Le Forum de l'Alliance Francophone

Nouvelles:

  • Projet du Mois FB: Primegrid

Auteur Sujet: Rosetta@home  (Lu 210524 fois)

0 Membres et 1 Invité sur ce sujet

Hors ligne JeromeC

  • CàA
  • Boinc'eur devant l'éternel
  • *****
  • Messages: 31349
  •   
Réponse #1050 le: 11 February 2022 à 12:52
Sauf si tu t'en sers par ailleurs, ça ne sert pas que pour boinc... mais bon c'est bien de savoir qu'il y a maintenant une solution.

A quoi bon prendre la vie au sérieux, puisque de toute façon nous n’en sortirons pas vivants ? (Alphonse Allais)



Hors ligne toTOW

  • Boinc'eur devant l'éternel
  • *****
  • Messages: 4539
  •   
    • FAH-Addict.net
    • E-mail
Réponse #1051 le: 11 February 2022 à 20:17
Ca tombe bien, je m'en sers pas ... :D

FAH-Addict, première source d'information francophone sur le projet Folding@Home.


Hors ligne PhilTheNet

  • Boinc'eur devant l'éternel
  • *****
  • Messages: 2139
  •   
    • E-mail
Réponse #1052 le: 20 February 2022 à 08:37
Toutes les UTs partent en erreur : (sur deux PC windows différents)

Dommage je comptais en faire qlqes unes...


<core_client_version>7.16.11</core_client_version>
<![CDATA[
<message>
(unknown error) - exit code 3221225477 (0xc0000005)</message>
<stderr_txt>
command: projects/boinc.bakerlab.org_rosetta/rosetta_4.20_windows_x86_64.exe @movingstub_gzm1_minimize_3CL_AVLstub_0229_35_extract_B.flags -nstruct 10000 -cpu_run_time 28800 -boinc:max_nstruct 20000 -checkpoint_interval 120 -mute all -database minirosetta_database -in::file::zip minirosetta_database.zip -boinc::watchdog -boinc::cpu_run_timeout 36000 -run::rng mt19937 -constant_seed -jran 1302704
Using database: database_357d5d93529_n_methyl\minirosetta_database


Unhandled Exception Detected...

- Unhandled Exception Record -
Reason: Access Violation (0xc0000005) at address 0x000000000000000F


 :cavapobienmwa:
« Modifié: 20 February 2022 à 13:04 par PhilTheNet »




Hors ligne Antares

  • Intel I7 12700 CG Zotac 4060TI CM Gigabite B760 I7 3.6 Ghz 12700K WC Be Quiet Pure Loop 2 ventilos SSD 1To Ram DDR4 32 go 3200
  • Méchant modo
  • Boinc'eur devant l'éternel
  • ******
  • Messages: 7287
  •   
    • E-mail
Réponse #1053 le: 20 February 2022 à 11:35
Ici aussi...

Quand le dernier arbre sera abattu, la dernière rivière empoisonnée, le dernier poisson capturé, alors le visage pâle réalisera que l'argent ne se mange pas.

Sitting Bull



Hors ligne toTOW

  • Boinc'eur devant l'éternel
  • *****
  • Messages: 4539
  •   
    • FAH-Addict.net
    • E-mail
Réponse #1054 le: 20 February 2022 à 11:48
Pour une fois qu'il y en a, ils les foirent ... :/

FAH-Addict, première source d'information francophone sur le projet Folding@Home.


Hors ligne PhilTheNet

  • Boinc'eur devant l'éternel
  • *****
  • Messages: 2139
  •   
    • E-mail
Réponse #1055 le: 21 February 2022 à 10:27
Bon du coup j'ai activé les UTs virtualbox et la ca me dis "VirtualBox jobs require hardware acceleration support. Your processor does not support the required instruction set"

j'ai vérifié les paramètres pour virtualbox et ils sont bons alors j'ai activé le projet QuChemPedIA@home qui lui lance bien une UT virtualbox donc...

