Sujet: FiND@Home (ex FightMalaria@Home)

[LOCTET SetiOne]

A COMPLÉTER PAR UN SPÉCIALISTE SVP

Le site du projet: http://findah.ucd.ie/index.php
Votre compte: http://findah.ucd.ie/home.php
Etat des serveurs: http://findah.ucd.ie/server_status.php   (*)
Applications: http://findah.ucd.ie/apps.php

Annonce sur FightMalaria qui est désormais arrêté http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,4921.msg319296.html#msg319296

Le nouveau projet que nous attendons tous sera FiND@Home (lutte contre les maladies orphelines). Il se concentrera d'abord sur la recherche de protéines d'accueil pour la recherche de nouvelles solutions dans la lutte contre la tuberculose. Voir les derniers échanges sur le transfert des comptes ici http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,4921.msg403347.html#msg403347

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6/01/2015

Des nouvelles

Apparemment, on a déjà fini le lot d'UT traitant de la tuberculose. Dans un autre fil, Ben dit qu'il manque ~43k UT. Vu la vitesse à laquelle elles se calculent, elles ne devaient pas manquer longtemps

Et tu devrais être content, Jéjé: l'appli Mac est la première sur sa to-do-list

TODO:
MacOS bin
Android bin (if possible)
Funny badges
(please comment to add stuff here)

Et les badges sont également dessus ^^


Edit: Les résultats des calculs sur FightMalaria@home sont également publiés: http://findah.ucd.ie/forum_thread.php?id=204&postid=1680

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3/12/2014

Message de l'admin d'il y a ~10 minutes:

-- IMPORTANT --

I shutting down the server. I need to optimize the assimilator, your are crushing my database
I just saw that I have 104 threads that insert data into my results database.

I also have to work with the vina code, to prevent it to be greedy.

I am leaning a lot thank to you guys

The WU will be back soon.

IMPORTANT

Je ferme le serveur. J'ai besoin d'optimiser l'assimilateur, vous êtes en train d'écraser ma base de données
Je viens juste de voir que j'avais 104 accès qui entraient des données dans ma base de données des résultats.

Je dois aussi travailler sur le code de Vina pour l'empêcher d'être trop gourmand.

J'apprends beaucoup grâce à vous les gars

Les UT seront de retour bientôt.

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12/12/14

http://findah.ucd.ie/forum_thread.php?id=183&postid=1538

Le premier batch est passé, il attend le retour des dernières UT avant de créer de nouvelles UT.

[toTOW]

Ils ont repris les comptes utilisateurs, mais pour l'instant, j'ai du mal à m'y rattacher ...

Le projet s'est ajouté, mais il n'arrive pas faire l'initialisation pour l'instant ...

[nabz]

Pareil pour moi.

[modesti]

Le site du projet: http://findah.ucd.ie/index.php
Votre compte: http://findah.ucd.ie/home.php
Etat des serveurs: http://findah.ucd.ie/server_status.php   (*)
Applications: http://findah.ucd.ie/apps.php

(*) on comprend pourquoi le projet n'arrive pas encore à s'initialiser

Et si j'ai bien compris ce message, la première appli qu'ils sont en train de tester sera une appli multithread.

[kipoos]

ça devrait arriver assez vite...

[toTOW]

Et si j'ai bien compris ce message, la première appli qu'ils sont en train de tester sera une appli multithread.

C'est pas explicite, mais je comprends la même chose.

Ils en profitent pour basculer dans la modernité 

Je me demande sur quelle appli ils vont baser leur travail : Vina, Gromacs, OpenMM, ... ?

[Jaehaerys Targaryen]

Il y a quelques unités 

[modesti]

J'allais dire la même chose

49 UT sont disponibles sur le projet FiND@Home

[fzs600]

 

État: Tous (545) · En cours (461) · Validation en attente (0) · Validation non concluante (0) · Valide (84) · Invalide (0) · Erreur (0)

[modesti]

Mais euh!

M'en fous, suis sur un autre chantier tasson, na! 

[Philippe06121966]

J'allais dire la même chose

49 UT sont disponibles sur le projet FiND@Home

Ah bon ? Suis connecté dessus depuis 3 jours et j'ai rien reçu 

[modesti]

FiND@Home    02/12/2014 à 18:12    5333    

Par contre, les 20 UT que j'ai chopées sont toujours en "Téléchargement en cours" à cause d'un fichier bloqué dans les tuyaux

Phil, as-tu pensé à vérifier le partage des ressources? Chez moi il était resté à 1 (mis sur fightmalaria à l'époque où le projet a "fermé"), j'ai chopé les UT - sans même forcer - quand je l'ai passé à 100 et fait une mise à jour du projet.

