GPUGrid

[Hildor]

Moi, j'ai beaucoup d'erreurs sur les cuda31 
Je n'ai pas de cuda42

Je baisse un peu l'oc, pour voir 

[Jaehaerys Targaryen]

Des nouvelles unités short...

Hi dear volunteers,

I submitted tonight 500 WU on acemd (short) 12500 credits each.
The system is a beta-lactamase in complex with a negative charged fragment.

cheers,

Paola

p.s. sorry for the delay of the post....I am on vacations, but still thinking about work

[sebastien11]

Une nouvelle qui arrive chez GPUGRID, je viens de recevoir ma première unité NOELIA !! 

[Spica]

c'est Noel!!!  []

[sebastien11]

c'est Noel!!!  []

Je détecte une pointe d'ironie dans ton propos 

[nabz]

Une nouvelle qui arrive chez GPUGRID, je viens de recevoir ma première unité NOELIA !! 

D'après l'admin, Noelia est une nouvelle étudiante en doctorat : http://www.gpugrid.net/forum_thread.php?id=3073#26266

Pour mémoire, l'équipe du projet se présente ici : http://www.gpugrid.net/about.php

[JeromeC]

Noela je sais pas (encore), mais Paola... 

[sebastien11]

Noela je sais pas (encore), mais Paola... 

Oh la oh la, c'est un projet de biologie, pas d'anatomie !!!

[JeromeC]

Biologie, sciences humaines... tout ce qui parle du vivant, c'est intéressant !

[ordralfabetix]

 
Je viens de vous rejoindre.J'ai une geforce 65 avec 1023Mo de ddr3 en mémoire vidéo dédiée et 2806Mo de mémoire graphique disponible,version du pilote 8.17.13.132 et cuda 4.2 installé.
Je viens de télécharger ma première ut et j'en ai pour 106 heures 
Je me demande si ma configuration convient bien à ce projet.
merci d'avance.
EDIT:j'ai seven 64 édition familiale premium avec 4go de ram.

[sebastien11]

  Désolé, je ne trouve pas d'infos sur les geforce 65  , mais pour comparaisons avec une GTX 550ti, je mets entre 12 et 14 heures pour calculer une unité PAOLA, maintenant, tu as peut-être reçu une long run? As-tu édité tes préférences de projet sur GPUGRID ? Tu décoche "Long run" et ensuite tu devrais recevoir des unités IBUCH ou PAOLA ou NOELIA. 

[ordralfabetix]

Merci pour la réponse,
En fait j'avais bien long runs de coché.Je l'ai décoché ainsi que ACEMD beta.
J'ai plus qu'a patienter.

[sebastien11]

Merci pour la réponse,
En fait j'avais bien long runs de coché.Je l'ai décoché ainsi que ACEMD beta.
J'ai plus qu'a patienter.

[Jaehaerys Targaryen]

Hi guys!

I've just sent 500 WU to acemdbeta with 5250 credits each for the first phase of the simulations.

This equilibration step can only be done in the beta queue, so this is not a test, but already the real simulation. Once all this WU are finished I will be able to prolong all them in the long queue, giving a total batch of 3500 WU with around 50000 credits each, likely in the next two days.

The new system have already been in gpugrid: it is the domain SH2 but focusing on the interaction with fragment(s) and not with polypeptides as before. I will keep you updated once I send the second part! thank you Noelia

trad de google :

Salut les gars!

Je viens d'envoyer 500 WU pour acemdbeta avec 5250 crédits chacun pour la première phase des simulations.

Cette étape d'équilibrage ne ​​peut être fait dans la file d'attente beta, donc ce n'est pas un test, mais déjà la simulation réelle. Une fois tout cela terminé WU je serai en mesure de prolonger tous ceux dans la file d'attente longue, donnant un lot total de 3500 WU, avec près de 50000 crédits chacun, susceptibles dans les deux prochains jours.

Le nouveau système ont déjà été en GPUGRID: c'est le domaine SH2, mais en se concentrant sur l'interaction avec le fragment (s) et non pas avec des polypeptides comme avant. Je vous tiendrai au courant une fois que j'ai envoyer la deuxième partie! je vous remercie;) Noelia

[sebastien11]

j'ai eu 7 "run replica noelia" qui sont partie en erreur ! 

[JeromeC]

Et oui, Noelia ne supporte pas d'être clonée

[sebastien11]

Et oui, Noelia ne supporte pas d'être clonée

[ordralfabetix]

  tout le monde
J'ai une unité long runs en cours en priorité haute qui risque fort de ne pas être terminée à temps.
Lorsque je fais "mettre à jour",j'ai "not reporting or requesting tasks" dans le journal des évènements.
Est-ce normal?
EDIT:j'ai oublié de vous dire un grand:MERCI d'avance

[sebastien11]

Avec ma faible expérience sur GPUGRID, j'ai constaté que le projet envoi une nouvelle Ut, lorsque l'état d'avancement de l'UT en cours atteint 80 %. Je pense que si tu ne peux pas finir ton unité long run, il vaut mieux l'abandonner et le projet te renverra une autre unité. 

[ordralfabetix]

ouah,ultra rapide la réponse.
J'ai suivi ton conseil sebastien11 et le projet vient de m'envoyer une ut  paola de 57 heures.
On verra bien.
merci,

[sebastien11]

ouah,ultra rapide la réponse.
J'ai suivi ton conseil sebastien11 et le projet vient de m'envoyer une ut  paola de 57 heures.
On verra bien.
merci,

Oui, je ne sais pas ce que fait "PAOLA" aujourd'hui  , il m'en ont envoyé une de 60 heures cet après-midi  , alors qu'avant c'était 12 a 14 heures. Mais bon elle avance bien, après 5 heures de calcul l'estimation est tombé a 22 heures, probablement une erreur dans l'estimation !! 

[ordralfabetix]

probablement une erreur dans l'estimation !! 

Tu as surement raison parce que 57 heures la wu,c'est chaud...

[sebastien11]

C'est clair 

[fzs600]

 

De l'admin du projet :

En début fin de l'année prochaine, nous aimerions retirer les cuda3.1 applications.
Ce sont encore les applications anciennes et n'ont pas plusieurs des nouvelles fonctionnalités disponibles dans la nouvelle application dont nous avons besoin pour faire la science. Nous allons probablement avoir une application cuda4.2 seulement, donc dans les prochains mois, les pilotes doivent être mis à niveau vers cette version. Dans nos machines, la dernière version du pilote 304.51 fonctionne très bien sous Linux, très robuste. gdf

http://www.gpugrid.net/forum_thread.php?id=3176#27203

[toTOW]

De toutes façons ils sont tellement élitistes sur ce projet que ca fait un bail que mes 9800 GTX+ ne peuvent plus rien y faire