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Auteur Sujet: [QuChemPedIA] le topic de préparation  (Lu 133296 fois)

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Hors ligne fzs600

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Réponse #900 le: 05 June 2021 à 08:18
:hello:
Purée, j'en reviens pas.
Réussi à me créer une machine virtuelle Ubuntu (externe), me connecter, accéder aux droits 'root', installer boinc et faire tourner QuChemPedIA.
Trop content :)
J'espère que ça va fonctionner, parce que Ubuntu et moi ...  :gno:
 :hello: :kookoo:
:yaya: :yaya: :yaya:


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Hors ligne DocPhilou1966

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Réponse #901 le: 05 June 2021 à 08:32
 :hilare:

Bon, ben du coup vais en faire une deuxième.

Comment on fait pour voir l'utilisation de la RAM ?

Merci  :jap:

 
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Hors ligne [AF] Kalianthys

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Réponse #902 le: 05 June 2021 à 08:58
Ma VM Ubunto a 6 cœurs et 3 Go de RAM. Je fait 6 tâches simultanément qui se termine sans erreur.

Kali





Hors ligne Oncle Bob

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Réponse #903 le: 05 June 2021 à 09:36
:hilare:

Bon, ben du coup vais en faire une deuxième.

Comment on fait pour voir l'utilisation de la RAM ?

Merci  :jap:

Sous linux ? htop (ou top si htop n'est pas installé).

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Hors ligne [AF] Kalianthys

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Réponse #904 le: 05 June 2021 à 09:54
j'installe toujours htop sur un serveur ubuntu. C'est utile pour voir le travail de chaque Coeur/Thread et surtout la conso de RAM.

Kali.





Hors ligne fzs600

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Réponse #905 le: 05 June 2021 à 10:00
:hilare:

Bon, ben du coup vais en faire une deuxième.

Comment on fait pour voir l'utilisation de la RAM ?

Merci  :jap:

Sous linux ? htop (ou top si htop n'est pas installé).
Sous Ubuntu : le moniteur système pour un meilleur visuel.
Déjà installer part défaut.
https://websetnet.net/fr/comment-utiliser-le-gestionnaire-de-t%C3%A2ches-%C3%A0-Ubuntu/


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Hors ligne DocPhilou1966

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Réponse #906 le: 05 June 2021 à 10:09
Merci à vous !

Du coup l'énorme différence de conso RAM entre W10 et Ubuntu c'est la VM ?

Merci !

 
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Hors ligne DocPhilou1966

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Réponse #907 le: 05 June 2021 à 10:23
Bon, ben juste pour dire suis content de participer un peu plus à ce projet.
Bon week-end ! Et merci pour vos coups de main !
 :hello: :kookoo:

 
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Hors ligne fredjke

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Réponse #908 le: 05 June 2021 à 12:08
Bonjour,

Apparemment il faut un code d'invitation pour rejoindre le projet. Est-ce qu'il circule ? Comment l'obtenir ?

Merci



Hors ligne [AF] Kalianthys

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Réponse #909 le: 05 June 2021 à 12:16
Bonjour,

Apparemment il faut un code d'invitation pour rejoindre le projet. Est-ce qu'il circule ? Comment l'obtenir ?

Merci

Tu as le code en page d'accueil sur le site internet du projet :

Invitation code : 3VwMu3-eTCg32

Cordialement,
Kali.





Hors ligne JeromeC

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Réponse #910 le: 05 June 2021 à 20:33
Du coup l'énorme différence de conso RAM entre W10 et Ubuntu c'est la VM ?
Ben oui of course, les inconvénients des tâches à VM-VB elles sont pour le cruncher (ressources, instabilité avec les "VM not manageable"...) et les avantages sont (en principe) pour le dev qui peut faire une appli multi-plateforme plus facilement, la preuve en est que QCPIA avait sortit très rapidement des applis pour les 3 plateforme, et après avoir sorti une appli linux native ben tout s'est arrêté faute de ressources humaines : faut des dev avec des compétences sur chaque OS pour faire une appli native dans chaque OS, beaucoup moins pour une appli VM-VB.

A quoi bon prendre la vie au sérieux, puisque de toute façon nous n’en sortirons pas vivants ? (Alphonse Allais)



Hors ligne damotbe

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Réponse #911 le: 05 June 2021 à 20:39
Ben oui of course, les inconvénients des tâches à VM-VB elles sont pour le cruncher (ressources, instabilité avec les "VM not manageable"...) et les avantages sont (en principe) pour le dev qui peut faire une appli multi-plateforme plus facilement, la preuve en est que QCPIA avait sortit très rapidement des applis pour les 3 plateforme, et après avoir sorti une appli linux native ben tout s'est arrêté faute de ressources humaines : faut des dev avec des compétences sur chaque OS pour faire une appli native dans chaque OS, beaucoup moins pour une appli VM-VB.

C'est un très bon résumé. Merci.



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Réponse #912 le: 06 June 2021 à 09:28
Merci pour vos explications !  :jap:

 
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Hors ligne fredjke

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Réponse #913 le: 06 June 2021 à 10:01
Merci!



