Cas@home

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bilan de l' année 2012


CAS@home 团队 Greetings, everyone! During the year of 2012, we have made great progress on CAS@home with all the kind help, including yours! We ported two applications on the platform, including dynamical molecular simuation software LAMMPS (used for Nanotech research by scientsts from Tsinghua University) and protein structure prediction software TreeThreader (used by scientists from ICT, CAS). And we devoted a lot of manpower to improve the stability and fault tolerance of the 2 applications in the second half year of 2012 as we officially launced them and got sufficient results back from volunteer hosts. LAMMPS: LAMMPS was offically launced in May 2012, and we have released 13 new version after the official launch which significally reduced the faulty hosts rate (a faulty host is a host which never successfully finishes any job) from 31% (version 1.16) to 5% (version 1.29). LAMMPS has gained 620K effective CPU hours worth proccess rate ever since its launch, and finished 20 batches of simulation. The results will be transfered back to Tsinghua and be post processed by the scientists as we finish setting up the data transfer channel between IHEP and Tsinghua. TreeThreader: TreeThreader was officially launched in September 2012. We have released 18 versions for both Windows and Linux platform ever since then to fix various bugs we saw along the running process or reported by volunteers. The faulty host rate is reduced from 34% (version 1.00) to 27%(1.18). However, the TreeThreader application still fails on 27% of the windows machines, developers from ICT are still working on investigating and fixing the problem. TreeThreader has gained about 95K effective CPU hours worth process rate ever since its launch, and successfully finished the struction prediction of about 1700 protein sequences so far, and there are still 6000 more sequences needs to be processed in the following period. Volunteers can follow these instructions to check the protein structure your computer contributed to compute. We are also writting scripts to generate summary of each volunteer's contribution over periods, and would send emails to volunteers about the summary. A few pages for your references: CAS@home Application version release history CAS@home Applicationfaulty hosts rate CAS@home project wide statistics In the year of 2012, we have run into a lot of problems on CAS@home due to the lack of manpower, lack of experience on porting cross platform applications on BOINC and project management experience. However, our volunteers have been giving us very positive and useful feedbacks on various problems then can detect from their computings which greatly helped us to debug and eventually find solutions to fix these problems. CAS@home is growing up with all your help, and we greatly appreciate your patience and kind help in the process. We learnt valuable lessons through the past experiences, so we have put more regulations into our project management. For example: 1) We have deployed a more comprehensive test platform to test the applications 2) Each release of applicaiton must be strictly tested on the test platform and pass the standards before it can be launched on CAS@home 3) New jobs need to be tested thoroughly and results need to be verified by scientists on the test platform before they can be submitted to CAS@home. 4) Before submitting a new batch a job, scientists users need to communicate with platform managers and analyze the results together to avoid exceptions happening. CAS@home is a project managed by volunteers from Computer Center, Institute of High Energy Physics. We formed a loose team to manage this project, and so far there is no official funding to support all the related work, so most work of this project is done by our team mates in their spare time. Like all the volunteers to CAS@home project, we would like also to contribute our effort to volunteer computing, and help with the scientific computing. The only purpose of CAS@home is to provide this distrbuted platform to bridge volunteers and scientific computing projects which are in bad needs of a large amount of computing power. As the first Chinese volunteer computing project, CAS@home is still young and in the process of growing up. We are fighting to release more stable application versions to volunteer hosts, and also learning from the experience of other well managed volunteer computing projects. We believe things can get better in 2013! Many thanks for your great effort! -CAS@home team

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 Salutations, tout le monde !
Au cours de l'année 2012, nous avons fait de merveilleux  progrès sur CAS@home avec toute l'aide possible, y compris la vôtre !
Nous avons développé deux applications sur la plate-forme, le logiciel dynamqiue de simuation moléculaire LAMMPS (utilisé pour la recherche nanotechnologique en sciences à l'Université de Tsinghua) et le logiciel de prédiction de structure protéinique TreeThreader (utilisé par les scientifiques de l'ICT, CAS).
Nous avons consacré beaucoup de nos ressources techniques afin d'améliorer la stabilité et la tolérance aux pannes des 2 applications dans le deuxième semestre de 2012 grâce à leur mise en service officiel  et au retour de résultats qualitatifs des cruncheurs.

