Sujet: SiDock@home ( ex-SiDock@home (test) )

[fzs600]

Une nouvelle application est disponible.

29 May 2021, 10:03:21 UTC    4 Jun 2021, 10:03:21 UTC    En cours    ---    ---    ---    CurieMarieDock on BOINC + zipped input, checkpoints and progress bar v1.00
arm-unknown-linux-gnueabihf

https://www.sidock.si/sidock/apps.php

[JeromeC]

C'est un peu ridicule de créer une nouvelle appli chaque fois qu'ils changent des trucs sans rapport avec le fond scientifique de l'appli en question...

[Maeda]

Pas super propre en effet, ils ne maîtrisent pas bien leurs applications Boinc. J'espère que le fond (résultats) du projet est mieux géré...

[fzs600]

29 May 2021, 9:59:22 UTC    29 May 2021, 23:43:04 UTC    Terminé et validé    42,918.58    42,618.52    327.24    CurieMarieDock on BOINC + zipped input, checkpoints and progress bar v1.00 windows_x86_64

29 May 2021, 9:59:21 UTC    29 May 2021, 21:08:04 UTC    Terminé et validé    38,819.69    38,457.16    247.89    CurieMarieDock on BOINC + zipped input, checkpoints and progress bar v1.00 windows_x86_64

   29 May 2021, 9:59:21 UTC    30 May 2021, 3:55:35 UTC    Terminé et validé    37,427.41    37,187.14    226.73    CurieMarieDock on BOINC + zipped input, checkpoints and progress bar v1.00 windows_x86_64

[Maeda]

Tu as testé un redémarrage de machine (ou du service boinc-client) ?

[fzs600]

Tu as testé un redémarrage de machine (ou du service boinc-client) ?

Pas pensé.
Mais un simple suspendre devrait suffire.

[hydrosaure]

Les miennes tournent depuis 24h. Ca fait un peu long je trouve. Je laisse la nuit et demain j'annule si elles sont toujours en cours.

Kali.

Sur mon RPi 2 c'est arrivé au bout après 460,069 secondes.....soit environ 5 jours et 8h....
2 ont été validées et 2 en temps dépassées...

On verra avec la nouvelle appli.

[[AF] Kalianthys]

Les miennes tournent depuis 24h. Ca fait un peu long je trouve. Je laisse la nuit et demain j'annule si elles sont toujours en cours.

Kali.

Sur mon RPi 2 c'est arrivé au bout après 460,069 secondes.....soit environ 5 jours et 8h....
2 ont été validées et 2 en temps dépassées...

On verra avec la nouvelle appli.

Sur le RPi 4 ca a prit  quasiment 2 jours. Je trouve ca un peu long du coup j'ai remis le RPi 4 sur WCG qui prend prend 9h/tache.

Kali.

[fzs600]

SiDock@home is going to join Gridcoin

Bonjour à tous,

nous souhaitons être inscrits sur la liste blanche de Gridcoin (à tout moment), afin de pouvoir recevoir cette crypto-monnaie pour le calcul scientifique. Nous pensons que le Gridсoin est éthique. C'est aussi l'occasion de mieux faire connaître le projet.

https://www.sidock.si/sidock/forum_thread.php?id=131&postid=1022

[JeromeC]

Ils sont partout 

[DocPhilou1966]

Ils sont partout 

Oui, ça me gave aussi les crunchers pour le pognon 

[cougarpelardou]

Pauvre Natalia c'est pas avec cela qu'elle acheter de nouveaux serveurs ou payer un technicien ...

Plus haut historique GridCoin : Le 09/01/2018 à 0,1443 $
Plus haut 2021 Le 16/04/2021 à 0,024 $
Cours du jour : 0,00073 $

Comme avec le système madoff , les nouveaux payent pour les créateurs de la pyramide. 

[[AF] Kalianthys]

SiDock@home is going to join Gridcoin

Bonjour à tous,

nous souhaitons être inscrits sur la liste blanche de Gridcoin (à tout moment), afin de pouvoir recevoir cette crypto-monnaie pour le calcul scientifique. Nous pensons que le Gridсoin est éthique. C'est aussi l'occasion de mieux faire connaître le projet.

https://www.sidock.si/sidock/forum_thread.php?id=131&postid=1022

Ca y est c'est acté ce jour :

https://www.sidock.si/sidock/forum_thread.php?id=134

Kali.

