Auteur Sujet: correlizer@home [Projet suspendu]  (Lu 12141 fois)

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Jaehaerys Targaryen

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correlizer@home [Projet suspendu]
« le: 02 août 2011 à 21:15 »



  • Informations utiles sur le projet :

    Statut : Projet alpha, Inactif
    Article sur le site de L'AF :
    Classement mondial de L'AF : http://boincstats.com/en/stats/119/team/list/0/0/0/
    Temps de calcul et points de sauvegarde : Pas disponible





    Citer
    L'organisation séquentielle des génomes, c'est à dire les relations entre les paires de bases éloignées et les régions au sein des séquences, et sa connexion à l'organisation tridimensionnelle des génomes est encore un problème largement non résolus. Longue distance en loi de puissance des corrélations ont été trouvées en utilisant une analyse de corrélation sur presque toute l'échelle observables de 132 chromosomes entièrement séquencé de 0,5? 106 à 3,0? 107 pb des Archaea, Bacteria, Arabidopsis thaliana, Saccharomyces cerevisiae, Schizosaccharomyces pombe, Drosophila melanogaster, et Homo sapiens. Les coefficients de corrélation locales montrent un comportement spécifique des espèces multi-échelle: près de corrélations aléatoires à l'échelle de quelques paires de bases, un premier maximum de 40 à 3400 pb (pour Arabidopsis thaliana et chez Drosophila melanogaster divisé en deux submaxima), et souvent une région d'une ou plusieurs secondes maxima de 105 à 3? 105 pb. Au sein de ce comportement d'échelle multi-, un montant supplémentaire de structure fine est présente et imputables à l'usage des codons dans tous, sauf les séquences humaines, où elle est liée à la liaison des nucléosomes. Séquences générées par ordinateur aléatoire en supposant un bloc d'organisation des génomes, l'usage des codons, et contraignant nucléosomiques expliquer ces résultats. Mutation par remaniement séquence détruit toutes les corrélations. Ainsi, la stabilité des corrélations semble être étroitement contrôlé et évolutif lié à l'organisation du génome spatiale, en particulier sur de grandes échelles. En résumé, les génomes montrent une organisation complexe séquentielle étroitement liée à leur organisation en trois dimensions.

    L'application a été développée aux Pays-Bas à l'Erasmus Medical Center de Rotterdam et distibuted jeté le Erasmus Grille Bureau

    Pour plus de détails, voir sur la page d'accueil du projet


    Url du projet : http://svahesrv2.bioquant.uni-heidelberg.de/correlizer/index.php

    Url pour s'attacher : http://svahesrv2.bioquant.uni-heidelberg.de/correlizer/



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    Messages traduit par dudumomo :

    Ce serveur est géré par Erasmus Grid Office et est prévu d’être public,   nous avons besoin de faire certains changements sur le serveur web pour   tout régler correctement et ajouter quelques topics au forum, ce que   nous allons faire plus tard dans la semaine.

    Ci-dessous, quelques premières informations sur nous :
    Erasmus   Grid Office offre des services aux chercheurs dans le Centre Médical   Erasmus qui ont besoin de ressources de calcul très performantes pour   leurs projets.
    Il y a différentes infrastructures en grille dont nous   avons accès qui inclut des grilles de Desktop et des grilles de   clusters dédiés.

    Erasmus Computing Grid: Une collaboration entre   le Centre Médical Erasmus et le lycée de Rotterdam qui se composent de   grilles de Desktop basées sur Condor.

    D-Grid: L’initiative de   grille Allemande fonde par the Ministère fédéral de l’Education et de la   Recherche, une infrastructure en grille composée d’un grand nombre de   clusters dédiés a haute performance où ils utilisent Globus, LCG/gLite   et UNICORE comme middlewares.

    EDGeS (Enabling Desktop Grids for   e-Science), un projet Européen qui a pour but de créer une   infrastructure en grille composée de clients BOINC et XtremWeb.

    Fraunhofer  Playstation Cluster : Une collaboration entre le Fraunhofer ITWM et le   laboratoire de développement IBM a Böblingen qui se compose de milliers   de cores de processeurs Cells.

    Tout cela est contrôlé par un  backend qui s’occupe des taches liées aux grilles sur ces   infrastructures de nos utilisateurs, qui de leur coté utilisent un   frontend pour communiquer avec le backend. Correlizer est un de ces   services où le backend pourra éventuellement planifier des taches aux   serveurs BOINC et comme certains d’entre vous l’ont vu, AlmereGrid est   l’un de ces projets. Pour le moment, le pont n’est pas encore   complètement mis en place sur le Backend et le pipeline est installé   d’une façon un peu différente pour que ca fonctionne.
     
