Sujet: GPUGrid

[[AF] fansyl]

Bonjour,

est-ce que quelqu'un arrive à calculer les unités Python apps for GPU hosts v4.04 (cuda1131) ?

Mes symptômes : aucune activité CPU ou GPU, tout reste à 0% et la tâche est bloquée à 4% au bout de 14h.

Sur un W10 avec une GTX 1080, pilotes à jour, environnement Python 3.10.4. J'ai recommencer le projet de zéro.

Une idée ?

 

[Yeux]

Chez moi toutes les unités partent en erreurs au bout de 2 minutes...

2 pcs Windows 11 avec GT 1030 + GTX 1070 + Quadro K5000 + GTX Titan.

 

[lepingouin]

Je ne sais si les causes sont communes mais toute les tâches Python apps for GPU hosts v4.03 (cuda1131) finissaient en erreur EOFerror.
Remarquant que le taux d'occupation CPU n'était pas de 0,99 comme affiché pour la tâche mais plutôt de 4 à 5 CPU, cela dépassait le nombre de CPU allouables et donc ça devait bourrer un poil... J'ai stoppé les autres tâches et Ô miracle, la tâche s'est bien terminée !

Avant :

Code: [Sélectionner]

33154350 27350219 29 Nov 2022 | 23:35:37 UTC 1 Dec 2022 | 2:24:52 UTC Erreur en cours de calculs 101,331.30 101,331.30 --- Python apps for GPU hosts v4.03 (cuda1131)

Après :

Code: [Sélectionner]

33156446 27349052 2 Dec 2022 | 16:22:22 UTC 3 Dec 2022 | 5:12:48 UTC Terminé et validé 161,817.80 161,817.80 105,000.00 Python apps for GPU hosts v4.03 (cuda1131) 

[fzs600]

 
Une nouvelle application en bêta test est disponible sur le projet.
ATM: Free energy calculations of protein-ligand binding
https://www.gpugrid.net/apps.php
Comme elle est en bêta test elle part en erreur de calcul.

   19 Jan 2023 | 8:34:44 UTC    19 Jan 2023 | 9:42:08 UTC    Erreur en cours de calculs    5,595.68    5,595.68    ---    ATM: Free energy calculations of protein-ligand binding v1.06 (cuda1121)

[[AF>Libristes] alain65]

 

Comme elle est en bêta test elle part en erreur de calcul.

   19 Jan 2023 | 8:34:44 UTC    19 Jan 2023 | 9:42:08 UTC    Erreur en cours de calculs    5,595.68    5,595.68    ---    ATM: Free energy calculations of protein-ligand binding v1.06 (cuda1121)

Pas forcément, j'en ai fait 3 ok:

33263461    27388647    188766    19 janv. 2023 | 5:26:49 UTC    19 janv. 2023 | 6:29:36 UTC    Terminé et validé    5 605,75    5 605,75    75 000,00    ATM : calculs d'énergie libre de la liaison protéine-ligand v1.06 (cuda1121)

[fzs600]

 

Comme elle est en bêta test elle part en erreur de calcul.

   19 Jan 2023 | 8:34:44 UTC    19 Jan 2023 | 9:42:08 UTC    Erreur en cours de calculs    5,595.68    5,595.68    ---    ATM: Free energy calculations of protein-ligand binding v1.06 (cuda1121)

Pas forcément, j'en ai fait 3 ok:

33263461    27388647    188766    19 janv. 2023 | 5:26:49 UTC    19 janv. 2023 | 6:29:36 UTC    Terminé et validé    5 605,75    5 605,75    75 000,00    ATM : calculs d'énergie libre de la liaison protéine-ligand v1.06 (cuda1121)

Je vois ça, ma deuxième UT a été calculé sans probleme. 

19 Jan 2023 | 15:51:50 UTC    19 Jan 2023 | 16:55:56 UTC    Terminé et validé    5,504.31    5,504.31    75,000.00    ATM: Free energy calculations of protein-ligand binding v1.06 (cuda1121)

[Maeda]

Une nouvelle application en bêta test est disponible sur le projet.
ATM: Free energy calculations of protein-ligand binding
https://www.gpugrid.net/apps.php
Comme elle est en bêta test elle part en erreur de calcul.

