Récapitulatif des projets de la catégorie biologie

[tibidao]

Au fur et à mesure que les projets s'accumulent, je trouve que les différentes catégories de cette section du forum perdent en lisibilité.
Mon idée est donc de faire un bilan des projets, de leur statut... sans faire de doublons avec ce qui est déjà fait.
Pour chaque projet présent dans la catégorie je mettrais le lien du topic dans le forum.
Le but est double : faire un "résumé" des projets du coin, et permettre au gens de (re)trouver les discussions sur chaque projet. 


Dernière mise à jour : 11/05/2016



Projets actifs

• CAS@home :
  Plateforme multiprojets.
  Statut : Alpha
  Un projet à caractère biomédical :
  

  • TreeThreader

  Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,3599.0.html
  
  
• Citizen Science Grid :
  Plateforme multiprojets
  Statut : beta
  Un projet à caractère biomédical :
  

  • DNA@home
    Sujet DNA@home sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,3498.0.html

  Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,6236.0.html
  
  
• DENIS@home :
  Statut : Alpha
  Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,6525.100.html
  
  
• EDGes@Home (Enabling Desktop Grids for e-Science) :
  Plateforme multiprojets
  Statut : Alpha
  Deux projets à caractère biomédical :
  

  • Autodock 4.2.3
    
    
  • Autodock VINA

  Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,3173.0.html
  
  
• FIND@Home (anciennement FightMalaria@home) :
  Statut : Alpha
  Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,6364.0.html
  
  
• GPUGrid :
  Statut : beta
  Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2325.0.html
  Topic spécial dédié "GPU sur boinc" : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,1588.0.html
  
  
• Ibercivis :
  Plateforme multiprojets.
  Statut : alpha, pas de travail actuellement (pas de nouvelles depuis le 01/06/15)
  Cinq applications à caractère biomédical :
  

  • bindsurf : massively parallel drug nanoscale
    
    
  • Drug liberation simulations at the nanoscale
    
    
  • GROMACS based calculations
    
    
  • mcgi : beta application
    
    
  • soluvel

  Informations sur Ibercivis en général
  Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,702.0.html
  
  
• MalariaControl.net (Africa@home) :
  Statut : Projet stable
  Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,1969.0.html
  
  
• MindModeling@Home (beta) :
  Statut : beta
  Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,705.0.html
  
  
• NRG (Najmanovich Research Group) :
  Statut : alpha
  Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,4573.msg296351.html#msg296351
  
  
• POEM :
  Statut : beta
  Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2312.0.html
  
  
• Ralph (Rosetta ALPHa) :
  Statut : test permanent, alpha
  Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,1914.0.html
  
  
• RNA World (beta) :
  Statut : beta (virtualbox nécessaire)
  Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,3273.0.html
  
  
• Rosetta@home :
  Statut : Projet stable
  Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2319.0.html
  
  
• the Lattice project :
  Statut : beta, projet intermittent
  Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2292.0.html
  
  
• TN-Grid Test Platform :
  Statut : Alpha
  Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,5921.0.html
  
  
• World Community Grid (WCG) :
  Plateforme multiprojets
  Statut : Projet stable
  Quatre projets à caractère biomédical
     
  

  • FightAIDS@Home
    Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,4806.0.html
    
    
  • FightAIDS@Home - Phase 2
    Sujet sur le forum :
    
    
  • Mapping Cancer Markers
    Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,5828.0.html
    
    
  • Outsmart Ebola Together
    Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,6370.0.html
    
    
  • Uncovering Genome Mysteries
    Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,6308.0.html
    
    

  Informations sur WCG
  Statut de l'ensemble des projets : http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProjects.do
  Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,3797.0.html
  


• Yoyo@home :
  Sous-projet: Evolution@home
  Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,690.0.html
  Article du portail relatif à Evolution@home: http://www.boinc-af.org/projets-ecologie/865-evolutionhome-yoyohome.html
  
  

Sujet sponsorisé par l'Équipe De La Science (EDLS)   

