Le Forum de l'Alliance Francophone

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Auteur Sujet: le jeu "Fold It!" (anciennement "Trial V" ou "Rosetta@Play")  (Lu 59931 fois)

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Hors ligne Damien

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Projet de l'Université de Washington qui ressemble à du BOINC mais qui n'est pas du BOINC
Ce projet n'altère pas la contribution de puissance allouable à BOINC



Citation de: Heyoka
Il faudrait qu'un maximum de personnes s'inscrivent dans l'AF avant que la presse française ne s'empare du sujet.

voilà la procédure :
Inscription : http://www.fold.it/portal/user/register
Ensuite il faut télécharger le programme (Windows XP ou Vista, Mac OS (Intel)) qui fait ~50 Mo
Puis pour finir rejoindre l'Alliance Francophone : http://www.fold.it/portal/node/61909 (appuyer sur "join this group")
Une fois le logiciel téléchargé, il faut l'installer (Fold It!), puis vous pouvez commencer à vous amusez avec.


Après il va falloir monter des tutos pour expliquer le fonctionnement en français, parce que sinon c'est pas facile à comprendre intuitivement.

Foldit au micro de France Culture:

http://www.franceculture.fr/2011-09-30-ces-jeux-en-reseau-qui-font-progresser-la-science.html

Foldit, article dans Nature traduction suivra  :jap:  23 janvier 2012

http://www.nature.com/news/victory-for-crowdsourced-biomolecule-design-1.9872



Voici la manip pour passer foldit en français (je la poste ici, cela peut éventuellement servir à d'autre)

Citer
1)récuperer le fichier de traduction (foldit.fr.po):
http://dl.free.fr/rRscVRjj7

2)le déposer dans le dossier des fichiers de données de foldit:
(The data files are in different places depending on your OS:
---on Windows:
if you installed after 8/23/2011, they will be in your installation directory (the default is C:\Program Files\Foldit\ or C:\Program Files (x86)\Foldit\)
if you installed prior to 8/23/2011:
on Windows XP at C:\Documents and Settings\All Users\Application Data\Foldit\
on Windows 7 and Vista at C:\ProgramData\Foldit\
---on a Mac, Ctrl-click on the app and choose "Show Package Contents, then go to Contents/Resources
---on Linux, is is the Foldit directory
)
3) modifier le fichier option.txt (du dossier de foldit) en rajoutant la ligne:
"langage":"fr"

4) relancer foldit

(voir ici: https://fold.it/portal/node/989342 )

question d'Augure

- "Mais d'ailleurs, c'est l'algo informatique de Fold'it qui est bon ou l'imagination des joueurs ?"

réponse de jobo 0502 ( admin équipe AF Fold it )

- "Non, le joueur défini la structure, la forme de la protéine et l'algo informatique tente de trouver le meilleur niveau d'énergie à partir de cette conformation, certes, l'ordinateur ne travaille pas pour rien, alors disons que c"est une construction en partenariat cerveau-processeur dont le l'homme est l'architecte et la machine l'entreprise en batiment.
Pour ce qui concerne l'imagination, le jeune qui a trouvé la meilleure structure de la fameuse protéine de l'article de "nature", à la question "Comment avez vous fait?" a répondu :"c'était la forme qui me plaisait le mieux"- citation de mémoire donc non textuelle-.
Il y a aussi une part d'esthétique, d'inspiration, car la logique de la nature nous imprègne et fait que nous la trouvons belle ou adéquate. Le poète rejoint le scientifique. "
« Modifié: 23 January 2012 à 15:25 par ousermaatre »




Hors ligne Heyoka

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Réponse #1 le: 09 December 2007 à 23:40
J'ais pas compris, il y a 2 boutond wiggle qui nous font gagner des points sans rien faire, apparement c'est le processeur qui calcule  :lol:
Par contre quand on se met à faire tourner nous même les chaines de la protéine, ça devient tout de suite extrêmement compliqué et on perd tout nos jolis points Bonus obtenus sans rien faire.
C'est vraiment quelque chose pour les gens qui ont beaucoup de patience. Par contre c'est aussi quelque chose qui peut intéresser les gens qui vous verront jouer. Et quand vous leurs répondrez que c'est de la vrai science qui peut aider à mieux comprendre les protéines, là ils seront encore plus intéressés



Hors ligne rom_185

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Réponse #2 le: 09 December 2007 à 23:47
Ce n'est pas le jeu rosetta dons David Baker nous avait parlé ?
Sinon, l'inscription c'est comme pour les autres projets :??: ?

