Auteur Sujet: [WCG] Smash Childhood Cancer (Lu 19460 fois)

[AF] fansyl · **le:** 27 January 2017 à 09:50

Nouveau projet sur les cancers infantiles

Lien du projet sur le site de WCG: https://www.worldcommunitygrid.org/research/scc1/overview.do

Traduction du résumé du projet:

Citer

La plupart des recherches sur le cancer se concentre sur les cancers qui touchent principalement les adultes. Voilà pourquoi les bénévoles du World Community Grid aident une équipe de recherche internationale à trouver de nouveaux traitements pour les cancers infantiles les plus courants.

Contexte
Chaque année, environ 300 000 enfants reçoivent un diagnostic de cancer et environ 80.000 meurent d'un cancer. En 2009, le World Community Grid a rejoint la bataille pour améliorer ces statistiques sinistres en soutenant le projet Help Fight Childhood Cancer. Cet effort de recherche a aidé les scientifiques à découvrir plusieurs traitements potentiels pour le neuroblastome, l'un des cancers les plus courants qui affectent les nourrissons et les jeunes enfants. Maintenant, les mêmes scientifiques élargissent leur équipe et la recherche pour trouver des médicaments candidats pour d'autres types de cancers infantiles avec le projet Smash Childhood Cancer.

Problème
Au cours des 20 dernières années, seul un petit nombre de nouveaux médicaments destinés à traiter le cancer de l'enfance ont été approuvés par la Food and Drug Administration des États-Unis. La moitié des traitements de chimiothérapie utilisés pour les enfants atteints de cancer existent depuis 25 ans ou plus.

Les membres de l'équipe de recherche Smash Childhood Cancer ont identifié des protéines et d'autres molécules qui jouent un rôle clé dans certains cancers de l'enfant. Le défi est maintenant de trouver des candidats chimiques qui ciblent spécifiquement ces molécules clés et donc contrôlent les cellules cancéreuses. Cependant, trouver ces médicaments candidats parmi des millions de possibilités est un processus coûteux et difficile.

Solution proposée
Une recherche à cette échelle est possible uniquement avec l'aide de bénévoles du World Community Grid. L'efficacité de ces composés chimiques peut être testé en millions d'expériences de chimie virtuelles, chacune réalisée sur les ordinateurs ou les appareils Android des bénévoles.

Ces calculs vont identifier les molécules supérieures qui sont susceptibles de contrôler chacune des molécules cibles qui se trouvent dans les cellules cancéreuses. Les tests de laboratoire permettront ensuite de sélectionner les meilleurs composés parmi les candidats identifiés pour poursuivre la recherche et le développement de médicaments.

En plus du neuroblastome, les scientifiques sont d'abord intéressés par le développement de traitements pour les tumeurs de Wilms (des tumeurs malignes dans les reins), hépatoblastome (cancer du foie), les tumeurs des cellules germinales, et l'ostéosarcome (cancer des os).

Ensuite, les médicaments candidats identifiés à travers les projets du World Community Grid passent généralement par le biais d'un processus de développement étendu pour être transformé en traitements. Par exemple, les chercheurs peuvent avoir besoin de modifier les molécules afin de les rendre plus puissantes, d'éliminer la toxicité, et les rendre plus faciles à administrer. Nous espérons que ce projet permettra à cette équipe de recherche et d'autres scientifiques d'atteindre ce stade de développement plus rapidement, pour finalement atteindre le but ultime: guérir ces cancers infantiles.

Comme tous les autres partenaires de recherche World Community Grid, l'équipe du Smash Childhood Cancer est engagé à publier toutes leurs données au public le plus rapidement possible, afin que les autres scientifiques puissent contribuer à faire avancer le développement de certains des composés prometteurs identifiés dans de nouveaux médicaments.

Les badges sont les suivants:

Le projet ne semble pas nécessiter d'instructions CPU particulières.
Le nom des UTs (SSC1) indiquerait peut-être qu'une 2ème phase est possible.

Une vidéo grand public du projet à diffuser pour recruter des volontaires:

L'écran de veille est le suivant:

Bon crunch et bonne chasse à tous !

