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Auteur Sujet: Rosetta@home  (Lu 207466 fois)

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Hors ligne [AF] fansyl

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Réponse #1000 le: 11 June 2021 à 20:08
Les dernières UTs en vbox en provenance de Ralph@home tournaient pas trop mal sur mes machines mais aussi gourmande en RAM que les UTs Rosetta actuelles.

Hâte de voir la suite !

 :hello:

Je crunche dans le silence et c'est ma joie !
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Réponse #1001 le: 30 June 2021 à 19:52
https://twitter.com/RosettaAtHome/status/1408533111793586178
Citer
Les projets COVID-19 sur notre plateforme se dirigent vers des essais cliniques humains ! Nos incroyables volontaires en ligne ont joué un rôle dans le développement d'un nouveau vaccin prometteur ainsi que dans des traitements antiviraux candidats.
De toute l'équipe de @UWproteindesign , MERCI !

[video]

Pour en savoir plus sur cette recherche #proteindesign sur le coronavirus , visitez http:// ipd.uw.edu

Vaccins COVID-19 : https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33160446/

Antiviraux COVID-19 : https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32907861/
« Modifié: 30 June 2021 à 19:54 par franky82 »

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Réponse #1002 le: 06 July 2021 à 22:43
Une bonne nouvelle par les temps qui court...

 :hello:

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Réponse #1003 le: 11 July 2021 à 17:25
J'ai eu des taches en erreur de calcul sur ce projet ... première fois que je vois ça ... :(

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Réponse #1004 le: 11 July 2021 à 17:44
Première fois que t'as des erreurs avec rosetta ?? la chance..... (cf forum)

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Réponse #1005 le: 15 July 2021 à 13:52
En même temps j'en fais pas souvent vu le ratio temps passé / ressources consommées / points attribués ... :/

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Réponse #1006 le: 15 July 2021 à 17:05
Il faut servir la science et que ça soit ta joie.


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Réponse #1007 le: 24 July 2021 à 12:09
J'ai FAH pour ça ! :blbl:

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Réponse #1008 le: 17 September 2021 à 20:13
rosetta python projects
 :hyperbon:




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Réponse #1009 le: 17 September 2021 à 20:26
rosetta python projects
 :hyperbon:
Oui mais on ne peut toujours pas choisir l'application désiré.  :cavachier:


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Réponse #1010 le: 18 September 2021 à 12:10
La file de tâches de l'autre app est vide, donc maintenant t'as plus besoin de faire le choix.  :coffeetime:




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Réponse #1011 le: 19 September 2021 à 09:57
Vu les ressources demandées en RAM et espace disque, il serait de bon ton de pouvoir choisir les applications que l'on souhaite. ça va surement arriver.

 :hello:
« Modifié: 26 January 2024 à 12:40 par [AF] fansyl »

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Réponse #1012 le: 05 November 2021 à 13:43
Vu les ressources demandées en RAM et espace disque, il serait de bon ton de pouvoir choisir les applications que l'on souhaite. ça va surement arrivé.

 :hello:

En attendant et vu que les app Vbox demandent 8Go de RAM, un app_config  permet de resoudre le probleme.

Perso j'ai mis 2 sur les machines a 32Go de RAM, ca fait tourner 2 UT vbox (16Go) et le reste en UT normales.

<app_config>

<app>
   <name>rosetta_python_projects</name>
   <max_concurrent>1</max_concurrent>
</app>

</app_config>



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Réponse #1013 le: 05 November 2021 à 18:54
Oula je savais même pas qu'ils étaient passé à VB sur rosetta !!

Vu que mes projets VB ne marchaient plus (je pense suite à ma migration Big Sur fin août), c'est compromis... mais je vois qu'il y a toujours des tâches non VB, je sais pas si ça marche de mettre <max_concurrent>0</max_concurrent> dans un app_config ?

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Réponse #1014 le: 05 November 2021 à 18:59
J'ai essayé le <max_concurrent>0</max_concurrent> dans l'app_config :
ça ne fonctionne pas, il charge des tâches quand même !

