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Auteur Sujet: [QuChemPedIA] le topic de préparation  (Lu 133264 fois)

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Hors ligne JeromeC

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Réponse #925 le: 20 June 2021 à 19:39
Très curieux, sans rien toucher à ma VM linux qui fait du QCPIA depuis quelques temps (10 threads alloués), alors même que j'avais un RAC riquiqui depuis le début (lire plus haut), soudain il se met à créditer beaucoup plus :




A quoi bon prendre la vie au sérieux, puisque de toute façon nous n’en sortirons pas vivants ? (Alphonse Allais)



Hors ligne damotbe

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Réponse #926 le: 20 June 2021 à 19:42
Je viens d'avoir le droit de relancer la ferme de calcul. Du coup, j'ai validé pas mal de calcul qui étaient en attente  :siflotte:



Hors ligne JeromeC

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Réponse #927 le: 20 June 2021 à 19:51
Ahhhhhhh :D

A quoi bon prendre la vie au sérieux, puisque de toute façon nous n’en sortirons pas vivants ? (Alphonse Allais)



Hors ligne DocPhilou1966

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Réponse #928 le: 21 June 2021 à 06:53
Vu le nombre et la taille des fichiers à traiter, on n'a pas mis en place de procédure manuelle.
On parle de centaines de millier de molécules et c'est ingérable manuellement  :/

Par contre, on a regardé quelques cas et il s'agit de cas pas assez instables pour casser dès le départ mais le résultat final est trop aléatoire. Du coup on est arrivé à : quand on ne trouve pas 2 fois le même résultat parmi 8 calculs (je trouve que c'est déjà beaucoup), on conclue qu'il s'agit d'une molécule instable. Évidemment, on commence par deux calculs, puis un 3ème s'ils ne sont pas d'accord, puis un 4ème ...
L'autre cas possible que j'ai identifié, c'est la combinaison de trop d'hôtes qui partent en erreur ou qui annule les tâches. Il se peut qu'un seul calcul est abouti, mais il ne peut pas être vérifié, il est donc éliminé à notre grand regret... C'est le comportement par défaut du serveur et je n'ai pas trouvé de moyen satisfaisant de géré ça. Il faudrait un stagiaire pour rendre ça plus robuste et propre...

Hello !  :hello:

Merci beaucoup pour tes explications  :jap:

Perso, j'ai du annuler plusieurs fois des UT's car mes machines en recevaient trop ... (je loue du temps de calcul à l'heure ...  :hyperbon:)
Du coup j'ai mis priorité '0' pour en recevoir moins.

Pour les UT's 'invalides', et il y en a pas mal si on fait le total du temps de calcul 'perdu' (pas un reproche, je n'y comprends rien)
mais qui ne correspondent pas tout à fait à la description ci-dessus.

Par exemple : https://quchempedia.univ-angers.fr/athome/workunit.php?wuid=2566198
Pourquoi envoyer une UT 7x si les 6 premiers résultats sont "mauvais" ?

J'en ai environ 75 sur la machine 2558367, et plusieurs centaines sur mes autres machines.

Est-il possible de ne plus envoyer une UT si les 2 ou 3 premiers calculs sont 'mauvais' ?
("Trop de résultats (peut être non déterministe) Trop de résultats totaux")

Cette UT https://quchempedia.univ-angers.fr/athome/workunit.php?wuid=2558367 est invalide car "Trop de résultats totaux"  :??:

Concernant les 'validation non concluantes', j'en ai regardé 1 ou 2, et idem. Elles sont parfois calculées 4x avec le résultat 'validation non concluante' mais tout de même renvoyée à quelqu'un pour un 5° calcul .... ? https://quchempedia.univ-angers.fr/athome/workunit.php?wuid=2517604 https://quchempedia.univ-angers.fr/athome/workunit.php?wuid=2566815

Est-ce qu'un maximum de 4 calculs aboutis ne suffirait pas ?