[AF] fansyl · **Réponse #1 le:** 27 January 2017 à 14:03

1ère UTs calculées en 2h30-3h sur un i7-3770T

PhilTheNet · **Réponse #2 le:** 27 January 2017 à 14:22

macMini i7 1,18 / 1,18    42,0 / 0,0
macMini i7 1,42 / 1,42    50,7 / 0,0
Q8200 3,24 / 3,51    81,9 / 0,0
i7-47140HQ 2,72 / 2,72    70,5 / 0,0

Maeda · **Réponse #3 le:** 29 January 2017 à 20:14

Cool de la nouveauté !
J'en ai déjà fait quelques unes, la plus rapide étant en un peu moins d'une heure.

foo_fight · **Réponse #4 le:** 30 January 2017 à 22:27

Pour moi :
environ 1H05 sur un i7 4930k@4GHz (IvyBridge)
entre 1H45 et 2H20 sur un Xeon E5 2696V3@2,2GHz (Haswell)

[AF] fansyl · **Réponse #5 le:** 16 March 2017 à 20:00

Pour les chasseurs de badges, la page de projet indique qu'il est déjà à 60% et qu'il se terminerai en avril.... une autre source (http://s137.photobucket.com/user/Sekerob/media/Daily/WCGYearsPi1Project.png.html) indique 6% et 1.9 années restantes.

Je n'ai pas d'avis sur la fiabilité des sources, dans le doute, j'essaye d'attraper le saphir.

Xe120 · **Réponse #6 le:** 16 March 2017 à 20:48

D'après une autre source, un type qui fait ses prédictions ça serait dans ces eaux là aussi.

https://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread?thread=39475&lastpage=yes#lastpost

J'ai aussi lu des gens qui disent sur le forum WCG qu'ils n'auraient pas balancer une nouvelle vague d'UT beta android pour corriger l'application mobile si le projet serait si court et qu'il sera surement alimenté en travail et que la barre de progression va diminuer une fois que ce sera fait.

Crunchons et voyons.

[AF] fansyl · **Réponse #7 le:** 16 March 2017 à 21:42

Oui j'ai lu pour la Beta sous Android, ce qui confirme que rien n'est sûr !

[AF] fansyl · **Réponse #8 le:** 31 May 2017 à 19:59

Le projet est donné à 90% complété avec une date de fin pour ce mois de juin, avis aux chasseurs de badges !

[AF] fansyl · **Réponse #9 le:** 13 June 2017 à 19:45

Actuellement ce projet est donné à 99% accompli avec une Estimation Complete Date (ECD) au 15 juin mais une nouvelle est arrivée sur le forum WCG pour ce projet: https://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewpostinthread?post=544623

Une traduction rapide:
Les chercheurs d'Open Zika ont récemment construit une bibliothèque propre avec 30 millions de ligands (composés pharmaceutiques candidats) pour une utilisation dans leur recherche de médicaments. Ils ont bien voulu offrir cette bibliothèque au projet Smash Childhood Cancer. Cela augmentera le nombre de candidats aux médicaments que le projet Smash Childhood Cancer va évaluer d'un facteur dix. Je suis en train de transférer ces données, ce qui devrait être terminé dans un jour ou deux. Ils construiront ensuite de nouvelles unités de travail pour utiliser ces ligands supplémentaires. Il pourrait y avoir une pause de quelques jours alors que tout cela se produit, mais il devrait y avoir beaucoup plus de travail pour le projet sur les cibles actuelles et toutes les nouvelles cibles si tout se passe bien.

Une bonne nouvelle pour les chasseurs de badges que nous sommes, moi le premier !

Maeda · **Réponse #10 le:** 13 June 2017 à 22:03

Bonne nouvelle ! Ça signifie que ça continue, ce n'est pas une phase 2 ?

mamouth · **Réponse #11 le:** 14 June 2017 à 11:20

Citation de: Maeda le 13 June 2017 à 22:03

Bonne nouvelle ! Ça signifie que ça continue, ce n'est pas une phase 2 ?