[tibidao]

 Projets terminés/suspendus

• AlmereGrid Boinc Grid :
  Statut : Inactif
  Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,689.0.html
  
  
• Artificial Intelligence System (AIS) : site inaccessible
  Statut : Arrêté à cause d'un certain nombre de "circonstances défavorables" ; le projet était à but lucratif.
  Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,686.0.html
  
  
• BioChemical Library (BCL)  (Ancien CSBP) : site inaccessible
  Statut : Arrêté par manque de budget
  Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2304.0.html
  
  
• Cels : site inaccessible
  Statut : Arrêté, puis repris puis disparu...
  Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2314.0.html
  
  
• correlizer@home :
  Statut : Suspendu depuis le 20/12/2014
  Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,4301.0.html
  
  
• DNA@Home : site inaccessible
  Statut : Projet fusionné dans la plateforme multiprojets Citizen Science Grid
  Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,3498.0.html
  
  
• docking :
  Statut : Terminé par manque de ressources, le 23 mai 2014
  Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2323.0.html
  
  
• Drug@home :
  Statut : Jamais vraiment lancé, aucune nouvelle depuis 2013
  Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,5564.0.html
  
  
• DrugDiscovery@home :
  Statut : Suspendu, migration des serveurs et de la base de données depuis juillet 2014
  Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2316.0.html
  
  
• evo@home : site inaccessible
  Statut : Projet abandonné
  Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,4073.0.html
  
  
• EvoGrid :
  Statut : Jamais lancé en fait....
  Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,3122.0.html
  
  
• GA@home : site inaccessible
  Satut : Projet mort-né
  Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,3746.0.html
  
  
• Genetic Life : site inaccessible
  Statut : Arrêté par manque de budget
  Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2322.0.html
  
  
• IGEM@home : site inaccessible
  Statut : projet d'étudiants pour un concours, terminé
  Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,6271.0.html
  
  
• MindModeling@PALM_project :
  Statut : Projet de test interne de MindModeling, ne délivre pas d'unités de travail
  Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,4960.0.html
  
  
• Neurona@home : site inaccessible
  Statut : Terminé avec succès
  Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,4255.msg281367.html#msg281367
           
  
• Physiome@home (anciennement identifikace@kofrlab) : site inaccessible
  Statut : Suspendu puis disparu (août 2015)
  Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,6494.0.html
  Sujet sur le premier projet au nom imprononçable : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,4162.0.html
  
  
• Predictor : site inaccessible
  Statut : Terminé, le projet était déconseillé par L'AF
  Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2300.0.html
  
  
• Predictor alpha : site inaccessible
  Statut : Terminé, il s'agissait de predictor version test permanent
  Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2297.0.html
  
  
• Proteins : site inaccessible
  Statut : Terminé
  Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2326.0.html
  
  
• PS3Grid :
  Statut : L'équipe a abandonné l'application PS3 pour se concentrer uniquement sur l'application GPUGrid
  Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2306.0.html
  
  
• Simap : site inaccessible
  Statut : Projet arrêté
  Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2294.0.html
  
  
• SimOne@home : site inaccessible
  Statut : terminé
  Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,4662.0.html
  
  
• Superlink@technion : site inaccessible
  Statut : Terminé
  Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2317.0.html
  
  
• Synchronised : site inaccessible
  Statut : terminé
  Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,5725.0.html
  
  
• Tanpaku :
  Statut : Terminé avec succès
  Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2310.0.html
  
  
• UCT malaria : site inaccessible
  Statut : Terminé
  Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,2305.0.html
  
  
• Virus Respiratorio Sincitial (VRS) : site inaccessible
  Statut : Terminé avec succès
  Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,3598.0.html
  
  
• Projets terminés sur World community Grid :
  Statut : Terminés avec succès
  

  
  

  • Discovering Dengue Drugs - Together (Ensemble, découvrons un médicament contre la dengue)  - Phase 1
    Sur le site de L'AF : http://www.boinc-af.org/projets-termines-suspendus/743-ensemble-decouvrons-un-medicament-contre-la-dengue-wcg.html
    