   19 Jan 2023 | 8:34:44 UTC    19 Jan 2023 | 9:42:08 UTC    Erreur en cours de calculs    5,595.68    5,595.68    ---    ATM: Free energy calculations of protein-ligand binding v1.06 (cuda1121)

J'en ai eu une (1 milliard de Gflops à calculer), elle a mis plus de 4 jours pour un total de 1 200 000 crédits. Ça doit être proportionnel au temps d'exécution j'imagine.

[toTOW]

C'est violent ...

[fzs600]

Une nouvelle application en bêta test est disponible sur le projet.
ATM: Free energy calculations of protein-ligand binding
https://www.gpugrid.net/apps.php
Comme elle est en bêta test elle part en erreur de calcul.

   19 Jan 2023 | 8:34:44 UTC    19 Jan 2023 | 9:42:08 UTC    Erreur en cours de calculs    5,595.68    5,595.68    ---    ATM: Free energy calculations of protein-ligand binding v1.06 (cuda1121)

J'en ai eu une (1 millions de Gflops à calculer), elle a mis plus de 4 jours pour un total de 1 200 000 crédits. Ça doit être proportionnel au temps d'exécution j'imagine.

Je viens de finir celle-ci.

30 Mar 2023 | 15:30:01 UTC    30 Mar 2023 | 19:15:55 UTC    Terminé et validé    13,512.51    11,372.48    1,125,000.00    ATMbeta: Free energy calculations of protein-ligand binding v1.09 (cuda1121)

[Maeda]

Celle que j'ai finie n'est pas estampillée Beta:
ATM: Free energy calculations of protein-ligand binding 1.14

[fzs600]

Celle que j'ai finie n'est pas estampillée Beta:
ATM: Free energy calculations of protein-ligand binding 1.14

Mes non-Beta. 

25 Mar 2023 | 9:07:29 UTC    25 Mar 2023 | 9:29:01 UTC    Terminé et validé    1,249.58    1,002.51    1,125,000.00    ATM: Free energy calculations of protein-ligand binding v1.14 (cuda1121)

   24 Mar 2023 | 16:04:10 UTC    25 Mar 2023 | 4:44:13 UTC    Terminé et validé    45,539.65    43,778.92    750,000.00    ATM: Free energy calculations of protein-ligand binding v1.14 (cuda1121)

24 Mar 2023 | 13:51:27 UTC    25 Mar 2023 | 8:34:31 UTC    Terminé et validé    67,091.01    56,292.95    1,125,000.00    ATM: Free energy calculations of protein-ligand binding v1.14 (cuda1121)

[JeromeC]

Celle qui te donne 1M de crédit pour 20mn, c'est, comment dire

Et après t'en as une autre qui te donne 750k pour 12 heures ?

Logique imparable

[Maeda]

Boinc et les crédits

[toTOW]

Les crédits fixes ... ça a ses avantages et ses inconvénients ...

[[AF>Amis des Lapins] Jean-Luc]

J'ai que chopé une tâche : il n'y en a pas beaucoup, ils sont à sec !

[toTOW]

Ca marche pas des masses leur truc :

Code: [Sélectionner]

20:29:56 (15180): wrapper: running C:/Windows/system32/cmd.exe (/c call run.bat)
  Running command git clone --filter=blob:none --quiet https://github.com/raimis/AToM-OpenMM.git 'E:\BOINC\Data\slots\2\tmp\pip-req-build-xbf0w744'
  Running command git rev-parse -q --verify 'sha^d7931b9a6217232d481731f7589d64b100a514ac'
  Running command git fetch -q https://github.com/raimis/AToM-OpenMM.git d7931b9a6217232d481731f7589d64b100a514ac
  Running command git checkout -q d7931b9a6217232d481731f7589d64b100a514ac
Warning: importing 'simtk.openmm' is deprecated.  Import 'openmm' instead.
Traceback (most recent call last):
  File "E:\BOINC\Data\slots\2\Scripts\rbfe_explicit_sync.py", line 8, in <module>
    rx.setupJob()
  File "E:\BOINC\Data\slots\2\lib\site-packages\sync\atm.py", line 82, in setupJob
    self.worker = OMMWorkerATM(ommsystem, self.config, self.logger)
  File "E:\BOINC\Data\slots\2\lib\site-packages\sync\worker.py", line 44, in __init__
    self.simulation.loadState(basename + "_0.xml")
  File "E:\BOINC\Data\slots\2\lib\site-packages\openmm\app\simulation.py", line 340, in loadState
    with open(file, 'r') as f:
FileNotFoundError: [Errno 2] No such file or directory: 'p38_protein_2-2aa-2bb_0.xml'
20:31:07 (15180): C:/Windows/system32/cmd.exe exited; CPU time 51.343750
20:31:07 (15180): app exit status: 0x16
20:31:07 (15180): called boinc_finish(195)
Faudrait leur dire que le core GPU de Folding@Home, c'est du OpenMM, et ça marche sans usine à gaz git et python ...