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Réponse #914 le: 06 June 2021 à 11:20
Ben oui of course, les inconvénients des tâches à VM-VB elles sont pour le cruncher (ressources, instabilité avec les "VM not manageable"...) et les avantages sont (en principe) pour le dev qui peut faire une appli multi-plateforme plus facilement, la preuve en est que QCPIA avait sortit très rapidement des applis pour les 3 plateforme, et après avoir sorti une appli linux native ben tout s'est arrêté faute de ressources humaines : faut des dev avec des compétences sur chaque OS pour faire une appli native dans chaque OS, beaucoup moins pour une appli VM-VB.

C'est un très bon résumé. Merci.

Vous me donnez envie de monter une crunchbox Linux Only  :siflotte: :miam:
Ptêt bien pendant l'été  :coffeetime:

 
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Réponse #915 le: 10 June 2021 à 07:36
Hello !  :hello:

Désolé si cette question a déjà été posée, mais qu'advient-il des UT en statut  'Validation non concluante (984)' ?

Merci  :jap:

 
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Hors ligne JeromeC

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Réponse #916 le: 10 June 2021 à 17:29
A. DTC
B. ça dépend des fois
C. ça dépend des autres
D. la réponse D

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Réponse #917 le: 11 June 2021 à 06:29
A. DTC
B. ça dépend des fois
C. ça dépend des autres
D. la réponse D
KAMOULOX !
J'ai gagné m'sieur ?
Où y'a Tina Turner en opposition qui se rase la langue ?
Mon métier ? j'veux gagner de l'or en barre parce que le code de l'aviation civile interdit à un pancake de tomber d'un avion !
 :D

Non mais à part ça, sérieux ?

L'UT n'est pas envoyée à un autre cruncher, du coup c'est validé 'manuellement' ?

 :hello: :kookoo:

 
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Hors ligne JeromeC

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Réponse #918 le: 11 June 2021 à 09:35
Il y avait 2 réponses sérieuses dans ma liste, le B et la C :

B. peut-être une variabilité en fonction des résultats du calcul, qui ne serait validé "qu'après étude" ? (d'un algo, d'un humain... ?)
C. que dit l'UT ? quid des calculs faits par les autres crunchers ? le serveur attend ptet un "meilleur" résultat et si jamais on lui renvoie, le tien est mort ? si personne ne le trouve, tout le monde est mort ?

ou un mix des deux...

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Hors ligne damotbe

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Réponse #919 le: 18 June 2021 à 10:20
Vu le nombre et la taille des fichiers à traiter, on n'a pas mis en place de procédure manuelle.
On parle de centaines de millier de molécules et c'est ingérable manuellement  :/

Par contre, on a regardé quelques cas et il s'agit de cas pas assez instables pour casser dès le départ mais le résultat final est trop aléatoire. Du coup on est arrivé à : quand on ne trouve pas 2 fois le même résultat parmi 8 calculs (je trouve que c'est déjà beaucoup), on conclue qu'il s'agit d'une molécule instable. Évidemment, on commence par deux calculs, puis un 3ème s'ils ne sont pas d'accord, puis un 4ème ...
L'autre cas possible que j'ai identifié, c'est la combinaison de trop d'hôtes qui partent en erreur ou qui annule les tâches. Il se peut qu'un seul calcul est abouti, mais il ne peut pas être vérifié, il est donc éliminé à notre grand regret... C'est le comportement par défaut du serveur et je n'ai pas trouvé de moyen satisfaisant de géré ça. Il faudrait un stagiaire pour rendre ça plus robuste et propre...



Hors ligne JeromeC

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Réponse #920 le: 18 June 2021 à 18:18
La recherche sans stagiaire, c'est la mouise :siflotte:

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Réponse #921 le: 19 June 2021 à 08:43
Pour le moment, toute mes unités partent en erreurs, il y a quelque chose à faire pour pallier au soucis ?



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Réponse #922 le: 19 June 2021 à 09:16
Pour le moment, toute mes unités partent en erreurs, il y a quelque chose à faire pour pallier au soucis ?

dans tes fichiers je peux voir :
VBoxManage.exe: error: Not in a hypervisor partition (HVP=0) (VERR_NEM_NOT_AVAILABLE).
VBoxManage.exe: error: AMD-V is disabled in the BIOS (or by the host OS) (VERR_SVM_DISABLED)
VBoxManage.exe: error: Details: code E_FAIL (0x80004005), component ConsoleWrap, interface IConsole

je conseille d'installer une VM Linux et de mettre boinc à l'intérieur. Ainsi, ça utilisera l'application native Linux et franchement ça marche mieux que le wrapper Boinc Vbox.



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Réponse #923 le: 19 June 2021 à 09:49
Merci, je vais tenter ça. Le AMD-V doit être activé dans le bios apparemment ? Il refuse même pour l'installation de la VM avec le oracle VM virtualbox installé en même temps que Boinc



Hors ligne Oncle Bob

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Réponse #924 le: 19 June 2021 à 11:48
AMD-V c'est pour justement faire de la virtualisation.

Donc ouais, active le :o

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