Auteur Sujet: Rosetta@home  (Lu 141086 fois)

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JeromeC

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Re : Rosetta@home
« Réponse #900 le: 16 juillet 2019 à 08:55 »
"titulaire d'une bourse John Harvard Distinguished Science Fellow à Harvard"

Tout de suite ça pose un homme (où une femme) :)
Parce que c'était lui, parce que c'était moi.

Jakez Sulli

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Re : Rosetta@home
« Réponse #901 le: 17 juillet 2019 à 10:12 »
 :kookoo: Encore des nouvelles du projet : https://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=13199

"Comme vous l'avez peut-être entendu, l'Institute for Protein Design a récemment été sélectionné dans le cadre de The Audacious Project. Cette collaboration philanthropique à grande échelle, qui succède au Prix TED, fait émerger et finance des projets ayant le potentiel de changer le monde.

Par conséquent, nous élargissons notre équipe de scientifiques et d'ingénieurs basée à Seattle qui travailleront ensemble pour faire progresser Rosetta, notre logiciel de conception et de prédiction de la structure des protéines. Le financement nous permettra également d'investir dans l'équipement, les fournitures et l'espace de laboratoire nécessaires pour concevoir et tester des millions de protéines synthétiques.

Quels défis devrons-nous relever ? Regardez mon TED parler pour le savoir.

Tout ce travail - comme tout ce que nous faisons - dépendra de vous, les participants de Rosetta@home. Qu'il s'agisse de créer des nanomatériaux personnalisés ou des thérapies anticancéreuses plus sûres, nous nous appuyons sur la plate-forme informatique distribuée Rosetta@home. Nous ne vous remercierons jamais assez d'avoir pris le temps de participer à cette recherche passionnante, et nous espérons que vous direz à au moins un ami qu'eux aussi peuvent jouer un rôle dans la révolution du design des protéines en dirigeant Rosetta@home.

Je vous remercie,

David Baker
Directeur, Institute for Protein Design"

Traduit avec www.DeepL.com/Translator
« La connaissance s'acquiert par l'expérience, tout le reste n'est que de l'information.» - Albert Einstein
 

[AF] fansyl

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Re : Rosetta@home
« Réponse #902 le: 17 juillet 2019 à 19:59 »
Souhaitons leur bonne chance !

Un petit RAID d'automne pour leur filer un coup de main ?  :D

 :hello:
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naz

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Re : Rosetta@home
« Réponse #903 le: 10 octobre 2019 à 22:22 »
Depuis 1h il y a des UT sous Android  :hyperbon: :hyperbon: :hyperbon:

[AF] fansyl

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Re : Rosetta@home
« Réponse #904 le: 11 octobre 2019 à 07:21 »
Cool, j'ai une AndroidBox qui en a chopé 8, elles sont en cours  :hyperbon:

J'espère qu'il y aura d'autres lots avant peut-être une dispo permanente.

 :hello:
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franky82

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Re : Rosetta@home
« Réponse #905 le: 11 octobre 2019 à 10:30 »
Bon, mes 2 Android (smartphone et tablette) en croix avec Rosetta : impossible de cruncher du Rosetta !  :/
ça me fait un gag avec les préférences de BOINC : "calcul suspendu - 100 % de batterie - le calcul reprendra quand la batterie aurra atteint 20 %" (un truc dans le genre) !?   :pt1cable:
J'ai remis mes 2 Android sur WCG, projet avec lequel ça fonctionne parfaitement !
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naz

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Re : Rosetta@home
« Réponse #906 le: 11 octobre 2019 à 11:36 »
Rentre ces paramètres... :kookoo:

franky82

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Re : Rosetta@home
« Réponse #907 le: 11 octobre 2019 à 12:10 »
J'ai essayé ces réglages mais ça n'a rien voulu savoir !  :/
Tant pis, j'ai assez avec mes ordis pour finir le Raid (en bonne position) !  :D
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[AF] fansyl

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Re : Rosetta@home
« Réponse #908 le: 16 mars 2020 à 21:34 »
Pour ceux que ça intéresse, Rosetta a introduit certaines UTs en rapport avec le COVID-19 : https://www.ipd.uw.edu/2020/02/rosettas-role-in-fighting-coronavirus/

 :hello:
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[AF>Amis des Lapins] Jean-Luc

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Re : Rosetta@home
« Réponse #909 le: 17 mars 2020 à 09:01 »
Merci pour l'info !

Je termine proprement mes WUs NumberFields pour le raid et je bascule sur Rosetta avec mon CPU d'ici 3-5 jours.
Tant pis pour mon classement dans le raid.

