Le fait d'avoir un boinc normal / boinc portable ne change strictement rien à "cruncher online ou offline".
Tu peux très n'avoir qu'un seul boinc installé sur la machine (le boinc normal, donc visiblement t'es admin et tu peux installer), tu coupes le réseau complètement dans les préférences boinc, et tu déplaces tes UT à la mano sur une clé. Pas du tout besoin de "boinc portable" dans ce contexte, je me répète le "portable" ça veut dire installable sans droit admin", après tu peux l'installer sur une clé, ou l'installer sur un PC, il est toujours "portable". Ne pas se méprendre sur la terminologie.
Attention, "déplacer les UT" d'une machine à l'autre n'est pas trivial : c'est un ensemble de fichiers xml (dont certaines parties seulement sont impactées) dans le répertoire data et de sous dossiers qui sont impactés, c'est pour ça que je faisais une synchro complète de toutes l'arboresence boinc avec un utilitaire ad-hoc, du PC vers la clé au bureau, puis de la clé vers le PC à la maison, lancement de boinc à la maison, réseau ouvert, renvoi / téléchargement de nouvelles unités, etc. Eventuellement "à la maison" tu peux le lancer directement depuis la clé USB si tu veux, tu gagnes une étape de syncho, mais je ne recommande pas de le lancer sur une clé USB au bureau.
--> tu veux peut-être le lancer directement depuis la clé au bureau aussi "pour laisser le moins de traces possibles sur le PC", mais à mon avis les I/O fréquents et répétés sur clé USB c'est pas bon pour elle (sans parler du début, selon le type d'USB ça peut ralentir le crunch). Tu peux tenter, dans ce cas je te conseille aussi de désinstaller le boinc normal installé sur le PC, que tu évoques.