Le Forum de l'Alliance Francophone
Boinc et les projets distribués => Biologie => Discussion démarrée par: Heyoka le 15 April 2008 à 18:45
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Je lance un petit concours du meilleur RMSD et du meilleur score sur Rosetta.
Pour les connaitre, appuyez ici :
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/rah_results.php?login=1
Cliquez sur la colonne Best RMSD user puis Best Score user (des fois que le meilleur score soit différent du meilleur RMSD)
Le top 10 RMSD de l'AF
1. Heyoka : 0.009
2. Kyuzo : 0.038
3. Ousermaatre : 0.061
4. Dudumomo : 0,093
5. RLDF : 0,101
6. Modesti : 0.554
6. Polynésia : 0.806
Top 10 meilleurs scores de l'AF
1. Julienh : -1407.24
2. Ousermaatre : -1325.58
3. Modesti : -1057.56
4. Kyuzo : -874.282
5. Polynésia : - 864.893
6. Heyoka : -696.254
7. rom_185 : -649.584
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Voilà mon meilleur score :
meilleur RMSD : 0,82 pour une unité du groupe 1elwA_BOINC_CONTROLABRELAX_VF_
meilleur score : -290,85 pour la même unité
J'ai calculé qu'une seule unité de ce type (colonne # Predictions user)
Le meilleur score sur l'ensemble des utilisateurs pour ce groupe d'unités 1elwA_BOINC_CONTROLABRELAX_VF_ a été de 0,5 pour le RMSD (colonne Best RMSD all users) et -302.41 pour le score (colonne Best score users). Au total, 171946 unités de ce type ont été calculées (Colonne # Predictions all users). Dernière mise à jour le 9 avril 2008 (Last Updated)
(http://www.boinc-af.org/images/Rosetta90.jpg)
Le point rouge c'est ma prédiction au milieu des 171946 autres unités calculées par l'ensemble des utilisateurs pour le groupe d'unités 1elwA_BOINC_CONTROLABRELAX_VF_
Sur ce graphique, l'énergie en Ordonné et le RMSD en abscisse. Plus on se rapproche du point (0;-310) et plus la prédiction est bonne
(http://www.boinc-af.org/images/Rosetta91.jpg)
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Et bien moi c'est 2.62, -151.63
Ce n'est pas difficile j'en ai qu'1 doit pouvoir faire mieux !
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Euh, j'ai 8 lignes de prédictions pour 8 groupes différents... mais je sais pas comment mettre l'image ici :spamafote:
En tout cas, merci pour ce topic Heyoka ! :jap:
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RMSD ? :heink:
random matris simulation day ?
:pt1cable: :lol:
[spoiler]Wai google est mon ami...
Root mean square deviation : http://fr.wikipedia.org/wiki/%C3%89cart_type[/spoiler]
En tout cas, merci pour ce topic Heyoka ! :jap:
+10,968 :jap: !
Tu pourrait mettre les scores de chacun dans ton 1er post STP :).
@Modesti : appuie sur "impr ecran syst", va dans paint, édition, coller, enregistre l'image (dans "type" mets JPEG c'est plus léger ;)), va ici : http://www.hiboox.com/ , selectionne ton image, ta catégorie... et donne nous le lien qui te sera donné en bas de page après l'envoi ;).
Pour moi, RMSD:
(http://images3.hiboox.com/images/1608/lt1nt4z4.jpg)
et le score :
(http://images3.hiboox.com/images/1608/3jfyv9mw.jpg)
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1.16; -477.05
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Battu au score [:douglas riper:3] mais pas au RMSD [:damien] !
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Battu au score [:douglas riper:3] mais pas au RMSD [:damien] !
