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Auteur Sujet: XANSONS for COD a traduire  (Lu 3343 fois)

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le: 11 November 2016 à 19:47
Est-ce possible de traduire tous ces textes ?
http://xansons4cod.com/xansons4cod/
Merci.  :jap: :jap:

About XANSONS for COD.
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XANSONS for COD is a research project aimed to create an open access database of simulated x-ray and neutron powder diffraction patterns for nanocrystalline phase of the materials presented in the Crystallography Open Database (COD). You can participate by downloading and running a free program on your computer.

This project is under heavy developement and will be re-launched when ready (approximately at the end of 2017). All the results obtained before the re-launch will likely be lost.

This project uses original open source (GPLv3 license) software XaNSoNS (X-ray and Neutron Scattering on Nanoscale Structures) to simulate the diffraction patterns on CPU and GPU.

XANSONS for COD is a privately managed BOINC project supported by the Russian Foundation for Basic Research (project RFBR #15-07-07901-a).

Scientific Problem.
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The conventional technique used to recover the structural properties of the crystalline samples by their powder diffraction pattern is the Rietveld refinement method. In this method, the theoretical powder diffraction pattern refined until it fits the experimental one. The computation of the angles and intensities of the Bragg peaks can be made almost instantaneously in the approximation of the infinite size of the crystallite. To adjust for the finite size of the crystallites in the samples or finite resolution of the measurement device, these peaks are broadened artificially with the broadening function (usually Gaussian). This artificial broadening works great until the size of the crystallite in the sample is something below few tens of nanometers. For the such small crystallites, it is very hard to get the right broadening function which works fine for all Bragg peaks. Fortunately, for the such small crystallites, it is not a problem to calculate the powder diffraction patterns using the Debye equation (with the distance-histogram approximation, such as that proposed by Marcin Wojdyr and implemented in his Debyer code). This project is aimed to calculate the x-ray and neutron powder diffraction patterns for the nanocrystallites with the size varying from 6 nm to 21 nm for the most of the entries of the Crystallography Open Database. The obtained database may simplify the diagnostics of the nanocrystalline samples and complement the Full Profile Search Match method in the crystallite size analysis of the nanocrystalline samples.

In addition to the above, the calculation of the powder diffraction pattern using the Debye equation allows to account the lattice defects such as site vacancies, atom replacements and displacements. So, if the Crystallography Information File (CIF) for the given structure provides the site occupancy numbers and atomic displacement parameters, the application will use them to calculate the diffraction pattern.

System Requirements.
Citer
Supported operating systems:

    Windows 7 SP1 64-bit and above. Visual C++ Redistributable Packages for Visual Studio 2013 are required (64-bit version).
    OS X 10.9.5 and above (including macOS).
    64-bit Linux with kernel 3.16 and above.

Supported GPUs:

    Nvidia GPU with CUDA Compute Capability 1.3 and above (Windows, Linux) or 2.0 and above (OS X/macOS) with at least 1GB of memory (GDDR5 memory is recommended). Driver version 340.21 and above (Windows, Linux) or CUDA Driver for MAC version 7.0.29 and above (OS X/macOS).
    AMD GPU with OpenCL 1.2+ support with at least 1GB of memory (GDDR5 memory is recommended) including the integrated ones.
    Intel GPU with OpenCL 1.2+ support (HD graphics 5xxx/5xx and above or Intel Iris are highly recommended, see Important Notes below).


Important Notes.
Citer
    Some antivirus software may place the executables into quarantine as unknown (and therefore suspicious) files. To prevent this from happening, disable blocking of unknown files in the antivirus preferences (e.g. in Avast disable CyberCapture feature). When BOINC client will download the executables, you can manually scan the BOINC data directory (C:\ProgramData\BOINC\ by default) for viruses. After that, the disabled antivirus functionality may be re-enabled again.

    The task progress displaying in the BOINC manager is incorrect for now. This will be fixed by the time of the release. The tasks vary greatly by the computational time. Some tasks can be completed within a second but some require about 10 minutes to complete even on the modern CPU.

    The algorithm which solves the problem on GPU requires high memory bandwidth and high memory read/write performance. It uses 64-bit integer atomic functions on Nvidia and AMD GPUs and emulates them on Intel GPUs. Therefore, for the tasks of this project, the GPUs with GDDR3 memory perform significantly slower than the GPUs with GDDR5 memory. For the integrated Intel GPU below 8th generation (HD graphics 4xxx or older) the performance may be even slower than for the CPU. If you'll notice the very slow GPU performance, disable it in project preferences in your account page.