Merci beaucoup !  :jap:

 :hello:  :kookoo:
« Modifié: 21 June 2021 à 07:31 par DocPhilou1966 »

 
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Réponse #929 le: 21 June 2021 à 08:38
 :hello:

Je me suis posé beaucoup de questions pour notre projet... le logiciel serveur est livré avec 3 réglages de maximum : erreurs/total/succès
Au début, je me suis dit "Super! on va pouvoir bien régler le bouzin... ", sauf que ces 3 catégories ne sont pas très bien documentées et ne sont pas si claires. Par exemple, j'ai pu observé que les erreurs comprenaient les annulations des utilisateurs :priz2tet: Donc avec les problèmes des VM, les annulations et les erreurs classique inévitables, j'ai mis 8 et je peux déjà dire que ce n'est pas toujours suffisant... Nous perdons parfois des molécules qui ne seront jamais calculées  :priz2tet:

Pour le nombre de calcul succès, j'ai choisi 6 pour trouver un compromis pour "essayer de sauver le plus de calculs possibles". Dès que deux machines trouvent le même calcul (avec une très très grande tolérance), je valide ! Thomas, le chimiste a été très surpris de voir deux calculs ne pas donner le même résultat. 6 résultats tous différents, ça nous laisse sans voix... Ce projet, unique au monde, nous fait découvrir pleins de choses, même les erreurs de calcul. Dommage que ça ne rapporte pas de crédit pour vous remercier...

En tout cas, merci pour l'aide.
« Modifié: 21 June 2021 à 08:58 par damotbe »



Hors ligne DocPhilou1966

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Réponse #930 le: 21 June 2021 à 13:47
Merci pour ta réponse et merci pour le projet :)  :plusun:
Je veux, dans un premier temps, mon badge des 2M  :siflotte:

 
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Réponse #931 le: 03 July 2021 à 11:24
C'est quand même curieux je suis retombé à une prod minimaliste avec mes 10 threads linux qui continuent de faire le même taff... ça ne cesse de décliner jour après jour, hier j'avais 3600 crédits, j'avais dû monter à 15000 ou je sais plus combien...

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Réponse #932 le: 04 July 2021 à 13:22
oui, pareil ici. Je pense qu'on est sur une mauvaise fournée : une partie de l'univers chimique particulièrement instable  :??:



Hors ligne JeromeC

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Réponse #933 le: 04 July 2021 à 14:09
Si on dépend de l'univers chimique maintenant, on est fichus :D

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Hors ligne modesti

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Réponse #934 le: 11 July 2021 à 19:46
:hello: damotbe,

Je m'interroge sur les deux tâches qui sont en cours chez moi... Soit c'est des molécules hyper-stables, soit elles sont plantées depuis longtemps à cause des mises en veille de l'ordi. Cf. capture jointe pour les références.


Viendez chez nous, cause qu'on est les meilleur(e)s :D


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Réponse #935 le: 11 July 2021 à 20:26
:hello: damotbe,

Je m'interroge sur les deux tâches qui sont en cours chez moi... Soit c'est des molécules hyper-stables, soit elles sont plantées depuis longtemps à cause des mises en veille de l'ordi. Cf. capture jointe pour les références.

 :jap:

c'est peut-être un plantage ou une molécule qui ne veut pas converger. Je pense que tu peux annuler sans conséquence pour nous.



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Réponse #936 le: 11 July 2021 à 23:29
Merci pour ton retour, damotbe :jap: Au moins elles auront fait progresser le compteur WUprop ;)


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Réponse #937 le: 12 July 2021 à 08:53
Merci pour ton retour, damotbe :jap: Au moins elles auront fait progresser le compteur WUprop ;)

Puis pour nous elle sera classée dans les molécules problématiques.



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Réponse #938 le: 19 August 2021 à 21:40
Je crois que le serveur est en difficulté : plus accessible et les unités ne sont plus transmises  :(

Je crunche dans le silence et c'est ma joie !
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Réponse #939 le: 20 August 2021 à 06:23
Je crois que le serveur est en difficulté : plus accessible et les unités ne sont plus transmises  :(
Citer
Dear members.

