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Auteur Sujet: Predictor@Home - [Projet Terminé]  (Lu 15062 fois)

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Hors ligne Black Hole Sun

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le: 20 August 2006 à 16:07
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08/15/06
The last of the bprion work units should go out today. After that there will be a down time while we implement new methods of protein structure prediction. Thank you for your support in this project and we look forward to working with you again.

15/08/2005
Les dernières unités de travail bprion sont sorties. Après cela, il y aura un arrêt des serveurs le temps que nous implémentions de nouvelles méthodes de prédiction de la structure des protéines. Merci de votre soutien dans ce projet et nous espérons retravailler avec vous.

Ce projet est à présent NON recommandé par l'Alliance Francophone
« Modifié: 09 May 2012 à 13:49 par Polynésia dit "Double-Face" »



Hors ligne jump400

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Réponse #1 le: 07 February 2007 à 12:30
Du nouveau sur Predictor  :bounce:
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NOTE: We are currently doing some testing of a new application called dTASSER on 32 bit linux, 64 bit linux, MacOS X G4 and G5, MacOS X Intel. We are also in the process of upgrading the boinc server software to version 5.9.2. In the process of the testing and upgrades the web site may have problems.

There are 10,000 short dtasser test jobs waiting to be run. When these finish we will look at the output and make whatever adjustments that are needed before sending out more. Windows versions of dTASSER will follow as soon as we can figure out how to compile it.

"NOTE : Nous faisons actuellement l'essai d'une nouvelle application appelée le dTASSER sur  linux 32 bits, linux 64 bits, MacOS X G4 et G5, MacOS X Intel. Nous sommes également en cours d'upgrade du serveur de boinc en version 5.9.2. En cours d'essai et mises à niveau le site Web peut avoir des problèmes. Il y a 10.000 Wus courtes de test  de dtasser en attente de calcul. Quand ceux-ci seront terminés nous regarderons le rendement et ferons les ajustements qui sont nécessaires avant d'en envoyer plus. Les versions de Windows de dTASSER suivront dès que nous aurons compris comment les compiler."



Hors ligne jump400

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Réponse #2 le: 07 February 2007 à 12:32
Une nouvelle application en test sur Predictor !
Cela interessera plus particulièrement les possesseurs de Linux 64bits et de Mac (G4, G5 et intel)

voir ici http://forum.boinc.fr/boinc/News/predictor/predictor-home-suspendu-sujet_56_1.htm#bas



Hors ligne Douglas Riper

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Réponse #3 le: 07 February 2007 à 13:26
Bonne nouvelle, je regarderai ca après AAA5 :)



Hors ligne popolito

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Réponse #4 le: 07 February 2007 à 13:33
MAAAIIIS EUUHHH, J'AAAAVAIS HEUPPE LE TOPIIIC PREDICTOOOORR !!! :D



Hors ligne jump400

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Réponse #5 le: 07 February 2007 à 15:59
Citation de: popolito
MAAAIIIS EUUHHH, J'AAAAVAIS HEUPPE LE TOPIIIC PREDICTOOOORR !!! :D

oui mais je t'ai grillé de ... 12 secondes  :D



Hors ligne jump400

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Réponse #6 le: 07 February 2007 à 22:51
je n'arrive pas à attacher de machine à Predictor. et vous ?
("projet momentanement indisponible")



Hors ligne ordralfabetix

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Réponse #7 le: 07 February 2007 à 23:00
Rien chez moi non plus.
Ma 1ère bécane est attaché à predictor mais je n'obtiens pas de travail ("project is down").



Hors ligne tibidao

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Réponse #8 le: 10 February 2007 à 17:34
Tout est prévu, c'est pour que vous restiez sur ABC pendant le fight  :lol:

L'Équipe De La Science recrute !
Venez faire un tour sur notre forum : http://www.boincedls.org/forum/
Vous pouvez aussi rejoindre notre groupe facebook : Équipe De La Science - AF - BOINC


Hors ligne Damien

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Réponse #9 le: 15 February 2008 à 19:51
Nouvelle adresse du projet Predictor: http://predictor.chem.lsa.umich.edu/




Hors ligne Pascal94

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Réponse #10 le: 15 February 2008 à 22:35
heu, les gars, c'est plus d'actualité ça ?  :??:
http://www.boinc-af.org/index.php?option=com_content&task=view&id=35&Itemid=219

nan, je dis ça parce que suis nouveau, alors je sais pas si le projet est maintenant accepté par l'AF ou pas ?



