Auteur Sujet: [WCG]Help Conquer Cancer  (Lu 50258 fois)

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ousermaatre

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[WCG]Help Conquer Cancer
« le: 02 mai 2012 à 01:39 »
Help Conquer Cancer



 Statut et résultats du projet :  
Vous trouverez des informations sur ce projet dans les pages Web ci-dessous et sur le site Web Aider à vaincre le cancer par le biais des chercheurs ayant contribué à ce projet. Pour obtenir le rapport d'état le plus récent, consultez le rapport d'état du projet Aider à vaincre le cancer. Pour envoyer des commentaires ou des questions sur ce projet, veuillez publier votre message sur le forum Aider à vaincre le cancer.

Mission
La mission du projet Aider à vaincre le cancer est d'améliorer les résultats de la cristallographie aux rayons X des protéines, qui aide les chercheurs non seulement à annoter les parties inconnues du protéome humain, mais surtout leur permet de comprendre la naissance, la progression et le traitement du cancer.

Importance
Afin d'influencer de manière significative la compréhension du cancer et de ses traitements, il est non seulement nécessaire de découvrir de nouvelles approches thérapeutiques capables de cibler les métastases (ou cancers se propageant à d'autres parties du corps), mais également d'identifier des marqueurs de diagnostic (ou indicateurs de la maladie), capables de détecter les premiers stades de la maladie.

Les chercheurs ont fait des découvertes importantes lors de l'étude de plusieurs cancers humains, même lorsqu'ils disposaient d'informations limitées ou inexistantes sur les protéines concernées. Cependant, pour mieux comprendre et traiter le cancer, il est important que les scientifiques découvrent de nouvelles protéines impliquées dans le cancer, et identifient leurs structure et fonction.

Les scientifiques s'intéressent particulièrement aux protéines susceptibles d'avoir une relation fonctionnelle avec le cancer. Ces protéines sont soit en surnombre, soit absentes dans les cancers, ou bien elles ont été modifiées ou mutées de manière structurelle.

L'amélioration de la cristallographie aux rayons X permettra aux chercheurs de déterminer plus rapidement la structure de nombreuses protéines liées au cancer. Ceci permettra de mieux comprendre la fonction de ces protéines et de conduire à des interventions pharmaceutiques potentielles pour traiter cette maladie mortelle.



Une version GPU de l'application est arrivé en octobre 2012...

2/11/2012
Citer
de Modesti
Pour ceux et celles qui - comme moi - ne jouent pas avec les app_info machinchose et laissent les projets bosser "normalement", je voudrais signaler une particularité de HCC par rapport à d'autres projets qui utilisent (presque) un CPU entier en plus du GPU (Einstein, Albert, Seti, Seti beta): WCG bloque de lui même un CPU, contrairement aux autres.

Je m'explique.
J'avais remarqué ça un jour où j'avais mis mon i7 à 75% pour Boinc parce que j'avais besoin de capacité pour bosser (ça m'arrive oui :D) et que j'ai dû avoir de l'Albert qui tournait aussi. Donc, en théorie, 6 UT CPU + 1 UT GPU + les différents NCI. Quand l'ordi s'est mis sur HCC GPU, je n'avais plus que 5 UT CPU qui tournaient, alors que 2 coeurs étaient libres.
Aujourd'hui, le i7 tourne à 100% et avec HCC GPU je n'ai que 7 UT CPU qui tournent.

AU 3/11/2012, il resterait 132 jours de calculs...
« Modifié: 03 novembre 2012 à 18:52 par Polynésia »

amine548

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Re : [WCG]Help Conquer Cancer
« Réponse #1 le: 03 mai 2012 à 02:42 »
Est-ce-que les UT GPU ont commencé a etre envoyé ou pas encore?

ousermaatre

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Re : [WCG]Help Conquer Cancer
« Réponse #2 le: 03 mai 2012 à 02:50 »
 :hello:
amine,

J'ai cherché sur le site WCG des informations complémentaires, à ce jour, aucunes nouvelles des unités GPU.