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Hors ligne Heyoka

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Réponse #3 le: 09 December 2007 à 23:48
Citation de: rom_185
Ce n'est pas le jeu rosetta dons David Baker nous avait parlé ?
Sinon, l'inscription c'est comme pour les autres projets :??: ?


Oui c'est le "jeu" rosetta.
Au lieu de faire calculer les processeurs pour arriver à l'énergie la plus basse, il faut le faire manuellement


Hors ligne rom_185

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Réponse #4 le: 09 December 2007 à 23:50
Citation de: Heyoka
Oui c'est le "jeu" rosetta.
Au lieu de faire calculer les processeurs pour arriver à l'énergie la plus basse, il faut le faire manuellement
:bounce:
EDIT : inscrit :jap:.


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Hors ligne pas93

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Réponse #5 le: 09 December 2007 à 23:56
Je test aussi :bounce:



Hors ligne rom_185

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Réponse #6 le: 09 December 2007 à 23:57
Citer
09/12/2007 23:56:29|rosetta@play|Master file download succeeded
09/12/2007 23:56:35|rosetta@play|Sending scheduler request: Project initialization.  Requesting 1 seconds of work, reporting 0 completed tasks
09/12/2007 23:56:40|rosetta@play|Scheduler request failed: Error 403
09/12/2007 23:57:25|rosetta@play|Sending scheduler request: Requested by user.  Requesting 29 seconds of work, reporting 0 completed tasks
09/12/2007 23:57:30|rosetta@play|Scheduler request failed: Error 403
09/12/2007 23:58:31|rosetta@play|Sending scheduler request: Requested by user.  Requesting 29 seconds of work, reporting 0 completed tasks
09/12/2007 23:58:36|rosetta@play|Scheduler request failed: Error 403
09/12/2007 23:59:36|rosetta@play|Sending scheduler request: Requested by user.  Requesting 29 seconds of work, reporting 0 completed tasks
09/12/2007 23:59:41|rosetta@play|Scheduler request failed: Error 403
:(
Serveur HS ?

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Hors ligne pas93

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Réponse #7 le: 10 December 2007 à 00:03
L'appli à Bugé 2 fois c'est lourd :o



Hors ligne rom_185

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Réponse #8 le: 10 December 2007 à 00:06
Arf, du rosetta tout craché (sens propre, comme figurer :p), je ferme les vannes, pas envie que BOINC plante pendant la semaine :o.

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Hors ligne Heyoka

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Réponse #9 le: 10 December 2007 à 00:18
C'est sure, le jeu ne marche pas avez BOINC.

Il faut s'inscrire : http://biocraft.cs.washington.edu/trial5/create_account_simple.php

Puis télécharger ce logiciel :


Téléchargement - Windows : http://biocraft.cs.washington.edu/trial5/download/app/win/InteractiveRosetta.msi
Téléchargement - OS X, x86 : http://biocraft.cs.washington.edu/trial5/download/app/osx-x86/interactive-rosetta-trial-5-v0.3.tar.gz

Ensuite il faut mettre son email et c'est partie.


Hors ligne pas93

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Réponse #10 le: 10 December 2007 à 00:20
Bha oui, c'est bien comme ça que je l'ai installer même :p

Mais je ne sait pas pourquoi, 2 fois ça a planter :o



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Réponse #11 le: 10 December 2007 à 00:23
Mais d'après moi, c'est n'est pas la version du jeu qui est à jour. Là il n'y a qu'une seule protéine.
Sur le forum de Rosetta@home, ils parlent d'une autre version ou David Baker est bien placé sur la protéine #6

http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=3789

Pour pouvoir y participer, il faut envoyer un mail à rosettaNOmod.SPzilla at yaAMhoo.comERS
Remplacer le "at" par un @ et enlever les lettres NOSPAMERS écrites en majuscule

Et envoyer un message avec ce titre : "Please add me to Rosetta Game beta list"


Hors ligne rom_185

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Réponse #12 le: 10 December 2007 à 00:26
Citation de: Heyoka
C'est sure, le jeu ne marche pas avez BOINC.

Il faut s'inscrire : http://biocraft.cs.washington.edu/trial5/create_account_simple.php

Puis télécharger ce logiciel :


Téléchargement - Windows : http://biocraft.cs.washington.edu/trial5/download/app/win/InteractiveRosetta.msi
Téléchargement - OS X, x86 : http://biocraft.cs.washington.edu/trial5/download/app/osx-x86/interactive-rosetta-trial-5-v0.3.tar.gz

Ensuite il faut mettre son email et c'est partie.
A oui... :o
Parti me cacher...


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Réponse #13 le: 10 December 2007 à 03:05
Windows n'a pas l'air d'aimer.  L'application plante après quelques manipulation de la molécule.