Utilisateur GNU-LINUX. fzs600@hub.g3l.org


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Réponse #1 le: 11 November 2016 à 20:05
Je vais voir ce que je peux faire :p

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Réponse #2 le: 11 November 2016 à 21:07
Et de un !
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XANSONS [ça semble être un logiciel qui simule des rayons-x et des neutrons] pour BLC (Base de données Libre de Crystallography) est un projet de recherche dont le but est de créer une base de données en libre accès de schéma diffraction de poudre (diffraction aux rayons X et diffraction de neutrons) de la phase nanocristalline des matériaux présentés dans le BLC [COD en anglais]. Vous pouvez participer en téléchargeant et exécutant un programme [logiciel/application] gratuit sur votre ordinateur.
Ce projet est en cours de développement intense et sera relancé  une fois prêt (vers fin 2017). Tous les résultats obtenus avant le relancement  seront probablement perdus.
Ce projet utilise la version originale du logiciel open source [« code source ouvert »] (sous licence GPLv3) XaNSoNS (Dispersion des Rayons X et Neutrons sur des structures nanométriques [je sais pas pourquoi on passe de diffraction à dispersion]) pour simuler les schémas de diffractions sur processeur (CPU) et carte graphique (GPU).
XANSONS pour COD est un projet privé BOINC dirigé et supporté par la Fondation Russe pour la Recherche Fondamentale (projet RFBR #15-07-07901-a).

[ ] = Ndt
« Modifié: 11 November 2016 à 23:44 par [AF>Libristes] Kao »

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Réponse #3 le: 11 November 2016 à 22:27
Le problème scientifique c'était vraiment pas un cadeau ! C'est vraiment très très technique tout ce projet.

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La technique conventionnelle utilisée pour retrouver les propriétés structurelles des échantillons cristallins par les schémas de leur diffraction de poudre est nommé la méthode <de raffinement [en français c’est juste méthode de Rietveld]> de Rietveld. Dans cette méthode, le schéma théorique de la diffraction de poudre (je suis pas sûr de la suite) est raffiné/affiné jusqu’à ce qu’il corresponde au schéma expérimental. [d’ailleurs plutôt que schéma ça serait peut-être figure de diffraction] Le calcul des angles et de l’intensité des pics de Bragg peuvent être fait pratiquement instantanément dans l’approximation de la taille infinie [infinie je ne sais pas pourquoi du tout] de la cristallite [les cristaux sont généralement composés de plusieurs monocristaux : les cristallites]. Pour ajuster la taille « finie » des cristallites dans les échantillons ou la résolution « finie » de l’outil de mesure, ces pick sont élargis artificiellement avec la fonction d’élargissement (habituellement Gaussienne). Cet élargissement artificiel fonctionne bien tant que la taille de la cristallite dans l’échantillon est supérieure à une dizaine de nanomètres [j’ai failli faire un contresens xD]. Pour des cristallites aussi petites [inférieures à 10 nanomètres], il est très compliqué d’obtenir la bonne fonction d’élargissement qui fonctionne correctement avec tous les pics de Bragg. Heureusement, pour de si petites cristallites, il n’est pas problématique de calculer la figure de diffraction de poudre [j’ai adopté figure au final à la place de schéma ici, vous me direz ce qui colle le mieux pour vous] en utilisant l’équation de Debye (avec l’approximation distance-histogramme [là j’ai rien trouvé à ce sujet], comme proposé par Marcin Wodjyr et implémenté dans son code de Debyer). Ce projet a pour but de calculer les figures de diffraction de poudre (diffraction aux rayons X et diffraction de neutron) pour des nanocristallites avec une taille variant de 6 à 21 nanomètres pour la majorité des entrées de la Base de données Libre de Cristallographie. La base de données obtenue devrait simplifier l’étude d’échantillons nanocristallins et compléter la méthode de Profil Complet de Recherche par Correspondance [je suis pas sûr] dans l’analyse de la taille des cristallites des échantillons nanocristallins.
En plus de cela, le calcul de figure de diffraction utilisant l’équation de Debye permet de prendre en compte les défauts du réseau [un réseau mais pas informatique, plus comme un treillis] tels que des vides, et des remplacements et déplacements d’atomes. Donc, si le Fichier d’Information Cristallographique (CIF) pour une structure donnée procure les paramètres de taux d’occupation et de déplacements atomiques, l’application les utilisera pour calculer la figure de diffraction.