For electrical checking reasons (in the whole university), the server must be shut down from tomorrow August 16th for about a week. I hope to be able to restart everything on August 23rd.

Sincerely
Benoit
En Français  :kookoo:
Citer
Chers membres.

Pour des raisons de vérification électrique (dans toute l'université), le serveur doit être arrêté à partir de demain 16 août pour environ une semaine. J'espère pouvoir tout redémarrer le 23 août.

Sincèrement
Benoit
.


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Réponse #940 le: 23 August 2021 à 10:05
 :hello:

Retour de l'électricité : c'est reparti !  :hyperbon: :hyperbon: :hyperbon:




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Réponse #941 le: 23 August 2021 à 11:35
 :bipbip:

Quand le dernier arbre sera abattu, la dernière rivière empoisonnée, le dernier poisson capturé, alors le visage pâle réalisera que l'argent ne se mange pas.

Sitting Bull



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Réponse #942 le: 23 August 2021 à 13:26
J'ai nettoyé le water-cooling de ma configuration principale ce week-end, pile-poil !

:hello:

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Réponse #943 le: 30 August 2021 à 17:13
:hello:

Viens de recevoir un MP d'un autre cruncheur pour me dire que mon ordi est un "bad host" :siflotte: (cf. PJ)
C'est vrai que les tâches ne durent que 3 secondes, mais elles ne finissent jamais en erreur de calcul et j'avoue ne pas aller sur mon compte pour connaître leur statut final (visiblement "validate error" pour toutes) :desole:
Ai-je vraiment un problème comme semble le suggérer PDW?


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Réponse #944 le: 01 September 2021 à 08:29
Oui tu as un problème, j'ai oublié de te contacter.
Parfois ça arrive après une mise à jour sous Ubuntu. ça m'a causé pas mal de tracas il y a quelques mois.  :priz2tet:

La solution proposée par un utilisateur: https://quchempedia.univ-angers.fr/athome/forum_thread.php?id=129&postid=1279
En version courte : utiliser la version du dépôt Ubuntu



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Réponse #945 le: 01 September 2021 à 09:45
Sauf que je ne suis pas sous Ubuntu mais sous Manjaro (Archlinux) :/ Et je prends toujours Boinc (et tous les autres logiciels) des dépôts - excepté pour BSF.

Je me demande si le souci ne viendrait pas plutôt de mon ordi (CM/processeur), vu les conneries qu'il peut me faire parfois. En attendant de trouver une solution, vais mettre le projet en pas de nouveau travail - snif!


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Réponse #946 le: 01 September 2021 à 20:59
Je suis presque sûr que ça vient d'une mise à jour. On a vu ce cas tellement de fois! Essaye de temps en temps quelques jobs pour voir ou installe une autre version de Boinc.



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Réponse #947 le: 01 September 2021 à 22:02
Ça devra attendre la prochaine Linux Install Party (début octobre) ;) Je demanderai au spécialiste.
C'est la rentrée - pour mes clients aussi... Pendant deux mois tu te tournes presque les pouces et en une journée t'as du taf pour une dizaine de jours, soirées et weekend inclus :D

Sinon: même si c'est du natif sous Linux, est-ce que ça peut avoir un lien avec la version de VirtualBox?


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Réponse #948 le: 02 September 2021 à 07:26
Ça devra attendre la prochaine Linux Install Party (début octobre) ;) Je demanderai au spécialiste.
C'est la rentrée - pour mes clients aussi... Pendant deux mois tu te tournes presque les pouces et en une journée t'as du taf pour une dizaine de jours, soirées et weekend inclus :D

Sinon: même si c'est du natif sous Linux, est-ce que ça peut avoir un lien avec la version de VirtualBox?

Non, je ne pense pas.
Bon courage pour le taf



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Réponse #949 le: 02 September 2021 à 09:11
:jap:


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