    
  • Discovering Dengue Drugs - Together (Ensemble, découvrons un médicament contre la dengue)  - Phase 2
    Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,4801.0.html
    
    
  • Drug Search for Leishmaniasis
    Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,4809.0.html
    
    
  • Genome Comparison (Comparaison du Génome)
    Sur le site de L'AF : http://www.boinc-af.org/projets-termines-suspendus/670-fiocruz-genome-comparison-wcg.html
    
    
  • GO Fight Against Malaria
    Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,4808.0.html
    
    
  • Help Conquer Cancer (Aider à Vaincre le Cancer)
    Sur le site de L'AF : http://www.boinc-af.org/content/view/814/219/
    
    
  • Help Cure Muscular Dystrophy (Lutte contre la Dystrophie musculaire) - Phase 1
    
    
  • Help Cure Muscular Dystrophy (Lutte Contre la Dystrophie Musculaire) - Phase 2
    Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,4802.0.html
    
    
  • Lutte contre le cancer (help defeat cancer)
    Sur le site de L'AF : http://www.boinc-af.org/projets-termines-suspendus/669-help-defeat-cancer-wcg.html
    
    
  • Help Fight Childhood Cancer (Aide à la lutte contre le cancer chez les enfants)
    Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,4803.0.html
    
    
  • Repliement du protéome humain (Human proteome Folding) - Phase 1
    
    
  • Repliement du protéome humain (Human Proteome Folding) - Phase 2
    Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,1922.0.html
    
    
  • Recherche d'Antiviraux contre la Grippe (Influenza Antiviral Drug Search)
    Sur le site de L'AF : http://www.boinc-af.org/projets-termines-suspendus/1091-recherche-dantiviraux-contre-la-grippe-wcg.html
    
    
  • Du riz pour l'humanité (Nutritious Rice for the World)
    Sur le site de L'AF : http://www.boinc-af.org/projets-sciences-de-la-vie/947-du-riz-pour-lhumanite-wcg.html
    
    
  • Say No to Schistosoma
    Sujet sur le forum : http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,4807.0.html
    

  
  

Bien entendu, pour ceux qui ont des suggestions de présentation à faire ; s'il y a des erreurs, inexactitudes ou oublis à signaler, n'hésitez pas. 

[modesti]

Beau travail, tibi

[julien76100]

Rien à dire, très bon travail. Il serait bien si un modo pouvait le mettre en post-it.

[tibidao]

je suis modo, mais je ne savais pas comment on faisait "la mise en post it". Mais après avoir lu ton message j'ai eu de l'inspiration, et j'ai trouvé.   [:yada44:5]

merci julien pour ton aide.  

[julien76100]

Mais de rien  
Désolé je savais pas que tu étais modo.  

[tif_inégalitéScapitalismTTdroitesÉcocide5gPubNucGafam-CRIMES]

mais ça s'étoffe grave dis-don...    

juste, genetic-life est en version gamma (je savais même pas que ça existait   )

[tibidao]

ha oui, j'avais même pas fait gaffe  
Alpha, beta, gamma... au moins la logique est respectée.  

[tibidao]

Petite mise à jour, avec ajout des projets qui manquaient. Reste plus que WCG à mettre, mais comme on dit, "coming soon".  
Normalement je suis bon au niveau des statuts (notamment si on peut télécharger des unités), mais je ne suis pas sur Genetic life, GPUGrid et PS3Grid. Donc si erreur, merci de me prévenir.
(Je vais d'ailleurs m'inscrire sur genetic life pour me tenir au courant, même s'il m'attire pas trop).

 

[[AF>Libristes] Dudumomo]

Ah ba je vois pourquoi tu as fais le tri !    
Genetic Life marche bien, pas de prob  

[RLDF]

il me semble que aqua est un projet bio mais non recommandé
le sous-projet docking d'ibercivis est bio
le sous-projet evolution de yoyo@home aussi ?
mindmodeling, et artificial intelligence, je ne sais pas si c'est assimilé à du bio

[rom_185]

Aqua c'est pour faire des ordinateurs quantique .
 

