Sujet: [WCG]Help Cure Muscular Dystrophy - Phase 2

[ousermaatre]

Help Cure Muscular Dystrophy - Phase 2
 

 
 Statut et résultats du projet :  
Vous trouverez des informations sur le projet Lutte contre la dystrophie musculaire dans ces pages ou sur le site Web Lutte contre la dystrophie musculaire. Pour envoyer des commentaires ou poser des questions sur ce projet, visitez le Forum Lutte contre la dystrophie musculaire.

Le World Community Grid et les chercheurs soutenus par Decrypthon, un partenariat entre AFM (Association Française contre les Myopathies), le CNRS (Centre National de Recherche Scientifique), l'université Pierre et Marie Curie et IBM étudient les interactions entre plus de 2 200 protéines dont la structure est connue, en se concentrant sur celles jouant un rôle dans les maladies neuromusculaires. Les informations obtenues seront rassemblées dans une base de données pour aider les chercheurs à concevoir les molécules susceptibles d'inhiber ou de favoriser la liaison de molécules particulières. L'objectif est de pouvoir trouver des traitements contre les myopathies et d'autres pathologies neuromusculaires.

Que sont les maladies neuromusculaires et la myopathie de Duchenne ?
Le terme générique « maladie neuromusculaire » désigne un groupe de maladies (plus de 200 au total) qui affectent le fonctionnement des muscles, soit en touchant directement le muscle (dystrophie musculaire), soit indirectement en touchant le nerf moteur ou la jonction entre le nerf et le muscle. La plupart de ces maladies sont rares (moins d'une personne sur 2 000 est affectée), elles sont d'origine génétique (80% des cas) et affectent aussi bien les enfants que les adultes. Ces maladies chroniques conduisent à une diminution de la force musculaire et occasionnent un handicap sévère de la fonction motrice (mouvements, respiration, etc.). Les manifestations de ces maladies sont variables. Certaines sont progressives alors que d'autres peuvent rester stables durant plusieurs années. De plus, la même pathologie peut produire des symptômes différents d'une personne à l'autre.

Malgré les avancées des approches thérapeutiques, il n'existe à ce jour aucun traitement curatif disponible de ces maladies.

[TheStressMan]

Bonsoir,

Je viens de recevoir un paquet d'UT 
J'ai forcé le chargement pour pouvoir récupérer le badge OR. Il me reste à peine 2 jours à faire. 

 

[Jaehaerys Targaryen]

Paru sur le site de WCG :

End of the Help Cure Muscular Dystrophy - Phase 2 project
 
 Catégorie: Help Cure Muscular Dystrophy
 Balises:  Events & Milestones , Project Update
 
 Récapitulatif
 As a result of the generous contribution of computing power from our members, the Help Cure Muscular Dystrophy - Phase 2 project is on the verge of finishing.
 
 
 World Community Grid is pleased to announce, that as a result of the generous contribution of computing power from our members, the Help Cure Muscular Dystrophy - Phase 2 project is very close to being completed.
 
 The Help Cure Muscular Dystrophy - Phase 2 project was launched on May 12, 2009. To date, World Community Grid members have processed over 113 million results which required nearly 53,000 years of computing power. This work would have taken too many years to even be attempted, using the computing resources available to the researchers at the Université Pierre et Marie Curie and joint research facilities. Using World Community Grid, this research was completed in less than 2.5 years.
 
 The researchers are now working on analyzing the results data to determine the more detailed protein-to-protein interactions involved with neuromuscular diseases.  They expect to publish their results in public databases, along with descriptive papers.
 
 You may read about these plans in this forum post by Dr. Alessandra Carbone, the lead researcher on the Help Cure Muscular Dystrophy - Phase 2 project.
 
 If you contributed your computer power to the Help Cure Muscular Dystrophy - Phase 2 research project, the staff at the Université Pierre et Marie Curie in Paris wish to express their sincere gratitude to you.
 
 Don't forget - we still need your help with the other active research projects running on World Community Grid! All of these important projects need your computer time. If you had selected to only contribute to the Help Cure Muscular Dystrophy - Phase 2 project, please go to your My Projects page to review and update your project selection.

[modesti]

merci pour l'info Poly

[JeromeC]

Un de perdu, 10 de retrouvés

[RLDF]

c'est surtout que c'est le projet du Téléthon, et qu'il va s'achever quasiment en même temps début décembre
j'ai entendu parler d'une phase 3 qui va suivre avec le prochain téléthon 

[Meteore31]

super un autre badge avec un petit 3

[ousermaatre]

Paru sur le site de WCG :

Même si certains membres comprennent très bien l'anglais, il serait souhaitable
de nous faire une petite traduction française, ou alors on peut changer le nom du forum, non ?

[fzs600]

ou alors on peut changer le nom du forum, non ?

OK pour L'alliance franglophone.   

[ousermaatre]

    

[JeromeC]

Comment on traduit "boinc"?

[cedricdd]

Fin du projet Help Cure Muscular Dystrophy - Phase 2
 
World Community Grid est heureux d'annoncer qu'avec la généreuse contribution de puissance de calcul de nos membres, le projet Help Cure Muscular Dystrophy - Phase 2 ne va pas tarder à être terminé.
 
Le projet Help Cure Muscular Dystrophy - Phase 2 a été lancé le 12 Mai 2009. Jusqu'à aujourd'hui, les membres de World Community Grid ont traité plus de 113 millions de résultats ce qui représente près de 53.000 années de puissance de calcul. Ce travail aurait nécessité trop de temps pour n'être que tenté en utilisant que les ressources informatiques qui sont disponibles pour les chercheurs de l'Université Pierre et Marie Curie et des instituts de recherche affiliés. En utilisant World Community Grid, cette recherche a été terminée en moins de 2.5 années.
 
