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Auteur Sujet: Ralph (Projet de test rosetta)  (Lu 41872 fois)

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Réponse #75 le: 01 February 2021 à 09:08
:hyperbon: :hyperbon: par intermittence depuis quelques jours. Je ne vois jamais les tâches, que les points dans mes stats.
La demande forcée à du bon :ange:


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Réponse #76 le: 10 February 2021 à 14:04
Une bonne journée pour moi hier sur ce projet!! :bounce:
Presque 19000 pts!!  :gniak: :siflotte:

Pour l'équipe: 1 MacPro octo X5570 2.93GHz 24Go de RAM, AMD RX 570 Nitro+ + 1 MacPro dodéca X5650 2.66GHz 32Go de RAM, AMD RX 580X + 1 MacPro dodéca X5690 3,46GHz 96Go de RAM, AMD RX 480X Nitro.
Un petit proverbe qui va bien avec l'air du temps:Quand le dernier arbre sera abattu, La dernière rivière empoisonnée, Le dernier poisson pêché, Alors vous découvrirez que l'argent ne se mange pas. A méditer...;-)


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Réponse #77 le: 10 February 2021 à 15:20
Sous macOS ?

A quoi bon prendre la vie au sérieux, puisque de toute façon nous n’en sortirons pas vivants ? (Alphonse Allais)



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Réponse #78 le: 10 February 2021 à 18:52
 :kookoo:
Yes man!!
Je suis un pommeux pur jus  :lol: pas de windaube ou autre n'a le droit de cité sur mes machines!!
Même pas avec des VMs! ;-)

Pour l'équipe: 1 MacPro octo X5570 2.93GHz 24Go de RAM, AMD RX 570 Nitro+ + 1 MacPro dodéca X5650 2.66GHz 32Go de RAM, AMD RX 580X + 1 MacPro dodéca X5690 3,46GHz 96Go de RAM, AMD RX 480X Nitro.
Un petit proverbe qui va bien avec l'air du temps:Quand le dernier arbre sera abattu, La dernière rivière empoisonnée, Le dernier poisson pêché, Alors vous découvrirez que l'argent ne se mange pas. A méditer...;-)


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Réponse #79 le: 10 February 2021 à 23:23
Tu pourras essayer kryptos, ils ont une bonne appli Mac qui est bien stable, sous VB.

A quoi bon prendre la vie au sérieux, puisque de toute façon nous n’en sortirons pas vivants ? (Alphonse Allais)



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Réponse #80 le: 18 February 2021 à 09:39
Je viens de voir de nouvelles tâches Ralph sur mon ordi - nouvelle appli: rosetta python projects 0.00 (vbox64)
Nom des tâches: ralph_local_test_15xx_xxxx
Deadline: dimanche 21/2/21


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Réponse #81 le: 18 February 2021 à 10:13
Je viens de voir de nouvelles tâches Ralph sur mon ordi - nouvelle appli: rosetta python projects 0.00 (vbox64)
Nom des tâches: ralph_local_test_15xx_xxxx
Deadline: dimanche 21/2/21
Merci pour l'info  :kookoo:


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Réponse #82 le: 23 February 2021 à 11:24
Pas terrible le résultat :(
https://ralph.bakerlab.org/results.php?hostid=44699&offset=0&show_names=0&state=0&appid=
Elles sont toutes en erreur de calcul. Et celles qui s'affichent en timeout, sont en fait encore en cours de calcul chez moi, depuis près de 4 jours (3j 16h pour l'une, 3j 18h pour les 3 autres) :pt1cable:


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Réponse #83 le: 23 February 2021 à 11:27
Pas terrible le résultat :(
https://ralph.bakerlab.org/results.php?hostid=44699&offset=0&show_names=0&state=0&appid=
Elles sont toutes en erreur de calcul. Et celles qui s'affichent en timeout, sont en fait encore en cours de calcul chez moi, depuis près de 4 jours (3j 16h pour l'une, 3j 18h pour les 3 autres) :pt1cable:
Être ATA c'est ça.  :D


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Réponse #84 le: 23 February 2021 à 11:34
Les miennes sont également parties en erreur, je pensais que ça venait de ma machine mais peut-être pas en fait ! :D

 :hello:

Je crunche dans le silence et c'est ma joie !
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Réponse #85 le: 08 August 2021 à 18:37
J'ai eu des unités à base de python sous VirtualBox qui prenaient 7Go de RAM mais je n'arrive pas à les renvoyer.... :(

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Réponse #86 le: 25 August 2021 à 17:05
J'ai chopé un lot de tâches mais c'est pas fameux-fameux: Temps de calcul très court (quelques minutes seulement), mais plus d'erreurs de calcul que de valides
https://www.dropbox.com/s/t07pkjep46k1hz0/Capture%20d%27%C3%A9cran%202021-08-25%2017.02.08.png?dl=0

D'après le nom des tâches, je dirais qu'on calcule encore sur du Sars-Cov-2


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Réponse #87 le: 25 August 2021 à 23:22
Je viens d'en toucher une nouvelle fournée de 61 sur une de mes machines.

