Rosetta@home

[arnaud25]

                                                                                                                               



Salut.
Statut : actif
Un nouveau projet: Rosetta@home
Application disponible : https://boinc.bakerlab.org/rosetta/apps.php
État du serveur : https://boinc.bakerlab.org/rosetta/server_status.php
L'alliance francophone : https://boinc.bakerlab.org/rosetta/team_display.php?teamid=30

EDIT rom_185 :

Projet du laboratoire Backer, département de Biochimie de l'Université de Washington.
Modélisations de protéines pour à terme aider les chercheurs à développer des traitements pour lutter contre certaines maladies (Malaria, Anthrax, VIH, Alzheimer, Cancer de la Prostate ,...)       

Le projet expliqué par l'AF
Etat des serveurs
Joindre l'AF
Mémoire vive recquise : 512 Mo
Durée des unités de 6 heures par défaut quelque soit votre machine
Plateformes : Linux, Mac et Windows

Mis a jour par fzs600 le 26 mars 2022

[intello222222]

ça à l'air comme predictor non ??

[Douglas Riper]

il y a déja une AF http://boinc.bakerlab.org/rosetta/team_display.php?teamid=30  

Je ne suis pas expert en bio je trouve que la description est proche de ProteinPredictor

[patouchon]

ben vi c'est la reflexion que je me suis fait en moi même, personellement...
qqun peut nous zespliquer ?

[Setiknocker]

Il y a une autre team : http://boinc.bakerlab.org/rosetta/team_display.php?teamid=37
la team France@Rosetta    

[Douglas Riper]

Il y a une autre team : http://boinc.bakerlab.org/rosetta/team_display.php?teamid=37
la team France@Rosetta    

http://forum.boinc.fr/boinc/LAllianceFrancophone/Public-relations-sujet-59-2.htm#t4394

je me passerai de commentaires on me demande de rester courtois

[Setiknocker]

Oui, tu as raison, j'avoue que pour ma part, ce mec me fait plutôt sourire tellement il a l'air ridicule...
Le pôvre... :pfff:
Il a déclaré une guerre ouverte et s'étonne que tout le monde n'adhère pas à ses projets "officiels"...
Bah, Il y a des rêveurs partout...  
Le but principal est de collaborer, pas de se faire la guerre, qu'il s'amuse  :sol:
En attendant, ses crédits ne sont guère élevés, c'est un digne représentant de ses diverses équipes en bois...
  FCCPU!!!

[Nightbird]

ben vi c'est la reflexion que je me suis fait en moi même, personellement...
qqun peut nous zespliquer ?

ce sont les mêmes buts
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=7

Thank you for your interest in helping our and similar projects, like Predictor@home!!!

[mamouth]

Après avoir survolé le site je me dis que ça ressemble
à prédictor en + beau et plus pro
j'ai pas eu le courage de lire toute les explications compliquées ( en anglais en  + )

ils mentionnent clairement le SIDA et le Cancer dans leur priorités de reherche

Projet intèressant à suivre donc avec des Wu assez longues ( plusieurs dizaines d'heures  )  

[Douglas Riper]

donc plus comme du folding quoi ?

[raphcl]

Cela me fait penser au projet "fightaidsathome".
Mais celui ci semble etre different.

[mamouth]

Alors il y a déjà des articles dans la presse concernant ce projet

http://www.telegraph.co.uk/connected/main.jhtml?xml=/connected/2005/09/21/ecfori21.xml

http://www.hhmi.org/news/baker4.html

Alors le projet se passe à l'université de washington et les chercheurs vont afficher ce genre de poster


dans le campus pour inciter les étudiants à utiliser BOINC
Le directeur est même impliqué et il a promis des prix pour les meilleurs
cool non ?


Ma première Wu temps estimé 180 heures 90 % calculé après 10H

2 autres wu en cache temps estimé 4H

je vous tiens au courrant ce soir je devrais avoir 1 ou 2 Wu terminées

[mamouth]

Tant que j'y suis

Rosetta à le même but que prédictor mais utilise une méthode différente pour y arriver
D'après le site de rosetta leur méthode serait la plus moderne et performante ... je suppose que chez prédictor ils vont dire la même chose

aussi point important les résultats seront publiés

Q2 - R@H is non-profit and for science, all results will be available to the public. The Rosetta application is licensed to pharma but most of the proceeds go to further research, for example - it funds an annual Rosetta development conference that brings researchers from various universities together. The application is available for free to academic users.

[Douglas Riper]

j'aime bien l'affiche

[philmo]

Marrant le slogan de celle là : http://www.boinc.bakerlab.org/rosetta/hfs_posters/HFS_BOINC_POSTER1.jpg

[mab74fr]

j'aime mieux celle citée par mamouth :



It's almost as noble as giving blood
- but without the juice and cookies

C'est presque aussi noble que de donner son sang
- mais sans le jus de fruits et les gateaux

[Douglas Riper]

ca serait pas mal ce genre de truc en français avec un joli boinc.fr

[raphcl]

Je vais demander a mon Proviseur si on ne pourrait pas afficher quelque chose sur Boinc dans mon lycee...

[Douglas Riper]

Bonne initiative

[Djezz]

Pour les affiches, je vais bosser dessus ce week-end.

[Douglas Riper]

bah pour ce genre d'initiative je propose qu'on en parle dans ce topic http://forum.boinc.fr/boinc/LAllianceFrancophone/Teams-Public-relations-sujet-59-1.htm

[symaski62]

http://boinc.bakerlab.org/rosetta/results.php?hostid=1004
 
1667 mhz et avec 256 mo de mémoire vive "seulement"
 
3H00 = 1 wu    
 
alo  ^^

[raphcl]

Merci symaski62 pour les infos.
Vu la frequence CPU tu dois avoir un 2000+.
Je devrais donc etre assez proche avec mon 2200+ et 512 mo de mémoire vive.
Mais par contre je me demande si le fait de partager les ressources avec un autre projet ne bloque pas Rosetta.
Car j'ai l'impression de ne finir des WU que quand Rosetta est seul.

[raphcl]

J'ai l'impression que il existait deja un logiciel nomme "HMMSTR/Rosetta Prediction" qui etudiait la structure tertiaire d'une protéine. Mais qui n'avait rien a voir avec le calcul distribue, son but etant l'etude et la visualisation pour les chercheurs.
Voici le site : http://pole-modelisation.univ-bpclermont.fr/prive/fiches_HTML/hmmrosetta.html

Je cherche toujours les differences exactes entre Predictor et Rosetta, quelqun ici pourrais nous expliquer ?

[yannva]

Rosetta a visiblement du mal avec le partage. En effet si je ne le laisse pas seul ma WU reprend toujours à 83.33 % sans jamais se terminer...