Au mois de septembre dernier l'université de Toronto annonçait celles-ci dans un futur proche.

Mais que veut dire futur proche dans le monde BOINC ? Patience, certainement que nous aurons des nouvelles, bientôt.


Sur le forum de discussions, il y a bien très épisodiquement des unités GPU envoyées pour test. Mais selon les discussions, pas encore, d'annonce sur du GPU au quotidien.


flux rss pour connaître si oui ou non, des ut GPU sont disponibles: http://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/rss?forum=181
« Modifié: 03 mai 2012 à 03:00 par ousermaatre »

amine548

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Re : [WCG]Help Conquer Cancer
« Réponse #3 le: 03 mai 2012 à 03:19 »
merci beaucoup pour ces infos

foo_fight

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Re : [WCG]Help Conquer Cancer
« Réponse #4 le: 03 mai 2012 à 06:56 »
Je confirme il n'y a eu que des UT beta pour GPU sur HCC.

Vivement l'arrivée des UT en prod car avec tout le travail qu'ils ont réinjecté ça va prendre du temps en CPU.


JackTheSkipper

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Re : [WCG]Help Conquer Cancer
« Réponse #5 le: 04 mai 2012 à 11:43 »
Est-ce-que les UT GPU ont commencé a etre envoyé ou pas encore?

A mon avis, le jour où les premières UTs GPU (non beta) sont envoyées, ça ne passera pas inaperçu ;)
Entre les AFiens qui surveillent leur Boinc Manager et ceux qui scrutent le forum WCG ça fait beaucoup des vigies  :desole:

Il suffit de bien ouvrir l'oeil sur ce forum  :eek:  :)
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lunetoile

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Re : [WCG]Help Conquer Cancer
« Réponse #6 le: 17 juin 2012 à 17:38 »
Bonjour, je suis un petit nouveau sur ce forum.

Je suis en "indépendant" depuis moin d'un an (comment rejoindre l'alliance, et comment publier nos stats ?), j'ai mis un pc 4 cores 8 threads sur ce projet, en ce qui me concerne, je compte rester sur WCG et aider dans un premier temps la recherche médicale.

j'ai 228 j de recherche pour help conquer cancer.

j'ai lu beaucoup de topic qui ne disait pas du bien de WCG sans expliquer vraiment pourquoi, j'aurais aimé savoir ce qu'il en retourne.

à bientot

Spica

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Re : [WCG]Help Conquer Cancer
« Réponse #7 le: 17 juin 2012 à 17:57 »
 :hello: lunetoile
Tout d'abord bienvenue sur notre forum, tu es chez toi ici  :jap:
Pour rejoindre l'AF(=l'alliance francophone) sur WCG, tu vas dans ton compte WCG dans les menus à gauche tu as "mon équipe" ecrit sur une ligne en bas: tu cliques dessus. Ensuite, tu fais 'trouver une equipe' (juste en dessous). Dans la case contient, tu tapes " l'alliance" (sans les guillemets évidemment) et puis chercher , ca devrait marcher. En ce moment, ca marche pas, essaie plus tard ou demain, il y a visiblement un probleme avec leur serveur.
Pour le reste que tu mentionens et les critiques sur WCG, je ne sais pas a quoi tu fais allusion, il y a des specialistes de WCG qui te repondront mieux que moi...
 :jap:
A bientot
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JeromeC

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Re : [WCG]Help Conquer Cancer
« Réponse #8 le: 17 juin 2012 à 20:14 »
Le sujet est historique : WCG a commencé à écrire et utiliser son propre client de calcul partagé (et serveur et site Web aussi), le tout avec le sponsoring actif d'IBM donc des moyens et des résultats. Puis ils ont décidé de migrer sur le logiciel boinc et d'abandonner leur client maison, je ne connais pas les dessous de l'histoire mais très certainement car c'est logique de cesser d'investir dans de l'administratif / logistique et de se concentrer sur le coeur de métier (les projets de recherche) quand il existe une solution efficace et gratuite pour s'en charger. Cependant ils n'ont pas tout pris dans la solution boinc et ne se sont pas pliés à tous les standards,  très probablement pour pouvoir capitaliser une partie de tout les développements fait avant et ne pas tout reprendre de zéro lors du passage à boinc, qui n'a pas du être simple non plus vu l'énorme infrastructure qui est derrière le WCG.