On verra demain matin  :bonui: :aulit:

 :hello:

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Réponse #88 le: 17 October 2022 à 18:13
Apparemment le projet est terminé.  :cavapobienmwa:


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Réponse #89 le: 17 October 2022 à 21:33
Ou en sommeil jusqu'au prochain développement d'une appli ;)


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Réponse #90 le: 01 December 2023 à 22:37
Il y a encore de la vie ici.  :kookoo:
Citer
1 Dec 2023, 10:52:27 UTC    1 Dec 2023, 21:18:12 UTC    Terminé et validé    30,458.58    30,189.88    276.55    rosetta python projects v0.21 (vbox64)
windows_x86_64
Citer
1 Dec 2023, 10:51:42 UTC    1 Dec 2023, 21:17:24 UTC    Terminé et validé    31,252.99    30,106.17    277.56    rosetta python projects v0.21 (vbox64)
windows_x86_64
Citer
1 Dec 2023, 10:51:42 UTC    1 Dec 2023, 21:17:24 UTC    Terminé et validé    30,898.12    30,076.61    319.57    rosetta python projects v0.21 (vbox64)
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Réponse #91 le: 03 December 2023 à 13:59
Houla, à base de VBox donc. La version "python" de rosetta donc, des tests, donc. Ce qui est bizarre c'est que la version de l'appli annoncée sur le site ralph date de 2021. Ou alors ils se fichent de maintenir la page à chaque (rare) fois qu'ils bricolent ?

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Réponse #92 le: 20 December 2023 à 14:54
Je viens de choper un peu de taf. Franchement, ils exagèrent avec les fichiers à télécharger !!!
  [ You are not allowed to view this attachment ]  

Mais je ne vais pas me plaindre, avant de redémarrer l'ordi, le projet me disait que VBox n'était pas installé  :pt1cable:


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Réponse #93 le: 20 December 2023 à 16:49
Ouais!!  J’ai eu la même!!!

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Réponse #94 le: 22 December 2023 à 22:50
Je viens de choper un peu de taf. Franchement, ils exagèrent avec les fichiers à télécharger !!!
  [ You are not allowed to view this attachment ]  

Mais je ne vais pas me plaindre, avant de redémarrer l'ordi, le projet me disait que VBox n'était pas installé  :pt1cable:
Les joies des VM ... :siflotte:

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Réponse #95 le: 23 December 2023 à 13:24
S'ils faisaient l'effort ils pourraient tout à fait faire une VM optimisée en prenant une distrib light et juste ce qu'il leur faut en plus... et je suis sûr que ça pourrait tenir en moins de 5,5 Go... mais bon après si t'installes un bon gros jeu récent ça se chiffre par dizaines de Go, et à chaque MaJ il en rajoute quelques Go...

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Réponse #96 le: 30 May 2024 à 17:26
Une nouvelle application est disponible sur le projet.  :kookoo:
Generalized biomolecular modeling and design with RoseTTAFold All-Atom
https://ralph.bakerlab.org/apps.php
Mais pas de panique tout part en erreur de calcul.  :/
Citer
30 May 2024, 5:44:53 UTC    30 May 2024, 6:14:05 UTC    Erreur en cours de calculs    2.16    0.05    ---    Generalized biomolecular modeling and design with RoseTTAFold All-Atom v0.00
windows_x86_64


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Réponse #97 le: 30 May 2024 à 23:12
Et c'est que windowz.

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Réponse #98 le: 02 June 2024 à 12:06
Oui, c'est dit dans la news :

Citer
New application: RoseTTAFold All-Atom
Starting this week, we will begin testing RoseTTAFold All-Atom, our state-of-the-art application designed to predict the structures of proteins in complex with ligands such as DNA and other biological molecules. It also models post-translational modifications. We are initially targeting only Windows machines with or without Nvidia GPUs for this test.

Ca plante pour tout le monde d'après le forum : https://ralph.bakerlab.org/forum_thread.php?id=928
« Modifié: 02 June 2024 à 12:08 par toTOW »

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