HCC News

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Analyzing crystals to help fight cancer

By: Help Conquer Cancer research team
28 août 2015    

Récapitulatif
Behind-the-scenes work continues on the Help Conquer Cancer project - the team is analyzing millions of protein crystallization images processed by World Community Grid volunteers, with the hope of finding patterns that will help researchers build better cancer screening tools.


Dear World Community Grid volunteers:

We continue to analyze the millions of protein-crystallization images that you processed as part of Help Conquer Cancer (HCC), with the end goal of gaining insight into the crystallization process. In turn, this will enable us to crystalize cancer and other disease-related proteins, determine their structure, function, and design drugs accordingly. We aim to identify non-trivial, interesting and ultimately useful patterns in this large and valuable data set.

We strive to integrate more detailed data we have received from Hauptman Woodward Institute which will allow us to interpret patterns we are identifying and linking properties of proteins, conditions, and temporal data to specific images that were processed on World Community Grid. Work is ongoing, albeit more slowly at present, as the Post Doctoral Fellow working on the integration and data mining had to take a leave of absence to expand her teaching skills. Christian continues to dedicate some of his time to the HCC project, but also had to expand on the analysis and streamline infrastructure to support our Mapping Cancer Markers project.

We have been working on some novel analysis angles with a visiting student from Denmark, and a new student is expected to start working on the project in the Fall 2015. We therefore expect to be able to give you more detailed results in the next HCC update, which we will provide in a few months.

In the meantime, here are some recent cancer-related publications and media coverage by our group, which all relate to our effort to identify better algorithms for determining prognostic/predictive signatures and work towards finding and validating novel treatment options for cancer patients. Combined, results from these papers feeds into our new work units for the MCM project, and in turn, results from the MCM projects feed into this research.

Recent publications, presentations and media coverage

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Analyse de cristaux dans l'aide à la lutte contre le cancer.

Par l'équipe du projet Help Conquer Cancer

Récapitulatif

En coulisses, les travaux se poursuivent au sein du projet Help Conquer Cancer- l'équipe analyse actuellement des millions d'images de cristallisation traitées par les bénévoles de WCG, avec l'espoir de trouver des modèles qui aideront les chercheurs à construire de meilleurs outils de dépistage du cancer.

Chers volontaires de WCG:

Nous continuons à analyser des millions d'images de cristallisation de la protéine que vous avez traitées dans le cadre du projet Help Conqer Cancer, avec comme objectif final d'obtenir un aperçu du processus de cristallisation. A son tour, cela nous permettra de cristalliser le cancer et d'autres protéines liée à la maladie,  de déterminer leurs structures, leurs fonctions, et concevoir des médicaments en conséquence. Nous visons l'identification de configurations non triviales, intéressantes et utiles en fin de compte dans ce grand et précieux jeu de données.

Nous nous efforçons d'intégrer des données plus détaillées, que nous avons reçues du Hauptman Woodward Institut et qui nous permettront d'interpréter les modèles que nous avons identifiés et ainsi, de les ajouter aux propriétés des protéines,aux conditions et aux données temporelles d'images spécifiques qui ont été traitées sur World Community Grid. Le travail se poursuit, quoique plus lentement à présent, comme le stagiaire post-doctorant travaillant sur l'intégration et l'exploration de données a pris un congé pour élargir ses compétences en enseignement. Christian continue de consacrer un peu de son temps au projet HCC, mais il doit également approfondir l'analyse et  rationaliser l'infrastructure nécessaire pour soutenir notre projet de cartographie des marqueurs du Cancer. (Mapping Cancer Markers)

Nous avons travaillé de nouveaux angles d'analyse avec un visiteur-étudiant du Danemark, et un nouvel étudiant devrait commencer à travailler sur le projet à l'automne 2015.


Je n'ai pas trouvé utile de parler de toutes les publications qui se rapportent aux deux projets, un peu lourd comme texte pour le portail, non?

[[AF>Libristes>Jip] Elgrande71]

Merci Ousermaatre, c'est bien comme ça .
Je pense que tu as raison, il ne faut peut être pas trop alourdir la publication sur le portail . 

[LOCTET SetiOne]

Effectivement, déjà là (sauf pour les férus de sciences) c'est déjà très complet "Nous continuons à analyser des millions d'images de cristallisation de la protéine que vous avez traitées dans le cadre du projet Help Conqer Cancer, avec comme objectif final d'obtenir un aperçu du processus de cristallisation" 
Merci Ousermaatre