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Auteur Sujet: Tanpaku - [Projet Terminé]  (Lu 31715 fois)

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Hors ligne arnaud25

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le: 18 March 2006 à 16:40
Tanpaku: http://issofty17.is.noda.tus.ac.jp/index_E.php
Citer
"TANPAKU" is the project that is aiming at attacking "protein structure prediction" problem by using "distributed computing" method. This project is developed in collaboration with Yamato lab.(in the Department of Biological Science and Technology) and Takeda lab.(in the Department of Information Sciences) groups at Tokyo University of Science. Now, the project finished a preliminary test within our university and it is open for public volunteers.
# NOTE - TANPAKU uses BOINC client version 4. They are planning to upgarede to version 5 soon.  This MAY mean it will not run on your computer until they upgrade!
# Also NOTE - Most of this site is in Japanese, but is actively being translated.
Source: BoincSynergy
« Modifié: 09 May 2012 à 13:47 par Polynésia dit "Double-Face" »



Hors ligne Black Hole Sun

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Réponse #1 le: 18 March 2006 à 18:31
impossible de voir si les résultats du projet seront dans le domaine public ou pas :o



Hors ligne philmo

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Réponse #2 le: 18 March 2006 à 23:35
:lol: effectivement si on ne comprend pas ce qui est écrit on ne pourra jamais savoir (les pages en anglais ne contiennent pas l'info d'après ce que j'ai vu)...
Help !



Hors ligne pas93

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Réponse #3 le: 19 March 2006 à 10:26
Qui parle japonais ? Peut être si j'arrive à joindre un amis qui parle Japonais mais alors le taux de le contacté s'élève à peine à 0,5% :D



Hors ligne jmb59

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Réponse #4 le: 19 March 2006 à 10:47
qui veut me payer une barette de shit de ram pour gérer tous les projets en même temps :??: :lol:



Hors ligne mandrake

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Réponse #5 le: 19 March 2006 à 12:56
 :non: Les barettes ce n'est pas bien  :kaola:

Que la magie passe ...


Hors ligne bichou

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Réponse #6 le: 12 April 2006 à 20:47
toujours pas d'éclaircissement sur le projet ? :??:



Hors ligne BlackStar95

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Réponse #7 le: 12 April 2006 à 21:47
les inscriptions sont ouvertes ...
mais impossible de s'attacher au projet ( il
faut la v.4 de boinc :(  bizard

Phenom@2.6Ghz (Overclock) ; nVidia 9500GT ; 2Go | Mandriva 2009.1 x86_64


Hors ligne BlackStar95

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Réponse #8 le: 12 April 2006 à 22:02

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Hors ligne pas93

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Réponse #9 le: 13 April 2006 à 03:34
Citation de: nicodu95
les inscriptions sont ouvertes ...
mais impossible de s'attacher au projet ( il
faut la v.4 de boinc :(  bizard



Ce n'est pas Bizard c'est juste que le projet existe depuis très longtemps et il na même pas encore passer ses serveurs à la version 5.x.x. ;) Seulement comme il était complètement en japonais s'était dur d ele voir :lol:  Mais depuis qu'il est en anglais il est de plus en plus connu :bounce:  :bounce:



Hors ligne BlackStar95

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Réponse #10 le: 13 April 2006 à 09:21
ouais mais pas moyen de savoir si les résultat sont publics ou non ... :(

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Hors ligne pas93

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Réponse #11 le: 13 April 2006 à 13:22
Non la course pour savoir ça est terrible. Peut être un e-mail. :sarcastic:



Hors ligne shann

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Réponse #12 le: 13 April 2006 à 17:49
Ca y est j'ai renvoyé mes premiers calculs.
Je suis 1er de l'AF
et l'AF est maintenant classée en  24eme position



Hors ligne BlackStar95

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Réponse #13 le: 13 April 2006 à 17:50
OK alors je te rejoins !!!
(Quand ils auront mis leur serveur à jour  :D )

Une WU dure combien de temp ?  :(

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Hors ligne shann

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Réponse #14 le: 13 April 2006 à 18:52
entre 5 et 10 Mn par Wu.

Il faut absolument une V4 de Boinc pour faire tourner le projet, ca tombe bien, au taf je n'ai pas les droits suffisants pour installer autre chose...



Hors ligne BlackStar95

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Réponse #15 le: 13 April 2006 à 19:22
moi j'ai la derniere la 5.2.13 et ça ne marche pas ... et j'ai pas envie de faire un downgrade  :D

Phenom@2.6Ghz (Overclock) ; nVidia 9500GT ; 2Go | Mandriva 2009.1 x86_64


Hors ligne shann

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Réponse #16 le: 15 June 2006 à 19:17
Ca y est, ils se sont décidés à passer à la version 5.xx de BOINC le 21 Juin
Citer
June 15, 2006
Important!
TANPAKU server will be down from 21 June to 22 June for upgrade and maintenance. You will use BOINC client version 5.
Ca va surement faire venir plus de monde sur ce projet



Hors ligne shann

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Réponse #17 le: 22 June 2006 à 19:37
Ca y est , la V5 de BOINC est là, par contre pas de boulot pour l'instant.....



