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Auteur Sujet: FightMalaria@Home  (Lu 43975 fois)

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Réponse #25 le: 19 July 2012 à 22:00
Version relue et corrigée :)

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Le projet Go Fight Against Malaria [WCG] dirigé par Alex Perryman au Scripps a pour but de trouver de nouveaux petits inhibiteurs de molécule pour des cibles protéiques connues. L'astuce qu'ils utilisent est de se concentrer sur les mutations qui ont déjà été trouvées au niveau des cibles utilisées par les médicaments contre la Malaria. En pratique c'est l'Homme contre le parasite - round 2, avec les Hommes adaptant le combat en prenant en compte les adaptations qu'ont réalisées les parasites de la Malaria pour résister au premier round.
Pour cela le projet GFAM a besoin de tester des millions de petites molécules avec quelques récepteurs de structures protéiques.

Nous faisons quelque chose de très différent. Nous utilisons les petits composés ayant déjà été utilisés contre la Malaria, et essayons de trouver avec quelle protéine ces composés se lient. Les grosses entreprises pharmaceutiques ont testé environ 3 millions de composés et en ont trouvé 19.000 qui sont actifs contre la Malaria. Mais trouver où ces composés se lient avec le parasite et comment ils fonctionnent sera difficile. Nous espérons faire cela en testant chaque composé avec chaque structure protéique.

Le principal avantage que nous avons par rapport au projet GFAM est que nous savons que les composés que nous utilisons sont efficaces contre la Malaria. Si nous trouvons quelle protéine ils inhibent, alors cela ouvrira un tout nouveau domaine de recherche : Que fait la protéine (biochimie) ? A quoi ressemble-t-elle (cristallographie aux rayons X) ? Peut-on trouver de meilleurs inhibiteurs (chimie médicale) ?

L'inconvénient principal est que nous ne serons jamais capables de couvrir l'ensemble du protéome. Certaines protéines sont naturellement déséquilibrées et resteront opaques à la cristallographie et à la modélisation. Mais nous ferons de notre mieux. Nous avons déjà des structures (rayons X ou modélisations) pour 1426 des 5363 protéines (26%) et nous continuerons de faire de la modélisation pour les protéines les plus complexes. Si nous essayions cela avec seulement un composé, nous n'aurions qu'une chance sur 4. Mais comme nous l'essayons près de 19.000 fois, nous devrions avoir une assez grande chance de succès.

Je serais enchanté si nous réussissions à ne trouver rien qu'une seule nouvelle cible contre la Malaria, ceci pouvant être le talon d'Achille que nous pourrons viser avec la toute-puissance de la chimie médicale.

Les nouveaux médicaments développés à partir de ce projet de science ouverte seront contre des cibles nouvelles pour lesquelles le parasite n'a pas encore eu une chance de développer de résistance. Comme tous les médicaments, eux aussi finiront par ne plus marcher, mais au moins nous essayons de trouver de nouveaux médicaments plus rapidement que le développement de résistance par le parasite. Le combat continue...

J'espère que cela répond à votre question.

:jap:


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Réponse #26 le: 20 July 2012 à 02:23
C'est dans les stats BZH maintenant.
« Modifié: 20 July 2012 à 02:35 par [AF>Libristes] Dudumomo »

News & Tutorial on how to host your server: http://freedif.org


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Réponse #27 le: 20 July 2012 à 06:26
Merci c'est très intéressant.