[tibidao]

Merci pour les retours...  

il me semble que aqua est un projet bio mais non recommandé
le sous-projet docking d'ibercivis est bio
le sous-projet evolution de yoyo@home aussi ?
mindmodeling, et artificial intelligence, je ne sais pas si c'est assimilé à du bio

En fait je me suis basé pour l'instant sur les projets présents dans la catégorie, d'où l'absence de certains projets.
Aqua, effectivement ça semble pas être un projet bio...  
Docking d'ibercivis, et evolution de yoyo sont effectivement à prendre en compte, mais est-ce que sur ibercivis on peut sélectionner ses projets ?
Mindmodeling  et artificial intelligence sont particulier, pour moi c'est pas des projets bio...    ce qui expliquerait pourquoi ils ne sont pas dans cette catégorie.  

[rom_185]

mais est-ce que sur ibercivis on peut sélectionner ses projets ?

Waip, comme sur yoyo, c'est tout pareil .

[tibidao]

Bon, j'ai avancé un peu, j'ai rajouté les projets de WCG. à cause d'une limitation technique du forum, j'ai pas pu présenter les projets comme je l'aurais aimé, j'aime pas trop comme ça mais c'est le moins pire que j'ai trouvé.  [:douglas riper:1]

Par contre, pour le lien concernant WCG en général sur le site de l'AF, il faut être inscrit, je me demande bien pourquoi.  

Donc il me reste à mettre le statut des projets WCG, que je ne connais pas (à part celui sur la distrophie) ; puis je mettrais les projets bio de yoyo et d'ibercivis.  

[mamouth]

Pour WCG tu as oublié The Clean Energy Project

à ma connaissance actuellement tous les projets actifs de WCG on du travail


Edit : Sauf si tu classes CEP dans les projets écologiques et pas bio  :whistle:

Edit 2 : pour le statut d'avancement des projets tu as ça :
http://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread?thread=18277

[tibidao]

   mamouth

Aucune image sur ton lien ne s'affiche chez moi....  

Pour clean energy project, c'est le projet de WCG qui n'est pas bio, donc je l'ai pas mis.
Faut bien laisser des projets pour les autres catégories  

Pour le travail, il n'y en a pas qui sont plus ou moins intermittent ? faudrait que je vérifie...  

[fr@ntz]

Tu prends les pré-alpha ?
http://boinc.drugdiscoveryathome.com/

[tibidao]

drugdiscovery, je vais voir ça assez rapidement
Bon, avec la migration il y a quelques petite choses qui changent, dont les liens sur le forum forcément. 
D'autre part, faut que je vois où se trouvent les limites de se forum ci 

[tibidao]

hé on m'a piqué des projets, ils se trouvent dans la catégorie "boinc et les projets distribués".
Sauf avis contraire, je les rappatrie dans le coin. Non mais 

EDIT : c'est bon, j'ai rapatrié les projets (CSB, genetic life et Cels) ; j'ai aussi modifié tout les liens vers les sujets, liens qui ont changé avec le changement de forum. J'ai rajouté DrugDiscovery sinon. 

[modesti]

excellent boulot tibi

[[AF>Libristes] Dudumomo]

Merci !!

[[AF>Libristes>Jip] Elgrande71]

Merci pour ton boulot. 

[viny]

Ho grand maitre, puis je surveiller ta mise à jour au cas ou j'aurai raté un truc pour le nouveau fofo des projets du domaine bio-medical de l'EDLS que j'essaye de mettre à jour.



http://www.boincedls.org/forum/viewforum.php?id=14

[tif_inégalitéScapitalismTTdroitesÉcocide5gPubNucGafam-CRIMES]

salut toutes et tous

m'enfin...    ce topic devrait être scotché quoi !

oualà, c'est tout