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Réponse #1015 le: 05 November 2021 à 19:01
Mmmmm... je me suis toujours pas décidé de quoi faire sur ce "RAID"...

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Réponse #1016 le: 05 November 2021 à 21:55
Perso je n'ai encore jamais reçu de tâches VB sur Rosetta...


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Réponse #1017 le: 06 November 2021 à 07:40
Peut-être parce que tu es sur un Linux :D, et que c'est natif Linux.


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Réponse #1018 le: 06 November 2021 à 08:58
Bien vu :D


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Madmax

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Réponse #1019 le: 10 November 2021 à 18:39
Après avoir démarré le RAID en cours, pour Rosetta VM j'avais 40Gb d'utilisé sur le SSD, et en ram 20Go utilisé (2*8 + 4 pour l'OS) .  Je fais exprès de les laisser en cache quand j'utilise le pc car j'ai suffisamment de ram.
Par contre j'en avais une depuis 3 jours à 99% qui était définitivement coincée dans son calcul (je ne suis pas le seul et c'est pas récent apparemment), j'ai dû l'annuler.
Et c'est bizarre car la plupart des autres tâches du projet ODLK étaient "suspended" avec "en attente de mémoire" alors que j'avais attribué 30Go de ram à Boinc. Pas grave, si on ne peut modifier le xml pour ne pas avoir de soucis de VM Rosetta pendant ce RAID, je vais le laisser de côté en attendant.
« Modifié: 10 November 2021 à 18:48 par HD10180 »



Davlabedave

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Réponse #1020 le: 10 November 2021 à 19:05
Si la version de zou ne fonctionne pas chez vous peut etre que celui la fonctionnera
<app_config>
<app_version>
<app_name>rosetta_python_projects</app_name>
<plan_class>vbox64</plan_class>
<max_concurrent>xxx</max_concurrent>
</app_version>
<project_max_concurrent>xxx</project_max_concurrent>
</app_config>
En remplaceant les xxx bien sur

« Modifié: 10 November 2021 à 19:07 par Davlabedave »



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Réponse #1021 le: 10 November 2021 à 20:09
Ah ben oui c'est vrai, j'en ai parlé sur le topic du RAID, mais "trop de python tue le python" si je comprends bien, donc il vaut mieux limiter les python VB à une tâche à la fois ?

Et donc il faut que je tue celles qui tournent depuis + d'un jour (dont une deadline déjà dépassée) ? parce que le CPU tourne à fond pour les tâches en question, comment savoir que "définitivement coincée" ? moi j'ai *beaucoup* de RAM sur mon Mac et j'ai l'impression que sur Mac ces tâches consomment bien moins que ce que je lis pour windows, mac 1.5 Go par tâche j'ai l'impression, là il me reste plus de 13 Go de RAM de dispo avec 4 python + 3 normales en cours... (en les normales prennent parfois limite plus de RAM que les python !!) en tout mon boinc utilise à cet instant 5 Go de RAM.

(+ une VM linux de 8 Go de RAM qui fait des tâches OLDK/ODLK1 sous nux)
« Modifié: 10 November 2021 à 20:14 par JeromeC »

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Réponse #1022 le: 10 November 2021 à 21:29
Faut s'avoir qu'allocation, ça veut dire réserver mais pas qu'il va tout utiliser, ici les rosettta VM s'octroient 8Go mais n'utilisent pas tout.




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Réponse #1023 le: 10 November 2021 à 22:57
Bon j'ai tué les 2 tâches et limité les VB à 2 avec le xml de zou.

Wait & see.

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Réponse #1024 le: 11 November 2021 à 17:15
En fait c'est la Bérézina : "à cause du app_config et d'un bug de boinc" (en réalité j'ai limité à 1 tâche python), dixit le gars sur le topic que je cite, il a téléchargé 1000 tâches (normale / non python) sur mon mac...  :priz2tet:

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