:kaola:
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[:modesti:4]
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(http://img151.imageshack.us/img151/3330/rosettasbmtlko5.jpg) (http://imageshack.us)
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Merci rom_185 pour tes conseils, mais je n'aime pas trop laisser des traces sur le web. Je crois que j'ai trouvé une autre astuce ;) J'ai fait un copier-coller du tableau dans Word :p
Edit: le copier-coller a foiré à cause des liens hypertexte. J'essaie autrement ;)
Best RMSD:
Active Work Units Best RMSD Best RMSD Best Score Best Score # Predictions # Predictions Last Updated
User all users user all users user all users
· CNTRL_01ABRELAX_SAVE_ALL_OUT_-1ubi_-_filters 2.68 0.86 -148.85 -6975.5 571 48030784 2008-02-01
Best score:
Active Work Units Best RMSD Best RMSD Best Score Best Score # Predictions # Predictions Last Updated
User all users user all users user all users
· w0x5_1_MolecularRep_1_w0x5_bpdb90-1-2qpw_a_StructuralGenomics_a 4.59 3.19 -302.51 -357.52 1 201031 2008-02-01
Re-edit: modifié selon les conseils de rom_185
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@ SBMTL : tu t'ais tromper de colonne :/.
@ Modesti : tu ne veut pas laissez de trace mais tu nous racontes des choses un peut privé sur toi :whistle: . Mets juste la 1ere ligne pour le score et le RMSD, ça suffit ;) .
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Message modifié :)
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Je vais surement avoir des beaux scores à la prochaine mise à jours ;)
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[:al@on:3], ayant un résultat sous le coude je me permets de participer à ce concours. :p
(http://apu.mabul.org/up/apu/2008/04/17/img-141254p9ss6.png) (http://mabul.org/)
@ modesti [:al@on:3], si tu veux préserver ta vie privée il te faut arrêter de te connecter au Net [:jwhy]...
ce serait quand même dommage pour le Forum de L'AF. [:modesti:3] ;)
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T'es mimi, al@ON :) mais je vais pas vous lâcher de si tôt :p
Et tu me suis de près sur le CNTRL 01ABRELAX SAVE ALL OUT :D
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Va falloir se remettre à Rosetta pour reprendre du gallon.
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Va falloir se remettre à Rosetta pour reprendre du gallon.
Et peut-être gagner 2 places au FB. :ange:
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J'ai une petite question à ce sujet. La requête tombe en erreur chez moi alors que ça fait 3 jours que mon pc calcule pour rosetta, je comprends pas bien si j'ai raté un truc ou quoi ?
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Oui, c'est normal, la dernière mise à jour date du 9 Avril.
Je pense qu'il y a une mise à jour tous les mois
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salut tout le monde
Mon best rmsd 0.39
et mon best score -446
je vous donne les screenshots ce soir :)
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Best score : -494.69 et je repasse 1er toutes catégories [:damien] !
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[:vtr webjo:3] rom pour ta 1ère place. [:al@on:1]
je vous donne les screenshots ce soir :)
Il est parti chercher des cigarettes, en fait il est parti... :p
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j'ai trouvé ça :
Active Work Units
# 1dcj__JUMP_NAT_HAIRPINS_SAVE_ALL_OUT-1dcj_-
Best RMSD user : 1.741
Best Score user : -63.383
je ne sais pas ce que ça veut dire
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Pas super :/...
T'as été là : http://boinc.bakerlab.org/rosetta/rah_results.php?login=1 et t'a cliqué sur le haut de la colonne best score user ?
Sinon, bah regarde la valeur de la 1ere ligne c'est la meilleur ;) !
Et fait pareil pour le RMSD :) !
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ah j'avais pris la première ligne mais j'avais pas cliqué sur les tri par colonnes
voila mes résultats :
Active Work Units CFR_B_d3_relax
Best RMSD user 0.12
Best RMSD all users 0.1
Best Score user -128.21
Best Score all users -128.76
Active Work Units s099_1_homologymodel_strictosidine_synthase
Best RMSD user 1.69
Best RMSD all users 0.2
Best Score user -566.96
Best Score all users -599.62
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:cry: :'(
Ma première place TOUTES catégories :( ...