Hors ligne pas93

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Réponse #11 le: 15 February 2008 à 22:45
Non toujours pas. :jap:



Hors ligne Pascal94

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Réponse #12 le: 15 February 2008 à 22:50
Citation de: pas93
Non toujours pas. :jap:


bah dans ce cas là, des projets sur les protéines y'en a d'autres, à commencer par Protéins  :jap:
http://biology.polytechnique.fr/proteinsathome/

je suis quand même surpris que les projets américains soient préférés aux projets français et européens  :??:



Hors ligne pas93

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Réponse #13 le: 15 February 2008 à 23:21
Bha proteins est un bon projet ^^  POEM qui est allemand aussi est un bon projet ^^



Hors ligne Heyoka

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Réponse #14 le: 15 February 2008 à 23:24
Citation de: Pascal94
bah dans ce cas là, des projets sur les protéines y'en a d'autres, à commencer par Protéins  :jap:
http://biology.polytechnique.fr/proteinsathome/

je suis quand même surpris que les projets américains soient préférés aux projets français et européens  :??:


Sur la semaine, il y a environ 57% de la puissance de l'AF sur des projets américains et 43% sur des projets européens.
Cette répartition est essentiellement dû au fait que les plus anciens projets sont américains (Seti, Einstein, WCG, Rosetta). Et il y a pas mal d'inertie dans le choix des projets, la grosse partie des membres de l'AF restent fidèle à un projet. ça avait était le cas avant, les gens ont mis pas mal de temps pour passer de Predictor à Rosetta.

Mais les projets européens regagnent de plus en plus de terrain avec des projets qui deviennent à leur tour des incontournables (ABC, QMC, Simap, Spinhenge, Malaria Control, Yoyo@home)
POEM@home sera surement un de ces projets incontournables dans les mois à venir

Par contre pour que Proteins devienne un gros projet sur Boinc, il faudrait qu'ils fassent un effort de communication par rapport à ce qu'ils ont fait lors de la première phase, surtout que dans ce domaine il y a de la concurrence.


Hors ligne Pascal94

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Réponse #15 le: 15 February 2008 à 23:46
Extrait d'un mail reçu ce jour de l'équipe Protéins:

"Chers participants de Proteins@Home,

Avant l’été, plus de 15.000 volontaires ont participé au projet Proteins@Home.
Je vous remercie chaleureusement pour votre extraordinaire soutien. Je remercie
également tous les développeurs et testeurs BOINC.

Grâce à votre aide, nous avons fait progresser la compréhension du repliement des
protéines et contribué aux méthodes de prédiction de structure. Nos premières publi-
cations vont paraitre, cf. par exemple http://www3.interscience.wiley.com/cgi-bin/abstract/117860966/ABSTRACT .
Un livre va paraitre en 2008 sur le calcul distribué
dans lequel il y a un chapitre décrivant Proteins@Home: Distributed & Grid Computing:
Science Made Transparent for Everyone. Principles, Applications and Supporting
Communities, Tektum Publishers, Berlin.

Ces derniers mois, grâce à Proteins@Home, nous avons nettement amélioré notre
méthode de prédiction de structures et commençons à l’appliquer à plusieurs familles
intéressantes de protéines, comme les “Src homology domains” ou les domaines dits
“WW”. Ces deux familles jouent un rôle dans les réseaux d’interaction protéine–
protéine dans la cellule. Leur étude nous aidera à identifier de nouveaux membres
des deux familles et à comprendre la fonction de gènes nouvellement découverts.

Le point de départ de notre méthode de prédiction de structures est le problème
“inverse” du repliement des protéines, formulé pour la première fois dans les années
80 par Pabo et Drexler. Au lieu de prédire la structure 3D à partir de la séquence
d’acides aminés (le problème du “repliement”), on considère une structure particulière
de la “chaine principale” et on prédit quelles séquences d’acides aminés se replient
dans cette structure (cf. Figure 1). Ces séquences fournissent une “signature” du pli en
question; nous pouvons utiliser cette signature pour identifier d’autres séquences qui
adoptent ce pli. Dans le rapport ci-dessous, nous expliquons brièvement la méthode,
nous décrivons quelques résultats obtenus, et nous décrivons les calculs en cours qui
exploitent le vaste jeu de données que vous avez contribué à créer.