[[AF] fansyl]

De nouvelles cibles pour les unités de calcul : https://www.sidock.si/sidock/forum_thread.php?id=140

 

[JeromeC]

Chers participants,

nous avons préparé trois nouvelles cibles pour vous ! Elles sont toutes basées sur la protéine 3CLpro, une cible de choix pour la découverte de médicaments antiviraux en raison de son implication centrale dans la réplication du virus. Une autre raison de les placer en tête de liste est que nous avons une bonne possibilité de tester des résultats intéressants en laboratoire. Les cibles 6, 7 et 8 sont des sites allostériques identifiés aux rayons X sur 3Clpro. Nous allons fabriquer un nombre limité d'unités de travail pour nous assurer que tout fonctionne bien, puis nous lancerons un criblage à grande échelle sur les nouvelles cibles. Nous interromprons temporairement le traitement de la cible 5 au profit des nouvelles cibles.

Avec nos meilleurs vœux,
Team SiDock@home

Ces cibles sont-elles déjà résolues par AlphaFold ? Comment comparer Sidock à AlphaDock ?

Le projet AlphaFold vise à prédire les formes tridimensionnelles des protéines in silico (dans un ordinateur). Les résultats peuvent être très utiles, mais il faut des informations supplémentaires pour effectuer un criblage virtuel. En particulier, il faut déterminer le site de liaison potentiel sur la surface complexe de la protéine. Nos nouvelles cibles sont de tels sites de liaison identifiés dans un article récent. Les auteurs ont étudié la protéine sous forme de cristal en utilisant les rayons X plutôt qu'in silico.

C'est vraiment bien deepl.com

[franky82]

En regardant mes UT en attente de validation, je suis tombé sur des ordis bizarres chez SETI Germany :
- 640 CPU : https://www.sidock.si/sidock/show_host_detail.php?hostid=12605
- 1024 CPU : https://www.sidock.si/sidock/show_host_detail.php?hostid=994
 
Bien sûr, ces ordis chargent un maximum d'UT et mettent très longtemps à les cruncher ! 

[cougarpelardou]

En amont des sprints, certains bunkerisent un max sur les UT de durée longue C'est ce que tu observes là je pense, les SetiGoths font cela depuis quelques temps.

Là, ils ont perdu, il fallait miser sur TnGrid

Ici un exemple sur Tn Grid  http://gene.disi.unitn.it/test/results.php?hostid=74523

Les UT sont envoyées le 8 septembre et toujours pas renvoyées. Là ils ont bien misées.

[franky82]

Dans ton exemple, l'ordi a 32 CPU, ce qui est normal pour un Ryzen 5950...
mais dans mes exemples, avec des i5 et i7, 640 et 1024 CPU, ce n'est pas normal ! C'est "un peu" exagéré !!!

[cougarpelardou]

Ils ont aussi leur outil dont il faut taire le nom chez les seti.goths
Ce que je fais en z51 sur le prono des sprints, ils le font aussi en remplissant leur garde manger pour la semaine.

Par exemple, pour le sprint un choix  Collatz était possible en GPU  et j'avais engrangé 6 jours d'UT Collante pour ma 1660  ce qui m'a rapporté 18 millions de points que j'ai lâché hier après le choix de Tn.

[JeromeC]

Ils ont aussi leur outil dont il faut taire le nom chez les seti.goths

Ils nous ont peut-être piqué "le nôtre" d'ailleurs 
(on a tendance à se l'approprier vous ne trouvez pas ?)

N'oublions pas que nous avons des teutonophiles dans l'équipe

Moi ça me dérange pas, je suis pour le brassage très poussé des cultures !! 

[modesti]

Ceux qui font du SiDock ont sûrement vu ce message dans leurs notifications:

Dear participants!

Just now, your computers are hitting three protein targets at once . Due to the low runtimes and (mainly) the friendly contributions of participants and their teams, the data is being processed fast, and we express our gratitude to all of you.
We announce a new competition between teams, SiDock@home September Sailing .

Trad:
Actuellement, vos ordinateurs visent trois cibles de protéines à la fois. Compte tenu des faibles durées et (principalement) des aimables contributions des participants et de leurs équipes, les données sont traitées rapidement et nous vous remercions tous.
Nous annonçons une nouvelle compétition entre équipes: le SiDock@home September Sailing.
Il y aura de jolis badges à la clé (voir lien du projet).

Voici le lien vers les (futures) stats du challenge: https://www.boincstats.com/stats/challenge/team/chat/1094

Si on participe massivement, on pourra se faire 2 ou 4 points FB

[Maeda]

Rétention d'UT utile dans ce cas ?

[cougarpelardou]

Je vous rejoindrai pour deux jours, ensuite je suis absent pour 8 jours.

J'ai choppé quelques UT pour après le sprint. Elles sont valides jusqu'au 18 septembre. Je vais bunkeriser un peu et relacher jeudi avant de partir.

A+

[modesti]

Rétention d'UT utile dans ce cas ?

Toujours

[cougarpelardou]

En montant le stockage et en mettant SiDock à 400% j'ai pas beaucoup d'UT. Il doit y avoir un dispositif de limittaion du stockage.