Nota: QuChemPedIA@home a planté au bout de s
"21/02/2022 10:25:32 | QuChemPedIA@home | Output file cl9_athome_b3lyp-321gd,batch123,001239982,nwchem,1632297729_4_r1030667066_1 for task cl9_athome_b3lyp-321gd,batch123,001239982,nwchem,1632297729_4 absent" mais ca c'est un autre pb

 :gno:




Hors ligne Arkhenia

  • Boinc'eur Junior
  • **
  • Messages: 173
  •   
Réponse #1056 le: 21 February 2022 à 12:04
Bon du coup j'ai activé les UTs virtualbox et la ca me dis "VirtualBox jobs require hardware acceleration support. Your processor does not support the required instruction set"

j'ai vérifié les paramètres pour virtualbox et ils sont bons alors j'ai activé le projet QuChemPedIA@home qui lui lance bien une UT virtualbox donc...

Nota: QuChemPedIA@home a planté au bout de s
"21/02/2022 10:25:32 | QuChemPedIA@home | Output file cl9_athome_b3lyp-321gd,batch123,001239982,nwchem,1632297729_4_r1030667066_1 for task cl9_athome_b3lyp-321gd,batch123,001239982,nwchem,1632297729_4 absent" mais ca c'est un autre pb

 :gno:

 :hello:

Voila ce qui est dit dans ton profil QuchempedIA : Virtualbox (6.1.32) installé, le processeur est incompatible avec la virtualisation matérielle

Voir du côté du bios pour activer la virtualisation du processeur

 :hello:



Hors ligne PhilTheNet

  • Boinc'eur devant l'éternel
  • *****
  • Messages: 2139
  •   
    • E-mail
Réponse #1057 le: 21 February 2022 à 12:37
Non justement c'est pas ca, la virtualisation est activée

Ca fait maintenant 1h20 qu'une UT virtualbox de QuChemPedIA@home tourne et j'ai toujours le msg "VirtualBox jobs require hardware acceleration support. Your processor does not support the required instruction set" de la part de Rosetta...

 :D

Edit: question posée sur le forum de Rosetta
« Modifié: 21 February 2022 à 14:52 par PhilTheNet »




Hors ligne Yeux

  • Modéré
  • Boinc'eur Junior
  • *
  • Messages: 145
    • E-mail

Hors ligne Fabien31

  • P'tit Nouveau
  • *
  • Messages: 3
  •   
Réponse #1059 le: 07 June 2022 à 15:07
Bonjour à tous,
Je viens de m'apercevoir qu'aucune nouvelle tache Rosetta n'arrivait sur Boinc. Normal ?
Fabien



Hors ligne [AF] Kalianthys

  • Boinc'eur devant l'éternel
  • *****
  • Messages: 1291
  •   
    • Astrophotographe
Réponse #1060 le: 07 June 2022 à 17:33
Salut.

Actuellement avec le projet Rosetta@home il y a peu de tâches dites "classique", du coup on a souvent l'impression de rien recevoir.

En revanche, il y a maintenant des tâches "Python" qui nécessite d'avoir Virtual Box d'installé donc peut être que tu n'as pas Virtual Box sur ta machine.

Ceci dit, les tâches Python de Rosseta n'ont pas bonne presse car elles nécessitent beaucoup de RAM.

Kali.






Hors ligne Xe120

  • CàA
  • Boinc'eur devant l'éternel
  • *****
  • Messages: 1525
  •   
    • E-mail
Réponse #1061 le: 07 June 2022 à 18:56
Si jamais des tâches virtualbox plantent, le projet retire l'option dans le profil du pc.




Hors ligne Oncle Bob

  • Boinc'eur devant l'éternel
  • *****
  • Messages: 5349
  •   
Réponse #1062 le: 07 June 2022 à 19:34
Je ne touche rien avec une Android TVBox avec son S912 :(

Boincstat
Projets du moment
Config principale : i7 2600K@4,2 GHz / 32 Go@1333 MHz / GTX 970 (Win 10)
Crunchbox passives : i7-4785T / 8 Go@1600 MHz / Akasa Euler S (Debian) || i3-4130T / 4 Go@1600 MHz / Akasa Euler (Debian)
ARM : 1*S922 + 1*H3
Boinc@Raspberry Pi | Boinc et Linux | Date fin de projets


Hors ligne JeromeC

  • CàA
  • Boinc'eur devant l'éternel
  • *****
  • Messages: 31349
  •   
Réponse #1063 le: 07 June 2022 à 22:04
Disponible il n'y a clairement que des python (5k).