ça continue sur le même projet

mais on risque d'avoir une interruption dans la distribution des UT le temps que tout se mette en place

SHURAL · **Réponse #12 le:** 14 June 2017 à 16:13

moi j'ai l'impression qu'il y a des nouvelle wus , je surveille le pc a distance et la je vois avec horreur !

toutes les WUs partent en vrille ! ( validation peu concluante )

le bleme ce que je peu rien faire je suis au boulot !

quelqu'un aurait des infos ?

[AF] fansyl · **Réponse #13 le:** 14 June 2017 à 16:24

RAS de mon côté pour le moment, mais je n'ai peut-être pas touché de nouvelles UTs...

Maeda · **Réponse #14 le:** 14 June 2017 à 20:58

La dernière que j'ai faite date d'hier, et est valide. À quoi vois-tu que c'est une nouvelle ?

[AF] fansyl · **Réponse #15 le:** 15 June 2017 à 19:50

Plus d'UTs depuis 13h aujourd'hui, seulement du re-send sur certains UTs.
Pas d'engagement sur la reprise.

En V.O: https://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewpostinthread?post=544741

SHURAL · **Réponse #16 le:** 16 June 2017 à 09:44

j'en ai reçu entre hier soir et ce matin plus de 300 UT à traité . ( je sais c'est beaucoup ) mais l'autre projet seti à l’arrêt ce qui fait que WCG a pris plein de WUs en réserve.( comme il est prioritaire )

d’après ce que je vois ( en direct ) 16/20 WUs sont traitées par heure , donc ça devrais être vite terminé ces 300 WUs

[AF] fansyl · **Réponse #17 le:** 16 June 2017 à 09:55

Perso, je n'arrive plus à en récupérer... pas rave, ça fera une pause, avec cette chaleur, ce n'est pas gênant.

SHURAL · **Réponse #18 le:** 16 June 2017 à 11:27

je viens de regarde WUs envoyé ,WUs réceptionné ......

au fil qu'il les envois , il en récupère des nouvelles !

ce qui fait qu'il y en a toujours autan ( 300 en stock ) ( 19 page de WUs à traité ! )

je vérifierai ce soir pourquoi autan de WUs .

pas le contrôle ,sur les WUs du travail .

je m’inquiète pas , elles seront toutes traitées !

un truc si tu reçois pas de WUs , coupe complétement boinc ( vérifis qu'il reste rien en mémoire ) et redémarre le client boinc monte le cache 2 ,( pas le 1 ça influencera pas ) et force mise à jour de WCG , tu as plus de chance d'en récupéré quelque une ! ( voir le cache complet du 2 ! met pas trop au cas ou ( 0.5 jours voir 1 jours max ))

j'ai déjà fait sur seti ça fonctionne très bien !

[AF] fansyl · **Réponse #19 le:** 16 June 2017 à 21:25

J'ai HSTB en 2ème projet WCG, du coup j'arrive à empiler un peu d'UT. Au pire, j'ai TN-Grid en projet de secours.

Je suis passé de 55 pages ce matin à 49 ce soir (certaines machines ne crunchent pas aux heures chaudes pour éviter trop de stress) j'avais bien augmenté mes caches

[AF] fansyl · **Réponse #20 le:** 22 June 2017 à 11:37

Toutes mes UTs sont renvoyées, il m'en reste 2 en attente de validation.
Selon WUProp, 497 UTs ont été crunchées ces dernières 24h, le projet est bien en pause.

J'essayerai de signaler ici même quand il reprendra.

SHURAL · **Réponse #21 le:** 22 June 2017 à 12:53

je confirme j'en reçois plus .

je suis passe sur ZIKA ( la il y en a )

[AF] fansyl · **Réponse #22 le:** 06 July 2017 à 22:45

Le projet repart: https://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewpostinthread?post=545911

[AF] fansyl · **Réponse #23 le:** 08 July 2017 à 16:18

Fausse alerte, le projet est de nouveau à sec... wait&see

SHURAL · **Réponse #24 le:** 14 July 2017 à 09:57

je viens de voir mon cache est plein ( plus d'une 100 aine )

il y en aurai de nouveau apparemment !