LAMMPS :

LAMMPS a été officiellement lancé en mai 2012, et nous avons développé 13 nouvelles versions après le lancement officiel, ce qui a permis de nettement réduire le taux de mauvais hôtes (un hôte défectueux est un hôte qui ne finit jamais avec succès ses unités) de 31 % (pour la version 1.16) à 5 % (pour la version 1.29).
LAMMPS a gagné 620K d'heures  CPU efficaces depuis son lancement et terminé 20 lots de simulation.
Les résultats seront transférés à Tsinghua et seront traités par les scientifiques lorsque nous aurons terminé la mise en place de la voie de transfert des données entre IHEP et Tsinghua de post.

TreeThreader :

TreeThreader a été lancé officiellement en septembre 2012. Depuis, nous avons publié 18 versions sur les palteformes Windows et Linux, afin de corriger différents bugs remarqués lors du processus d'exécution ou signalés par des bénévoles.
Le taux de mauvais hôte s'est réduit de 34 % (version 1.00) à 27%(1.18).
Toutefois, l'application TreeThreader ne fonctionne toujours pas sur 27 % des machines windows, de l'ICT(CAS@home), les développeurs enquêtent encore à la fixation du problème. TreeThreader a gagné environ 95K d' heures efficaces de CPU depuis son lancement, et terminé avec succès la prédiction de structure d'environ 1700 séquences protéiques.  Il ya encore un peu plus de 6000 séquences à traiter dans la période à venir.

Nos volontaires (étudiants?) suivent les résultats de près afin de  vérifier la structure de la protéine que votre ordinateur a contribué à réaliser.
Nous sommes également entrain de rédiger des scripts  pour générer un compte-rendu de la contribution de chaque bénévole par période et nous allons envoyer des emails aux bénévoles de celui-ci.

J'ai bcp de mal à retranscrire cette phrase: "A few pages for your references: CAS@home Application version release history CAS@home Applicationfaulty hosts rate CAS@home project wide statistics In the year of 2012, we have run into a lot of problems on CAS@home due to the lack of manpower, lack of experience on porting cross platform applications on BOINC and project management experience."

Cependant, nos bénévoles nous ont apporté des réactions très positives et utiles sur divers problèmes qu'ils ont remarqué lors des calculs effectués sur leurs machines, cela nous a grandement aidé à déboguer et à trouver des solutions pour régler ces problèmes.
CAS@Home s'améliore avec votre aide,  nous apprécions votre patience et votre aide dans ce processus.
Nous avons beaucoup appris de leçons par les expériences du passé, ainsi nous avons mis plus de rigueur dans la gestion de notre projet.
Par exemple:
1) nous avons déployé une plate-forme plus complète de test pour tester les applications

2) chaque sortie de nouvelle version d'application doit être strictement testée sur la plate-forme d'essai et passe des normes de contrôle avant d'être lancée sur CAS@home.

3) Les nouvelles unités de travail  doivent être testées soigneusement et les résultats doivent être vérifiés par les scientifiques sur la plateforme de test avant qu'elles ne puissent être envoyées sur le projet CAS@home.

4) Avant de soumettre un nouveau lot d'unités, les testeurs scientifiques doivent communiquer avec les gestionnaires de la plateforme et analyser ensemble les résultats  pour éviter les erreurs prévisibles.

CAS@Home est un projet géré par des bénévoles du centre informatique, l' Institute of High Energy Physics.
Nous formons une équipe restreinte pour gérer ce projet, et jusqu'à présent, il n'y a pas de financement officiel pour prendre en charge tous les travaux connexes,  la plupart des travaux de ce projet sont fait par notre équipe lors de leur temps libre.

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traduction et relecture de Modesti:




Bonjour à tous !
Au cours de l'année 2012, nous avons fait de grands  progrès sur CAS@home avec toute sorte d'aide, y compris la vôtre !
Nous avons porté deux applications sur la plate-forme : le logiciel dynamique de simulation moléculaire LAMMPS (utilisé pour la recherche nanotechnologique par des scientifiques de l'Université de Tsinghua) et le logiciel de prédiction de structure protéique TreeThreader (utilisé par les scientifiques de l'ICT, CAS).
Nous avons consacré beaucoup de nos ressources humaines afin d'améliorer la stabilité et la tolérance aux pannes des 2 applications au cours du deuxième semestre de 2012 lors de leur lancement officiel  et nous avons reçu suffisamment résultats en retour des hôtes des volontaires.

LAMMPS :

LAMMPS a été officiellement lancé en mai 2012, et nous avons publié 13 nouvelles versions après le lancement officiel, ce qui a permis de nettement réduire le taux d'hôtes défectueux (un hôte défectueux est un hôte qui ne finit jamais ses unités avec succès) de 31 % (pour la version 1.16) à 5 % (pour la version 1.29).
LAMMPS a gagné 620K heures CPU efficaces depuis son lancement et a terminé 20 lots de simulation.
Les résultats seront renvoyés à Tsinghua et seront traités par les scientifiques lorsque nous aurons terminé la mise en place de la voie (du canal ?) de transfert des données entre IHEP et Tsinghua.

TreeThreader :

TreeThreader a été lancé officiellement en septembre 2012. Depuis, nous avons publié 18 versions pour les plateformes Windows et Linux, afin de corriger différents bugs remarqués lors du processus d'exécution ou signalés par des bénévoles.
Le taux d'hôtes défectueux s'est réduit de 34 % (version 1.00) à 27 % (1.18).
Toutefois, l'application TreeThreader ne fonctionne toujours pas sur 27 % des machines Windows ;  les développeurs de l'ICT travaillent encore à la recherche et à l'élimination du problème. TreeThreader a gagné environ 95K heures CPU efficaces depuis son lancement et a terminé avec succès la prédiction de structure d'environ 1700 séquences protéiques.  Il y a encore 6000 séquences supplémentaires à traiter dans la période à venir.

Les volontaires peuvent suivre ces instructions pour vérifier quelle structure de la protéine votre ordinateur a contribué à calculer.
Nous sommes également en train de rédiger des scripts  pour générer un compte-rendu de la contribution de chaque bénévole par période et nous enverrons des emails aux volontaires à ce sujet.


Quelques pages pour votre référence:
CAS@home Historique des versions des applications
CAS@home Taux des hôtes défectueux par application
CAS@home Statistiques de l'ensemble du projet
Au cours de l'année 2012, nous avons eu beaucoup de problèmes sur CAS@home en raison du manque de personnel, du manque d'expérience au niveau du portage d'applications sur plusieurs plateformes sur BOINC et du manque d'expérience de gestion de projet.

Cependant, nos volontaires ont remonté des réactions très positives et utiles sur divers problèmes qu'ils ont décelés lors des calculs effectués sur leurs machines, cela nous a grandement aidé à déboguer et à trouver des solutions pour régler ces problèmes.
CAS@Home grandit avec votre aide et  nous apprécions beaucoup votre patience et votre aimable aide dans ce processus.
Nous avons appris de précieuses leçons par les expériences passées, ainsi nous avons mis plus de règlements dans la gestion de notre projet.
Par exemple:
1) Nous avons déployé une plateforme plus complète de test pour tester les applications

2) Chaque sortie d'une application doit être strictement testée sur la plateforme d'essai et réussir les normes de contrôle avant de pouvoir être lancée sur CAS@home.

3) Les nouvelles unités de travail  doivent être testées soigneusement et les résultats doivent être vérifiés par les scientifiques sur la plateforme de test avant qu'elles ne puissent être soumises à CAS@home.

4) Avant de soumettre un nouveau lot d'unités, les utilisateurs scientifiques doivent communiquer avec les gestionnaires de la plateforme et ils doivent analyser les résultats  ensemble pour éviter la survenue d'exceptions.

CAS@Home est un projet géré par des bénévoles du centre informatique de l'Institute of High Energy Physics (Institut pour la Physique à Haute Energie).
Nous avons formé une équipe peu structurée pour gérer ce projet, et jusqu'à présent, il n'y a pas de financement officiel pour prendre en charge tous les travaux connexes ;  la plupart des travaux de ce projet sont donc faits par nos coéquipiers pendant leur temps libre.

Comme tous les volontaires au projet CAS@home, nous aimerions également contribuer au calcul distribué et aider au calcul scientifique. Le seul objectif de CAS@home est de fournir cette plateforme distribuée pour relier les volontaires et les projets de calcul scientifique qui ont grand besoin d'une grande puissance de calcul. En tant que premier projet chinois de calcul partagé, CAS@home est toujours jeune et en cours de croissance. Nous nous battons pour publier des versions plus stables des applications pour les hôtes des volontaires. Et nous apprenons également de l'expérience d'autres projets de calcul distribué bien gérés.

Nous pensons que les choses peuvent s'améliorer en 2013 ! Merci beaucoup pour tous vos efforts !
L'équipe de CAS@home