[Philippe06121966]

Je me suis attaché au nouveau projet, partage 100 ....
Ce sera pour plus tard

[[AF>PlusCitoyen] Kether]

 

19h04 : c'est parti les amis, plusieurs dizaines d'UT dans le cache (1h16 chacune pour mon i5) 



19h11 : bon, pas de précipitation, finalement : on est encore vraiment en phase de test, les calculs s'arrêtent au pire au bout d'1mn30 et renvoient l'UT en "Erreur de calcul" (appli : Autodock VINA 1.00) 
D'ailleurs, je suis bombardé pour 24 heures de travail et plus alors que je n'ai autorisé que 0.10 jours...

[Jaehaerys Targaryen]

Moi les calculs étaient bon et rapide mais les unités fessaient freezer mon PC (Version Boinc 7.4.27)

[[AF>PlusCitoyen] Kether]

Par prudence (superstition ?), j'avais gardé fightmalaria@home ET FIND@home : ils ont fusionné les deux (en gardant les données de l'ancien compte fightmalaria) et envoyé une petite notice pour dire d'abandonner l'un des deux.

Mais ça change pas grand chose au final, pour l'instant.   

[modesti]

Moi les calculs étaient bon et rapide mais les unités fessaient faisaient freezer mon PC (Version Boinc 7.4.27)

Le freeze est un classique des UT Vina. Si je me souviens bien, c'était déjà le cas sur les dernières de FightMalaria et sur les Vina d'Edges aussi.
Chez moi, il n'y a que les Vina de FAAH/WCG qui ne posent pas de problème.

Mais bon, le problème ne devrait pas se poser (de suite) chez moi, parce que:
a) j'ai chopé les UT sur un monocore qui ne tourne pour ainsi dire que pour Boinc
b) le fichier de taleur est toujours bloqué dans les tuyaux

[Philippe06121966]

Il doit s'agir de "bugs", car sur leurs sites les serveurs indiquent 0 partout ...

[toTOW]

J'ai toujours : 02/12/2014 23:59:58 | FiND@Home | Project is temporarily shut down for maintenance ... Et le projet a toujours pas finit son initialisation dans BOINC, j'ai toujours pas de pseudo ni d'équipe affichée ...

[kipoos]

idem que totow.
j'ai essayé en ajoutant le projet à la main ou avec SAM.

[modesti]

De mon côté, j'ai toujours ça pour le dernier fichier qui manque:

03.12.14 08:19:51 | FiND@Home | Started download of CHEMBL1630698_2
03.12.14 08:19:53 | FiND@Home | Temporarily failed download of CHEMBL1630698_2: transient HTTP error
03.12.14 08:19:53 | FiND@Home | Backing off 3 hr 7 min 5 sec on download of CHEMBL1630698_2

Apparemment, l'erreur a déjà été reportée et l'admin est très réactif. A lire à partir d'ici: http://findah.ucd.ie/forum_thread.php?id=183&postid=1452
Visiblement ce sont surtout (uniquement?) les fichiers CHEM* qui posent problème.

[Philippe06121966]

Ca fonctionne on dirait

Au fait, le projet a t'il été ajouté aux stats et à WuProp ?

Merci !!!

EDIT : Il y a beaucoup d'UT. J'en ai reçu > 1.000 et elles durent de 1 à 5 mins, suivant CPU.

Par contre, pour info, j'ai pas mal d'erreurs.

Sur 1 pc :

Celles dont le temps CPU = le temps de calcul = erreur
Celles dont le temps CPU > temps de calcul = valides

Sur un autre, il y a des erreurs quel que soit le temps CPU 

 

 

[kipoos]

j'ai aussi reçu des UTs.
je repasserai pour un p'tit bilan.

[modesti]

Message de l'admin d'il y a ~10 minutes:

-- IMPORTANT --

I shutting down the server. I need to optimize the assimilator, your are crushing my database
I just saw that I have 104 threads that insert data into my results database.

I also have to work with the vina code, to prevent it to be greedy.

I am leaning a lot thank to you guys

The WU will be back soon.

IMPORTANT

Je ferme le serveur. J'ai besoin d'optimiser l'assimilateur, vous êtes en train d'écraser ma base de données
Je viens juste de voir que j'avais 104 accès qui entraient des données dans ma base de données des résultats.

Je dois aussi travailler sur le code de Vina pour l'empêcher d'être trop gourmand.

J'apprends beaucoup grâce à vous les gars

Les UT seront de retour bientôt.

[JeromeC]

Et un projet avec un admin réactif, un !

En même temps s'il ne l'est pas maintenant il le sera jamais

En revanche je doute qu'il y ait des UT pour Mac, ou si ?