Hors ligne Heyoka

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Réponse #18 le: 08 July 2006 à 16:03
Voilà la description du projet est en ligne sur le site de l'AF.
http://www.boinc-af.org/index.php?option=com_content&task=view&id=209&Itemid=219

Ce qui est intéressant c'est que ce projet est complémentaire de Rosetta et Simap.

Simap : constitution d'une grande base de donnée publique sur les protéines.
Rosetta : Prediction de la structure des Proteines à l'aide d'une méthode traditionnelle (recherche actuelle)
Tanpaku (recherche future) : mise au point d'une nouvelle méthode (dynamique brownienne) qui permettra dans le long terme de simuler les protéines en faisant appelle à une puissance de calcul beaucoup moins grande que ce qu'il est exigé avec la méthode traditionnelle.
Dynamique Brownienne en chimie, chaque acide animé est représenté par 1 à 3 pseudo-atomes : http://www.lcp.u-psud.fr/Pageperso/thissen/seminaires/ExpoSacquin.ppt


Il n'y a qu'à voire le projet Rosetta qui espére arriver à une puissance de calcul de 150 teraflops rien que pour le projet Rosetta, et pour n'analyser qu'une infime partie de protéines. Donc là on voit bien que la recherche actuelle se heurte à un problème de puissance de calcul gigantesteque que même Boinc ne pourrait pas fournir.
En plus Rosetta n'est pas seul dans le domaine il y a aussi Predictor,Folding, HPF sous WCG, tout ces projets auraient besoin d'une puissance de calcul énorme
D'ou l'utilité de Tanpanku :jap:

Donc ces 3 projets se complétent largement.


Hors ligne Heyoka

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Réponse #19 le: 15 July 2006 à 18:42
Arrivez vous à renvoyer vos unités vers le serveur de Tanpaku, depuis ce matin je n'y arrive pas .
En plus j'ais au moins 100 unités à renvoyer :(
Et comme la deadline est très courte, il faut que je les renvois avant ce soir 23h55


Hors ligne popolito

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Réponse #20 le: 13 August 2006 à 22:35
Qu'en est-il au sujet de la disponibilité des résultats ?
Car, ce projet est très intéressant, mais je ne leur fais pas trop confiance (bien qu'il y est un effort avec par exemple la "results gallery"). Dans la description du projet, ils ne parlent pas des résultats (de plus, la frontière entre le privé et le public chez les japonais.. :D)



Hors ligne popolito

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Réponse #21 le: 14 August 2006 à 17:26
Up =D



Hors ligne Heyoka

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Réponse #22 le: 17 August 2006 à 13:59
Je pense qu'il ne doit pas y avoir de problème.
C'est un projet de l'université de Tokyo, et apparement il ont dejà publié pas mal de papiers scientifiques assez détaillés
http://issofty17.is.noda.tus.ac.jp/doc/papers.html

Et la projet en lui même n'a pas de débouchés à court ou moyen terme, c'est juste la mise au point d'une nouvelle méthode innovante qui ne sera exploitable que dans plusieurs années.
Les modélisations de protéines dans ce projet sont juste des tests , ce qui est intéressant dans le projet c'est la mise au point de la nouvelle méthode de prédiction des protéines
Si toutes les étapes de cette méthode une fois mise au point sont détaillés dans un journal scientifique, n'importe quel scientifique à travers le monde pourra utiliser cette méthode.


Pour être complétement sure, peut être faudrait-il leur demander sur le message board
http://issofty17.is.noda.tus.ac.jp/forum_forum.php?id=1


Hors ligne Heyoka

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Réponse #23 le: 28 August 2006 à 13:09
Je voudrais poser une question sur le forum de Tanpaku à propos de l'utilisation des résultats.
Pouvez-vous corriger voire rajouter des phrases, parsqu'écrire en anglais c'est pas trop mon truc :p
Si possible je voudrais la poser ce soir

Je pose la question ici : http://issofty17.is.noda.tus.ac.jp/forum_forum.php?id=1

Il me faudrait aussi un titre :o

Citer
will be the results of this project 100% public ?
The use of this new methods will be completely free for education and public research ?
Many members of l'Alliance Francophone need to know that to invest itself on the Tanpaku project.


Hors ligne arnaud25

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Réponse #24 le: 28 August 2006 à 18:20
Citation de: Heyoka

will be the results of this project 100% public ?
The use of this new methods will be completely free for education and public research ?
Many members of l'Alliance Francophone need to know that to invest itself on the Tanpaku project.
[/quote]
Will the results of this project be 100% public ?
Will the use of these new methods be completly free for education and public research ?
Many members of the team l'Alliance Francophone need to know that to invest (themselves ?)  on the Tanpaku project

Titre: What is the status of this project: private or public ?
ou: Are the results of this project fully available to the public (or scientific community) ?
HTH