Je vais aussi essayer de mobiliser des amis, qui ne font jamais de calcul partagé.
Peut-être auront-ils envie de "se battre" contre le virus de cette manière, en fait, la seule  dont nous soyons capable.
Je ne vois pas ce que je peux faire d'autre contre ce virus.
Je me dis que peut-être, si beaucoup de monde se mobilise, la recherche peut gagner 1, 2 ou 3 jours ou 1, 2 ou 3 semaines dans le combat, j'en sais rien ?
Et ce petit délai aura peut-être une certaine importance ?

En tout cas, je crois que je me sentirai un peu mieux si je me lance dans Rosetta...

Et dans GPUGrid s'ils proposent plus tard comme annoncé des tâches GPU contre le virus.



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Re : Rosetta@home
« Réponse #910 le: 17 mars 2020 à 09:19 »
Perso de mon coté j'ai fais un don à https://pasteur-lille.iraiser.eu/Cancer2020/~mon-don?utm_source=bing&utm_medium=cpc&utm_campaign=2020%20-%20Don%20-%20Marque&utm_term=pasteur%20don&utm_content=Pasteur

Bien rappelé que c'est eux qui on isolés les souches du coronavirus 2019-nCoV pour les transmettre au monde entier  :jap: Il ne faut pas oublier que se sont les particulier comme nous qui finançons les recherches à hauteur de 75%

Après je trouve ca très bien de faire don de ses CPU pour lutter contre ce virus. Je basculerais dessus après le Raid  :jap:
« Modifié: 17 mars 2020 à 09:21 par naz »

Contender

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Re : Re : Rosetta@home
« Réponse #911 le: 17 mars 2020 à 11:42 »
Je me suis remis boinc sur mon pc de bureau perso et pas pro, ça faisait longtemps que je n'avais pas touché à Rosetta :hello:
Bon, mes 2 Android (smartphone et tablette) en croix avec Rosetta : impossible de cruncher du Rosetta !  :/
ça me fait un gag avec les préférences de BOINC : "calcul suspendu - 100 % de batterie - le calcul reprendra quand la batterie aurra atteint 20 %" (un truc dans le genre) !?   :pt1cable:
J'ai remis mes 2 Android sur WCG, projet avec lequel ça fonctionne parfaitement !
Perso il ne me télécharge aucunes tâches sous android, pas grave.


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franky82

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Re : Re : Re : Rosetta@home
« Réponse #912 le: 17 mars 2020 à 11:52 »
Je me suis remis boinc sur mon pc de bureau perso et pas pro, ça faisait longtemps que je n'avais pas touché à Rosetta :hello:
Perso il ne me télécharge aucunes tâches sous android, pas grave.
ça fait un moment qu'il n'y a plus aucune tâche Android
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naz

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Re : Re : Re : Rosetta@home
« Réponse #913 le: 17 mars 2020 à 12:18 »
Je me suis remis boinc sur mon pc de bureau perso et pas pro, ça faisait longtemps que je n'avais pas touché à Rosetta :hello:
Bon, mes 2 Android (smartphone et tablette) en croix avec Rosetta : impossible de cruncher du Rosetta !  :/
ça me fait un gag avec les préférences de BOINC : "calcul suspendu - 100 % de batterie - le calcul reprendra quand la batterie aurra atteint 20 %" (un truc dans le genre) !?   :pt1cable:
J'ai remis mes 2 Android sur WCG, projet avec lequel ça fonctionne parfaitement !
Perso il ne me télécharge aucunes tâches sous android, pas grave.

Y'en a pas! Parcontre il y a du yoyo! Si tu fais une tache de numberfield et tu laisse tourner ton android sur yoyo t'es parti pour participer au raid  :kookoo:

Maeda

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Re : Re : Rosetta@home
« Réponse #914 le: 17 mars 2020 à 23:21 »
Perso de mon coté j'ai fais un don à https://pasteur-lille.iraiser.eu/Cancer2020/~mon-don?utm_source=bing&utm_medium=cpc&utm_campaign=2020%20-%20Don%20-%20Marque&utm_term=pasteur%20don&utm_content=Pasteur

Bien rappelé que c'est eux qui on isolés les souches du coronavirus 2019-nCoV pour les transmettre au monde entier  :jap: Il ne faut pas oublier que se sont les particulier comme nous qui finançons les recherches à hauteur de 75%

Après je trouve ca très bien de faire don de ses CPU pour lutter contre ce virus. Je basculerais dessus après le Raid  :jap:
J'hésite aussi à switcher sur du Rosetta + Folding@home pour le GPU (et stopper Collatz). Avec le rapport du Raid, ma CG risque d'être plus utile à Folding qu'à Collatz.

