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Mort aux antivurus !!! (= mort à windows )
Le projet envoie déjà de lui meme des applications optimisées ...
Server down this weekendOur storage system (managed by the University) has some serious problem. They are working to fix it but they cannot estimate for how long it will be down. We decided to stop the server at least until the next Monday.Thank you for your understanding. 20 Apr 2018, 18:02:34 UTC
The experiments on Vitis vinifera are almost finished, thank you all. We will soon switch to a new organism. We made some tests some time ago but we found that the outputs of the Windows and Linux applications didn't match each other. The new forthcoming Windows applications should behave correctly.The next Monday we will distribute them and (slowly) start creating new work.
Les expériences sur Vitis vinifera sont presque terminées, merci à tous. Nous allons bientôt passer à un nouvel organisme. Nous avons fait quelques tests il y a quelque temps mais nous avons constaté que les résultats des applications Windows et Linux ne correspondaient pas. Les nouvelles applications Windows à venir devraient se comporter correctement.Lundi prochain nous allons les déployer et commencerons (lentement) à créer de nouvelles tâches.Traduit avec www.DeepL.com/Translator
Ces dernières années, la communauté scientifique s'est fortement engagée dans l'étude de la réponse de la vigne au changement climatique.L'objectif final est l'identification des caractères génétiques clés à utiliser dans l'élevage de la vigne et la mise en place de pratiques agronomiques pour améliorer la résilience climatique. La disponibilité croissante des études transcriptomiques, qui décrivent l'expression des gènes dans de nombreux tissus et conditions de développement ou de traitement, a permis la mise en œuvre de compendiums d'expression génétique, qui renferment une énorme quantité d'informations. L'extraction de données transcriptomiques représente une approche efficace pour étendre un réseau génique local connu (LGN) en trouvant de nouveaux gènes apparentés. Nous avons récemment publié un pipeline basé sur l'application itérative de l'algorithme PC, appelé NES2RA, pour étendre les réseaux de gènes dans Escherichia coli et Arabidopsis thaliana.Nous proposons ici l'application de cette méthode au compendium transcriptomique de la vigne Vespucci, afin d'étendre quatre LGNs liés à la réponse de la vigne au changement climatique. Deux réseaux sont liés aux voies métaboliques secondaires de synthèse des anthocyanines et des stilbénoïdes, impliquées dans la réponse au rayonnement solaire, tandis que les deux autres sont des réseaux de signalisation, liés aux hormones acide abscissique et éthylène, éventuellement impliqués dans la régulation du bilan hydrique cellulaire et la transpiration des cuticules. Les réseaux d'expansion produits par l'algorithme NES2RA ont été évalués par comparaison avec des données expérimentales et des connaissances biologiques sur les gènes identifiés qui montrent une assez bonne cohérence des résultats. De plus, l'algorithme n'a réussi à retenir que les interactions les plus significatives entre les gènes, ce qui a fourni un cadre utile pour la validation expérimentale.L'application de la NES2RA aux données d'expression de Vitis vinifera au moyen de l'implémentation basée sur BOINC est disponible sur demande.
近年来,科学界一直积极参与研究葡萄藤对气候变化的反应。最终目标是确定用于葡萄种植的关键遗传特性,并建立农艺实践以改善气候适应力。转录研究,描述在多种组织和发育条件或治疗基因表达的可用性的增加,使基因表达的概略,其含有大量的信息的执行。转录组数据检索是通过寻找新的相关基因来扩展已知的局部基因网络(NGL)的有效方法。我们最近发布的基于称为NES2RA,扩大在大肠杆菌和拟南芥的基因网络的PC算法的迭代应用管道。我们建议这种方法韦斯普奇藤的转录纲要的应用程序来扩展与藤蔓对气候变化的响应4个Lgns。两个网络连接到花色素苷和茋类,参与响应于太阳辐射的合成的次级代谢途径,而另两个信令与激素脱落酸和乙烯相关联的网络,可能参与了平衡控制细胞液和角质层蒸腾。 NES2RA算法生成的扩展网络通过与实验数据和已鉴定基因的生物学知识进行比较来评估,这些基因显示出相当好的结果一致性。此外,该算法能够仅保留基因之间最重要的相互作用,这为实验验证提供了有用的框架。可根据要求提供NES2RA通过基于BOINC的实施方案对Vitis vinifera表达数据的应用。