Brainstorm@home

[fzs600]

                                                                                     


                                                                                                                                                     



Infos utiles.
Pour le projet l'installation de Virtualbox est fortement recommander : https://www.virtualbox.org/
Projet de recherche sur les bases moléculaires des maladies liées au cerveau.
Projet affilier a Université Pompeu Fabra : https://www.upf.edu/



Statut : A l'arrêt
URL du projet : http://brainstormhome.org/
Application disponible : http://brainstormhome.org/apps.php
État du serveur : http://brainstormhome.org/server_status.php
L'alliance francophone : http://brainstormhome.org/team_display.php?teamid=13
Classement mondial de L'af : pas de données


Résumé.

Mis a jour par fzs600 le 28 avril 2020

[naz]

Je pense que c'est ca : https://fr.wikipedia.org/wiki/R%C3%A9cepteur_NMDA

[franky82]

Ce projet m'intéresse mais j'ai jamais réussi à finir de tâche VirtualBox ! 
et toutes les applications sont VBox / MT...

[naz]

Ce projet m'intéresse mais j'ai jamais réussi à finir de tâche VirtualBox ! 
et toutes les applications sont VBox / MT...

As-tu Java à jour?

[franky82]

Oui, je mets Java à jour régulièrement !

[franky82]

5 UT "testsim" finie en 1 mn 15 à 2 mn 15, en attente de validation...
quorum 2 - 
J'ai fait 2 tâches (2 fois) avec le même ordi mais pas validées

[toTOW]

Ca a l'air intéressant ... mais bon VitrualBox quoi ...

[Antares]

Virtualbox = Pas pour moi...

[JeromeC]

VirtualBox = pour moi !!!

Je ferai des tests dès que possible

[Ceclo]

Chez moi, sur un PC les UT ne sont même pas téléchargées, même après réinstallation Boinc et VB et sur un autre, erreur de téléchargement... Apparemment c'est un projet quelque peu capricieux!

[nafrayou]

Hello 

pas d équipe pour l AF pour le moment ?

[fzs600]

Hello 

pas d équipe pour l AF pour le moment ?

J'ai essayé mais pour le moment c'est impossible. 

[JeromeC]

C'est ce qu'on appelle un projet en "alpha test" on dirait

Tiens une jolie nimage pour le 1er post du topic :



La news de la page d'accueil date... du 05/09/2018 oO

Notre recherche :

Découverte de médicaments dans le cadre du RCPG

Profilage in-silico multirécepteurs des antipsychotiques.

L'efficacité clinique des antipsychotiques a été attribuée à une interaction complexe composée de cibles multiples (en particulier les récepteurs couplés aux protéines G, RCPG) et de mécanismes multiples (p. ex. biais de signalisation, diaphonie des récepteurs) qui déterminent ensemble un modèle distinct de signalisation cellulaire. Dans ce contexte, notre groupe se concentre sur le décryptage des mécanismes moléculaires de cette interaction complexe des antipsychotiques actuels qui sont responsables de leur efficacité clinique. Enfin, nous visons la découverte de nouvelles interventions pharmacologiques et la conception de nouvelles structures principales pour la thérapie antipsychotique.

Les dimères du RCPG comme cible médicamenteuse pour le traitement de la schizophrénie.

Des études récentes ont décrit la dimérisation des récepteurs comme un mécanisme pertinent pour la signalisation médiée par les RCPG. Nous étudions ce phénomène dans le contexte de l'action des antipsychotiques. Notre groupe apporte son soutien à la conception de ligands bivalents qui ciblent sélectivement un dimère GPCR spécifique. D'une part, de telles sondes moléculaires sont extrêmement utiles pour interroger la contribution des dimères aux états psychotiques. D'autre part, ces sondes nous permettent de valider l'utilité des dimères de RCPG comme cible médicamenteuse dans le traitement de la schizophrénie. Une fois qu'une cible est validée, nous appliquons divers outils de calcul pour obtenir d'abord de petites molécules de type médicament (à base de structure/ligand) vers cette cible.

Effets des membranes à médiation lipidique sur la signalisation GPCR.

La composition lipidique des membranes cellulaires peut moduler la fonction de protéines membranaires clés telles que les récepteurs couplés aux protéines G (RCPG). Comme plusieurs maladies ont suggéré de modifier les propriétés biophysiques pertinentes des membranes, comme la densité ou la fluidité, la compréhension du rôle de l'environnement membranaire sur la dynamique et la fonction des RCPG est devenue une priorité de recherche. Nous abordons cette question importante en étudiant les effets directs et indirects des membranes sur les monomères et les dimères des récepteurs à l'aide de configurations de simulation tout atome et à grain grossier.

Base de données sur la dynamique du RCPG.