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désolé, j'aurais pas dû lire ce post :(
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J'ai 0.8 en best RMSD et -120 en score :)
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désolé, j'aurais pas dû lire ce post :(
Mais je ne t'en veux pas :D !!!
C'est le jeu :).
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Allé je veux la place N°3 et N°2 ; j'ai 0.73 et -510.84
EDIT: :D Merci :whistle:
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[:ousermaatre:3] bonjour à tous
best RMSD: 0,21
best score user: -582,827
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je profite du up de ce post pour mettre à jour mon score :lol:
# hombench_mtyka_foldcst_simple_foldcst_simple_t312__
0.101 0.067 -168.614 -236.796 26 25065 2008-11-08
# AA2A_20_modeling_1_AA2A_1_AA2A_2VTA_SAVE_ALL_OUT_align
4.45 3.2 -587.59 -632.84 7 139922 2008-10-29
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Itou : :whistle:
# hombench_mtyka_foldcst_boinc_test3_foldcst_simple_t312__
0.14 0.1 -226.406 -257.28 9 18091 2008-10-29
# AA2A_20_modeling_1_AA2A_1_AA2A_2VTA_SAVE_ALL_OUT_align
4.79 3.2 -551.42 -632.84 1 139922 2008-10-29
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La compétition devient rude :o
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Best score de -649.584 :D !
Best RMSD de 0.57 :o...
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Ohoh joli score (Sauf RMSD)
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Best score de -649.584 :D !
Best RMSD de 0.57 :o...
[:czame17:8] rom185
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Best RMSD : 0.093 :D
Best score User :-629.627 :o
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0.081 0.074 -233.949 -242.713 4 11257 2009-01-21
:whistle: :whistle:
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Rahhhhh !!! :D
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d'ailleurs, j'y pense ça fait quelques temps qu'on a pas vu Heyoka, des nouvelles ?
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Non.. je ne l'ai pas trop vu non plus sur le forum...
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Il a fait un bref passage sur le topic de WCG et une news sur le projet concernant le dystrophie musculaire !
J'espère bien, comme beaucoup de monde, qu'il reviendra peu à peu sur ce forum !
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Il a fait un bref passage sur le topic de WCG et une news sur le projet concernant le dystrophie musculaire !
J'espère bien, comme beaucoup de monde, qu'il reviendra peu à peu sur ce forum !
[:al@on:5]
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[:ousermaatre:3] Heyoka qui est passé en coup de vent :jap: :jap:
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0.585 0.032 -635.256 -639.762 99 85891 2009-04-29
en gras mes chiffres, alors la meilleure unité, c'est l'Alliance Francophone qui l'a prédite ?
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-635...grrr tu m'as encore dépassé !!
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:lol: :lol:
j'en fais au moins deux à trois unités par jour, ptetre ça vient de là, ou de la chance de tomber sur les bonnes unités de travail. :jap:
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Je reviendraiiii !!!!
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1ctf__BOINC_ABINITIO_IGNORE_THE_REST-MOO43--1ctf_-_10770_100 voici les unités qui rapportent en ce moment :jap:
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Best RMSD 0.038 0.038 -605.173 -606.333 99 87079 2009-04-30
et meilleur score : 3 2.292 -874.282 -876.683 68 30127 2009-04-30
Bon, ou pas bon?
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(http://forum.boinc.fr/mesimages/3285/hiphourra.gif)(http://forum.boinc.fr/mesimages/3285/hiphourra.gif)
excellent !!!!!! kyuzo
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2.798 2.798 -15.138 -84.658 115 9970 2009-04-30 :??:
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:yahoo:
Best RMSD : 0,009 (abinitio_norelax_homfrag_natfrag_129_B_5croA_SAVE_ALL_OUT)
Best score : -610,116 (ccf_fair_filt_0.5_chunk_1_8_hb_t326__)
(http://forum-images.hardware.fr/images/perso/pinhead.gif)
Même si d'après les graphiques je crois que pas mal de monde a eu les mêmes scores que moi pour ces 2 types d'unité
(http://forum.boinc-af.org/index.php?action=dlattach;topic=2318.0;attach=615)
(http://boinc.bakerlab.org/rosetta/rah_results.php?BatchID=6252&SubBatchName=abinitio_norelax_homfrag_natfrag_129_B_5croA_SAVE_ALL_OUT&UserID=7547&OrderBy=2&stdZoomX=0&stdZoomY=0&image=1)
(http://forum.boinc-af.org/index.php?action=dlattach;topic=2318.0;attach=617)
(http://boinc.bakerlab.org/rosetta/rah_results.php?BatchID=10666&SubBatchName=ccf_fair_filt_0.5_chunk_1_8_hb_t326__&UserID=7547&OrderBy=4&stdZoomX=0&stdZoomY=0&image=1)
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-696.254 (http://forum-images.hardware.fr/images/perso/cerveau%20dawak.gif) : iRp40_S_3d85_ip40_2ije.pdb.gz_00000008_fa_dock.xml_score12_pert38_DOCK
(http://forum.boinc-af.org/index.php?action=dlattach;topic=2318.0;attach=631)
(http://boinc.bakerlab.org/rosetta/rah_results.php?BatchID=11891&SubBatchName=iRp40_S_3d85_ip40_2ije.pdb.gz_00000008_fa_dock.xml_score12_pert38_DOCK&UserID=7547&OrderBy=4&stdZoomX=0&stdZoomY=0&image=1)
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Ouf, j'ai eu chaud :D
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(http://images3.hiboox.com/images/2109/2bff82a961c4ac15e4adda36c65ddca9.jpg) (http://www.hiboox.fr/go/images/informatique/recrosetta,2bff82a961c4ac15e4adda36c65ddca9.jpg.html)
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Bien joué Netrider :jap:
Tu peux me donner le score pour que je le rajoute en première page
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Best RMSD : 0.188 0.155 -256.69 -287.929 9 25052 2009-07-18
Best Score : 1.212 0.354 -889.381 -898.039 99 73902 2009-07-10
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:eek: :eek: :eek: :eek: :eek:
Ahhhh........ je vais diparaître du classement :D
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http://boinc.bakerlab.org/rosetta/rah_results.php?UserID=506
:siflotte:
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http://boinc.bakerlab.org/rosetta/rah_results.php?userid=199869
Je crois bien que j'ai réussi à faire une "meilleure prédiction" :siflotte:
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:kookoo:
la puce
tu peux voir sur le premier post de ce topic les meilleurs scores des membres.
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oui, je sais - sauf que c'est toutes UT confondues, donc on peut être amené à comparer des torchons et des serviettes. :jeboude:
mais là, visiblement, dans la première ligne mon best score correspond au best score de tous les utilisateurs :p c'est ça que je voulais dire.
et puis, de toute façon, avec mon -1057.56 je détrône largement julienh dans les meilleurs scores :p :gniak: :sun:
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et puis, de toute façon, avec mon -1057.56 je détrône largement julienh dans les meilleurs scores :p :gniak: :sun:
:hello: ma belle,
Ce post mérite effectivement un petit dépoussiérage et une actualisation des résultats...
...avec mon -1407.24 je détrône largement modesti dans les meilleurs scores :p :gniak: :sun:
:hap:
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Best RMSD user = 0.806
Best Score user = - 864.893
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ok je m'y attelle :kookoo:
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comme quoi, je devrais regarder un peu plus :miam:
30.635 3.281 -1325.58 best scores Ousermaatre :D :D
mem_widd_run01_B_2kdc_SAVE_ALL_OUT_ 17.321 best rmsd user :D 0.061
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J'attends vos scores, les amis :jap: :jap:
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Si Polynésia/Boris est 6è en RMSD avec 0.806, je suis devant lui avec 0.554 :ange:
A part ça, entre le PDLS sur eOn et le challenge sur WCG à partir du 16, Rosetta devra attendre encore un peu :p