J'ai réussi à faire un petit bout 65 points bonus.  Je suis 23e au classement.

J'ai aussi tenté de créer L'Alliance sur le projet.  Vais avoir besoin d'aide.

A noter que ce projet utilise presque toute la puissance de l'ordinateur si on ne le limite pas.

Reste à savoir si ça donnera de vrai crédits un moment donné.


Hors ligne Thrr-Gilag

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Réponse #14 le: 10 December 2007 à 14:28
Tssss, pourquoi ils refont mes cours de modélisation moléculaire ?



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Réponse #15 le: 11 December 2007 à 00:36
Pour que tu nous montres que tu es le meilleur


Hors ligne rom_185

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Réponse #16 le: 16 December 2007 à 20:14
On ne peut pas renvoyer ce que l'on a fait :??:, j'ai eu 324 points bonus :).

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Hors ligne Heyoka

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Réponse #17 le: 16 December 2007 à 23:34
Abandonnez ce projet, ce n'est plus cette version qui est utilisée maintenant.
Pour avoir accès au vrai bêta test il faut suivre cette procédure :

Citer
Mais d'après moi, c'est n'est pas la version du jeu qui est à jour. Là il n'y a qu'une seule protéine.
Sur le forum de Rosetta@home, ils parlent d'une autre version ou David Baker est bien placé sur la protéine #6  
 
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/ [...] hp?id=3789
 
Pour pouvoir y participer, il faut envoyer un mail à rosettaNOmod.SPzilla at yaAMhoo.comERS
Remplacer le "at" par un @ et enlever les lettres NOSPAMERS écrites en majuscule
 
Et envoyer un message avec ce titre : "Please add me to Rosetta Game beta list"


Là vous verrez un nouveau site beaucoup plus évolué, et avec plusieurs types de protéines, et un classement pour chaque protéine. Vous verrez aussi David Baker qui participe au jeu, ce qui montre toute l'importance qu'il donne à cette nouvelle méthode.
Quand ce projet sera officiellement lancé, ça risque d'être un gros buzz sur internet et dans les médias.

Mais pour l'instant l'accès est restreint pour que le site et le jeu soit vraiment parfait lors du lancement officiel.


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Réponse #18 le: 17 December 2007 à 00:15
J'ai déjà envoyé le mail ;).[spoiler]"Quand ce projet sera officiellement lancé, ça risque d'être un gros buzz sur internet et dans les médias."
Je vais encore pouvoir me venté auprès de mes copains et leurs dire "j'y étais" :).[/spoiler]

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Bon, je pense que l'on peut en parlé en public depuis le temps que ce "projet" existe....
[spoiler] Voir ici : http://forum.boinc.fr/boinc/Zone51/rosetta-sujet_99_1.htm#t11894 [/spoiler]
La nouvelle adresse est : http://game.bakerlab.org/portal/
L'AF est fondée : http://game.bakerlab.org/portal/node/61909
Mais la présentation HTML merde un peut....

Je suis pour l'instant 38eme au général, il faut ce bouger car je suis tout seul :na:...

@Damien : tu peut faire une màj du 1er post STP :) ?

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Hors ligne rom_185

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@ Damien : Merci pour la MàJ :hello: !

Pour les news :
1) Le site est reffet de A à Z.
2) Je n'est plus accès à la page d'édition de L'AF  :??: ...
3) Un classement par points est mis en place pour les équipes.
4) L'AF à deux membres (Heyoka et moi :p) et nous totalisons 1800 points :jap:.
5) Fold It fonctionne sous WINE  :bounce: !

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Hors ligne Heyoka

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David Baker a annoncé sur le forum que le site est maintenant public.
Il a également annoncé qu'il fallait s'attendre à entendre parler du Rosetta game dans vos journaux préférés. Donc il prépare un communiqué de presse qui devrait faire du bruit.
C'est le moment de faire une actu sur boinc-af


Hors ligne rom_185

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C'est le moment de faire une actu sur boinc-af
Je vais voir ce que je peux faire  :jap: .

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Hors ligne Caius666

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Plus besoin d'invitation pour s'inscrire :)



Hors ligne Heyoka

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Et voilà, les articles dans la presse commencent à affluer :

MIT Technology Review : http://www.technologyreview.com/Biotech/20738/
The Economist : http://www.economist.com/science/displaystory.cfm?story_id=11326188
Science Daily : http://www.sciencedaily.com/releases/2008/05/080508122520.htm
Howard Hughes Medical Institute : http://www.hhmi.org/news/foldit20080508.html

La nouvelle adresse du projet http://www.fold.it/
le projet s'appelle maintenant fold it "résoudre des puzzles pour la science"