Auteur Sujet: TN-Grid Test Platform  (Lu 29160 fois)

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franky82

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Re : TN-Grid Test Platform
« Réponse #175 le: 17 octobre 2020 à 09:44 »
News : Paper published on IEEE Transactions on Emerging Topics in Computing
https://gene.disi.unitn.it/test/forum_thread.php?id=298#2008
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Actualités : Article publié sur les transactions IEEE sur des sujets émergents en informatique
L'article suivant, «Un système informatique pour découvrir les relations causales entre les gènes humains pour améliorer le repositionnement des médicaments», est disponible dans la zone «Accès anticipé» sur IEEE Xplore.
Cet article a été accepté pour publication dans un prochain numéro de cette revue, mais n'a pas été édité et le contenu peut changer avant la publication finale. Cet article apparaît dans: IEEE Transactions on Emerging Topics in Computing , Digital Object Identifier: 10.1109 / TETC.2020.3031024.
Vous pouvez le trouver ici: https://ieeexplore.ieee.org/document/9224179 (voir cadre ci-dessous)
Merci à tous pour votre précieux soutien !
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Un système informatique pour découvrir les relations causales entre les gènes humains afin d'améliorer le repositionnement des médicaments
Extrait :
La découverte automatique de relations causales entre les gènes humains peut éclairer les processus de régulation des gènes et guider le repositionnement des médicaments. À cette fin, une méthode lourde de calcul pour la découverte causale est distribuée sur une grille de calcul volontaire et, en tirant parti du sous-ensemble variable et de la stratification, s'avère utile pour étendre les réseaux locaux de régulation des gènes. Les données d'entrée sont des mesures purement observationnelles de l'expression des transcriptions dans les tissus humains et les lignées cellulaires collectées dans le cadre du projet FANTOM. Le système s'appuie sur la plateforme BOINC et sur un code client optimisé. La pertinence fonctionnelle des résultats, mesurée en analysant les annotations des interactions identifiées, augmente significativement par rapport à la simple corrélation de Pearson entre les transcriptions. Aditionellement, dans 82% des cas, les réseaux se chevauchent significativement avec les interactions protéine-protéine connues annotées dans les bases de données biologiques. Dans les deux études de cas présentées, cette approche a été utilisée pour élargir les réseaux de gènes associés à deux pathologies humaines sévères: le cancer de la prostate et la coronaropathie. La méthode a identifié respectivement 22 et 36 gènes à évaluer comme de nouvelles cibles pour des médicaments déjà approuvés, démontrant l'applicabilité efficace de l'approche dans les pipelines visant le repositionnement des médicaments.

Lien PDF complet (en anglais) : https://ieeexplore.ieee.org/stamp/stamp.jsp?tp=&arnumber=9224179
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toTOW

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Re : TN-Grid Test Platform
« Réponse #176 le: 17 octobre 2020 à 20:37 »
Le projet est à sec ...
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[AF] fansyl

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Re : TN-Grid Test Platform
« Réponse #177 le: 20 octobre 2020 à 05:17 »
Peut-être parce qu'AMD leur fait bénéficier de puissance de calcul ? https://www.amd.com/en/corporate/hpc-fund

 :hello:
Je crunche dans le silence et c'est ma joie !
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franky82

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Re : Re : TN-Grid Test Platform
« Réponse #178 le: 20 octobre 2020 à 09:07 »
Peut-être parce qu'AMD leur fait bénéficier de puissance de calcul ? https://www.amd.com/en/corporate/hpc-fund

 :hello:

J'en ai parlé plus haut :
https://gene.disi.unitn.it/test/forum_thread.php?id=292#1945
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Our gene@home project (hosted by the University of Trento, Italy) has been chosen by AMD as a recipient for their COVID-19 HPC fund, see the official announcement https://www.amd.com/en/corporate/hpc-fund

We are really grateful to receive this donation, it will give us access to high performance computing nodes, boosting our research. More info and comments here: https://gene.disi.unitn.it/test/forum_thread.php?id=291
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Notre projet gene@home (hébergé par l'Université de Trento, Italie) a été choisi par AMD comme bénéficiaire de son fonds COVID-19 HPC, voir l'annonce officielle https://www.amd.com/en/corporate/hpc-fund

Nous sommes vraiment reconnaissants de recevoir ce don, il nous donnera accès à des nœuds de calcul haute performance, dynamisant notre recherche. Plus d'informations et commentaires ici: https://gene.disi.unitn.it/test/forum_thread.php?id=291
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Maeda

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Re : TN-Grid Test Platform
« Réponse #179 le: 07 mars 2021 à 09:03 »
modesti a posté dans le topic du RAID, mais pour info, un challenge Boincstat va démarrer demain à 13h00 (heure Paris).
Sous Linux ? => ⛏ Script pour suspendre / reprendre les UT | ☺Que faire avant un RAID/Pentathlon ? Passer l'aspirateur dans ses machines !

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modesti

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Re : TN-Grid Test Platform
« Réponse #180 le: 07 mars 2021 à 10:07 »
Ah nan, c'est pas moi :D Sans vouloir cafeter, c'est naz qui a trouvé ce challenge ;)

Viendez chez nous, cause qu'on est les meilleur(e)s :D


In memoriam Jip

Maeda

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Re : TN-Grid Test Platform
« Réponse #181 le: 07 mars 2021 à 10:58 »
Oups, désolé naz (si tu passes par là) :jap:.
Sous Linux ? => ⛏ Script pour suspendre / reprendre les UT | ☺Que faire avant un RAID/Pentathlon ? Passer l'aspirateur dans ses machines !

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naz

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Re : TN-Grid Test Platform
« Réponse #182 le: 07 mars 2021 à 11:26 »
 :jap:

JeromeC

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Re : TN-Grid Test Platform
« Réponse #183 le: 07 mars 2021 à 12:10 »
Et on est inscrit ? sur BoincStats ça dit que le founder doit inscrire son équipe aux challenges...
Parce que c'était lui, parce que c'était moi.

DocPhilou1966

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Re : Re : TN-Grid Test Platform
« Réponse #184 le: 07 mars 2021 à 12:47 »
Et on est inscrit ? sur BoincStats ça dit que le founder doit inscrire son équipe aux challenges...
Oui, j'ai vérifié ;)
 
13800346^131072+1   935,840 (decimal)   2019-01-27 Generalized Fermat Prime Search

modesti

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Re : TN-Grid Test Platform
« Réponse #185 le: 07 mars 2021 à 18:59 »
Et on est inscrit ? sur BoincStats ça dit que le founder doit inscrire son équipe aux challenges...
Depuis le temps tu devrais savoir que l'AF est inscrite d'office à tous les challenges ;)
:origin:

Viendez chez nous, cause qu'on est les meilleur(e)s :D


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Re : TN-Grid Test Platform
« Réponse #186 le: 07 mars 2021 à 19:07 »
Oh moi tu sais les choses qui se passent dans les hautes sphères, je m'intéresse pas trop :siflotte:
Parce que c'était lui, parce que c'était moi.

naz

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Re : TN-Grid Test Platform
« Réponse #187 le: 18 juin 2021 à 04:38 »

toTOW

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Re : TN-Grid Test Platform
« Réponse #188 le: 19 juin 2021 à 12:33 »
Du projet sur l'homme, il faut préciser. Il y a les autres études en attente ...
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