Donc il y a des choses qui ne marchent pas comme dans les autres projets sous boinc et on râle parce qu'on aime ça,  mais en pratique on est nombreux à cruncher dessus parce que c'est un (ensemble de)  projet formidable caractérisée par son sérieux,  loin de l'amateurisme fantaisiste de certains projets "full boinc compliants " ;)
Parce que c'était lui, parce que c'était moi.

lunetoile

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Re : [WCG]Help Conquer Cancer
« Réponse #9 le: 17 juin 2012 à 20:47 »
bonsoir, merci pour ces précisions, alors voilà, c'est officiel, je fais parti de l'équipe AF.

Je me sens tout de suite moin seul.

ça va crucher sévère !  :D

kasur

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Re : [WCG]Help Conquer Cancer
« Réponse #10 le: 17 juin 2012 à 21:48 »
Bienvenue! :kookoo:

Si tu ne l'ai as pas voici deux liens pleins d'infos mises à jour:
https://secure.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread?thread=18277
http://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread?thread=26012
Par exemple dans la premiere image du premier lien tu vois que le projet HFCC fini dans 54j.

Si tu es, comme pas mal ici, un chasseur de badges WCG n'hésites pas à visiter ce topic AF --> Vos Badges

a+

et 194 SETI@home classic workunits (4 764 hours) :p Toutes les Minivilles AF

nabz

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Re : [WCG]Help Conquer Cancer
« Réponse #11 le: 17 juin 2012 à 22:58 »
bonsoir, merci pour ces précisions, alors voilà, c'est officiel, je fais parti de l'équipe AF.

 :hello:
Contrôle de BOINC : SAM - BoincTasks 1.78 - TThrottle 7.52 - TeamViewer 13.1
Calculs : Boinc 7.12.1 SF - VirtualBox 5.2.8 - Pilote Ati 17.9.3 - Pilote nVidia 416.34
OS et utilitaires : Win10 x86/64 - Core Temp 1.12.1 - CCleaner 5.47 - DriverSweeper 3.1

ousermaatre

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Re : [WCG]Help Conquer Cancer
« Réponse #12 le: 18 juin 2012 à 00:53 »
Bonjour, je suis un petit nouveau sur ce forum.

Je suis en "indépendant" depuis moin d'un an (comment rejoindre l'alliance, et comment publier nos stats ?), j'ai mis un pc 4 cores 8 threads sur ce projet, en ce qui me concerne, je compte rester sur WCG et aider dans un premier temps la recherche médicale.

j'ai 228 j de recherche pour help conquer cancer.

j'ai lu beaucoup de topic qui ne disait pas du bien de WCG sans expliquer vraiment pourquoi, j'aurais aimé savoir ce qu'il en retourne.

à bientot

Bonjour lunetoile,

Au sujet de tes stats dans l'AF, elles devraient apparaître sous peu pour celà, il te faudra consulter ces pages : http://statseb.boinc-af.org/classement_membres.py?projet=0&sort=total&offset=0

et dès maintenant, en mettant ton pseudo d'utilisateur, tu devrais les voir ici : http://boincstats.com/

Là, en haut à gauche, tu mets ton pseudo et tu fais search.

Pour la signature ici sur le forum avec tes stats, il faudra mettre à jour tes infos sur les stats de sébastien, premier lien.