    Anis Abuseiris
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« Modifié: 10 juillet 2015 à 15:57 par tibidao »


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fzs600

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Re : correlizer@home
« Réponse #1 le: 02 août 2011 à 22:34 »
Merci pour l'info poly   :hello:

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supersnoopy

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Re : correlizer@home
« Réponse #2 le: 02 août 2011 à 22:49 »

+1, merci poly  :)    :jap:
De leurs épées ils forgeront des socs

samuel debergh

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Re : correlizer@home
« Réponse #3 le: 02 août 2011 à 23:01 »
rah encore un projet! :D

Jaehaerys Targaryen

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Re : correlizer@home
« Réponse #4 le: 02 août 2011 à 23:02 »
Si la trad est pas trop merdique, je mettrais bien la description en article sur le portail ?


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[AF>Libristes] nico8313

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Re : Re : correlizer@home
« Réponse #5 le: 02 août 2011 à 23:03 »
rah encore un projet! :D

Et oui !  va falloir que tu fasses 100 000 points sur celui là aussi  :D
ça commence à faire  :D

Ryzen

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Re : correlizer@home
« Réponse #6 le: 02 août 2011 à 23:35 »
c'est normal que ça soit le même nom d'application qu'AlmereGrid?

toTOW

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Re : correlizer@home
« Réponse #7 le: 03 août 2011 à 01:09 »
Ils devraient faire des url de projet encore plus pourries ... :ange:
FAH-Addict, première source d'information francophone sur le projet Folding@Home.

[AF>Libristes] Dudumomo

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Re : correlizer@home
« Réponse #8 le: 03 août 2011 à 01:54 »
Sur leur forum,
Citer
post#54 - there is reference to an AlmereGrid pdf document that mentions Erasmus:
http://boinc.almeregrid.nl/forum_thread.php?id=24#50

So, the client and purpose is one and the same, except that AlmereGrid implements the test (AlmereGrid TestGridand) production (AlmereGrid) versions and this one in Germany (correlizer) is the production version only.
But clearly they are coordinated efforts.
News & Tutorial on how to host your server: http://freedif.org

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Re : correlizer@home
« Réponse #9 le: 03 août 2011 à 06:55 »
Une réponse de l'admin  sur le fofo du projet   :kookoo:
http://svahesrv2.bioquant.uni-heidelberg.de/correlizer/forum_thread.php?id=1#6

Merci d'avance pour la traduction en francais   :ange:

 :jap:

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samuel debergh

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Re : correlizer@home
« Réponse #10 le: 03 août 2011 à 07:13 »
qu'est ce que ça peut ramer!

[AF>Libristes] Dudumomo

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Re : correlizer@home
« Réponse #11 le: 03 août 2011 à 10:41 »
Une réponse de l'admin  sur le fofo du projet   :kookoo:
http://svahesrv2.bioquant.uni-heidelberg.de/correlizer/forum_thread.php?id=1#6

Merci d'avance pour la traduction en francais   :ange:

 :jap:


En gros ca donne:

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Ce serveur est géré par Erasmus Grid Office et est prévu d’être public, nous avons besoin de faire certains changements sur le serveur oueb pour tout régler correctement et ajouter quelques topics au forum, ce que nous allons faire plus tard dans la semaine.

Ci-dessous, quelques premières informations sur nous :
Erasmus Grid Office offre des services aux chercheurs dans le Centre Médical Erasmus qui ont besoin de ressources de calcul très performantes pour leurs projets.
Il y a différentes infrastructures en grille dont nous avons accès qui inclut des grilles de Desktop et des grilles de clusters dédiés.

Erasmus Computing Grid: Une collaboration entre le Centre Médical Erasmus et le lycée de Rotterdam qui se composent de grilles de Desktop basées sur Condor.

D-Grid: L’initiative de grille Allemande fonde par the Ministère fédéral de l’Education et de la Recherche, une infrastructure en grille composée d’un grand nombre de clusters dédiés a haute performance où ils utilisent Globus, LCG/gLite et UNICORE comme middlewares.

EDGeS (Enabling Desktop Grids for e-Science), un projet Européen qui a pour but de créer une infrastructure en grille composée de clients BOINC et XtremWeb.

Fraunhofer Playstation Cluster : Une collaboration entre le Fraunhofer ITWM et le laboratoire de développement IBM a Böblingen qui se compose de milliers de cores de processeurs Cells.

