-4770K CPU @ 3.50GHz
Comment se fait-il que ce "petit" Phenom soit si "performant" sur ces tâches en particulier ?
Merci ! :jap:
hors ligne
depuis 2014-04-28 06:30:27
Bonjour, :kookoo:Maintenance. :kookoo:
Le projet Simap est terminé :cry: ou bien s'agit-il juste d'une coupure temporaire ?Citerhors ligne
depuis 2014-04-28 06:30:27
We are moving our entire server infrastructure to another building. This project will therefore be offline from Monday, 28th of April, 6.30 UTC until the move has finished. We plan to be online again on Tuesday, 29th of April, 1pm UTC. best regards Thomas
SIMAP will leave BOINC by end of 2014 SIMAP is currently moving towards new algorithms for similarity calculations and scoring. After extensive tests and evaluations during the last months it turned out that the best way to continue SIMAP will be to use dedicated local hardware in our institute. SIMAP will therefore use BOINC only to maintain the current SIMAP database until the end of 2014. BOINC clients for the new SIMAP database will not be released and there will be no workunits for SIMAP after 2014. After 10 very successful years of SIMAP within BOINC this decision was not an easy one for us. However, we thank all users for their support in the past and in the upcoming last period until the end of the year.
Enéfé, il me faut mes 10000h et 2,5Millions de crédits sur ce projet.... :cavachier: :siflotte: :D
Plus sérieusement, dommage que ce projet s'arrête :cry:
During the last week we have imported about 4 million new proteins from the databases Uniprot and RefSeq into SIMAP.
The workunits of these sequences will be available from Sun, Aug 10 . We expect about two months of continuous work for SIMAP.
Best regards and thanks a lot for crunching SIMAP,
Thomas
SIMAP - Similarity Matrix of Proteins is temporarily shut down for maintenance. Please try again later.
Désolée, je ne pensais pas qu'il y avait qqun d'autre que moi sur Simap.
Désolée, je ne pensais pas qu'il y avait qqun d'autre que moi sur Simap.Toujours présent aussi !
Ont-ils expliqué pourquoi ils arrêtaient ?
SIMAP will leave BOINC by end of 2014. SIMAP is currently moving towards new algorithms for similarity calculations and scoring. After extensive tests and evaluations during the last months it turned out that the best way to continue SIMAP will be to use dedicated local hardware in our institute. SIMAP will therefore use BOINC only to maintain the current SIMAP database until the end of 2014. BOINC clients for the new SIMAP database will not be released and there will be no workunits for SIMAP after 2014. After 10 very successful years of SIMAP within BOINC this decision was not an easy one for us. However, we thank all users for their support in the past and in the upcoming last period until the end of the year.
Remaining: 51 min
12.12.14 10:24:04 | boincsimap | Started download of 141105.1624476
Project status: no work:??: :??:
Next work expected: around Feb 1
Project status: no work
Project is closing. No more work to be calculated.
Tiens c'est curieux il a changé de tête, Charlie ?! :)