Les chercheurs travaillent maintenant à l'analyse des données pour déterminer les interactions entre protéines les plus détaillées qui sont impliquées dans les maladies neuromusculaires. Ils espèrent publier leurs résultats dans des bases de données publiques de même que des rapports descriptifs.
 
Vous pouvez en savoir plus sur ces plans sur ce topic du forum posté par le Dr. Alessandra Carbone, la responsable du projet Help Cure Muscular Dystrophy - Phase 2.
 
Si vous avez mis à disposition votre puissance de calcul pour le projet Help Cure Muscular Dystrophy - Phase 2, l'équipe de l'Université Pierre et Marie Curie à Paris voudrait vous exprimer leur sincère gratitude.
 
N'oubliez pas - nous avons encore besoin de votre aide avec les autres projets encore actifs sur World Community Grid! Tous ces importants projets ont besoin de votre puissance de calcul. Si vous aviez choisi de ne participer qu'au projet Help Cure Muscular Dystrophy - Phase 2, veuillez aller sur la page "Mes Projets" pour mettre à jour votre sélection.

[ousermaatre]

 

[[AF] fansyl]

Des nouvelles de ce projet français, datant du 19 aout 2016:

Récapitulatif

Le Docteur Alessandra Carbone, chercheur principal pour le projet "Help Stop Muscular Dystrophy" a récemment co-écrit un document qui utilise les données du World Community Grid pour faire la lumière sur la façon dont fonctionnent les protéines et interagissent les unes avec les autres.

Le Docteur Alessandra Carbone, qui dirige le projet HSMD, a récemment publié un document qui a utilisé les données du projet pour examiner la fonction des protéines et de l'interaction protéine-protéine.

Les protéines sont des molécules très importantes impliquées dans les processus biologiques et la machinerie des cellules. Leurs interactions entres elles et avec d'autres molécules déterminent et mettent en œuvre leurs fonctions. Ainsi, il est important de comprendre lorsqu'elles interagissent, et plus précisément la façon dont elles interagissent. La surface complexe des protéines comporte des schémas de charges électriques attractives et répulsives qui correspondent à un degré variable à des schémas opposés de charges sur d'autres surfaces de molécules. Comprendre lesquelles des nombreuses parties de la surface d'une protéine sont les plus responsables des réactions avec d'autres molécules et les protéines sont essentielles à la compréhension de leurs fonctions.

Le présent document en "accès ouvert" décrit les efforts et les techniques utiles pour identifier et classer les sites d'interaction de surface des protéines en utilisant les résultats calculés dans la phase 1 du projet Help Cure Muscular Dystrophy, qui a fonctionné sur le World Community Grid de Décembre 2006 à Juin de 2007.

Information

Titre: Great interactions: Comment les partenaires de liaison incorrectes peuvent nous en apprendre sur la reconnaissance et la fonction des protéines

Auteurs: Lydie Vamparys, Laurent Benoist, Alessandra Carbone, Sophie Sacquin-Mora

La citation ci-dessus est issue de l'article. Pour une future étude, les chercheurs envisagent d'appliquer les outils d'analyse de cette expérience pour les résultats de la phase 2 du projet Help Cure Muscular Dystrophy.

Résumé des auteurs :

Les interactions protéine-protéine jouent un rôle clé dans la plupart des processus biologiques et la compréhension de leur mécanisme est un problème fondamental qui conduit à de nombreuses applications pratiques. La prédiction des sites de liaison de protéines, en particulier, est d'une importance primordiale car les protéines représentent désormais une grande classe de cibles thérapeutiques. Parmi les autres méthodes, les simulations d'amarrage entre deux protéines connues pour interagir peuvent être un outil utile pour la prédiction des correctifs susceptibles de liaison sur une surface de la protéine. De l'analyse des interfaces protéiques générés par une expérience de cross-docking massif en utilisant les 168 protéines de la Docking Benchmark 2.0, où toutes les paires de protéines possibles, et pas seulement celles expérimentales, ont été amarré ensemble, nous montrons qu'il est également possible de prédire les résidus de liaison d'une protéine sans avoir aucune connaissance préalable concernant ses partenaires d'interaction potentiels. L'évaluation de la performance des prévisions de cross-docking en utilisant l'aire sous la spécificité-sensibilité courbe ROC (AUC) conduit à une valeur AUC de 0,77 pour l'indice de référence complet (par rapport à la valeur AUC 0,5 obtenu pour les prédictions aléatoires). En outre, une nouvelle analyse de la concentration effectuée sur les patchs de liaison qui sont dispersés sur la surface  des protéines montrent que leur distribution et la croissance dépendront du groupe fonctionnel de la protéine. Enfin, dans plusieurs cas, les prédictions-site de liaison résultant des simulations de cross-docking vont conduire à l'identification d'une autre interface, ce qui correspond à l'interaction avec un partenaire biomoléculaire qui ne sont pas inclus dans l'indice de référence d'origine.

[JeromeC]

Fut également publié sur le portail, mais c'est vrai que c'est pas idiot de remettre la news dans le topic du projet...

[[AF] fansyl]

Bah je trouve que c'est pas mal pour un cruncheur qui a participé à ce projet il y a déjà quelques temps.
Et si il a délaissé le crunch et le forum de l'AF, un mail de notification de réponse peut l'inciter à revenir faire un tour ici ! 

[JeromeC]

Toutafey