Y'a pas mal de rosetta normales dans la nature (18k)  mais 0 dispo. Donc ça doit arriver au compte goutte / annulations / deadlines dépassées, sauf s'ils génèrent de nouveaux batchs.

A quoi bon prendre la vie au sérieux, puisque de toute façon nous n’en sortirons pas vivants ? (Alphonse Allais)



Hors ligne Fabien31

  • P'tit Nouveau
  • *
  • Messages: 3
  •   
Réponse #1064 le: 08 June 2022 à 09:04
Bonjour,
Merci pour les infos.
Vivement que WCG reprenne.
Bonne journée.



Hors ligne JeromeC

  • CàA
  • Boinc'eur devant l'éternel
  • *****
  • Messages: 31349
  •   
Réponse #1065 le: 08 June 2022 à 10:30
Y'a pas *que* Rosetta et WCG même si tu veux faire "que du biomédical" : tu as

- sidock (y'a du taff, linux + windows)
- TN-Grid (y'a du taff, linux + windows + mac)
- GPUGrid (dur d'avoir du taff / windows + linux mais GPU only il me semble / pas tous les GPU)
- (bientôt) Denis
- RNA-World aussi (mais y'a pas de taff)
« Modifié: 08 June 2022 à 10:35 par JeromeC »

A quoi bon prendre la vie au sérieux, puisque de toute façon nous n’en sortirons pas vivants ? (Alphonse Allais)



Hors ligne Fabien31

  • P'tit Nouveau
  • *
  • Messages: 3
  •   
Réponse #1066 le: 08 June 2022 à 11:17
Y'a pas *que* Rosetta et WCG même si tu veux faire "que du biomédical" : tu as

- sidock (y'a du taff, linux + windows)
- TN-Grid (y'a du taff, linux + windows + mac)
- GPUGrid (dur d'avoir du taff / windows + linux mais GPU only il me semble / pas tous les GPU)
- (bientôt) Denis
- RNA-World aussi (mais y'a pas de taff)

Merci




Hors ligne JeromeC

  • CàA
  • Boinc'eur devant l'éternel
  • *****
  • Messages: 31349
  •   
Réponse #1068 le: 08 June 2022 à 16:17
Mais ce n'est pas Boinc.

Exactement, et on est pas dans la bonne section du forum  :cavachier:

A quoi bon prendre la vie au sérieux, puisque de toute façon nous n’en sortirons pas vivants ? (Alphonse Allais)



Hors ligne JeromeC

  • CàA
  • Boinc'eur devant l'éternel
  • *****
  • Messages: 31349
  •   
Réponse #1069 le: 09 July 2022 à 22:16

A quoi bon prendre la vie au sérieux, puisque de toute façon nous n’en sortirons pas vivants ? (Alphonse Allais)



Hors ligne Yeux

  • Modéré
  • Boinc'eur Junior
  • *
  • Messages: 145
    • E-mail
Réponse #1070 le: 10 July 2022 à 00:36
"L'IPD est heureux d'annoncer que le premier médicament protéique conçu a été approuvé à l'étranger.

Félicitations et merci à tous les contributeurs de Rosetta@home ! L'informatique que vous avez fournie a grandement contribué à relever les défis de la conception de protéines de novo, tels que le développement de vaccins, ce qui a permis des percées comme celle-ci.

Pour plus d'informations, vous pouvez consulter l'article sur les vaccins de l'IPD.

Une vidéo est également disponible ici.


Extrait du site d'information de l'IPD :

- Les tests cliniques ont montré que le vaccin surpasse celui d'Oxford/AstraZeneca.

- Le vaccin à base de protéines, désormais appelé SKYCovione, ne nécessite pas de congélation.

- L'Université de Washington renonce aux redevances pour la durée de la pandémie.