Meilleurs voeux,

Thomas Simonson

Responsable du projet Proteins@Home"

Y'a encore plein de trucs (10 pages en anglais et français), mais c'est un fichier PDF, je ne sais pas comment le mettre à disposition sur le forum ?



Hors ligne Heyoka

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Réponse #16 le: 16 February 2008 à 00:09
Oui j'avais aussi reçu le mail en anglais. Il faudrait qu'ils continuent à informer de cette façon, surtout de l'information sur les unités en cours comme le faisait David Baker avec un message par semaine sur l'avancée des recherches (c'est grâce à ça que Rosetta s'est développé aussi rapidement). Et aussi d'utiliser un peu plus le flux RSS. pour annoncer des informations scientifiques
C'est toi qui a traduit le mail en français ?


Hors ligne rom_185

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Réponse #17 le: 16 February 2008 à 00:15
Le PDF... enfin le PDF Zipper  :whistle: .
http://www.mediafire.com/?4qht32kccge

BOINC, les grandes énigmes de la science résolues en 2 temps 3 calculs
I reject your reality and substitue my own


Hors ligne Hildor

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Réponse #18 le: 16 February 2008 à 02:21
Citation de: Heyoka
Oui j'avais aussi reçu le mail en anglais. Il faudrait qu'ils continuent à informer de cette façon, surtout de l'information sur les unités en cours comme le faisait David Baker avec un message par semaine sur l'avancée des recherches (c'est grâce à ça que Rosetta s'est développé aussi rapidement). Et aussi d'utiliser un peu plus le flux RSS. pour annoncer des informations scientifiques
C'est toi qui a traduit le mail en français ?


Je l'ai également reçu, les premières pages du fichier PDF est en français ensuite c'est en anglais.
Heyoka, ils te prenne peut-être pour un Vénézuelien !   :D



Hors ligne xipehuz

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Réponse #19 le: 16 February 2008 à 06:33
Avec un peu de chance, en même temps que le déménagement ils auront peut-être viré l'autocrate dictatorial et liberticide qui leur servait d'admin du forum.

l faudra surveiller ça. Si ce malade n'est plus là, on pourra remettre Predictor dans les projets conseillés.

Je prends les compliments comme des reproches d'hypocrites (Palinka)


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Réponse #20 le: 16 February 2008 à 06:40
J'ai parlé trop vite, il est toujours là http://predictor.chem.lsa.umich.edu/forum_thread.php?id=2670

Et tant qu'il sera là, je ne donnerai pas une seul nano-seconde de calcul à ce projet.

Tant pis.

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Hors ligne Czame17

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Réponse #21 le: 16 February 2008 à 09:37
C'est qui le Nazi ? J'te suis pas trop là !  :??:



Hors ligne Caius666

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Réponse #22 le: 16 February 2008 à 11:18
En gros il y aurait des tricheurs sur predictor qui ont boosté leurs crédits, l'admin à fermé les yeux la dessus, mais en plus de ça il s'est amusé à remettre à zero le conteur de tout ceux qui l'avaient avertit qu'il se passait un truc louche concernant ces comptes...



Hors ligne xipehuz

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Réponse #23 le: 16 February 2008 à 15:45
J'ai édité mon 1er post pour ne pas choquer.

J'ajouterais à ce que dit Caius qu'il a également banni du forum de nombreux utilisateurs qui ne faisaient que donner leur opinion sans troller.

Il est même allé jusquà bannir des plages d'IP entieres pour empecher certains utilisateurs de se réinscrire à partir du même domaine.

Innacceptable et révoltant.

Voir http://forum.boinc.fr/boinc/LAllianceFrancophone/predictor-home-censure-sujet_224_1.htm
et
http://forum.boinc.fr/boinc/LAllianceFrancophone/Teams/reponse-predictor-home-sujet_218_1.htm

pour en savoir plus.

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Hors ligne al@ON

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Réponse #24 le: 16 February 2008 à 17:18
Citation de: xipehuz
Voir ici et ici  pour en savoir plus.
xipehuz es-tu sûr pour tes liens car chez moi ils ne fonctionnent pas. :??:  :cry: