SiDock@home ( ex-SiDock@home (test) )

[franky82]

https://fightcovid.boinc.ru/sidocktest/forum_thread.php?id=28

Veuillez noter que nous avons publié une nouvelle version de l'application 12.0 (Windows 64 bits) qui devrait résoudre les erreurs sur Windows 7.

https://fightcovid.boinc.ru/sidocktest/forum_thread.php?id=29

Chers amis, nous désactivons temporairement la génération de tâches pour Windows en raison du taux élevé d'erreurs sur les machines Windows. Cette application a besoin de plus de travail.

De plus, vous pouvez maintenant voir de nombreuses erreurs d'affilée pour tout type de système, pour des unités de travail publiées il y a plusieurs jours et pour lesquelles votre résultat n'était pas le premier. Ceci est une conséquence du changement des noms de certains fichiers dans la nouvelle version des applications. Lorsque ces unités de travail auront terminé leur cycle de vie, nous les recréerons pour une nouvelle application.

Cette erreur se produit pour les unités de travail dont la première tâche a échoué.

Peut-être avez-vous remarqué que pour Windows 7, get_fraction_done ne fonctionne pas non plus ...

Bien que ce ne soit pas un stopper.

Nous avons déplacé les «unités de travail ayant échoué» de la base de données et désactivé la génération de tâches. Un certain nombre de tâches peuvent entrer, essayez de le résoudre.
J'espère que de nouvelles tâches pour Linux seront bientôt disponibles.

Les tâches pour les ordinateurs Linux et Mac OS sont prêtes à être exécutées !

Pour ma part, je n'ai eu aucune erreur, autant sous Windows 10 que sous Linux (Ubuntu) !

[Maurice Goulois]

J'ai 7 erreurs sur win pour 63 valides, j'ai encore des uts de l'appli 11.81. A surveiller.

[franky82]

Je n'ai plus d'UT en cours sous Windows
d'ailleurs, il n'y en a vraiment plus de dispo pour Windows (pour l'instant) : https://fightcovid.boinc.ru/sidocktest/apps.php

Mise-à-jour 12h28 : les UT Windows sont, à nouveau, dispo !

[JeromeC]

Je suis embêté car comme ce projet n'est pas sous SAM et en fait j'utilise un client SSH online (vu que sur ce PC du taff je peux pas utiliser un vrai client) qui a pour particularité de pas reconnaitre la touche F9 indispensable pour ouvrir le menu dans boinctui et pouvoir contrôler le projet, et boinccmd ne collabore pas du tout du tout...

Code Sélectionner Étendre

jerome@EatAtJoe7:~$ boinccmd --project http://188.68.219.241/sidocktest/ nomorework
Operation failed: authentication error

J'avais eu le même problème pour me rattacher à sidock, obligé de passer par le fichier xml en fait...

Comment je fais pour faire "pas de nouveau travail", hein ??


PS : entre temps madame m'avait prêté son MS Surface, avec BoincTasks j'ai pu le faire
PS2 : maintenant que je suis de nouveau vraiment équipé, ça va le faire !!!

[Oncle Bob]

Je suis embêté car comme ce projet n'est pas sous SAM et en fait j'utilise un client SSH online (vu que sur ce PC du taff je peux pas utiliser un vrai client) qui a pour particularité de pas reconnaitre la touche F9 indispensable pour ouvrir le menu dans boinctui et pouvoir contrôler le projet, et boinccmd ne collabore pas du tout du tout...

Je ne sais pas depuis ni à quelle machine tu te connectes, mais tu peux faire du ssh depuis un terminal linux ou la console Windows sans passer par un logiciel tiers.

[JeromeC]

Sur mon PC du bureau (même si je suis chez moi) le SSH est bloqué (putty, client dans le terminal, etc), le proxy est féroce.

Seul moyen : depuis un site web qui lui n'est pas bloqué (sachant que pleins d'autres sites sont bloqués, mais pas celui là).

Mais bon maintenant j'ai un iMac à la maison ! et j'ai débloqué la situation via le PC de Madame...

[franky82]

https://fightcovid.boinc.ru/sidocktest/forum_thread.php?id=40#182

Bonjour à tous!

Nous sommes heureux d'annoncer la nouvelle application CurieMarieDock (cmdock). Actuellement pour Windows 64 bits et MacOS 64 bits, et d'autres plates-formes suivront. Si vous constatez des erreurs ou des effets indésirables, veuillez le signaler.

CurieMarieDock est une application d'amarrage moléculaire développée comme un fork de RxDock par les auteurs du projet de base COVID.SI: Marko Jukić, Nejc Ilc, Davor Sluga, Črtomir Podlipnik et Gašper Tomšič.

Merci à tous pour votre participation.

Pas encore d'UT disponibles : https://fightcovid.boinc.ru/sidocktest/server_status.php
[edit] Ah si, maintenant ! [/edit]

[[AF] fansyl]

Ils n'ont pas encore mis à jour le site pour pouvoir choisir les applications dans les préférences.

J'ai des RxDock et CurieDock qui tournent, <100Mo de RAM, RAS pour le moment, ça avance normalement.

[Maurice Goulois]

Moi aussi, j'ai 6 Test of CurieDock en cours.

[franky82]

Plus aucune UT pour Linux, ce matin : seule la nouvelle appli a des UT disponibles mais seulement pour Windows et Mac ! 

[edit] C'est revenu, les UT RxDock ! [/edit]

Ils n'ont pas encore mis à jour le site pour pouvoir choisir les applications dans les préférences.

C'est maintenant dispo !

[JeromeC]

DEUX APPLIS MAC !!!! \o/


Edith : ça part tout en sucette, j'ai posté.

[fzs600]

2020-12-04: progress report
https://fightcovid.boinc.ru/sidocktest/forum_thread.php?id=42&postid=213

Bonjour à tous !

Voici un aperçu du travail accompli jusqu'à présent.

Tout d'abord, nous avons connecté 48% de la base de données de ligands à la première cible, le 3CL Pro. 480 millions de petites molécules ont été testées in silico. C'est un excellent travail ! Maintenant, nous passons à la couverture de 100% de la base de données.
Le criblage virtuel est une procédure complexe qui comprend le post-traitement des résultats, dont certains sont redondants. La prochaine étape importante sera donc le traitement des résultats et l'étude du sous-espace chimique qu'ils représentent. Il est important de comprendre comment les scores d'arrimage sont divisés dans l'ensemble des données. Ensuite, notre équipe développera des règles de filtrage plus efficaces.

Deuxièmement, la prochaine cible pour l'amarrage est en cours de préparation. Au total, 59 cibles liées au SRAS-CoV-2 doivent être étudiées.

Troisièmement, le nouveau logiciel d'amarrage CurieMarieDock a été développé comme une bifurcation de RxDock. Il est optimisé et fonctionne plus rapidement. Des versions pour Windows, MacOS et Linux sont disponibles. Une version ARM est en cours de préparation.

C'est fascinant de travailler avec vous tous ! Merci de votre participation ! Passez un bon week-end.

Avec nos meilleurs vœux,
Natalia

Traduit avec www.DeepL.com/Translator (version gratuite)

[JeromeC]

Ils ont fixé les applis macOS, ça tourne maintenant

[fzs600]

Transition to production project
https://fightcovid.boinc.ru/sidocktest/forum_thread.php?id=46&postid=243

Bonjour à tous !

Au cours des prochains jours, nous prévoyons de transformer le projet de test actuel en production. Aujourd'hui, nous générons les dernières unités de travail et, une fois terminé, le projet de test sera arrêté. Le projet de production aura une autre URL et nous la publierons. Nous prévoyons également de transférer les statistiques des équipes et des participants, ainsi que les informations sur les comptes, du projet de test au projet de production.

Vous êtes tous les bienvenus pour rester avec nous sur le projet de production !

Traduit avec www.DeepL.com/Translator (version gratuite)

[JeromeC]

Ça va encore être chiant dans la gestion des stats ça...

Pour ceux qui s'en chargent

[franky82]

Si le projet s'appelle toujours SiDock@home et qu'ils récupèrent la base de données, ça ne devrait pas poser de problème, non ?

[Maurice Goulois]

Le projet s'appelle sidocktest, ça demande juste d'ajouter un nouveau projet sidock, à priori.

[franky82]

Le projet s'appelle "SiDock@home (test)" mais apparaît dans les stats comme SiDock@home...

l'URL est https://fightcovid.boinc.ru/sidocktest
mais peut-être qu'ils vont garder le NDD :
- https://fightcovid.boinc.ru/
ou
- https://fightcovid.boinc.ru/sidock (ou sidockathome )

[Maurice Goulois]

On va voir de toutes façons

Je penche pour la deuxième option, mais il y a a d'autres contraintes possibles que nous ne connaissons pas 

[Maurice Goulois]

https://fightcovid.boinc.ru/sidock/ est en ligne mais ne vous jetez pas dessus, tout n'a pas encore été mis en place; notamment les comptes utilisateurs n'ont pas encore été récupérés et il y a 0 wus à traiter 

[fzs600]

https://fightcovid.boinc.ru/sidock/ est en ligne mais ne vous jetez pas dessus, tout n'a pas encore été mis en place; notamment les comptes utilisateurs n'ont pas encore été récupérés et il y a 0 wus à traiter 

Merci pour l'info. 

Quand il sera actif je ferais les modifications nécessaire en gardant le mème topic.

[franky82]

Apparemment, ça se dirige plutôt vers http://www.sidock.si/sidock/ (plus abouti)...
mais base de données toujours pas transférée !

[Maurice Goulois]

Possible j'ai vu aussi ça sur certains liens; de toutes façons, il n'y a pas de taf, donc patience

[franky82]

J'avais raison pour le nouveau site https://www.sidock.si/sidock !
La base de données a été transférée : on peut se connecter sur le site !
Il n'y a pas encore d'UT disponibles mais ça va venir : https://www.sidock.si/sidock/server_status.php

(Les dernières UT ont été terminées, auparavant, sur le site de test https://fightcovid.boinc.ru/sidocktest/server_status.php)

Un nouveau badge est attribué pour avoir participé au projet test :
Vitamine C


Je me suis rattaché à ce "nouveau" projet : sidock...
il ne reste qu'à attendre les UT et la prise en charge adaptée par les stats 

[JeromeC]

Oui les comptes sont transférés, avec les stats, avec l'équipe l'AF, et mêmes ses messages sur le forum !

Excellent boulot !

Manque plus que le projet soit reconnu par SAM et que le joli badge soit reconnu pas StatSeb et tout sera parfait !!