- La Corée du Sud va acheter 10 millions de doses pour un usage domestique

Un vaccin contre le COVID-19 mis au point à la faculté de médecine de l'université de Washington a été approuvé par le ministère coréen de l'alimentation et de la sécurité des médicaments pour une utilisation chez les personnes âgées de 18 ans et plus. Le vaccin, désormais connu sous le nom de SKYCovione, s'est révélé plus efficace que le vaccin d'Oxford/AstraZeneca vendu sous les noms de marque Covishield et Vaxzevria.

SK bioscience, la société qui dirige le développement clinique du SKYCovione à l'étranger, cherche maintenant à faire approuver son utilisation au Royaume-Uni et au-delà. S'il est approuvé par l'Organisation mondiale de la santé, le vaccin sera mis à disposition dans le cadre de COVAX, un effort international visant à distribuer équitablement les vaccins COVID-19 dans le monde entier. En outre, le gouvernement sud-coréen a accepté d'acheter 10 millions de doses pour un usage domestique.

Les scientifiques de Seattle à l'origine du nouveau vaccin ont cherché à créer un vaccin COVID-19 de "deuxième génération", sûr, efficace à faible dose, simple à fabriquer et stable sans congélation. Ces caractéristiques pourraient permettre une vaccination à l'échelle mondiale en atteignant des personnes dans des régions où les ressources médicales, de transport et de stockage sont limitées.

"Nous savons que plus de deux milliards de personnes dans le monde n'ont pas reçu une seule dose de vaccin", a déclaré David Veesler, professeur associé de biochimie à la faculté de médecine de l'UW et co-développeur du vaccin. "Si notre vaccin est distribué par le biais de COVAX, cela lui permettra d'atteindre les personnes qui ont besoin d'y avoir accès."

L'Université de Washington accorde une licence gratuite sur la technologie du vaccin pour la durée de la pandémie.

Félicitations et merci encore à tous les contributeurs de R@h !"

Traduit avec www.DeepL.com/Translator (version gratuite)

Perso je ne fais plus Rosetta, les unités se chargent et progressent mais l'occupation des cpus restent à zéro... apparement ils sont passés sous VM... pas une réussite...



Hors ligne JeromeC

  • CàA
  • Boinc'eur devant l'éternel
  • *****
  • Messages: 31349
  •   
Réponse #1071 le: 10 July 2022 à 12:38
Article publié sur le portail.
ça voulait bien dire publié sur le portail :lol:

Mais bon c'est vrai que de nos jours, tous ces clics, ça fatigue ;)

A quoi bon prendre la vie au sérieux, puisque de toute façon nous n’en sortirons pas vivants ? (Alphonse Allais)



Hors ligne Xe120

  • CàA
  • Boinc'eur devant l'éternel
  • *****
  • Messages: 1525
  •   
    • E-mail
Réponse #1072 le: 10 September 2022 à 14:16
Citer
Rosetta@home: Notice from server
VirtualBox jobs require hardware acceleration support. Your processor does not support the required instruction set.

Ah bah c'est bien gênant ça.
Ça fonctionnait avant et maintenant j'ai même plus de LHC aussi, donc Vbox fonctionne plus avec Boinc.
J'ai bien la virtualisation d'activé sur le pc (windows 11), Vbox reconnu dans les logs du Boinc manager.
J'ai mis à jour Boinc sur la dernière version, Vbox mis à jour aussi.
J'ai vérifié que le paramètre est bien activé dans le client_state.
J'ai vérifié que j'accepte les tâches virtualisés sur l'ordinateur dans le profil rosetta.

Une idée ?




Hors ligne [AF>Libristes] ElGuillermo

  • Boinc'eur Respectable
  • ****
  • Messages: 636
  •   
    • E-mail
Réponse #1073 le: 10 September 2022 à 14:35
T'aurais pas activé WSL des fois ?



Hors ligne Xe120

  • CàA
  • Boinc'eur devant l'éternel
  • *****
  • Messages: 1525
  •   
    • E-mail
Réponse #1074 le: 10 September 2022 à 14:42
WSL et HyperV désactivé, seulement la virtualisation d'activé dans windows.