Tout cela est contrôlé par un backend qui s’occupe des taches liées aux grilles sur ces infrastructures de nos utilisateurs, qui de leur coté utilisent un frontend pour communiquer avec le backend. Correlizer est un de ces services où le backend pourra éventuellement planifier des taches aux serveurs BOINC et comme certains d’entre vous l’ont vu, AlmereGrid est l’un de ces projets. Pour le moment, le pont n’est pas encore complètement mis en place sur le Backend et le pipeline est installé d’une façon un peu différente pour que ca fonctionne.
 
Anis Abuseiris
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Ca a l'air interessant
News & Tutorial on how to host your server: http://freedif.org

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Re : correlizer@home
« Réponse #12 le: 03 août 2011 à 10:58 »
 :jap:

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Infomat

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Re : correlizer@home
« Réponse #13 le: 04 août 2011 à 04:35 »
+1

J'ai eu des ut...sous win

Edit
J'ai des ut sous win sans erreur sur un i980x :hyperbon:
« Modifié: 10 août 2011 à 05:14 par Infomat »


[6c/ 12t] Intel i7-980X @3.7  2xNVidia GTX 760  AMD 6970    Windows 7 Pro x64 ou Windows 10 Pro x64 ou Linux 
ELAF= Electrons Libres de l'AF http://forum.electronslibres.boinc-af.org/

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Re : correlizer@home
« Réponse #14 le: 09 août 2011 à 15:50 »
Sur i7 45 Uts en erreurs de calculs  depuis hier soir

Citer
   8 Aug 2011 | 19:39:00 UTC    9 Aug 2011 | 8:17:46 UTC    Erreur en cours de calculs    2,958.91    1,282.81    ---    BioMedial Genome Correlations v1.00
   8 Aug 2011 | 19:38:30 UTC    9 Aug 2011 | 7:06:40 UTC    Erreur en cours de calculs    2,958.91    1,673.08    ---    BioMedial Genome Correlations v1.00
8 Aug 2011 | 19:39:37 UTC    9 Aug 2011 | 10:29:47 UTC    Erreur en cours de calculs    2,959.42    1,590.46    ---    BioMedial Genome Correlations v1.00

 :/

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Re : correlizer@home
« Réponse #15 le: 10 août 2011 à 00:16 »

Jaehaerys Targaryen

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Re : correlizer@home
« Réponse #16 le: 10 août 2011 à 00:31 »
merci j'ai effacé mon post....


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Re : correlizer@home
« Réponse #17 le: 14 août 2011 à 22:40 »
701 Ut en pending

324 en erreurs de calcul

Alors forcement j'avance pas   :rhaa: :rhaa:

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Jaehaerys Targaryen

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« Réponse #18 le: 15 août 2011 à 16:55 »


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Re : correlizer@home
« Réponse #19 le: 16 août 2011 à 11:29 »
Nouvelle application : Correlizer Beta Applications     1.00

http://svahesrv2.bioquant.uni-heidelberg.de/correlizer/apps.php

 :jap:

Pour cela ne pas oublier de cocher "Lancer les applications de test ?"  dans les préférences de votre compte.   
« Modifié: 16 août 2011 à 15:55 par fzs600 »

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Re : correlizer@home
« Réponse #20 le: 20 août 2011 à 13:38 »
Site pas mal du tout, projet boche, sujet assez intéressant, dommage qu'il n'y ait pas de message board. :cavachier:
Tu aimes Mathematica®, t'es un noob en informatique ou tu t'ennuies, c'est le moment d'aller sur HEImicro.

modesti

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Re : correlizer@home
« Réponse #21 le: 20 août 2011 à 18:00 »
Action de SG à venir sur ce projet ?

http://www.seti-germany.de/blog/2011/08/fruhstart-bei-correlizer/


T'as tout compris :D Ils veulent prendre la première place à SUSA

Viendez chez nous, cause qu'on est les meilleur(e)s :D


In memoriam Jip

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Re : correlizer@home
« Réponse #22 le: 21 août 2011 à 19:03 »
Paye bien les BETA    :p

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21 Aug 2011 | 3:53:30 UTC    21 Aug 2011 | 13:51:11 UTC    Terminé et validé    1,099.94    1,036.55    11.59    Correlizer Beta Applications v1.01
21 Aug 2011 | 2:38:48 UTC    21 Aug 2011 | 12:16:31 UTC    Terminé et validé    1,092.31    1,021.40    11.29    Correlizer Beta Applications v1.01

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Re : correlizer@home
« Réponse #23 le: 27 août 2011 à 08:17 »
Et hop 100k sur le projet !!   :lestat:

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Re : correlizer@home
« Réponse #24 le: 27 août 2011 à 09:41 »
bravo