Et si tu le désires, tu peux venir te présenter en bref, aux autres membres du forum ici : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,467.2625.html#lastPost

Bienvenue à toi dans la grande famille francophone des cruncheurs, n'hésite pas à nous questionner, il y aura toujours une bonne âme pour te répondre.  :kookoo:

foo_fight

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Re : [WCG]Help Conquer Cancer
« Réponse #13 le: 25 juin 2012 à 17:25 »
Pour info il y a un laché de Beta GPU.

Contender

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Re : [WCG]Help Conquer Cancer
« Réponse #14 le: 27 juin 2012 à 11:21 »
WCG est down aujourdhuis, même leur site repond pas  :/

Pc Familial: Windows 10 Pro 64-Bits Intel Core2 Quad Q9550 2.83 GHZ OC à 3.4 GHZ 8 Go RAM AMD Radeon HD 6870 series 1024 mo Catalyst 15.201 BOINC Manager 7.6.33

JeromeC

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Re : [WCG]Help Conquer Cancer
« Réponse #15 le: 27 juin 2012 à 13:59 »
Ça va faire un peu d'air pour les autres projets :)


edit : au bout d'un moment le site finit quand même par répondre.
« Modifié: 27 juin 2012 à 14:05 par JeromeC »
Parce que c'était lui, parce que c'était moi.

Spica

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Re : [WCG]Help Conquer Cancer
« Réponse #16 le: 27 juin 2012 à 14:11 »
Ca revient doucement.... mais surement! :pt1cable:
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amine548

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Re : [WCG]Help Conquer Cancer
« Réponse #17 le: 27 juin 2012 à 14:16 »
Le site est de nouveau accessible, je viens d'essayer.

[AF>Libristes] Dudumomo

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Re : [WCG]Help Conquer Cancer
« Réponse #18 le: 29 juin 2012 à 05:25 »
Article sympa sur WCG.

HCC a ete le projet avec le plus de retour d'unites

Peut etre faire une news sur le portail pour le projet WCG complet.
News & Tutorial on how to host your server: http://freedif.org

amine548

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Re : [WCG]Help Conquer Cancer
« Réponse #19 le: 03 juillet 2012 à 14:51 »
La version GPU est enfin sorti, voici le lien : http://www.cs.utoronto.ca/~juris/WCG/UPDATE-JUN2012.pdf

toTOW

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Re : [WCG]Help Conquer Cancer
« Réponse #20 le: 03 juillet 2012 à 20:09 »
Mouais c'est pas encore dispo, j'ai que du taf pour CPU :(
FAH-Addict, première source d'information francophone sur le projet Folding@Home.

foo_fight

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Re : [WCG]Help Conquer Cancer
« Réponse #21 le: 03 juillet 2012 à 21:00 »
Normal, ils sont en train d'analyser les résultats du dernier laché d'UT qui a eu lieu la semaine dernière.

Il faut attendre mais c'est en bonne voie. :)

amine548

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Re : [WCG]Help Conquer Cancer
« Réponse #22 le: 03 juillet 2012 à 21:22 »
que dise-ils dans ce PDF exactement ?

foo_fight

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Re : [WCG]Help Conquer Cancer
« Réponse #23 le: 09 juillet 2012 à 23:03 »
Je suis pas assez bon en anglais pour te répondre.

En gros ils sont content de la forte participation à la phase beta GPU qui a démarré le 13 mars. Ils ont conscience qu'on aurait aimer avoir plus d'UT à "manger".
Et ils sont en train de préparer les nouvelles UT GPU et augmenter leur capacité de stockage car ils s'attendent à une forte augmentation du processing rate (je ne sais pas comment on peu traduire ça) lorsque les UT GPU basculeront de la phase BETA à la production.

Sinon pour info ce soir nouveau laché d'UT BETA GPU.


Jaehaerys Targaryen

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Re : [WCG]Help Conquer Cancer
« Réponse #24 le: 10 juillet 2012 à 00:18 »
Comment avoir que les unités GPU ?


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