Autre petit speech (de ce que j'ai compris): GFAM test les nouvelles réponses aux mutations de malaria, tout y passe, FM étudie les dernières réponses pour prévoir les prochaines, c'est une phase d'une recherche plus ciblée.


et 194 SETI@home classic workunits (4 764 hours) :p


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Réponse #28 le: 20 July 2012 à 20:45


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Réponse #29 le: 21 July 2012 à 01:34
J'ai reçu environ 1400 UT. :eek:

Les premières ont été calculées sans problème, en 1 min 30 environ. :miam:

Contrôle de BOINC : SAM - BoincTasks 1.80 béta - Bureau à distance Chrome
Calculs : Boinc 7.16.6 SE - VirtualBox 6.1.12 -  TThrottle 7.72 - Pilote AMD 20.4.2 - Pilote nVidia 451.67
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Réponse #30 le: 21 July 2012 à 09:22
Ils ont detecte que ton RAc était gigantesque, ils ont pas eu peur de t'en donner... :siflotte:
j'espere juste que chaque upoload ou download ne fait pas quelques MB... :gno:

22717 SETI@home classic workunits; Redécouverte pulsar J1916+12 (le 07Nov2009) Einstein@Home.


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Réponse #31 le: 21 July 2012 à 17:33
Je vais faire quelques WUs avec le P4 pour voir ce que ca donne ...

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Réponse #32 le: 22 July 2012 à 20:22
Le projet fait sont entrer dans les stats.
https://statseb.boinc-af.org/classement_membres.py?projet=166&offset=0#2

Merci seb.

 :jap:


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Réponse #33 le: 23 July 2012 à 20:55
 :hyperbon:

Kill all my demons, and my angels might die too.


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Réponse #34 le: 23 July 2012 à 21:53
 :hyperbon:

Et avec une nouvelle application. VINA 2.0
http://boinc.ucd.ie/fmah/apps.php

Et en plus il faut de déttacher/rattacher au projet.  :kookoo:
http://boinc.ucd.ie/fmah/forum_thread.php?id=6

 :jap:


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Hors ligne Jaehaerys Targaryen

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Réponse #35 le: 23 July 2012 à 23:21
ok fait merci de l'info



Twitter : devweborne // Chaine Youtube : https://www.youtube.com/channel/UCXcoCd-1UlHpYIYzNER0n1Q


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Réponse #36 le: 24 July 2012 à 07:54
Et j'ai oublier :

De l'admin du projet :
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Nous avons limité le nombre de tâches en cours par ordinateur à 20 pour core. Bien que cela n'a pas été un problème pour certains, nous avons eu un grand nombre de tâches avortés en raison de l'envoi de trop de travail pour chaque nœud. Merci pour votre votre aide. Kevin

Voila maintenant vous savez tout.  :kookoo:
 


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Réponse #37 le: 24 July 2012 à 12:04
c'est un problème de ce qui nous envoie le taf (ordonnanceur ?) qui calculs mal ou qui est mal programmé pour la quantité max de ce que peut taffer notre PC...



Twitter : devweborne // Chaine Youtube : https://www.youtube.com/channel/UCXcoCd-1UlHpYIYzNER0n1Q


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Réponse #38 le: 28 July 2012 à 22:28
 :hello:

De l'admin du projet : des points de controle dans quelques jours.
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Oui, il semble être devenu une nécessité. Il sera ajouté dans les prochains jours.
Merci pour votre retour,
Kevin

http://boinc.ucd.ie/fmah/forum_thread.php?id=7#95

 :jap:


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Réponse #39 le: 28 July 2012 à 23:36
merci d'avoir mis l'info... :desole:



Twitter : devweborne // Chaine Youtube : https://www.youtube.com/channel/UCXcoCd-1UlHpYIYzNER0n1Q


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Réponse #40 le: 04 August 2012 à 12:21
La franchement ca pique les yeux.   :cpopossib: :cavapobienmwa:
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   3 Aug 2012 | 13:29:43 UTC    4 Aug 2012 | 10:07:40 UTC    Terminé et validé    72,896.77    66,358.82    33.63    vina v2.00
    3 Aug 2012 | 13:29:36 UTC    4 Aug 2012 | 10:07:40 UTC    Terminé et validé    72,044.06    65,569.68    33.63    vina v2.00



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Réponse #41 le: 05 August 2012 à 11:46
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   3 Aug 2012 | 13:28:45 UTC    5 Aug 2012 | 9:35:23 UTC    Terminé et validé    126,536.11    96,484.34    21.10    vina v2.00