La mission principale de ce projet est de fournir un aperçu dynamique des récepteurs cristallisés sur une plateforme accessible au public. Les principales caractéristiques comprennent le dépôt et le stockage des données de MD, les outils d'interrogation, la visualisation des MD pour les caractéristiques pertinentes ainsi que les outils d'analyse de base. Il est important de noter que la base de données est conçue pour permettre non seulement aux experts en médecine dentaire, mais aussi aux chimioinformaticiens ou aux chimistes médicinaux de parcourir et d'utiliser facilement des informations dynamiques sur les RCPG. GPCRmd sera intégré dans la base de données GPCRdb (http://gpcrdb.org/). Cette intégration facilitera le processus de popularité et accélérera le dépôt de nouvelles simulations de DM et peut apporter une contribution importante à la découverte de nouveaux médicaments pour cette importante classe cible. Plus d'informations

Notre équipe : ils sont tous super jeunes mais je vote pour Mariona

Pour l'instant le serveur status est pas délirant et aucune réponse / support sur les quelques premiers messages de crunchers rapportant des erreurs.

Ca sent bon le projet universitaire

[franky82]

Un UT "MD sim" terminée et validée ! 

Un petit message dans le Stderr output :

2019-02-08 11:46:49 (289532): Guest Log: GROMACS reminds you: "Your Bones Got a Little Machine" (Pixies)

[video]https://www.youtube.com/watch?v=CKHsSz1dAac[/video]

(et toujours pas de team AF... !? )

[JeromeC]

Y'a de gros doutes sur la signification de cette expression

Toutefois Genius est plus explicite :

What Francis is describing as a bone machine could very well be the human skeleton. Francis is imagining examining all the intricate pieces of Carol's skeleton in some cruel form of torture/revenge. He said in Select, in 1997:

The imagery is a reference to female anatomy – the pelvis as a sexual area of life. It's an area that people move and swing when they dance

It could also be a sexual reference referring to a woman's pelvis as a "bone machine", as explained in this interview for Fa Onrust (A Dutch Music Program) in 1988.

Ce que Francis décrit comme une machine à os pourrait très bien être le squelette humain. Francis s'imagine en train d'examiner tous les morceaux complexes du squelette de Carol dans une forme cruelle de torture/ vengeance. Il a dit dans Select, en 1997 :

"L'imagerie est une référence à l'anatomie féminine - le bassin en tant que zone sexuelle de la vie. C'est un endroit où les gens bougent et se balancent quand ils dansent."

Il pourrait également s'agir d'une référence sexuelle faisant référence au bassin d'une femme en tant que "machine à os", comme expliqué dans cette interview pour Fa Onrust (A Dutch Music Program) en 1988.

Tout ceci en sortie d'une tâche boinc, c'est original

[franky82]

J'ai cherché d'autres UT terminées et j'ai trouvé d'autres phrases :

GROMACS reminds you: "You Fill Me With Inertia" (The Long Blondes)

GROMACS reminds you: "Ich war schwanger, mir gings zum kotzen" (Nina Hagen)

GROMACS reminds you: "Documentation is like sex: When it's good it's great, and when it's bad it's better than nothing." (Linus Torvalds)

...

 

[GuL]

GROMACS reminds you: "You Fill Me With Inertia" (The Long Blondes)

Ça sent bon l'humour d'informaticien :

Code Sélectionner Étendre

$ apt-get moo
         (__)
         (oo)
   /------\/
  / |    ||
*  /\---/\
    ~~   ~~
...."Have you mooed today?"...
$ apt-get --help | grep 'Super Cow Powers'
                       This APT has Super Cow Powers.

[JeromeC]

J'adore la citation de Linus !!!

Et les apt-get sont pas mal non plus
Faudra que je teste sur un linux !!

[toTOW]

Ah les citations de GROMACS ... on avait ça sur FAH à une époque, mais certaines sont pas passées auprès de certains plieurs, alors ils les ont désactivées ...

[JeromeC]

J'avais pas fait gaffe à la citation de Nina Hagen :

"J'étais enceinte, j'ai commencé à vomir"

LOOOOOVE !!!!

My kind of humor !

[nafrayou]

Hello

j ai une WU en ( MT ) qui tourne avec 9 cpu's depuis 1 jour 13 heures 20 mins ....... elle n est qu a 92%  !! !! !! !! !!   

qui a déjà réussi a en finir une ?   

[fzs600]

Hello

j ai une WU en ( MT ) qui tourne avec 9 cpu's depuis 1 jour 13 heures 20 mins ....... elle n est qu a 92%  !! !! !! !! !!   

qui a déjà réussi a en finir une ?   

Moi j'en ai fini plein. 

État: Tous (52) · En cours (0) · Validation en attente (28) · Validation non concluante (0) · Valide (24) · Invalide (0) · Erreur (0)

[JeromeC]

Et ça y est maintenant les app tournent / terminent sans planter / créditent ?

Je suppose que ce projet est pas encore comptabilisé dans les diverses stats, ou si ?

[franky82]

Je suppose que ce projet est pas encore comptabilisé dans les diverses stats, ou si ?

Non, pas encore !
(et toujours pas de team AF)

[fzs600]

Je suppose que ce projet est pas encore comptabilisé dans les diverses stats, ou si ?

Non, pas encore !
(et toujours pas de team AF)

Impossible de créer une équipe quelque soit cette équipe Française étrangère ou mème martienne pour le moment.