[[AF>Amis des Lapins] Jean-Luc]

Si je me détache du projet, et que je me rattache, je chope une WU et une seule.
Si je reste rattaché, je n'en chope plus une seule depuis 2 semaines !
C'est pareil chez-vous ?
Y'a une manip à faire pour en choper ?

PS : Je fais bien attention à l'état du serveur et je sais bien que je ne peux pas en choper quand il n'y en a plus de disponibles.
Mais c'est idem quand il y en a plein de disponibles.

[Maeda]

Avec l'outil magique j'en ai en continu (relatif : ça met une journée de calcul quasiment pour mon GPU).

[[AF>Amis des Lapins] Jean-Luc]

J'utilise l'outil magique, mais rien !

[toTOW]

Trop d'erreurs ?

[[AF>Amis des Lapins] Jean-Luc]

Non, c'est pas que je n'ai pas d'erreurs !
C'est plutôt que ma machine ne télécharge pas de tâche !

[it came from the desert]

Non, c'est pas que je n'ai pas d'erreurs !
C'est plutôt que ma machine ne télécharge pas de tâche !

En ce moment y'a que du Python Runtime disponible, c'est activé dans tes prefs GPUGRID ?

Autre option possible

If no work for selected applications is available, accept work from other applications?

mettre oui 

[[AF>Amis des Lapins] Jean-Luc]

Pardon : j'ai oublié de préciser, je n'ai coché que les ATM (beta) et ne veux que ces WUs-là !

 

[JeromeC]

Quand yanapa, yanapa.

[Arkhenia]

 

Venant de changer de carte graphique (Passage d'une GTX 1650 à une RTX 3060), j'ai voulu refaire du GPUGrid

J'ai testé les tâches ACEMD 3 qui passent sans problème

Par contre, dès que je selectionne des ATMBeta ou des Python GPU App elles se terminent toutes en erreur au bout de quelques secondes (voire minutes)

Exemple pour la dernière ATMBeta :

Code: [Sélectionner]

<core_client_version>7.20.2</core_client_version>
<![CDATA[
<message>
(unknown error) - exit code 195 (0xc3)</message>
<stderr_txt>
11:59:20 (16892): wrapper (7.9.26016): starting
11:59:20 (16892): wrapper: running python.exe (bin/conda-unpack)
11:59:21 (16892): python.exe exited; CPU time 0.000000
11:59:21 (16892): wrapper: running Library/usr/bin/tar.exe (xjvf input.tar.bz2)
Bace_protein_nH-4i-13m_0.xml
Bace_protein_nH-4i-13m_asyncre.cntl
Bace_protein_nH-4i-13m.inpcrd
Bace_protein_nH-4i-13m.prmtop
run.bat
run.sh
11:59:23 (16892): Library/usr/bin/tar.exe exited; CPU time 0.000000
11:59:23 (16892): wrapper: running C:/Windows/system32/cmd.exe (/c call run.bat)
11:59:24 (16892): C:/Windows/system32/cmd.exe exited; CPU time 0.000000
11:59:24 (16892): app exit status: 0x1
11:59:24 (16892): called boinc_finish(195)
0 bytes in 0 Free Blocks.
322 bytes in 4 Normal Blocks.
1144 bytes in 1 CRT Blocks.
0 bytes in 0 Ignore Blocks.
0 bytes in 0 Client Blocks.
Largest number used: 0 bytes.
Total allocations: 462472 bytes.

Je suis Windows 11 avec les drivers NVidia 531.41

Quelqu'un aurait-il une idée ?