 :cry: :cry:


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Réponse #42 le: 05 August 2012 à 11:47
Ca frise le foutage de gueule ce projet dites donc ... :/

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Réponse #43 le: 06 August 2012 à 18:11
Bon il y a de l'amélioration :  :kookoo:

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   6 Aug 2012 | 14:20:05 UTC    6 Aug 2012 | 15:08:38 UTC    Terminé et validé    2,426.26    1,948.20    16.32    vina v2.00
    6 Aug 2012 | 14:20:09 UTC    6 Aug 2012 | 15:08:38 UTC    Terminé et validé    2,200.42    1,979.25    14.80    vina v2.00
    6 Aug 2012 | 14:20:12 UTC    6 Aug 2012 | 15:46:42 UTC    Terminé et validé    2,598.05    1,980.97    17.47    vina v2.00



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Réponse #44 le: 12 August 2012 à 10:11
J'ai l'impression que le site a un petit coup de mou.  :/


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Réponse #45 le: 18 August 2012 à 06:42
 :hello:

De l'admin du projet :
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Salut tout le monde,
Nous sommes toujours des problèmes avec le serveur. Cependant, les bonnes nouvelles sont la recherche informatique ont accepté de nous fournir deux serveurs beaucoup mieux. Nous espérons faire avancer le projet à ces cours le week-end, mais il sera probablement mercredi avant nous sommes à nouveau opérationnel. Nous ne serons pas envoyer de nouvelles unités de travail jusque-là.
Merci de votre patience,
Kevin
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Réponse #46 le: 22 August 2012 à 10:39
Salut à tous.

J'avais loupé le lancement de ce projet en juillet cause vacances...  :desole:

Inscrit hier, UTOD aujourd'hui  :moimoi:

 :hello:

Bon par contre pas moyen de rejoindre l'AF, ni par le site ni par BAM...  :priz2tet:
« Modifié: 22 August 2012 à 10:51 par [AF>Libristes] cottesloe »


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Réponse #47 le: 22 August 2012 à 14:54
Bon par contre pas moyen de rejoindre l'AF, ni par le site ni par BAM...  :priz2tet:

Suggestions :
- changer de navigateur
- réduire la taille de l'affichage (Ctrl+-) jusqu'à ce que le lien "Join this team" (ou "Rejoindre cette équipe") devienne visible / ou agrandir l'affichage (Ctrl++)
- donner un gros coup de pompe dans l'ordinateur et/ou un coup de poing dans l'écran => marche pas en général :D


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Réponse #48 le: 22 August 2012 à 17:22
- donner un gros coup de pompe dans l'ordinateur et/ou un coup de poing dans l'écran => marche pas en général :D
Humour licornien.
 :capello:


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Hors ligne [AF>Libristes] cottesloe

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Réponse #49 le: 23 August 2012 à 09:25
En regardant ce matin, le lien "Rejoindre cette équipe" était présent.  :sun:
Donc, un clic dessus et hop! L'AF a un cruncheur de plus sur ce projet!  :)

Reste plus qu'a avoir des UTs...  :hyperbon:  :hyperbon:  :hyperbon:

EDIT: Ce n'est pas gagné...
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jeu. 23 août 2012 16:03:25 CEST | fightmalaria@home | update requested by user
jeu. 23 août 2012 16:03:26 CEST | fightmalaria@home | Sending scheduler request: Requested by user.
jeu. 23 août 2012 16:03:26 CEST | fightmalaria@home | Requesting new tasks for CPU
jeu. 23 août 2012 16:03:29 CEST | fightmalaria@home | Scheduler request completed: got 0 new tasks
jeu. 23 août 2012 16:03:29 CEST | fightmalaria@home | Project has no tasks available

 :(
« Modifié: 23 August 2012 à 16:05 par [AF>Libristes] cottesloe »


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