Je me tâte tellement que je pense le faire :)

Mais 75% me paraît énorme ! S'ils utilisaient certains supercalculateurs GPU ou CPU (disponibles en France) pendant ne serait-ce qu'une demi-journée, je suis sûr qu'ils plieraient largement plus que tout ce qu'ils ont en ce moment.
Sous Linux ? => ⛏ Script pour suspendre / reprendre les UT | ☺Que faire avant un RAID/Pentathlon ? Passer l'aspirateur dans ses machines !

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[AF>Amis des Lapins] Jean-Luc

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Re : Rosetta@home
« Réponse #915 le: 20 mars 2020 à 18:38 »
Ça y est : j'ai reçu plein de WUs intitulées "COVID-19" sur Rosetta.
C'est la première fois en ce qui me concerne...


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Re : Rosetta@home
« Réponse #916 le: 20 mars 2020 à 18:46 »
Les serveurs doivent saturer un peu : j'ai des UT en attente de fin de téléchargement ou en attente de renvoi...

Ça y est : j'ai reçu plein de WUs intitulées "COVID-19" sur Rosetta.
C'est la première fois en ce qui me concerne...
Ah ! et à quoi on peut les reconnaître ? ça s'affiche en clair ou c'est codé ?
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[AF>Amis des Lapins] Jean-Luc

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Re : Rosetta@home
« Réponse #917 le: 20 mars 2020 à 21:20 »
Je t'invite à regarder la capture d'écran jointe.
C'est dans le nom, colonne de droite, mais tu dois déplacer la barre pour les voir, l'image est très grande et c'est sur la partie cachée à droite.
« Modifié: 20 mars 2020 à 21:21 par [AF>Amis des Lapins] Jean-Luc »


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Re : Rosetta@home
« Réponse #918 le: 20 mars 2020 à 21:25 »
Ah oui !
Du coup, j'ai regardé sur mes ordis et j'en ai quelques-un également !
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Re : Rosetta@home
« Réponse #919 le: 22 mars 2020 à 10:50 »
Mes tâches sur Rosetta :

26 valides
7 erreurs

WAOUH !
Le taux d'échec est énorme !
Et ce n'est pas comme pour Collatz, ça ne se met pas en erreur au bout de 2 secondes.
Ça calcule parfois pendant 25000 secondes avant de planter.

MAIS, j'ai remarqué que les noms des WUs qui plantent ont tous l'intitulé "IGNORE_THE_REST".
Les autres ne semblent pas partir en erreur.
Je vais purger les "IGNORE_THE_REST" de mon BM.
Je ne vois pas d'autre solution. Mais ce sera laborieux !!!

AVEZ-VOUS LE MÊME PROBLÈME CHEZ-VOUS ?



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Re : Rosetta@home
« Réponse #920 le: 22 mars 2020 à 11:13 »
Oui, quelques erreurs de temps en temps mais ça reste raisonnable...

J'ai un autre soucis, ce sont les UT qui ne finissent pas de se télécharger : "Erreur en cours de téléchargement (sens download)"
alors que d'autres UT se chargent sans problème, celles-là se mettent en attente et ne finissent pas de charger, même si on force dans le BM...
quand je m'en aperçois, je les annule.
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Re : Rosetta@home
« Réponse #921 le: 22 mars 2020 à 11:24 »
Les Rosetta mini prennent plus de temps que les Rosetta "tout court" chez moi (~8H00 contre 7) sur mon 2600K@4,00 GHz.

Pareil chez vous où j'ai un soucis de config ?
Boincstat
Projets du moment
Config principale : i7 2600K@4,0 GHz / 32 Go@1333 MHz / R9 290X (Win 10)
Crunchbox passives : i7-4785T / 8 Go@1600 MHz / Akasa Euler S (Debian) || i3-4130T / 4 Go@1600 MHz / Akasa Euler (Debian)
ARM : 2*H3 + 1*S905X + 3*S912 | RAID : 2*L5408 + 1*E3110
Boinc@Raspberry Pi | Boinc et Linux | Date fin de projets

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Re : Rosetta@home
« Réponse #922 le: 22 mars 2020 à 11:51 »
La durée par défaut des UT chez Rosetta est +- 8h. Il se peut que certaines mettent moins de temps. Je crois que les "mini" c'est juste parce qu'elles bouffent moins de RAM.

Viendez chez nous, cause qu'on est les meilleur(e)s :D


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JeromeC

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Re : Rosetta@home
« Réponse #923 le: 22 mars 2020 à 13:12 »
On pouvait pas paramétrer la durée des tâches sur le compte rosetta ? ou je confonds avec un autre projet ?
Parce que c'était lui, parce que c'était moi.

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Re : Rosetta@home
« Réponse #924 le: 22 mars 2020 à 13:20 »
Si on peut, mais généralement les gens oublient :)

Viendez chez nous, cause qu'on est les meilleur(e)s :D


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