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Réponse #4 le: 11 November 2016 à 22:38
La suite la voilà :
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Systèmes d’exploitation supportés :
-   Windows 7 SP1 64-bit et ultérieurs. "Visual C++ Redistributable Packages for Visual Studio 2013" (version 64-bit) [je traduis pas, ça se trouve plus facilement comme ça sur internet] est requis.
-   OS X 10.9.5 et ultérieurs (inclue macOS).
-   Linux 64-bit avec kernel(noyau) 3.16 et ultérieurs.
Cartes graphiques supportées :
-   Cartes Nvidia compatible avec CUDA 1.3 et ultérieur (Windows et Linux) ou 2.0 et ultérieur (OS X/macOS) avec au moins 1GB de mémoire (la mémoire de type GDDR5 est recommandée). Pilotes 340.21 et ultérieurs (Windows et Linux) ou pilote CUDA pour MAC 7.0.29 et ultérieurs (OS X/macOS).
-   Cartes AMD avec OpenCL 1.2+ et au moins 1GB de mémoire (la mémoire de type GDDR5 est recommandée incluant les <cartes> intégrées.
-   Intel GPU avec OpenCL 1.2+ (HD graphics 5xxx/5xx et ultérieurs ou Intel Iris sont hautement recommandées, voir les notes importantes plus bas).

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Réponse #5 le: 11 November 2016 à 22:58
Fin !!!
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Certains antivirus sont susceptibles de placer les exécutables en quarantaine en tant que fichiers inconnus (et donc potentiellement malveillants selon l'antivirus). Pour empêcher cela, désactiver le blocage des fichiers inconnus dans les préférences de l'antivirus ( dans Avast, désactiver l'agent web). Quand le client BOINC téléchargera les éxécutables, vous pourrez manuellement scanner le dossier BOINC data (C:\ProgramData\BOINC\ par défaut pour Windows). Après quoi, le service antivirus désactivé pour être réactivé.
L'avancement de tâches affichées par BOINC est actuellement incorrect. Cela sera fixé lors du déploiement. Les tâches varient beaucoup au niveau du temps de calcul. Certaines sont complétées en moins d'une seconde et d'autres prennent autour de 10 minutes même sur des processeurs récents.
L'algorithme qui résous le problème (donc qui calcule) depuis les cartes graphiques  requiert une grande bande passante et de grandes performances de lectures/écritures mémoire. Cela utilise des fonctions atomiques entières 64-bit sur les cartes graphiques Nvidia et AMD et les émules sur les cartes Intel. Donc, pour les tâches de ce projet, les cartes avec une mémoire GDDR3 auront des performances significativement moindres en comparaison aux cartes avec une mémoire GDDR5. Pour les graphiques intégrés Intel inférieures à la 8ème génération (HD graphics 4xxx or older) [Donc en réalité c'est plutôt inférieure à la 7ème génération si je ne me trompe pas) les performances pourraient être inférieures à celle du processeur [donc en gros perte de temps, ne prenez pas les projets intel GPU dans ce cas-là]. Si vous remarquez des performances médiocres avec la carte graphique, désactivez la dans les préférences du projets sur la page de votre compte.

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Hors ligne Xe120

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Réponse #6 le: 11 November 2016 à 23:33
le Recherche Basique [ ? je sais pas du tout ce qu’est la recherche basique] (projet RFBR #15-07-07901-a).

La recherche fondamentale.  :kookoo:




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Réponse #7 le: 11 November 2016 à 23:43
Merci une nouvelle fois Xe120 xD. Je vais éditer ça tout de suite :P

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Hors ligne JeromeC

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Réponse #8 le: 13 November 2016 à 01:22
:jap: :jap: :jap:

A quoi bon prendre la vie au sérieux, puisque de toute façon nous n’en sortirons pas vivants ? (Alphonse Allais)



Hors ligne [AF>Amis des Lapins] Jean-Luc

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Réponse #9 le: 13 November 2016 à 10:16
Merci à vous.



Rédacteur d'un article sur BOINC, adresse :
http://www.astrocaw.eu/?p=605
Créateur d'un site actif de recherche sur les suites aliquotes :
http://www.aliquotes.com/


Hors ligne [AF>Libristes>Jip] Elgrande71

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Réponse #10 le: 23 November 2016 à 15:33
Merci pour la traduction  :jap:

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